vestnik-bio-msuВестник Московского университета. Серия 16. БиологияVestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya0137-0952Lomonosov Moscow State University, School of Biologyvestnik-bio-msu-227Research ArticleСтатьиОЦЕНКА РАВНОМЕРНОСТИ ХОДА МОЛЕКУЛЯРНЫХ ЧАСОВ В РОДОСЛОВНЫХ ВИДОВ ДРОЗОФИЛ ГРУППЫ VIRILISESTIMATION OF THE RATE OF MOLECULAR CLOCK IN LINEAGES OF THE DROSOPHILA VIRILIS SPECIES GROUPКуликовА. М.KulikovA. M.

канд. биол. наук, ст. науч. сотр., Учреждение Российской академии наук Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН. Тел. (499)135-87-81

 

amkulikov@gmail.comЛазебныйО. Е.LazebnyO. E.

канд. биол. наук, ст. науч. сотр., Учреждение Российской академии наук Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН. Тел. (499)135-87-81

oelazebny@gmail.comРыбаковаЕ. Ю.RybakovaE. Yu.

аспирантка, Учреждение Российской академии наук Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН. Тел. (499)135-87-81.

Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАНRussian Federation20102407201504100103Copyright © Куликов А.М., Лазебный О.Е., Рыбакова Е.Ю., 20152015Куликов А.М., Лазебный О.Е., Рыбакова Е.Ю.Kulikov A.M., Lazebny O.E., Rybakova E.Y.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/227

Исследована филогения видов-двойников группы Drosophila virilis на основе изменчивости пяти ядерных и митохондриальных генов: Adh, NonA, Fu, Ras1 и 16S-12S рРНК. Предложена модель для оценки неравномерности накопления замен в филогенетических линиях группы видов по произвольному числу последовательностей ДНК с учетом множественных, параллельных и обратных замен. Реконструированы периоды неравномерного хода молекулярных часов в группе видов virilis и построено филогенетическое дерево данной группы на основе нейтральной изменчивости.

 

Phylogeny of the DroSophila viriliS species group is studied on the base of five nuclear and mi- tochondrial genes: Adh, NonA, Fu, RaSl и 16S-12S rRNA. Mathematical simulation to estimate uneven accumulation of replacements in lineages of closely related species using arbitrary number of sequences was suggested. It accounts for multiple, parallel and reverse mutations. Periods of evolution with irregular rates in the viriliS species group were reconstructed. Phylogeny tree for the group given on the base of neutral variability was constructed.

эволюциямолекулярные часынейтральная изменчивостьDrosophila virilis.evolutionmolecular clockneutral variabilityDroSophila viriliS.Работа поддержана Российским фондом фундаментальных исследований (грант № 09-04-01745).ReferencesКуликов А.М., Лазебный О.Е., Горностаев Н.Г., Чекунова А.И. Митрофанов В.Г. Неравномерность скорости эволюции у дрозофил группы viriliS. I. Применение филогенетически опосредованных тестов Такезаки // Изв. РАН. Сер. биол. 2010. Т. 37. № 1. С. 25—33.Куликов А.М., Лазебный О.Е., Горностаев Н.Г., Чекунова А.И. Митрофанов В.Г. Неравномерность скорости эволюции у дрозофил группы viriliS. I. Применение филогенетически опосредованных тестов Такезаки // Изв. РАН. Сер. биол. 2010. Т. 37. № 1. С. 25—33.Куликов А.М., Лазебный О.Е., Горностаев Н.Г., Чекунова А.И. Митрофанов В.Г. Неравномерность скорости эволюции у дрозофил группы viriliS. II. Применение метода тестирования Таджимы // Изв. РАН. Сер. биол. 2010. Т. 37. № 1. С. 206—209Куликов А.М., Лазебный О.Е., Горностаев Н.Г., Чекунова А.И. Митрофанов В.Г. Неравномерность скорости эволюции у дрозофил группы viriliS. II. Применение метода тестирования Таджимы // Изв. РАН. Сер. биол. 2010. Т. 37. № 1. С. 206—209GaSperini R., GibSon G.J. Absence of protein polymorphism in the RaS genes of DroSophila melanogaSter // Mol. Evol. 1999. Vol. 49. N 5. P. 583—590.GaSperini R., GibSon G.J. Absence of protein polymorphism in the RaS genes of DroSophila melanogaSter // Mol. Evol. 1999. Vol. 49. N 5. P. 583—590.Сорокина С.Ю., Мюге Н.С., Андрианов Б.В., Митрофанов В.Г.Изменчивость 3'-концевого фрагмента гена 16S рРНК в группе бизкородственных видов дрозофил viriliS // Генетика. 2005. Т. 41. № 8. С. 1049—1054.Сорокина С.Ю., Мюге Н.С., Андрианов Б.В., Митрофанов В.Г.Изменчивость 3'-концевого фрагмента гена 16S рРНК в группе бизкородственных видов дрозофил viriliS // Генетика. 2005. Т. 41. № 8. С. 1049—1054.Чекунова А.И., Куликов А.М., Михайловский С.С., Лазебный О.Е. Лазебная И.В., Митрофанов В.Г Родственные отношения дрозофил группы viriliS, рекомендованные на основе последовательностей гена DraSl // Генетика. 2008. Т. 44. № 3. С. 336—345.Чекунова А.И., Куликов А.М., Михайловский С.С., Лазебный О.Е. Лазебная И.В., Митрофанов В.Г Родственные отношения дрозофил группы viriliS, рекомендованные на основе последовательностей гена DraSl // Генетика. 2008. Т. 44. № 3. С. 336—345.Cutler D.J. Understanding the overdispersed molecular clock // Genetics. 2000. Vol. 154. P. 1403—1417.Cutler D.J. Understanding the overdispersed molecular clock // Genetics. 2000. Vol. 154. P. 1403—1417.GilleSpie J.H. Lineage effects and the index of dispersion of molecular evolution // Mol. Biol. Evol. 1989. Vol. 6. N 5. P. 636—647.GilleSpie J.H. Lineage effects and the index of dispersion of molecular evolution // Mol. Biol. Evol. 1989. Vol. 6. N 5. P. 636—647.Bulmer M. Estimating the variability of substitution rates // Genetics 1989. Vol. 123. P. 615—619.Bulmer M. Estimating the variability of substitution rates // Genetics 1989. Vol. 123. P. 615—619.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.