vestnik-bio-msuВестник Московского университета. Серия 16. БиологияVestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya0137-0952Lomonosov Moscow State University, School of Biologyvestnik-bio-msu-229Research ArticleСтатьиПОЛНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ МИТОХОНДРИАЛЬНОГО ГЕНОМА D. LITTORALIS (DIPTERA: DROSOPHILIDAE): СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ ГЕНОМОВ В ГРУППЕ ДРОЗОФИЛ VIRILISCOMPLETE MITOCHONDRIAL GENOME SEQUENCE OF D. LITTORALIS (DIPTERA: DROSOPHILIDAE): COMPARATIVE ANALYSIS OF THE MITOCHONDRIAL GENOMES IN DROSOPHILA VIRILIS SPECIES GROUPСорокинаС. Ю.SorokinaS. Yu.

канд. биол. наук, мл. науч. сотр. лаборатории генетики Института биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН. Тел. 7(499)135-87-81

svetlana_ibr@mail.ruАндриановБ. В.AndrianovB. V.

канд. биол. наук, ст. науч. сотр. лаборатории сравни­тельной генетики животных Института общей генетики имени Н.И. Вавилова РАН. Тел. 7(499)135-11-30

andrianovb@mail.ruМитрофановВ. Г.MitrofanovV. G.

докт. биол. наук, проф., зав. лабораторией генетики Института биологии развития им. Н.К. Кольцова РАН. Тел. 7(499)135-87-81.

Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН, г. МоскваRussian FederationИнститут общей генетики имени Н.И. Вавилова РАНRussian Federation20102407201504108111Copyright © Сорокина С.Ю., Андрианов Б.В., Митрофанов В.Г., 20152015Сорокина С.Ю., Андрианов Б.В., Митрофанов В.Г.Sorokina S.Y., Andrianov B.V., Mitrofanov V.G.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/229

Представлен анализ полной последовательности митохондриального (мт) генома D. littoralis. Приведены его основные характеристики, размер, нуклеотидный состав, последовательность генов, а также степень давления стабилизирующего отбора на разные участки генома. Обсуждены особенности структуры белок-кодирующих генов и генов тРНК. Приведена структура некодирующих районов: контрольного района и межгенных спейсеров мтДНК группы virilis. Найдены фрагменты мт-генов atp6 и cox3 в ядерном геноме D. virilis. Эволюционная история митохондриальных и ядерных последовательностей этих генов указывает на то, что процесс образования мт-псевдогенов идет в настоящее время и связан с активностью ретротранспозонов.

 

An analysis of the complete sequence of D. littoralis mitochondrial genome (mt-genome) is presented. The basic characters of the mt-genome, such as size, nucleotide composition, genes order, as well as a degree of purifying selection pressure on different parts of the mt-genome are reported. The features of protein-coding genes and tRNA genes are discussed. The structure of mtDNA control region and intergenic spacers in the virilis group are presented. The fragments of mitochondrial genes atp6 and cox3 were found in the nuclear genome of D. virilis. The evolution history of mitochondrial and nuclear genes data indicates that mitochondrial gene transfer to the nucleus is a recent event and connected to the activity of retrotransposons.

 

митохондриальный геномнуклеотидная последовательностьмежгенный спейсерпсевдогенретротранспозон Tv1Drosophila littoralis.mitochondrial genomenucleotide sequence intergenic spacerTv1 retrotransposoneDrosophila littoralis.ReferencesThrockmorton L.H. The virilis species group // The genetics and biology of Drosophila / Eds. M. Ashburner, H.L.Carson, J.N. Thompson. London: Academic Press, 1982. 3b. P. 227—296.Throckmorton L.H. The virilis species group // The genetics and biology of Drosophila / Eds. M. Ashburner, H.L.Carson, J.N. Thompson. London: Academic Press, 1982. 3b. P. 227—296.Митрофанов В.Г., Полуэктова Е.В. Инверсионный полиморфизм в природной популяции Drosophila imere- tensis Sokolov (D. littoralis Meig.) // Генетика. 1982. Т. 18. № 11. C. 1849—1855.Митрофанов В.Г., Полуэктова Е.В. Инверсионный полиморфизм в природной популяции Drosophila imere- tensis Sokolov (D. littoralis Meig.) // Генетика. 1982. Т. 18. № 11. C. 1849—1855.Гончаренко Г.Г., Митрофанов В.Г., Корочкин Л.И. Изучение генотипической структуры Drosophila imeretensis Sokolov (D. littoralis Meigen) в географически разделенных популяциях Краснодарского края и Белоруссии // Докл. АН СССР. 1984. Т. 279. № 1. C. 216—219.Гончаренко Г.Г., Митрофанов В.Г., Корочкин Л.И. Изучение генотипической структуры Drosophila imeretensis Sokolov (D. littoralis Meigen) в географически разделенных популяциях Краснодарского края и Белоруссии // Докл. АН СССР. 1984. Т. 279. № 1. C. 216—219.Андрианов Б.В., Сорокина С.Ю., Мюге Н.С., Резник Н.Л., Митрофанов В.Г. Популяционная динамика митохондриального полиморфизма в природной популя-ции Drosophila littoralis // Генетика. 2008. Т. 44. № 2. С. 195—201.Андрианов Б.В., Сорокина С.Ю., Мюге Н.С., Резник Н.Л., Митрофанов В.Г. Популяционная динамика митохондриального полиморфизма в природной популя-ции Drosophila littoralis // Генетика. 2008. Т. 44. № 2. С. 195—201.Clary D.O., Wolstenholme D.R. The mitochondrial DNA molecule of Drosophila yakuba: Nucleotide sequence, gene organization, and genetic code // J. Mol. Evol. 1985. Vol. 22. N 3. P. 252—271.Clary D.O., Wolstenholme D.R. The mitochondrial DNA molecule of Drosophila yakuba: Nucleotide sequence, gene organization, and genetic code // J. Mol. Evol. 1985. Vol. 22. N 3. P. 252—271.Montooth K., Abt D., Hofmann J., Rand D. Comparati¬ve genomics of Drosophila mtDNA: Novel features of conservation and change across functional domains and lineages // J. Mol Evol. 2009. Vol. 69. N 1. P. 94—114.Montooth K., Abt D., Hofmann J., Rand D. Comparati¬ve genomics of Drosophila mtDNA: Novel features of conservation and change across functional domains and lineages // J. Mol Evol. 2009. Vol. 69. N 1. P. 94—114.Saito S., Tamura K., Aotsuka T. Replication origin of mitochondrial DNA in insects // Genetics. 2005. Vol. 171. N 4. P. 1695—1705.Saito S., Tamura K., Aotsuka T. Replication origin of mitochondrial DNA in insects // Genetics. 2005. Vol. 171. N 4. P. 1695—1705.Andrianov B.V., Zakharyev V.M., Reznik N.L., Gorelo- va T.V., Evgen'ev M.B. Gypsy group retrotransposon Tv1 from Drosophila virilis // Gene. 1999. Vol. 239. N 1. P. 193—199.Andrianov B.V., Zakharyev V.M., Reznik N.L., Gorelo- va T.V., Evgen'ev M.B. Gypsy group retrotransposon Tv1 from Drosophila virilis // Gene. 1999. Vol. 239. N 1. P. 193—199.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.