vestnik-bio-msuВестник Московского университета. Серия 16. БиологияVestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya0137-0952Lomonosov Moscow State University, School of Biology10.1234/XXXX-XXXX-2011-1-26-31vestnik-bio-msu-249Research ArticleМОЛЕКУЛЯРНАЯ ФИЛОГЕНЕТИКАMOLECULAR PHILOGENETICSИДЕНТИФИКАЦИЯ БАКТЕРИЙ РОДА LACTOBACILLUS НА ОСНОВЕ АНАЛИЗА ФРАГМЕНТА ГЕНА БЕТА-СУБЪЕДИНИЦЫ РНК-ПОЛИМЕРАЗЫ rpoBTHE IDENTIFICATION OF LACTOBACILLUS spp. ON THE BASE OF ANALYSIS OF GENE FRAGMENT BETA- SUBUNIT RNA -POLYMERASE (rpoB)ШевцовА. Б.ShevtsovA. B.

науч. сотр. Национальной научной лаборатории кол­лективного пользования РГП Национальный центр биотехнологии РК КН МОН РК. Тел. 87172200793  

nmcrshevtsov@mail.ruКушугуловаА. Р.КushugulovаА. R.

канд. мед. наук, зав. лабораторией коллекции микроорганизмов, ДГП Республиканская коллекция микроорганизмов РГП "НЦБ РК" КН МОН РК. Тел. 87172200793; факс: 87172200927

 

Lgene@biocenter.kzКожахметовС. С.КоjakhmetovS. S.

канд. биол. наук, ст. науч. сотр. лаборатории генети­ки и биохимии микроорганизмов, ДГП Республиканская коллекция микроорганизмов РГП "НЦБ РК" КН МОН РК. Тел. 87172200793; факс: 87172200927

 

Lgene@biocenter.kzОралбаеваС. С.ОralbaevaS. S.

канд. биол. наук, ст. науч. сотр. Национальной науч­ной лаборатории коллективного пользования РГП Национальный центр биотехнологии РК КН МОН РК. Тел. 87172200793

soralbaeva@mail.ruСтояноваЛ. Г.StoyanovaL. G.

докт. биол. наук кафедры микробиологии биологи­ческого факультета МГУ. Тел. 939-27-63

stoyanovamsu@mail.ruСейдалинаА. Б.SeidalinaА. B.

мл. науч. сотр. Национальной научной лаборато­рии коллективного пользования РГП Национальный центр биотехнологии РК КН МОН РК. Тел. 87172200793.

 

МомыналиевК. Т.МомinalievК. Т.

докт. биол. наук, гл. науч. сотр. Национальной научной лаборатории коллективного пользования РГП Национальный центр биотехноло­гии РК КН МОН РК. Тел. 87172200793.

РГП Национальный центр биотехнологии Республики Казахстан КН МОН РК, г. Астана.Russian FederationДГП Республиканская коллекция микроорганизмов, Республика Казахстан, г. Астана.Russian Federationкафедра микологииRussian Federation201125072015012631Copyright © Шевцов А.Б., Кушугулова А.Р., Кожахметов С.С., Оралбаева С.С., Стоянова Л.Г., Сейдалина А.Б., Момыналиев К.Т., 20152015Шевцов А.Б., Кушугулова А.Р., Кожахметов С.С., Оралбаева С.С., Стоянова Л.Г., Сейдалина А.Б., Момыналиев К.Т.Shevtsov A.B., Кushugulovа А.R., Коjakhmetov S.S., Оralbaeva S.S., Stoyanova L.G., Seidalina А.B., Момinaliev К.Т.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/249

В настоящей работе проведен сравнительный анализ нуклеотидных последовательно­стей rpoB гена для оценки возможности его использования в качестве генетического мар­кера видовой идентификации бактерий рода Lactobacillus spp., выделенных из кисломолоч­ных продуктов разных районов республики Казахстан. Показано, что дискриминационная характеристика нуклеотидной последовательности rpoB гена более достоверна для иденти­фикации близкородственных генов Lactobacillus по сравнению с использованием для этих целей только 16S rRNA гена. Филогения последовательности rpoB гена идентична 16S rRNA гену и может быть использована как дополнительный филогенетический маркер.

 

It was carry out a comparative analysis of the nucleotide sequences of the rpoB gene to assess its use as a genetic marker for identification genus Lactobacillus spp., obtained from acid milk product of different regions of Kazakhstan. Discriminatory ability of the nucleotide sequence analyze of rpoB gene is higher than the 16S rRNA gene for closely related species of the Lactoba­cillus genus. Phylogeny of nucleotide sequence of rpoB gene is identical to 16S rRNA gene and can be used as its additional phylogenetic marker.

 

Lactobacillusбета-субъединица РНК-полимеразыидентификациясеквенированиефилогения16S rRNA генrpoB генLactobacillusbeta-subunit of RNA- polymeraseidentificationsequencingphylo­geny16S rRNA generpoB gene.ReferencesКоролев Ю.Н., Малахов Ю.И., Калабеков А.Л. Использование методов спектрометрии МНПВО для анализа биологических объектов // Измерительные технологии. 2002. № 8. С. 40—45.Королев Ю.Н., Малахов Ю.И., Калабеков А.Л. Использование методов спектрометрии МНПВО для анализа биологических объектов // Измерительные технологии. 2002. № 8. С. 40—45.Асланян Р.Р., Лебедева А.Ф., Бабусенко Е.С., Королев Ю.Н., Королева С.Ю. Культуры микроорганизмов как пример информационного взаимодействия // Вестн. Моск. ун-та. Сер. Биология. 2009. № 2. С. 19—25.Асланян Р.Р., Лебедева А.Ф., Бабусенко Е.С., Королев Ю.Н., Королева С.Ю. Культуры микроорганизмов как пример информационного взаимодействия // Вестн. Моск. ун-та. Сер. Биология. 2009. № 2. С. 19—25.Асланян Р.Р., Королев Ю.Н. Исследование роста культуры одноклеточных зеленых водорослей методом неинвазивного анализа // Вестн. Моск. ун-та. Сер. Биология. 2007. № 3. С. 13—16.Асланян Р.Р., Королев Ю.Н. Исследование роста культуры одноклеточных зеленых водорослей методом неинвазивного анализа // Вестн. Моск. ун-та. Сер. Биология. 2007. № 3. С. 13—16.Бинги В.Н. Физика взаимодействия живых объектов с окружающей средой. М., 2004. 230 с.Бинги В.Н. Физика взаимодействия живых объектов с окружающей средой. М., 2004. 230 с.Кудряшов Ю.Б., Петров Ю.Ф., Рубин А.Б. Радиационная биофизика: радиочастотные и микроволновые электромагнитные излучения. М.: ФИЗМАТЛИТ, 2008. 184 с.Кудряшов Ю.Б., Петров Ю.Ф., Рубин А.Б. Радиационная биофизика: радиочастотные и микроволновые электромагнитные излучения. М.: ФИЗМАТЛИТ, 2008. 184 с.Гусев М.В., Королев Ю.Н. О взаимосвязи эволюции живых систем и их открытости // Синергетика. Т. 7. Проблемы открытости сложных эволюционирующих систем. М.: МГУ, 2004. С. 150—169.Гусев М.В., Королев Ю.Н. О взаимосвязи эволюции живых систем и их открытости // Синергетика. Т. 7. Проблемы открытости сложных эволюционирующих систем. М.: МГУ, 2004. С. 150—169.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.