vestnik-bio-msuВестник Московского университета. Серия 16. БиологияVestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya0137-0952Lomonosov Moscow State University, School of Biology10.1234/XXXX-XXXX-2012-4-10-16vestnik-bio-msu-68Research ArticleБиохимияBiochemistryМОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕХАНИЗМЫ ТРАНСКРИПЦИИ ХРОМАТИНА РНК-ПОЛИМЕРАЗОЙ 3. ЧАСТЬ 2MOLECULAR MECHANISMS OF TRANSCRIPTION THROUGH CHROMATIN BY RNA POLYMERASE IIIСтудитскийВ. М.StuditskyV. M.

докт. биол. наук, зав. лабораторией регуляции транскрипции и репликации биологического факультета МГУ. Тел.: 8-495-938-22-91

studitvm@umdnj.eduОрловскийИ. В.OrlovskyI. V.

науч. сотр. лаборатории регуляции транскрипции и репликации биологического факультета МГУ. Тел.: 8-495-938-22-91

igor.orlovski@gmail.comЧертковО. В.ChertkovO. V.

науч. сотр. лаборатории регуляции транскрипции и репликации биологического факультета МГУ. Тел.: 8-495-938-22-91

o_chertkov@mail.ruЕфимоваН. С.EfimovaN. S.

аспирантка кафедры биоинженерии биологического факультета МГУ. Тел.: 8-495-938-22-91

shordome@gmail.comЛогиноваМ. А.LoginovaM. A.

аспирантка кафедры биоинженерии биологического факультета МГУ. Тел.: 8-495-938-22-91;

perhydroselenazina@gmail.comКулаеваО. И.KulaevaO. I.

канд. биол. наук, глав. научн. сотр. лаборатории эпигенетической регуляции транскрипции (Университет Ратгерса, США).

studitoi@umdnj.eduDepartment of Pharmacology, University of Medicine and Dentistry of New Jersey, 675 Hoes Lane, Room 405, Piscataway, NJ 08854, USA.Россия201220052015041016Copyright © Студитский В.М., Орловский И.В., Чертков О.В., Ефимова Н.С., Логинова М.А., Кулаева О.И., 20152015Студитский В.М., Орловский И.В., Чертков О.В., Ефимова Н.С., Логинова М.А., Кулаева О.И.Studitsky V.M., Orlovsky I.V., Chertkov O.V., Efimova N.S., Loginova M.A., Kulaeva O.I.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/68

Нуклеосома формирует “нуклеосомный барьер”, который представляет серьезное препятствие для транскрипционного аппарата. Рассмотрены исследования формирования и преодоления “нуклеосомного барьера” некоторыми видами РНК-полимераз. Показано, что для транскрипции хроматина сходные механизмы используются очень разными полимеразами. Приведены данные, свидетельствующие о сходстве механизмов транскрипционного и АТФ-зависимого ремоделирования хроматина. Предложена модель транскрипции через нуклеосому.

The nucleosome forms the so-called “nucleosome barrier”, which presents a serious obstacle to the transcription machinery. We consider the study of formation and overcoming of the “nucleosomal barrier” by different RNA polymerases. It is shown that similar mechanisms are used by very different polymerases for transcription through chromatin. We discuss the data showing a high similarity between the mechanisms of transcription through chromatin and ATP-dependent chromatin remodeling. A model of transcription through the nucleosome is proposed.

хроматинтранскрипциянуклеосома“нуклеосомный барьер”ремоделирование хроматинаэлонгацияРНК-полимераза 3.chromatintranscriptionnucleosomenucleosome barrierchromatin remodelingelongationRNA polymerase III.ReferencesBednar J., Studitsky V.M., Grigoryev S.A., Felsenfeld G., Woodcock C.L. The nature of the nucleosomal barrier to transcription: direct observation of paused intermediates by electron cryomicroscopy // Mol. Cell. 1999. Vol. 4. N 3. P. 377—386.Bednar J., Studitsky V.M., Grigoryev S.A., Felsenfeld G., Woodcock C.L. The nature of the nucleosomal barrier to transcription: direct observation of paused intermediates by electron cryomicroscopy // Mol. Cell. 1999. Vol. 4. N 3. P. 377—386.Studitsky V.M., Kassavetis G.A., Geiduschek E.P., Felsenfeld G. Mechanism of transcription through the nucleosome by eukaryotic RNA polymerase // Science. 1997. Vol. 278. N 5345. P. 1960—1963.Studitsky V.M., Kassavetis G.A., Geiduschek E.P., Felsenfeld G. Mechanism of transcription through the nucleosome by eukaryotic RNA polymerase // Science. 1997. Vol. 278. N 5345. P. 1960—1963.Gangaraju V.K., Bartholomew B. Mechanisms of ATP dependent chromatin remodeling // Mutat. Res. 2007. Vol. 618. N 1—2. P. 3—17.Gangaraju V.K., Bartholomew B. Mechanisms of ATP dependent chromatin remodeling // Mutat. Res. 2007. Vol. 618. N 1—2. P. 3—17.Cairns B.R. Chromatin remodeling: insights and intrigue from single-molecule studies // Nat. Struct. Mol. Biol. 2007. Vol. 14. N 11. P. 989—996.Cairns B.R. Chromatin remodeling: insights and intrigue from single-molecule studies // Nat. Struct. Mol. Biol. 2007. Vol. 14. N 11. P. 989—996.Studitsky V.M., Clark D.J., Felsenfeld G. A histone octamer can step around a transcribing polymerase without leaving the template // Cell. 1994. Vol. 76. N 2. P. 371—382.Studitsky V.M., Clark D.J., Felsenfeld G. A histone octamer can step around a transcribing polymerase without leaving the template // Cell. 1994. Vol. 76. N 2. P. 371—382.Oler A.J., Alla R.K., Roberts D.N., Wong A., Hollenhorst P.C., Chandler K.J., Cassiday P.A., Nelson C.A., Hagedorn C.H., Graves B.J., Cairns B.R. Human RNA polymerase III transcriptomes and relationships to Pol II promoter chromatin and enhancer-binding factors // Nat. Struct. Mol. Biol. 2010. Vol. 17. N 5. P. 620—628.Oler A.J., Alla R.K., Roberts D.N., Wong A., Hollenhorst P.C., Chandler K.J., Cassiday P.A., Nelson C.A., Hagedorn C.H., Graves B.J., Cairns B.R. Human RNA polymerase III transcriptomes and relationships to Pol II promoter chromatin and enhancer-binding factors // Nat. Struct. Mol. Biol. 2010. Vol. 17. N 5. P. 620—628.Kireeva M.L., Walter W., Tchernajenko V., Bondarenko V., Kashlev M., Studitsky V.M. Nucleosome remodeling induced by RNA polymerase II: loss of the H2A/H2B dimer during transcription // Mol. Cell. 2002. Vol. 9. N 3. P. 541—552.Kireeva M.L., Walter W., Tchernajenko V., Bondarenko V., Kashlev M., Studitsky V.M. Nucleosome remodeling induced by RNA polymerase II: loss of the H2A/H2B dimer during transcription // Mol. Cell. 2002. Vol. 9. N 3. P. 541—552.Kulaeva O.I., Gaykalova D.A., Pestov N.A., Golovastov V.V., Vassylyev D.G., Artsimovitch I., Studitsky V.M. Mechanism of chromatin remodeling and recovery during passage of RNA polymerase II // Nat. Struct. Mol. Biol. 2009. Vol. 16. N 12. P. 1272—1278.Kulaeva O.I., Gaykalova D.A., Pestov N.A., Golovastov V.V., Vassylyev D.G., Artsimovitch I., Studitsky V.M. Mechanism of chromatin remodeling and recovery during passage of RNA polymerase II // Nat. Struct. Mol. Biol. 2009. Vol. 16. N 12. P. 1272—1278.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.