2026-04-19T02:03:22Z https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/oai

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/218 2015-07-24T10:26:40Z jour:%D0%A4%D0%98%D0%97 driver

SYMBIOSIS AS A BIOLOGICAL BASIS OF INFECTION СИМБИОЗ — БИОЛОГИЧЕСКАЯ ОСНОВА ИНФЕКЦИИ O. V. Bukharin О. В. Бухарин межклеточные взаимодействия infection persistence colonizing resistance intercellular interactions межклеточные взаимодействия инфекция персистенция колонизационная резистентность межклеточные взаимодействия Symbiosis  has  been  considered as  a  biological basis  of  infectious process.   Particular attention was  paid  to  the  change of  paradigm in  symbiology   and  the  appearance of  a  novel  term  — associative   symbiosis.   Principal  structural-and-functional  elements  of  associative  symbiosis   were   estimated, and  3  vectors  of  infectious process  such  as  1)  host  — normaflora, 2)  host  — associants, 3)  associants — indigious   microflora (microsymbiocenosis) were  isolated. Functions  of  microsymbionts   that   determine  colonization  resistance  of  the   host,   and   the   formation  of  dysbioses   and pathobiocenoses were  reviewed.  Defensiability of biotopes of an  organism against  microbes is connected with  substrates  overcoming  of  which,   associants with  persistent potential  carry  out.   Basis of  interaction of  symbionts makes   up  the  change of  persistent potential  and  antagonism both   of an  infectious causative   agent  and  of  commensal microorganisms. Material was  presented to  characterize the  role  of  intercellular interactions  of  symbionts at  the  level  of  prokaryotes, proeukaryotes  under  conditions of infectious pathology. Симбиоз рассмотрен в качестве биологической основы инфекционного  процесса. Обращено внимание на  смену   парадигмы в  симбиологии и  появление  нового термина — “ас- социативный симбиоз”. Оценены основные структурно-функциональные элементы ассоциа- тивного симбиоза и  выделены 3 вектора инфекционного процесса: 1)  хозяин—нормофлора, 2)  хозяин—ассоцианты, 3)  ассоцианты—индигенная микрофлора (микросимбиоценоз). Рас- смотрены функции микросимбионтов, определяющие колонизационную резистентность хо- зяина,  формирование дисбиозов и  патобиоценозов.  Защищенность  биотопов организма от микробов связана с  субстратами, преодоление которых осуществляют ассоцианты  с  перси- стентным потенциалом. Основу взаимодействий симбионтов составляют антагонизм и изме- нение персистентного потенциала как  самого возбудителя инфекции,  так  и  комменсальных микроорганизмов. Приведен материал, характеризующий роль  межклеточных взаимодействий симбионтов на  уровне пропрокариот, проэукариот в условиях инфекционной  патологии.  Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-24 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/218 10.1234/XXXX-XXXX-2011-1-7-14 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2011); 7-14 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2011); 7-14 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2011-1 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/218/216 де Бари А.А. 1879 (цит. по: Руш К., Руш Ф.) Микробиологическая терапия. М.: Арнебия, 2003. С. 22. Маргелис Л. Роль симбиоза в эволюции клетки. М.: Мир, 1983. 352 с. Lange R. Bacterial symbiosis with plants // Symbiosis. Vol. 1 / Ed. S.M. Henry. New York: Academic Press, 1966. P. 99—170. Бухарин О.В., Лобакова Е.С., Немцева Н.В., Черкасов С.В. Ассоциативный симбиоз. Екатеринбург: УрО РАН, 2007. 264 с. Van der Vaaij. Colonial resistance of the digestive tract. Mechanism and clinical consequences // Nahrung. 1987. Vol. 31. N 5/6. P. 507—517. Усвяцов Б.Я., Карташова О.Л. Микрофлора верхних дыхательных путей человека // Экология микроорга- низмов человека. Екатеринбург: УрО РАН, 2006. С. 103—166. Tannock G.W. Role of the indigenous microbiota in health and disease // Terapeutic Microbiology / Ed. J. Versalovic, M. Wilson. Wahington, D.C.: ASM Press, 2008. P. 9—18. Карташова О.Л., Киргизова С.Б., Стадников А.А. и др. Антикарнозиновая активность стафилококков как критерий оценки их персистентного потенциала // Журн. микробиол. 2006. № 4. С. 13—16. Валышева И.В. Антилактоферриновая активность микроорганизмов: Автореф. дис. ... канд. биол. наук. Оренбург, 2005. 22 с. Валышев А.В., Гильмутдинова Ф.Г. Микробная экология пищеварительного тракта человека // Экология микроорганизмов человека. Екатеринбург: УрО РАН, 2006. С. 167—290. Ильин В.К., Воложин А.И., Виха Г.В. Колонизационная резистентность организма в измененных усло- виях обитания. М.: Наука, 2005. С. 274. Ройт А., Бристофф Дж., Мейл Д. Иммунология. М., 2000. 582 с. Петров Р.В. Иммунология. М., 1982. 368 с. Janeway C.A., Medzhitov R. 2002. Innate immune recognition // Ann. Rev. Immunol. 1982. Vol. 20. P. 197—216. Кокряков В.Н. Очерки врожденного иммунитета. СПб.: Наука, 2006. 262 с. Семенов А.В. Характеристика антагонистической активности бактерий при межмикробных взаимодействиях: Автореф. дис. ... канд.биол. наук. Оренбург, 2009. 22 с. Бухарин О.В., Валышев А.В., Иванова Е.В. и др. Взаимодействие возбудителя с ассоциативными бактерия- ми при сальмонеллезной инфекции // Журн. микробиол. 2008. № 3. С. 3—6. Сгибнев А.В. Механизмы выживания бактерий в условиях окислительного стресса и дефицита ионов же- леза // Журн. микробиол. 2006. № 4. С. 20—22. Перунова Н.Б. Характристика биологических свойств микроорганизмов в бактериальногрибковых ас- социациях кишечника человека: Автореф. дис. ... канд. мед. наук. Оренбург, 2003. 27 с. Усвяцов Б.Я, Паньков А.С., Бухарин О.В. Механизмы взаимодействия ассоциативных симбионтов при вирусо-бактериальных инфекциях // Журн. микробиол. 2009. № 2. С. 117—121. Красноперова Ю.Ю. Характеристика изменений патогенного потенциала микроорганизмов — симбион- тов в протозойно-бактериальных ассоциациях: Автореф. дис. ... докт. биол. наук. 2009. 40 с. Dziarski R. Peptidoglycan recognition in innate immunity // J. Endotoxin Res. 2005. Vol. 11. P. 304—310. Бухарин О.В., Усвяцов Б.Я., Хлопко Ю.А. Структурно-функциональная характеристика микросимбиоце- ноза человека // Журн. микробиол. 2009. № 4. С. 4—8. Гриценко В.А. Микроэкологические аспекты инфекции мочевыделительной системы // Экология микро- организмов человека. 2006. С. 389—470. Бухарин О.В., Перунова Н.Б., Эль-Регистан Г.И. и др. Влияние химического аналога внеклеточных мик- робных ауторегуляторов на антилизоцимную активность бактерий // Журн. микробиол. 2007. № 6. С. 3—6. Бухарин О.В., Перунова Н.Б., Явнова С.В. Изменение популяционной структуры бактерий по антилизоцимному признаку под влиянием гексилрезорцина // Журн. микробиол. 2008. № 6. С. 7—10. Хмель И.А. Quorum sensing: регуляция и коммуникация у бактерий // Бюл. МОИП. Отд. биол. Приложение. 2009. Т. 114. Вып. 2. С. 17—18. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1338 2024-05-15T21:48:28Z jour:RA driver

Vitamins A and E content in the tissues of the bank vole (Myodes (Clethrionomys) glareolus) and common shrew (Sorex araneus) inhabiting in Karelia Содержание витаминов A и E в тканях рыжей полевки (Myodes (Clethrionomys) glareolus) и обыкновенной бурозубки (Sorex araneus), обитающих в Карелии T. N. Ilyina I. V. Baishnikova A. E. Yakimova I. A. Zaitseva Т. Н. Ильина И. В. Баишникова А. Е. Якимова И. А. Зайцева млекопитающие vitamin E metabolism age season mammals млекопитающие витамин E метаболизм возраст сезон млекопитающие We studied the vitamins A (retinol) and E (α-tocopherol) content in the tissues of the bank vole (Myodes (Clethrionomys) glareolus) and common shrew (Sorex araneus) inhabiting the northern periphery of its range. The distribution of vitamin A in the common shrew and bank vole tissues was similar, the highest content was found in the liver, and the lowest level was in the heart. Agerelated differences in retinol content were detected in the kidneys of two species, as well as in the skeletal muscle of the shrew. Significantly lower vitamin E content was found in all organs of young shrews before wintering, compared to adult wintered animals, while in the bank vole no such age-related differences were found. Interspecies differences in the levels of vitamins A and E in the liver of overwintered animals were revealed. The results obtained show that vitamins A and E content in the tissues of the bank vole and the common shrew is determined by the metabolic processes and the ecological characteristics of the species. The vitamins level in the common shrew depends largely on age. Исследовали содержание витаминов A (ретинол) и E (α-токоферол) в тканях рыжей полевки (Myodes (Clethrionomys) glareolus) и обыкновенной бурозубки (Sorex araneus), обитающих на северной границе ареала. Распределение витамина A в тканях обоих видов было схожим, наибольшее содержание обнаруживалось в печени, наименьшее – в сердце. У обоих видов выявлены возрастные различия по уровню ретинола в почках, а также у бурозубки в скелетной мышце. Во всех органах у молодых бурозубок, которым предстояла зимовка, установлено достоверно более низкое содержание витамина E по сравнению с взрослыми зимовавшими животными, в то время как у рыжей полевки таких возрастных различий обнаружено не было. Выявлены межвидовые различия по уровню витаминов A и E в печени зимовавших зверьков. Полученные результаты показывают, что содержание витаминов A и E в тканях рыжей полевки и обыкновенной бурозубки обусловлено характером обменных процессов и экологическими особенностями видов. У обыкновенной бурозубки уровень витаминов в значительной степени зависит от возраста Lomonosov Moscow State University, School of Biology This study was carried out under state order (project № FMEN-2022-0003). Финансовое обеспечение исследований осуществлялось из средств федерального бюджета на выполнение государственного задания – тема № FMEN-2022-0003 2024-05-15 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1338 10.55959/MSU0137-0952-16-79-1-8 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 79, № 1 (2024); 72-79 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 79, № 1 (2024); 72-79 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1338/667 Сафронов В.М. Адаптивные особенности терморегуляции и поддержания энергетического баланса у мышевидных грызунов. Вестн. Том. гос. ун-та. Биология. 2009;4(8):47–61. Schaeffer P.J., O’Mara M.T., Breiholz J., Keicher L., Lázaro J., Muturi M., Dechmann D.K.N. Metabolic rate in common shrews is unaffected by temperature, leading to lower energetic costs through seasonal size reduction. R. Soc. Open Sci. 2020;7(4):191989. Gliwicz J., Taylor J.R.E. Comparing life histories of shrews and rodents. Acta Theriol. 2002;47(1):185–208. Rogovin K.A., Bushuev A.V., Khruscheva A.M., Vasilieva N.Y. Resting metabolic rate, stress, testosterone, and induced immune response in spring-and fall-born males of Campbell’s dwarf hamsters: maintenance in long-day conditions. Biol. Bull. Rev. 2014;4(3):181–191. Башенина Н.В. Пути адаптаций мышевидных грызунов. М.: Наука; 1977. 355 с. Ивантер Э.В. Очерки популяционной экологии мелких млекопитающих на северной периферии ареала. М.: Тов-во науч. изд. КМК; 2018. 770 с. Tarakhtii E.A., Davydova Yu.A. Seasonal variation in hematological indices in bank vole (Clethrionomys glareolus) in different reproductive states. Biol. Bull. 2007; 34(1):9–19. Новиков Е.А., Кондратюк Е.Ю., Петровский Д.В. Влияние типа онтогенеза на биоэнергетические показатели красной полевки (Myodes rutilus Pall) из горно-таежной популяции юга Западной Сибири. Экология. 2015;(5):387–391. Campbell K.L., Signore A.V., Harada M., Weber R.E. Molecular and physicochemical characterization of hemoglobin from the high-altitude Taiwanese browntoothed shrew (Episoriculus fumidus). J. Comp. Physiol. B. 2012;182(6):821–829. Ribot J., Felipe F., Bonet M.L., Palou A. Changes of adiposity in response to vitamin A status correlate with changes of PPARγ2 expression. Obes. Res. 2001;9(8):500–509. Sprenger R.J., Tanumihardjo S.A., Kurtz C.C. Developing a model of vitamin A deficiency in a hibernating mammal, the 13-lined ground squirrel (Ictidomys tridecemlineatus). Compar. Med. 2018;68(3):196–203. Калабухов Н.И. Спячка млекопитающих. М.: Наука; 1985. 260 с. Карасева Е.В., Телицына А.Ю., Жигальский О.А. Методы изучения грызунов в полевых условиях. М.: Изд-во ЛКИ; 2008. 416 с. Тупикова Н.В., Сидорова Г.А., Коновалова Э.Ф. Определение возраста лесных полевок. Фауна и экология грызунов. М.: Изд-во МГУ; 1970:160–167. Ивантер Э.В. Популяционная экология мелких млекопитающих таежного Северо-Запада СССР. Л.: Наука. 1975. 246 с. Оленев Г.В. Альтернативные типы онтогенеза цикломорфных грызунов и их роль в популяционной динамике (экологический анализ). Экология. 2002;(5):341–350. Оленев Г.В. Определение возраста цикломорфных грызунов, функционально-онтогенетическая детерминированность, экологические аспекты. Экология. 2009;(2):103–115. Скурихин В.Н., Двинская Л.М. Определение α-токоферола и ретинола в плазме крови сельскохозяйственных животных методом микроколоночной высокоэффективной жидкостной хроматографии. Сельскохозяйственная биология. 1989;4:127–129. Ильина Т.Н., Илюха В.А., Баишникова И.В., Белкин В.В., Сергина С.Н., Антонова Е.П. Система антиоксидантной защиты в тканях полуводных млекопитающих. Ж. эволюц. биохим. физиол. 2017;53(4):251–256. Ивантер Э.В. Опыт экологического анализа морфофизиологических особенностей мелких млекопитающих. Ученые записки Петрозаводского университета. 2018;8(177):7–16. Nieminen P., Hyvärinen H. Seasonality of leptin levels in the BAT of the common shrew (Sorex araneus). Z. Naturforsch C. J. Biosci. 2000;55(5–6):455–460. Ивантер Э.В., Ивантер Т.В., Туманов И.Л. Адаптивные особенности мелких млекопитающих: Эколого-морфологические и физиологические аспекты. Л.: Наука; 1985. 318 с. Kiselev S.V. Interannual variability in the energy reserves of Laxmann’s shrew (Sorex caecutiens) on the northern coast of the sea of Okhotsk. Biol. Bull. 2022;49(2):107–116. Соломонов Н.Г., Попов М.В. Эколого-физиологические и морфологические адаптации якутских млекопитающих к зимним условиям. Адаптация животных к зимним условиям. Под ред. В.Е Соколова. М.: Наука; 1980:109–116. Мордосов И.И., Прокопьев Н.П. Популяционная экология грызунов Лено-Вилюйского междуречья. Якутск: Изд. дом СВФУ; 2021. 264 с. Mercader J., Ribot J., Murano I., Felipe F., Cinti S., Bonet M.L., Palou A. Remodeling of white adipose tissue after retinoic acid administration in mice. Endocrinology. 2006;147(11):5325–5332. Hyvärinen H. Brown fat and the wintering of shrews. Advances in the biology of shrews. Carnegie Mus. Nat. Hist. Spec., vol 18. Eds. J.F. Merritt, G.L. Kirkland, Jr., and R.K. Rose. Pittsburgh: 1994:259–266. Keicher L., O’Mara M.T., Voigt C.C., Dechmann D.K. Stable carbon isotopes in breath reveal fast metabolic incorporation rates and seasonally variable but rapid fat turnover in the common shrew (Sorex araneus). J. Exp. Biol. 2017;220(15):2834–2841. Hissa R., Tarkkonen H. Seasonal variations in brown adipose tissue in two species of voles and the common shrew. Ann. Zool. Fenn. 1969;6:444–447. Hindle A.G, Lawler J.M, Campbell K. L, Horning M. Muscle senescence in short-lived wild mammals, the soricine shrews Blarina brevicauda and Sorex palustris. J. Exp. Zool. A Ecol. Genet. Physiol. 2009;311(5):358–367. Hollander D., Dadufalza V. Lymphatic and portal absorption of vitamin E in aging rats. Dig. Dis. Sci. 1989;34(5):768–772. Stewart J.M., Woods A.K., Blakely J.A. Maximal enzyme activities, and myoglobin and glutathione concentrations in heart, liver and skeletal muscle of the Northern Short-tailed shrew (Blarina brevicauda; Insectivora: Soricidae). Comp. Biochem. Physiol. B. 2005;141(3):267–273. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/418 2017-01-22T17:24:56Z jour:MOL-BIO driver

THE GENOME SEQUENCING AND TRANSCRIPTOMIC ASSEMBLY OF THE PARASITOID WASP MEGAPHRAGMA AMALPHITANUM (HYMENOPTERA: TRICHOGRAMMATIDAE) СЕКВЕНИРОВАНИЕ ГЕНОМА И ТРАНСКРИПТОМА МИНИАТЮРНОГО ПЕРЕПОНЧАТОКРЫЛОГО MEGAPHRAGMA AMALPHITANUM (HYMENOPTERA: TRICHOGRAMMATIDAE) E. B. Prokhortchouk A. V. Nedoluzhko F. S. Sharko S. V. Tsygankova E. S. Boulygina S. M. Rastorguev A. S. Sokolov A. M. Mazur A. A. Polilov K. G. Skryabin Е. Б. Прохорчук А. В. Недолужко Ф. С. Шарко С. В. Цыганкова Е. С. Булыгина С. М. Расторгуев А. С. Соколов А. М. Мазур А. А. Полилов К. Г. Скрябин миниатюризация genome transcriptome Megaphragma amalphitanum parasitoid wasp miniaturization миниатюризация геном транскриптом Megaphragma amalphitanum паразитический наездник миниатюризация Miniaturization of organisms is one of the most interesting evolutionary phenomena. This is a very common process, widely represented in multicellular organisms: invertebrates (nemertean, nematodes, brachiopods, mollusca, arachnids, and insects) and vertebrates (fishes, amphibians, birds, and even mammals). Miniaturization leads to a significant reduction in the body size and simplifying of some systems and organs without loss of species viability. The cell size reduce as well as genome and gene structure change during minitiaruzation. Typically, this complex evolutionary modification is associated with the occupation of ecological niches. Parasitoid wasp Megaphragma amalphitanum (Hymenoptera: Trichogrammatidae) is considered one of the smallest insects described to date and therefore is attractive as an object for studying of genetic aspects of body size reduction during evolution. The whole genome sequencing of M. amalphitanum and subsequent genome annotation and transcriptome assembly allow us to understand how the genetic material changes during miniaturization in relation to the corresponding characteristics of the larger Hymenoptera species. Preliminary analysis showed that the genome size of the M. amalphitanum is 346 Mbp; the transcriptome size is 27.5 Mbp. Миниатюризация организмов — одно из наиболее интересных эволюционных явлений. Это весьма распространенный процесс, широко представленный у многоклеточных организмов: беспозвоночных (немертины, круглые черви, брахиоподы, моллюски, паукообразные и насекомые) и позвоночных (рыбы, амфибии, птицы и даже млекопитающие). Миниатюризация приводит к значительному сокращению размеров организма и упрощению ряда систем и органов без потери жизнеспособности. Как правило, эта комплексная эволюционная модификация связана с занятием особой экологической ниши, свободной от конкурентов. В ходе этого процесса не только изменяется общий размер организма, но и уменьшаются размеры клеток, составляющих его, а также меняется структура генома и отдельных генов. Паразитический наездник Megaphragma amalphitanum (Hymenoptera: Trichogrammatidae) считается одним из мельчайших насекомых, описанных к настоящему времени, и потому представляет значительный интерес в качестве объекта для изучения генетических аспектов уменьшения размеров организмов в процессе эволюции. Секвенирование полного генома M. amalphitanum и его последующая аннотация, а также сборка транскриптома позволяют понять, насколько меняется генетический материал таких организмов при миниатюризации по сравнению с другими (более крупными) представителями отряда Hymenoptera. Предварительный анализ показал, что размер генома M. amalphitanum составляет 346 миллионов пар оснований, а размер транскриптома — 27,5 миллионов пар оснований. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2017-01-22 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/418 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 72, № 1 (2017); 35-38 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 72, № 1 (2017); 35-38 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/418/376 Grebennikov V.V., Beutel R.G. Morphology of the minute larva of Ptinella tenella, with special reference to effects of miniaturisation and the systematic position of Ptiliidae (Coleoptera: Staphylinoidea) // Arthropod Struct. Dev. 2002. Vol. 31. N 2. P. 157–172. Polilov A.A. The smallest insects evolve anucleate neurons // Arthropod Struct. Dev. 2012. Vol. 41. N 1 P. 29–34. Polilov A.A. Consequences of miniaturization in insect morphology // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2015. Vol. 70. N 3. P. 37–43. Gregory T.R., Hebert P.D., Kolasa J. Evolutionary implications of the relationship between genome size and body size in flatworms and copepods // Heredity (Edinb). 2000. Vol. 84. Pt. 2. P. 201–208. Liu S., Hui T.H., Tan S.L., Hong Y. Chromosome evolution and genome miniaturization in minifish // PLoS One. 2012. Vol. 7. N 5. e37305. Harris R.A., Tardif S.D., Vinar T., Wildman D.E., Rutherford J.N., Rogers J., Worley K.C., Aagaard K.M. Evolutionary genetics and implications of small size and twinning in callitrichine primates // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2014. Vol. 111. N 4. P. 1467–1472. Nedoluzhko A.V., Sharko F.S., Boulygina E.S., Tsygankova S.V., Sokolov A.S., Mazur A.M., Polilov A.A., Prokhortchouk E.B., Skryabin K.G. Mitochondrial genome of Megaphragma amalphitanum (Hymenoptera: Trichogrammatidae) // Mitochondrial DNA Part A. 2016.Vol. 27. N 6. P. 4526–4527. Zhang J., Kobert K., Flouri T., Stamatakis A. PEAR: a fast and accurate Illumina Paired-End reAd mergeR // Bioinformatics. 2014. Vol. 30. N 5. P. 614–620. Luo R., Liu B., Xie Y., et al. SOAPdenovo2: an empirically improved memory-efficient short-read de novo assembler // Gigascience. 2012. Vol. 1. N 1. P. 18. Haas B.J., Papanicolaou A., Yassour M., et al. De novo transcript sequence reconstruction from RNA-seq using the Trinity platform for reference generation and analysis // Nat. Protoc. 2013. Vol. 8. N 8. P. 1494–1512. Stanke M., Steinkamp R., Waack S., Morgenstern B. AUGUSTUS: a web server for gene finding in eukaryotes // Nucleic Acids Res. 2004. Vol. 32 (Web Server issue). W309–W312. Tsutsui N.D., Suarez A.V., Spagna J.C., Johnston J.S. The evolution of genome size in ants // BMC Evol. Biol. 2008. Vol. 8 : 64. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/495 2017-10-20T14:08:10Z jour:MIC driver

SECRETION OF EXTRACELLULAR PROTEINASES, ACTIVE AGAINST FIBRILLARY PROTEINS, BY MICROMYCETES СЕКРЕЦИЯ МИКРОМИЦЕТАМИ ВНЕКЛЕТОЧНЫХ ПРОТЕИНАЗ, АКТИВНЫХ ПО ОТНОШЕНИЮ К ФИБРИЛЛЯРНЫМ БЕЛКАМ E. A. Popova D. M. Bednenko A. A. Osmolovskiy V. G. Kreyer I. B. Kotova N. S. Egorov Е. А. Попова Д. М. Бедненко А. А. Осмоловский В. Г. Крейер И. Б. Котова Н. С. Егоров энзиматический индекс proteolytic activity fibrinolytic enzymes collagenolytic enzymes elastolytic enzymes enzymatic index энзиматический индекс протеолитическая активность фибринолитические ферменты коллагенолитические ферменты эластолитические ферменты энзиматический индекс Micromycetes Aspergillus ustus 1 and Tolypocladium inflatum k1 were shown to produce proteolytic enzymes with high collagenolytic, fibrinolytic and elastolytic activity. The activity of the proteinases against fibrillar proteins was determined by the cleavage of azocollagen: collagenolytic activity was 122.6•10–3 EAzc/ml (EAzc – the amount of azocollagen cleaved in 1 min in micrograms) for proteinases produced by A. ustus 1 and 69.7•10–3 EAzc/ml for proteinases produced by T. inflatum k1. The maximum activity values were observed at submerged cultivation of A. ustus 1 during 4 days, and T. inflatum k1 during 5 days. It has been shown that the maximum of collagenolytic and general proteolytic activity during the cultivation of A. ustus 1 are time-separated, unlike T. inflatum k1. This fact, presumably, can simplify the procedure for obtaining of active proteinases. Показано, что микромицеты Aspergillus ustus 1 и Tolypocladium inflatum k1 секретируют протеолитические ферменты, обладающие высокой коллагенолитической, фибринолитической и эластолитической активностью. Активность протеиназ, гидролизующих фибриллярные белки, определяемая по расщеплению азоколлагена, у T. inflatum k1 составила 122,6•10–3 ЕАзк/мл у A.ustus 1 и 69,7•10–3 ЕАзк/мл (ЕАзк – количество расщепившегося за 1 мин азоколлагена в микрограммах). Максимальные значения активности наблюдались при культивировании в глубинных условиях A. ustus 1 в течение 4 сут, а T. inflatum k1 – в течение 5 сут. Показано, что максимумы проявления коллагенолитической и общей протеолитической активности при культивировании у A. ustus 1, в отличие от T. inflatum k1, разнесены во времени, что, предположительно, может упростить процедуру получения активных по отношению к фибриллярным белкам протеиназ. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2017-10-20 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/495 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 72, № 4 (2017); 241-245 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 72, № 4 (2017); 241-245 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/495/408 Wanderley M.C. de A., Neto J.M.W.D., Filho J.L. de L., Lima C. de A., Teixeira J.A.C., Porto A.L.F. Collagenolytic enzymes produced by fungi: a systematic review // Braz. J. Microbiol. 2017. Vol. 48. N 1. P. 13–24. Kotb E. The biotechnological potential of fibrinolytic enzymes in the dissolution of endogenous blood thrombi // Biotechnol. Prog. 2014. Vol. 30. N 3. P. 656–672. Sharkova T.S., Kurakov A.V., Osmolovskiy A.A., Matveeva E.O., Kreyer V.G., Baranova N.A., Egorov N.S. Screening of producers of proteinases with fibrinolytic and collagenolytic activities among micromycetes // Microbiology. 2015. Vol. 84. N 3. P. 359–364. Rudenskaya G.N. Brachyurins, serine collagenolytic enzymes from crabs // Russ. J. Bioorg. Chem. 2003. Vol. 29. N 2. P. 101–111. Watanabe K. Collagenolytic proteases from bacteria // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2004. Vol. 63. N 5. P. 520–526. Hasan S., Ahmad A., Purwar A., Khan N., Kundan R., Gupta G. Enzymes in the entomopathogenic fungus Verticillium lecanii // Bioinformation. 2013. Vol. 9. N 5. P. 238–242. Yike I. Fungal proteases and their pathophysiological effects // Mycopathologia. 2011. Vol. 171. N 5. P. 299–323. Osmolovskiy A.A., Rukavitsyna E.D., Kreier V.G., Baranova N.A., Egorov N.S. Production of proteinases with fibrinolytic and fibrinogenolytic activity by a micromycete Aspergillus ochraceus // Microbiology. 2017. Vol. 86. N 4. P. 512–516. Gupta P., Samant K. Sahu A. Isolation of cellulosedegrading bacteria and determination of their cellullytic potential // Int. J. Microbiol. 2012. Vol. 22. Article ID 578925. Behera B.C., Parida S., Dutta S.K., Thatoi N.H. Isolation and identification of cellulose degrading bacteria from angrove soil of Mahanadi river delta and their cellulose production ability // Am. J. Microbiol. Res. 2014. Vol. 2. N 1. P. 41–46. Osmolovskiy A.A., Popova E.A., Kreyer V.G., Baranova N.A., Egorov N.S. Fibrinolytic and collagenolytic activity of extracellular proteinases of the strains of micromycetes Aspergillus ochraceus L-1 and Aspergillus ustus 1 // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2016. Vol. 71. N 1. P. 62–66. Chavira R. Jr., Burnett T.J., Hageman J.N. Assaying proteinase with Azocoll // Anal. Biochem. 1984. Vol. 136. N 2. P. 446–450. El-Aassar S.A., El-Badry H.M., Abdel-Fattah A.F. The biosynthesis of proteases with fibrinolytic activity in immobilized cultures of Penicillium chrysogenum H9 // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1990. Vol. 33. N 1. P. 26–30. Osmolovskiy A.A., Kurakov A.V., Kreyer V.G., Baranova N.A., Egorov N.S. Ability of extracellular proteinases of micromycetes Aspergillus flavipes, Aspergillus fumigatus, and Aspergillus sydowii to affect proteins of the human haemostatic system // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2017. Vol. 72. N 1. P. 20–24. Lima C.A., Viana Marques D.A., Neto B.B., Lima Filho J.L., Carneiro-da-Cunha M.G., Porto A.L.F. Fermentation medium for collagenase production by Penicillium aurantiogriseum URM4622 // Biotechnol. Prog. 2011. Vol. 27. N 5. P. 1470–1477. Егоров Н.С., Ландау Н.С., Буяк Л.И., Крейер В.Г. Гидролитическая система нокардиоформной бактерии Nocardia minima в процессе ее роста, развития и дифференциации // Микробиология. 1991. Т. 60. № 4. С. 637–643. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/128 2015-07-22T15:41:54Z jour:FF driver

THE EPIPHYTIC BRYOFLORA OF NATIONAL PARK “RUSSKY SEVER” (VOLOGDA REGION) ЭПИФИТНЫЕ МОХООБРАЗНЫЕ НАЦИОНАЛЬНОГО ПАРКА РУССКИЙ СЕВЕР (ВОЛОГОДСКАЯ ОБЛАСТЬ) E. V. Karmazina L. I. Abramova Е. В. Кармазина Л. И. Абрамова The aim of research work was to investigate epiphytic bryoflora of the National Park “Russkyi Sever” (Kyrillov district, Vologda region). The National Park “Russkyi Sever” was established in 1992 for the purpose preservation of unique natural landscape, historical and cultural monuments. The epiphytic bryoflora includes 67 species, 10 of them — liverworts (belong to 8 genus and 6 families) and 57 species — mosses (belong to 34 genus and 18 families). Aspen is the richest timber species of the epiphytic content; it was detected 45 species of epiphytic bryoflora on the aspen trees. Целью исследования явилось изучение эпифитной бриофлоры в национальном парке Русский Север (Кирилловский р-н, Вологодская обл.), организованном в 1992 г. с целью сохранения природного и историко-культурного наследия края. Список эпифитных мохообразных включает 67 видов, 10 из них — печеночные мхи, относящиеся к 8 родам и 6 семействам и 57 видов листостебельных мхов, относящихся к 34 родам и 18 семействам. Наибольшее богатство эпифитной бриофлоры обнаруживает осина, на которой произрастает 45 видов мохообразных. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-22 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/128 10.1234/XXXX-XXXX-2009-1-55-61 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2009); 55-61 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2009); 55-61 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2009-1 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/128/128 Арискина Н.П. 1978. Краткий определитель листостебельных мхов Татарской АССР. Казань. Бардунов Л.В. 1974. Листостебельные мхи Алтая и Саян. Новосибирск. Бардунов Л.В. 1978. Эпифитные мхи Южной Сибири // Флора Прибайкалья / Под ред. Л.И. Малышева, Г.А. Пешковой. Новосибирск. С. 4—18. Бардунов Л.В., Черданцева В.Я. 1982. Листостебельные мхи Южного Приморья. Новосибирск. Воробьев Ю.М. 1986. Бриофлора северо-западной части Приволжской возвышенности // Бриолихенологические исследования в СССР. Апатиты. С. 24—28. Косачева Л.А. 1970. Эпифитная флора мхов среднего Приобья (бассейн р. Чаи) // Уч. зап. Омск. пед. ин-та. Вып. 58. 81—88. Максимова В.Ф., Мухина О.А., Черданцева В.Я. 1990. Эпифитные мхи в лесах Восточного Сихотэ-Алиня // Вестн. Моск. ун-та. Сер. География. № 3. 83—90. Особо охраняемые природные территории, растения и животные Вологодской области. 1993 / Под ред. Г.А. Воробьева. Вологда. Полевая геоботаника. 1964 / Под общ. ред. Е.И. Лавренко, А.А. Корчагина. М.; Л. Растительность европейской части СССР. 1980. Л. Рыковский Г.Ф. 1970. Эпифитные мохообразные Березинского заповедника // Флористические и геоботанические исследования в Белоруссии. Минск. С. 30—37. Рыковский Г.Ф. 1989. Эпифитные мхи как экологическая группа экстремальных местообитаний // Проблемы бриологии в СССР / Под ред. И.И. Абрамова. Л. С. 190—201. Савич В.П., Савич Л.И. 1924. Краткий предварительный отчет об исследовании флоры мхов и лишайников Белоруссии летом 1923 г. // Зап. Белоруск. с.-х. ин-та. Вып. 3. 57—72. Слука З.А. 1978. Мхи-эпифиты Звенигородской биологической станции Московского университета // Науч. докл. высш. школы. Биол. науки. № 8. 84—88. Шкараба Е.М. 1970. Характеристика некоторых форм консортивных связей в лесах Северо-Западного Предуралья: Автореф. дис. ... канд. биол. наук. Пермь. Шубина Т.П., Железнова Г.В. 2002. Листостебельные мхи равнинной части средней тайги европейского Северо-Востока. Екатеринбург. Barkman J.J. 1958. Phytosociology and ecology of cryptogamic epiphytes. Including a taxonomic survey and description of their vegetation units in Europe. Assen. Ignatov M.S., Ignatova E.A., Kuray -eva E.N., Minajeva T.Yu., Potemkin A.D. 1998. Bryophyte flora of Zentralno-Lesnoj Biosphere Nature Reserve (European Russia, Tver Province) // Arctoa. 7. 45—58. Kuusinen M. 1994а. Epiphytic lichen flora and diversity on Populus tremula in old-growth and managed forests of southern and middle boreal Finland // Ann. Bot. Fenn. 31. 245—260. Kuusinen M. 1994б. Metsдtalouden vaikutus epifyyttijдkдlдlajiston monimuotoisuuteen // Metsдtalouden ecologiset vaikutukset boreaalisissa havumetsissд / Eds. Y. Haila, P. Niemelд, J. Kouki. Metsдntutkimuslaitoksen tiedonantoja. 482. 75—82. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1056 2021-12-02T11:05:01Z jour:RA driver

The effect of phytohormones on the expression of USP encoding genes in Arabidopsis thaliana seedlings Влияние фитогормонов на экспрессию генов USP в проростках Arabidopsis thaliana D. S. Gorshkova E. S. Pojidaeva Д. С. Горшкова Е. С. Пожидаева GRUSP auxins gibberellins methyl jasmonate universal stress proteins ethylene Arabidopsis thaliana GRUSP GRUSP ауксины гиббереллины метилжасмонат универсальные стрессовые белки этилен Arabidopsis thaliana GRUSP Universal stress proteins (USP) are potentially involved in the processes that control plant morphogenesis, in which phytohormones play an important role. In this study, we searched for the genes of Arabidopsis thaliana USP that modulate their expression in response to the action of phytohormones. Fifteen USP genes have been identified whose expression is differently regulated by two or more phytohormones. Moreover, the accumulation of transcripts of the most studied genes was observed under the action of hormones involved in the formation of plant resistance to stress – abscisic acid, ethylene, and methyl jasmonate. At the same time, auxins and gibberellins, hormones that regulate plant growth, suppressed the expression of the studied USP genes. The obtained results revealed potential genes of USP, whose functional activity may be directly or indirectly associated with phytohormone-dependent processes that ensure plant growth under normal and stress conditions. Универсальные стрессовые белки (Universal Stress Proteins, USP) являются потенциальными участниками процессов, контролирующих морфогенез растений, в которых важная роль отводится фитогормонам. В данном исследовании был выполнен поиск генов USP Arabidopsis thaliana, изменяющих свою экспрессию в ответ на действие фитогормонов. Выявлены 15 генов USP, экспрессия которых дифференциально регулируется двумя и более фитогормонами. Причем, накопление транскриптов у большинства из исследованных генов наблюдали при действии гормонов, участвующих в формировании устойчивости растений к стрессу – абсцизовой кислоты, этилена и метилжасмоната. В то же время ауксины и гиббереллины – гормоны, регулирующие рост растений, – подавляли экспрессию изученных генов USP. Полученные результаты выявили потенциальные гены USP, чья функциональная активность напрямую или опосредовано может быть связана с фитогормон-зависимыми процессами, обеспечивающими жизнедеятельность растений в нормальных и стрессовых условиях. Lomonosov Moscow State University, School of Biology The research was funded by the Russian Foundation for Basic Research, project no. 19-34-90017. Исследование выполнено при финансовой поддержке Российского фонда фундаментальных исследований в рамках научного проекта № 19-34-90017. Работа осуществлена без использования животных и без привлечения людей в качестве испытуемых. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов. 2021-12-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1056 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 76, № 4 (2021); 241-249 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 76, № 4 (2021); 241-249 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1056/570 Kerk D., Bulgrien J., Smith D.W., Gribskov M. Arabidopsis proteins containing similarity to the universal stress protein domain of bacteria // Plant Physiol. 2003. Vol. 131. N 3. P. 1209–1219. Nyström T., Neidhardt F.C. Expression and role of the universal stress protein, UspA, of Escherichia coli during growth arrest // Mol. Microbiol. 1994. Vol. 11. N 3. P. 537–544. Vollmer A.C., Bark S.J. Twenty-five years of investigating the universal stress protein: function, structure, and applications // Adv. Appl. Microbiol. 2017. Vol. 102. P. 1–36. Chi Y.H., Koo S.S., Oh H.T., Lee E.S., Park J.H., Phan K.A.T., Wi S.D., Bae S.B., Paeng S.K., Chae H.B., Kang C.H., Kim M.G., Kim W.-Y., Yun D.-J., Lee S.Y. The physiological functions of universal stress proteins and their molecular mechanism to protect plants from environmental stresses // Front. Plant. Sci. 2019. Vol. 10: 750. Bhuria M., Goel P., Kumar S., Singh A.K. Genomewide identification and expression profiling of genes encoding universal stress proteins (USP) identify multistress responsive USP genes in Arabidopsis thaliana // Plant Physiol. Rep. 2019. Vol. 24. N 3. P. 434–445. Jung Y.J., Melencion S.M.B., Lee E.S., Park J.H., Alinapon C.V., Oh H.T., Yun D.-J., Chi Y.N., Lee S.Y. Universal stress protein exhibits a redox-dependent chaperone function in Arabidopsis and enhances plant tolerance to heat shock and oxidative stress // Front. Plant. Sci. 2015. Vol. 6: 1141. Melencion S.M.B., Chi Y.H., Pham T.T., Paeng S.K., Wi S.D., Lee C., Ryu S.W., Koo S.S., Lee S.Y. RNA chaperone function of a universal stress protein in Arabidopsis confers enhanced cold stress tolerance in plants // Int. J. Mol. Sci. 2017. Vol. 18. N 12: 2546. Verma V., Ravindran P., Kumar P.P. Plant hormonemediated regulation of stress responses // BMC Plant Biol. 2016. Vol. 16: 86. Bhuria M., Goel P., Kumar S., Singh A.K. The promoter of AtUSP is co-regulated by phytohormones and abiotic stresses in Arabidopsis thaliana // Front. Plant. Sci. 2016. Vol. 7: 1957. Gorshkova D.S., Getman I.A., Voronkov A.S., Chizhova S.I., Kuznetsov Vl.V., Pojidaeva E.S. The gene encoding the Universal Stress Protein AtUSP is regulated by phytohormones and involved in seed germination of Arabidopsis thaliana // Dokl. Biochem. Biophys. 2018. Vol. 479. N 1. P. 105–107. Sauter M., Rzewuski G., Marwedel T., Lorbiecke R. The novel ethylene-regulated gene OsUSP1 from rice encodes a member of a plant protein family related to procaryotic universal stress proteins // J. Exp. Bot. 2002. Vol. 53. N 379. P. 2325–2331. Lee L.Y.C., Hou X., Fang L., Fan S., Kumar P.P., Yu H. STUNTED mediates the control of cell proliferation by GA in Arabidopsis // Development. 2012. Vol. 139. N 9. P. 1568–1576. Gorshkova D.S., Pojidaeva E.S. Members of the Universal Stress Protein family are indirectly involved in gibberellin-dependent regulation of germination and postgermination growth // Russ. J. Plant Physiol. 2021. Vol. 68. N 3. P. 451–462. Gorshkova D.S., Getman I.A., Sergeeva L.I., Kuznetsov Vl.V., Pojidaeva E.S. GRUSP, an universal stress protein, is involved in gibberellin-dependent induction of flowering in Arabidopsis thaliana // Dokl. Biochem. Biophys. 2021. Vol. 499. N 1. P. 233–237. Winter D., Vinegar B., Nahal H., Ammar R., Wilson G.V., Provart N.J. An “Electronic Fluorescent Pictograph” browser for exploring and analyzing large-scale biological data sets // PLoS One. 2007. Vol. 8: 718. Zentella R., Zhang Z.-L., Park M., Thomas S.G., Endo A., Murase K., Fleet C.M., Jikumaru Y., Nambara E., Kamiya Y., Sun T.-P. Global analysis of DELLA direct targets in early gibberellin signaling in Arabidopsis // Plant Cell. 2007. Vol. 19. N 10. P. 3037–3057. Uno Y., Furihata T., Abe H., Yoshida R., Shinozaki K., Yamaguchi-Shinozaki K. Arabidopsis basic leucine zipper transcription factors involved in an abscisic acid-dependent signal transduction pathway under drought and high-salinity conditions // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000. Vol. 97. N 21. P. 11632–11637. Tatematsu K., Kumagai S., Muto H., Sato A., Watahiki M.K., Harper R.M., Liscum E., Yamamotoa K.T. MAS-SUGU2 encodes Aux/IAA19, an auxin-regulated protein that functions together with the transcriptional activator NPH4/ARF7 to regulate differential growth responses of hypocotyl and formation of lateral roots in Arabidopsis thaliana // Plant Cell. 2004. Vol. 16. N 2. P. 379–393. McGrath K.C., Dombrecht B., Manners J.M., Schenk P.M., Edgar C.I., Maclean D.J., Scheible W.-R., Udvardi M.K., Kazan K. Repressorand activator-type ethylene response factors functioning in jasmonate signaling and disease resistance identified via a genome-wide screen of Arabidopsis transcription factor gene expression // Plant Physiol. 2005. Vol. 139. N 2. P. 949–959. Solano R., Stepanova A., Chao Q., Ecker J.R. Nuclear events in ethylene signaling: a transcriptional cascade mediated by ETHYLENE-INSENSITIVE3 and ETHYLENE-RESPONSE-FACTOR1 // Genes Dev. 1998. Vol. 12. N 23. P. 3703–3714. Corbineau F., Xia Q., Bailly C., El-MaaroufBouteau H. Ethylene, a key factor in the regulation of seed dormancy // Front. Plant Sci. 2014. Vol. 5: 539. Gepstein S., Sabehi G., Carp M.-J., Hajouj T., Nesher M.F.O., Yariv I., Dor C., Bassani M. Large-scale identification of leaf senescence-associated genes // Plant J. 2003. Vol. 36. N 5. P. 629–642. Song L., Liu D. Ethylene and plant responses to phosphate deficiency // Front. Plant. Sci. 2015. Vol. 6: 796. Bari R., Pant B.D., Stitt M., Scheible W.-R. PHO2, microRNA399, and PHR1 define a phosphate-signaling pathway in plants // Plant Physiol. 2006. Vol. 141. N 3. P. 988–999. Khan G.A., Vogiatzaki E., Glauser G., Poirier Y. Phosphate deficiency induces the jasmonate pathway and enhances resistance to insect herbivory // Plant Physiol. 2016. Vol. 171. N 1. P. 632–644. Mandaokar A., Dinesh Kumar V., Amway M., Browse J. Microarray and differential display identify genes involved in jasmonate-dependent anther development // Plant Mol. Biol. 2003. Vol. 52. N 4. P. 775–786. Goda H., Sawa S., Asami T., Fujioka S., Shimada Y., Yoshida S. Comprehensive comparison of auxin-regulated and brassinosteroid-regulated genes in Arabidopsis // Plant Physiol. 2004. Vol. 134. N 4. P. 1555–1573. Nakabayashi K., Okamoto M., Koshiba T., Kamiya Y., Nambara E. Genome-wide profiling of stored mRNA in Arabidopsis thaliana seed germination: epigenetic and genetic regulation of transcription in seed // Plant J. 2005. Vol. 41. N 5. P. 697–709. Reeves W.M., Lynch T.J., Mobin R., Finkelstein R.R. Direct targets of the transcription factors ABAInsensitive(ABI)4 and ABI5 reveal synergistic action by ABI4 and several bZIP ABA response factors // Plant Mol. Biol. 2011. Vol. 75. N 4–5. P. 347–363. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/160 2015-07-23T10:25:46Z jour:FF driver

INDIVIDUALITY IN TRUMPET CALLS OF HIGHLY SOCIAL CRESTED AUKLET (AETHIA CRISTATELLA) ПРОЯВЛЕНИЕ ИНДИВИДУАЛЬНЫХ ОСОБЕННОСТЕЙ В ТРИУМФАЛЬНЫХ КРИКАХ ВЫСОКОСОЦИАЛЬНОЙ БОЛЬШОЙ КОНЮГИ (AETHIA CRISTATELLA) A. V. Klenova V. A. Zubakin E. V. Zubakina А. В. Клёнова В. А. Зубакин Е. В. Зубакина чистиковые. individual recognition sound Alcidae. чистиковые. индивидуальное распознавание звук колониальные морские птицы чистиковые. Crested auklet  — unique species  of  Alcidae, how  display  complex social  behavior and  breeds in   dense   colonies  included  up   to   million  individuals.  Here   we   studied   individual  differences in  trumpet calls  — loud  vocalization, used  by auklets  as advertising display.  In  2008  and  2009  we recorded 231  calls,  from  24  marked birds  from  Talan   island  (Sea  of  Okhotsk). The  discriminant analysis,   based   on  7  parameters  of  introduction,  showed   84,8%;   and   based   on  7  parameters  of main  part  — 82,3%  of  correct assignment. Both  values  are  significantly higher  the  random  value. Our  data   suggest  that   trumpet calls  of  crested   auklets   carry  strong   individually  specific   features. Even introduction or main part is potentially sufficient for individual recognition of calling bird. We suppose that this superfluity of individually specific information is one of possible adaptation for communication in noisy environment of dense colonies: anklets need to hear only the small part ofthe trumpet cafor undbubtedTidentification of calling bird. Большая конюга — уникальный представитель семейства чистиковых, обладающий сложным   социальным  поведением  и   гнездящийся  в   плотных  колониях,   насчитывающих  до 1 млн  особей. Здесь  мы  исследуем индивидуальные особенностей в триумфальных криках — громких криках,  используемых конюгами  для  саморекламирования. В  2008  и  2009  гг.  мы записали 231 крик от 24 индивидуально опознаваемых самцов большой конюги, на  о-ве  Талан  (Охотское море). Пошаговый дискриминантный  анализ,  основанный  только на  7  параметрах   вступления,  показал 84,8%;   и  только на  7  параметрах основной  части   — 82,3% правильной классификации криков к  особи, что  существенно превышает величину случайной   классификации.  Таким  образом,  одного лишь   вступления,  также   как   и  одной  лишь основной части, достаточно для  высоко достоверного определения индивидуальности кричащей  птицы. Мы  предполагаем, что  подобная избыточность потенциала для  индивидуального распознавания  может   облегчать идентификацию  криков  большего  числа   конспецификов в  условиях плотных колоний,  где  численность  гнездящихся  птиц   может   достигать десятков  пар  на  1 м2. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-23 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/160 10.1234/XXXX-XXXX-2011-3-38-45 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 3 (2011); 38-45 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 3 (2011); 38-45 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2011-3 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/160/159 Owren M.J., Rendall D. An affect-conditioning model of nonhuman primate vocal signaling // Perspectives in Ethology Vol. 12: Communication / Eds. D.H. Owings, M.D. Beecher, N.S. Thompson. New York: Plenum, 1997. C. 299—346. Beecher M.D., Beecher I.M., Hahn S. Parent-offspring recognition in bank swallows (Riparia riparia): II. Development and acoustic basis // Anim. Behav. 1981. Vol. 29. P. 95—101. Jones I.L., Falls J.B., Gaston A.J. Vocal recognition between parents and young of ancient murrelets, Synthlibo ramphus antiquus (Aves: Alcidae) // Anim. Behav. 1987 Vol. 35. P. 1405—1415. Insley S.J., Paredes R., Jones I.L. Sex differences in razorbill Alca torda parent — offspring vocal recognition // J. Exper. Biol. 2003. Vol. 206. P. 25—31. Aubin T., Jouventin P. How to vocally identify kin in a crowd: the penguin model // Adv. Study Behav. 2002. Vol. 31. P. 243—277. Mulard H., Aubin T., White J.L.F., Hatch S.A., Danchin E. Experimental evidence of vocal recognition in young and adult black-legged kittiwakes // Anim. Behav. 2008. Vol. 76. P. 1855—1861. Hardouin L.A., Tabel P., Bretagnolle V. Neighborstranger discrimination in the little owl, Athene noctua // Anim. Behav. 2006. Vol. 72. P. 105—112. Briefer E., Aubin T., Lehongre K., Rybak F. How to identify dear enemies: the group signature in the complex song of the skylark Alauda arvensis // J. Exper. Biol. 2008. Vol. 211. P. 317—326. Beecher M.D. Signalling systems for individual recognition: an information theory approach // Anim. Behav. 1989. Vol. 18. P. 465—482. Searby A., Jouventin P. How to measure information carried by a modulated vocal signature? // J. Acoust. Soc. Am. 2004. Vol. 116(5). P. 3192—3198. Falls J.B. Individual recognition by sounds in birds // Acoustic Communication in Birds. Vol. 2 / Eds. D.H. Krodsma, E.H. Miller. New York: Academic Press, 1982. P. 237—278. Lengagne T., Lauga J., Jouventin P. A method of independent time and frequency decomposition of bioacoustics signals: inter-individual recognition in four species of penguins // C. R. Acad. Sci. Paris, 1997. Vol. 320. P. 885—891. Aubin T., Jouventin P., Hildebrand C. Penguins use the tow-voice system to recognize each other // Proc. R. Soc. Lond. 2000. Vol. 267. P. 1081—1087. Lengagne T., Lauga J., Aubin T. Intra-syllabic acoustic signatures used by the king penguin in parent-chick recognition: an experimental approach // J. Exp. Biol. 2001. Vol. 204. P. 663—672. Mathevon N., Charrier I., Jouventin P. Potential for individual recognition in acoustic signals: a comparative study of two gulls with different nesting patterns // C. R. Biologies. 2003. Vol. 326. P. 329—337. Gaston A.J., Jones I.L. The Auks. Oxford: Oxford Univ. Press, 1998. 349 p. Robisson P., Aubin T., Bremond J.C. Individuality in the voice of emperor penguin Aptenodytes forsteri: adaptation to a noisy environment // Ethology. 1993. Vol. 94. P. 279—290. Charrier I., Jouventin P., Mathevon N., Aubin T. Individual identity coding depends on call type in the South Polarskua Catharacta maccormicki // Polar Biol. 2001. Vol. 24. P. 378—382. Aubin T., Mathevon N., Staszewski V., Boulinier T. Acoustic communication in the Kittiwake Rissa tridactyla: potential cues for sexual and individual signatures in long calls // Polar. Biol. 2007. Vol. 30. P. 1027—1033. Конюхов Н.Б. Большая конюга // Птицы СССР. Чистиковые. Москва: Наука, 1990. С. 112—121. Зубакин В.А. Некоторые аспекты гнездовой биологии и социального поведения большой конюги // Изучение морских колониальных птиц в СССР. Информационные материалы / Под ред. А.Я. Кондратьева. Магадан: Институт Биологических Проблем Севера ДВО АН СССР, 1990. С. 9—13. Зубакин В.А. О социальной организации морских птиц // Методы и теоретические аспекты исследования морских птиц: Мат-лы V Всерос. школы по морской биологии / Под ред. Г.Г. Матишова. Ростов-на-Дону: Южный Научный Центр РАН, 2007. С. 180—202. Зубакин В.А., Володин И.А., Клёнова А.В., Зубакина Е.В., Володина Е.В., Лапшина Е.Н. Поведение большой конюги (Aethia cristatella, Charadriiformes, Alcidae) в период размножения: двигательные и акустические демонстрации // Зоол. журн. 2010. Т. 89. Вып. 3. С. 331—345. Харитонов С.П. Изучение структуры колоний околоводных птиц // Методы и теоретические аспекты исследования морских птиц: Мат-лы V Всерос. школы по морской биологии / Под ред. Г.Г. Матишова. Ростов-наДону: Южный Научный Центр РАН, 2007. С. 122—147. Klenova A.V., Zubakin V.A., Volodin I.A., Zubakina E.V., Volodina E.V. Behavior of the crested auklet (Aethia cristatella): vocal and visual display during a breeding season // Proc. of 36th Annual Meeting Pacific Seabird Group / Ed. V. Mendenhall. Japan, Hakodate, 2009. P. 56. Seneviratne S.S., Jones I.L., Miller E.H. Vocal repertoires of auklets (Alcidae: Aethini): structural organization and categorization // Wilson J. Ornithol. 2009. Vol. 121(3). P. 568—584. Jones I.L. Crested auklet (Aethia cristatella)// The Birds of North America, N 70. Philadelphia: The Academy of Natural Sciences; Washington: The American Ornithologists’ Union. 1993. 16 p. Griffiths R., Double M.C., Orr K., Dawson R. A DNA test to sex most birds // Molec. Ecology. 1998. Vol. 7. P. 1071—1075. Mathevon N. What parameters can be used for individual acoustic recognition by the greater flamingo? // C. R. Acad. Sci. 1996. Vol. 319. P. 29—32. Solow A.R. A randomization test for misclassification probability in discriminant analysis // Ecology. 1990. Vol. 71. P. 2379—2382. Frommolt K.-H., Goltsman M.E., Macdonald D.W. Barking foxes, Alopex lagopus: field experiments in individual recognition in a territorial mammal // Anim. Behav. 2003. Vol. 65. P. 509—518. Fisher J. Evolution and bird sociality // Evolution as a Process / Eds. J. Huxley, A.C. Hardy, E.B. Ford. London: Allen and Unwin, 1954. P. 71—83. Lengagne T., Aubin T., Lauga J., Jouven tin P. How do king penguins (Aptenodytes patagonicus) apply the mathematical theory of information to communicate in windy conditions? // Proc. R. Soc. Lond. B. 1999. Vol. 266. P. 1623—1628. Jones I.L., Konyukhov N.B., Williams J.C., Byrd G.V. Parakeet auklet (Aethia psittacula) // The Birds of North America, N 594. Philadelphia: The Academy of Natural Sciences; Washington: The American Ornithologists’ Union. 2001. 20 p. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1184 2022-11-30T10:16:20Z jour:%D0%9E%D0%98 driver

Mechanisms of the White Sea cod Gadus morhua marisalbi (Gadidae) intestinal smooth muscle cholinergic contraction: the contribution of various subtypes of M-cholinergic receptors and Rho-kinase Механизмы холинергического сокращения гладкой мускулатуры кишечника беломорской трески Gadus morhua marisalbi (Gadidae): вклад различных подтипов М-холинорецепторов и Rho-киназы A. A. Shvetsova G. V. Morgunova E. A. Novoderezhkina V. M. Potekhina A. A. Kamensky O. S. Tarasova А. А. Швецова Г. В. Моргунова Е. А. Новодережкина В. М. Потехина А. А. Каменский О. С. Тарасова Rho-киназа smooth muscle intestine acetylcholine muscarinic receptors Rho-kinase Rho-киназа гладкая мышца кишечник ацетилхолин мускари- новые холинорецепторы Rho-киназа The study of the functioning of various body systems in different vertebrates is one of the key tasks of comparative physiology. Teleost fish are a large group of vertebrates, however, the mechanisms of functioning of their digestive tract have been studied little and mainly only for such a model object as Danio rerio. The aim of this work was to characterize the participation of various subtypes of M-cholinergic receptors and the enzyme Rho-kinase in the cholinergic contraction of the intestinal smooth muscles of the White Sea cod Gadus morhua marisalbi (Gadidae). A longitudinal strip was excised from the proximal cod intestine and placed in an apparatus for recording contractile responses in the isometric mode. Contractile responses to acetylcholine were completely blocked by atropine. Blockade of M3 cholinergic receptors with 4-DAMP resulted in a decrease in acetylcholine-induced contraction compared with the control response. Blockade of M1 receptors with pirenzepine led to a weakening of contraction, less pronounced than with blockade of M3 cholinergic receptors. Blockade of M2-cholinergic receptors with methoctramine did not affect the magnitude of the contractile response. Incubation of preparations with the Rho-kinase inhibitor fasudil was accompanied by a significant decrease in contractile responses compared with the control, as well as a faster decrease in the contraction force after reaching the “peak” of the reaction. Thus, acetylcholine causes contraction of cod intestinal smooth muscle by activating M3- and M1- but not M2-cholinergic receptors. The activity of the Rho-kinase enzyme contributes to the development and maintenance of cod intestinal smooth muscle contraction under the action of acetylcholine. The results obtained are of interest for comparative physiology, may be important for understanding the mechanisms of the damaging effect of environmental factors on the bony fish’ body, as well as for the use of fish as objects of preclinical studies of drugs. Изучение особенностей функционирования различных систем организма у разных позвоночных животных является одной из ключевых задач сравнительной физиологии. Костистые рыбы – многочисленная группа позвоночных, однако механизмы функционирования их пищеварительного тракта недостаточно изучены и в основном только для такого модельного объекта как Danio rerio. Целью данной работы было охарактеризовать участие различных подтипов М-холинорецепторов и фермента Rho-киназы в холинергическом сокращении гладкой мускулатуры кишечника беломорской трески Gadus morhua marisalbi (Gadidae). Из проксимального отдела кишки вырезали продольную полоску и помещали ее в установку для регистрации сократительных ответов в изометрическом режиме. Сократительные реакции в ответ на ацетилхолин полностью блокировались атропином. Блокада М3-холинорецепторов с помощью 4-DAMP приводила к ослаблению вызванного ацетилхолином сокращения по сравнению с ответом в контроле. При блокаде М1-рецепторов с помощью пирензепина сократительные ответы также уменьшались, но менее выраженно, чем при блокаде М3-холинорецепторов. Блокада М2-холинорецепторов с помощью метоктрамина не влияла на величину сократительного ответа. Инкубация препаратов с ингибитором Rho-киназы сопровождалась существенным уменьшением сократительных реакций по сравнению с контролем, а также более быстрым снижением силы сокращения после достижения «пика» реакции. Таким образом, ацетилхолин вызывает сокращение гладкой мускулатуры кишечника трески путем активации М3 и М1, но не М2-холинорецепторов. Активность фермента Rho-киназы способствует развитию и поддержанию сокращения гладкой мускулатуры кишечника трески под действием ацетилхолина. Полученные результаты представляют интерес для сравнительной физиологии, они могут оказаться важными для понимания механизмов повреждающего влияния факторов окружающей среды на организм костистых рыб, а также при использовании рыб в доклинических исследованиях лекарственных препаратов. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2022-11-29 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1184 10.55959/MSU0137-0952-16-2022-77-4-231-240 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 77, № 4 (2022); 231-240 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 77, № 4 (2022); 231-240 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1184/604 Shahjahan M. Taslima K., Rahman M.S., Al- Emran M., Alam S.I., Faggio С. Effects of heavy metals on fish physiology – A review // Chemosphere. 2022. Vol. 300: 134519. Pasparakis C., Esbaughb A.J., Burggrenc W., Grosella M. Impacts of deepwater horizon oil on fish // Comp. Biochem. Physiol. Part – C: Toxicol. Pharmacol. 2019. Vol. 224: 108558. Cueto-Escobedo J., German-Ponciano L.J., Guillén- Ruiz G., Soria-Fregozo C., Herrera-Huerta E.V. Zebrafish as a useful tool in the research of natural products with potential anxiolytic effects // Front. Behav. Neurosci. 2022. Vol. 15: 795285. Karila P., Shahbazi F., Jensen J., Holmgren S. Projections and actions of tachykininergic, cholinergic, and serotonergic neurones in the intestine of the Atlantic cod // Cell Tissue Res. 1998. Vol. 291. N 3. P. 403–413. Olsson C., Holmgren S. Autonomic control of gut motility: A comparative view // Auton. Neurosci. Basic Clin. 2011. Vol. 165. N 1. P. 80–101. Jensen J., Holmgren S. Neurotransmitters in the intestine of the atlantic cod, Gadus morhua // Comp. Biochem. Physiol. Part – C: Toxicol. Pharmacol. 1985. Vol. 82. N 1. P. 81–89. Gómez A., Martos F., Bellido I., Marquez E., Garcia A. J., Pavia J., de la Cuesta F.S. Muscarinic receptor subtypes in human and rat colon smooth muscle // Biochem. Pharmacol. 1992. Vol. 43. N 11. P. 2413–2419. Unno T., Matsuyama H., Sakamoto T., Uchiyama M., Izumi Y., Okamoto H., Yamada M., Wess J., Komori S. M2 and M3 muscarinic receptor-mediated contractions in longitudinal smooth muscle of the ileum studied with receptor knockout mice // Br. J. Pharmacol. 2005. Vol. 146. N 1. P. 98–108. Kerr P.M., Hillier K., Wallis R.M., Garland C.J. Characterization of muscarinic receptors mediating contractions of circular and longitudinal muscle of human isolated colon // Br. J. Pharmacol. 1995. Vol. 115. N 8. P. 1518–1524. Ehlert F.J. Contractile role of M2 and M3 muscarinic receptors in gastrointestinal, airway and urinary bladder smooth muscle // Life Sci. 2003. Vol. 74. N 2–3. P. 355–366. Hu X.Q., Zhang L. Functon and regulation of large conductance Ca2+ activated K+ channel in vascular smooth muscle cells // Drug Discov. Today. 2012. Vol. 17. N 17–18. P. 974–987. Tanahashi Y., Komori S., Matsuyama H., Kitazawa T., Unno T. Functions of muscarinic receptor subtypes in gastrointestinal smooth muscle: A review of studies with receptor-knockout mice // Int. J. Mol. Sci. 2021. Vol. 22. N 2. P. 1–24. Tran J.A., Matsui M., Ehlert F.J. Differential coupling of muscarinic M1, M2, and M3 receptors to phosphoinositide hydrolysis in urinary bladder and longitudinal muscle of the ileum of the mouse // J. Pharmacol. Exp. Ther. 2006. Vol. 318. N 2. P. 649–656. Glaza I. Szadujkis-Szadurski L., Szadujkis- Szadurski R., Gajdus M., Olkowska J. Modulating activity of M1 receptor to the reaction of ileal smooth muscle // Postepy Hig. Med. Dosw. 2011. Vol. 65. P. 478–481. Menozzi A., Pozzoli C., Poli E., Bontempi G., Serventi P., Meucci V., Intorre L., Bertini S. Role of muscarinic receptors in the contraction of jejunal smooth muscle in the horse: An in vitro study // Res. Vet. Sci. 2017. Vol. 115. P. 387–392. Karaki H., Weiss G.B. Calcium release in smooth muscle // Life Sci. 1988. Vol. 42. N 2. P. 111–122. Somlyo A.P., Somlyo A.V. Ca2+ sensitivity of smooth muscle and nonmuscle myosin II: modulated by G proteins, kinases, and myosin phosphatase // Physiol. Rev. 2003. Vol. 83. N 4. P. 1325–1358. Sahin L., Cevik O.S., Koyuncu D.D., Buyukafsar K. Role of rho-kinase (ROCK) in tonic but not phasic contraction in the frog stomach smooth muscle // Life Sci. 2018. Vol. 198. P. 46–55. Loirand G., Cario-Toumaniantz C., Chardin P., Pacaud P. The Rho-related protein Rnd1 inhibits Ca2+ sensitization of rat smooth muscle // J. Physiol. 1999. Vol. 516. N 3. P. 825–834. Swärd K., Dreja K., Susnjar M., Hellstrand P., Hartshorne D.J. Walsh M.P. Inhibition of Rho-associated kinase blocks agonist-induced Ca2+ sensitization of myosin phosphorylation and force in guinea-pig ileum // J. Physiol. 2000. Vol. 522. N 1. P. 33–49. Bayguinov O., Dwyer L., Kim H., Marklew A., Sanders K. M., Koh S.D. Contribution of Rho-kinase to membrane excitability of murine colonic smooth muscle // Br. J. Pharmacol. 2011. Vol. 163. N 3. P. 638–648. Park S.Y., Song H.J., Sohn U.D. Participation of Rho-associated kinase in electrical stimulated and acetylcholine-induced contraction of feline esophageal smooth muscle // Eur. J. Pharmacol. 2009. Vol. 607. N 1–3. P. 220–225. Rattan S., Phillips B.R., Maxwell P.J. RhoA/Rho- Kinase: pathophysiologic and therapeutic implications in gastrointestinal smooth muscle tone and relaxation // Gastroenterology. 2010. Vol. 138. N 1. P. 13–18. Андрияшев А.П. Рыбы северных морей СССР. М.; Л.: Изд-во Акад. наук СССР, 1954. 567 с. Kitazawa T., Itoh K., Yaosaka N., Maruyama K., Matsuda K., Teraoka H., Kaiya H. Ghrelin does not affect gastrointestinal contractility in rainbow trout and goldfish in vitro // Gen. Comp. Endocrinol. 2012. Vol. 178. N 3. P. 539–545. Kitazawa T., Hoshi T., Chugun A. Effects of some autonomic drugs and neuropeptides on the mechanical activity of longitudinal and circular muscle strips isolated from the carp intestinal bulb (Cyprinus carpio) // Comp. Biochem. Physiol. Part – C: Toxicol. Pharmacol. 1990. Vol. 97. N 1. P. 13–24. Karila P., Holmgren S. Enteric reflexes and nitric oxide in the fish intestine // J. Exp. Biol. 1995. Vol. 198. N 11. P. 2405–2411. Harrington A.M., Peck C.J., Liu L., Burcher E., Hutson J. M., Southwell B.R. Localization of muscarinic receptors M1R, M2R and M3R in the human colon // Neurogastroenterol. Motil. 2010. Vol. 22. N 9: 999–e263. Honda K., Takano Y., Kamiya H. Pharmacological profiles of muscarinic receptors in the longitudinal smooth muscle of guinea pig ileum // Jpn. J. Pharmacol. 1993. Vol. 62. N 1. P. 43–47. Tobin G., Giglio D., Lundgren O. Muscarinic receptor subtypes in the alimentary tract // J. Physiol. Pharmacol. 2009. Vol. 60. N 1. P. 3–21. Hu J., Gao W.Y., Ma L., Man S.L., Huang L.Q., Liu C.X. Activation of M3 muscarinic receptor and Ca2+ influx by crude fraction from Crotonis Fructus in isolated rabbit jejunum // J. Ethnopharmacol. 2012. Vol. 139. N 1. P. 136–141. Harrington A.M., Hutson J.M., Southwell B.R. Cholinergic neurotransmission and muscarinic receptors in the enteric nervous system // Prog. Histochem. Cytochem. 2010. Vol. 44. N 4. P. 173–202. Uchiyama T., Chess-Williams R. Muscarinic receptor subtypes of the bladder and gastrointestinal tract // J. Smooth Muscle Res. 2004. Vol. 40. N 6. P. 237–247. Unno T., Matsuyama H., Izumi Y., Yamada M., Wess J., Komori S. Roles of M2 and M3 muscarinic receptors in cholinergic nerve-induced contractions in mouse ileum studied with receptor knockout mice // Br. J. Pharmacol. 2006. Vol. 149. N 8. P. 1022–1030. Griffin M.T., Matsui M., Ostrom R.S., Ehlert F.J. The guinea pig ileum lacks the direct, high-potency, M2-muscarinic, contractile mechanism characteristic of the mouse ileum // Naunyn. Schmiedebergs. Arch. Pharmacol. 2009. Vol. 380. N 4. P. 327–335. Griffin M.T., Ehlert F.J. Specific inhibition of isoproterenol-stimulated cyclic AMP accumulation by M2 muscarinic receptors in rat intestinal smooth muscle // J. Pharmacol. Exp. Ther. 1992. Vol. 263. N 1. P. 221–225. Reddy H., Watson N., Ford A.P.D.W., Eglen R.M. Characterization of the interaction between muscarinic M2 receptors and β-adrenoceptor subtypes in guinea-pig isolated ileum // Br. J. Pharmacol. 1995. Vol. 114. N 1. P. 49–56. North R.A., Slack B.E., Surprenant A. Muscarinic M1 and M2 receptors mediate depolarization and presynaptic inhibition in guinea-pig enteric nervous system // J. Physiol. 1985. Vol. 368. N 1. P. 435–452. Harrington A.M., Hutson J.M., Southwell B.R. Immunohistochemical localisation of cholinergic muscarinic receptor subtype 1 (M1r) in the guinea pig and human enteric nervous system // J. Chem. Neuroanat. 2007. Vol. 33. N 4. P. 193–201. Delvalle N.M., Fried D.E., Rivera-Lopez G., Gaudette L., Gulbransenet B.D. Cholinergic activation of enteric glia is a physiological mechanism that contributes to the regulation of gastrointestinal motility // Am. J. Physiol. – Gastrointest. Liver Physiol. 2018. Vol. 315. N 4. P. G473–G483. Takeuchi T., Fujinami K., Goto H., Fujita A., Taketo M.M., Manabe T., Matsui M., Hataet F. Roles of M2 and M4 muscarinic receptors in regulating acetylcholine release from myenteric neurons of mouse ileum // J. Neurophysiol. 2005. Vol. 93. N 5. P. 2841–2848. Patel C.A., Rattan S. Spontaneously tonic smooth muscle has characteristically higher levels of RhoA/ROK compared with the phasic smooth muscle // Am. J. Physiol. – Gastrointest. Liver Physiol. 2006. Vol. 291. N 5. P. 830–837. Shabir S., Borisova L., Wray S., Burdyga T. Rhokinase inhibition and electromechanical coupling in rat and guinea-pig ureter smooth muscle: Ca2+-dependent and -independent mechanisms // J. Physiol. 2004. Vol. 560. N 3. P. 839–855. Kim B.J., Jeon J.H., Kim S.J., So I. Role of calmodulin and myosin light chain kinase in the activation of carbachol-activated cationic current in murine ileal myocytes // Can. J. Physiol. Pharmacol. 2007. Vol. 85. N 12. P. 1254–1262. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/337 2016-08-01T12:25:19Z jour:BOT driver

BOTANY-COLLECTION.BIO.MSU.RU: INFORMATION SYSTEM ON PLANT MORPHOLOGY AND ANATOMY BOTANY-COLLECTION.BIO.MSU.RU: ИНФОРМАЦИОННАЯ СИСТЕМА ПО АНАТОМИИ И МОРФОЛОГИИ РАСТЕНИЙ E. E. Severova M. V. Nilova A. G. Devyatov O. A. Volkova S. R. Mayorov S. V. Polevova A. G. Platonova A. I. Rudko V. R. Filin D. M. Firnin Е. Э. Северова М. В. Нилова А. Г. Девятов О. А. Волкова С. Р. Майоров С. В. Полевова А. Г. Платонова А. И. Рудько В. Р. Филин Д. М. Фырнин база данных plants morphology anatomy palynology wood carpology information system database база данных высшие растения морфология анатомия пали- нология древесина карпология информационная система база данных The article describes open access information system (http://botany-collection.bio.msu.ru)combining digital data inferred from three collections (palynological, carpological and wood anatomy) that were accumulated during the last 70 years at the School of Biology of Lomonosov Moscow State University. Database includes both digital images and short morphological descriptions. The system has an interactive check-list of all samples that allows searching with thenames of species, genus, family and life form. Besides, each collection has a separate cataloguewith different search possibilities. Full checklists of all collections are presented as Excel files. В статье описана информационная система (http://botany-collection.bio.msu.ru), объединяющая данные по трем коллекциям (палинологической, карпологической и коллекции по анатомии древесины), созданным на кафедре высших растений биологического факультета МГУ за последние 70 лет. Цифровая база данных включает изображения объектов и их краткие морфологические описания. Система имеет общий интерактивный каталог всех введенных в систему образцов с функцией поиска по названиям видов, родов, семейств и жизненным формам. Кроме того, каждая коллекция имеет отдельный каталог образцов с функциями поиска по различным параметрам в зависимости от особенностей материала. Полные каталоги всех коллекций размещены на сайте в виде файлов Exсel. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2016-07-30 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/337 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 3 (2016); 17-19 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 3 (2016); 17-19 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/337/328 Судебно-экспертное исследование некоторых объектов биологического происхождения / Под ред. Л.В. Дроновой, Ф.А. Калашникова. М.: ВНИИСЭ, 1980. 279 с. Hall D.W., Byrd J.H. Forensic botany: a practical guide. Chichester: Wiley-Blackwell, 2012. 195 p. Erdtman’s handbook of palynology / Eds. S. Nilsson, J. Praglowski. Copenhagen: Munksgaard, 1992. 580 p. Moore P.D., Webb J.A., Collinson M.E. Pollen analysis. Oxford: Blackwell, 1991. 580 p. Erdtman G. The acetolysis method. A revised description // Svensk Bot. Tidskr. 1960. Vol. 54. P. 561–564. Барыкина Р.П., Веселова Т.Д., Девятов А.Г., Джалилова Х.Х., Ильина Г.М., Чубатова Н.В. Справочник по ботанической микротехнике. Основы и методы. М.: МГУ, 2004. 312 с. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/372 2016-10-09T19:06:57Z jour:MA driver

RESISTANCE OF RUSSIAN PHYTOPHTHORA INFESTANS STRAINS TO FUNGICIDES METALAXYL AND DIMETHOMORPH УСТОЙЧИВОСТЬ РОССИЙСКИХ ШТАММОВ PHYTOPHTHORA INFESTANS К ФУНГИЦИДАМ МЕТАЛАКСИЛ И ДИМЕТОМОРФ S. N. Elansky V. P. Apryshko D. I. Milyutina B. E. Kozlovsky С. Н. Еланский В. П. Апрышко Д. И. Милютина Б. Е. Козловский альгология algology альгология альгология In total, 2000 P. infestans isolates collected during 1988—2004 in different regions of Russia were tested for resistance to metalaxyl. In the majority of field populations frequency of resistant strains decreased after 1993—1994. Possibly it was connected with changes in potato industry in Russia: potato producing was concentrated in small private gardens. The part of resistant strains in populations from small private patches was less than at a big commercial potato fields. Small private gardens became the great source of sensitive genotypes. Last years the part of resistant strains in the majority of field populations was less than 30%. Small number of resistant strains in population occurs even if there was no treatment with metalaxyl—containing preparations during a long time. In some populations the frequency of resistant strains increased, it would be connected with treatments. A variation in the level of resistance to metalaxyl in one clonal linage is shown. Resistant strains occurred in potato leaves and tubers, in tomato leaves; they were rare in tomato fruits. Probably, the sensitive strains affecting fruits have selective advantage.More than 370 strains from different regions were tested for resistance to dimethomorph. In several fields isolates were collected after treatment with dimethomorph—containing preparations. Resistant strains were not detected. Материалы конференции “Взаимоотношения низших растений (грибов, водорослей, лишайников) с другими растениями биоценоза”. МГУ, биологический факультет, 31 января—3 февраля 2006 г. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2016-10-09 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/372 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2007); 14-18 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2007); 14-18 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/372/350 Bagirova S.F., An Zsan Li, Dolgova A.V., Elansky S.N., Shaw D.S., Dуakov Y.T. 2001. Mutants of Phytophthora infestans resistant to dimethomorph fungicide // J. Russ. Phytopathol. Soc. 2. 19-25. Cohen Y., Baider A., Cohen B. 1995. Dimethomorph activity against oomycete fungal plant pathogens // Phytopathology. 85. N 12. 1500—1506. Cohen Y., Reuveni V. 1983. Occurrence of me- talaxyl — resistant isolates of Phytophthora infestans in potato fields in Israel // Phytopathology. 73. 925—927. Davidse L.C., Danial D.L., Van Westen C.J. 1983. Resistance to metalaxyl in Phytophthora infestans in The Netherlands // Neth. J. Plant Pathol. 89. 1-20. Davidse L.C., Looijen D., Turkensteen L.J., van der Val D. 1981. Occurrence of metalaxyl — resistant strains of Phytophthora infestans in Dutch potato fields // Neth. J. Plant Pathol. 97. 65—68. Davidse L.C., Van den В e rg - Velthuis, Mantel B.C., Jespers A.B.K. 1991. Phenylamides and Phytophthora // Phytophthora. Cambridge. P. 234—241. Elansky S., Smirnov A., Dyakov Y., Dolgova A., Filippov A., Kozlovsky B., Kozlovskaya I., Russo P., Smart C., Fry W. 2001. Genotypic analysis of Russian isolates of Phytophthora infestans from the Moscow region, Siberia and Far East // J. Phytopathol. 149. N 10. 605—611. Gisi U., Cohen Y. 1996. Resistance to phenila- mide fungicides: a case study with Phytophthora infestans involving mating type and race structure // Ann. Rev. Phytopathol. 34. 549-572. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/70 2015-05-20T09:00:33Z jour:BIO driver

MODULATION OF THE RABBIT MITOCHONDRIAL ENDONUCLEASE ACTION BY S-ADENOSYL-L-METHIONINE МОДУЛЯЦИЯ ДЕЙСТВИЯ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ НУКЛЕАЗЫ КРОЛИКА S-АДЕНОЗИЛ-L-МЕТИОНИНОМ D. E. Sobolev B. F. Vanyushin Д. Е. Соболев Б. Ф. Ванюшин метилирование endonuclease G S-adenosyl-L-methionine methylation метилирование эндонуклеаза G S-аденозил-L-метионин метилирование Endonuclease activity found in rabbit liver mitochondrial extract is similar to known endonuclease G: it has an apparent molecular mass value of about 30 kDa, it depends on Mg2+ and is inhibited with Zn2+. Unlike WEN1 and WEN2 plant endonucleases it is unsensitive to DNA methylation status and inhibited with S-adenosyl-L-methionine. В экстракте из митохондрий печени кролика обнаружена эндонуклеазная активность, которая по свойствам сходна с животной эндонуклеазой G. Эта активность выявлена в белковой фракции с молекулярной массой около 30 кДа, она стимулируется ионами Mg2+ и ингибируется ионами Zn2+. В отличие от растительных эндонуклеаз WEN1 и WEN2 она не чувствительна к статусу метилирования субстратных ДНК и ингибируется S-аденозил-L-метионином. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-05-20 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/70 10.1234/XXXX-XXXX-2012-4-24-27 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 4 (2012); 24-27 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 4 (2012); 24-27 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2012-4 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/70/72 Ruiz-Carrillo A., Renaud J. Endonuclease G: a (dG)n · (dC)n-specific DNase from higher eukaryotes // EMBO Journal. 1987. Vol. 6. N 2. P. 401—407. Ohsato T., Ishihara N., Muta T., Umeda S., Ikeda S., Mihara K., Hamasaki N., Kang D. Mammalian mitochondrial endonuclease G. Digestion of R-loops and localization in intermembrane space // Eur. J. Biochem. 2002. N 269. P. 5765—5770. Davies A.M., Hershman S., Stabley G.J., Hoek J.B., Peterson J., Cahill A. ACa2+-induced mitochondrial permeability transition causes complete release of rat liver endonuclease G activity from its exclusive location within the mitochondrial intermembrane space. Identification of a novel endo-exonuclease activity residing within the mitochondrial matrix // Nucleic Acids Res. 2003. Vol. 31. N 4. P. 1364—1373. Oda K., Kawasaki N., Fukuyama M., Ikeda S. Ectopic expression of mitochondria endonuclease Pnu1p from Schizosaccharomyces Pombe induces cell death of the yeast // J. Biochem. and Mol. Biol. 2007. Vol. 40. N 6. P. 1095—1099. Balk J., Chew S.K., Leaver C.J., McCabe P.F. The intermembrane space of plant mitochondria contains a DNase activity that may be involved in programmed cell death // Plant J. 2003. N 34. P. 573—583. Loll B., Gebhardt M., Wahle E., Meinhart A. Crystal structure of the EndoG/EndoGI complex: mechanism of EndoG inhibition // Nucleic Acids Res. 2009. Vol. 37. N 21. P. 7312—7320. Widlak P., Li L.Y., Wang X., Garrard W.T. Action of recombinant human apoptotic endonuclease G on naked DNA and chromatin substrates: co operation with exonuclease and DNase I // J. Biol. Chem. 2001. Vol. 276. N 51. P. 48404—48409. Widlak P., Garrard W.T. Discovery, regulation, and action of the major apoptotic nucleases DFF40/CAD and endonuclease G // J. Cell. Biochem. 2005. N 94. P. 1078—1087. Cфtй J., Ruiz-Carrillo A. Primers for mitochondrial DNA replication generated by endonuclease G // Science. 1993. Vol. 261. N 5122. P. 765—769. Zassenhaus H.P., Denniger G. Analysis of the role of the NUC1 endo/exonuclease in yeast mitochondrialDNA recombination // Current Genetics. 1994. Vol. 25. N 2. P. 142—149. Ikeda S., Ozaki K. Action of mitochondrial endonuclease G on DNA damaged by L-ascorbic acid, peplomycin, and cis-diamminedichloroplatinum (II) // Biochem. and Biophys. Res. Comm. 1997. Vol. 235. N 2. P. 291—294. van Loo G., Schotte P., van Gurp M., Demol H., Hoorelbeke B., Gevaert K., Rodriguez I., Ruiz-Carrillo A., Vandekerckhove J., Declercq W., Beyaert R., Vandenabeele P. Endonuclease G: a mitochondrial protein released in apoptosis and involved in caspase-independent DNA degradation // Cell Death and Differentiation. 2001. Vol. 8. N 12. P. 1136—1142. Li L.Y., Luo X., Wang X. Endonuclease G is an apoptotic DNase when released from mitochondria // Nature. 2001. Vol. 412. N 6842. P. 95—99. Parrish J., Li L., Klotz K., Ledwich D., Wang X., Xue D. Mitochondrial endonuclease G is important for apoptosis in C. elegans // Nature. 2001. Vol. 412. N 6842. P. 90—94. Bьttner S., Eisenberg T., Carmona-Gutierrez D., Ruli D., Knauer H., Ruckenstuhl C., Sigrist C., Wissing S., Kollroser M., Frцhlich K.U., Sigrist S., Madeo F. Endonuclease G regulates budding yeast life and death // Mol. Cell. 2007. Vol. 25. N 2. P. 233—246. Fedoreyeva L.I., Sobolev D.E., Vanyushin B.F. Wheat endonuclease WEN1 dependent on S-adenosyl-L-methionine and sensitive to DNA methylation status // Epigenetics. 2007. Vol. 2. N 1. P. 50—53. Федореева Л.И., Соболев Д.Е., Ванюшин Б.Ф. S-Аденозил-L-метионинзависимая и чувствительная к статусу метилирования ДНК эндонуклеаза WEN2 из колеоптилей пшеницы // Биохимия. 2008. Т. 73. № 9. С. 1243—1251. Sistla S., Rao D.N. S-Adenosyl-L-methionine-dependent restriction enzymes // Critical reviews in biochemistry and molecular biology. 2004. Vol. 39. N 1. P. 1—19. Laemmli U.K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 // Nature. 1970. Vol. 227. N 5259. P. 680—685. Merril C.R., Goldman D., Sedman S.A., Ebert M.H. Ultrasensitive stain for proteins in polyacrylamide gels shows regional variation in cerebrospinal fluid proteins // Science. 1981. Vol. 211. N 4489. P. 1437—1438. Bradford M.M. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding // Anal. Biochem. 1976. Vol. 72. P. 248—254. Cummings O.W., King T.C., Holden J.A., Low R.L. Purification and characterization of the potent endonuclease in extracts of bovine heart mitochondria // J. Biol. Chem. 1987. Vol. 262. N 5. P. 2005—2015. Low R.L., Gerschenson M. Endonuclease G isolation and assays // Methods in Molecular Biology. 2002. Vol. 197. P. 331—349. Yang W. Nucleases: diversity of structure, function and mechanism // Quarterly Rev. of Biophys. 2011. Vol. 44. N 1. P. 1—93. Sir Richard J. Roberts. REBASE — The Restriction Enzyme Database. (URL: http://rebase.neb.com 01.12.2011). Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/873 2020-05-31T17:11:29Z jour:RA driver

Molecular characterization of new Crimean Plum pox virus isolates Молекулярный анализ новых крымских изолятов вируса оспы сливы A. A. Sheveleva I. V. Мitrofanova V. M. Gorina S. N. Chirkov А. А. Шевелева И. В. Митрофанова В. М. Горина С. Н. Чирков моноклональные антитела germplasm collection plum pox virus phylogenetic analysis epitope monoclonal antibody моноклональные антитела генофондовые коллекции вирус оспы сливы филогенетический анализ эпитоп моноклональные антитела Molecular analysis of new Plum pox virus (PPV) isolates found in peach, apricot, and plum cultivar collections of the Nikita botanical gardens–National scientific center of the Russian Academy of Sciences (NBS), as well as in wild myrobalans growing in the surrounding area was performed. Nineteen new PPV isolates were detected using ELISA and immunocapture reverse transcription-polymerase chain reaction. Most of them belonged to the strain D; one isolate of the strain Rec and another one belonging to the strain M were also found. 3’-terminal genomic sequences of new isolates encompassing the coat protein (CP) gene and flanking sequences of the NIb gene and 3’-untranslated region were sequenced. Phylogenetic analysis of the 3’-terminal sequences assigned PPV-D isolates to several clusters or clades. The average level of divergence of new and previously characterized Crimean PPV-D isolates was 2%. The comparatively high genetic diversity of the strain D isolates from the Crimea suggests a long-standing introduction of their ancestors to the NBS. The H23 isolate found in the apricot cultivar collection belonged to the strain M. This is the first PPV-M detection in the Crimea. The strain Rec Al-Ch isolate was revealed on a wild myrobalan tree. A K59T mutation was found in the СP of the K87 isolate (strain D), which impairs its recognition by PPV-D-specific monoclonal antibody 4DG5. Аmino acid substitutions were found in position 68 of the CP of the Al-Ch as well as previously characterized Russian K28 and Kisl-1pl strain Rec isolates. These substitutions did not affect the recognition of these isolates by PPV-M-specific monoclonal antibody AL suggesting that position 68 seems to be outside the epitope. In all likelihood, PPV entered the NBS as a result of several independent introductions of the infected stone fruit crops from various regions of the world and spread along the plantings by aphids. Проведен молекулярный анализ новых изолятов вируса оспы сливы (Plum pox virus, PPV), обнаруженных в генофондовых коллекциях персика, абрикоса и сливы Никитского ботанического сада – Национального научного центра РАН (НБС), а также на дикорастущих деревьях алычи на прилегающей территории. Методами иммуноферментного анализа и полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией выявлено 19 новых изолятов PPV. Большинство принадлежало к штамму D; найдено также по одному изоляту штаммов Rec и М. Секвенированы 3’-концевые последовательности генома новых изолятов, включающие ген белка оболочки (БО) и примыкающие последовательности гена NIb и 3’-нетранслируемого региона. При филогенетическом анализе этих последовательностей изоляты PPV-D распределялись в несколько кластеров или клад. Средний уровень дивергенции между последовательностями крымских изолятов PPV-D составил 2,0%. Сравнительно высокий уровень генетической изменчивости указывает на давнюю интродукцию предков нынешних изолятов PPV-D в НБС. Изолят Н23, выявленный в коллекции абрикоса, принадлежал к штамму М. Это первое обнаружение PPV-M в Крыму. Изолят AL-Ch (штамм Rec) обнаружен на дикорастущей алыче. В БО изолята К87 (штамм D) обнаружена мутация К59Т, которая препятствует его распознаванию PPV-D-специфичными моноклональными антителами 4DG5. В БО Al-Ch и охарактеризованных ранее изолятов K28 и Kisl-1pl (штамм Rec) обнаружены аминокислотные замены в позиции 68, которые не влияли на распознавание этих изолятов моноклональными антителами AL. По-видимому, позиция 68 находится за пределами PPV-M/Rec-специфичного эпитопа. Результаты работы показывают, что, по всей вероятности, PPV проник в НБС с зараженным материалом косточковых культур в результате нескольких независимых интродукций из различных регионов мира и распространился по насаждениям тлями. Lomonosov Moscow State University, School of Biology Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда (проект № 19-16-00091). 2020-05-31 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/873 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 75, № 2 (2020); 93-99 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 75, № 2 (2020); 93-99 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/873/511 Cambra M., Boscia D., Myrta A., Llacer G. Plum pox virus and estimated cost associated with Sharka disease // Bull. OEPP/EPPO Bull. 2006. Vol. 36. N 2. P. 202–204. Revers F., Garcia J.A. Molecular biology of potyviruses // Adv. Virus Res. 2015. Vol. 92. P. 101–199. Rimbaud L., Dallot S., Gottwald T., Decroocq V., Jacquot E., Soubeyrand S., Thebaud G. Sharka epidemiology and worldwide management strategies: learning lessons to optimize disease control in perennial plants // Annu. Rev. Phytopathol. 2015. Vol. 53. P. 17.1–17.22. Garcia J.A., Glasa M., Cambra M., Candresse T. Plum pox virus and sharka: a model potyvirus and a major disease // Mol. Plant Pathol. 2014. Vol. 15. N 3. P. 226–241. Mitrofanova I., Mitrofanova O., Chirkov S., Lesnikova-Sedoshenko N., Chelombit S. Detection and identification of Plum pox virus on Prunus species in Crimea // Agriculture and Forestry. 2015. Vol. 61. N 4. P. 197–204. Chirkov S., Ivanov P., Sheveleva A., Kudryavtseva A., Prikhodko Y., Mitrofanova I. Occurrence and characterization of plum pox virus strain D isolates in European Russia and Crimea // Arch. Virol. 2016. Vol. 161. N 2. P. 425–430. Mitrofanova I.V., Mitrofanova O.V., Lesnikova-Sedoshenko N.P., Ivanov P.A., Sheveleva A.A., Chirkov S.N. Three highly divergent groups of Plum pox virus strain D isolates coexist in stone-fruit plantings of Nikita Botanical Gardens, Crimea // Acta Hortic. 2017. Vol. 1163. P. 117–122. Chirkov S., Ivanov P., Sheveleva A., Kudryavtseva A., Mitrofanova I. Molecular characterizarion of Plum pox virus Rec isolates from Russia suggests a new insight into evolution of the strain // Virus Genes. 2018. Vol. 54. N 2. P. 328–332. Wetzel T., Candresse T., Macquaire G., Ravelonandro M., Dunez J. A highly sensitive immunocapture polymerase chain reaction method for Plum pox virus detection // J. Virol. Meth. 1992. Vol. 39. N 1–2. P. 27–37. Olmos A., Cambra M., Dasi M.A., Candresse T., Esteban O., Gorris M.T., Asensio M. Simultaneous detection and typing of Plum pox potyvirus (PPV) isolates by heminested PCR and PCR-ELISA // J. Virol. Meth. 1997. Vol. 68. N 2. P. 127–137. Šubr Z., Pittnerova S., Glasa M. A simplified RT-PCR-based detection of recombinant Plum pox virus isolates // Acta Virologica. 2004. Vol. 48. N 3. P. 173–176. Wallis C.M., Stone A.L., Sherman D.J., Damsteegt V.D., Gildow F.E., Schneider W.L. Adaptation of plum pox virus to a herbaceous host (Pisum sativum) following serial passages // J. Gen. Virol. 2007. Vol. 88. N 10. P. 2839–2845. Matic S., Elmaghrabi I., Law V., Varga A., Reed C., Myrta A., James D. Serological and molecular characterization of isolates of Plum pox virus strain El Amar to better understand its diversity, evolution, and unique geographic distribution // J. Plant Pathol. 2011. Vol. 93. N 2. P. 303–310. Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets // Mol. Biol. Evol. 2016. Vol. 33. N 7. P. 1870–1874. Boscia D., Zeramdini H., Cambra M., Potere O., Gorris M.T., Myrta A., Di Terlizzi B., Savino V. Production and characterization of a monoclonal antibody specific to the M serotype of plum pox potyvirus // Eur. J. Plant Pathol. 1997. Vol. 103. N 5. P. 477–480. Cambra M., Asensio M., Gorris M.T., Perez E., Camarasa T., Garcia J.A., Moya J.J., Lopez-Abella D., Vela C., Sanz A. Detection of plum pox potyvirus using monoclonal antibodies to structural and non-structural proteins // Bull. OEPP/EPPO Bull. 1994. Vol. 24. N 3. P. 569–577. Schneider W.L., Damsteegt V.D., Gildow F.E., Stone A.L., Sherman D.J., Levy L.E., Mavrodieva V., Richwine N., Welliver R., Luster D.G. Molecular, ultrastructural, and biological characterization of Pennsylvania isolates of Plum pox virus // Phytopathology. 2011. Vol. 101. N 5. P. 627–636. Dallot S., Glasa M., Jevremovic D., Kamenova I., Paunovic S., Labonne G. Mediterranean and central-eastern European countries host viruses of two different clades of Plum pox virus strain M // Arch. Virol. 2011. Vol. 156. N 3. P. 539–542. Gurсan K., Teber S., Caglayan K. Further investigation of a genetically divergent group of plum pox virus-M strain in Turkey // J. Plant Pathol. 2019. Vol. 101. N 2. P. 385–391. Candresse T., Saenz P., Garcia J. A., Boscia D., Navratil M., Gorris M.T., Cambra M. Analysis of the epitope structure of Plum pox virus coat protein // Phytopathology. 2011. Vol. 101. N 5. P. 611–619. Matic S., Rwahnih M., Myrta A. Diversity of Plum pox virus isolates in Bosnia and Herzegovina // Plant Pathol. 2006. Vol. 55. N 1. P. 11–17. Glasa M., Palkovics L., Kominek P., Labonne G., Pittnerova S., Kudela O., Candresse T., Subr Z. Geographically and temporally distant natural recombinant isolates of Plum pox virus (PPV) are genetically very similar and form a unique PPV subgroup // J. Gen. Virol. 2004. Vol. 85. N 9. P. 2671–2681. Gurcan K., Teber S., Candresse T. Genetic analysis suggests a long and largely isolated evolutionary history of plum pox virus strain D in Turkey // Plant Pathol. 2020. Vol. 69. N 2. P. 370–378. Приходько Ю.Н., Живаева Т.С., Шнейдер Ю.А. Скрининговые методы выявления комплекса штаммов вируса шарки слив (PPV) // Садоводство и виноградарство. 2019. № 1. C. 36–42. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/102 2015-06-01T12:28:03Z jour:GR driver

INFLUENCE OF SEVERAL BIOLOGICAL AND SOCIAL FACTORS ON THE RATES OF AGING AND WOMEN LIFESPAN ON THE EXAMPLE OF THE CASE STUDY OF TIRASPOL LONG LIVERS ВЛИЯНИЕ НЕКОТОРЫХ БИОСОЦИАЛЬНЫХ ФАКТОРОВ НА ТЕМПЫ СТАРЕНИЯ И ПРОДОЛЖИТЕЛЬНОСТЬ ЖИЗНИ ЖЕНЩИН (НА ПРИМЕРЕ ИЗУЧЕНИЯ ДОЛГОЖИТЕЛЕЙ г. ТИРАСПОЛЬ) N. E. Lapshina M. A. Negasheva R. V. Okushko Н. Е. Лапшина М. А. Негашева Р. В. Окушко демография longevity aging demography демография долгожительство старение демография In this study we investigated influence of biological factors (e.g. number of kids, age of first delivery, age of reaching menarche and climax, life-span of their parents) and social (e.g. place of living, nature of work) on rates of aging of elderly and long-living women in Transnistria (Tiraspol). Biological age and rates of aging were evaluated using “Ageing Diagnostics” software, which includes a set of functional characteristics for cardio-vascular, respiratory, neuromuscular system and other data. For long-living women, later terms of the first delivery and longer reproductive period are typical. As for the social factors, the closest relation with the rate of aging and life-span is noted for the character of professional activity: for women involved in work with high physical load, accelerated aging rates are usual. Исследовано влияние ряда биологических (количество детей, возраст рождения первого ребенка, возраст наступления первых менструаций и климакса, продолжительность жизни родителей) и социальных факторов (место жительства, характер трудовой деятельности) на темпы старения женщин пожилого возраста и долгожительниц Приднестровья (г. Тирасполь). Оценка биологического возраста и темпов старения проводилась с помощью компьютеризированной программы “Диагностика старения”, включающей набор маркеров функционирования сердечно-сосудистой, дыхательной, нейромышечной систем и др. Для долгожительниц характерны более поздние сроки первых родов и более длительный репродуктивный период. Из социальных факторов наибольшая связь с темпами старения и продолжительностью жизни отмечена для характера трудовой деятельности: для женщин, занимающихся трудом с высокой физической нагрузкой, характерны ускоренные темпы старения. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-06-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/102 10.1234/XXXX-XXXX-2014-4-20-24 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 4 (2014); 20-24 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 4 (2014); 20-24 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2014-4 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/102/103 Анисимов В.Н. Молекулярные и физиологические механизмы старения. Т. 1. СПб.: Наука, 2008. 482 с. Москалёв А.А. Старение и гены. СПб.: Наука, 2008. 358 с. Фролькис В.В. Старение и биологические возможности организма. М.: Наука, 1975. 272 с. Хрисанфова Е.Н. Основы геронтологии (антропологические аспекты). М.: Владос, 1999. 151 с. Crews D.E., Garruto R.M. Biological anthropology and aging: Perspectives on human variation over the life span. Oxford: Oxford Univ. Press, 1994. 445 p. Dilman V.M. Development, Aging, and Disease: A New Rationale for an Intervention Strategy. Harwood Academic Publ., 1994. 387 p. Gavrilova N.S., Gavrilov L.A., Severin F.F., Skulachev V.P. Testing predictions of the programmed and stochastic theories of aging: comparison of variation in age at death, menopause, and sexual maturation // Biochemistry (Mosc). 2012. Vol. 77. N 7. P. 754—760. Hayflick L. How and why we age // Exp. Gerontol. 1998. Vol. 33. P. 639—653. Olovnikov A.M. Telomeres, telomerase and aging: origin of the theory // Exp. Gerontol. 1996. Vol. 31. P. 443—448. Perls T., Kunkel L.M., Puca A.A. The genetics of aging // Curr. Opin.Genet. Dev. 2002. Vol. 12. N 3. P. 362—369. Perls T., Kunkel L.M., Puca A.A. The genetics of exceptional human longevity // J. Am. Geriatr. Soc. 2002. Vol. 50. N 2. P. 359—368. Sanders J.L., Minster R.L., Barmada M.M., Matteini A.M., Boudreau R.M., Christensen K., Mayeux R., Borecki I.B., Zhang Q., Perls T., Newman A.B. Heritability of and mortality prediction with a longevity phenotype: the healthy aging index // J. Gerontol. A Biol. Sci. Med. Sci. 2014. Vol. 69. N 4. P. 479—485. Schulz-Aellen M.-F. Aging and human longevity. Boston: Birkhauser, 1997. 283 p. Абхазское долгожительство / Под ред. В.И. Козлова. М.: Наука, 1987. 293 с. Franceschi C. et al. Genetics of healthy aging in Europe: the EU-integrated project GEHA (Genetics of Healthy Aging) // Ann. N.Y. Acad. Sci. 2007. Vol. 1100. P. 21—45. Cevenini E., Cotichini R., Stazi M.A., Toccaceli V., Palmas M.G., Capri M., De Rango F., Dato S., Passarino G., Jeune B., Franceschi C.; GEHA Project Consortium. Health status and 6 years survival of 552 90+ Italian sib-ships recruited within the EU Project GEHA (Genetics of Healthy Ageing) // Age (Dordr). 2014. Vol. 36. N 2. P. 949—966. Arbeev K.G., Akushevich I., Kulminski A.M., Arbeeva L.S., Akushevich L., Ukraintseva S.V., Culminskaya I.V., Yashin A.I. Genetic model for longitudinal studies of aging, health, and longevity and its potential application to incomplete data // J. Theor. Biol. 2009. Vol. 258. N 1. P. 103—111. Yashin A.I., Akushevich I.V., Arbeev K.G., Akushevich L., Ukraintseva S.V., Kulminski A. Insights on aging and exceptional longevity from longitudinal data: novel findings from the Framingham Heart Study // Age (Dordr). 2006. Vol. 28. N 4. P. 363—374. Yu P., Song X., Shi J., Mitnitski A., Tang Z., Fang X., Rockwood K. Frailty and survival of older Chinese adults in urban and rural areas: results from the Beijing Longitudinal Study of Aging // Arch. Gerontol. Geriatr. 2012. Vol. 54. N 1. P. 3—8. Busse A., Bischkopf J., Riedel-Heller S.G., Angermeyer M.C. Mild cognitive impairment: prevalence and incidence according to different diagnostic criteria. Results of the Leipzig Longitudinal Study of the Aged (LEILA75+) // Br. J. Psychiatry. 2003. Vol. 182. P. 449—454. Then F.S., Luck T., Luppa M., Thinschmidt M., Deckert S., Nieuwenhuijsen K., Seidler A., Riedel-Heller S.G. Systematic review of the effect of the psychosocial working environment on cognition and dementia // Occup. Environ. Med. 2014. Vol. 71. N 5. P. 358—365. Голубева Е.Ю., Данилова Р.И. Характеристика темпов старения у лиц пожилого возраста на европейском севере России // Усп. геронтол. 2012. Т. 25. № 1. С. 45—48. Bulpitt C.J. Assessing biological age: practicality? // Gerontology. 1995. Vol. 41. N 6. P. 315—321. Crews D.E. Senescence, aging, and disease // J. Physiol. Anthropol. 2007. Vol. 26. N 3. P. 365—372. Dean W., Anacker P.C., Kaufman R.C., Weber H.U. Biological aging measurement: Clinical applications. Los Angeles: Center for Bio-Gerontology, 1988. 426 p. Медведев Н.В., Горшунова Н.К. Значение определения биологического возраста в оценке адаптационных резервов организма при старении // Усп. совр. естествознания. 2007. № 12. С. 148—149. Серова Л.Д., Серова Н.Д., Терешина Е.В., Юрина Т.М., Шабалин В.Н. Медико-социальные характеристики долгожителей Москвы и ветеранов Великой Отечественной войны // Усп. геронтол. 2011. Т. 24. № 3. С. 505—510. Hughes V., Frontera W., Roubenoff R., Evans W., Singh M. Longitudinal changes in body composition in older men and women: role of body weight change and physical activity // Am. J. Clin. Nutr. 2002. Vol. 76. N 2. P. 473—481. Донцов В.И., Крутько В.Н., Гаврилов М.А. Системный подход к количественной диагностике старения человека с применением компьютерной системы “Диагностика старения” // Системный анализ и управление в биомедицинских системах. 2010. Т. 9. №. 2. С. 381—387. Назаренко Г.И., Героева И.Б., Кузнецов Е.А., Негашева М.А., Глушков В.П. Новые компьютерные технологии в оценке биологического возраста // Клин. геронт. 2005. Т. 11. № 7. С. 62—67. Татаринова О.В., Никитин Ю.П. Некоторые демографические показатели старения и долгожительства в Якутии // Усп. геронтол. 2008. Т. 21. № 4. С. 525—534. Le Bourg Й. Does reproduction decrease longevity in human beings? // Ageing Res. Rev. 2007. Vol. 6. N 2. P. 141—149. Henretta J.C. Early childbearing, marital status, and women’s health and mortality after age 50 // J. Health Soc. Behav. 2007. Vol. 48. N 3. P. 254—266. Данилов А.Н., Шульдяков В.А., Малинова Л.И., Ахмадулина Л.Г., Денисова Т.П. Старение и долгожительство населения Поволжского региона // Саратовский науч.-мед. журн. 2012. Т. 8. № 2. С. 242—247. Gagnon A., Smith K.R., Tremblay M., Vйzina H., Parй P.P., Desjardins B. Is there a trade-off between fertility and longevity? A comparative study of women from three large historical databases accounting for mortality selection // Am. J. Hum. Biol. 2009. Vol. 21. N 4. P. 533—540. McArdle P.F., Pollin, T.I., O’Connell J.R., Sorkin J.D., Agarwala R., Schдffer A.A., Mitchell B.D. Does having children extend life span? A genealogical study of parity and longevity in the Amish // J. Gerontol. A Biol. Sci. Med. Sci. 2006. Vol. 61. N 2. P. 190—195. Smith K.R., Mineau G.P., Bean L.L. Fertility and post-reproductive longevity // Biodemography Soc. Biol. 2002. Vol. 49. N 3—4. P. 185—205. Westendorp R.G.J., Kirkwood T.B.L. Human longevity at the cost of reproductive success // Nature. 1998. Vol. 396. N 6713. P. 743—746. Gavrilov L.A., Gavrilova N.S. Is there a reproductive cost for human longevity? // J. Anti Aging Med. 1999. Vol. 2. N 2. P. 121—123. Palmer J.R., Rosenberg L., Wise L.A., Horton N.J., Adams-Campbell L.L. Onset of natural menopause in African American women // Am. J. Public. Health. 2003. Vol. 93. N 2. P. 299—306. Thomas F., Renaud F., Benefice E., De Meeьs T., Guegan J.F. International variability of ages at menarche and menopause: patterns and main determinants // Hum. Biol. 2001. Vol. 73. N 2. P. 271—290. Whelan E.A., Sandler D.P., McConnaughey D.R., Weinberg C.R. Menstrual and reproductive characteristics and age at natural menopause // Am. J. Epidemiol. 1990. Vol. 131. N 4. P. 625—632. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/967 2021-03-06T12:16:09Z jour:RA driver

Subcutaneous and visceral fat indices and their relationship with the complex of endogenous and exogenous factors in the group of adult population of the Altai Republic Индексы подкожного и висцерального жироотложения и их связь с комплексом эндогенных и экзогенных факторов в группе взрослого населения Республики Алтай A. N. Rokkina A. E. Pravednikova Yu. V. Shidlovskii E. V. Popova L. V. Zadorozhnaya I. A. Khomyakova А. Н. Роккина А. Э. Праведникова Ю. В. Шидловский Е. В. Попова Л. В. Задорожная И. А. Хомякова физическая нагрузка local impedancemetry visceral fat UCP anthropometry physical activity физическая нагрузка локальная импедансометрия висцеральный жир UCP антропометрия физическая нагрузка The aim of the study was to analyze the association between complex of anthropogenetic and environmental factors with subcutaneous and visceral fat indices measured by local configurations of bioimpedance analysis in group of ethnic Altaians. In this study we examined whether anthropogenetic and environmental factors contributed to subcutaneous (SFI) and visceral fat indexes (FVI) measured by local configurations of bioimpedance analysis among ethnic Altaians. The study included 110 relatively healthy participants aged 17 to 35 years; 48 were female (44%). The examination program included anthropometric measurements, buccal swabs collection for genetic analysis (UCP1-3, rs1800592, rs660339, rs1800849) and body composition assessment by using bioelectrical impedance analysis (ABC-02 “Medass”), which was applied using a conventional whole-body «wrist-to-ankle» measurement configuration and two local measurement configurations in the abdominal region for the assessment of subcutaneous and visceral fat. Significant gender-related differences were found in the most morphological and functional characteristics. Maximal correlations were shown for subcutaneous and visceral fat indexes with WHtR and body fat percentage. Endogenous factors such as sex, age and genotype were not found to have significant effect on SFI and VFI in the examined group. Informative feature selection was performed by random forest and Boruta algorithm and WHtR and body fat percentage were revealed as the key predictors of abdominal fat deposition indexes. Проведен анализ связей комплекса антропогенетических и средовых факторов со значениями индексов подкожного и висцерального жироотложения, определяемых в локальных отведениях биоимпедансного анализа в группе взрослых мужчин и женщин – этнических  алтайцев.  Было  обследовано  110  «условно  здоровых»  мужчин  (62) и женщин (48) – представителей коренных народов Алтая – в возрасте от 17 до 35 лет. Программа обследования включала антропометрическое обследование, определение состава тела с использованием биоимпедансометрии (анализатор АВС-02 «Медасс»), измерение локальных импедансов в абдоминальной области, определение генотипов по полиморфным системам генов разобщающих белков UCP1-3. Показан половой диморфизм по большинству исследованных морфофункциональных признаков. Для индексов подкожного и висцерального жироотложения выявлен высокий уровень корреляционной зависимости с индексом центрального ожирения и долей жировой массы тела. Эндогенные признаки пол, возраст и число «бережливых» аллелей генов разобщающих белков 1-3 не оказывают значимого влияния на индексы подкожного и висцерального жироотложения в обследованной  группе  лиц  молодого  возраста (17–35 лет). В результате отбора информативных признаков с помощью метода случайного леса и алгоритма «Boruta» было выявлено, что ведущими предикторами, ассоциированными с абдоминальной топографией жироотложения в обследованной группе, являются WHtR (Waist-to-height ratio – отношение обхвата талии к длине тела) и %ЖМ (процент жировой массы в организме). Lomonosov Moscow State University, School of Biology The research was funded by Russian Foundation for Basic Research (project numbers 18-09-00258, 18-59-94015, 20-49-040004 r_a) and was performed under the state assignment of Moscow State University (project number 19-119013090163-2). Работа выполнена при финансовой поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (№№18-09-00258, 18-59-94015, 20-49-040004 р_а), также плановой темы НИР № АААА-А19-119013090163-2 «Антропология евразийских популяций» МГУ. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов. Протоколы исследования были утверждены локальным комитетом по биоэтике биологического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова (№ 91-о от 24.05.2018 г.). 2021-03-06 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/967 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 76, № 1 (2021); 33-40 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 76, № 1 (2021); 33-40 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/967/544 Официальный сайт Всемирной организации здравоохранения [Электронный ресурс]. 2020. URL: https://www.who.int/ru/news-room/fact-sheets/detail/obesity-and-overweight (дата обращения: 25.08.2020). Ibrahim M.M. Subcutaneous and visceral adipose tissue: structural and functional differences // Obes. Rev. 2010. Vol. 11. N 1. P. 11–18. Tanaka T., Kishi S., Ninomiya K., Tomii D., Koseki K., Sato Y., Okuno T., Sato K., Koike H., Yahagi K., Komiyama K., Aoki J., Tanabe K. Impact of abdominal fat distribution, visceral fat, and subcutaneous fat on coronary plaque scores assessed by 320-row computed tomography coronary angiography // Atherosclerosis. 2019. Vol. 287. P. 155–161. Jialal I., Devaraj S. Subcutaneous adipose tissue biology in metabolic syndrome // Horm. Mol. Biol. Clin. Investig. 2018. Vol. 33. N 1. DOI: 10.1515/hmbci-2017-0074. Scharfetter H., Schlager T., Stollberger R., Felsberger R., Hutten H., Hinghofer-Szalkay H. Assessing abdominal fatness with local bioimpedance analysis: basics and experimental findings // Int. J. Obes. Relat. Metab. Disord. 2001. Vol. 25. N 4. P. 502–511. Ryo M., Maeda K, Onda T., Katashima M., Okumiya A., Nishida M., Yamaguchi T., Funahashi T., Matsuzawa Y., Nakamura T., Shimomura I. A new simple method for the measurement of visceral fat accumulation by bioelectrical impedance // Diabetes Care. 2005. Vol. 28. N 2. P. 451–453. Соловьева А. Е., Гиль-Ордонес Э., Гонзалес-Корреа К. Х., Руднев С. Г. Применение локальной импедансометрии для оценки подкожного и висцерального жироотложения в абдоминальной области у студентов вуза // Морфология. 2019. Т. 156. № 4. С. 85–90. Sámano R., Huesca-Gómez C., López-Marure R., Hernández-Cabrera A. K., Rodríguez-Ventura A., Tolentino M., Morales R. M., Gamboa R. Association between UCP polymorphisms and adipokines with obesity in Mexican adolescents // J. Pediatr. Endocrinol. Metab. 2018. Vol. 31. N 5. P. 561–568. Pravednikova A. E., Shevchenko S. Y., Kerchev V. V., Kerchev V. V., Skhirtladze M. R., Larina S. N., Kachaev Z. M., Egorov A. D., Shidlovskii Y. V. Association of uncoupling protein (Ucp) gene polymorphisms with cardiometabolic diseases // Mol. Med. 2020. Vol. 26. N 1: 51. Brondani L. A., Assmann T. S., de Souza B. M., Bouças A. P., Canani L. H., Crispim D. Meta-analysis reveals the association of common variants in the uncoupling protein (UCP) 1-3 genes with body mass index variability // PLoS One. 2014. Vol. 9. N 5: e96411. Salopuro T., Pulkkinen L., Lindström J., Kolehmainen M., Tolppanen A. M., Eriksson J. G., Valle T. T., Aunola S., Ilanne-Parikka P., Keinänen-Kiukaanniemi S., Tuomilehto J., Laakso M., Uusitupa M. Variation in the UCP2 and UCP3 genes associates with abdominal obesity and serum lipids: the Finnish Diabetes Prevention Study // BMC Med. Genet. 2009. Vol. 10. N 1: 94. Официальный сайт Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Алтай [Электронный ресурс]. 2006—2015. URL: http://04.rospotrebnadzor.ru/index.php/press-center/healthylifestyle/11171-12082019.html (дата обращения: 25.08.2020). Хомякова И. А., Балинова Н. В. Антропологические исследования в Республике Алтай: предварительный анализ морфологических особенностей северных и южных алтайцев // Вестн. Моск. ун-та. Сер. 23. Антропол. 2017. № 4. С. 28–41. Негашева М. А. Основы антропометрии. М.: Экон-Информ, 2017. 216 с. Николаев Д. В., Смирнов А. В., Бобринская И. Г., Руднев С. Г. Биоимпедансный анализ состава тела человека. М.: Наука, 2009. 392 с. R Core Team. R: A language and environment for statistical computing. [Электронный ресурс] // R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. 2018. URL: https://www.R-project.org/ (дата обращения: 25.08.2020). Zuur A. F., Ieno E. N., Elphick C. S. A protocol for data exploration to avoid common statistical problems // Methods Ecol. Evol. 2010. Vol. 1. N 1. P. 3–14. Browning L. M., Mugridge O., Dixon A. K., Aitken S. W., Prentice A. M., Jebb S. A. Measuring abdominal adipose tissue: comparison of simpler methods with MRI // Obes. Facts. 2011. Vol. 4. N 1. P. 9–15. Fang H, Berg E, Cheng X, Shen W. How to best assess abdominal obesity // Curr. Opin. Clin. Nutr. Metab. Care. 2018. Vol. 21. N 5. P. 360–365. Pouliot M. C., Jean-Pierre Després J. P., Lemieux S., Moorjani S., Bouchard C., Tremblay A., Nadeau A., Lupien P.J. Waist circumference and abdominal sagittal diameter: best simple anthropometric indexes of abdominal visceral adipose tissue accumulation and related cardiovascular risk in men and women // Am. J. Cardiol. 1994. Vol. 73. N 7. P. 460–468. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/260 2015-08-17T09:01:17Z jour:BIO driver

SMALL HEAT SHOCK PROTEINS AND DIABETES МАЛЫЕ БЕЛКИ ТЕПЛОВОГО ШОКА И ДИАБЕТ M. V. Sudnitsyna N. B. Gusev Николай Борисович Гусев Мария Викторовна Судницына обзор diabetes metabolic stress carbohydrate metabolism review обзор диабет метаболический стресс углевод­ный обмен обзор Review devoted to analysis of probable participation of small heat shock proteins in different cellular processes at diabetes. Diabetes causes the metabolic stress which is accompanied by the change of carbohydrate metabolism, accumulation of products of glycation and glycosylation, modulation of protein kinase activity, modulation of redox state of the cell and increase of reactive oxygen species. All these processes can increase expression of small heat shock proteins. Therefore diabetes increases the level of small heat shock proteins in the heart, retina, certain brain regions and in the kidney cells. Increase of the level of small heat shock proteins can improve transduction of insulin signal; protect the cell against oxidative stress and apoptosis. Different ways providing increase of the level of small heat shock proteins are analyzed. Different mechanisms of covalent modification of proteins by carbohydrates and their metabolites are described. The data are presented that indicate that hyperglycemia induces modification of different amino acid residues. This leads to the changes in the structure, chemical crosslinking and modulation of physiologically important properties of small heat shock proteins. Further detailed investigation of small heat shock proteins might be important for utilization of these proteins as promising potential target for developing of new approaches for treatment of different forms of diabetes. Обзор посвящен анализу возможного участия малых белков теплового шока в различных клеточных процессах, возникающих при диабете. Показано, что диабет приводит к метаболическому стрессу, сопровождающемуся изменением обмена углеводов, накоплением продуктов гликирования и гликозилирования, модуляцией активности протеинкиназ, изменением ре­докс состояния клетки и увеличением концентрации активных форм кислорода. Все эти про­ цессы могут активировать экспрессию малых белков теплового шока. Диабет вызывает увели­чение концентрации некоторых малых белков теплового шока в сердце, сетчатке, некоторых отделах мозга, а также в клетках почек. Повышение концентрации малых белков теплового шока может улучшать эффективность передачи сигнала от инсулинового рецептора внутрь клетки, защищает клетки от окислительного стресса и предотвращает их апоптоз. Проанали­ зированы различные способы повышения уровня экспрессии малых белков теплового шока. Подробно рассмотрены различные механизмы ковалентной модификации малых белков теп­ лового шока под действием углеводов и продуктов их метаболизма. Приведены данные, сви­ детельствующие о том, что гипергликемия сопровождается модификацией различных амино­кислотных остатков в составе малых белков теплового шока, и это может приводить к из­менению их структуры, химическому “сшиванию” и изменению их физиологически важных свойств. Дальнейшее подробное исследование малых белков теплового шока может позволить использовать эти белки в качестве одной из возможных перспективных мишеней при разра­ботке методов лечения диабета. Lomonosov Moscow State University, School of Biology Российский научный фонд 2015-08-17 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/260 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 2 (2015); 24-30 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 2 (2015); 24-30 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/260/255 Dedov I.I. Diabetes mellitus­a dangerous treat to the mankind // Vestn. Ross. Akad. Med. Nauk. 2012. N 1. P. 7—13. Brownlee M. Biochemistry and molecular cell biology of diabetic complications // Nature. 2001. Vol. 414. N 6865. P. 813—820. Basha E., O’Neill H., Vierling E. Small heat shock proteins and alpha­crystallins: dynamic proteins with flexible functions // Trends Biochem. Sci. 2012. Vol. 37. N 3. P. 106—117. Mymrikov E.V., Seit­Nebi A.S., Gusev N.B. Large potentials of small heat shock proteins // Physiol. Rev. 2011. Vol. 91. N 4. P. 1123—1159. Gruden G., Bruno G., Chaturvedi N., Burt D., Schalkwijk C., Pinach S., Stehouwer C.D., Witte D.R., Fuller J.H., Perin P.C., Group E.P.C.S. Serum heat shock protein 27 and diabetes complications in the EURODIAB prospective complications study: a novel circulating marker for diabetic neuropathy // Diabetes. 2008. Vol. 57. N 7. P. 1966—1970. Burt D., Bruno G., Chaturvedi N., Schalkwijk C., Stehouwer C.D., Witte D.R., Fuller J.H., Pinach S., Perin P.C., Gruden G. Anti­heat shock protein 27 antibody levels and diabetes complications in the EURODIAB study // Diabetes Care. 2009. Vol. 32. N 7. P. 1269—1271. Burut D.F., Borai A., Livingstone C., Ferns G. Serum heat shock protein 27 antigen and antibody levels appear to be related to the macrovascular complications associated with insulin resistance: a pilot study // Cell Stress Chaperones. 2010. Vol. 15. N 4. P. 379—386. Tezel G., Wax M.B. The mechanisms of hsp27 antibody­mediated apoptosis in retinal neuronal cells // J. Neurosci. 2000. Vol. 20. N 10. P. 3552—3562. Pourhamidi K., Dahlin L.B., Boman K., Rolandsson O. Heat shock protein 27 is associated with better nerve function and fewer signs of neuropathy // Diabetologia. 2011. Vol. 54. N 12. P. 3143—3149. Hooper P.L., Balogh G., Rivas E., Kavanagh K., Vigh L. The importance of the cellular stress response in the pathogenesis and treatment of type 2 diabetes // Cell Stress Chaperones. 2014. Vol. 19. N 4. P. 447—464. Reddy V.S., Kumar C.U., Raghu G., Reddy G.B. Expression and induction of small heat shock proteins in rat heart under chronic hyperglycemic conditions // Arch. Biochem. Biophys. 2014. Vol. 558. P. 1—9. Reddy V.S., Raghu G., Reddy S.S., Pasupulati A.K., Suryanarayana P., Reddy G.B. Response of small heat shock proteins in diabetic rat retina // Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 2013. Vol. 54. N 12. P. 7674—7682. Kumar P.A., Haseeb A., Suryanarayana P., Ehtesham N.Z., Reddy G.B. Elevated expression of lpha­ and alphaBcrystallins in streptozotocin­induced diabetic rat //Arch. Biochem. Biophys. 2005. Vol. 444. N 2. P. 77—83. Losiewicz M.K., Fort P.E. Diabetes impairs the neuroprotective properties of retinal alpha­crystallins // Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 2011. Vol. 52. N 9. P. 5034—5042. Mastrocola R., Barutta F., Pinach S., Bruno G., Perin P.C., Gruden G. Hippocampal heat shock protein 25 expression in streptozotocin­induced diabetic mice // Neuroscience. 2012. Vol. 227. P. 154—162. Akbar M.T., Lundberg A.M., Liu K., Vidyadaran S., Wells K.E., Dolatshad H., Wynn S., Wells D.J., Latchman D.S., de Belleroche J. The neuroprotective effects of heat shock protein 27 overexpression in transgenic animals against lpha_i­induced seizures and hippocampal cell death // J. Biol. Chem. 2003. Vol. 278. N 22. P. 19956—19965. Sanchez­Nino M.D., Sanz A.B., Sanchez­Lopez E., Ruiz­Ortega M., Benito­Martin A., Saleem M.A., Mathieson P.W., Mezzano S., Egido J., Ortiz A. HSP27/HSPB1 as an adaptive podocyte antiapoptotic protein activated by high glucose and angiotensin II // Lab. Invest. 2012. Vol. 92. N 1. P. 32—45. Dunlop M.E., Muggli E.E. Small heat shock protein alteration provides a mechanism to reduce mesangial cell contractility in diabetes and oxidative stress // Kidney Int. 2000. Vol. 57. N 2. P. 464—475. Dai T., Natarajan R., Nast C.C., LaPage J., Chuang P., Sim J., Tong L., Chamberlin M., Wang S., Adler S.G. Glucose and diabetes: effects on podocyte and glomerular p38MAPK, heat shock protein 25, and actin cytoskeleton // Kidney Int. 2006. Vol. 69. N 5. P. 806—814. McCarty M.F. Induction of heat shock proteins may combat insulin resistance // Med. Hypotheses. 2006. Vol. 66. N 3. P. 527—534. Simar D., Jacques A., Caillaud C. Heat shock proteins induction reduces stress kinases activation, potentially improving insulin _lpha_ing in monocytes from obese subjects // Cell Stress Chaperones. 2012. Vol. 17. N 5. P. 615—621. Arrigo A.P. Human small heat shock proteins: protein interactomes of homo­ and hetero­oligomeric complexes: an update // FEBS Lett. 2013. Vol. 587. N 13. P. 1959—1969. Dai T., Patel­Chamberlin M., Natarajan R., Todorov I., Ma J., LaPage J., Phillips L., Nast C.C., Becerra D., Chuang P., Tong L., de Belleroche J., Wells D.J., Wang Y., Adler S.G. Heat shock protein 27 overexpression mitigates cytokine­induced islet apoptosis and streptozotocin­induced diabetes // Endocrinology. 2009. Vol. 150. N 7. P. 3031—3039. Korngut L., Ma C.H., Martinez J.A., Toth C.C., Guo G.F., Singh V., Woolf C.J., Zochodne D.W. Overexpression of human HSP27 protects sensory neurons from diabetes // Neurobiol. Dis. 2012. Vol. 47. N 3. P. 436—443. Najemnikova E., Rodgers C.D., Locke M. Altered heat stress response following streptozotocin­induced diabetes // Cell Stress Chaperones. 2007. Vol. 12. N 4. P. 342—352. Sharma A.K., Bharti S., Ojha S., Bhatia J., Kumar N., Ray R., Kumari S., Arya D.S. Up­regulation of PPARgamma, heat shock protein­27 and ­72 by naringin attenuates insulin resistance, beta­cell dysfunction, hepatic steatosis and kidney damage in a rat model of type 2 diabetes // Br. J. Nutr. 2011. Vol. 106. N 11. P. 1713—1723. Shao B., Tang M., Li Z., Zhou R., Deng Y., Nie C., Yuan Z., Zhou L., Tang M., Tong A., Wei Y. Proteomics analysis of human umbilical vein endothelial cells treated with resveratrol // Amino Acids. 2012. Vol. 43. N 4. P. 1671—1678. Diaz­Chavez J., Fonseca­Sanchez M.A., ArechagaOcampo E., Flores­Perez A., Palacios­Rodriguez Y., DominguezGomez G., Marchat L.A., Fuentes­Mera L., Mendoza­Hernandez G., Gariglio P., Lopez­Camarillo C. Proteomic profiling reveals that resveratrol inhibits HSP27 expression and sensitizes breast cancer cells to doxorubicin therapy // PloS ONE. 2013. Vol. 8. N 5. e64378. Sharma K.K., Santhoshkumar P. Lens aging: effects of crystallins // Biochim. Biophys. Acta. 2009. Vol. 1790. N 10. P. 1095—1108. Groenen P.J., Merck K.B., de Jong W.W., Bloemendal H. Structure and modifications of the junior chaperone alpha­crystallin. From lens transparency to molecular pathology // Eur. J. Biochem. 1994. Vol. 225. N 1. P. 1—19. Argirov O.K., Lin B., Ortwerth B.J. 2­ammonio­6­ (3­oxidopyridinium­1­yl)hexanoate (OP­lysine) is a newly identified advanced glycation end product in cataractous and aged human lenses // J. Biol. Chem. 2004. Vol. 279. N 8. P. 6487—6495. Ahmed N., Thornalley P.J., Dawczynski J., Franke S., Strobel J., Stein G., Haik G.M. Methylglyoxal­derived hydroimidazolone advanced glycation end­products of human lens proteins // Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 2003. Vol. 44. N 12. P. 5287—5292. Derham B.K., Harding J.J. Effects of modifications of alpha­crystallin on its chaperone and other properties // Biochem. J. 2002. Vol. 364. Pt 3. P. 711—717. Bhattacharyya J., Shipova E.V., Santhoshkumar P., Sharma K.K., Ortwerth B.J. Effect of a single AGE modification on the structure and chaperone activity of human alphaB­crystallin // Biochemistry. 2007. Vol. 46. N 50. P. 14682—14692. Nagaraj R.H., Shipanova I.N., Faust F.M. Protein cross­linking by the Maillard reaction. Isolation, characterization, and in vivo detection of a lysine­lysine cross­link derived from methylglyoxal // J. Biol. Chem. 1996. Vol. 271. N 32. P. 19338—19345. Nagaraj R.H., Oya­Ito T., Padayatti P.S., Kumar R., Mehta S., West K., Levison B., Sun J., Crabb J.W., Padival A.K. Enhancement of chaperone function of alpha­crystallin by methylglyoxal modification // Biochemistry. 2003. Vol. 42. N 36. P. 10746—10755. Biswas A., Miller A., Oya­Ito T., Santhoshkumar P., Bhat M., Nagaraj R.H. Effect of site­directed mutagenesis of methylglyoxal­modifiable arginine residues on the structure and chaperone function of human lpha­crystallin // Biochemistry. 2006. Vol. 45. N 14. P. 4569—4577. Kumar M.S., Reddy P.Y., Kumar P.A., Surolia I., Reddy G.B. Effect of dicarbonyl­induced browning on alpha­crystallin chaperone­like activity: physiological significance and caveats of in vitro aggregation assays // Biochem. J. 2004. Vol. 379. Pt. 2. P. 273—282. Nahomi R.B., Oya­Ito T., Nagaraj R.H. The combined effect of acetylation and glycation on the chaperone and anti­apoptotic functions of human alpha­crystallin // Biochim. Biophys. Acta. 2013. Vol. 1832. N 1. P. 195—203. Schalkwijk C.G., van Bezu J., van der Schors R.C., Uchida K., Stehouwer C.D., van Hinsbergh V.W. Heat­shock protein 27 is a major methylglyoxal­modified protein in endothelial cells // FEBS Lett. 2006. Vol. 580. N 6. P. 1565—1570. van Heijst J.W., Niessen H.W., Musters R.J., van Hinsbergh V.W., Hoekman K., Schalkwijk C.G. Argpyrimidine­modified Heat shock protein 27 in human non­small cell lung cancer: a possible mechanism for evasion of apoptosis // Cancer Lett. 2006. Vol. 241. N 2. P. 309—319. Sakamoto H., Mashima T., Yamamoto K., Tsuruo T. Modulation of heat­shock protein 27 (Hsp27) anti­apoptotic activity by methylglyoxal modification // J. Biol. Chem. 2002. Vol. 277. N 48. P. 45770—45775. Padival A.K., Crabb J.W., Nagaraj R.H. Methylglyoxal modifies heat shock protein 27 in glomerular mesangial cells // FEBS Lett. 2003. Vol. 551. N 1—3. P. 113—118. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/29 2015-06-10T14:49:43Z jour:FF driver

MORPHOLOGY AND ULTRASTRUCTURE OF MODERN AND FOSSIL SPORES IN ORDER SCHIZAEALES SCHIMP МОРФОЛОГИЯ И УЛЬТРАСТУКТУРА СОВРЕМЕННЫХ И ИСКОПАЕМЫХ СПОР ПАПОРОТНИКОВ ПОРЯДКА SCHIZAEALES SCHIMP S. V. Polevova A. S. Avramenko С. В. Полевова А. С. Авраменко Lygodium sporoderm ultrastructure Schizaeales Anemia Klukia Lygodium Lygodium ультраструктура спородермы Schizaeales Anemia Klukia Lygodium The morphology and ultrastructure of modern and fossil spores are investigated by light, scanning and transmission electron microscopes. We have grouped the study of spores in the two clusters: 1 — exospore of Anemia and Klukia form the echini of sculpture, 2 — exospore of Lygodium is smooth and perispore form the verrucae of sculpture. С помощью светового, электронных сканирующего и трансмиссионного микроскопов исследованы морфология и ультраструктура современных и ископаемых спор представителей порядка Schizaeales. Изученные споры по особенностям ультраструктуры и скульптуры спородермы объединены в две группы: у спор Anemia и Klukia экзоспорий формирует шипы, у спор Lygodium экзоспорий гладкий, периспорий формирует бугорки. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-05-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/29 10.1234/XXXX-XXXX-2013-3-48-52 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 3 (2013); 48-52 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 3 (2013); 48-52 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2013-3 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/29/31 Болховитина Н.А. Ископаемые и современные споры семейства схизеевых // Тр. Геол. ин-та. 1961. Вып. 40. 196 с. Van Konijnenburg-van Cittert J.H.A. The evolutionary development of schizaeaceous spores in situ // Cour. Forsch. Inst. Senckenb. 1992. Vol. 147. P. 109—117. Christehusz M.J.M., Zhang X.C., Schneider H. A linear sequence of extant families and genera of lycophytes and ferns // Phytotaxa. 2011. Vol. 19. P. 5—22. Красилов В.А. Klukia и палеошироты // Палеонтол. журн. 1977. № 1. С. 127—133. Барыкина Р.П., Веселова Т.Д., Девятов А.Г. и др. Основы и методы ботанической микротехники. Справочное руководство. М.: Изд-во Моск. ун-та, 2004. 312 с. Уикли Б. Электронная микроскопия для начинающих / Под ред. В.Ю. Полякова. М.: Мир, 1975. 324 с. Пыльцевой анализ / Под ред. И.М. Покровской. М.: Госгеолиздат, 1950. 553 с. Куприянова Л.А., Алешина Л.А. Пыльца и споры растений флоры европейской части СССР. Т. 1. Л.: Наука, 1972. 170 с. Tryon A.F., Lugardon B. Spores of the pteridophyta: surface, wall structure, and diversity based on electron micro- scope studies. N.Y.: Springer, 1991. 648 p. Krassilov V.A. Mesozoic lycopods and ferns from the Bureja Basin // Palaeontogr. Abt. B. 1978. Bd 166. S. 16—29. Harris T.M. Notes of the Jurassic flora of Yorkshire // Ann. Mag. Nat. Hist. 1946. Vol. 19. N 11—12. P. 357—365. Делле Г.В. Среднеюрская флора Ткварчельского угленосного бассейна // Тр. Бот. ин-та АН СССР. Сер. 8. Вып. 6. C. 51—132. Сурова Т.Д. Морфология и развитие спор представителей семейства Schizaeaceae Kaulf.: Автореф. дис. ... канд. биол. наук. Кишинев, 1985. 17 с. Lugardon B. La structure fine de l’exospore et de la pйrispore des Filicinйes isosporйs. II. Filicales. Commentaires // Pollen et Spores. 1974. Vol. 16. P. 161—226. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1444 2025-03-04T06:43:39Z jour:RST driver

Content composition and dynamics of photosynthetic pigments in the reservoirs of the Kalmius River of the Donetsk People’s Republic Содержание, состав и динамика фотосинтетических пигментов в водохранилищах реки Кальмиус Донецкой Народной Республики E. I. Mirnenko Э. И. Мирненко Донбасс chlorophyll a phytoplankton reservoirs ecosystem Donbass Донбасс хлорофилл а фитопланктон водохранилища экосистема Донбасс The paper presents data on the content, composition, and interannual and seasonal dynamics of photosynthetic pigments in the Nizhnekalmius and Starobeshevo reservoirs of the Kalmius River in the Donetsk People’s Republic. The average chlorophyll a content in the reservoirs ranged from 54.24 ± 1.4 to 106.47 ± 1.5 µg/litre. The Nizhnekalmius reservoir was characterised by higher values of photosynthetic pigment concentration with lower phytoplankton biodiversity. The presence of a constant dominant group and increased concentrations of nutrients characterise the reservoir ecosystem as unstable. The summer bloom of cyanobacteria determines high chlorophyll a concentrations. The increase in the absolute and relative number of cyanobacteria indicates the transition to the eutrophic type of the reservoir. The Starobeshevo reservoir was characterised by a wide variability of chlorophyll a values with no single peak character of phytoplankton development. Interannual changes in chlorophyll a depend indirectly on the temperature factor and largely on the variation of concentrations and biogenic elements. The annual increase in temperature leads to a prolongation of the period of maximum chlorophyll a concentrations. In general, the ecosystem of the Starobeshevo and Nizhnekalmius reservoirs is coping with anthropogenic impacts. В работе представлены данные о содержании, составе, а также межгодовой и сезонной динамике фотосинтетических пигментов в Нижнекальмиусском и Старобешевском водохранилищах реки Кальмиус Донецкой Народной Республики. Среднее содержание хлорофилла а по водохранилищам составляло от 54,24 ± 1,4 до 106,47 ± 1,5 мкг/л. Нижнекальмиусское водохранилище характеризовалось более высокими значениями концентрации фотосинтетических пигментов при меньшем биоразнообразии фитопланктона. Наличие постоянной доминантной группы и повышенных концентраций биогенных элементов характеризует экосистему водохранилища как нестабильную. Высокие значения концентрации хлорофилла а определяются летним «цветением» цианобактерий. Рост абсолютного и относительного числа цианобактерий свидетельствует о переходе к эвтрофному типу водоема. Старобешевское водохранилище характеризовалось широкой вариабельностью значений хлорофилла а при отсутствии однопикового характера развития фитопланктона. Межгодовые изменения хлорофилла а косвенно зависят от температурного фактора и в большей степени – от варьирования концентраций и биогенных элементов. Ежегодное увеличение температуры приводит к удлинению периода максимальных концентраций хлорофилла а. В целом экосистема Старобешевского и Нижнекальмиусского водохранилища справляется с антропогенным воздействием. Lomonosov Moscow State University, School of Biology The task has been completed within the framework of the youth laboratory “Diagnostics and mechanisms of adaptation of natural and anthropogenically transformed ecosystems of Donbass” (№ 1023110700153-4-1.6.19 1.6.11 1.6.12). Исследование выполнено в рамках молодежной лаборатории «Диагностика и механизмы адаптации природных и антропогенно-трансформированных экосистем Донбасса» (№ госрегистрации НИОКТР 1023110700153-4-1.6.19 1.6.11 1.6.12). 2025-03-03 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1444 10.55959/MSU0137-0952-16-79-4-15 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 79, № 4 (2024); 353-359 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 79, № 4 (2024); 353-359 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1444/709 Мирненко Э.И. Диатомовый анализ водохранилищ, расположенных на р.Кальмиус. Самарский научный вестник. 2023;12(1):82–86. Мирненко Э.И., Макуха А.О. Экологическое состояние прудов г. Донецка по содержанию органического вещества. Проблемы экологии и охраны природы техногенного региона. 2021;(1–2):17–22. Safonov A. Indicator plants of anthropogenic disturbances: Scientific approach, educational technologies. E3S Web of Conferences. 2023;431:e01031. Mineeva N.M. Composition and content of photosynthetic pigments in plankton of the Volga River reservoirs (2015-2016). Transactions of Papanin Institute for Biology of Inland Waters RAS. 2018;81(84):85–96. Минеева Н.М. Растительные пигменты в воде волжских водохранилищ. М.: Наука; 2004. 156 с. Gregor J. Freshwater phytoplankton quantification by chlorophyll a: a comparative study of in vitro, in vivo and in situ methods. Water Res. 2004;38(3);517–522. Мирненко Э.И. Минерализация водных экосистем как фактор трансформации комплексов фитопланктона прудов г. Донецка. Проблемы экологии и охраны природы техногенного региона. 2021;(3–4):30–35. Авраимова Т.В., Сафонов А.И. Экологические разработки в Донбассе: библиографический учет и популяризация научных исследований. Научные и технические библиотеки. 2023;(3):30–42. Сафонов А.И., Глухов А.З. Фитомониторинг в техногенно трансформированной среде: методология и практика. Экосистемы. 2021;(28):16–28. Mirnenko E.I. Taxonomic diversity of phytoplankton of the Kalmius River and its reservoirs. Ecosystem Transformation. 2022;5(2):63–73. Кузьменко Л.В., Сидько А.Ф., Васильев В.А. Сравнение содержания хлорофилла, измеренного стандартным спектрофотометрическим и безэкстрактным методами в приэкваториальной зоне Индийского океана. Экология моря.1990;34:8–15. Ефимова Т.В., Чурилова Т.Я., Скороход Е.Ю., Моисеева Н.А., Землянская Е.А. Вертикальное распределение биооптических показателей вод Азово-Черноморского бассейна в апреле – мае 2019 года. Морской гидрофизический журнал. 2020;36(5(215)):571–581. Минеева Н.М. Мухутдинов В.Ф. Сравнительная оценка содержания хлорофилла в водохранилищах Верхней Волги по данным спектрофотометрического и флуоресцентного методов. Вода: химия и экология. 2017;(4):3–9. Inyang A.I., Wang Y.-S. Phytoplankton diversity and community responses to physicochemical variables in mangrove zones of Guangzhou province. Ecotoxicology. 2020;29(6):650–668. Фомин Г.С. Вода. Контроль химической, бактериальной и радиационной безопасности. М.: Протектор; 2000. 848 с. Руководство по методам гидробиологического анализа поверхностных вод и донных отложений. Под ред. А. В. Абакумова. Л.: Гидрометеоиздат; 1983. 239 с. Algaebase.org [Электронный ресурс] URL: https://www.algaebase.org/ (дата обращения: 11.09.2024). Логинов В.В., Баянов Н.Г., Кривдина Т.В. Сезонная динамика хлорофилла а и каротиноидов оз. Светлояр и его трофический статус. Вода: химия и экология. 2012;11(53):60–66. Эдельштейн, К.К. Даценко Ю.С., Пуклаков В.В. Цветение водохранилища многолетнего регулирования стока. Водные ресурсы. 2021;48(2):164–172. Сафонов А.И. Экологический фитомониторинг антропогенных трансформаций. Донецк.: Изд-во ЭДИТ; 2024. 289 с. Маркевич А.В., Ветрова Е.В. Сезонная динамика и пространственное распределение химических показателей воды Верхне-Кальмиусского водохранилища. Проблемы экологии и охраны природы техногенного региона. 2009;1(9):194–201. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/297 2016-03-14T12:41:54Z jour:VIR driver

MOLECULAR DIAGNOSTICS OF POTATO INFECTIONS WITH PVY AND PLRV BY IMMUNOCHROMATOGRAPHY МОЛЕКУЛЯРНАЯ ДИАГНОСТИКА ИНФЕКЦИЙ Y-ВИРУСОМ И ВИРУСОМ СКРУЧИВАНИЯ ЛИСТЬЕВ КАРТОФЕЛЯ МЕТОДОМ ИММУНОХРОМАТОГРАФИИ O. A. Kondakova K. O. Butenko E. V. Skurat Yu. F. Drygin О. А. Кондакова К. О. Бутенко Е. В. Скурат Ю. Ф. Дрыгин молекулярная диагностика potato leafroll virus chimerical PLRV virus immunochromatography infection molecular diagnostics молекулярная диагностика вирус скручивания листьев картофеля химерный вирус иммунохроматография инфекция молекулярная диагностика Immunochromatography test systems were developed for molecular diagnostics of the potato virus Y and PLRV infection. To increase a low yield of PLRV and raise antibodies against the PLRV antigen, chimerical virus was constructed comprising the PLRV coat protein and recombinant RNA of a tobamovirus, in which capsid protein gene was replaced by the PLRV coat protein gene. Binary vector containing the DNA copy of the recombinant RNA was infectious, and yield of the chimerical virus increased up to 800 times in comparison with the WT PLRV. On the basis of experience in the development of the diagnostics of viral and viroid infections, a rational tactics is proposed for the mass laboratory and field diagnosis of viral infections on the molecular level. Для молекулярной диагностики инфекций картофеля Y-вирусом и вирусом скручивания листьев картофеля (ВСЛК) разработаны иммунохроматографические тест-системы. Чтобы размножить антиген — капсидный белок труднодоступного флоэмно-ограниченного ВСЛК, был создан бинарный вектор, содержащий кДНК рекомбинантной РНК тобамовируса, в которой ген капсидного белка был заменен на ген белка оболочки ВСЛК. Рекомбинантная тобамовирусная РНК упаковывалась белком оболочки ВСЛК в сферические вирусные частицы. Химерный вирус был инфекционен, а выход его и белка оболочки ВСЛК при выделении был в 800 раз выше, чем у дикого типа. К химерному вирусу были получены антитела для лабораторного и полевого анализа инфекции картофеля. На основании опыта разработки и применения диагностических тест-систем предлагается тактика рациональной массовой лабораторной и практической диагностики вирусных заболеваний организмов на молекулярном уровне. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2016-03-14 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/297 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2016); 46-51 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2016); 46-51 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/297/290 Дрыгин Ю.Ф. Детекция целевой последовательности нуклеотидов и целевого антигена // 8-я Всероссийская научно-практическая конференция “Молекулярная диагностика 2014” / М: МБА, 2014. C. 126. Drygin Yu.F., Chirkov S.N., Kondakova O.A., Zinovkin R.A., Ivanov P.A., Blintsov A.N., Gavryushina E.S., Zherdev A.V., Byzova N.A., Dzantiev B.B., Atabekov J.G. Highsensitive technologies for molecular diagnostics of potato virus and viroid infections // Potato Production and Innovative Technologies / Eds. A.J. Haverkort and B.V. Anisimov. Wageningen: Acad. Publishers, 2007. P. 274–285. Кондакова О.А., Дрыгин Ю.Ф. Диагностика вироидного заболевания картофеля зондами (диен)Pt-ДНК // Биотехнология. 1999. № 4. С. 83–90. Дрыгин Ю.Ф., Кондакова О.А., Чирков С.Н., Зиновкин Р.А., Киселева В.И., Атабеков И.Г. Способ одновременного обнаружения множества РНК-последовательностей в биологическом образце. Международный патент #WO/2009/123494. Takanami Y., Kubo S. Enzyme-assisted purification of two phloem-limited plant viruses: tobacco necrotic dwarf and potato leafroll // J. Gen. Virol. 1979. Vol. 44. N 1. P. 153–159. Weller M.G. Immunochromatographic techniques — a critical review // Fresen. J. Anal. Chem. 2000. Vol. 366. N 6. P. 635–645. Posthuma-Trumpie T., Korf J., van Amerongen A. Lateral flow (immuno) assay: its strengths, weaknesses, opportunities and threat. A literature survey // Anal. Bioanal. Chem. 2008. Vol. 393. N 2. P. 569–582. Zhang G., Guo J., Wang X.. Immunochromatographic lateral flow strip tests // Biosensors and Biodetection. Methods and Protocols / Eds. A. Rasooly and K.E. Herold. NY: Humana Press, 2009. P. 169–183. Wong R., Tse H. Lateral flow immunoassay. NY: Humana Press, 2009. 223 p. Dzantiev B.B., Byzova N.A., Urusov A.E., Zherdev A.V. Immunochromatographic methods in food analysis // Trends Anal. Chem. 2014. Vol. 55. P. 81–93. Drygin Y.F., Blintsov A.N., Osipov A.P., Grigorenko V.G., Andreeva I.P., Uskov A.I., Varitsev Y.A., Anisimov B.V., Novikov V.K., Atabekov J.G. High-sensitivity express immunochromatographic method for detection of plant infection by tobacco mosaic virus // Biochemistry (Mosc.). 2009. Vol. 74. N 9. P. 986–993. Drygin Yu. F., Blintsov A N., Grigorenko, V.G., Andreeva I.P., Osipov A.P., Varitzev Y.A., Uskov A.I., Kravchenko D.V., Atabekov J.G. High sensitive field test lateral flow immunodiagnostics of PVX infection // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2012. Vol. 93. N 1. P. 179–189. Егоров А.М., Осипов А.П., Дзантиев Б.Б., Гаврилова Е.М. Теория и практика иммуноферментного анализа. М.: Высшая школа, 1991. С. 288. Дрыгин Ю.Ф., Скурат Е.В., Кондакова О.А., Атабеков И.Г., Бутенко К.О. Способ получения препаративных количеств вирусных частиц флоэмно-ограниченных вирусов. Патент РФ: 2555534 от 08.06.2015 г. Дрыгин Ю.Ф. Стратегия и тактика молекулярной диагностики инфекций картофеля на практике // Второе научно-практическое совещание “Генетические и агротехнологические ресурсы повышения качества продовольственного и технического картофеля”. М.: МГУ, 2012. С. 10–11. Бутенко К.О., Скурат Е.В., Кондакова О.А., Варицев Ю.А., Гаврюшина Е.С., Дрыгин Ю.Ф., Атабеков И.Г. Полевой метод диагностики инфекции картофеля вирусом скручивания листьев на тест-полосках с антителами к химерному вирусу // Защита картофеля. 2014. Т. 1. № 1. С. 35–36. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/61 2015-05-18T11:36:54Z jour:MA driver

SAFETY OF FUNGAL SECONDARY METABOLITES IN HERBARIAL LICHEN SPECIMENS СОХРАННОСТЬ ВТОРИЧНЫХ МЕТАБОЛИТОВ ГРИБОВ В ГЕРБАРНЫХ ОБРАЗЦАХ ЛИШАЙНИКОВ A. A. Burkin T. Yu. Tolpysheva G. P. Kononenko А. А. Буркин Т. Ю. Толпышева Г. П. Кононенко гербарий mycotoxins herbarium гербарий микотоксины гербарий Fresh and taken from herbarium thalli of epigeous lichens Cladonia stellaris, C. rangiferina, Allocatraria nivalis, A. cucullata, Cetraria islandica, Peltigera canina, Nephroma arcticum were studied by indirect enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). There were found no significant differences in the content of secondary metabolites belonging  o mycotoxins deoxynivalenol, diaceto- xyscirpenol, zearalenone, alternariol, citrinin, sterigmatocystin, cyclopiazonic acid, mycophenolicacid, emodin, PR-toxin. Revealing of these substances in specimens kept in herbarium for some decades testify to an effective system of conservation of metabolic products in lichens. Методом иммуноферментного анализа в гербарных и свежесобранных слоевищах эпигейных лишайников Cladonia stellaris, C.rangiferina, Allocetraria nivalis, A. cucullata, Cetraria islandica, Peltigera canina и Nephroma arcticum не выявлено существенных различий в содержании вторичных метаболитов, относящихся к микотоксинам — дезоксиниваленола, диацетоксисцирпенола, зеараленона, альтернариола, цитринина, стеригматоцистина, циклопиазоновой кислоты, микофеноловой кислоты, эмодина и PR-токсина. Обнаружение этих веществ в образцах, сроки хранения которых превышают несколько десятилетий, свидетельствует об эффективной системе консервации продуктов метаболического обмена в лишайниках. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-05-18 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/61 10.1234/XXXX-XXXX-2012-3-28-32 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 3 (2012); 28-32 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 3 (2012); 28-32 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/61/63 Corradi da Silva M., Iacomini M., Jablonski E., Gorin Ph.A.J. Carbohydrate, glycopeptide and protein components of the lichen Sticta sp. and effect of storage // Phytochemistry. 1993. Vol. 33. N 3. P. 547—552. Culberson Ch.F. The lichen substances of the genus Evernia // Phytochemistry. 1963. Vol. 2. N 4. P. 335—340. Равинская А.П., Вайнштейн Е.А. Хематаксономическое значение изменений содержания лишайниковых кислот // Новости систематики низших растений. 1975. Т. 12. С. 266—273. Шапиро И.А. Содержание усниновой кислоты в лишайнике Parmelia vagans Nyl. // Растительные ресурсы. 1977. Т. 13. Вып. 3. С. 463—466. Буркин А.А., Кононенко Г.П. Первые сведения о контаминации ягеля микотоксинами // Иммунология, аллергология, инфектология. 2010. № 1. С. 185—186. Буркин А.А., Кононенко Г.П. Контаминация ягеля микотоксинами // Докл. Рос. акад. с.-х. наук. 2011. № 2. С. 56—58. Кононенко Г.П., Буркин А.А., Толпышева Т.Ю. Иммуноферментный анализ вторичных метаболитов микромицетов в составе лишайниковых веществ // рикладная биохим. и микробиол. 2012. Т. 48. № 1. С. 81—89. Moreau C., Mould S. Toxins and food. Chichester; New York; Brisbane; Toronto: John Wiley & Sons, 1979. 477 p. Girlanda M., Isocrono D., Bianco C., Luppi-Mosca A.M. 1997. Two foliose lichens as microfungal ecological niches // Mycologia. Vol. 89. N 4. P. 531—536. Трасс Х.Х. Сем. Cladoniaceae // Определитель лишайников СССР. 1978. Вып. 5. С. 7—79. Рассадина К.А. Сем. Parmeliaceae // Определитель лишайников СССР. 1971. Вып. 1. С. 282—386. Домбровская А.В. Сем. Peltigeraceae incl. Nephromataceae // Определитель лишайников СССР. 1975. Вып. 3. С. 139—196. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1549 2025-11-10T18:21:01Z jour:KS driver

Study of a cold-adapted attenuated SARS-CoV-2 mutant using transmission, cryo-electron and atomic force microscopy Исследование холодоадаптированного ослабленного мутанта SARS-CoV-2 методами просвечивающей, криоэлектронной и атомно-силовой микроскопии L. V. Kordyukova A. V. Moiseenko T. C. Trifonova A. I. Akhmetova A. V. Gracheva E. R. Korchevaya I. V. Yaminsky E. B. Faizuloev Л. В. Кордюкова А. В. Моисеенко Т. С. Трифонова А. И. Ахметова А. В. Грачева Е. Р. Корчевая И. В. Яминский Е. Б. Файзулоев АСМ cold-adapted (ca) mutant temperature sensitive (ts) phenotype S-protein TEM cryo-EM AFM АСМ холодоадаптированный (са) мутант температурочувствительный (ts) фенотип S-белок криоЭМ ПЭМ АСМ One of the traditional approaches to the creation of live attenuated vaccines is cold adaptation of the virus to produce temperature-sensitive (ts) mutants. In this work, we investigated the mor phological features and antigenic properties of the attenuated ts mutant F-F3 SARS-CoV-2 in comparison with the parent strain FEB2 (Omicron BA.5.2). Transmission electron microscopy of the virus inactivated by ultraviolet radiation revealed no significant differences in the morphol ogy of negatively contrasted virus particles and S-spikes: a characteristic “crown” consisting of spikes in the native prefusion conformation was found around the virions. Cryoelectron micros copy of the parent strain confirmed the presence of S-spikes in the prefusion conformation, while the ts mutant was not studied by this method due to insufficient virion concentration. In cubation with immune sera against an omicron-like strain revealed the formation of immune complexes both in the case of the parent strain and the ts mutant. Atomic force microscopy sug gested the presence of single virions in the preparation, but did not reveal a characteristic corona around them. This may be due to the fragility of S-spikes destroyed during sample preparation, or to the masking effect of serum albumin aggregates from the culture cell medium. Одним из традиционных подходов к созданию живых аттенуированных вакцин является холодовая адаптация вируса с получением температурочувствительных (ts) мутантов. В настоящей работе мы исследовали морфологические особенности и антигенные свойства ослабленного ts-мутанта F-F3 SARS-CoV-2 в сравнении с родительским штаммом FEB2 (Omicron BA.5.2). Просвечивающая электронная микроскопия вируса, инактивированного ультрафиолетовым облучением, не выявила существенных различий в морфологии негативно контрастированных вирусных частиц и S-спайков: вокруг вирионов обнаружена характерная «корона», состоящая из шипов в нативной префузионной кон формации. Криоэлектронная микроскопия родительского штамма подтвердила присутствие S-спайков в префузионной конформации, в то время как ts-мутанта не исследовали данным методом в связи с недостаточной концентрацией вирионов. Инкубация с иммунными сыворотками против омикрон-подобного штамма выявила образование иммунных комплексов как в случае родительского штамма, так и ts-мутанта. Атомно-силовая микроскопия позволила предположить наличие в препарате единичных вирионов, но не выявила характерной «короны» вокруг них. Это может быть связано с хрупкостью S-спайков, разрушаемых в процессе пробоподготовки, либо с маскирующим эффектом агрегатов сывороточного альбумина из культуральной клеточной среды. Lomonosov Moscow State University, School of Biology The study was conducted under the state assignment of Lomonosov Moscow State University and I.I. Mechnikov Scientific Research Institute of Vaccines and Serums. Исследования выполнены в рамках государственного задания МГУ имени М.В. Ломоно- сова и Научно-исследовательского института вакцин и сывороток имени И.И. Мечникова и проведены без использования животных и без привлечения людей в качестве испытуемых. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов. 2025-11-10 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1549 10.55959/MSU0137-0952-16-80-3S-16 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 80, № 3S (2025); 106–112 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 80, № 3S (2025); 106–112 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1549/741 Kordyukova L.V., Shanko A.V. COVID-19: Myths and reality. Biochemistry (Mosc.). 2021;86(7):800–817. Maassab H.F., DeBorde D.C. Development and characterization of cold-adapted viruses for use as live virus vaccines. Vaccine. 1985;3(5):355–369. Gracheva A.V., Drokov A.O., Smirnova D.I., Khokhlo va D.M., Korchevaya E.R., Pankratov A.A., Trunova G.V., Khokhlova V.A., Vorontsova M.S., Leneva I.A., Svitich O.A., Zverev V.V., Faizuloev E.B. Virulence and tissue tropism of dif ferent epidemiologically significant SARS-CoV-2 variants for golden Syrian hamsters. J. Microbiol. Epidemiol. Immunobiol. 2024;101(4):470–482. Kordyukova L.V., Moiseenko A.V., Serebrya- kova M.V., Shuklina M.A., Sergeeva M.V., Lioznov D.A., Shanko A.V. Structural and immunoreactivity properties of the SARS-CoV-2 spike protein upon the development of an inactivated vaccine. Viruses. 2023;15(2):480. Kordyukova L.V., Moiseenko A.V., Timofeeva T.A., Fedyakina I.T. Cryo-electron microscopy of enveloped vi ruses using an upgraded transmission electron microscope: influenza type A and B viruses and SARS-CoV-2. Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2023;78(Suppl. 1):S17–S21. Kiss B., Kis Z., Pályi B., Kellermayer M.S.Z. Topog raphy, spike dynamics, and nanomechanics of individual na tive SARS-CoV-2 virions. Nano Lett. 2021;21(6):2675–2680. Bagrov D.V., Glukhov G.S., Moiseenko A.V., et al. Structural characterization of Β-PROPIOLACTONE inacti vated severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS COV-2) particles. Microsc. Res. Tech. 2022;85(2):562–569. Yaminsky I., Akhmetova A., Meshkov G. Femtoscan online software and visualization of nano-objecs in high-res olution microscopy. Nanoindustry. 2018;(6):414–416. Gracheva A.V., Korchevaya E.R., Ammour Yu.I., Smirnova D.I., Sokolova O.S., Glukhov G.S., Moiseen ko A.V., Zubarev I.V., Samoilikov R.V., Leneva I.A., Svi- tich O.A., Zverev V.V., Faizuloev E.B. Immunogenic prop erties of SARS-CoV-2 inactivated by ultraviolet light. Arch. Virol. 2022;167(11):2181–2191. Грачева А.В. Вирулентность, иммуногенность и протективная активность холодоадаптированного омикрон-подобного штамма SARS-CoV-2. Материалы XVI Всероссийской научно-практической конференции молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора Современные проблемы эпидемиологии, микробиологии и гигиены. Екатеринбург: ФБУН ЕМНЦ ПОЗРПП Роспотребнадзора; 2024:35–37. Wrobel A.G., Benton D.J., Roustan C., Borg A., Hussain S., Martin S.R., Rosenthal P.B., Skehel J.J., Gam blin S.J. Evolution of the SARS-CoV-2 spike protein in the human host. Nat. Commun. 2022;13(1):1178. Cardoso-Lima R., Santos-Oliveira R., Souza P.F.N., Barbosa L.R.S., Wuite G.J.L., Alencar L.M.R. Physical viro- logy: how physics is enabling a better understanding of recent viral invaders. Biophys. Rev. 2023;15(4):611–623. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/660 2018-11-30T17:26:08Z jour:GID driver

THE FIRST RECORD OF THALASSIOSIRA ANGULATA (BACILLARIOPHYCEAE) BLOOM IN THE WHITE SEA: SPATIAL DISTRIBUTION AND CONCOMITANT SPECIES ПЕРВАЯ РЕГИСТРАЦИЯ ЦВЕТЕНИЯ THALASSIOSIRA ANGULATA (BACILLARIOPHYCEAE) В БЕЛОМ МОРЕ: ПРОСТРАНСТВЕННОЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ И СОПУТСТВУЮЩИЕ ВИДЫ I. G. Radchenko V. P. Shevchenko M. D. Kravchishina V. V. Il’inskii A. P. Georgiev A. V. Tolsticov A. L. Tchultsova L. V. Ilyash И. Г. Радченко В. П. Шевченко М. Д. Кравчишина В. В. Ильинский А. П. Георгиев А. В. Толстиков А. Л. Чульцова Л. В. Ильяш гидрофизические условия phytoplankton bloom phytoplankton structure Thalassiosira angulate nutrients hydrophysical conditions гидрофизические условия цветение фитопланктона структура фитопланктона Thalassiosira angulata биогенные элементы гидрофизические условия Species composition and biomass of phytoplankton (Bsum), concentrations of chlorophyll “a” and nutrients, as well as hydrophysical conditions were studied from 5th to 12th of July, 2011 at 29 stations in the White Sea. With the exception of indicators for two stations in the surface layer of the water column, the values of chlorophyll “a” and Bsum corresponded to the level of phytoplankton bloom (> 1 mg/m3 and > 30 mg C/m3, respectively). The biomass dominance of diatom Thalassiosira angulata was first noted in vast area of the White Sea, its abundance and biomass in the surface layer reached 24·103 cells/l and 34.56 mg C/m3, respectively. Still higher values were noted at one of the coastal stations at a depth of 3 m (179·103 cells/l and 258 mg C/m3). The main factors responsible for the spatial variability of the T. angulata biomass were the stability of the water column (positive relation) and salinity (negative relation). Видовой состав и биомасса фитопланктона (В сум), концентрация хлорофилла “а” и биогенных элементов, а также гидрофизические условия были оценены с 5 по 12 июля 2011 г. на 29 станциях в Белом море. За исключением показателей для двух станций в поверхностном слое водной толщи, величины хлорофилла “а” и В сум соответствовали уровню цветения фитопланктона (>1 мг/м3 и >30 мг С/м3 соответственно). Впервые на обширной акватории Белого моря отмечено доминирование по биомассе диатомовой водоросли Thalassiosira angulata, численность и биомасса которой в поверхностном слое достигали 24 тыс. кл/л и 34,56 мг С/м3 соответственно. На одной из прибрежных станций на глубине 3 м отмечены еще более высокие значения (179 тыс. кл/л и 258 мг С/м3). Основными факторами, обусловливающими пространственную изменчивость биомассы T. angulata являлись устойчивость водного столба (положительная связь) и соленость (отрицательная связь). Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2018-11-30 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/660 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 73, № 4 (2018); 263-268 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 73, № 4 (2018); 263-268 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/660/450 Berger V., Dahle S., Galaktionov K., Kosobokova X., Naumov A., Rat’kova T., Savinov V., Savinova T. White sea. Ecology and environment. St. Petersburg–Tromsø: Derzavets Publisher, 2001. 157 p. Pantyulin A.N. Hydrological system of the White sea // Oceanology. 2003. Vol. 43. N Suppl.1. P. S1–S14. Ilyash L.V., Belevich T.A., Zhitina L.S., Radchenko I.G., Ratkova T.N. Phytoplankton of the White sea // The handbook of environmental chemistry / Eds. D. Barceló and A.G. Kostianoy. Berlin, Heidelberg: Springer, 2018. DOI: 10.1007/698_2018_320 Ilyash L.V., Radchenko I.G., Shevchenko V.P., Zdorovennov R.E., Pantyulin A.N. Contrasting summer phytoplankton communities in stratified and mixed waters of the White sea // Oceanology. 2014. Vol. 54. N 6. P. 730–738. Ilyash L.V., Zhitina L.S., Belevich T.A., Shevchenko V.P., Kravchishina M.D., Pantyulin A.N., Tolstikov A.V., Chultsova A.L. Spatial distribution of the phytoplankton in the White sea during atypical domination of dinoflagellates (July 2009) // Oceanology. 2016. Vol. 56. N 3. P. 372–381. Ilyash L.V., Belevich T.A., Stupnikova A.N., Drits A.V., Flint M.V. Effects of local hydrophysical conditions on the spatial variability of phytoplankton in the White sea // Oceanology. 2015. Vol. 55. N 2. P. 216–225. IPCC, Intergovernmental Panel on climate change.Climate change 2007: the physical science basis. Contribution of working group I to the fourth assessment report of the intergovernmental panel on climate change / Eds. S. Solomon, D. Qin, M. Manning, Z. Chen, M. Marquis, K.B. Averyt, M. Tignor, and H.L. Miller. N.Y.: Cambridge Univ. Press, 2007. 996 p. Lovejoy C., Vincent W.F., Bonilla S., Roy S., Martineau M.J., Terrado R., Potvin M., Massana R., Pedros-Alio C. Distribution, phylogeny, and growth of cold-adapted picoprasinophytes in arctic seas // J. Phycol. 2007. Vol. 43. N 1. P. 78–89. de Boyer Montégut C., Madec G., Fischer A.S., Lazar A., Iudicone D. Mixed layer depth over the global ocean: an examination of profile data and a profile-based climatology // J. Geophys. Res. 2004. Vol. 109. N C12. DOI: 10.1029/2004JC002378 Grasshoff K., Ehrhardt M., Kremling K. Methods of seawater analysis. Weinheim; N.Y.; Chiester; Brisbane; Singapore; Toronto: Wiley-VCH, 1999. 600 p. Arar E.J., Collins G.B. Method 445.0. In vitro determination of chlorophyll “a” and pheophytin “a” in marine and freshwater algae by fluorescence. Revision 1.2. Cincinnati: U.S. Environmental Protection Agency, 1997. 22 p. Hillebrand H., Dürselen C.-D., Kirschtel D., Pollingher U., Zohary T. Biovolume calculation for pelagic and benthic microalgae // J. Phycol. 1999. Vol. 35. N 2. P. 403–424. Menden-Deuer S., Lessard E.J. Carbon to volume relationships for dinoflagellates, diatoms, and other protist plankton // Limnol. Oceanogr. 2000. Vol. 45. N 3. P. 569–579. Simonsen R. The diatom plankton of the Indian Ocean Expedition of R.V.’Meteor’ 1964-65 // Meteor Forschungsrgeb. (D. Biol.). 1974. Vol. 19. P. 1–66. Hammer Ø., Harper D.A.T., Ryan P. D. PAST: Paleontological Statistics Software Package for Education and Data Analysis // Palaeontol. Electron. 2009. Vol. 4. N 1. Clarke K.R., Gorley R.N. PRIMER v6: User Manual / Tutorial. Plymouth: PRIMER-E, 2006. 192 p. Sapozhnikov V.V., Arzhanova N.V., Mordasova N.V. Hydrochemistry and production-destruction processes in the White sea // The handbook of environmental chemistry / Eds. D. Barceló and A.G. Kostianoy. Berlin, Heidelberg: Springer, 2018. DOI: 10.1007/698_2018_302 Mitchell B.G., Holm-Hansen O. Observations and modeling of the Antarctic phytoplankton crop in relation to mixing depth // Deep-Sea Res. 1991. Vol. 38. N 8–9. P. 981–1007. Hasle G.R. Some Thalassiosira species with one central process (Bacillariophyceae) // Norw. J. Bot. 1978. Vol. 25. N 2. P. 77–110. Park J.S., Jung S.W., Lee S.D.,Yun S.M., Lee J.H. Species diversity of the genus Thalassiosira (Thalassiosirales, Bacillariophyta) in South Korea and its biogeographical distribution in the world // Phycologia. 2016. Vol. 55. N 4. P. 403–423. Rat’kova T.N. Phytoplankton composition in the White Sea Basin in summer–autumn 1998 and 1999 // Berichte Polarforsch. 2000. Vol. 359. P. 97–109. Semina H.J. Iconographia Diatomologica, Volume 10: SEM-studied diatoms of different regions of the World Ocean. Koeltz Scientific Books, 2003. 363 p. Гогорев Р.М. Диатомовые водоросли поздневесеннего льда Белого моря // Новости систематики низших растений. 1998. Т. 32. С. 8–13. Filatov N., Pozdnyakov D., Johannessen O.M., Pettersson L.H., Bobylev L.P. Oceanographic regime // White Sea. Its marine environment and ecosystem dynamics influenced by global change / Eds. N.N. Filatov and D.V. Pozdnyakov. London: Springer-Verlag London Ltd, 2005. P. 73–154. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/774 2019-09-22T15:31:26Z jour:RA driver

The corticospinal excitability influenced by motor imagery and simultaneous electrical stimulation Кортикоспинальная возбудимость человека при представлении движений в сопряжении с функциональной электростимуляцией L. V. Yakovlev N. V. Syrov E. Y. Morozova A. Y. Kaplan Л. В. Яковлев Н. В. Сыров Е. Ю. Морозова А. Я. Каплан моторные вызванные потенциалы motor imagery corticospinal exciteability functional neuromuscular stimulation neurorehabilitation motor evoked potentials моторные вызванные потенциалы представление движений кортикоспинальная возбудимость функциональная электростимуляция нейрореабилитация моторные вызванные потенциалы 18 healthy volunteers were involved and the effect of functional neuromuscular electrical stimulation, which causes flexion of the hand, on the corticospinal excitability during motor imagery and resting state was investigated in this study. It was shown that the combined action of functional electrical stimulation and the kinesthetic representation of movements leads to an increase in the amplitudes of motor evoked potentilals, caused by a single-pulse transcranial magnetic stimulation. At the same time, in the state of motor rest this effect was not obtained. Since a change in corticospinal excitability at the cortical level may affect the processes of plastic reorganization necessary for the restoration of motor functions after strokes and other neurotraumas, the results of this work have a direct practical potential. In particular, the possibility of creating effective training complexes for the restoration of motor functions based on brain-computer interfaces, based on the presentation of movements with functional neuromuscular stimulation as a sensor-motor feedback, is discussed. Rehabilitation with the use of such training complexes will help to shed light on the mechanisms of motor recovery, which are based on the phenomena of neuroplasticity, due to changes in the level of excitability of the neurons of the sensorimotor cortex. В исследовании с участием 18 здоровых испытуемых-добровольцев изучалось влияние функциональной электростимуляции, вызывающей сгибание кисти, на кортикоспинальную возбудимость при представлении движений и в состоянии покоя. Было показано, что совместное действие функциональной электростимуляции и кинестетического представления движений приводит к увеличению амплитуд моторных ответов, вызванных одиночной транскраниальной магнитной стимуляцией. При этом в состоянии двигательного покоя данного эффекта получено не было. Поскольку изменение кортикоспинальной возбудимости на корковом уровне может влиять на процессы пластической реорганизации, необходимые для восстановления двигательных функций после инсультов и иных нейротравм, результаты данной работы имеют прямой практический потенциал. В частности, обсуждается возможность создания эффективных тренажерных комплексов для восстановления двигательных функций на базе интерфейсов мозг-компьютер, основанных на представлении движений с функциональной электростимуляцией в качестве сенсомоторной обратной связи. Проведение реабилитации с использованием таких тренажерных комплексов поможет пролить свет на механизмы двигательного восстановления, в основе которых лежат явления нейропластичности, обусловленные изменением уровня возбудимости нейронов сенсомоторных областей коры. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2019-09-22 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/774 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 74, № 3 (2019); 229-235 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 74, № 3 (2019); 229-235 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/774/483 Pfurtscheller G., Neuper C. Motor imagery activates primary sensorimotor area in humans // Neurosci. Lett. 1997. Vol. 239. N 2–3. P. 65–68. Lotze M., Halsband U. Motor imagery // J. Physiol. Paris. 2006. Vol. 99. N. 4–6. P. 386–395. Mizuguchi N., Nakata, H., Uchida, Y., Kanosue, K. Motor imagery and sport performance // Jpn. J. Phys. Fit. Sport. 2012. Vol. 1. N. 1. P. 103–111. Walsh N.E., Jones L., McCabe C.S. The mechanisms and actions of motor imagery within the clinical setting // Textbook of neuromodulation / Eds. H. Knotkova and D. Rasche. N.Y.: Springer, 2015. P. 151–158. Guerra Z.F., Lucchetti A.L.G., Lucchetti G. Motor imagery training after stroke: a systematic review and meta-analysis of randomized controlled trials // J. Neurol. Phys. Ther. 2017. Vol. 41. N 4. P. 205–214. Li R.Q., Li Z.M., Tan J.Y., Chen G.L., Lin W.Y. Effects of motor imagery on walking function and balance in patients after stroke: a quantitative synthesis of randomized controlled trials // Complement. Ther. Clin. 2017. Vol. 28. P. 75–84. Kaplan A.Ya. Neurophysiological foundations and practical realizations of the brain– machine interfaces in the technology in neurological rehabilitation // Human Physiology. 2016. Vol. 42. N 1. P. 103–110. Kaneko F., Hayami T., Aoyama T., Kizuka T. Motor imagery and electrical stimulation reproduce corticospinal excitability at levels similar to voluntary muscle contraction // J. Neuroeng. Rehabil. 2014. Vol. 11. N. 1: 94. Vogt S., Di Rienzo F., Collet C., Collins A., Guillot A. Multiple roles of motor imagery during action observation // Front. Hum. Neurosci. 2013. Vol. 7: 807. Reynolds C., Osuagwu B.A., Vuckovic A. Influence of motor imagination on cortical activation during functional electrical stimulation // Clin. Neurophysiol. 2015. Vol. 126. N 7. P. 1360– 1369. Kurumadani H., Yoshimura M., Fukae A., Onishi K., Hayashi J., Shinomiya R., Sunagawa T. Long-term disuse of the hand affects motor imagery ability in patients with complete brachial plexus palsy // Neuroreport. 2019. Vol. 30. N 6. P. 452– 456. Saito K., Yamaguchi T., Yoshida N., Tanabe S., Kondo K., Sugawara K. Combined effect of motor imagery and peripheral nerve electrical stimulation on the motor cortex // Exp. Brain Res. 2013. Vol. 227. N. 3. P. 333–342. Kaplan A., Vasilyev A., Liburkina S., Yakovlev L. Poor BCI performers still could benefit from motor imagery training // Foundations of augmented cognition: neuroergonomics and operational neuroscience. AC 2016. Lecture Notes in Computer Science, vol. 9743 / Eds. D. Schmorrow and C. Fidopiastis. Cham: Springer, 2016. P. 46–56 Vasilyev A., Liburkina S., Yakovlev L., Perepelkina O., Kaplan A. Assessing motor imagery in brain-computer interface training: psychological and neurophysiological correlates // Neuropsychologia. 2017. Vol. 97. P. 56–65. Liburkina S.P., Vasilyev A.N., Yakovlev L.V., Gordleeva S.Y., Kaplan A.Y. A motor imagerybased brain–computer interface with vibrotactile stimuli // Neurosci. Behav. Physiol. 2018. Vol. 48. N 9. P. 1067–1077. Васильев А.Н., Либуркина С.П., Каплан А.Я. Латерализация паттернов ЭЭГ у человека при представлении движений руками в интерфейсе мозг–компьютер // Ж. высш. нервн. деят. им. И.П. Павлова. 2016. Т. 66. № 3. С. 302. Schalk G., McFarland D.J., Hinterberger T., Birbaumer N., Wolpaw J.R. BCI2000: a generalpurpose brain-computer interface (BCI) system // IEEE T. Biomed. Eng. 2004. Vol. 51. N 6. P. 1034–1043. Hashimoto R., Rothwell J.C. Dynamic changes in corticospinal excitability during motor imagery // Exp. Brain Res. 1999. Vol. 125. N 1. P. 75–81. Mokienko O., Chervyakov A., Kulikova S., Bobrov P., Chernikova L., Frolov A., Piradov M. Increased motor cortex excitability during motor imagery in brain-computer interface trained subjects // Front. Comput. Neurosci. 2013. Vol. 7: 168. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/202 2015-07-23T20:56:52Z jour:%D0%A1%D0%A2 driver

PHYLOGENETIC RELATIONSHIPS OF ENDEMIC PARATANYTARSUS BAICALENSIS (TSHERN.) TO SOME SPECIES OF PARATANYTARSUS THIEN. ET BAUSE AND MICROPSECTRA KIEFF. (DIPTERA, CHIRONOMIDAE) ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ВЗАИМООТНОШЕНИЯ БАЙКАЛЬСКОГО ЭНДЕМИКА PARATANYTARSUS BAICALENSIS (TSHERN.) С ПРЕДСТАВИТЕЛЯМИ РОДОВ PARATANYTARSUS THIEN. ET BAUSE И MICROPSECTRA KIEFF. (DIPTERA, CHIRONOMIDAE) L. S. Kravtsova O. V. Mayer D. Yu. Sherbakov Л. С. Кравцова О. В. Майер Д. Ю. Щербаков филогения. Baikalian endemic phylogenetic филогения. эндемики Байкала филогения. Phylogenetic relationships of Baikalian endemic Chironomid Paratanytarsus baicalensis (Tshern.) and other representaives of tribe Tanytarsini have been studied using 117 partial sequences of mito­chondrial gene COI belonging to 33 species of Paratanytarsus и Micropsectra. It was shown that the Baikalian species is closely related to two European species P. austriacus, P. hyperboreus and itself it splits into two genetically distinctive clades. Исследованы филогенетические взаимоотношения эндемика Байкала Paratanytarsus bai- calensis (Tshern.) с представителями двух родов трибы Tanytarsini. Анализ филогенетических связей проведен на основе 117 нуклеотидных последовательностей фрагмента гена мтДНК СО!, принадлежащих 33 видам из родов Paratanytarsus и Micropsectra. Установлено, что байкальский вид по происхождению близок к географически удаленным европейским видам P. austriacus, P. hyperboreus и генетически неоднороден. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-23 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/202 10.1234/XXXX-XXXX-2010-4-54-57 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 4 (2010); 54-57 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 4 (2010); 54-57 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2010-4 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/202/201 Кравцова Л.С. Хирономиды водоемов Прибайкалья // Биота водоемов Байкальской рифтовой зоны / Под ред. А.С. Плешанова. Иркутск: Изд-во Иркут. ун-та, 2009. С. 155—165. Черновский А.А. Определитель личинок комаров сем. Tendipedidae (Chironomidae) // Определитель по фауне СССР. М.; Л.: Наука, 1949. 186 с. Линевич А.А. Биология беспозвоночных Байкала // Тр. Лимнологического института СО РАН. Л.: Наука, 1963. Т. 21. С. 1—48. Панкратова В.Я. Личинки и куколки комаров подсемейства Chironominae фауны СССР (Diptera, Chironomidae=Tendipedidae). Л.: Наука, 1983. 296 с. Ashe P., Cranston P.S. Chironomidae // Catalogue of palaearctic Diptera / Ed. A. Soos. Budapest, 1990. Vol. 2. P. 113—499. Doyle J.J., Dickson E. Preservation of plant samples for DNA restriction endonuclease analysis // Taxon. 1987. Vol. 36. N 4. Ð. 715—722. Guindon S., Gascuel O. A simple, fast, and accurate algorithm to estimate large phylogenies by maximum likeli¬hood // Syst. Biol. 2003. Vol. 52. N 5. P. 696—704. Huelsenbeck J.P., Ronquist T.MRBAYES: Bayesian inference of phylogenetic trees // Bioinformatics. 2001. Vol. 17. N 8. P. 754—755. Hasegawa M, Kishino H, Yano T. Man's place in Hominoidea as inferred from molecular clocks of DNA // J. Molec. Evol. 1987. Vol. 26. N 1—2. P. 132—147. Paradis E., Claude J., Strimmer K. APE: analyses of phylogenetics and evolution in R language // Bioinformatics. 2004. Vol. 20. N 2. P. 289—290. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1275 2023-12-04T08:03:04Z jour:STM driver

Rheological behavior of polysaccharide hydrogels of alginate reinforced by small amount of halloysite nanotubes for extrusion 3D printing Реологические свойства полисахаридных гидрогелей альгината с малыми добавками нанотрубок галлуазита для экструзионной 3D-печати V. S. Molchanov S. A. Glukhov O. E. Philippova В. С. Молчанов С. А. Глухова О. Е. Филиппова сетки viscoelasticity hydrogel halloysite alginate networks сетки вязкоупругость гидрогель галлуазит альгинат сетки The rheological properties of hydrogels of a natural polysaccharide sodium alginate and small amount of clay nanotubes of halloysite were investigated. Changes of rheological properties during the transition from a semi-dilute polymer solution to a hydrogel upon cross-linking by calcium ions were shown. In the gel state, the samples have a yield stress, and their viscosity decreases with the shear rate, but the properties are quickly recovered after the load removal. It was obtained that the addition of up to 0.3 vol.% nanotubes of natural clay halloysite leads to an increase by several times of a storage modulus and an yield stress of the hydrogels. At the same time, the practically important properties of shear thinning and the rapid recovery of properties after the load removing make the nanocomposite hydrogels of alginate and halloysite nanotubes promising for use as ink for extrusion 3D printing. Исследованы реологические свойства гидрогелей природного полисахарида альгината натрия при наполнении матрицы нанотрубками глины галлуазита в малых концентрациях. Выявлены изменения реологических свойств при переходе от полуразбавленного раствора полимера к гидрогелю при сшивании ионами кальция. В состоянии геля образцы обладают пределом текучести, и их вязкость при течении падает при увеличении скорости сдвига, но реологические свойства достаточно быстро восстанавливаются после снятия нагрузки. Обнаружено, что добавление до 0,3 об.% нанотрубок природной глины галлуазита приводит к увеличению модуля упругости и предела текучести гидрогеля в несколько раз, но при этом сохраняются практически важные свойства псевдопластичности и быстрого восстановления свойств после снятия нагрузки, что делает нанокомпозитные гидрогели альгината и нанотрубок галлуазита перспективными для применения в качестве чернил для экструзионной 3D-печати. Lomonosov Moscow State University, School of Biology This work was supported by the Russian Science Foundation, project number 23-13-00177. Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда (проект №23-13-00177). Исследования проведены без использования животных и без привлечения людей в качестве испытуемых. 2023-12-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1275 10.55959/MSU0137-0952-16-78-3S-11 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 78, № 3S (2023); 63-68 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 78, № 3S (2023); 63-68 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1275/646 Liu J., Sun L., Xu W., Wang Q., Yu S., Sun J. Current advances and future perspectives of 3D printing natural-derived biopolymers. Carbohydr. Polym. 2019;207:297–316. Mobaraki M., Ghaffari M., Yazdanpanah A., Luo Y., Mills D.K. Bioinks and bioprinting: A focused review. Bioprinting. 2020;18:e00080. Valentine A.D., Busbee T.A., Boley J.W., Raney J.R., Chortos A., Kotikian A., Berrigan J.D., Durstock M.F., Lewis J.A. Hybrid 3D printing of soft electronics. Adv. Mater. 2017;29(40):1703817. Arzhakova O.V., Arzhakov M.S., Badamshina E.R., et al. Polymers for the future. Russ. Chem. Rev. 2022;91(12):RCR5062. Li H., Tan C., Li L. Review of 3D printable hydrogels and constructs. Mater. Des. 2018;159:20–38. Truby R.L., Lewis J.A. Printing soft matter in three dimensions. Nature. 2016;540(7633):371–378. Heinrich M.A., Liu W., Jimenez A., Yang J., Akpek A., Liu X., Pi Q., Mu X., Hu N., Schiffelers R.M., Prakash J., Xie J., Zhang Y.S. 3D bioprinting: from benches to translational applications. Small. 2019;15(23): 1805510. Stanton M.M., Samitier J., Sánchez S. Bioprinting of 3D hydrogels. Lab Chip. 2015;15(15):3111–3115. Rastogi P., Kandasubramanian B. Review of alginate-based hydrogel bioprinting for application in tissue engineering. Biofabrication. 2019;11(4):42001. Diañez I., Gallegos C., Brito-de la Fuente E., Martínez I., Valencia C., Sánchez MC., Diaz M.J., Franco J.M. 3D printing in situ gelification of κ-carrageenan solutions: Effect of printing variables on the rheological response. Food Hydrocoll. 2019;87:321–330. Hu C., Du Z., Tai X., Mao X., Liu X. The property study of sodium dodecyl benzenesulfonate and polyvinylpyrrolidone complexes. Colloid Polym. Sci. 2018;335–340. Axpe E., Oyen M.L. Applications of alginate-based bioinks in 3D bioprinting. Int. J. Mol. Sci. 2016;17(12):1976. Murphy S.V., Atala A. 3D bioprinting of tissues and organs. Nat. Biotechnol. 2014;32(8):773–785. Dávila J.L., d’Ávila M.A. Rheological evaluation of Laponite/alginate inks for 3D extrusion-based printing. Int. J. Adv. Manuf. Technol. 2019;101(1–4):675–686. Peak C.W., Stein J., Gold K.A., Gaharwar A.K. Nanoengineered colloidal inks for 3D bioprinting. Langmuir. 2018;34(3):917–925. Liu L., Wan Y., Xie Y., Zhai R., Zhang B., Liu J. The removal of dye from aqueous solution using alginatehalloysite nanotube beads. Chem. Eng. J. 2012;187:210–216. Del Buffa S., Rinaldi E., Carretti E., Ridi F., Bonini M., Baglioni P. Injectable composites via functionalization of 1D nanoclays and biodegradable coupling with a polysaccharide hydrogel. Colloids Surf. B Biointerfaces. 2016;145:562–526. Li H., Liu S., Li L. Rheological study on 3D printability of alginate hydrogel and effect of graphene oxide. Int. J. Bioprinting. 2016;2(2):58–66. Glukhova S.A., Molchanov V.S., Lokshin B.V., Rogachev A.V., Tsarenko A.A., Patsaev T.D., Kamyshinsky R.A., Philippova O.E. Printable alginate hydrogels with embedded network of halloysite nanotubes: Effect of polymer cross-linking on rheological properties and microstructure. Polymers. 2021;13(23):4130. Glukhova S.A., Molchanov V.S., Chesnokov Y.M., Lokshin B.V., Kharitonova E.P., Philippova O.E. Green nanocomposite gels based on binary network of sodium alginate and percolating halloysite clay nanotubes for 3D printing. Carbohydr. Polym. 2022;282:119106. Stokke B.T., Draget K.I., Smidsrod O., Yuguchi Y., Urakawa H., Kajiwara K. Small-angle X-ray scattering and rheological characterization of alginate gels. 3. Alginic acid gels. Macromolecules. 2000;33(5):1853–1863. Cavallaro G., Chiappisi L., Pasbakhsh P., Gradzielski M., Lazzara G. A structural comparison of halloysite nanotubes of different origin by small-angle neutron scattering (SANS) and electric birefringence. Appl. Clay Sci. 2018;160:71–80. Hernández R., Sacristán J., Mijangos C. Sol/gel transition of aqueous alginate solutions induced by Fe2+ cations. Macromol. Chem. Phys. 2010;211(11):1254–1260. Li H., Liu S., Li L. Rheological study on 3D printability of alginate hydrogel and effect of graphene oxide. Int. J. Bioprinting. 2016;2(2):54–66. Hashemnejad S.M., Kundu S. Rheological properties and failure of alginate hydrogels with ionic and covalent crosslinks. Soft Matter. 2019;15(39):7852–7862. Molchanov V.S., Efremova M.A., Kiseleva T.Y., Philippova O.E. Injectable ultra-soft hydrogel with natural nanoclay. Nanosyst.: Phys. Chem. Math. 2019;10(1):76–85. Shishkhanova K.B., Molchanov V.S., Baranov A.N., Kharitonova E.P., Orekhov A.S., Arkharova N.A., Philippova O.E. A pH-triggered reinforcement of transient network of wormlike micelles by halloysite nanotubes of different charge. J. Mol. Liq. 2023;370:121032. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/234 2015-07-24T20:33:27Z jour:LOM driver

ARTIFICIAL SEEDS AS THE METHOD OF THE ECOLOGICAL PURE MEDICINAL RAW MATERIAL PRODUCTION AND THE WAY OF PRESERVATION OF THE RARE PLANTS “ИСКУССТВЕННЫЕ СЕМЕНА” КАК СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ЭКОЛОГИЧЕСКИ ЧИСТОГО ЛЕКАРСТВЕННОГО СЫРЬЯ И СОХРАНЕНИЯ ИСЧЕЗАЮЩИХ ВИДОВ РАСТЕНИЙ M. Yu. Vdovitchenko I. N. Kuzovkina М. Ю. Вдовитченко И. Н. Кузовкина зеленые корни. immobilization hairy roots green roots. зеленые корни. иммобилизация hairy roots зеленые корни. Artificial  seeds production by the  encapsulation of somatic embryos  in alginate  gel is widely applied  method in  micropropagation. In  this  study,  artificial seeds  were  obtained from  pRi  T-DNA transformed roots  (known also  as “hairy  root  culture”) of skullcap  (Scutellaria baicalensis  Georgi). Root  segments  in  artificial seeds  were  viable  after  prolonged storage  at  +4°C. The  main  parameters of  hairy  root   cultures, produced from  the  artificial seeds,   were  investigated. Using   encapsulation method, the  hairy  root  culture of skullcap  with  higher  productivity was obtained. After  encapsulation  there  was observed  the  chloroplasts formation in  root  cells  under  light  conditions, and  the  total amount of chlorophyll and  the  content of flavonoids  in  green  roots  were  determined. Исследовано влияние  инкапсулирования  в  гелевую   оболочку сегментов изолированно растущих pRi  Т-ДНК трансформированных корней лекарственного растения шлемника байкальского  (Scutellaria baicalensis  Georgi) на  морфологические, анатомические, физиологические   и  биохимические  параметры  корневых  культур, возобновляемых  из  так  называемых “искусственных семян” (ИС). Полученные ИС  сохраняли жизнеспособность после  длительного  хранения при  температуре +4°.  С  помощью инкапсулирования было  проведено обновление и  оздоровление корневой культуры шлемника. При  изучении анатомических особенностей культуры корней, возобновленной из  ИС, было  отмечено формирование хлоропластов  в клетках корней, культивируемых в условиях освещения. Определено общее  количество хлорофилла  и   соотношение  хлорофиллов  a  и   b,  а  также   содержание  флавонов  в  зеленых  корнях.  Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-24 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/234 10.1234/XXXX-XXXX-2011-2-4-6 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 2 (2011); 4-6 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 2 (2011); 4-6 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2011-2 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/234/232 Murashige T. Plant growth substances in commercial uses of tissue culture // In Frontiers of Plant Tissue Culture / Ed. Т. Thrope. Calgary: International Association of Plant Tissue Culture, 1978. P. 15—26. Uozumi N., Nakasbimada Y., Kato Y., Andy Kobay- asbi T. Production of artificial seed from horseradish hairy root // J. Ferment. Bioeng. 1992. Vol. 74. P. 21—26. Hirata K., Mukai M., Goda S., Ishio-Kinugasa M., Yoshida K., Sakai A., Miyamoto K. Cryopreservation of hairyroot cultures of Vinca minor (L.) by encapsulation-dehydration // Biotechnology Letters. 2002. Vol. 24. P. 371—376. Кузовкина И.Н., Гусева А.В., Ковач Д., Сёке Е., Вдовитченко М.Ю. Флавоны генетически трансформированных корней шлемника байкальского (Scutellaria baicalensis Georgi) и индукция их образования при элиситации метилжасмонатом // Физиол. раст. 2005. Т. 52. С. 90—96. Wintermans J.F., De Mots A. Spectrophotometric characteristics of chlorophyll a and b and their pheophytins in ethanol // Biochim. Biophys. Acta. 1965. Vol. 109. P. 448—453. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/468 2017-07-28T14:01:51Z jour:GID driver

PHOTOTROPHIC PICOEUKARYOTES OF THE ONEGA BAY, THE WHITE SEA: ABUNDANCE AND SPEСIES COMPOSITION ОБИЛИЕ И ВИДОВОЙ СОСТАВ ФОТОАВТОТРОФНЫХ ПИКОЭУКАРИОТ ОНЕЖСКОГО ЗАЛИВА БЕЛОГО МОРЯ T. A. Belevich L. V. Ilyash I. A. Milyutina M. D. Logacheva A. V. Troitsky Т. А. Белевич Л. В. Ильяш И. А. Милютина М. Д. Логачева А. В. Троицкий метагеномный анализ phototrophic picoeukaryotes Micromonas Bathycoccus Ostreococcus Illumina sequencing метагеномный анализ фототрофные пикоэукариоты Micromonas Bathycoccus Ostreococcus метагеномный анализ The abundance, biomass and species composition of phototrophic picoeukaryotes (PPE, cells size less than 3 μm) were studied in Onega Bay of the White Sea in June 2015. The highest PPE abundance and biomass were registered in the 0–5 m water layer. In the bay the average (in the 0–5 m water layer) abundance and biomass varied from 0 to 36,8 ·104 cell/l and from 0 to 117 μg С/m3, respectively. The Illumina sequencing of V4 region of 18S rRNA gene revealed eight classes of PPE. Mamiellophyceae dominated both in number of reads and operational taxonomic units. The green algae Bathycoccus prasinos, Ostreococcus tauri and Micromonas pusila, as well as diatoms Skeletonema marinoi and Minidiscus trioculatus were identified to species level. Численность, биомасса и состав фотоавтотрофных пикоэукариот (ФПЭ, размер клеток менее 3 мкм) оценены в Онежском заливе Белого моря в июне 2015 г. Наибольшие значения численности и биомассы ФПЭ были приурочены к слою 0–5 м, в котором средние значения этих показателей ФПЭ по акватории залива изменялись в пределах 0–36,8 ·104 кл/л и 0–117 мкг С/м3, соответственно. Метагеномное секвенирование области V4 гена 18S рРНК выявило присутствие таксонов ФПЭ, относящихся к восьми классам водорослей. По числу прочтений и операционных таксономических единиц преобладали Mamiellophyceae. До видового уровня идентифицированы зелёные водоросли Bathycoccus prasinos, Ostreococcus tauri и Micromonas pusila, а также диатомеи Skeletonema marinoi и Minidiscus trioculatus. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2017-07-28 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/468 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 72, № 3 (2017); 128-134 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 72, № 3 (2017); 128-134 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/468/392 Li W.K., McLaughlin F.A., Lovejoy C., Carmack E.C. Smallest algae thrive as the Arctic Ocean freshens // Science. 2009. Vol. 326. N 5952. P. 539. Kirkham A.R., Lepère C., Jardillier L.E., Not F., Bouman H., Mead A., Scanlan D.J. A global perspective on marine photosynthetic picoeukaryote community structure // The ISME J. 2013. Vol. 7. N 5. P. 922–936. Kilias E.S., Nöthig E.-M., Wolf C., Metfies K. Picoeukaryote plankton composition off West Spitsbergen at the entrance to the Arctic Ocean // J. Eukaryot. Microbiol. 2014. Vol. 61. N 6. P. 569–579. Metfies K., von Appen W.-J., Kilias E., Nicolaus A., Nöthig E.-M. Biogeography and photosynthetic biomass of arctic marine pico-eukaryotes during summer of the record sea ice minimum 2016 // PLoS ONE. 2016. Vol. 11. N 2. e0148512. Intergovernmental panel on climate change. Working group I 2007. Climate change 2007: the physical science basis. Contribution of working group I to the fourth assessment report of the intergovernmental panel on climate change / Eds. S. Solomon, D. Qin, M. Manning, Z. Chen, M. Marquis, K.B. Averyt, M. Tignor, and H.L. Miller. Cambridge Univ. Press, 2007. 996 pp. Lovejoy C., Vincent W.F., Bonilla S., Roy S., Martineau M.J., Terrado R., Potvin M., Massana R., Pedros-Alio C. Distribution, phylogeny, and growth of cold-adapted picoprasinophytes in arctic seas // J. Phycol. 2007. Vol. 43. N 1. P. 78–89. Berger V., Dahle S., Galaktionov K., Kosobokova X., Naumov A., Rat’kova T., Savinov V., Savinova T. White Sea. Ecology and Environment. St-Petersburg: Zoological Institute Russian Academy of Sciences, 2001. 157 p. Belevich T.A., Ilyash L.V., Milyutina I.A., Logacheva M.D., Goryunov D.V., Troitsky A.V. Metagenomic analyses of White Sea picoalgae: first data // Biochemistry. 2015. Vol. 80. N 11. P. 1514–1521. Belevich T.A., Ilyash L.V., Zimin A.V., Kravchishina M.D., Novikhin A.E., Dobrotina E.D. Peculiarities of summer phytoplankton spatial distribution in Onega Bay of the White Sea under local hydrophysical conditions // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2016. Vol. 71. N 3. P. 135–140. Hillebrand H., Dürselen C.-D., Kirschtel D., Pollingher U., Zohary T. Biovolume calculation for pelagic and benthic microalgae // J. Phycol. 1999. Vol. 5. N 2. P. 403–424. Verity P.G., Robertson C.Y., Tronzo C.R., Andrews M.G., Nelson J.R., Sieracki M.E. Relationship between cell volume and the carbon and nitrogen content of marine photosynthetic nanoplankton // Limnol. Oceanogr. 1992. Vol. 37. N 7. P. 1434–1446. Schloss P.D., Westcott S.L., Ryabin T. et al. Introducing mothur: open-source, platform- independent, community- supported software for describing and comparing microbial communities // Appl. Environ. Microbiol. 2009. Vol. 75. N 23. P. 7537–7541. Quast C., Pruesse E., Yilmaz P., Gerken J., Schweer T., Yarza P., Peplies J., Glockner F.O. The SILVA ribosomal RNA gene database project: improved data processing and webbased tools // Nucleic Acids Res. 2013. Vol. 41. N D1. P. D590–D596. Vaulot D., Eikrem W., Viprey M., Moreau H. The diversity of small eukaryotic phytoplankton (≤3 μm) in marine ecosystems // FEMS Microb. Rev. 2008. Vol. 32. N 5. P. 795–820. Zhu F., Massana R., Not F., Marie D., Vaulot D. Mapping of picoeucaryotes in marine ecosystems with quantitative PCR of the 18S rRNA gene // FEMS Microbiol. Ecol. 2005. Vol. 52. N 1. P. 79–92. Worden A.Z., Lee J.-H., Mock T. et al. Green evolution and dynamic adaptations revealed by genomes of the marine picoeukaryotes Micromonas // Science. 2009. Vol. 324. N 5924. P. 268–272. Choi D.Y., An S.M., Chun S., Yang E.C., Selph K.E., Lee C.M., Noh J.H. Dynamic changes in the composition of photosynthetic picoeukaryotes in the northwestern Pacific Ocean revealed by high-throughput tag sequencing of plastid 16S rRNA genes // FEMS Microbiol Ecol. 2016. Vol. 92. N 2. fiv170. Ilyash L.V., Belevich T.A., Stupnikova A.N., Drits A.V., Flint M.V. Effects of local hydrophysical conditions on the spatial variability of phytoplankton in the White Sea // Oceanology. 2015. Vol. 55. N 2. P. 216–225. Zhang F., He J., Lin L., Jin H. Dominance of picophytoplankton in the newly open surface water of the central Arctic Ocean // Polar Biol. 2015. Vol. 38. N 7. P. 1081–1089. Clayton S., Lin Y.-C., Follows M.J., Worden A.Z. Coexistence of distinct Ostreococcus ecotypes at an oceanic front // Limnol. Oceanogr. 2017. Vol. 62. N 1. P. 75–88. Simmons M.P., Bachy C., Sudek S., van Baren M.J., Sudek L., Ares M. Jr., Worden A.Z. Intron invasions trace algal speciation and reveal nearly identical Arctic and Antarctic Micromonas populations // Mol. Biol. Evol. 2015. Vol. 32. N 9. P. 2219–2235. Ichinomiya M., Lopes dos Santos A., Gourvil P., Yoshikawa S., Kamiya M., Ohki K., Audic S., Vargas C. de Noël M.-H., Vaulot D., Kuwata A. Diversity and oceanic distribution of the Parmales (Bolidophyceae), a picoplanktonic group closely related to diatoms // ISME J. 2016. Vol. 10. N 10. P. 2419–2434. Balzano S., Marie D., Gourvil P., Vaulot D. Composition of the summer photosynthetic pico and nanoplankton communities in the Beaufort Sea assessed by T-RFLP and sequences of the 18S rRNA gene from flow cytometry sorted samples // The ISME J. 2012. Vol. 6. N 8. P. 1480–1498. Marquardt M., Vader A., Stübner E.I., Reigstad M., Gabrielsen T.M. Strong seasonality of marine microbial eukaryotes in a high-Arctic fjord (Isfjorden, West Spitsbergen) // Appl. Environ. Microbiol. 2016. Vol. 82. N 6. P. 1868–1880. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/578 2019-08-06T13:35:09Z jour:GR driver

ON THE CHOICE OF CONTROL OBJECTS IN EXPERIMENTAL GERONTOLOGICAL RESEARCH О ВЫБОРЕ КОНТРОЛЬНЫХ ОБЪЕКТОВ В ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНО-ГЕРОНТОЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЯХ A. N. Khokhlov A. A. Klebanov G. V. Morgunova А. Н. Хохлов А. А. Клебанов Г. В. Моргунова экспериментальные животные cell senescence geroprotectors control groups cell cultures experimental animals экспериментальные животные клеточное старение геропротекторы контрольные группы клеточные культуры экспериментальные животные Recently, a large number of papers have appeared that describe the successful use of various biologically active compounds (mitochondrial antioxidants, antidiabetic biguanides, mimetics of dietary restriction, etc.) as geroprotectors. However, in our opinion, in most cases, the positive results of such studies are determined by a “successful” selection of control objects. As such, animals with some abnormalities are often used, so that any favorable effect on the corresponding pathological processes leads to an increase in life span. Besides, control animals can be normal, i.e. wild type, but placed in some extreme conditions, which can be overcome precisely by certain biologically active compounds. Thus, treatment of pathologies is present, and not an effect on the fundamental processes of aging. There is a point of view, according to which the results of Clive McСay’s experiments, which have significantly prolonged the life of rats by limiting caloric intake, are determined, firstly, by the fact that the control animals were fed ad libitum (which is not at all characteristic of animals in the wild), and secondly, because the Fisher-344 rats used in experiments are short-lived. The above considerations seem to concern also gerontological experiments on cultured cells. In particular, we sometimes hear from our colleagues remarks about the model of “stationary phase aging” of cell cultures used in our laboratory due to the fact that most of the experiments are carried out on transformed rather than normal cells. However, this approach seems to us quite justified, because the phenomenon of “stationary phase”/chronological aging is common to a wide variety of cells, including bacteria, yeasts, cyanobacteria, mycoplasmas, animal and plant cells. Herewith cells with unlimited mitotic potential do not change either from experiment to experiment or during long-term cultivation both with and without (in the framework of stationary phase aging model) subcultivation, which cannot be said of normal diploid fibroblasts, whose telomeres are shortened with each division (and from the moment of seeding of the cells to their entering the stationary phase of growth they can divide up to 10 times!). We believe that to search for effective geroprotectors, which provide an impact on the fundamental mechanisms of aging, it is necessary to conduct studies on “maximally healthy” animals, or on “maximally stable” model systems. В последнее время появилось большое количество публикаций, описывающих успешное использование различных биологически активных соединений в качестве геропротекторов. Среди таких препаратов – короткие пептиды, митохондриальные антиоксиданты, антидиабетические бигуаниды, миметики ограничения питания, модуляторы аутофагии и др. Однако, на наш взгляд, в большинстве случаев положительные результаты таких исследований определяются “удачным” выбором контрольных объектов. В качестве таковых часто используются животные с какими-либо аномалиями, так что любое благоприятное воздействие на соответствующие патологические процессы ведет к увеличению продолжительности жизни (впрочем, контрольные животные могут быть нормальными, т.е. дикого типа, но помещенными в некоторые экстремальные условия, бороться с которыми как раз и могут помогать определенные биологически активные соединения). Таким образом, налицо лечение патологий, а не воздействие на фундаментальные процессы старения. Существует точка зрения, согласно которой известные всему миру результаты опытов Клайва Маккея, значительно продлившего жизнь крысам с помощью ограничения калорийности питания, определяются, во-первых, тем, что контрольные животные питались ad libitum, т.е. потребляли столько пищи, сколько хотели съесть (что совершенно не свойственно животным в дикой природе), а во-вторых, тем, что использованные в экспериментах крысы Фишер-344 являются короткоживущими. Вышеупомянутые соображения, по-видимому, касаются и геронтологических экспериментов на клеточных культурах. В частности, мы иногда слышим от коллег замечания в адрес используемой в нашей лаборатории модели “стационарного старения” клеточных культур в связи с тем, что большинство экспериментов проводятся на трансформированных, а не на нормальных клетках. Однако такой подход представляется нам вполне оправданным, так как феномен “стационарного”/хронологического старения свойствен самым разным клеткам, среди которых бактерии, дрожжи, цианобактерии, микоплазмы, клетки животных и растений. При этом клетки с неограниченным митотическим потенциалом не изменяются ни от эксперимента к эксперименту, ни в процессе длительного культивирования как с пересевами, так и без пересевов (в рамках модели “стационарного старения”), чего не скажешь о нормальных диплоидных фибробластах, теломеры которых укорачиваются при каждом делении. А от момента посева клеток до входа их в стационарную фазу роста клетки могут поделиться до 10 раз! Мы полагаем, что для поиска эффективных геропротекторов, обеспечивающих воздействие на фундаментальные механизмы старения, необходимо проводить исследования на “максимально здоровых” животных либо на “максимально стабильных” модельных системах. Lomonosov Moscow State University, School of Biology Работа выполнена в рамках государственного задания МГУ, ч. 2 (фундаментальные научные исследования, № АААА-А16-116021660098-8). Исследования Г.В. Моргуновой поддержаны стипендией Президента РФ (SP-4224.2018.4) и грантом Российского фонда фундаментальных исследований (проект № 18-34-00813 мол_а) 2018-05-03 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/578 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 73, № 2 (2018); 72-77 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 73, № 2 (2018); 72-77 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/578/472 McCay C.M., Crowell M.F., Maynard L.A. The effect of retarded growth upon the length of life span and upon the ultimate body size // J. Nutr. 1935. Vol. 10. N 1. P. 63–79. Chesky J.A., Rockstein M. Life span characteristics in the male Fischer rat // Exp. Aging Res. 1976. Vol. 2. N 5. P. 399–407. Carey J.R., Judge D.S. Longevity records: life spans of mammals, birds, amphibians, reptiles, and fish. Odense monographs on population aging, 8. Odense: Odense Univ. Press, 2000. 214 pp. Nistiar F., Racz O., Lukacinova A., Hubkova B., No-vakova J., Lovasova E., Sedlakova E. Age dependency on some physiological and biochemical parameters of male Wi-star rats in controlled environment // J. Environ. Sci. Health A Tox. Hazard Subst. Environ. Eng. 2012. Vol. 47. N 9. P. 1224–1233. Maronpot R.R., Nyska A., Foreman J.E., Ramot Y. The legacy of the F344 rat as a cancer bioassay model (a retrospective summary of three common F344 rat neoplasms) // Crit. Rev. Toxicol. 2016. Vol. 46. N 8. P. 641–675. McCay C. M., Pope F., Lunsford W. Experimental prolongation of the life span // Bull. N. Y. Acad. Med. 1956. Vol. 32. N 2. P. 91–101. Khokhlov A.N. From Carrel to Hayflick and back, or what we got from the 100-year cytogerontological studies // Biophysics. 2010. Vol. 55. N 5. P. 859–864. Wei L., Li Y., He J., Khokhlov A.N. Teaching the cell biology of aging at the Harbin Institute of Technology and Moscow State University // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2012. Vol. 67. N 1. P. 13–16. Khokhlov A.N., Klebanov A.A., Morgunova G.V. Does aging have a purpose? // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2017. Vol. 72. N 4. P. 222–224. Takeda T., Hosokawa M., Takeshita S., Irino M., Higuchi K., Matsushita T., Tomita Y., Yasuhira K., Ha mamoto H., Shimizu K., Ishii M., Yamamuro T. A new murine model of accelerated senescence // Mech. Ageing Dev. 1981. Vol. 17. N 2. P. 183–194. Takeda T., Hosokawa M., Higuchi K. Senescence-accelerated mouse (SAM): a novel murine model of senescence // Exp. Gerontol. 1997. Vol. 32. N 1–2. P. 105–109. Takeda T. Senescence-accelerated mouse (SAM) with special references to neurodegeneration models, SAMP8 and SAMP10 mice // Neurochem. Res. 2009. Vol. 34. N 4. P. 639–659. Yuneva M.O., Bulygina E.R., Gallant S.C., Kramarenko G.G., Stvolinsky S.L., Semyonova M.L., Boldy rev A.A. Effect of carnosine on age-induced changes in senescence-accelerated mice // J. Anti-Aging Med. 1999. Vol. 2. N 4. P. 337–342. Li L., Ng T.B., Gao W., Li W., Fu M., Niu S.M., Zhao L., Chen R.R., Liu F. Antioxidant activity of gallic acid from rose flowers in senescence accelerated mice // Life Sci. 2005. Vol. 77. N 2. P. 230–240. Chan Y.C., Hosoda K., Tsai C.J., Yamamoto S., Wang M.F. Favorable effects of tea on reducing the cognitive deficits and brain morphological changes in senescence-accelerated mice // J. Nutr. Sci. Vitaminol. (Tokyo). 2006. Vol. 52. N 4. P. 266–273. Kolosova N.G., Stefanova N.A., Korbolina E.E., Fur-sova A.Zh., Kozhevnikova O.S. Senescence-acce lerated OXYS rats: a genetic model of premature aging and age-related diseases // Adv. Gerontol. 2014. Vol. 4. N. 4. P. 294–298. Morley J.E., Armbrecht H.J., Farr S.A., Kumar V.B. The senescence accelerated mouse (SAMP8) as a model for oxidative stress and Alzheimer’s disease // Biochim. Biophys. Acta. 2012. Vol. 1822. N 5. P. 650–656. Stefanova N.A., Kolosova N.G. Evolution of Alzheimer’s disease pathogenesis conception // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2016. Vol. 71. N 1. P. 4–10. Kolosova N.G., Muraleva N.A., Zhdankina A.A., Stefanova N.A., Fursova A.Z., Blagosklonny M.V. Prevention of age-related macular degeneration-like retinopathy by rapamycin in rats // Am. J. Pathol. 2012. Vol. 181. N 2. P. 472–477. Loshchenova P.S., Sinitsyna O.I., Fedoseeva L.A., Stefanova N.A., Kolosova N.G. Influence of antioxidant SkQ1 on accumulation of mitochondrial DNA deletions in the hippocampus of senescence-accelerated OXYS rats // Biochemistry (Moscow). 2015. Vol. 80. N 5. P. 596–603. Kolosova N.G., Vitovtov A.O., Stefanova N.A. Met-formin reduces the signs of sarcopenia in old OXYS rats // Adv. Gerontol. 2016. Vol. 6. N 1. P. 70–74. Shabalina I.G., Vyssokikh M.Y., Gibanova N., Csikasz R.I., Edgar D., Hallden-Waldemarson A., Rozhdestvenskaya Z., Bakeeva L.E., Vays V.B., Pustovidko A.V., Skula -chev M.V., Cannon B., Skulachev V.P., Nedergaard J. Improved health-span and lifespan in mtDNA mutator mice treated with the mitochondrially targeted antioxidant SkQ1 // Aging (Albany NY). 2017. Vol. 9. N 2. P. 315–336. Anisimov V.N., Egorov M.V., Krasilshchikova M.S. et al. Effects of the mitochondria-targeted antioxidant SkQ1 on lifespan of rodents // Aging (Albany NY). 2011. Vol. 3. N 11. P. 1110–1119. Frolkis V.V., Muradian Kh.K. Life span prolongation. Boca Raton: CRC Press, 1991. 427 pp. Khokhlov A.N., Klebanov A.A., Morgunova G.V. Anti-aging drug discovery in experimental gerontological studies: from organism to cell and back // Aging: exploring a complex phenomenon / Ed. Sh.I. Ahmad. Boca Raton: Taylor & Francis, 2018. P. 577–595. Khokhlov A.N., Morgunova G.V. Testing of geroprotectors in experiments on cell cultures: pros and cons // Anti-aging drugs: From basic research to clinical practice / Ed. A.M. Vaiserman. Royal Society of Chemistry, 2017. P. 53–74. Morgunova G.V., Klebanov A.A., Khokhlov A.N. Interpretation of data about the impact of biologically active compounds on viability of cultured cells of various origin from a gerontological point of view // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2016. Vol. 71. N 2. P. 62–70. Khokhlov A.N., Morgunova G.V. On the constructing of survival curves for cultured cells in cytogerontological experiments: a brief note with three hierarchy diagrams // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2015. Vol. 70. N 2. P. 67–71. Khokhlov A.N. Which aging in yeast is “true”? // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2016. Vol. 71. N 1. P. 11–13. Morgunova G.V., Klebanov A.A., Marotta F., Khokhlov A.N. Culture medium pH and stationary phase/chronological aging of different cells // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2017. Vol. 72. N 2. P. 47–51. Khokhlov A.N. Evolution of the term “cellular senescence” and its impact on the current cytogerontological research // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2013. Vol. 68. N 4. P. 158–161. von Zglinicki T., Saretzki G., Döcke W., Lotze C. Mild hyperoxia shortens telomeres and inhibits proliferation of fibroblasts: a model for senescence? // Exp. Cell Res. 1995. Vol. 220. N 1. P. 186–193. Saretzki G., Feng J., von Zglinicki T., Villeponteau B. Similar gene expression pattern in senescent and hyperoxic-treated fibroblasts // J. Gerontol. A Biol. Sci. Med. Sci. 1998. Vol. 53. N 6. P. B438–B442. von Zglinicki T., Pilger R., Sitte N. Accumulation of single-strand breaks is the major cause of telomere shortening in human fibroblasts // Free Radic. Biol. Med. 2000. Vol. 28. N 1. P. 64–74. Khokhlov A.N. Stationary cell cultures as a tool for gerontological studies // Ann. N.Y. Acad. Sci. 1992. Vol. 663. P. 475–476. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1019 2021-11-08T13:21:25Z jour:RA driver

Effect of ONC201 antitumor drug on the number of mitochondrial nucleoids in BT474 breast cancer cells in culture Действие противоопухолевого препарата ONC201 на число митохондриальных нуклеоидов в культуре клеток рака молочной железы BT474 A. A. Mishukov A. V. Berezhnov M. I. Kobyakova Ya. V. Evstratova E. Yu. Mndlyan E. L. Holmuhamedov А. А. Мишуков А. В. Бережнов М. И. Кобякова Я. В. Евстратова Е. Ю. Мндлян Э. Л. Холмухамедов анализ изображений cell culture BT474 ONC201 fragmentation of mitochondria mitochondrial nucleoids mitochondrial DNA image analysis анализ изображений культура клеток ВТ474 ONC201 фрагментация митохондрий митохондриальные нуклеоиды митохондриальная ДНК анализ изображений The effect of the cytostatic antitumor drug ONC201 on the number of mitochondrial nucleoids and the average size of mitochondria in the BT474 human breast cancer cells was studied. It was shown that incubation of BT474 cells with ONC201 (10 μM) for 24 h reduces the number of nucleoids from 262 ± 46 to 140 ± 27 per cell, and in cells incubated with drug for 48 h the number of mitochondrial nucleoids was further reduced to 67 ± 22 per cell. It was found that the ONC201-induced change in the number of nucleoids per cell depends on the duration of treatment. Short-term (24 h) and long-term (48 h) exposure of cells to a single dose of ONC201 led to a reversible and irreversible change in the number of nucleoids per cell, respectively. Thus, after 24 h of exposure and subsequent 120 h washout with ONC201-free medium, the number of nucleoids was restored to 211 ± 47 per cell, while 120-hour washout of drug after 48 hours of treatment did not lead to the restoration of the number of nucleoids, and their number remained at the level of 70 ± 59 per cell. Changes in the number of mitochondrial nucleoids, regardless of the duration of cell treatment with ONC201, positively correlated with changes in the average size of mitochondria as an indicator of their morphology. It is concluded that ONC201 has a cytostatic effect on BT474 cells in culture, suppresses cell proliferation and induces a reversible or irreversible decrease in the number of mitochondrial nucleoids and fragmentation of mitochondria, depending on the duration of treatment. Исследовано действие цитостатического противоопухолевого препарата ONC201 на число митохондриальных нуклеоидов в клетке и средний размер митохондрий в культуре клеток рака молочной железы человека линии BT474. Показано, что инкубация клеток BT474 в течение 24 ч с ONC201 (10 мкМ) снижает количество нуклеоидов с 262 ± 46 до 140 ± 27 на клетку, а увеличение длительности инкубации до 48 ч сопровождается снижением количества митохондриальных нуклеоидов до 67 ± 22 на клетку. Обнаружено, что ONC201-индуцированное изменение числа нуклеоидов на клетку зависело от длительности присутствия агента в среде инкубации. Кратковременное (24 ч) и долговременное (48 ч) воздействия на клетки однократной дозы ONC201 приводили к обратимому и/или необратимому изменению количества нуклеоидов на клетку. Так, после 24 ч обработки и последующей инкубации клеток в свободной от ONC201 среде (отмывка) в течение 120 ч, наблюдалось восстановление количества нуклеоидов до 211 ± 47 на клетку. Напротив, 120-часовая отмывка клеток, после 48 ч обработки, не приводила к восстановлению количества нуклеоидов, и их количество оставалось на уровне 70 ± 59 на клетку. Изменение количества митохондриальных нуклеоидов, независимо от длительности обработки клеток препаратом ONC201, положительно коррелирует с изменением среднего размера митохондрий как показателя их морфологии. Заключается, что ONC201 оказывает цитостатическое действие на клетки ВТ474 в культуре, подавляет пролиферацию клеток, индуцирует зависимое от длительности обработки обратимое или необратимое уменьшение числа митохондриальных нуклеоидов и фрагментацию митохондрий. Lomonosov Moscow State University, School of Biology Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда (проект № 19-75- 20-145, Э.Л.Х.). А.A.М. выражает благодарность коллективу Лаборатории фармакологической регуляции клеточной резистентности ИТЭБ РАН за поддержку при выполнении этой работы. 2021-08-03 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1019 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 76, № 3 (2021); 110-117 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 76, № 3 (2021); 110-117 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1019/554 Allen J.E., Kline C.L., Prabhu V.V., et al. Discovery and clinical introduction of first-in-class imipridone ONC201 // Oncotarget. 2016. Vol. 7. N 45. P. 74380–74392. Arrillaga-Romany I., Chi A.S., Allen J.E., Oster W., Wen P.Y., Batchelor T.T. A phase 2 study of the first imipridone ONC201, a selective DRD2 antagonist for oncology, administered every three weeks in recurrent glioblastoma // Oncotarget. 2017. Vol. 8. N 45. P. 79298–79304. Graves P.R., Aponte-Collazo L.J., Fennell E.M. J., et al. Mitochondrial protease ClpP is a target for the anticancer compounds ONC201 and related analogues // ACS Chem. Biol. 2019. Vol. 14. N 5. P. 1020–1029. Ishizawa J., Zarabi S.F., Davis R.E., et al. Mitochondrial ClpP-mediated proteolysis induces selective cancer cell lethality // Cancer Cell. 2019. Vol. 35. N 5. P. 721–737. Greer Y.E., Porat-Shliom N., Nagashima K., et al. ONC201 kills breast cancer cells in vitro by targeting mitochondria // Oncotarget. 2018. Vol. 9. N 26. P. 18454–18479. Stoker M.L., Newport E., Hulit J.C., West A.P., Morten K.J. Impact of pharmacological agents on mitochondrial function: a growing opportunity? // Biochem. Soc. Trans. 2019. Vol. 47. N 6. P. 1757–1772. Taanman J.W. The mitochondrial genome: structure, transcription, translation and replication // Biochim. Biophys. Acta 1999. Vol. 1410. N 2. P. 103–123. Calvo S.E., Mootha V.K. The mitochondrial proteome and human disease // Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2010. Vol. 11. P. 25–44. Green D.R., Galluzzi L., Kroemer G. Cell biology. Metabolic control of cell death // Science. 2014. Vol. 345. N 6203: 1250256. Porporato P. E., Filigheddu N., Pedro J.M.B., Kroemer G., Galluzzi L. Mitochondrial metabolism and cancer // Cell Res. 2018. Vol. 28. N 3. P. 265–280. Fontana G.A., Gahlon H.L. Mechanisms of replication and repair in mitochondrial DNA deletion formation // Nucleic Acids Res. 2020. Vol. 48. N 20. P. 11244–11258. La Morgia C., Maresca A., Caporali L., Valentino M.L., Carelli V. Mitochondrial diseases in adults // J. Intern. Med. 2020. Vol. 287. N 6. P. 592–608. Ralff M.D., Jhaveri A., Ray J.E., Zhou L., Lev A., Campbell K.S., Dicker D.T., Ross E.A., El-Deiry W.S. TRAIL receptor agonists convert the response of breast cancer cells to ONC201 from anti-proliferative to apoptotic // Oncotarget. 2020. Vol. 11. N 42. P. 3753–3769. McArthur K., Whitehead L.W., Heddleston J.M., et al. BAK/BAX macropores facilitate mitochondrial herniation and mtDNA efflux during apoptosis // Science. 2018. Vol. 359. N 6378: eaao6047. Pruss M., Dwucet A., Tanriover M., Hlavac M., Kast, R.E., Debatin K.M., Wirtz C.R., Halatsch M.E., Siegelin M.D., Westhoff M.A., Karpel-Massler G. Dual metabolic reprogramming by ONC201/TIC10 and 2-Deoxyglucose induces energy depletion and synergistic anti-cancer activity in glioblastoma // Br. J. Cancer. 2020. Vol. 122. N 8. P. 1146–1157. Kline C.L., Van den Heuvel A.P., Allen J.E., Prabhu V.V., Dicker D.T., El-Deiry, W.S. ONC201 kills solid tumor cells by triggering an integrated stress response dependent on ATF4 activation by specific eIF2alpha kinases // Sci. Signal. 2016. Vol. 9. N 415: ra18. Geiss C., Witzler C., Poschet G., Ruf W., RegnierVigouroux A. Metabolic and inflammatory reprogramming of macrophages by ONC201 translates in a pro-inflammatory environment even in presence of glioblastoma cells // Eur. J. Immunol. 2021. Vol. 51. N 5. P. 1246–1261. Kukat C., Wurm C.A., Spåhr H., Falkenberg M., Larsson N.G., Jakobs S. Super-resolution microscopy reveals that mammalian mitochondrial nucleoids have a uniform size and frequently contain a single copy of mtDNA // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011. Vol. 108. N 33. P. 13534–13539. Bonekamp N.A., Larsson N.G. SnapShot: Mitochondrial nucleoid // Cell. 2018. Vol. 172. N 1–2. P. 388–388.e1. Sasaki T., Sato Y., Higashiyama T., Sasaki N. Live imaging reveals the dynamics and regulation of mitochondrial nucleoids during the cell cycle in Fucci2- HeLa cells // Sci. Rep. 2017. Vol. 7: e11257. Leonard A.P., Cameron, R.B., Speiser J.L., Wolf B.J., Peterson Y.K., Schnellmann R.G., Beeson C.C., Rohrer B. Quantitative analysis of mitochondrial morphology and membrane potential in living cells using high-content imaging, machine learning, and morphological binning // Biochim. Biophys. Acta. 2015. Vol. 1853. N 2. P. 348–360. Schindelin J., Arganda-Carreras I., Frise E., et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis // Nat. Methods. 2012. Vol. 9. N 7. P. 676–682. Armstrong R.A. When to use the Bonferroni correction // Ophthalmic Physiol. Opt. 2014. Vol. 34. N 5. P. 502–508. Galluzzi L., Bravo-San Pedro J.M., Kroemer G. Organelle-specific initiation of cell death // Nat. Cell Biol. 2014. Vol. 16. N 8. P. 728–736. Galluzzi L., Bravo-San Pedro J. M., Kepp O., Kroemer G. Regulated cell death and adaptive stress responses // Cell Mol. Life Sci. 2016. Vol. 73. N 11–12. P. 2405–2410. Gallage, S., Gil J. Mitochondrial Dysfunction Meets Senescence // Trends Biochem. Sci. 2016. Vol. 41. N 3. P. 207–209. Vasileiou P.V.S., Evangelou K., Vlasis K., Fildisis G., Panayiotidis M.I., Chronopoulos, E., Passias P.G., Kouloukoussa M., Gorgoulis V.G., Havaki S. Mitochondrial homeostasis and cellular senescence // Cells. 2019. Vol. 8. N 7: 686. Prabhu V.V., Morrow S., Rahman Kawakibi A., et al. ONC201 and imipridones: Anti-cancer compounds with clinical efficacy // Neoplasia. 2020. Vol. 22. N 12. P. 725–744. Ishizawa J., Kojima K., Chachad D., et al. ATF4 induction through an atypical integrated stress response to ONC201 triggers p53-independent apoptosis in hematological malignancies // Sci. Signal. 2016. Vol. 9. N 415: ra17. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/144 2015-07-22T18:14:53Z jour:GN driver

TEMPORAL VARIABILITY THE GENETIC CHARACTERISTICS IN BROUN TROUT (SALMO TRUTTA L.) FROM THE VOROB’EV RIVER (WHITE SEA) ON ALLOZYME ВРЕМЕННБЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ХАРАКТЕРИСТИК КУМЖИ SALMO TRUTTA L. РУЧЬЯ ВОРОБЬЕВА (БЕЛОЕ МОРЕ) НА ОСНОВАНИИ АНАЛИЗА АЛЛОЗИМОВ A. V. Semenova S. A. Ponomarev А. В. Семёнова С. А. Пономарёв структура популяций population genetics polymorphism structure of population. структура популяций популяционная генетика полиморфизм структура популяций Analysis  of allozyme variability  in  brown  trout  from  Vorob’ev  river  was carry  out.  We  studied 17 gene  loci  coding  enzymes: glycerol-3-phosphate  dehydrogenase (G3PDH ); aspartate aminotrans- ferase  (AAT );  malate dehydrogenase (MDH );  lactate dehydrogenase (LDH );  superoxide dismutase (SOD );  esterase  D  (EST-D ).  Significant differences between   the  sampes  of  brown  trout   catching in  1981—1982   and/or 1992—1995   were  determined  by  loci:  AAT-1,2*,  G3PDH-2,3*,  LDH-5*, MDH-2*.  We  should   suppose   that   allele   frequency  changing  by  the   time   in  brown   trout   from Vorob’ev  river  were  bound up  with  genetic  drift. Проведен  анализ  аллозимной  изменчивости  кумжи из  ручья   Воробьева. Исследовано7 генных локусов, кодирующих ферменты: глицеро-3-фосфатдегидрогеназу (G3PDH);  аспартатаминотрансферазу (AAT);  малатдегидрогеназу (MDH);  лактатдегидрогеназу (LDH); супероксиддисмутазу (SOD); эстеразу D  (EST-D). Выявлены достоверные различия в частотах аллелей  локусов AAT-1,2*, G3PDH-2,3*, LDH-5*, MDH-2* между  выборками кумжи, собранной в 1981—1982  и/или 1992—1995  гг.  Предполагается, что  изменения частот  аллелей со  временем  у кумжи ручья  Воробьева связано с дрейфом генов. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-22 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/144 10.1234/XXXX-XXXX-2011-4-13-16 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 4 (2011); 13-16 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 4 (2011); 13-16 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2011-4 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/144/144 Ferguson A., Taggart J.B. Genetic differentiation among the sympatric brown trout (Salmo trutta) population of Lough Melvin, Ireland // Biol. J. Linnean Soc. 1991. Vol. 43. P. 221—237. Махров А.А., Кузищин К.В., Новиков Г.Г. Генети¬ческая дифференциация кумжи (Salmo trutta L.) побе¬режья пролива Великая салма // Генетика. 1999. Т. 35. № 7. С. 969—975. Grozier W.W., Ferguson A. Electrophoretic examination of the population structure of brown trout, Salmo trut- ta L., from the Lough Neagh catchment, Northern Ireland // J. Fish. Biol. 1986. Vol. 28. P. 459—477. Jensen L.F., Hansen M.M., Carlsson J., Loeschcke V., Mensberg K.D. Spatial and temporal genetic differentiation and effective population size of brown trout (Salmo trutta L.) in small Danish rivers // Conserv. Genet. 2005. Vol. 6. N 4. P. 615—621. Davis B.J. Disc-electrophoresis. Method and application to human serum proteins // Ann. N.-Y. Acad. Sci. 1964. Vol. 121. P. 404—427. Peacock A.C., Bunting S.L., Quenn K.G. Serum protein electrophoresis in acrilamide gel: patterns from normal human subject // Science. 1965. Vol. 147. P. 1451—1452. Allendorf F. W., Phelps S.R. Use of allelic frequencies to describe population structure // Can. J. Fish. Aquat. Sci. 1981. Vol. 38. P. 1507—1514. Shaklee J.B, Allendorf F.W, Morizot D.C., Whitt G.S. Gene nomenclature for protein-coding loci in fish // Trans. Amer. Fish. Soc. 1990. Vol. 119. P. 2—15. Waples R.S. Estimation of allele frequencies at isoloci // Genetics. 1988. Vol. 118. N 2. P. 371-384. Осинов А.Г. Кумжа (Salmo trutta L., Salmonidae) бассейнов Черного и Каспийского морей: популяцион- но-генетический анализ // Генетика. 1988. Т. 24. № 12. С. 2172-2186. Осинов А.Г, Берначе Л. "Атлантическая" и "дунайская" филогенетические группы кумжи Salmo trutta complex: генетическая дивергенция, эволюция, охрана // Вопр. ихтиологии. 1996. Т. 36. № 6. С. 762—786. Животовский Л.А. Популяционная биометрия. М.: Наука, 1991. 283 с. Zaykin D.V., Pudovkin A.I. Two programs of estimate Chi-square values using pseudo-probability test //J. Hered. 1993. Vol. 84. P. 152. Новиков Г.Г., Семенова А.В., Строганов А.Н., Тагизаде В. Аллозимная изменчивость в популяциях кумжи Salmo trutta из Ирана // Вопр. ихтиологии. 2008. Т. 48. № 4. С. 421—426. Jorde P.E., Ryman N. Demographic genetic of brown trout (Salmo trutta) and estimation of effective population size from temporal change of allele frequencies // Genetics, 1996. Vol. 143. N 3. P. 1369—1381. Allendorf F.W., Utter F.M. Population genetics // Fish Physiol. 1979. Vol. 8. P. 407—454. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1131 2023-01-09T09:17:45Z jour:RA driver

Peculiarities of Mn(II) cation oxidation in the photosystem II without oxygen-evolving complex. Evolutionary aspect Особенности окисления катионов Mn(II) в мембранных препаратах фотосистемы 2 без кислород-выделяющего комплекса. Эволюционный аспект E. R. Lovyagina L. N. Davletshina B. K. Semin Е. Р. Ловягина Л. Н. Давлетшина Б. К. Семин пероксид водорода photosystem II oxygen-evolving complex manganese, citrate hydrogen peroxide пероксид водорода фотосистема 2 кислород-выделяющий комплекс марганец цитрат пероксид водорода One of the main reactions in the process of the light energy transformation in oxygenic organisms is the extraction of electrons from water, which are necessary for the light stage of photosynthesis. The light-dependent oxidation of water is carried out by an oxygen-evolving complex (OEC), the catalytic center of which is the cluster Mn4CaO5. OEC is located in photosystem II (PSII) on the lumen side of thylakoid membrane. The evolutionary origin of the PSII is unclear, as is the origin of the manganese cluster in the OEC. Recently, Johnson et al. (2013) suggested that in the primary PSII in the Archean period, the cluster Mn4CaO5 was absent, and PSII oxidized not water, but Mn(II) cations, i.e., manganese cations were the  source of electrons. In the presented work, we investigated the possibility of the influence of some environmental factors (citrate and hydrogen peroxide) on the oxidation rate of Mn(II) cations by a PSII that does not contain OEC. We found that citrate inhibit the oxidation of Mn(II) cations binding them but doesn’t extract Mn cations from OEC. Hydrogen peroxide, on the contrary, significantly increases the oxidation rate of manganese (from 28±2 to 145±7 μmol 2,6-dichlorophenolindophenol mg Chl-1 h-1 in the presence of H2O2). Such effects should be taken into account when investigating the oxidation of manganese cations by the photosystem as a possible source of electrons in the early stages of evolution.  Одним из основных этапов в процессе трансформации энергии света в оксигенных организмах является извлечение электронов из воды, которые необходимы для световой стадии фотосинтеза. Светозависимое окисление воды осуществляется кислород-выделяющим комплексом (КВК), каталитическим центром которого является кластер Mn4CaO5. КВК расположен в фотосистеме 2 (ФС2) с внутренней стороны тилакоидной мембраны. Эволюционное происхождение ФС2 неясно, так же, как и происхождение марганцевого кластера в КВК. Недавно Джонсон c соавторами (2013) предположили, что в первичной ФС2 в Архейском периоде кластер Mn4CaO5 отсутствовал, а ФС2 окисляла не воду, а катионы Mn(II), т.е. источником электронов были катионы марганца. В представленной работе мы исследовали возможность влияния некоторых факторов окружающей среды (ионы цитрата и пероксид водорода) на скорость окисления катионов Mn(II) ФС2, не содержащей КВК. Мы установили, что цитрат ингибирует окисление катионов марганца, связывая их, но не экстрагирует катионы марганца из КВК. Пероксид водорода, наоборот, значительно увеличивает скорость окисления марганца (с 28±2 до 145±7 мкмоль 2,6-дихлорофенолиндофенола (мг хлорофилла)-1 ∙ ч-1 в присутствии пероксида водорода). Подобные эффекты следует учитывать при исследовании процесса окисления катионов марганца фотосистемой как возможного источника электронов на ранних стадиях эволюции. Lomonosov Moscow State University, School of Biology The research was carried out as part of the Scientific Project of the State Order of the Government of Russian Federation to Lomonosov Moscow State University No. 121032500058-7 Исследование выполнено в рамках научного проекта государственного задания МГУ №121032500058-7 2022-06-14 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1131 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 77, № 2 (2022); 98–103 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 77, № 2 (2022); 98–103 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1131/586 Umena Y., Kawakami K., Shen J.-R., Kamiya N. Crystal structure of oxygen evolving photosystem II at a resolution of 1.9 Å // Nature. 2011. Vol. 473. N 7345. P. 55–60. Suga M., Akita F., Hirata K., Ueno G., Murakami H., Nakajima Y., Shimizu T., Yamashita K., Yamamoto M., Ago H., Shen J.-R. Native structure of photosystem II at 1.95 Å resolution viewed by femtosecond X-ray pulses // Nature. 2015. Vol. 517. N 7532. P. 99–103. Johnson J.E., Webb S.M., Thomas K., Ono S., Kirschvink J.L., Fischer W.W. Manganese-oxidizing photosynthesis before the rise of cyanobacteria // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013. Vol. 110. N 28. P. 11238–11243. Dismukes G.C., Klimov V.V., Baranov S.V., Kozlov Y.N., Dasgupta J., Tyryshkin A. The origin of atmospheric oxygen on Earth: the innovation of oxygenic photosynthesis // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001. Vol. 98. N 5. P. 2170–2175. Terentyev V.V., Zharmukhamedov S.K. Evolutionary loss of the ability of the photosystem I primary electron donor for the redox interaction with Mn-bicarbonate complexes // Biochemistry (Mosc.). 2020. Vol. 85. N 6. P. 697–708. Kozlov Y.N., Zharmukhamedov S.K., Tikhonov K.G., Dasgupta J., Kazakova A.A., Dismukes G.C., Klimov V.V. Oxidation potentials and electron donation to photosystem II of manganese complexes containing bicarbonate and carboxylate ligands // Phys. Chem. Chem. Phys. 2004. Vol. 6. N 20. P. 4905–4911. Khorobrykh A.A., Terentyev V.V., Zharmukhamedov S.K., Klimov V.V. Redox interaction of Mn–bicarbonate complexes with reaction centres of purple bacteria // Phil. Trans. R. Soc. B: Biol. Sci. 2008. Vol. 363. N 1494. P. 1245–1251. Terentyev V V., Shkuropatov A.Y., Shkuropatova V A., Shuvalov V A., Klimov V.V. Investigation of the Redox interaction between Mn-bicarbonate complexes and reaction centers from Rhodobacter sphaeroides R-26, Chromatium minutissimum, and Chloroflexus aurantiacus // Biochemistry (Mosc.). 2011. Vol. 76. N 12. P. 1360–1366. Khorobrykh A., Dasgupta J., Kolling D.R., Terentyev V., Klimov V.V., Dismukes G.C. Evolutionary origins of the photosynthetic water oxidation cluster: bicarbonate permits Mn2+ photo-oxidation by anoxygenic bacterial reaction centers // ChemBioChem. 2013. Vol. 14. N 14. P. 1725–1731. Chernev P., Fischer S., Hoffmann J., Oliver N., Assunção R., Yu B., Burnap R.L., Zaharieva I., Nürnberg D.J., Haumann M., Dau H. Light-driven formation of manganese oxide by today’s photosystem II supports evolutionarily ancient manganese-oxidizing photosynthesis // Nat. Commun. 2020. Vol. 11. Art. ID 6110. Semin B.K., Ghirardi M.L., Seibert M. Blocking of electron donation by Mn (II) to YZ• following incubation of Mn-depleted photosystem II membranes with Fe (II) in the light // Biochemistry. 2002. Vol. 41. N 18. P. 5854-5864. Ghanotakis D.F., Babcock G.T. Hydroxylamine as an inhibitor between Z and P680 in photosystem II // FEBS Lett. 1983. Vol. 153. N 1. P. 231-234. Porra R.J., Thompson W.A., Kriedemann P.E. Determination of accurate extinction coefficients and simultaneous equations for assaying chlorophylls a and b extracted with four different solvents: verification of the concentration of chlorophyll standards by atomic absorption spectroscopy // Biochim. Biophys. Acta Bioenerg. 1989. Vol. 975. N 3. P. 384–394. Armstrong J.M.D. The molar extinction coefficient of 2,6-dichlorophenol indophenol // Biochim. Biophys. Acta Gen. Subj. 1964. Vol. 86. N 1. P. 194-197. Semin B.K., Seibert M. A simple colorimetric determination of the manganese content in photosynthetic membranes // Photosynth. Res. 2009. Vol. 100. N 1. P. 45–48. Semin B.K., Davletshina L.N., Ivanov I.I., Seibert M., Rubin A.B. Rapid degradation of the tetrameric Mn cluster in iluminated, PsbO-depleted photosystem II preparations // Biochemistry (Mosc.). 2012. Vol. 77. N 2. P. 152–156. Yocum C.F., Yerkes C.T., Blankenship R.E., Sharp R.R., Babcock G.T. Stoichiometry, inhibitor sensitivity, and organization of manganese associated with photosynthetic oxygen evolution // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1981. Vol. 78. N 12. P. 7507–7511. Kuntzleman T., McCarrick R., Penner-Hahn J., Yocum C. Probing reactive sites within the photosystem II manganese cluster: evidence for separate populations of manganese that differ in redox potential // Phys. Chem. Chem. Phys. 2004. Vol. 6. N 20. P. 4897–4904. Serrat F.B. 3,3′,5,5′-Tetramethylbenzidine for the colorimetric determination of manganese in water // Microchim. Acta. 1998. Vol. 129. P. 77–80. Xu Q., Bricker T.M. Structural organization of proteins on the oxidizing side of photosystem II. Two molecules of the 33-kDa manganese-stabilizing proteins per reaction center // J. Biol. Chem. 1992. Vol. 267. N 36. P. 25816–25821. Blankenship R.E., Hartman H. The origin and evolution of oxygenic photosynthesis // Trends Biochem. Sci. 1998. Vol. 23. N 3. P. 94–97. Boussac A., Picaud M., Etienne A.-L. Effect of potassium iridic chloride on the electron donation by Mn2+ to photosystem II particles // Photochem. Photobiophys. 1986. Vol. 10. P. 201–211. Inoue H., Wada T. Requirement of manganese for electron donation of hydrogen peroxide in photosystem II reaction center complex // Plant Cell Physiol. 1987. Vol. 28. N 5. P. 767–773. Hoganson C.W., Ghanotakis D.F., Babcock G.T., Yocum C.F. Mn2+ reduces YZ + in manganese-depleted photosystem II preparations // Photosynth. Res. 1989. Vol. 22. N 3. P. 285–293. Semin B.K., Davletshina L.N., Timofeev K.N., Ivanov I.I., Rubin A.B., Seibert M. Production of reactive oxygen species in decoupled, Ca2+-depleted PSII and their use in assigning a function to chloride on both sides of PSII // Photosynth. Res. 2013. Vol. 117. N 1. P. 385–399. Lovyagina E.R., Loktyushkin A.V., Semin B.K. Effective binding of Tb3+ and La3+ cations on the donor side of Mn-depleted photosystem II // J. Biol. Inorg. Chem. 2021. Vol. 26. N 1. P. 1–11. Inoué H., Akahori H., Noguchi M. Activation of electron donation from hydrogen peroxide by manganese in non-oxygen evolving photosystem II particles // Plant Cell Physiol. 1987. Vol. 28. N 7. P. 1339–1343. Inoué H., Wada T. Requirement of manganese for electron donation of hydrogen peroxide in photosystem II reaction center complex // Plant Cell Physiol. 1987. Vol. 28. N. 5. P. 767–773. Kurashov V.N., Lovyagina E.R., Shkolnikov D.Y., Solntsev M.K., Mamedov M.D., Semin B.K. Investigation of the low-affinity oxidation site for exogenous electron donors in the Mn-depleted photosystem II complexes // Biochim. Biophys. Acta Bioenerg. 2009. Vol. 1787. N 12. P. 1492–1498. Dawson R.M.C., Elliott D.C., Elliott W.H., Jones K.M. Data for biochemical research. 3rd Ed. Oxford: Clarendon press, 1989. 592 pp. Ono T., Inoue Y. Discrete extraction of the Ca atom functional for O2 evolution in higher plant photosystem II by a simple low pH treatment // FEBS Lett. 1988. Vol. 227. N 2. P. 147–152. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/176 2015-07-23T17:32:18Z jour:%D0%A1%D0%A2 driver

INTRODUCTION ВСТУПИТЕЛЬНАЯ СТАТЬЯ M. P. Kirpichnikov М. П. Кирпичников . . Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-23 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/176 10.1234/XXXX-XXXX-2010-4-3 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 4 (2010); 3 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 4 (2010); 3 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2010-4 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/176/175 Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1564 2025-11-26T20:23:15Z jour:RST driver

The comparative analysis of motor and spatial learning dynamics in animals survived prenatal hypoxia Сравнительный анализ динамики моторного и пространственного обучения у животных, переживших пренатальную гипоксию A. V. Graf M. V. Maslova A. S. Maklakova А. В. Граф М. В. Маслова А. С. Маклакова нейропластичность intrauterine programming peripubertal period motor learning spatial learning neuroplasticity нейропластичность внутриутробное программирование перипубертатный период моторное обучение пространственное обучение нейропластичность The data of modern neurobiology indicates a critical dependence of the nervous system formation upon the conditions of intrauterine development. Pregnancy, childbirth and the early postnatal period are of key importance for normal maturation of the nervous system. The developing fetus is especially vulnerable to the effects of adverse external and internal factors in periods of brain and neuronal structures morphological differentiation, during childbirth and the transition to independent breathing. Fetal and/or newborn hypoxia is considered one of the main causes of disorders in brain development, manifested later in form of cognitive impairments, problems with learning, memory and attention, social interactions, movements and emotions. The aim of the present study was to investigate the effect of prenatal hypoxia, suffered in periods critical for brain development and maturation, on the ability of white rats to motor and spatial learning. It was shown that males, survived acute late gestational hypoxia, turned out to be more sensitive to its effects, demonstrating at the age of one month both a deficit in learning, reproduction and maintainance of motor skills, and a failure in solving cognitive task in T-shaped maze. At the same time acute hypoxia of the early organogenesis period had practically no effect on the ability of peripubertal animals to motor and spatial learning. Therefore, comprehensive testing allows to assess the effects of hypoxic brain damage more completely, which is important for early diagnosis and the development of rehabilitation programs. Данные современной нейробиологии свидетельствуют о критической зависимости формирования нервной системы от условий внутриутробного развития. Гипоксия плода и/или новорожденного – одна из основных причин нарушений в развитии головного мозга, которые могут проявляться в более позднем возрасте в виде когнитивных расстройств, проблем с обучением, памятью и вниманием, движениями и эмоциями. В работе исследовали влияние пренатальной гипоксии, перенесенной в критические для развития и созревания мозга периоды, на способность белых крыс к моторному и пространственному обучению. Самцы, пережившие острую предродовую гипоксию, оказались наиболее чувствительными к ее воздействию, продемонстрировав в месячном возрасте как дефицит моторного обучения, воспроизведения и сохранения моторных навыков, так и ухудшение решения когнитивной задачи в Т-образном лабиринте. Острая гипоксия периода раннего органогенеза практически не оказала воздействия на способность животных перипубертатного возраста к моторному и пространственному обучению. Комплексное тестирование с использованием модифицированной методики обучения на вращающемся стержне позволяет более полно оценить последствия гипоксического повреждения мозга, что важно для ранней диагностики и разработки программ реабилитации. Lomonosov Moscow State University, School of Biology The study was conducted under the state assignment of Lomonosov Moscow State University. The equipment used was provided by MSU within the framework of federal project “The development of infrastructure for science and education” (Agreement №359). Исследование выполнено в рамках государственного задания МГУ имени М.В. Ломоносова. 2025-11-26 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1564 10.55959/MSU0137-0952-16-80-3-9 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 80, № 3 (2025); 197-205 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 80, № 3 (2025); 197-205 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1564/752 Sidorova I.S., Nikitina N.A., Unanyan A.L., Ageev M.B. Development of the human fetal brain and the influence of prenatal damaging factors on the main stages of neurogenesis. Russian Bulletin of Obstetrician-Ginekologist. 2022;22(1):35–44. Kostovic I., Judas M. Embryonic and fetal development of the human cerebral cortex. Brain Mapping. 2015;2:167–175. Piešová M., Mach M. Impact of perinatal hypoxia on the developing brain. Physiol. Res. 2020;69(2):199–213. Orzeł A., Unrug-Bielawska K., Filipecka-Tyczka D., Berbeka K., Zeber-Lubecka N., Zielińska M., Kajdy A. Molecular pathways of altered brain development in fetuses exposed to hypoxia. Int. J. Mol. Sci. 2023;24(12):10401. Mabry S., Wilson EN., Bradshaw JL., Gardner JJ., Fadeyibi O., Vera E Jr., Osikoya O., Cushen SC., Karamichos D., Goulopoulou S., Cunningham RL. Sex and age differences in social and cognitive function in offspring exposed to late gestational hypoxia. Biol. Sex Differ. 2023;14(1):81. Graf A., Trofimova L., Ksenofontov A., Baratova L., Bunik V. Hypoxic adaptation of mitochondrial metabolism in rat cerebellum decreases in pregnancy. Cells. 2020;9(1):139. Shiotsuki H., Yoshimi K., Shimo Y., Funayama M., Takamatsu Y., Ikeda K., Takahashi R., Kitazawa S., Hattoriet N. A rotarod test for evaluation of motor skill learning. J. Neurosci. Methods. 2010;189(2):180–185. Howard L.M., Khalifeh H. Perinatal mental health: a review of progress and challenges. World Psychiatry. 2020;19(3):313–327. Gennaro S., Melnyk B.M., Szalacha L.A, Gibeau A.M., Hoying J., O’Connor C.M., Cooper A.R., Aviles M.M. Effects of two group prenatal care interventions on mental health: an RCT. Am. J. Prev. Med. 2024;66(5):797–808. Lautarescu A., Craig M.C., Glover V. Prenatal stress: Effects on fetal and child brain development. Int. Rev. Neurobiol. 2020;150:17–40. Wang B., Zeng H., Liu J., Sun M. Effects of prenatal hypoxia on nervous system development and related diseases. Front. Neurosci. 2021;15:755554. Lu G., Rili G., Shuang M. Impact of hypoxia on the hippocampus: a review. Medicine (Baltimore). 2025;104(12):e41479. Graf A.V., Maslova M.V., Artiukhov A.V., Ksenofontov A.L., Aleshin V.A., Bunik V.I. Acute prenatal hypoxia in rats affects physiology and brain metabolism in the offspring, dependent on sex and gestational age. Int. J. Mol. Sci. 2022;23(5):2579. Stratilov V., Potapova S., Safarova D., Tyulkova E., Vetrovoy O. Prenatal hypoxia triggers a glucocorticoid-associated depressive-like phenotype in adult rats, accompanied by reduced anxiety in response to stress. Int. J. Mol. Sci. 2024;25(11):5902. Monteleone M.C., Pallarés M.E., Billi S.C., Antonelli M.C., Brocco M.A. In vivo and in vitro neuronal plasticity modulation by epigenetic regulators. J. Mol. Neurosci. 2018;65(3):301–311. Xu H., Liu Y.-Y., Li L.-S., Liu Y.-S. Sirtuins at the crossroads between mitochondrial quality control and neurodegenerative diseases: structure, regulation, modifications, and modulators. Aging Dis. 2023;14(3):794–824. McCarthy M.M., Nugent B.M., Lenz K.M. Neuroimmunology and neuroepigenetics in the establishment of sex differences in the brain. Nat. Rev. Neurosci. 2017;18(8):471–484. Bale T.L., Epperson C.N. Sex differences and stress across the lifespan. Nat. Neurosci. 2015;18(10):1413–1420. Bland ST, Schmid MJ, Der-Avakian A, Watkins LR, Spencer RL, Maier SF. Expression of c-fos and BDNF mRNA in subregions of the prefrontal cortex of male and female rats after acute uncontrollable stress. Brain Res. 2005;1051(1–2):90–99. Hayley S., Du L., Litteljohn D., Palkovits M., Faludi G., Merali Z., Poulter M.O., Anisman H. Gender and brain regions specific differences in brain derived neurotrophic factor protein levels of depressed individuals who died through suicide. Neurosci. Lett. 2015;600:12–16. Spencer-Segal J.L., Tsuda M.C., Mattei L., Waters E.M., Romeo R.D., Milner T.A., McEwen B.S., Ogawa S. Estradiol acts via estrogen receptors alpha and beta on pathways important for synaptic plasticity in the mouse hippocampal formation. Neuroscience. 2012;202:131–146. Hyer M.M., Phillips L.L., Neigh G.N. Sex differences in synaptic plasticity: hormones and beyond. Front. Mol. Neurosci. 2018;11:266. Li G., Liu J., Guan Y., Ji X. The role of hypoxia in stem cell regulation of the central nervous system: From embryonic development to adult proliferation. CNS Neurosci. Ther. 2021;27(12):1446–1457. Herculano-Houzel S. Numbers of neurons as biological correlates of cognitive capability. Curr. Opin. Behav. Sci. 2017;16:1–7. Spritzer M.D., Roy E.A. Testosterone and adult neurogenesis. Biomolecules. 2020;10(2):225. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/356 2016-10-08T17:02:04Z jour:EC driver

PROPERTIES OF SEASON DYNAMICS, COMMUNITY STRUCTURE AND PRODUCTIVITY OF PHYTOPLANKTON IN UCHINSKOE RESERVOIR IN 1998—2001 ОСОБЕННОСТИ СЕЗОННОЙ ДИНАМИКИ, СТРУКТУРЫ И ПРОДУКТИВНОСТИ ФИТОПЛАНКТОНА УЧИНСКОГО ВОДОХРАНИЛИЩА В 1998—2001 гг. M. N. Korsak S. A. Mosharov G. A. Dallakyan A. J. Belov М. Н. Корсак С. А. Мошаров Г. А. Даллакян А. Ю. Белов экология Results of research of season dynamics of phytoplankton total numbers and primary production in Uchinskoe reservoir in 1998—2001. Diatom and bluegreen algae play a leading role in seasonal succession of phytoplankton. These groups cause the seasonal number maxima. Spring blooms to be dominated by diatoms (90%) usually found on first ten days of May. Bluegreen algae appear in the phytoplankton in June and their numbers increase very quickly. Bluegreen algae dominate (98%) in phytoplankton till autumn.Integral estimate of primary production to be made on experimental tests were calculated for seasonal succession periods. Production rates in different region of reservoir were distinguish, but exhibit commonly tendency to annual and seasonal variations. The maximal number seasons were characterized by maximal productivity. Not available Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2016-10-06 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/356 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2005); 33-38 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2005); 33-38 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/356/334 Д а л л а к я н Г . А . , К о р с а к М . Н . , М о ш а р о в С . А . 2001. Динамика первичной продукции Учинского водохранилища в летний период 1998 года // Вестн. Моск. ун-та. Сер. Биология. № 1. 42—43. К о н с т а н т и н о в А . С . Общая гидробиология. 1979. М. 480 с. К о р с а к М . Н . , М о ш а р о в С . А . , Д а л л а к я н Г . А . , Б е л о в А . Ю . , М и т и н А . В . 2003. Динамика фитопланктона Учинского водохранилища и биогенных элементов в 1998—1999 гг. // Вестн. Моск. ун-та. Сер. Биология. № 2. 34—39. Н а к а н и Д . В . , К о р с а к М . И . 1976. Первичная продукция фитопланктона Учинского водохранилища // Гидробиол. журн. 12. № 3. 15—19. П о т а п о в а Н . А . 1976. Динамика численности бактериопланктона в Учинском водохранилище // Гидробиол. журн. 12. № 3. 66—68. Р о м а н е н к о В . И . , К у з н е ц о в С . И . 1974. Экология микроорганизмов пресных водоемов. Л. 194 с. Учинское и Можайское водохранилища (гидробиологические и ихтиологические исследования). 1963. М. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/391 2016-10-26T20:41:11Z jour:MOL-BIO driver

MOLECULAR GENETIC FEATURES OF 5S rDNA NON-TRANSCRIBED SPACER IN HIPPOPHAE RHAMNOIDES L. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ НЕТРАНСКРИБИРУЕМОГО СПЕЙСЕРА 5S-рДНК У HIPPOPHAE RHAMNOIDES L. O. S. Alexandrov A. V. Evtukhov I. I. Kiselev G. I. Karlov О. С. Александров А. В. Евтухов И. И. Киселёв Г. И. Карлов Calligonum mongolicum Turcz non-transcribed spacer microsatellite locus Hippophae rhamnoides L. Elaeagnus angustifolia L. Calligonum mongolicum Turcz Calligonum mongolicum Turcz нетраскрибируемый спейсер микросателлитный локус Hippophae rhamnoides L. Elaeagnus angustifolia L. Calligonum mongolicum Turcz Amplification of sea buckthorn Hippophae rhamnoides L. 5S rDNA non-transcribed spacer with coding border anneal primers showed existence of single fragment. The fragment was cloned and sequenced. It was shown that length of the Hippophae rhamnoides L. 5S rDNA nontranscribed spacer is 807 bp. Analysis of the sequence allowed to detect a high homology with early described microsatellite locuses of Hippophae rhamnoides L., russian olive Elaeagnus angustifolia L. and Calligonum mongolicum Turcz., that include a (GA)9 motif. These results may be useful to study a ribosomal RNA gene organization.  Амплификация нетранскрибируемого спейсера 5S-рДНК облепихи крушиновидной (Hippophae rhamnoides L.) с помощью праймеров, подобранных на фланги соседних кодирующих областей, показала наличие единичного фрагмента. Данный фрагмент был клонирован и секвенирован. Было обнаружено, что длина нетраскрибируемого спейсера облепихи составляет 807 п.о. Анализ последовательности показал высокий уровень гомологии с ранее описанными микросателлитными локусами облепихи, лоха серебристого (Elaeagnus angustifolia L.) и джузгуна (Calligonum mongolicum Turcz.), включающими мотив (GA)9. Полученные результаты могут быть полезны для дальнейшего изучения организации генов рибосомной РНК.  Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2016-10-26 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/391 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 4 (2016); 57-60 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 4 (2016); 57-60 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/391/366 Martins C. Wasko A.P. Organization and evolution of 5S ribosomal DNA in the fish genome // Focus on Genome Research / Eds. C.R. Williams. Hauppauge: Nova Science Publishers, 2004. P. 289–319. Wicke S., Costa A., Muñoz J., Quandt D. Restless 5S: the re-arrangement(s) and evolution of the nuclear ribosomal DNA in land plants // Mol. Phylogenet. Evol. 2011. Vol. 61. N 2. P. 321–332. Vierna J., Wehner S., Höner zu Siederdissen C., Martínez-Lage A., Marz M. Systematic analysis and evolution of 5S ribosomal DNA in metazoans // Heredity. 2013. Vol. 111. N 5. P. 410–421. Pendas A.M., Moran P., Martinez J.L., Garcia-Vasquez E. Applications of 5S rDNA in Atlantic salmon, brown trout, and in Atlantic salmon × brown trout hybrid identification // Mol. Ecol. 1995. Vol. 4. N 2. P. 275–276. Liu Z.L., Zhang D., Wang X.Q., Ma X.F. Intragenomic and interspecific 5S rDNA sequence variation in five asian pines // Am. J. Bot. 2003. Vol. 90. N 1. P. 17–24. Mythili Avadhani M.N., Immanuel Selvaraj C., Tharachand C., Rajasekharan P.E. Molecular characterization of medicinal and aromatic plants by 5S rRNA NTS and PCR RFLP — A mini review // Res. Biotechnol. 2012. Vol. 3. N 2. P. 41–48. Brown G.R., Carlson J.E. Molecular cytogenetics of the genes encoding 18s–5.8s–26s rRNA and 5s rRNA in two species of spruce (Picea) // Theor. Appl. Genet. 1997. Vol. 95. N 1–2. P. 1–9. Schmidt T., Schwarzacher T., Heslop-Harrison J.S. Physical mapping of rRNA genes by fluorescent in situ hybridization and structural analysis of 5S rRNA genes and intergenic spacer sequences in sugar beet (Beta vulgaris) // Theor. Appl. Genet. 1994. Vol. 88. N 6. P. 629–636. Wilson N. Genome analysis of Populus species: assessment of genetic diversity of P. deltoides, characterization of wide hybrids and phylogenetic analysis using molecular markers. New Delhi: Teri University, 2013. 177 p. Александров О.С., Карлов Г.И., Сорокин А.Н., Потапенко Н.Х. Создание системы молекулярных маркеров для видовой идентификации представителей рода Тополь и анализа гибридов // Материалы III Всероссийской молодёжной конференции с участием иностранных учёных “Перспективы развития и проблемы современной ботаники” (Новосибирск, 10–14 ноября 2014 г.). Новосибирск: Академиздат, 2014. C. 123–124. Islam A., Sinha P., Sharma S.S., Negi M.S., Tripathi S.B. Isolation and characterization of novel polymorphic microsatellite loci in Hippophae rhamnoides // Proc. Natl. Acad. Sci., India, Sect. B. Biol. Sci. 2015. DOI: 10.1007/s40011-0150646-2. Truta E., Capraru G., Rosu C.M., Zamfirache M.M., Olteanu Z., Manzu C. Morphometric pattern of somatic chromosomes in three Romanian seabuckthorn genotypes // Caryologia. 2011. Vol. 64. N 2. P. 189–196. Zhou X., Ma J., Wang W., Gong N., Liu J. Genome size of the diploid hybrid species Hippophae goniocarpa and its parental species, H. rhamnoides ssp. sinensis and H. neurocarpa ssp. neurocarpa (Elaeagnaceae) // Acta Biol. Cracoviensia Ser. Bot. 2010 Vol. 52. N 2. P. 12–16. Doyle J.J., Doyle J.L. Isolation of plant DNA from fresh tissue // Focus. 1990. Vol. 12. N 1. P. 13–15. GeneDoc: Analysis and visualization of genetic variation [Электронный ресурс]. 1997. URL: http://www.nrbsc. org/gfx/genedoc/ebinet.htm (дата обращения: 10.08.2016). Negi M.S., Rajagopal J., Chauhan N., Cronn R., Lakshmikumaran M. Length and sequence heterogeneity in 5S rDNA of Populus deltoides // Genome. 2002. Vol. 45. N 6. P. 1181–1188. Fernández M., Ruiz M.L., Linares C., Fominaya A., Pérez de la Vega M. 5S rDNA genome regions of Lens species // Genome. 2005. Vol. 48. N 5. P. 937–942. Cruz V.P., Oliveira C., Foresti F. An intriguing model for 5S rDNA sequences dispersion in the genome of freshwater stingray Potamotrygon motoro (Chondrichthyes: Potamotrygonidae) // Mol. Biol. 2015. Vol. 49. N 3. P. 466-469. Campo D., Machado-Schiaffino G., Horreo J.L., Garcia-Vazquez E. Molecular organization and evolution of 5S rDNA in the genus Merluccius and their phylogenetic implications // J. Mol. Evol. 2009. Vol. 68. N 3. P. 208–216. Deiana A.M., Cau A., Salvadori S., Coluccia E., Cannas R., Milia A. Tagliavini J. Major and 5S ribosomal sequences of the largemouth bass Micropterus salmoides (Perciformes, Centrarchidae) are localized in GC-rich regions of the genome // Chromosome Res. 2000. Vol. 8. N 3. P. 213–218. 2 Moran P., Garcia-Vazquez E. Identification of highly prized commercial fish using a PCR-based methodology // Biochem. Mol. Biol. Educ. 2006. Vol. 34. N 2. P. 121–124. Ota K., Tateno Y., Gojobori T. Highly differentiated andconserved sex chromosome in fish species (Aulopus japonicus: Teleostei, Aulopidae) // Gene. 2003. Vol. 317. N 1–2. P. 187–193. Gornung E., De Innocentilis S., Annesi F., Sola L. Zebrafish 5S rRNA genes map to the long arms of chromosome 3 // Chromosome Res. 2000.Vol. 8. N 4. P. 362. Gaskin J.F., Hufbauer R.A., Bogdanowicz S.M. Microsatellite markers for Russian olive (Elaeagnus angustifolia; Elaeagnaceae) // Appl. Plant Sci. 2013. Vol. 1. N 9. P. 1300013. Zhang Q. Zhu X.T. Microsatellite DNA loci from the drought desert plant Calligonum mongolicum Turcz. (Polygonaceae) // Con. Gen. 2009. Vol. 10. N 6. P. 1891–1893. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/800 2020-01-17T07:29:56Z jour:RA driver

Effect of acetylation of histone H4 on communication in chromatin Влияние ацетилирования гистона Н4 на дистанционные взаимодействия в хроматине E. V. Nizovtseva N. S. Gerasimova V. M. Studitsky Е. В. Низовцева Н. С. Герасимова В. М. Студитский ацетилирование transcription regulation enhancers histones modifications acetylation ацетилирование транскрипция регуляция энхансеры гистоны модификации ацетилирование Long-distance interaction plays an important role in the regulation of eukaryotic genes. Chromatin structure is involved in the process, but the role of histone modifications has not been studied. In the present work the role of acetylation Н4К16 (Н4К16-Ac) to enhancer-promoter communication (EPC) was analyzed. This modification is associated with euchromatin and is involved in the decompaction of chromatin fibers. We have shown that the effect of H4K16-Ac on EPC in vitro depends on the level of chromatin assembly. EPC in chromatin, which lacks nucleosomes at random positions on DNA, is inhibited in the presence of H4K16-Ac. At the same time, EPC in chromatin, in which nucleosomes occupy all available positions on DNA, is somewhat stimulated in the presence of H4K16-Ac. Дистанционные взаимодействия ДНК играют важную роль в регуляции генов эукариот. Структура хроматина участвует в этом процессе, но влияние модификаций гистонов детально не изучено. В настоящей работе исследована роль ацетилирования гистона Н4 по остатку лизина в положении 16 (Н4К16-Ац) в энхансер-промоторном взаимодействии (ЭПВ). Данная модификация ассоциирована с эухроматином и участвует в декомпактизации хроматиновой фибриллы. Нами показано, что влияние Н4К16-Ац на ЭПВ invitro зависит от степени упаковки ДНК. Так, при неполном насыщении ДНК октамерами гистонов транскрипция ингибируется в присутствии этой модификации, а в случае, если нуклеосомы занимают все доступные положения на ДНК, ЭПВ несколько стимулируется. Lomonosov Moscow State University, School of Biology Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда (проект № 19-74-30003) 2019-12-13 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/800 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 74, № 4 (2019); 308–312 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 74, № 4 (2019); 308–312 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/800/494 Wasylyk B., Wasylyk C., Chambon P. Short and long range activation by the SV40 enhancer // Nucleic Acids Res. 1984. Vol. 12. N 14. P. 55895608. Kulaeva O.I., Nizovtseva E.V., Polikanov Y.S., Ulianov S.V., Studitsky V.M. Distant activation of transcription: mechanisms of enhancer action // Mol. Cell. Biol. 2012. Vol. 32. N 24. P. 4892-4897. Gilbert N, Boyle S, Fiegler H, Woodfine K., Carter N.P., Bickmore W.A. Chromatin architecture of the human genome: gene-rich domains are enriched in open chromatin fibers // Cell. 2004. Vol. 118. N 5. P. 555-566. Spitz F. Gene regulation at a distance: From remote enhancers to 3D regulatory ensembles // Semin. Cell Dev. Biol. 2016. Vol. 57. P. 57-67. Nizovtseva E.V., Todolli S, Olson W.K., Studitsky V.M. Towards quantitative analysis of gene regulation by enhancers // Epigenomics. 2017. Vol. 9. N 9. P. 1219-1231. Rubtsov M.A., Polikanov Y.S., Bondarenko V.A., Wang Y.H., Studitsky V.M. Chromatin structure can strongly facilitate enhancer action over a distance // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006. Vol. 103. N 47. P. 17690-17695. Polikanov Y.S., Studitsky V.M. Analysis of distant communication on defined chromatin templates in vitro // Methods Mol. Biol. 2009. Vol. 543. P. 563-576. Maeshima K., Rogge R., Tamura S, Joti Y., Hikima T, Szerlong H, Krause C, Herman J, Seidel E, DeLuca J., Ishikawa T, Hansen J.C. Nucleosomal arrays self-assemble into supramolecular globular structures lacking 30-nm fibers // EMBO J. 2016. Vol. 35. N 10. P. 1115-1132. Nizovtseva E.V., Clauvelin N, Todolli S, Polikanov Y.S., Kulaeva O.I., Wengrzynek S, Olson W.K., Studitsky, V.M. Nucleosome-free DNA regions differentially affect distant communication in chromatin // Nucleic Acids Res. 2017. Vol. 45. N 6. P. 3059-3067. Kulaeva O.I., Zheng G., Polikanov Y.S., Colasanti A.V., Clauvelin N, Mukhopadhyay S, Sengupta A.M., Studitsky V.M., Olson W.K. Internucleosomal interactions mediated by histone tails allow distant communication in chromatin // J. Biol. Chem. 2012. Vol. 287. N 24. P. 20248-20257. Bone J.R, Lavender J., Richman R, Palmer M.J., Turner B.M., Kuroda M.I. Acetylated histone H4 on the male X chromosome is associated with dosage compensation in Drosophila // Genes Dev. 1994. Vol. 8. N 1. P. 96-104. Shogren-Knaak M., Ishii H., Sun J.M., Pazin M.J., Davie J.R, Peterson C.L. Histone H4-K16 acetylation controls chromatin structure and protein interactions // Science. 2006. Vol. 311. N 5762. P. 844-847. Polikanov Y.S., Rubtsov M.A., Studitsky V.M. Biochemical analysis of enhancer-promoter communication in chromatin // Methods. 2007. Vol. 41. N 3. P. 250-258. Dann G.P., Liszczak G.P., Bagert J.D., Muller M.M., Nguyen U.T.T., Wojcik F., Brown Z.Z., Bos J., Panchenko T., Pihl R, Pollock S.B., Diehl K.L., Allis C.D., Muir T.W. ISWI chromatin remodellers sense nucleosome modifications to determine substrate preference // Nature. 2017. Vol. 548. N 7669. P. 607-611. Polach K.J., Lowary P.T. Widom J. Effects of core histone tail domains on the equilibrium constants for dynamic DNA site accessibility in nucleosomes // J. Mol. Biol. 2000. Vol. 298. N 2. P. 211-223. Walter W, Studitsky V.M. Construction, analysis, and transcription of model nucleosomal templates // Methods. 2004. Vol. 33. N 1. P. 18-24. Taylor G.C., Eskeland R, Hekimoglu-Balkan B, Pradeepa M.M., Bickmore W.A. H4K16 acetylation marks active genes and enhancers of embryonic stem cells, but does not alter chromatin compaction // Genome Res. 2013. Vol. 23. N 12. P. 2053-2065. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/86 2015-05-25T08:57:44Z jour:EC driver

EXPERIMENTAL STUDY OF TEMPERATURE ON MORTALITY AND DEVELOPMENTAL RATE IN EARLY ONTOGENESIS OF COMMON TOAD (BUFO BUFO) ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ВЛИЯНИЯ ТЕМПЕРАТУРЫ НА СМЕРТНОСТЬ И ТЕМПЫ РАЗВИТИЯ В РАННЕМ ОНТОГЕНЕЗЕ СЕРОЙ ЖАБЫ BUFO BUFO E. V. Dmitrieva Е. В. Дмитриева температура ontogenesis mortality temperature температура онтогенез смертность температура The influence of temperature on mortality and developmental rate of common toad Bufo bufo was investigated in the laboratory conditions. It was shown that the rate of embryogenesis at +19°С increased almost 1,4 times as compared with the development of a temperature of +15°С. The temperature affects the resulting embryo mortality at the time of hatching primarily in the clutches with low survival. В лабораторных условиях было исследовано влияние температуры на смертность и темпы развития серой жабы Bufo bufo. Было показано, что скорость эмбриогенеза при температуре +19°С увеличилась почти в 1,4 раза по сравнению с развитием при температуре +15°С. Влияние температуры на результирующую смертность эмбрионов к моменту вылупления сказывается в первую очередь в кладках с пониженной выживаемостью. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-05-25 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/86 10.1234/XXXX-XXXX-2014-2-31-34 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 2 (2014); 31-34 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 2 (2014); 31-34 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2014-2 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/86/87 Ручин А.Б. Изучение влияния температуры и освещенности на рост и развитие личинок травяной лягушки (Rana temporaria) // Зоол. журн. 2004. Т. 83. № 12. С. 1463—1467. Moore J.A. Temperature tolerance and rates of development in the eggs of Amphibia // Ecology. 1939. Vol. 20. N 4. P. 459—478. Флякс Л.Н. Влияние pH среды на выживаемость и развитие бесхвостых амфибий Сахалина // Тр. Зоол. ин-та АН СССР. 1986. Т. 157. С. 152—165. Северцов А.С., Ляпков СМ., Сурова Г.С. Соотношение экологических ниш травяной (Rana temporaria L.) и остромордой (Rana arvalis Nilss.) лягушек (Anura, Amphibia) // Журн. общ. биол. 1998. Т. 59. № 3. С. 279—301. Martof B.S. Growth and development of the greenfrog, Rana clamitans, under natural condition // Amer. Midland Natur. 1956. Vol. 55. N 1. P. 101—117. Ануфриев В.М., Бобрецов А.В. Фауна европейского северо-востока России. Амфибии и рептилии. Т. IV. СПб.: Наука, 1996. 130 с. Яковлев В.А. К экологии серой жабы Bufo byfo (L.) в Алтайском заповеднике. Герпетологические исследования в Сибири и на Дальнем Востоке. Л.: ЗИН АН СССР, 1981. С. 132—136. Cambar R., Gipouloux J. Table chronologique du development embryonnaire et larvaire du crapaud commun Bufo bufo L. // Bull. biol. de la France et de la Belgique. 1956. Vol. 90. P. 198—217. Dmitrieva E.V. The effects of density on mortality and development rate of the Bufo bufo eggs and tadpoles // Herpetologia Petropolitana / Eds. N. Ananjeva, O. Tsinenko. St. Petersburg, 2005. P. 130—133. Северцов А.С., Сурова Г.С. Гибель личинок Rana temporaria и факторы, ее определяющие // Зоол. журн. 1979. Т. 58. № 3. С. 393—403. Сурова Г.С., Северцов А.С. Гибель травяной лягушки (Rana temporaria) в раннем онтогенезе и вызывающие ее факторы // Зоол. журн. 1985. Т. 64. № 1. C. 61—71. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/932 2020-11-06T22:27:02Z jour:REVI driver

Nongenomic effects of thyroid hormones: role in regulation of the vascular system Негеномное действие тиреоидных гормонов: роль в регуляции сосудистой системы E. K. Selivanova O. S. Tarasova Е. К. Селиванова О. С. Тарасова интегрин αvβ3 nongenomic effects angiogenesis vascular tone tetrac integrin αvβ3 интегрин αvβ3 негеномное влияние ангиогенез тонус сосудов тетрак интегрин αvβ3 The nongenomic effects of thyroid hormones develop within minutes or hours and do not depend on the binding of the hormone to the transcriptionally active nuclear receptors TRα and TRβ. These effects are characterized by a variety of receptors and signaling pathways involved, which may be distinct in different cell types. T3 or T4 can induce nongenomic effect by association with transcriptionally inactive TRα and TRβ in the cytoplasm of the cell, their truncated isoforms or integrin αvβ3. With nongenomic action, as well as with genomic action, T3 and T4 can alter gene transcription, but in this case, their influence is extended to wider spectrum of genes. The nongenomic effects of thyroid hormones often complement the genomic ones, causing similar changes in cell activity, or enhance them by providing TRα and TRβ translocation into the nucleus or their post-translational modification. The nongenomic effects of thyroid hormones on the vasculature include angiogenesis and rapid vasodilation. The key signaling cascade mediating angiogenesis includes integrin αvβ3, protein kinase D, and histone deacetylase 5. The mechanisms of rapid vasodilation are still poorly understood and may vary in different regions of the vascular bed. In cytoplasm of endothelial cells, the nongenomic effect of thyroid hormones is mediated by TRα1, PI3K, and NO synthase, but this mechanism is not universal. Thyroid hormones-induced vasodilation of skeletal muscle arteries includes the participation of αvβ3 integrin located in smooth muscle cells, but the signaling cascades triggered by it have not yet been studied. Knowledge of the molecular mechanisms of the nongenomic effect of thyroid hormones is important for the development of new methods of pharmacological correction of vascular pathologies, which are usually associated with thyroid disorders. Негеномное действие тиреоидных гормонов (ТГ) проявляется в течение нескольких минут или часов и не зависит от связывания гормона с транскрипционно активными ядерными рецепторами TRα и TRβ. Такое действие характеризуется разнообразием задействованных рецепторов и сигнальных путей, которые могут различаться в разных типах клеток. Тироксин и трийодтиронин способны оказывать негеномное влияние при взаимодействии с транскрипционно неактивными TRα и TRβ в цитоплазме клетки, их укороченными изоформами или интегрином αvβ3. При негеномном действии ТГ также могут изменять транскрипцию генов, но в этом случае их влияние распространяется на более широкий спектр генов, чем при геномном действии. Негеномное действие ТГ часто дополняет геномное, вызывая сходные изменения активности клеток, или же усиливает его, обеспечивая транслокацию TRα и TRβ в ядро или их посттрансляционную модификацию. В сосудистом русле ТГ оказывают негеномное регуляторное влияние на ангиогенез и тонус сосудов (вызывают быструю вазодилатацию). Ключевой сигнальный каскад, опосредующий ангиогенез, включает интегрин αvβ3, протеинкиназу D и деацетилазу гистонов 5. Механизмы быстрой вазодилатации пока изучены недостаточно и могут различаться в разных регионах сосудистого русла. В цитоплазме эндотелиальных клеток негеномное влияние ТГ реализуется с участием рецептора TRα1, фосфоинозитид-3-киназы и NO-синтазы, однако такой механизм не является универсальным. ТГ также могут вызывать вазодилатацию артерий скелетных мышц при взаимодействии с интегрином αvβ3, расположенным в гладкомышечных клетках, однако запускаемые им сигнальные каскады пока не изучены. Знание молекулярных механизмов негеномного влияния ТГ важно для разработки новых способов фармакологической коррекции сосудистых патологий, развитие которых связано с нарушениями тиреоидного статуса. Lomonosov Moscow State University, School of Biology Обзор написан при финансовой поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (проект № 19-315-90027). 2020-11-06 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/932 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 75, № 4 (2020); 226-236 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 75, № 4 (2020); 226-236 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/932/528 Hulbert A.J. Thyroid hormones and their effects: a new perspective // Biol. Rev. 2000. Vol. 75. N 4. P. 519–631. Vasudevan N., Ogawa S., Pfaff D. Estrogen and thyroid hormone receptor interactions: physiological flexibility by molecular specificity // Physiol. Rev. 2002. Vol. 82. N 4. P. 923–944. Vassy R.. Nicolas P., Yin Y.L., Perret G.Y. Nongenomic effect of triiodothyronine on cell surface betaadrenoceptors in cultured embryonic cardiac myocytes // Proc. Soc. Exp. Biol. Med. 1997. Vol. 214. N 4. P. 352–358. Hammes S.R., Davis P.J. Overlapping nongenomic and genomic actions of thyroid hormone and steroids // Best Pract. Res. Clin. Endocrinol. Metab. 2015. Vol. 29. N 4. P. 581–593. Davis P.J., Davis F.B., Lin H.Y., Mousa S.A., Zhou M., Luidens M.K. Translational implications of nongenomic actions of thyroid hormone initiated at its integrin receptor // Am. J. Physiol. Endocrinol. Metab. 2009. Vol. 297. N 6. P. E1238–E1246. Flamant F., Cheng S., Hollenberg A., Moeller L.C., Samarut J., Wondisford F.E., Yen P.M., Refetoff S. Thyroid hormone signaling pathways: Time for a more precise nomenclature // Endocrinology. 2017. Vol. 158. N 7. P. 2052–2057. Davis P.J., Leonard, J.L., Lin H.Y., Leinung M., Mousa S.A. Molecular basis of nongenomic actions of thyroid hormone // Vitam. Horm. 2018. Vol. 106. P. 67–96. Louzada R.A., Carvalho D.P. Similarities and differences in the peripheral actions of thyroid hormones and their metabolites // Front. Endocrinol. 2018. Vol. 9: 394 Schroeder A., Jimenez R., Young B., Privalsky M.L. The ability of thyroid hormone receptors to sense T4 as an agonist depends on receptor isoform and on cellular cofactors // Mol. Endocrinol. 2014. Vol. 28. N 5. P. 745–757. Cao X., Kambe F., Moeller L.C., Refetoff S., Seo H. Thyroid hormone induces rapid activation of Akt/protein kinase B-mammalian target of rapamycin-p70S6K cascade through phosphatidylinositol 3-kinase in human fibroblasts // Mol. Endocrinol. 2005. Vol. 19. N 1. P. 102–112. Moeller L.C., Dumitrescu A.M., Refetoff S. Cytosolic action of thyroid hormone leads to induction of hypoxiainducible factor-1α and glycolytic genes // Mol. Endocrinol. 2005. Vol. 19. N 12. P. 2955–2963. Hiroi Y., Kim H.H., Ying H., Furuya F., Huang Z., Simoncini T., Noma K., Ueki K., Nguyen N., Scanlan T.S., Moskowitz M.A., Cheng S.Y., Liao J.K. Rapid nongenomic actions of thyroid hormone // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006. Vol. 103. N 38. P. 14104–14109. Plateroti M., Gauthier K., Domon-Dell C., Freund J., Samarut J., Chassande O. Functional interference between thyroid hormone receptor alpha (TRalpha) and natural truncated TRDeltaalpha isoforms in the control of intestine development // Mol. Cell. Biol. 2001. Vol. 21. N 14. P. 4761–4772. Chassande O., Fraichard A., Gauthier K., Flamant F., Legrand C., Savatier P., Laudet V., Samarut J. Identification of transcripts initiated from an internal promoter in the c-erbAα locus that encode inhibitors of retinoic acid receptor-α and triiodothyronine receptor activities // Mol. Endocrinol. 1997. Vol. 11. N 9. P. 1278–1290. Siegrist-Kaiser C.A., Juge-Aubry C., Tranter M.P., Ekenbarger D.M., Leonard J.L. Thyroxine-dependent modulation of actin polymerization in cultured astrocytes. A novel, extranuclear action of thyroid hormone // J. Biol. Chem. 1990. Vol. 265. N 9. P. 5296–5302. Davis P.J., Leonard J.L., Davis F.B. Mechanisms of nongenomic actions of thyroid hormone // Front. Neuroendocrinol. 2008. Vol. 29. N 2. P. 211–218. Cheng S.Y., Leonard J.L., Davis P.J. Molecular aspects of thyroid hormone actions // Endocr. Rev. 2010. Vol. 31. N 2. P. 139–170. Lanni A., Moreno M., Goglia F. Mitochondrial actions of thyroid hormone // Compr. Physiol. 2016. Vol. 6. N 4. P. 1591–1607. Wrutniak C., Cassar-Malek I., Marchal S., Rascle A., Heusser S., Keller J., Flechon J., Dauca M., Samarut J., Ghysdael J., Cabello G. A 43-kDa protein related to c-Erb A α1 is located in the mitochondrial matrix of rat liver // J. Biol. Chem. 1995. Vol. 270. N 27. P. 16347–16354. Pessemesse L., Lepourry L., Bouton K., Levin J., Cabello G., Wrutniak-Cabello C., Casas F. P28, a truncated form of TRα1 regulates mitochondrial physiology // FEBS Lett. 2014. Vol. 588. N 21. P. 4037–4043. Botta J., Mendoza D., Morero R.D., Farias R.N. High affinity L-triidothyronine binding sites on washed rat erythrocyte membranes // J. Biol. Chem. 1983. Vol. 258. N 11. P. 6690–6692. Lin H.Y., Davis F.B., Gordinier J.K., Martion L.J., Davis P.J. Thyroid hormone induces activation of mitogenactivated protein kinase in cultured cells // Am. J. Physiol. Cell Physiol. 1999. Vol. 276. N 5. P. C1014–C1024. Kalyanaraman H., Schwappacher R., Joshua J., Zhuang S., Scott B.T., Klos M., Casteel D.E., Frangos J.A., Dillmann W., Boss G.R., Pilz R.B. Nongenomic thyroid hormone signaling occurs through a plasma membranelocalized receptor // Sci. Signal. 2014. Vol. 7. N 326: ra48. Bergh J.J., Lin H., Lansing L., Mohamed S.N., Davis F.B., Mousa S., Davis P.J. Integrin αVβ3 contains a cell surface receptor site for thyroid hormone that is linked to activation of mitogen-activated protein kinase and induction of angiogenesis // Endocrinology. 2005. Vol. 146. N 7. P. 2864–2871. LaFoya B., Munroe J.A., Miyamoto A., Detweiler M.A., Crow J.J., Gazdik T., Albig A.R. Beyond the matrix: The many non-ECM ligands for integrins // Int. J. Mol. Sci. 2018. Vol. 19. N 2: 449. Hynes R.O. Integrins: Versatility, modulation, and signaling in cell adhesion // Cell. 1992. Vol. 69. N 1. P. 11–25. Xiong J.-P., Stehle T., Zhang R., Joachimiak A., Frech M., Goodman S.L., Arnaout M.A. Crystal structure of the extracellular segment of integrin αVβ3 in complex with an Arg-Gly-Asp ligand // Science. 2002. Vol. 296. N 5565. P. 151–155. Freindorf M., Furlani T.R., Kong J., Cody V., Davis F.B., Davis P.J. Combined QM/MM study of thyroid and steroid hormone analogue interactions with integrin // J. Biomed. Biotechnol. 2012. Vol. 2012: 959057. Lin H.Y., Sun M., Tang H., Lin C., Luidens M.K., Mousa S.A., Incerpi S., Drusano G.L., Davis F.B., Davis P.J. L-thyroxine vs. 3,5,3′-triiodo-L-thyronine and cell proliferation: Activation of mitogen-activated protein kinase and phosphatidylinositol 3-kinase // Am. J. Physiol. Cell Physiol. 2009. Vol. 296. N 5. P. C980–C991. Uzair I.D., Grand J.C., Flamini M.I., Sanchez A.M. Molecular actions of thyroid hormone on breast cancer cell migration and invasion via cortactin/N-WASP // Front. Endocrinol. 2019. Vol. 10: 139. Davis P.J., Shih A., Lin H., Martino L.J., Davis F.B. Thyroxine promotes association of mitogen-activated protein kinase and nuclear thyroid hormone receptor (TR) and causes serine phosphorylation of TR // J. Biol. Chem. 2000. Vol. 275. N 48. P. 38032–38039. Cao H.J., Lin H., Luidens M.K., Davis F.B., Davis P.J. Cytoplasm-to-nucleus shuttling of thyroid hormone receptor-β1 (Trβ1) is directed from a plasma membrane integrin receptor by thyroid hormone // Endocr. Res. 2009. Vol. 34. N 1–2. P. 31–42. Lin H., Shih A., Davis F.B., Davis P.J. Thyroid hormone promotes the phosphorylation of STAT3 and potentiates the action of epidermal growth factor in cultured cells // Biochemistry. 1999. Vol. 338. N 2. P. 427–432. Liu X., Zheng N., Shi Y., Yuan J., Lanying L. Thyroid hormone induced angiogenesis through the integrin αvβ3/protein kinase D/histone deacetylase 5 signaling pathway // J. Mol. Endocrinol. 2014. Vol. 52. N 3. P. 245–254. Lei J., Ingbar D.H. Src kinase integrates PI3K/Akt and MAPK/ERK1/2 pathways in T3-induced Na-KATPase activity in adult rat alveolar cells // Am. J. Physiol. Cell Mol. Physiol. 2011. Vol. 301. N 5. P. L765–L771. Axelband F., Dias J., Ferrão F.M., EinickerLamas M. Nongenomic signaling pathways triggered by thyroid hormones and their metabolite 3-iodothyronamine on the cardiovascular system // J. Cell. Physiol. 2010. Vol. 226. N 1. P. 21–28. Farwell A.P., Dubord-Tomasetti S.A., Pietrzykowski A.Z., Stachelek S.J., Leonard J.L. Regulation of cerebellar neuronal migration and neurite outgrowth by thyroxine and 3,3′,5′-triiodothyronine // Dev. Brain Res. 2005. Vol. 154. N 1. P. 121–135. Lin H., Su Y., Hsieh M., Lin S., Meng R., London D., Lin C., Tang H., Hwang J., Davis F.B., Mousa S.A., Davis P.J. Nuclear monomeric integrin αv in cancer cells is a coactivator regulated by thyroid hormone // FASEB J. 2013. Vol. 27. N 8. P. 3209–3216. Oliveira M., Olimpio R.M.C, Sibio M.T., Moretto F.C.F., Luvizotto R.A.M.. Nogueira C.R. Short-term effects of triiodothyronine on thyroid hormone receptor alpha by PI3K pathway in adipocytes, 3T3-L1 // Arq. Bras. Endocrinol. Metabol. 2014. Vol. 58. N 8. P. 833–837. Lin H.-Y., Hopkins R., Cao H.J., Tang H., Alexander C., Davis F.B., Davis P.J. Acetylation of nuclear hormone receptor superfamily members: thyroid hormone causes acetylation of its own receptor by a mitogen-activated protein kinase-dependent mechanism // Steroids. 2005. Vol. 70. N 5–7. P. 444–449. Sánchez-Pacheco A., Martinez-Iglesias O., MendezPertuz M., Aranda A. Residues K128, 132, and 134 in the thyroid hormone receptor-α are essential for receptor acetylation and activity // Endocrinology. 2009. Vol. 150. N 11. P. 5143–5152. Scapin S., Leoni S., Spagnuolo S., Gnocchi D., De Vito P., Luly P., Pedersen J.Z., Incerpi S. Short-term effects of thyroid hormones during development: Focus on signal transduction // Steroids. 2010. Vol. 75. N 8–9. P. 576–584. Danzi S., Klein I. Thyroid disease and the cardiovascular system // Endocrinol. Metab. Clin. 2014. Vol. 43. N 2. P. 517–528. Vargas F., Moreno J.M., Rodriguez-Gomez I., Wangensteen R., Osuna A., Alvarez-Guerra M., GarcisEstan J. Vascular and renal function in experimental thyroid disorders // Eur. J. Endocrinol. 2006. Vol. 154. N 2. P. 197–212. Heron M.I., Rakusan K. Short- and long-term effects of neonatal hypo- and hyperthyroidism on coronary arterioles in rat // Am. J. Physiol. 1996. Vol. 271. N 5. P. H1746–H1754. Rodriguez-Gomez I., Banegas I., Wangensteen R., Quesada A., Jimenez R., Gomez-Morales M., Francisco O’Valle, Duarte J., Vargas F. Influence of thyroid state on cardiac and renal capillary density and glomerular morphology in rats // J. Endocrinol. 2013. Vol. 216. N 1. P. 43–51. Селиванова Е.К., Тарасова О.С. Программирующее влияние тиреоидных гормонов на сердечно-сосудистую систему // Валеология. 2016. № 4. С. 60–67. Тарасова О.С., Софронова С.И., Гайнуллина Д.Г., Борзых А.А., Мартьянов А.А. Регуляция продукции оксида азота эндотелием сосудов при физической нагрузке: роль тиреоидных гормонов // Авиакосм. эколог. мед. 2015. Т. 49. № 2. С. 55–62. McAllister R.M., Grossenburg V. D., Delp M.D., Laughlin M.H. Effects of hyperthyroidism on vascular contractile and relaxation responses // Am. J. Physiol. Endocrinol. Metab. 1998. Vol. 274. N 5. P. E946–E953. Khorshidi-Behzadi M., Alimoradi H., HaghjooJavanmard S., Sharifi M.R., Rahimi N., Dehpour A.R. The effect of chronic hyperthyroidism and restored euthyroid state by methimazole therapy in rat small mesenteric arteries // Eur. J. Pharmacol. 2013. Vol. 701. N 1–3. P. 20–26. Honda H., Iwata T., Mochizuki T., Kogo H. Changes in vascular reactivity induced by acute hyperthyroidism in isolated rat aortae // Gen. Pharmacol. Vasc. Syst. 2000. Vol. 34. N 6. P. 429–434. Deng J., Zhao R., Zhang Z., Wang J. Changes in vasoreactivity of rat large- and medium-sized arteries induced by hyperthyroidism // Exp. Toxicol. Pathol. 2010. Vol. 62. N 3. P. 317–322. Гайнуллина Д.К., Селиванова Е.К., Шарова А.П., Тарасова О.С. Повышение констрикторного влияния Rho-киназы в артериях скелетных мышц и сердца при хроническом гипотиреозе у крыс // Бюлл. сиб. мед. 2018. Т. 17. № 4. С. 23–32. Iwata T., Honda H. Acute hyperthyroidism alters adrenoceptor- and muscarinic receptor-mediated responses in isolated rat renal and femoral arteries // Eur. J. Pharmacol. 2004. Vol. 493. N 1–3. P. 191–199. Zwaveling J., Pfaffendorf M., van Zwieten P.A. The direct effects of thyroid hormones on rat mesenteric resistance arteries // Fundam. Clin. Pharmacol. 1997. Vol. 11. N 1. P. 41–46. Gaynullina D.K., Sofronova S.I., Selivanova E.K., Shvetsova A.A., Borzykh A.A., Sharova A.P., Kostyunina D.S., Martyanov A.A., Tarasova O.S. NO-mediated anticontractile effect of the endothelium is abolished in coronary arteries of adult rats with antenatal/early postnatal hypothyroidism // Nitric Oxide. 2017. Vol. 63. P. 21–28. Luidens M.K., Mousa S.A., Davis F.B., Lin H.Y., Davis P.J. Thyroid hormone and angiogenesis // Vascul. Pharmacol. 2010. Vol. 52. N 3–4. P. 142–145. Yoshida T., Gong J., Xu Z., Wei Y., Duh E.J. Inhibition of pathological retinal angiogenesis by the integrin αvβ3 antagonist tetraiodothyroacetic acid (tetrac) // Exp. Eye Res. 2012. Vol. 94. N 1. P. 41–48. Mousa S.A., Bergh J.J., Dier E., Rebbaa A., O’Connor L.J., Yalcin M., Aljada A., Dyskin E., Davis F.B., Lin H., Davis P.J. Tetraiodothyroacetic acid, a small molecule integrin ligand, blocks angiogenesis induced by vascular endothelial growth factor and basic fibroblast growth factor // Angiogenesis. 2008. Vol. 11. N 2. P. 183–190. Millard M., Odde S., Neamati N. Integrin targeted therapeutics // Theranostics. 2012. Vol. 1. P. 154–188. Yoneda K., Takasu N., Higa S., Oshiro C., Oshiro Y., Shimabukuro M., Asahi T. Direct effects of thyroid hormones on rat coronary artery: nongenomic effects of triiodothyronine and thyroxine // Thyroid. 1998. Vol. 8. N 7. P. 609–613. Barreto-Chaves M.L., De Souza Monteiro P., Fürstenau C.R. Acute actions of thyroid hormone on blood vessel biochemistry and physiology // Curr. Opin. Endocrinol. Diabetes Obes. 2011. Vol. 18. N 5. P. 300–303. Lozano-Cuenca J., Lopez-Canales O.A., AguilarCarrasco J.C., Villagrana-Zesati J.R., Lopez-Mayorga R.M., Castillo-Henkel E.F., Lopez-Canales J.S. Pharmacological study of the mechanisms involved in the vasodilator effect produced by the acute application of triiodothyronine to rat aortic rings // Brazilian J. Med. Biol. Res. 2016. Vol. 49. N 8. P. 1–9. Gachkar S., Nock S., Geissler C., Oelkrug R., Johann K., Resch J., Rahman A., Arner A., Kirchner H., Mittag J. Aortic effects of thyroid hormone in male mice // J. Mol. Endocrinol. 2019. Vol. 62. N 3. P. 91–99. Colantuoni A., Marchiafava P.L., Lapi D., Forini F.S., Iervasi G. Effects of tetraiodothyronine and triiodothyronine on hamster cheek pouch microcirculation // Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. 2005. Vol. 288. N 4. P. H1931–H1936. Kimura K., Shirozaki Y., Jujo S., Shizuma T., Fukuyama N.. Nakazawa H. Triiodothyronine acutely increases blood flow in the ventricles and kidneys of anesthesized rabbits // Thyroid. 2006. Vol. 16. N 4. P. 357–360. Krasner J.L., Wendling W.W., Cooper S.C., Chen D., Hellman S.K., Eldridge C.J., McClurken J.B., Jeevanandam V., Carlsson C. Direct effects of triiodothyronine on human internal mammary artery and saphenous veins // J. Cardiothorac. Vasc. Anesth. 1997. Vol. 11. N 4. P. 463–466. Schmidt B.M.W., Martin N., Georgens A.C., Tillman H., Feuring M., Christ M., Wehling M. Nongenomic cardiovascular effects of triiodothyronine in euthyroid male volunteers // J. Clin. Endocrinol. Metab. 2002. Vol. 87. N 4. P. 1681–1686. Cai Y., Manio M.M., Leung G.P.H., Xu A., Tang E.H.C., Vanhoutte P.M. Thyroid hormone affects both endothelial and vascular smooth muscle cells in rat arteries // Eur. J. Pharmacol. 2015. Vol. 747. P. 18–28. Liu K.L., Lo M., Canaple L., Gauthier K., Carmine P., Beylot M. Vascular function of the mesenteric artery isolated from thyroid hormone receptor-α knockout mice // J. Vasc. Res. 2014. Vol. 51. N 5. P. 350–359. Park K.W., Dai H.B., Ojamaa K., Lowenstein E., Klein I., Sellke F.W. The direct vasomotor effect of thyroid hormones on rat skeletal muscle resistance arteries // Anesth. Analg. 1997. Vol. 85. N 4. P. 734–738. Selivanova E., Gaynullina D., Tarasova O. Endothelium and Rho-kinase are not essential for nongenomic relaxatory effects of thyroxine in rat skeletal muscle arteries // Acta Physiol. (Oxf.). 2019. Vol. 227. N S721. P. 119. Carrillo-Sepulveda M.A., Ceravolo G.S., Fortes Z.B., Carvalho M.H., Tostes R.C., Laurindo F.R. Webb R.C., Barreto-Chaves M.L.M. Thyroid hormone stimulates NO production via activation of the PI3K/Akt pathway in vascular myocytes // Cardiovasc. Res. 2010. Vol. 85. N 3. P. 560–570. Гайнуллина Д.К., Кирюхина О.О., Тарасова О.С. Оксид азота в эндотелии сосудов: регуляция продукции и механизмы действия // Усп. физиол. наук. 2013. Т. 44. № 4. С. 88–102. Ojamaa K., Klemperer J.D., Klein I. Acute effects of thyroid hormone on vascular smooth muscle // Thyroid. 1996. Vol. 6. N 5. P. 505–512. Flamant F., Samarut J. Thyroid hormone receptors: Lessons from knockout and knock-in mutant mice // Trends Endocrinol. Metab. 2003. Vol. 14. N 2. P. 85–90. Aoki T., Tsunekawa K., Araki O., Ogiwara T., Nara M., Sumino H., Kimura T., Murakami M. Type 2 iodothyronine deiodinase activity is required for rapid stimulation of PI3K by thyroxine in human umbilical vein endothelial cells // Endocrinology. 2015. Vol. 156. N 11. P. 4312–4324. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/118 2015-07-22T15:41:46Z jour:PH driver

SYSTEMIC ANALYSIS OF GENERAL HUMAN CONSTITUTION СИСТЕМНЫЙ АНАЛИЗ ОБЩЕЙ КОНСТИТУЦИИ ЧЕЛОВЕКА M. A. Negasheva М. А. Негашева Connections between three systems of characteristics have been studies using materials of complex anthropological examination of 669 young men and girls at the age of 16—23 years old including measurement of 40 body, head and face parameters, fingerprinting results and determination of personal psychological characteristics based on Eysenck, Spielberger, Strelau and Cat-tell tests using different methods of multivariate statistics. The author suggested an original model of connections of somatic, dermatoglyphic and psychological features in the structure of general human constitution based on statistically significant canonical correlations (revealed by the author) and taking in consideration the degree of influence of genetic and social as well as economic complex of factors (based on the data from scientific literature) on development and formation of the investigated systems of characteristics. The results of work with the anthropological material, evidences of the conception stipulating relative autonomy of morphofunctional systems as an essential condition of integrity of the body in general are presented. На материалах комплексного антропологического обследования 669 юношей и девушек в возрасте от 16 до 23 лет, включающего измерение 40 параметров тела,головы и лица, снятие отпечатков пальцев и определение психологических характеристик личности по тестам Айзенка, Спилбергера, Стреляу и Кэттелла с помощью различных методов многомерной статистики, изучены связи между тремя системами признаков. Предложена оригинальная модель взаимосвязей соматических, дерматоглифических и психологических признаков в структуре общей конституции человека, основанная на статистически значимых канонических корреляциях (полученных автором) и учитывающая степень влияния генетического и социально-экономического комплекса факторов (по литературным данным) на развитие и формирование исследованных систем признаков. По результатам работына антропологическом материале приводятся доказательтва концепции об относительной автономности морфофункциональных систем как необходимом условии интегрированности организма в целом. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-22 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/118 10.1234/XXXX-XXXX-2009-1-3-8 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2009); 3-8 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2009); 3-8 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2009-1 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/118/119 Абрамова Т.Ф. 2003. Пальцевая дерматоглифика и физические способности: Автореф. дис. ... докт. биол. наук. М. Акинщикова Г.И. 1977. Соматическая и психофизиологическая организация человека. Л. Бец Л.В. 2000. Антропологические аспекты изучения гормонального статуса человека: Автореф. дис. ... докт. биол. наук. М. Гусева И.С. 1986. Морфогенез и генетика гребешковой кожи. Минск. Карлинская И.М. 1999. Психодиагностические материалы. М. Левонтин Р. 1993. Человеческая индивидуальность: наследуемость и среда. М. Мерлин В.С. 1986. Очерк интегрального исследования индивидуальности. М. Никитюк Б.А. 1991. Конституция человека // Итоги науки и техники. Сер. Антропология. 4. 5—151 Равич-Щербо И.В., Марютина Т.М., Григоренко Е.Л. 2006. Психогенетика. М. Рогинский Я.Я. 1966. Методологические ос-новы антропологии // Биол. науки. № 3 (35). 9—18. Русалов В.М. 1979. Биологические основы индивидуально-психологических различий. Савельев С.В. 2002. Стадии эмбрионального развития мозга человека. М. Северцов А.Н. 1935. Морфобиологическая теория эволюции и теория филэмбриогенеза // Собр. соч. Т. 3. М.; Л. С. 345—528. Трубников В.И., Гиндилис В.М. 1980. Многомерный генетический анализ антропометрических показателей. Построение генетически эффективного пространства // Вопр. антропологии. Вып. 65. 54—66. Хайруллин Р.М., Никитюк Д.Б., Кри кун Е.Н. 2005. Факторы изменчивости кожных узоров пальцев. Ульяновск. Хрисанфова Е.Н. 1990. Конституция и биохимическая индивидуальность человека. М. Шмальгаузен И.И. 1938. Организм как целое в индивидуальном и историческом развитии. М.; Л. Cummins H., Midlo Ch. 1943. Finger prints, palms and soles. An introduction to dermatoglyphics. Philadelphia. Loehlin J.C. 1992. Genes and Environment in Personality Development. Sage. Penrose L.S., Ohara P.T. 1973. The development of the epidermal ridges // J. Med. Genet. N 3. 201—208. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/13 2015-04-30T18:51:50Z jour:PH driver

INVESTIGATION OF PROTECTIVE PROPERTIES OF SHIGELLA SONNEI CARBOHYDRATE BIOPOLYMERS UNDER EXPERIMENTAL ENDOTOXIC SHOCK MODELS ИССЛЕДОВАНИЕ ЗАЩИТНЫХ СВОЙСТВ БИОПОЛИМЕРОВ УГЛЕВОДНОЙ ПРИРОДЫ SHIGELLA SONNEI НА МОДЕЛЯХ ЭНДОТОКСИЧЕСКОГО ШОКА A. A. Markina I. A. Kondratieva А. А. Маркина И. А. Кондратьева ФНО- . exopolysaccharide lipopolysaccharid , Shigella sonnei endotoxin tolerance TNF- . ФНО- . экзополисахарид липополисахарид Shigella son- nei эндотоксичeская толерантность ФНО- . Study tolerogenic properties of new non-pyrogenic low-endotoxic complex preparation composed of Shigella sonnei carbohydrate biopolymers under D-galactosamine and direct experimental endotoxic shock models. Pretreatment with complex preparation protects mice (CBA Ѕ C57Bl/6)F1 against lipopolysaccharide (E. coli O:55) — mediated death. We demonstrate correlation between increasing pre-immunization dose of complex preparation with rate of survival and reduction of TNF-a serum level under direct endotoxic shock model. Проведено исследование толерогенных свойств нового апирогенного, низкоэндотоксичного комплексного препарата на основе биополимеров углеводной природы Shigella sonnei на D-галактозаминовой и прямой моделях эндотоксического шока. Профилактическое введение препарата защищает мышей (CBA Ѕ C57Bl/6)F1 от гибели при введении летальных доз эндотоксина E. coli О:55. На прямой модели эндотоксического шока было показано, что повышение дозы иммунизации коррелирует с увеличением выживаемости и снижением уровня ФНО-a в сыворотках крови экспериментальных животных. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-04-30 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/13 10.1234/XXXX-XXXX-2013-2-12-15 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 2 (2013); 12-15 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 2 (2013); 12-15 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/13/15 Cross A.S., Opal S.M., Warren H.S., Palardy J.E., Glaser K., Parejo A., Bhattacharjee A.K. Active immunization with a detoxified Escherichia coli J5 lipopolysaccharide group B meningococcal outer membrane protein complex vaccine protects animals from experimental sepsis // J. Infect. Dis. 2001. N 183. P. 1079—1086. Astiz M.E., Rackow E.C. Septic shock // Lancet. 1998. N 361. P. 1501—1505. Dinarello C. Cytokines as mediators in the pathogenesis of septic shock // Curr. Topics Microbiol. Immunol. 1996. N 216. P. 133—165. Ulloa L., Tracey K.J. The “cytokine profile”: a code for sepsis // Trends Mol. Med. 2005. N 11. P. 56—63. Madonna G.S., Peterson J.E., Ribi E.E., Vogel S.N. Early-phase endotoxin tolerance: induction by detoxified lipid A derative, monophosphoryl lipid A // Infect. Immun. 1986. N 52. Vol. 1. P. 6—11. Dinarello C.A. Immediate cytokine responses to endotoxin: tumor necrosis factor a and interleukin-1 family // Endotoxin in Health and Disease / Ed. H. Brade. New York: Marcell Dekker, 1999. P. 817—830. van Amersfoort E.S., van Berkel T.J., Kuiper J. Receptors, mediators, and mechanisms involved in bacterial sepsisand septic shock // Clin. Microbial. Rev. 2003. N 16. Vol. 3. P. 379—414. Lehmann B.V., Freudenberg M.A., Galanos G. Lethal toxicity of lipopolysaccharide and tumor necrosis factor in normal and D-galactosamine-treated mice // J. Exp. Med. 1987. N 165. P. 657—663. Tiegs G., Wolter M., Wendel A. Tumour necrosis factor is a terminal mediator in galactosamine/endotoxin-induced hepatitis in mice // Biochem. Pharmacol. 1989. N 38. P. 627—631. Mignon A., Rouquet N., Fabre M., Martin S., Pages J.C., Dhainaut J.F., Kahn A., Briand P., Joulin V. LPS challenge in D-galactosamine-sensitized mice accounts for caspase-dependent fulminant hepatitis, not for septic shock // Am. J. Respir. Crit. Care Med. 1999. N 159. P. 1308—1315. Johnston C.A., Greisman S.E. Mechanism of endotoxin tolerance // Handbook of Endotoxin. Vol. 2. Pathophysiology of endotoxin / Ed. L.B. Hishaw. New York: Elsever, 1985. P. 359—391. Suffredini A.F., Reda D., Banks S.M., Tropea M., Agosti J.M., Miller R. Effects of recombinant dimeric TNF-a receptor on human inflammatory responses following intra-venous endotoxin administration // J. Immunol. 1995. N 155. P. 5038—5045. Marano M.A., Fong Y., Moldawer L.L., Wei H., Calvano S.E., Tracey K.J., Barie J.S., Manogue K., Cerami A., Shires G.T.G., Lowry S.F. Serum cachectin/tumor necrosis factor in critically ill patients with burns correlate with infection and mortality // Surg. Gynecol. Obset. 1990. N 170. P. 32—38. Christman J.W., Lancaster L.H., Blackwell T.S. Nuclear factor “B: a pivotal role in the systemic inflammatory response syndrome and new target for therapy // Intens. Care Med. 1998. N 24. P. 1131—1138. Schade F.U., Flach R., Flohe S., Majetschak M., Kreuzfelder E., Dominguez-Fernandes E., Borgermann J., Reuter M., Obertacke U. Endotoxin tolerance // Endotoxin in Health and Disease / Ed. H. Brade. New York: Marcell Dekker, 1999. P. 751—767. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1409 2024-11-25T08:10:25Z jour:RST driver

Urban dust nanoparticles induce proinflammatory activation of neutrophils and macrophages Наночастицы городской пыли вызывают провоспалительную активацию нейтрофилов и макрофагов A. N. Pavlyuchenkova N. V. Vorobyeva A. A. Dashkevich L. A. Zinovkina A. I. Ivaneev M. S. Ermolin P. S. Fedotov R. A. Zinovkin M. A. Chelombitko B. V. Chernyak А. Н. Павлюченкова Н. В. Воробьева А. А. Дашкевич Л. А. Зиновкина А. И. Иванеев М. С. Ермолин П. С. Федотов Р. А. Зиновкин М. А. Челомбитько Б. В. Черняк макрофаги urban dust innate immune cells inflammatory activation neutrophils macrophages макрофаги городская пыль клетки врожденного иммунитета воспалительная активация нейтрофилы макрофаги Urban dust particles are a major pathogenic factor in respiratory diseases such as asthma and chronic obstructive pulmonary disease, and also increase the risk of cardiovascular disease and lung cancer. Nanoparticles (NPs) of various origins are an important component of urban dust, but their effects on the human body are barely studied. In the present work, the effect of urban dust NPs on innate immune cells, neutrophils and macrophages was investigated in vitro. Urban dust nanoparticles were isolated from urban dust samples using coiled tube field-flow fractionation technique. Urban dust NPs were shown to induce a slight increase in the production of reactive oxygen species in human neutrophils. Preincubation of neutrophils with dust NPs resulted in a significant increase in ROS production in response to the chemoattractant peptide N-formylmethionine-leucyl-phenylalanine (fMLP). This suggests an effect of neutrophil priming with nanoparticles. On macrophages differentiated from the monocytic line THP-1, urban dust NPs stimulated the secretion of pro-inflammatory cytokines, tumor necrosis factor, and interleukin-6. The inflammatory activation of neutrophils and macrophages was reduced by antibiotic polymyxin B, which is able to bind bacterial wall lipopolysaccharide. The results suggest that the pro-inflammatory effect of urban dust NPs on neutrophils and macrophages is, at least in part, due to the presence of LPS. Частицы городской пыли служат важнейшим патогенным фактором при заболеваниях дыхательных путей, таких как астма и хроническая обструктивная болезнь легких, а также повышают риск развития сердечно-сосудистых заболеваний и рака легких. Наночастицы (НЧ) различного происхождения являются важным компонентом городской пыли, однако их воздействие на организм человека практически не изучено. В настоящей работе было исследовано влияние НЧ городской пыли на клетки врожденного иммунитета, нейтрофилы и макрофаги in vitro. В работе были использованы НЧ, выделенные из образцов городской пыли с помощью метода проточного фракционирования частиц во вращающейся спиральной колонке. Показано, что НЧ пыли вызывают статистически значимое повышение продукции активных форм кислорода в нейтрофилах человека. Преинкубация нейтрофилов с НЧ пыли приводила к четырехкратному усилению продукции активных форм кислорода в ответ на хемоаттрактантный пептид N-формил-метионил-лейцил-фенилаланин, что свидетельствует об эффекте праймирования нейтрофилов наночастицами. У макрофагов, полученных при дифференцировке клеток моноцитарной линии THP-1, НЧ пыли стимулировали секрецию провоспалительных цитокинов, фактора некроза опухолей и интерлейкина-6. Добавление антибиотика полимиксина B, способного связывать липополисахарид бактериальной стенки, снижало воспалительную активацию нейтрофилов и макрофагов. Полученные данные указывают на то, что провоспалительное действие НЧ городской пыли на нейтрофилы и макрофаги, по крайней мере отчасти, связано с присутствием в них липополисахарида бактериальной стенки. Lomonosov Moscow State University, School of Biology The research was funded by the Russian Science Foundation (project No. 23-14-00084). Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда (проект №23-14-00084). 2024-11-25 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1409 10.55959/MSU0137-0952-16-79-3-5 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 79, № 3 (2024); 211-220 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 79, № 3 (2024); 211-220 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1409/693 Giere R., Querol X. Solid particulate matter in the atmosphere. Elements. 2010;6(4):215–222. Haynes H.M., Taylor K.G., Rothwell J., Byrne P. Characterisation of road-dust sediment in urban systems: a review of a global challenge. J. Soils Sediments. 2020;20(12):4194–4217. Loomis D., Grosse Y., Lauby-Secretan B., El Ghissassi F., Bouvard V., Benbrahim-Tallaa L., Guha N., Baan R., Mattock H., Straif K. The carcinogenicity of outdoor air pollution. Lancet Oncol. 2013;14(13):1262–1263. Ревич Б.А. Мелкодисперсные взвешенные частицы в атмосферном воздухе и их воздействие на здоровье жителей мегаполисов. Проблемы экологического мониторинга и моделирования экосистем. 2018;29(3):53–78. Hu X., Zhang Y., Luo J., Wang T., Lian H., Ding Z. Bioaccessibility and health risk of arsenic, mercury and other metals in urban street dusts from a mega-city, Nanjing, China. Environ. Pollut. 2011;159(5):1215–1221. Albanese A., Tang P.S., Chan W.C. The effect of nanoparticle size, shape, and surface chemistry on biological systems. Annu. Rev. Biomed. Eng. 2012;14(1):1–16. Saffari A., Daher N., Shafer M.M., Schauer J.J., Sioutas C. Seasonal and spatial variation of trace elements and metals in quasi-ultrafine (PM0.25) particles in the Los Angeles metropolitan area and characterization of their sources. Environ. Pollut. 2013;181:14–23. Deng J., Zhang Y., Qiu Y., Zhang H., Du W., Xu L., Hong Y., Chen Y., Chen J. Source apportionment of PM2.5 at the Lin’an regional background site in China with three receptor models. Atmos. Res. 2018;202:23–32. Dietrich M., O’Shea M.J., Gieré R., Krekeler M.P.S. Road sediment, an underutilized material in environmental science research: a review of perspectives on United States studies with international context. J. Hazard. Mater. 2022;432:128604. Phairuang W., Inerb M., Hata M., Furuuchi M. Characteristics of trace elements bound to ambient nanoparticles (PM0.1) and a health risk assessment in southern Thailand. J. Hazard Mater. 2022;425:127986. Fedotov P.S., Ermolin M.S., Karandashev V.K., Ladonin D.V. Characterization of size, morphology and elemental composition of nano-, submicron, and micron particles of street dust separated using field-flow fractionation in a rotating coiled column. Talanta. 2014;130:1–7. Ermolin M.S., Fedotov P.S., Ivaneev A.I., Karandashev V.K., Fedyunina N.N., Burmistrov A.A. A contribution of nanoscale particles of road-deposited sediments to the pollution of urban runoff by heavy metals. Chemosphere. 2018;210:65–75. Gualtieri M., Øvrevik J., Holme J.A., Perrone M.G., Bolzacchini E., Schwarze P.E., Camatini M. Differences in cytotoxicity versus pro-inflammatory potency of different PM fractions in human epithelial lung cells. Toxicol. In Vitro. 2010;24(1):29–39. Babin K., Antoine F., Goncalves D.M., Girard D. TiO2, CeO2 and ZnO nanoparticles and modulation of the degranulation process in human neutrophils. Toxicol. Lett. 2013;221(1):57–63. Masoud R., Bizouarn T., Trepout S., Wien F., Baciou L., Marco S., Houée Levin C. Titanium dioxide nanoparticles increase superoxide anion production by acting on NADPH oxidase. PLoS One. 2015;10(12):e0144829. Poulsen K.M., Albright M.C., Niemuth N.J., Tighe R.M,. Payne C.K. Interaction of TiO2 nanoparticles with lung fluid proteins and the resulting macrophage inflammatory response. Environ. Sci. Nano. 2023;10(9):2427–2436. Pavlin M., Lojk J., Strojan K., Hafner-Bratkovič I., Jerala R., Leonardi A., Križaj I., Drnovšek N., Novak S., Veranič P., Bregar V.B. The relevance of physico-chemical properties and protein corona for evaluation of nanoparticles immunotoxicity-in vitro correlation analysis on THP-1 macrophages. Int. J. Mol. Sci. 2022;23(11):6197. Svadlakova T., Holmannova D., Kolackova M., Malkova A., Krejsek J., Fiala Z. Immunotoxicity of carbon-based nanomaterials, starring phagocytes. Int. J. Mol. Sci. 2022;23(16):8889. Glencross D.A., Ho T-R., Camiña N., Hawrylowicz C.M., Pfeffer P.E. Air pollution and its effects on the immune system. Free Radic. Biol. Med. 2020;151:56–68. Vorobjeva N.V., Chernyak B.V. NETosis: molecular mechanisms, role in physiology and pathology. Biochemistry (Mosc.). 2020;85(10):1178–1190. Mass E., Nimmerjahn F., Kierdorf K., Schlitzer A. Tissue-specific macrophages: how they develop and choreograph tissue biology. Nat. Rev. Immunol. 2023;23(9):563–579. Sheu K.M., Hoffmann A. Functional hallmarks of healthy macrophage responses: their regulatory basis and disease relevance. Annu. Rev. Immunol. 2022;40(1):295–321. Ivaneev A.I., Brzhezinskiy A.S., Karandashev V.K., Ermolin M.S., Fedotov P.S. Assessment of sources, environmental, ecological, and health risks of potentially toxic elements in urban dust of Moscow megacity, Russia. Chemosphere. 2023;321:138142. Ivaneev A.I., Ermolin M.S., Fedotov P.S., Faucher S., Lespes G. Sedimentation field-flow fractionation in thin channels and rotating columns: from analytical to preparative scale separations. Sep. Purif. Rev. 2020;50(4):363–379. Vorobjeva N., Prikhodko A., Galkin I., Pletjushkina O., Zinovkin R., Sud’ina G., Chernyak B., Pinegin B. Mitochondrial reactive oxygen species are involved in chemoattractant-induced oxidative burst and degranulation of human neutrophils in vitro. Eur. J. Cell Biol. 2017;96(3):254–265. Vorobjeva N., Galkin I., Pletjushkina O., Golyshev S., Zinovkin R., Prikhodko A., Pinegin V., Kondratenko I., Pinegin B., Chernyak B. Mitochondrial permeability transition pore is involved in oxidative burst and NETosis of human neutrophils. Biochim. Biophys. Acta Mol. Basis Dis. 2020;1866(5):165664. Chanput W., Mes J.J., Wichers H.J. THP-1 cell line: an in vitro cell model for immune modulation approach. Int. Immunopharmacol. 2014;23(1):37–45. Mohd Yasin Z.N., Mohd Idrus F.N., Hoe C.H., Yvonne-Tee G.B. Macrophage polarization in THP-1 cell line and primary monocytes: a systematic review. Differentiation. 2022;128:67–82. Kettler K., Giannakou C., de Jong W.H., Hendriks A.J., Krystek P. Uptake of silver nanoparticles by monocytic THP-1 cells depends on particle size and presence of serum proteins. J. Nanopart. Res. 2016;18(9):286. Premshekharan G., Nguyen K., Zhang H., Forman H.J., Leppert V.J. Low dose inflammatory potential of silica particles in human-derived THP-1 macrophage cell culture studies – mechanism and effects of particle size and iron. Chem. Biol. Interact. 2017;272:160–171. Brzicova T., Javorkova E., Vrbova K., Zajicova A., Holan V., Pinkas D., Philimonenko V., Sikorova J., Klema J., Topinka J., Rossner P. Jr. Molecular responses in THP-1 macrophage-like cells exposed to diverse nanoparticles. Nanomaterials. 2019;9(5):687 Zijno A., Cavallo D., Di Felice G., Ponti J., Barletta B., Butteroni C., Corinti S., De Berardis B., Palamides J., Ursini C.L., Fresegna A.M., Ciervo A., Maiello R., Barone F. Use of a common European approach for nanomaterials’ testing to support regulation: a case study on titanium and silicon dioxide representative nanomaterials. J. Appl. Toxicol. 2020;40(11):1511–1525. Smulders S., Kaiser J.-P., Zuin S., Van Landuyt K.L., Golanski L., Vanoirbeek J., Wick P., Hoet P.H. Contamination of nanoparticles by endotoxin: evaluation of different test methods. Part. Fibre Toxicol. 2012;9:41. Bhor V.M., Thomas C.J., Surolia N., Surolia A. Polymyxin B: an ode to an old antidote for endotoxic shock. Mol. Biosyst. 2005;1(3):213–222. Monopoli M.P., Aberg C., Salvati A., Dawson K.A. Biomolecular coronas provide the biological identity of nanosized materials. Nat. Nanotechnol. 2012;7(12):779–786. Neagu M., Piperigkou Z., Karamanou K., Engin A.B., Docea A.O., Constantin C., Negrei C., Nikitovic D., Tsatsakis A. Protein bio-corona: critical issue in immune nanotoxicology. Arch. Toxicol. 2017;91(3):1031–1048. Cai K., Wang A.Z., Yin L., Cheng J. Bio-nano interface: The impact of biological environment on nanomaterials and their delivery properties. J. Control Release. 2017;263:211–222. Bianchi M.G., Allegri M., Chiu M., Costa A.L., Blosi M., Ortelli S., Bussolati O, Bergamaschi E. Lipopolysaccharide adsorbed to the bio-corona of TiO 2 nanoparticles powerfully activates selected pro-inflammatory transduction pathways. Front. Immunol. 2017;8:866. Li Y., Shi Z., Radauer-Preiml I., Andosch A., Casals E., Luetz-Meindl U., Cobaleda M., Lin Z., Jaberi-Douraki M., Italiani P., Horejs-Hoeck J., Himly M., Monteiro-Riviere N.A., Duschl A., Puntes V.F., Boraschi D. Bacterial endotoxin (lipopolysaccharide) binds to the surface of gold nanoparticles, interferes with biocorona formation and induces human monocyte inflammatory activation. Nanotoxicology. 2017;11(9–10):1157–1175. Borregaard N., Cowland J.B. Granules of the human neutrophilic polymorphonuclear leukocyte. Blood. 1997;89(10):3503–3521. Guthrie L.A., McPhail L.C., Henson P.M., Johnston R.B. Jr. Priming of neutrophils for enhanced release of oxygen metabolites by bacterial lipopolysaccharide. Evidence for increased activity of the superoxide-producing enzyme. J. Exp. Med. 1984;160(6):1656–1671. Goodridge H.S., Wolf A.J., Underhill D.M. Betaglucan recognition by the innate immune system. Immunol. Rev. 2009;230(1):38–50. Forehand J.R., Pabst M.J., Phillips W.A., Johnston R.B. Jr. Lipopolysaccharide priming of human neutrophils for an enhanced respiratory burst. Role of intracellular free calcium. J. Clin. Invest. 1989;83(1):74–83. Böhmer R.H., Trinkle L.S., Staneck J.L. Dose effects of LPS on neutrophils in a whole blood flow cytometric assay of phagocytosis and oxidative burst. Cytometry. 1992;13(5):525–531. Wan J., Shan Y., Fan Y., Fan C., Chen S., Sun J., Zhu L., Qin L., Yu M., Lin Z. NF-κB inhibition attenuates LPS-induced TLR4 activation in monocyte cells. Mol. Med. Rep. 2016;14(5):4505–4510. Martinon F, Burns K, Tschopp J. The inflammasome: a molecular platform triggering activation of inflammatory caspases and processing of proIL-beta. Mol. Cell. 2002;10(2):417–426. Kagi T., Naganuma R., Inoue A., Noguchi T., Hamano S., Sekiguchi Y., Hwang G.W., Hirata Y., Matsuzawa A. The polypeptide antibiotic polymyxin B acts as a pro-inflammatory irritant by preferentially targeting macrophages. J. Antibiot. 2022;75(1):29–39. Arango Duque G., Descoteaux A. Macrophage cytokines: involvement in immunity and infectious diseases. Front. Immunol. 2014;5:491. Barnes P.J. The cytokine network in chronic obstructive pulmonary disease. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 2009;41(6):631–638. Matera M.G., Calzetta L., Cazzola M. TNF-alpha inhibitors in asthma and COPD: we must not throw the baby out with the bath water. Pulm. Pharmacol. Ther. 2010;23(2):121–128. Rincon M., Irvin C.G. Role of IL-6 in asthma and other inflammatory pulmonary diseases. Int. J. Biol. Sci. 2012;8(9):1281–1290. Barnes P.J. Targeting cytokines to treat asthma and chronic obstructive pulmonary disease. Nat. Rev. Immunol. 2018;18(7):454–466. Osei E.T., Brandsma C.-A., Timens W., Heijink I.H., Hackett T.-L. Current perspectives on the role of interleukin-1 signalling in the pathogenesis of asthma and COPD. Eur. Respir. J. 2020;55(2):1900563. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/276 2015-11-28T15:11:12Z jour:GR driver

EPIGENETIC AND ENDOCRINE DETERMINANTS OF DIFFERENCES IN LIFESPAN BETWEEN CASTES OF SOCIAL INSECTS ЭПИГЕНЕТИЧЕСКИЕ И ЭНДОКРИННЫЕ ДЕТЕРМИНАНТЫ РАЗЛИЧИЙ ПО ДЛИТЕЛЬНОСТИ ЖИЗНИ МЕЖДУ КАСТАМИ СОЦИАЛЬНЫХ НАСЕКОМЫХ A. M. Vaiserman А. М. Вайсерман продолжительность жизни developmental programming DNA methylation epigenetics gene expression longevity. продолжительность жизни онтогенетическое программирование метилирование ДНК эпигенетика экспрессия гена продолжительность жизни Social insects are promising model organisms in the study of the mechanisms determining longevity. They have the caste system in which the same genome may produce phenotypes significantly differing in longevity. In honeybee, caste differentiation depends on the duration of supply by specific nutrient mixture (royal jelly) on the larval stage. Longer feeding by the royal jelly leads to the formation of the queen epigenome which differs from the epigenome of worker bee. Such epigenetic differences, in turn, induce endocrine changes manifested in increased synthesis of juvenile hormone and activation of TOR signaling pathway, as well as in the modulation of insulin/IGF-1 pathway in queen-destined larvae. In adults, these processes influence the synthesis of vitellogenin (egg yolk precursor affecting many aspects of insect ontogenesis). Epigenetic and endocrine mechanisms that underlie differences in longevity among social insect castes are discussed. Cоциальные насекомые являются перспективными модельными организмами при изучении механизмов, определяющих потенциал долгожительства. Они имеют кастовую систему, в которой существенно различающиеся по продолжительности жизни фенотипы возникают на основе идентичных геномов. У пчелы выбор различных “онтогенетических траекторий” зависит от длительности питания специфической питательной смесью (маточным молочком) на стадии личинки. Более длительное кормление маточным молочком приводит к формированию у королевы эпигенома, отличающегося от эпигенома рабочей пчелы. Подобные эпигенетические различия в свою очередь индуцируют эндокринные изменения, проявляющиеся в увеличении синтеза ювенильного гормона и активизации сигнального пути TOR (target of rapamycin), а также в модуляции инсулинового сигнального пути у “королевских” личинок. У взрослых особей от этих процессов зависит уровень синтеза вителлогенина (предшественника желтка яиц, в значительной степени влияющего на многие аспекты онтогенеза насекомых). В представленном обзоре обсуждаются эпигенетические и эндокринные механизмы, обусловливающие формирование контрастных по длительности жизни каст социальных насекомых. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-11-28 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/276 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 4 (2015); 8-14 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 4 (2015); 8-14 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/276/274 Vaiserman A.M. Early-life nutritional programming of longevity // J. Dev. Orig. Health Dis. 2014. Vol. 5. N 5. P. 325–338. Münch D., Kreibich C.D., Amdam G.V. Aging and its modulation in a long-lived worker caste of the honey bee // J. Exp. Biol. 2013. Vol. 216. N 9. P. 1638–1649. Remolina S.C., Hughes K.A. Evolution and mechanisms of long life and high fertility in queen honey bees // Age (Dordr). 2008. Vol. 30. N 2–3. P. 177–185. Winston M.L. The biology of the honey bee. Cambridge: Harvard Univ. Press, 1991. 294 p. Welch M., Lister R. Epigenomics and the control of fate, form and function in social insects // Curr. Opin. Insect Sci. 2014. Vol. 1. P. 31–38. Weiner S.A., Toth A.L. Epigenetics in social insects: a new direction for understanding the evolution of castes // Genet. Res. Int. 2012. Vol. 2012. ID: 609810. Klose R.J., Bird A.P. Genomic DNA methylation: the mark and its mediators // Trends Biochem. Sci. 2006. Vol. 31. N 2. P. 89–97. Ванюшин Б.Ф. Эпигенетика сегодня и завтра // Вавиловский журн. генет. и селекции. 2013. T. 17. № 4/2. С. 805–832. Lyko F., Maleszka R. Insects as innovative models for functional studies of DNA methylation // Trends Genet. 2011. Vol. 27. N 4. P. 127–131. Kucharski R., Maleszka J., Foret S., Maleszka R. Nutritional control of reproductive status in honeybees via DNA methylation // Science. 2008. Vol. 319. N 5871. P. 1827–1830. Lyko F., Foret S., Kucharski R., Wolf S., Falckenhayn C., Maleszka R. The honey bee epigenomes: differential methylation of brain DNA in queens and workers // PLoS Biol. 2010. Vol. 8. N 11. e1000506. Foret S., Kucharski R., Pellegrini M., Feng S., Jacobsen S.E., Robinson G.E., Maleszka R. DNA methylation dynamics, metabolic fluxes, gene splicing, and alternative phenotypes in honey bees // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2012. Vol. 109. N 13. P. 4968–4973. Ikeda T., Furukawa S., Nakamura J., Sasaki M., Sasaki T. CpG methylation in the hexamerin 110 gene in the European honeybee, Apis mellifera // J. Insect. Sci. 2011. Vol. 11. N 1. P. 74. Shi Y.Y., Huang Z.Y., Zeng Z.J., Wang Z.L., Wu X.B., Yan W.Y. Diet and cell size both affect queen-worker differentiation through DNA methylation in honey bees (Apis mellifera, Apidae) // PLoS One. 2011. Vol. 6. N 4. e18808. Shi Y.Y., Yan W.Y., Huang Z.Y., Wang Z.L., Wu X.B., Zeng Z.J. Genomewide analysis indicates that queen larvae have lower methylation levels in the honey bee (Apis mellifera) // Naturwissenschaften. 2013. Vol. 100. N 2. P. 193–197. Bonasio R., Li Q., Lian J. et al. Genome-wide and caste-specific DNA methylomes of the ants Camponotus floridanus and Harpegnathos saltator // Curr. Biol. 2012. Vol. 22. N 19. P. 1755–1764. Bonasio R., Zhang G., Ye C. et al. Genomic comparison of the ants Camponotus floridanus and Harpegnathos saltator // Science. 2010. Vol. 329. N 5995. P. 1068–1071. Rothbart S.B., Strahl B.D. Interpreting the language of histone and DNA modifications // Biochim. Biophys. Acta. 2014. Vol. 1839. N 8. P. 627–643. Simola D.F., Ye C., Mutti N.S., Dolezal K., Bonasio R., Liebig J., Reinberg D., Berger S.L. A chromatin link to caste identity in the carpenter ant Camponotus floridanus // Genome Res. 2013. Vol. 23. N 3. P. 486–496. Spannhoff A., Kim Y.K., Raynal N.J., Gharibyan V., Su M.B., Zhou Y.Y., Li J., Castellano S., Sbardella G., Issa J.P., Bedford M.T. Histone deacetylase inhibitor activity in royal jelly might facilitate caste switching in bees // EMBO Rep. 2011. Vol. 12. N. 3. P. 238–243. Weaver D.B., Anzola J.M., Evans J.D., Reid J.G., Reese J.T., Childs K.L., Zdobnov E.M., Samanta M.P., Miller J., Elsik C.G. Computational and transcriptional evidence for microRNAs in the honey bee genome // Genome Biol. 2007. Vol. 8. N 6. P. 97. Guo X., Su S., Skogerboe G., Dai S., Li W., Li Z., Liu F., Ni R., Guo Y., Chen S., Zhang S., Chen R. Recipe for a busy bee: microRNAs in honey bee caste determination // PLoS One. 2013. Vol. 8. N 12. e81661. Corona M., Estrada E., Zurita M. Differential expression of mitochondrial genes between queens and workers during caste determination in the honeybee Apis mellifera // J. Exp. Biol. 1999. Vol. 202. N 8. P. 929–938. Evans J.D., Wheeler D.E. Differential gene expression between developing queens and workers in the honey bee, Apis mellifera // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999. Vol. 96. N 10. P. 5575–5580. Cristino A.S., Nunes F.M., Lobo C.H., Bitondi M.M., Simões Z.L., da Fontoura Costa L., Lattorff H.M., Moritz R.F., Evans J.D., Hartfelder K. Caste development and reproduction: a genome-wide analysis of hallmarks of insect eusociality // Insect Mol. Biol. 2006. Vol. 15. N 5. P. 703–714. Begna D., Fang Y., Feng M., Li J. Mitochondrial proteins differential expression during honeybee (Apis mellifera L.) queen and worker larvae caste determination // J.Proteome Res. 2011. Vol. 10. N 9. P. 4263–4280. Barchuk A.R, dos Santos Cristino A., Kucharski R., da Fontoura Costa L., Simies Z.L.P., Maleszka R. Molecular determinants of caste differentiation in the highly eusocial honeybee Apis mellifera // BMC Dev. Biol. 2007. Vol. 7. N 70. Chen X., Hu Y., Zheng H., Cao L., Niu D., Yu D., Sun Y., Hu S., Hu F. Transcriptome comparison between honey bee queen- and worker-destined larvae // Insect Biochem. Mol. Biol. 2012. Vol. 42. N 9. P. 665–673. Grozinger C.M., Fan Y., Hoover S.E., Winston M.L. Genome-wide analysis reveals differences in brain gene expression patterns associated with caste and reproductive status in honey bees (Apis mellifera) // Mol. Ecol. 2007. Vol. 16. N 22. P. 4837–4848. Azevedo S.V., Caranton O.A., de Oliveira T.L., Hartfelder K. Differential expression of hypoxia pathway genes in honey bee (Apis mellifera L.) caste development // J. Insect Physiol. 2011. Vol. 57. N 1. P. 38–45. Aamodt R.M. Age- and caste-dependent decrease in expression of genes maintaining DNA and RNA quality and mitochondrial integrity in the honeybee wing muscle // Exp. Gerontol. 2009. Vol. 44. N 9. P. 586–593. Pereboom J.J., Jordan W.C., Sumner S., Hammond R.L., Bourke A.F. Differential gene expression in queen-worker caste determination in bumble-bees // Proc. Biol. Sci. 2005. Vol. 272. N 1568. P. 1145–1152. Feldmeyer B., Elsner D., Foitzik S. Gene expression patterns associated with caste and reproductive status in ants: worker-specific genes are more derived than queen-specific ones // Mol. Ecol. 2014. Vol. 23. N 1. P. 151–161. Koch S.I., Groh K., Vogel H., Hansson B.S., Kleineidam C.J., Grosse-Wilde E. Caste-specific expression patterns of immune response and chemosensory related genes in the leaf-cutting ant, Atta vollenweideri // PLoS One. 2013. Vol. 8. N 11. e81518. Gräff J., Jemielity S., Parker J.D., Parker K.M., Keller L. Differential gene expression between adult queens and workers in the ant Lasius niger // Mol. Ecol. 2007. Vol. 16. N 3. P. 675–683. Corona M., Hughes K.A., Weaver D.B., Robinson G.E. Gene expression patterns associated with queen honey bee longevity // Mech. Ageing Dev. 2005. Vol. 126. N 11. P. 1230– 1238. Parker J.D., Parker K.M., Sohal B.H., Sohal R.S., Keller L. Decreased expression of Cu-Zn superoxide dismutase 1 in ants with extreme lifespan // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2004. Vol. 101. N 10. P. 3486–3489. Capella I.C., Hartfelder K. Juvenile hormone effect on DNA synthesis and apoptosis in caste-specific differentiation of the larval honey bee (Apis mellifera L.) ovary // J. Insect Physiol. 1998. Vol. 44. N 5–6. P. 385–391. Wheeler D.E., Buck N., Evans J.D. Expression of insulin pathway genes during the period of caste determination in the honey bee, Apis mellifera // Insect Mol. Biol. 2006. Vol. 15. N 5. P. 597–602. de Azevedo S.V., Hartfelder K. The insulin signaling pathway in honey bee (Apis mellifera) caste development — differential expression of insulin-like peptides and insulin receptors in queen and worker larvae // J. Insect Physiol. 2008. Vol. 54. N 6. P. 1064–1071. Wang Y., Azevedo S.V., Hartfelder K., Amdam G.V. Insulin-like peptides (AmILP1 and AmILP2) differentially affect female caste development in the honey bee (Apis mellifera L.) // J. Exp. Biol. 2013. Vol. 216. N 23. P. 4347–4357. Wolschin F., Mutti N.S., Amdam G.V. Insulin receptor substrate influences female caste development in honeybees // Biol. Lett. 2011. Vol. 7. N 1. P. 112–115. Kamakura M. Royalactin induces queen differentiation in honeybees // Nature. 2011. Vol. 473. N 7348. P. 478–483. Patel A., Fondrk M.K., Kaftanoglu O., Emore C., Hunt G., Frederick K., Amdam G.V. The making of a queen: TOR pathway is a key player in diphenic caste development // PLoS One. 2007. Vol. 2. N 6. e509. Shao X.L., He S.Y., Zhuang X.Y., Fan Y., Li Y.H., Yao Y.G. mRNA expression and DNA methylation in three key genes involved in caste differentiation in female honeybees (Apis mellifera) // Dongwuxue Yanjiu (Zool. Res.). 2014. Vol. 35. N 2. P. 92–98. Mutti N.S., Dolezal A.G., Wolschin F., Mutti J.S., Gill K.S., Amdam G.V. IRS and TOR nutrient-signaling pathways act via juvenile hormone to influence honey bee caste fate // J. Exp. Biol. 2011. Vol. 214. N 23. P. 3977–3984. Wheeler D.E., Buck N.A., Evans J.D. Expression of insulin/insulin-like signalling and TOR pathway genes inhoney bee caste determination // Insect Mol. Biol. 2014. Vol. 23. N 1. P. 113–121. Seehuus S.C., Norberg K., Gimsa U., Krekling T., Amdam G.V. Reproductive protein protects functionally sterile honey bee workers from oxidative stress // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2006. Vol. 103. N 4. P. 962–967. Corona M., Velarde R.A., Remolina S., Moran-Lauter A., Wang Y., Hughes K.A., Robinson G.E. Vitellogenin, juvenile hormone, insulin signaling, and queen honey bee longevity // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2007. Vol. 104. N 17. P. 7128–7133. Vaiserman A. Developmental epigenetic programming of caste-specific differences in social insects: an impact on longevity // Curr. Aging Sci. 2014. Vol. 7. N 3. P. 176–186. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/45 2015-05-17T11:48:50Z jour:MIC driver

МИКРОБНАЯ БИОТЕХНОЛОГИЯ: СТАНОВЛЕНИЕ И СОСТОЯНИЕ Н. С. Егоров . Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-05-17 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/45 10.1234/XXXX-XXXX-2012-1-47-50 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2012); 47-50 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2012); 47-50 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/45/47 Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1510 2025-07-14T13:18:18Z jour:RA driver

Ecto-ATPases, morphometry and heat production activity of erythrocytes of cartilaginous and teleost fishes of the Black Sea Экто-АТФазы, морфометрия и теплопродукционная активность эритроцитов хрящевых и костистых черноморских рыб Yu. A. Silkin M. Yu. Silkin E. N. Silkina S. O. Omelchenko Ю. А. Силкин М. Ю. Силкин Е. Н. Силкина С. О. Омельченко экто-АТФаза temperature erythrocytes cytomorphometry ATP heat production ecto-ATPase экто-АТФаза температура эритроциты цитоморфометрия АТФ теплопродукция экто-АТФаза The activity of ecto-ATPase and the size characteristics of erythrocytes in two species of cartilaginous and ten species of bony fishes, as well as the heat-production activity of the erythrocyte suspension in Scorpaena porcus and Raja clavata were studied. It was shown that the activity of ecto-ATPase of red blood cells (RBC) between cartilaginous fishes differs by 1.5 times and is 3.1 nmol Fn/min/μl RBC in Raja clavata, and 2.1 nmol Fn/min/μl RBC in Dasyatis pastinaca. Erythrocytes of teleost fish are characterized by a more significant variability of ecto-ATPase activity, which differed between its extreme values by more than 60 times (in Scorpaena porcus it was 6.4 nmol Fn/min/μl RBC, in Spicara flexuosa and some other species – 0.1 nmol Fn/min/μl RBC). When comparing the size characteristics of erythrocytes and the values of ecto-ATPase activity, a direct relationship was shown between these indicators. A study of heat production in suspensions of thresher and scorpionfish erythrocytes showed that adding ATP to a suspension of isolated cells (1 mg/ml) significantly increased the temperature in the experimental cell. The erythrocytes of the thresher and scorpionfish demonstrated different heat generation dynamics. Thus, ΔT generated by stingray erythrocytes was almost two times lower than in scorpionfish erythrocytes. The total duration of the heat generation process to the maximum ΔT in the thresher erythrocyte suspension was almost four times shorter than in the thresher. However, the process of temperature reduction in the thresher erythrocyte suspension occurred more than two times slower than in the thresher. The results obtained showed that ecto-ATPases of fish erythrocytes apparently function as a source of local heat generation on the erythrocyte surface and, thus, can be deeply integrated into the functioning of the cell membrane and the entire blood flow as a whole. Изучены активность экто-АТФазы и размерные характеристики эритроцитов у двух видов хрящевых и десяти видов костных рыб, а также теплопродукционная активность суспензии эритроцитов у Scorpaena porcus и Raja clavata. Показано, что активность экто-АТФазы красных клеток крови (red blood cells – RBC) между хрящевыми рыбами различается в 1,5 раза и составляет у Raja clavata 3,1 нмоль Фн / мин / мкл RBC, а у Dasyatis pastinaca – 2,1 нмоль Фн / мин / мкл RBC. Для эритроцитов костистых рыб характерна более значительная изменчивость активности экто-АТФазы, которая между своими крайними значениями различалась более, чем в 60 раз (у Scorpaena porcus она составила 6,4 нмоль Фн / мин / мкл RBC, у Spicara flexuosa и некоторых других видов – 0,1 нмоль Фн / мин / мкл RBC). При сравнении размерных характеристик эритроцитов и величин активности экто-АТФазы была показана прямая связь между этими показателями. Исследование теплопродукции суспензий эритроцитов морской лисицы и скорпены показало, что при добавлении АТФ к суспензии выделенных клеток (1 мг / мл) происходит значительное увеличение температуры в экспериментальной ячейке. Эритроциты морской лисицы и скорпены демонстрировали разную динамику генерации тепла. Так ΔТ, генерируемая эритроцитами скатов, была почти в два раза ниже, чем в эритроцитах скорпены. Общая продолжительность процесса генерации тепла до максимума ΔТ в суспензии эритроцитов морской лисицы была почти в четыре раза короче, чем у скорпены. Однако процесс понижения температуры в суспензии эритроцитов скорпены происходил в два с лишним раза медленнее, чем у морской лисицы. Полученные результаты показали, что экто-АТФазы эритроцитов рыб, по-видимому, несут функцию источника локальной генерации тепла на поверхности эритроцита и, тем самым, могут быть глубоко интегрированы в функционирование мембраны клетки и всего кровотока в целом. Lomonosov Moscow State University, School of Biology The study was carried out within the framework of the research topic “Study of the fundamental characteristics of marine hydrobionts that ensure their functioning in ecosystems and serve as the basis for their rational use and conservation” (No. 124030100100-0). Исследование выполнено в рамках темы НИР «Изучение фундаментальных характеристик морских гидробионтов, обеспечивающих их функционирование в экосистемах и служащих основой их рационального использования и сохранения» (регистрационный номер 124030100100-0). 2025-07-14 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1510 10.55959/MSU0137-0952-16-80-2-8 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 80, № 2 (2025); 119-129 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 80, № 2 (2025); 119-129 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1510/725 Венкстерн Т.В., Энгельгардт В.А. Поверхностнолокализованная аденозин-полифосфатаза ядерных эритроцитов. Докл. Акад. наук СССР. 1955;102(1):133–136. Венкстерн Т.В., Энгельгардт В.А. Распространение экто-аденозилполифосфатазы и характеристика некоторых ее свойств. Биохимия. 1957;22(5):911–916. Bencic D.C., Yates T.J., Ingermann R.L. Ecto – ATPase activity of vertebrate blood cells. Physiol. Zool. 1997;70(6):621–630. González-Alonso J., Olsen D. B., Saltin B. Erythrocyte and the regulation of human skeletal muscle blood flow and oxygen delivery. Role of circulating ATP. Circ. Res. 2002;91(11):1046–1055. Jensen F.B., Agnisola C., Novak I. ATP release and extracellular nucleotidase activity in erythrocytes and coronary circulation of rainbow trout. Comp. Biochem. Physiol. A Mol. Integr. Physiol. 2009;152(3):351–356. Пищенко Е.В. Гематология пресноводных рыб. Новосибирск: Новосиб. Гос. Аграр. Ун-т; 2002. 48 с. Girish V., Vijavalakshmi A. Affordable image analysis using NIH Image/Image. Indian J. Cancer. 2004;41(1):41–47. Acharya G., Mohanty P.K., Comparative cetomorphometry of red blood cells of some fishes. African J. Biol. Sci. 2019;1(1):23–32 Казеннов А.М., Маслова М.Н., Савина Г.В. Сравнительная характеристика свойств Na+, K+- АТФазы эритроцитов человека и карпа Cyprinus carpio. Ж. эвол. биохим. физиол. 1984;20(2):167–173. Казеннов А.М., Маслова М.Н. Особенности активации детергентами Na, K-аденозинтрифосфатазы головного мозга позвоночных. Ж. эвол. биохим. физиол. 1980;16(5):430–436. Chen P.S., Toribara T.Y., Warner H. Microdetermination of phosphorus. Anal. Chem. 1956;28(11):1756–1758. Stolbov A.Y., Mishurov V.G., Shadrin N.V. The macrocalorimetric method in hydrobiology: description of the pilot device. Mar. Ecol. 2009;77(3):94–96. Mann T. Studies on the metabolism of semen. Biochem. J. 1945;39(5):451–458. Rothstein A., Meier R. The relationship of the cell surface to metabolism I Phosphatases in the cell surface of living yeast cells. J. Comp. Cell. Physiol. 1948; 32(1) :77–95. Sprague R.S., Stephenson A.H., Ellsworth M.L. Red not dead: signaling in and from erythrocytes. Trends Endocrinol. Metab. 2007;18(9):350–355. Силкин Ю.А., Силкина Е.Н., Силкин М.Ю. Влияние солей азида фторида, ортованадата и ЭДТА натрия на экто-АТФазную активность эритроцитов скорпены (Scorpaena porcus L.) и морской лисицы (Raja clavata L.). Ж. эвол. биохим. физиол. 2021;57(5):380–391. Glomski C.A., Tamburlin J., Hard R., Chatnani M. The phylogenetic odyssey of erythrocyte IV. The amphibians. Hystol. Hystopathol. 1997;12(1):147–170. Лисничая Е.Н., Ефимов В.Г. Особенности исследования морфологического состава крови рептилий. Науково-технiчний бюллетень НОЦ бiобезпеки та екологiчного контролю ресурсiв АПК. 2014;2(1):1–13. Zimmermann H., Zebisch M., Strater N. Cellular function and molecular structure of ecto-nucleotidases. Purinergic Signal. 2012;8(3):437–502. Yegutkin G.G. Enzymes involved in metabolism of extracellular nucleotides and nucleosides: Functional implications and measurement of activities. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2014;49(6):473–497. Кребс Е.М. Липиды клеточных мембран. Л.: Наука. 1981. 339 с. Забеленский С.А., Чеботарева М.А., Шуколюкова Е.П., Никитина Е.Р., Кривченко А.И. Жирнокислотный состав фосфолипидов эритроцитов крысы при стрессе (длительное плавание). Ж. эвол. биохим. физиол. 2019;55(1):37–42. Wan J., Ristenpart W. D., Stone H.A. Dynamics of shear-induced ATP release from red blood cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008;105(43):16432–16437. Aloni B., Shinitzky M., Livne A. Dynamics of erythrocyte lipids in intact cells, in ghost membranes and in liposomes. Biochim. Biophys. Acta. 1974;348(3):438–441. Katiukhin L. N. About of mechanism of the Fahraeus-Lindquist-effec. J. Blood Disorders Transf. 2014;5(5):211–213. Dickson K.A., Craham J. B. Evolution consequences of endothermy in fishes. Physiol. Biochem. Zool. 2004;77(6):998–1018. Dolton H.R., Jackson A.L., Deavill R., Hall J., Hall G., McManus G.,Perkins M.W., Rolfe R.A., Snelling E.P., Houghton J.D.R., Sims D.W., Payne N.L. Regionally endothermic traits in planktivorous basking sharks Cetorhinus maximus. Endang. Species Res. 2023;51(2): 227–232. Wegner N.C., Snodgrass O.E., Dewar H., Hyde J.R. Whole-body endothermy in a mesopelagic fish, the opah, Lampris guttatus. Science. 2015;348(6236):786–789. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/623 2018-08-22T08:43:07Z jour:BPH driver

POSSIBILITIES OF OPTICAL MONITORING OF PHOSPHORUS STARVATION IN SUSPENSIONS OF THE MICROALGA CHLORELLA VULGARIS IPPAS C-1 (CHLOROPHYCEAE) ВОЗМОЖНОСТИ ОПТИЧЕСКОГО МОНИТОРИНГА ФОСФОРНОГО ГОЛОДАНИЯ В СУСПЕНЗИОННЫХ КУЛЬТУРАХ МИКРОВОДОРОСЛИ CHLORELLA VULGARIS IPPAS C-1 (CHLOROPHYCEAE) A. G. Kuznetsov S. I. Pogosyan I. V. Konyukhov S. G. Vasilieva A. A. Lukyanov V. S. Zotov L. Nedbal A. E. Solovchenko А. Г. Кузнецов С. И. Погосян И. В. Конюхов С. Г. Васильева А. А. Лукьянов В. С. Зотов Л. Недбал А. Е. Соловченко Chlorella vulgaris light scattering phosphorus starvation chlorophyll fluorescence photobioreactor Chlorella vulgaris Chlorella vulgaris светорассеяние фосфорное голодание флуоресценция хлорофилла фотобиореактор Chlorella vulgaris Studies of the impact of inorganic phosphorus (Pi ), an important nutrient, on the growth and physiological parameters of single-celled algae are important for investigations of the dynamics of phytoplankton abundance and productivity in natural ecosystems as well as in industrial systems for the cultivation of microalgae. Difficulties in carrying out such studies are associated with the complex kinetics of Pi uptake by and the ability of microalgae to store phosphorus in their cells. This situation necessitates the efficient methods for express monitoring of microalgal cultures such as the methods based on the registration of optical properties of cells, such as absorption and scattering of light and fluorescence of chlorophyll contained in the cells. Here, we describe the results of monitoring the cultures of a chlorophyte Chlorella vulgaris IPPAS C-1, starving for phosphorus. It was found that both optical (light absorption in the bands of the key pigments–chlorophylls and carotenoids) and luminescent (variable fluorescence of chlorophyll) parameters reflect closely the culture condition. The correction for the contribution of light scattering to the overall extinction of light by microalgal cell suspensions turned to be necessary. At the same time, the light scattering signal is an accurate measure of the total number of suspended particles in the suspension. However, it is difficult to monitor via optical absorption the samples with abundant light-scattering particles lacking the photosynthetic pigments (such as heterotrophic bacteria). For such cultures, the using of variable fluorescence-based parameter Fv/Fm reflecting the maximum photochemical efficiency of the photosystem II is advisable. Исследования влияния обеспеченности неорганическим фосфором (Pi ), важным биогенным элементом, на рост и физиологические параметры одноклеточных водорослей важны для определения динамики численности и продуктивности фитопланктона в природных экосистемах и промышленных системах с целью культивирования этих организмов. Затруднения при проведении таких исследований связаны со сложной кинетикой поглощения Pi клетками и способностью микроводорослей к внутриклеточному запасанию фосфора. В этой связи необходимы эффективные способы экспресс-мониторинга состояния культур микроводорослей. Данным критериям отвечают методы, основанные на регистрации оптических свойств клеток, таких как поглощение и рассеяние света культурами и флуоресценции содержащегося в клетках хлорофилла. В настоящей статье описаны результаты мониторинга культуры зеленой микроводоросли Chlorella vulgaris IPPAS C-1, культивируемой в среде, не содержащей фосфора. Установлено, что и оптические (поглощение света в полосах фотосинтетических пигментов – хлорофиллов и каротиноидов), и люминесцентные (переменная флуоресценция хлорофилла) параметры отражают состояние культуры. При регистрации оптических свойств необходима коррекция вклада светорассеяния в общее ослабление света суспензиями клеток микроводорослей, при этом сам по себе уровень светорассеяния является точной мерой общего количества взвешенных частиц в суспензии. Однако мониторинг культур, содержащих значительное количество светорассеивающих частиц без фотосинтетических пигментов (таких как гетеротрофные бактерии) затруднен. Для подобных культур оптимальным является использование переменной флуоресценции – например, параметра Fv/Fm, отражающего максимальную фотохимическую эффективность фотосистемы II. Lomonosov Moscow State University, School of Biology Минобрнауки 2018-08-22 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/623 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 73, № 3 (2018); 146-152 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 73, № 3 (2018); 146-152 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/623/434 Grossman A.R., Aksoy M. Algae in a phosphorus-limited landscape // Annual plant reviews. Vol. 48. Phosphorus metabolism in plants / Eds. W. Plaxton and H. Lambers. John Wiley & Sons, 2015. P. 337–374. Solovchenko A., Verschoor A.M., Jablonowski N.D., Nedbal L. Phosphorus from wastewater to crops: An alternative path involving microalgae // Biotechnol. Adv. 2016. Vol. 34. N 5. P. 550–564. Schreiber C., Schiedung H., Harrison L., Briese C., Ackermann B., Kant J., Schrey S.D., Hofmann D., Singh D., Ebenhöh O., Amelung W., Schurr U., Mettler-Altmann T., Huber G., Jablonowski N. D., Nedbal L. Evaluating potential of green alga Chlorella vulgaris to accumulate phosphorus and to fertilize nutrient-poor soil substrates for crop plants // J. Appl. Phycol. 2018. DOI 10.1007/s10811-018-1390-9. Cembella A.D., Antia N.J., Harrison P.J. The utilization of inorganic and organic phosphorous compounds as nutrients by eukaryotic microalgae: A multidisciplinary perspective: Part I // Crit. Rev. Microbiol. 1982. Vol. 10. N 4. P. 317–391. Antal T.K., Matorin D.N., Ilyash L.V., Volgusheva A.A., Osipov V.I., Konyuhov I.V., Krendeleva T.E., Rubin A.B. Probing of photosynthetic reactions in four phytoplanktonic algae with a PEA fluorometer // Photosynth. Res. 2009. Vol. 102. N. 1. P. 67–76. Maxwell K., Johnson G. Chlorophyll fluorescence — a practical guide // J. Exp. Bot. 2000. Vol. 51. N 345. P. 659–668. Matorin D.N., Antal T.K., Ostrowska M., Rubin A.B., Ficek D., Majchrowski R. Chlorophyll fluorimetry as a method for studying light absorption by photosynthetic pigments in marine algae // Oceanologia. 2004. Vol. 46. N 4. P. 519–531. Solovchenko A., Gorelova O., Selyakh I., Pogosyan S., Baulina O., Semenova L., Chivkunova O., Voronova E., Konyukhov I., Scherbakov P. A novel CO2-tolerant symbiotic Desmodesmus (Chlorophyceae, Desmodesmaceae): Acclimation to and performance at a high carbon dioxide level // Algal Res. 2015. Vol. 11. P. 399–410. Solovchenko A., Pogosyan S., Chivkunova O., Selyakh I., Semenova L., Voronova E., Scherbakov P., Konyukhov I., Chekanov K., Kirpichnikov M., Lobakova E. Phycoremediation of alcohol distillery wastewater with a novel Chlorella sorokiniana strain cultivated in a photobioreactor monitored on-line via chlorophyll fluorescence // Algal Res. 2014. Vol. 6. Part B. P. 234–241. Solovchenko A., Merzlyak M., Khozin-Goldberg I., Cohen Z., Boussiba S. Coordinated carotenoid and lipid syntheses induced in Parietochloris incisa (Chlorophyta, Trebouxiophyceae) mutant deficient in Δ5 desaturase by nitrogen starvation and high light // J. Phycol. 2010. Vol. 46. N 4. P. 763–772. Rippka R., Deruelles J., Waterbury J. B., Herdman M., Stanier R. Y. Generic assignments, strain histories and properties of pure cultures of cyanobacteria // J. Gen. Microbiol. 1979. Vol. 111. N 1. P. 1–61. Nagul E.A., McKelvie I.D., Worsfold P., Kolev S.D. The molybdenum blue reaction for the determination of orthophosphate revisited: opening the black box // Analyt. Chim. Acta. 2015. Vol. 890. P. 60–82. Merzlyak M.N., Naqvi K.R. On recording the true absorption spectrum and the scattering spectrum of a turbid sample: application to cell suspensions of the cyanobacterium Anabaena variabilis // J. Photochem. Photobiol. B. Biol. 2000. Vol. 58. N 2–3. P. 123–129. Solovchenko A., Khozin-Goldberg I., Cohen Z., Merzlyak M. Carotenoid-to-chlorophyll ratio as a proxy for assay of total fatty acids and arachidonic acid content in the green microalga Parietochloris incisa // J. Appl. Phycol. 2009. Vol. 21. N 3. P. 361–366. Merzlyak M.N., Chivkunova O.B., Maslova I.P., Naqvi K.R., Solovchenko A.E., Klyachko-Gurvich G.L. Light absorption and scattering by cell suspensions of some cyanobacteria and microalgae // Russ. J. Plant Physiol. 2008. Vol. 55. N 3. P. 464–470. Aitchison P., Butt V. The relation between the synthesis of inorganic polyphosphate and phosphate uptake by Chlorella vulgaris // J. Exp. Bot. 1973. Vol. 24. N 3. P. 497–510. Ruban A. V. Non-photochemical chlorophyll fluorescence quenching: mechanism and effectiveness in protection against photodamage // Plant Physiol. 2016. Vol. 170. N 4. P. 1903–1916. Horton P. Developments in research on non-photochemical fluorescence quenching: Emergence of key ideas, theories and experimental approaches // Non-photochemical quenching and energy dissipation in plants, algae and cyanobacteria / Eds. B. Demmig-Adams, G. Garab,W. Adams III, and Govindjee. Dordrecht: Springer Netherlands, 2014. P. 73–95. Shibata K. Dual wavelength scanning of leaves and tissues with opal glass // Biochim. Biophys. Acta. 1973. Vol. 304. N 2. P. 249–259. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/743 2019-07-04T12:55:13Z jour:RA driver

The effect of a single heating treatment on laboratory mice behaviour, adult neurogenesis and the expression of heatshock protein HSP70 Влияние однократного прогревания на поведение, нейрогенез взрослого мозга и экспрессию белка теплового шока HSP-70 у лабораторных мышей O. V. Perepelkina N. A. Ogienko I. G. Lilp D. G. Garbuz A. V. Revishchin G. V. Pavlova I. I. Poletaeva О. В. Перепелкина Н. А. Огиенко И. Г. Лильп Д. Г. Гарбуз А. В. Ревищин Г. В. Павлова И. И. Полетаева мыши-гибриды F1 behavioral activation cognitive ability elementary logic task adult neurogenesis heat shock proteins hybrid F1 mice мыши-гибриды F1 активация поведения когнитивные способности элементарная логическая задача нейрогенез взрослого мозга белки теплового шока мыши-гибриды F1 Male hybrid mice (F1 CBA x C57BL/6J) were kept for 1.5 h at the temperature 39,5°С. In cognitive tests (extrapolation and puzzle-box elementary logic task solution) mice of experimental groups (after being kept in elevated temperature environment) solved the tasks more quickly and more successfully, while their activity the «small open field» (in which no stress-inducing stimuli were present) and in Porsolt test (unescapable swimming) was higher than in control mice. tests they were also more active. In separate experiments the temporary impairment in the adult neurogenesis (the decrease of new cells numbers detected immunо-histochemically by the marker Ki67) after elevated temperature exposure was demonstrated in both subgranular area of dentate fascia and in subventricular proliferative zone of the forebrain. The heating treatment was accompanied by the increase of HSP70 expression at the time point 3 h after the treatment but which was not different from the controls after 24 h. Мыши-самцы (гибриды F1 CBA x C57BL/6J) содержались в течение 1,5 ч при температуре 39,5°С. В тестах на когнитивные способности (решение элементарных логических задач — на способность к экстраполяции направления движения и на поиск входа в укрытие) мыши опытных групп (после воздействия повышенной температуры) решали задачу быстрее и эффективнее, а общая активность в тесте «малое открытое поле» (в отсутствие стрессогенной обстановки) и в тесте Порсолта (неизбегаемое плавание) была выше, чем у контрольных мышей. В отдельных экспериментах показано, что нагревание вызывает временное ухудшение нейрогенеза (т.е. уменьшение числа новых клеток по иммуногистохимическому маркеру Ki67) как в пролиферативной зоне гиппокампа (субгранулярный слой зубчатой фасции), так и в субвентрикулярной зоне переднего мозга. Прогревание также вызывало повышение экспрессии белка теплового шока HSP70 через 3 ч после воздействия, но через 24 ч отличий от контроля не было. Lomonosov Moscow State University, School of Biology Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (проект № 17-29-01001), а также в рамках темы госрегистрации «АААА-А16-116021660055-1» 2019-07-04 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/743 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 74, № 2 (2019); 107-114 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 74, № 2 (2019); 107-114 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/743/466 Пастухов Ю.Ф., Екимова И.В. Молекулярные, клеточные и протективные функции белка теплового шока 70 кДа // Нейронауки. 2005. Т.2. № 2. С. 3-25. De Maio A. Extracellular HSP70: export and function // Curr. Protein Pept. Sci. 2014. Vol. 15. N 3. P. 225-231. Bozaykut P, Ozer N.K., Karademir B. Regulation of protein turnover by heat shock proteins // Free Radic. Biol. Med. 2014. Vol. 77. P. 195-209. Ren M, Leng Y., Jeong M, Leeds P.R., Chuang D.M. Valproic acid reduces brain damage induced by transient focal cerebral ischemia in rats: potential roles of histone deacetylase inhibition and heat shock protein induction // J. Neurochem. 2004. Vol. 89. N 6. P. 1358-1367. Santoro M.G. Heat shock factors and the control of the stress response // Biochem. Pharmacol. 2000. Vol. 59. N 1. P. 55-63. Zlatkovic J., Bernardi R.E., Filipovic D. Protective effect of Hsp70i against chronic social isolation stress in the rat hippocampus // J. Neural. Transm. (Vienna). 2014. Vol. 121. N 1. P. 3-14. Duhan V., Joshi N, Nagarajan P, Upadhyay P. Protocol for long duration whole body hyperthermia in mice // J. Vis. Exp. 2012. Vol. 25. N 66: e3801. Bobkova N, Guzhova I., Margulis B., Nesterova 1., Medvedinskaya N, Samokhin A., Alexandrova 1., Garbuz D, Nudler E, Evgen’ev M. Dynamics of endogenous HSP70 synthesis in the brain of olfactory bulbectomized mice // Cell Stress Chaperon. 2013. Vol. 18. N 1. P. 109-118. Evgen’ev M.B., Krasnov G.S., Nesterova I.V., Garbuz D.G., Karpov V.L., Morozov A.V., Snezhkina A. V., Samokhin A.N., Sergeev A., Kulikov A.M., Bobkova N. V. Molecular mechanisms underlying neuroprotective effect of intranasal administration of human hsp70 in mouse model of Alzheimer’s disease // J. Alzheimers. Dis. 2017. Vol. 59. N 4. P. 14151426. Chen S, Brown I.R. Neuronal expression of constitutive heat shock proteins: implications for neurodegenerative diseases // Cell Stress Chaperon. 2007. Vol. 12. N 1. P. 51-58. Zhu C, Wu Y., Chen S, Yu M., Zeng Y, You X., Xiao J., Wang S. Protective immune responses in mice induced by intramuscular and intranasal immunization with a Mycoplasma pneumoniae P1C DNA vaccine // Can. J. Microbiol. 2012. Vol. 58. N 5. P. 644-652. Wang Y.S., Liu S.J., Huang S.C., Chang C.C, Huang Y.C., Fong W.L., Chi M.S., Chi K.H. Recombinant heat shock protein 70 in combination with radiotherapy as a source of tumor antigens to improve dendritic cell immunotherapy // Front. Oncol. 2012. Vol. 2: 149. Ohnishi K., Matsumoto H., Takahashi A., Wang X., Ohnishi T. Heat shock transcription factor, HSF, is activated by ultraviolet irradiation // Photochem. Photobiol. 1996. Vol. 64. N 6. P. 949-952. Liu F.F., Miller N., Levin W., Zanke B., Cooper B. , Henry M., Sherar M.D., Pintilie M., Hunt J.W., Hill R.P. The potential role of HSP70 as an indicator of response to radiation and hyperthermia treatments for recurrent breast cancer // Int. J. Hyperthermia. 1996. Vol. 12. N 2. P. 197-208. Lee H.J., Lee Y.J., Kwon H.C., Bae S., Kim S.H., Min J.J., Cho C.K., Lee Y.S. Radioprotective effect of heat shock protein 25 on submandibular glands of rats // Am. J. Pathol. 2006. Vol. 169. N. 5. P. 1601-1607. Schildkopf P., Frey B, Ott O.J., Rubner Y., Multhoff G., Sauer R., Fietkau R., Gaipl U.S. Radiation combined with hyperthermia induces HSP70-dependent maturation of dendritic cells and release of pro-inflammatory cytokines by dendritic cells and macrophages // Radiother. Oncol. 2011. Vol. 101. N 1. P. 109-115. Fedotova I.B., Nikolaev G.M., Kostyna Z.A., Poletaeva I.I. Remote effects of short-term neonatal hyperthermia in Krushinsky-Molodkina rats prone to audiogenic seizures strain // Dokl. Biol. Sci. 2017. Vol. 472. N 1. P. 1-3. Крушинский Л.В. Биологические основы рассудочной деятельности / М.: Изд. МГУ, 1977. 272 с. Poletaeva I.I., Popova N.V., Romanova L.G. Genetic aspects of animal reasoning // Behav. Genet. 1993. Vol. 23. N 5. P. 467-475. Perepelkina O.V., Golibrodo V.A., Lilp I.G., Poletaeva I.I. Selection of mice for high scores of elementary logical task solution // Dokl. Biol. Sci. 2015. Vol. 460. N 1. P. 52-56. Galsworthy M.J., Paya-Cano J.L., Liu L., Monleon S., Gregoryan G., Fernandes C., Schalkwyk L.C., Plomin R. Assessing reliability, heritability and general cognitive ability in a battery of cognitive tasks for laboratory mice // Behav. Genet. 2005. Vol. 35. N 5. P. 675-692. Ben Abdallah N.M.-B., Fuss J., Trusel M., Galsworthy M.J., Bobsin K., Colacicco G., Deacon R.M., Riva M.A., Kellendonk C., Sprengel R., Lipp H.P., Gass P. The puzzle box as a simple and efficient behavioral test for exploring impairments of general cognition and executive functions in mouse models of schizophrenia // Exp. Neurol. 2011. Vol. 227. N 1. P. 42-52. Porsolt R.D. Animal model of depression // Biomedicine. 1979. Vol. 30. N 3. P. 139-140. Zucca P., Milos N., Vallortigara G. Piagetian object permanence and its development in Eurasian jays (Garrulus glandarius) // Anim. Cogn. 2007. Vol. 10. N 2. P. 243-258. Timoshenko T.V., Perepelkina O.V., Markina N.V., Revischin A.V., Pavlova G.V., Poletaeva I.I., Sukhih G.T. Audiogenic epilepsy in mice with different genotypes after neonatal treatments enhancing neurogenesis in dentate gyrus // Bull. Exp. Biol. Med. 2009. Vol. 147. N 4. P. 458-461. Cleveland D.W., Fischer S.G., Kirschner M.W., Laemmli U.K. Peptide mapping by limited proteolysis in sodium dodecyl sulfate and analysis by gel electrophoresis // J. Biol. Chem. 1977. Vol. 252. N 3. P. 1102-1106. Schneider C.A., Rasband W.S., Eliceiri K.W. NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis // Nat. Methods. 2012. Vol. 9. N 7. P. 671-675. Lipp H.-P. Evolutionary shaping of adult hippocampal neurogenesis in mammals-cognitive gain or developmental priming of personality traits? // Front. Neurosci. 2017. Vol. 11: 420. Vilar M., Mira H. Regulation of neurogenesis by neurotrophins during adulthood: expected and unexpected roles // Front Neurosci. 2016. Vol. 10: 26. Rossi C, Angelucci A., Costantin L, Braschi C, Mazzantini M., Babbini F, Fabbri M.E., Tessarollo L, Maffei L, Berardi N, Caleo M. Brain-derived neurotrophic factor (BDNF) is required for the enhancement of hippocampal neurogenesis following environmental enrichment // Eur. J. Neurosci. 2006. Vol. 24. N 7. P. 1850-1856. Hashimoto K., Tomitaka S, Bi Y, Narita N, Minabe Y., Iyo M. Rolipram, a selective phosphodiesterase type-IV inhibitor, prevents induction of heat shock protein HSP-70 and hsp-70 mRNA in rat retrosplenial cortex by the NMDA receptor antagonist dizocilpine // Eur. J. Neurosci. 1997. Vol. 9. N 9. P. 1891-1901. Wetsel W.C. Hyperthermic effects on behavior // Int. J. Hyperthermia. 2011. Vol. 7. N 4. P. 353-373. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/186 2015-07-23T18:32:57Z jour:%D0%A1%D0%A2 driver

DIVERSITY AND PHYLOGENY OF CHLOROPLAST GENOMES IN D-GENOME AEGILOPS L. GROUP BASED ON CPSSR-DATE ПОЛИМОРФИЗМ И ФИЛОГЕНИЯ D-ГЕНОМНЫХ ВИДОВ AEGILOPS L. ПО РЕЗУЛЬТАТАМ АНАЛИЗА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ ЛОКУСОВ ХЛОРОПЛАСТНОГО ГЕНОМА S. V. Goryunova N. N. Chikida E. D. Badaeva V. A. Pukhalskiy С. В. Горюнова Н. Н. Чикида Е. Д. Бадаева В. А. Пухальский Aegilops. polyploids phylogeny Aegilops. Aegilops. полиплоиды филогения Aegilops. 14 chloroplast microsatellite markers were used for analysis of diversity and phylogenetic rela­tionships of chloroplast genomes of 71 accessions of six D-genome Aegilops species. The highest intraspecies variation was observed for Ae. tauschii. The highes haplotype diversity among polyploid species was revealed for Ae. ventricosa (DN). All haplotypes of Ae. ventricosa were remarkably dif­fer from haplotypes of Ae. tauschii. All accessions of Ae. cylindrica analyzed had closely related haplotypes similar with haplotypes of Ae. tauschii.   14 хлоропластных микросателлитных маркеров использовано для анализа изменчивости и филогении цитоплазматического генома у 71 представителя 6 видов эгилопса с D-гено- мом. Наибольшее внутривидовое разнообразие выявлено у диплоидного вида Ae. tauschii. Среди полиплоидных видов наибольшая внутривидовая изменчивость показана для вида Ae. ventricosa. Гаплотипы Ae. ventricosa существенно отличаются от гаплотипов Ae. tauschii. Проанализированные образцы Ae. cylindrica имеют сходные гаплотипы, близкие гаплотипам Ae. tauschii. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-23 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/186 10.1234/XXXX-XXXX-2010-4-21-24 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 4 (2010); 21-24 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 4 (2010); 21-24 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2010-4 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/186/185 Кочиева Е.З., Супрунова Т.П. Идентификация межи внутрисортового полиморфизма у томатов // Генетика. 1999. Т. 35. № 10. С. 1386-1389. Ishii T., Mori N, Ogihara F.Evaluation of allelic diversity at chloroplast microsatellite loci among common wheat and its ancestral species // Theor. Appl. Genetic. 2001. Vol. 103. P. 896-904. Nei M. Molecular evolutionary genetics. N.Y.: Columbia Univ. Press, 1987. 512 p. Badaeva E.D., Amosova A.V., Muravenko O.V., Sama- tadze T.E., Chikida N.N., Zelenin A.V., Friebe B, Gill B.S. Genome differentiation in Aegilops. Evolution of the D-geno- me cluster // Plant Systematics and Evolution. 2002. Vol. 231. P. 163-190. Tsunewaki K. Plasmon analysis in the Triticum-Aegi- lops complex// Breeding Science. 2009. Vol. 59. P. 455—470. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1258 2023-11-21T07:19:58Z jour:RA driver

Evaluation of the primary reactions of photosynthesis in microalgae single cell by microfluorimetric method Оценка первичных реакций фотосинтеза в индивидуальных клетках микроводорослей микрофлуориметрическим методом А. А. Volgusheva I. V. Konyukhov T. K. Antal А. А. Волгушева И. В. Конюхов Т. К. Антал микроводоросли OJIP transient JIP-test chlorophyll fluorescence microfluorimetry microalgae микроводоросли OJIP-кривые JIP-тест флуоресценция хлорофилла микрофлуориметрия микроводоросли High-resolution chlorophyll fluorescence light induction curves (OJIP transients) are widely used to assess the primary photosynthetic responses of phototrophic microorganisms. Chlorophyll fluorescence measuring methods coupled with microscopy techniques provide a promising opportunity to measure OJIP transients on individual algal cells, allowing scientists to investigate stress adaptation mechanisms related to reorganization of microalgae population or phytoplankton community. In this work, we first characterized the OJIP transients measured on individual algae cells using the original microfluorimeter and compared them with OJIP transients recorded in microalgae suspensions. Based on the results of the study, we proposed a method for analyzing OJIP curves of individual microalgae cells as well as ways to further improve microfluorimeters. Регистрация кривых световой индукции флуоресценции хлорофилла высокого разрешения (т.н. OJIP-кривых) широко используется для оценки первичных реакций фотосинтеза фототрофных организмов. Современные флуоресцентные методы в совокупности с методами микроскопии предоставляют перспективную возможность регистрации OJIP-кривых на индивидуальных водорослевых клетках, что позволяет исследовать механизмы адаптации микроводорослей к стрессовым воздействиям, сопровождающиеся реорганизацией структуры популяции. В данной работе мы впервые охарактеризовали OJIP-кривые, полученные на индивидуальных водорослевых клетках с помощью оригинального микрофлуориметра, и сравнили их с кривыми, снятыми традиционно в суспензиях микроводорослей. По результатам исследования предложены метод анализа OJIP-кривых индивидуальных клеток микроводорослей, а также пути дальнейшего улучшения микрофлуориметрического метода. Lomonosov Moscow State University, School of Biology The research was funded by Russian Science Foundation, project number 23-24-00353. Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда (проект №23-24- 00353). 2023-11-20 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1258 10.55959/MSU0137-0952-16-78-3-4 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 78, № 3 (2023); 170-177 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 78, № 3 (2023); 170-177 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1258/630 Bender M.L., Grande K.D., Johnson K.M., Marra J.F., Williams P.J., Sieburth J.M., Pilson M.E., Langdon C., Hitchcock G.L., Orchardo J., Hunt C.P., Donaghay P.L., Heinemann K. A comparison of four methods for determining planktonic community production 1. Limnol. Oceanogr. 1987;32(5):1085–1098. Kelly C.A., Fee E., Ramlal P.S., Rudd J.W.M., Hesslein R.H., Anema C., and Schindler E.U. Natural variability of carbon dioxide and net epilimnetic production in the surface waters of boreal lakes of different sizes. Limnol. Oceanogr. 2001;46(5):1054–1064. del Giorgio P.A., Williams P.J. Respiration in aquatic ecosystems: history and background. Respiration in Aquatic Ecosystems. Eds. P.A. del Giorgio and P.J. Williams. N.Y.: Oxford Univ. Press; 2023:1–17. Маторин Д.Н., Горячев С.Н. Флуоресценция хлорофилла микроводорослей в биотестировании загрязнений. М.: Альтекс; 2017. 142 с. Погосян С.И., Конюхов И.В., Рубин А.Б. Проблемы экологической биофизики. М. – Ижевск: АНО Ижевский институт компьютерных исследований; 2017. 270 с. Schreiber U. Pulse-Amplitude-Modulation (PAM) fluorometry and saturation pulse method: An overview. Chlorophyll a fluorescence. A signature of photosynthesis. Advances in photosynthesis and respiration, vol. 19. Eds. G.C. Papageorgiou and Govindjee. Berlin.: Springer; 2004:279–319. Papageorgiou G.C., Tsimilli-Michael M., Stamatakis K. The fast and slow kinetics of chlorophyll a fluorescence induction in plants, algae and cyanobacteria: a viewpoint. Photosynth. Res. 2007;94(2–3):275–290. Stirbet A., Govindjee Chlorophyll a fluorescence induction: a personal perspective of the thermal phase, the J–I–P rise. Photosynth. Res. 2012; 113(1–3):15–61. Lazár D. The polyphasic chlorophyll a fluorescence rise measured under high intensity of exciting light. Funct. Plant Biol. 2006; 33(1):9–30. Schansker G., Tóth S.Z., Kovács L., Holzwarth A.R., Garab G. Evidence for a fluorescence yield change driven by a light-induced conformational change within photosystem II during the fast chlorophyll a fluorescence rise. Biochim. Biophys. Acta. 2011;1807(9):1032–1043. Vredenberg W.J., Bulychev A. Photoelectric effects on chlorophyll fluorescence of photosystem II in vivo. Kinetics in the absence and presence of valinomycin. Bioelectrochemistry. 2003;60(1–2):87–95. Sipka G., Magyar M., Mezzetti A., Akhtar P., Zhu Q., Xiao Y., Han G., Santabarbara S., Shen J.-R., Lambrev P.H., Garab G. Light-adapted charge-separated state of photosystem II: Structural and functional dynamics of the closed reaction center. Plant Cell. 2021;33(4):1286–1302. Murchie E.H., Lawson T. Chlorophyll fluorescence analysis: a guide to good practice and understanding some new applications. J Exp Bot. 2013;64(13):3983–98. Kuznetsov A.G., Konyukhov I.V., Pogosyan S.I., Rubin A.B. Microfluorimeter for studying the state of photosynthetic apparatus of individual cells of microalgae. Oceanology. 2021;61(6):1055–1063. Volgusheva A.A., Todorenko D.A., Konyukhov I.V., Voronova E.N., Pogosyan S.I., Plyusnina T.Y., Khruschev S.S., Antal T.K. Acclimation response of green microalgae Chlorella sorokiniana to 2,3’,4,4’,6-pentachlorobiphenyl. Photochem. Photobiol. 2022; 99(4):1106–1114. Strasser R.J., Tsimilli-Michael M., Srivastava A. Analysis of the chlorophyll а fluorescence transient. Chlorophyll a fluorescence. A signature of photosynthesis. Advances in photosynthesis and respiration, vol. 19. Eds. G.C. Papageorgiou and Govindjee. Dordrecht.: Springer; 2004:321–362. Rippka R., Deruelles J., Waterbury J., Herdman M., Stanier R. Generic assignments, strain histories and properties of pure cultures of cyanobacteria. J. Gen. Microbiol. 1979; 111(1):1–61. Harris E.H. The Chlamydomonas sourcebook: A comprehensive guide to biology and laboratory use. San Diego: Academic Press; 1989. 780 pp. Antal T.K., Osipov V., Matorin D.N., Rubin A.B. Membrane potential is involved in regulation of photosynthetic reactions in the marine diatom Thalassiosira weissflogii. J. Photochem. Photobiol. B. 2011;102(2):169–173. Vanharanta M., Elovaara S., Franklin D.J., Spilling K., Tamelander T. Viability of picoand nanophytoplankton in the Baltic Sea during spring. Aquat. Ecol. 2020;54:119–135. Swoczyna T., Kalaji H.M., Bussotti F., Mojski J., Pollastrini M. Environmental stress – what can we learn from chlorophyll a fluorescence analysis in woody plants? A review. Front. Plant Sci. 2022;13:1048582. Kalaji H.M., Jajoo A., Oukarroum A., Brestic M., Zivcak M., Samborska I., Cetner M.D., I. Lukasik, Goltsev V. and Ladle R.J. Chlorophyll a fluorescence as a tool to monitor physiological status of plants under abiotic stress conditions. Acta Physiol Plant. 2016; 38(4):102. Sasi S., Venkatesh J., Daneshi R.F., Gururani M.A. Photosystem II extrinsic proteins and their putative role in abiotic stress tolerance in higher plants. Plants. 2018;7(4):100. Behrenfeld M.J., Milligan A.J. Photophysiological expressions of iron stress in phytoplankton. Ann. Rev. Mar. Sci. 2013;5:217–246. Van de Waal D.B., Litchman E. Multiple global change stressor effects on phytoplankton nutrient acquisition in a future ocean. Philos. Trans R Soc. Lond. B Biol. Sci. 2020;375(1798):20190706. Antal T.K., Krendeleva T.E., Tyystjärvi E. Multiple regulatory mechanisms in the chloroplast of green algae: relation to hydrogen production. Photosynth. Res. 2015;125(3):357–381. Петрова Е.В., Кукарских Г.П., Кренделева Т., Антал, Т.К. О механизмах и роли фотосинтетического образования водорода у зеленых микроводорослей. Микробиол. 2020;89(3):259–275. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/326 2016-05-23T19:13:33Z jour:METH driver

SCREENING OF CULTURE MEDIA WITH DIFFERENT NUTRIENT CONTENT FOR CULTIVATION OF MICROALGAE ASSOCIATED WITH WHITE SEA BENTHIC INVERTEBRATES СКРИНИНГ СРЕД С РАЗЛИЧНЫМ СОДЕРЖАНИЕМ БИОГЕННЫХ ЭЛЕМЕНТОВ ДЛЯ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ МИКРОВОДОРОСЛЕЙ, АССОЦИИРОВАННЫХ С БЕСПОЗВОНОЧНЫМИ БЕЛОГО МОРЯ E. S. Lobakova I. O. Selyakh L. R. Semenova O. B. Chivkunova P. N. Scherbakov A. E. Solovchenko Е. С. Лобакова И. О. Селях Л. Р. Семенова О. Б. Чивкунова П. Н. Щербаков А. Е. Соловченко биогенные элементы biomass accumulation testing cultural medium symbiotic microalgae cultivation biogenic elements. биогенные элементы накопление биомассы тестирование сред симбиотические микроводоросли культивирование биогенные элементы The growth and biomass accumulation of three microalgal strains of Desmodesmus (Scenedesmaceae, Chlorophyceae), 1Рm66В, 2Cl66E, 3Dp86Е-1, isolated from White Sea benthic invertebrates were studied under conditions of batch culture in different standard (BG-11, Prat, Goldberg, Gromov, Tamiya, artificial sea water) and modified media. Culture condition and biomass accumulation were recorded as well as the uptake of nitrate and phosphate. Vigorous growth of the microalgae brought about a significant alkalization of the culture medium to pH 10. The most significant biomass accumulation was recorded in BG-11 (the complete medium and one with addition of artificial sea water), Tamiya and Prat media. Addition of the sea water did not affect the growth of Desmodesmus sp. in the nitrate-containing media although that maintained the growth of the microalgae in the nitrogen-lacking media without cell aggregation. The obtained results suggest the suitability of BG-11 medium for isolation and cultivation of both symbiotic and free-living microalgae. The Prat medium is more suitable for maintaining the microalgal strains in collection. Оценивали способность к росту и накоплению биомассы трех выделенных из ассоциаций с морскими донными беспозвоночными животными штаммов Desmodesmus sp. (Scenedesmaceae, Chlorophyceae) — 1Рm66В, 2Cl66E, 3Dp86Е-1 — в условиях периодического культивирования на жидких минеральных питательных средах (BG-11, среда Прата, Гольдберга, Громова, Тамия, искусственная морская вода) стандартного и модифицированного состава. Регистрировали визуальные показатели состояния культур, накопление биомассы, а также остаточное количество нитратного азота и фосфора. Интенсивный рост культур сопровождался защелачиванием среды до pH 10,0. Наибольший прирост биомассы отмечен на средах BG-11 (полной и с добавлением морской воды), Тамия, а также на среде Прата. Добавление искусственной морской воды не влияло на накопление биомассы Desmodesmus sp. в средах, содержащих связанный азот, а в отсутствие азота поддерживало рост, не вызывая агрегации клеток. По всем исследованным показателям среда BG-11 признана универсальной (пригодной для культивирования как симбиотических, так и свободноживущих микроводорослей). Среда Прата оптимальна для поддержания штаммов в коллекции. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2016-05-23 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/326 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 2 (2016); 43-48 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 2 (2016); 43-48 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/326/311 Соловченко А.Е., Лобакова Е.С., Барский Е.Л., Саванина Я.В., Дольникова Г.А., Лукьянов А.А., Кирпичников М.П. Экологические фотобиотехнологии для очистки сточных вод // Биотехнология. 2011. Т. 6. С. 70–88. Borowitzka M.A., Borowitzka L.J., Kessly D. Effects of salinity increase on carotenoid accumulation in the green alga Dunaliella salina // J. Appl. Phycol. 1990. Vol. 2. N 2. P. 111–119. Spolaore P., Joannis-Cassa C., Duran E., Isambert A. Commercial applications of microalgae // J. Biosci. Bioeng. 2006. Vol. 101. N 2. P. 87–96. Hill R. Microbes from marine sponges: a treasure trove of biodiversity for natural 1 products discovery // Microbial diversity and bioprospecting / Eds. A.T. Bull. Washington, DC: ASM Press, 2006. P. 177–190. Gorelova O.A., Kosevich I.A,. Baulina O.I., Fedorenko T.A., Torshkhoeva A.Z., Lobakova E.S. Associations between the White sea invertebrates and oxygen-evolving phototrophic microorganisms // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2009. Vol. 64. N 1. P. 16–22. Gorelova O.A., Baulina O.I., Solovchenko A.E., Fedorenko T.A., Kravtsova T.R., Chivkunova O.B., Koksharova O.A., Lobakova E.S. Green microalgae isolated from associations with white sea invertebrates // Microbiology. 2012. Vol. 81. N 4. P. 505–507. Пятаева С.В., Лобакова Е.С., Косевич И.А. Цианобактерии — эндосимбионты колониальных гидроидных // Вестн. Моск. ун-та. Сер. 16. Биология. 2006. № 4. C. 39–42. Gorelova O., Baulina O., Solovchenko A., Chekanov K., Chivkunova O., Fedorenko T., Lobakova E. Similarity and diversity of the Desmodesmus spp. microalgae isolated from associations with White Sea invertebrates // Protoplasma. 2015. Vol. 252. N 2. P. 489–503. Stanier R., Kunisawa R., Mandel M., Cohen-Bazire G. Purification and properties of unicellular blue-green algae (order Chroococcales) // Bacteriol. Rev. 1971. Vol. 35. N 2. P. 171–205. Prát S. Algarum, Hepaticarum, Muscorumque in culturis collectio // Preslia. 1948. Vol. 22–23. P. 1–12. Кабанова Ю.Г. Органический фосфор как источник питания фитопланктона: Автореф. дис. … канд. биол. наук. М., 1958. 13 c. Громов Б.В., Титова Н.Н. Коллекция культур водорослей лаборатории микробиологии Биологического института Ленинградского университета // Культивирование коллекционных штаммов водорослей / Под ред. Б.В. Громова. Л.: ЛГУ, 1983. С. 3–27. Tamiya H. Mass culture of algae // Annu. Rev. Plant Physiol. 1957. Vol. 8. P. 309–334. Reed R. H., Stewart W.D.P. Evidence for turgorsensitive K+ influx in the cyanobacteria Anabaena variabilis ATCC 29413 and Synechocystis PCC 6714 // Biochim. Biophys. Acta — Biomembranes. 1985. Vol. 812. N 1. P. 15–162. Stanier R., Cohen-Bazire G. Phototrophic prokaryotes: the cyanobacteria // Annu. Rev. Microbiol. 1977. Vol. 31. P. 225–274. Guschina I.A., Harwood J.L. Algal lipids and effect of the environment on their biochemistry // Lipids in Aquatic Ecosystems / Eds. M. Kainz and M. Brett. Dordrecht: Springer, 2009. P. 1–24. Solovchenko A.E.,Chivkunova O.B.,Semenova L.R., Selyakh I.O., Shcherbakov P.N., Karpova E.A., Lobakova E.S. Stress-induced changes in pigment and fatty acid content in the microalga Desmodesmus sp. isolated from a White Sea hydroid // Rus. J. Plant Physiol. 2013. Vol. 60. N 3. Р. 313–321. Solovchenko A., Gorelova O., Baulina O., Selyakh I., Semenova L., Chivkunova O., Scherbakov P., Lobakova E. Physiological plasticity of symbiotic Desmodesmus (Chlorophyceae) isolated from taxonomically distant white sea invertibrates // Rus. J. Plant Physiol. 2015. Vol. 62. N 5. P. 653–663. Chekanov K., Lobakova E., Selyakh I., Semenova L., Sidorov R., Solovchenko A. Accumulation of astaxanthin by a new Haematococcus pluvialis strain BM1 from the White Sea coastal rocks (Russia) // Mar. Drugs. 2014. Vol. 12. N 8. P. 4504–4520. Solovchenko A., Pogosyan S., Chivkunova O., Selyakh I., Semenova L., Voronova E., Scherbakov P., Konyukhov I., Chekanov K., Kirpichnikov M., Lobakova E. Phycoremediation of alcohol distillery wastewater with a novel Chlorella sorokiniana strain cultivated in a photobioreactor monitored on-line via chlorophyll fluorescence // Algal Res. 2014. Vol. 6. Part B. P. 234–241. Исмагулова Т.Т., Шебанова А.С., Баулина О.И., Горелова О.А., Чеканов К.А., Лобакова Е.С. Анализ элементного состава вакуолярных включений зеленых микроводорослей методом энергодисперсионной рентгеновской спектроскопии // Всероссийский симпозиум с международным участием “Современные проблемы физиологии, экологии и биотехнологии микроорганизмов” (24–27 декабря 2014 г.). М.: Макс Пресс, 2014. С. 107. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/367 2016-10-09T19:09:03Z jour:%D0%A4%D0%98%D0%97 driver

СИММЕТРИЯ, ЭНТРОПИЯ, ПОЭЗИЯ СИММЕТРИЯ, ЭНТРОПИЯ, ПОЭЗИЯ M. V. Gusev A. F. Lebedeva Yu. N. Korolev М. В. Гусев А. Ф. Лебедева Ю. Н. Королёв Not available Not available Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2016-10-08 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/367 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2006); 43-50 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2006); 43-50 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/367/345 Анохин П.К. 1975. Очерки по физиологии функциональных систем. М. Вернадский В.И. 1994. Живое вещество и биосфера. М. Гусев М.В., Калабеков А.Л., Королев Ю.Н. 2001. Энтропийный подход в экспериментальной оценке живых систем // Сложные системы: проблемы, исследования, идеи, перспективы. М. Евин И.А. 2004. Искусство и синергетика. М. Заличев Н.Н. 1995. Энтропия информации и сущность жизни. М. Князева Е.Н. 1995. Одиссея научного разума. Синергетическое видение научного прогресса. М. Курдюмов С.П., Малинецкий Г.Г. 1983. Синергетика — теория самоорганизации: идеи, методы, перспективы. М. Пригожин И.Р. 1980. Время, структура и флуктуации (нобелевская лекция) // Усп. физ. наук. 131. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/65 2015-05-18T11:36:56Z jour:FF driver

STIPA UCRAINICA AND S. ZALESSKII (GRAMINEAE): MORPHOLOGICAL AND AREOLOGICAL COMPARISON КОВЫЛИ УКРАИНСКИЙ И ЗАЛЕССКОГО: МОРФОЛОГИЧЕСКОЕ И АРЕАЛОГИЧЕСКОЕ СРАВНЕНИЕ Yu. O. Kopylov-Guskov Ю. О. Копылов-Гуськов морфология S. zalesskii taxonomy morphology. морфология S. zalesskii систематика морфология Feather grasses of Stipa dasyphylla group always were a problem group for taxonomy. In this research we performed a critical analysis of diagnostic characters are used nowadays, and attempted to find new morphological characters which could make a discrimination of species of the group easier. We have shown a necessity of Stipa ucrainica and S. zalesskii distinguishing and also a distance of not-reaching a base of awn by ventral line of hairs on lemmas was non-effective character. Систематика перистых ковылей родства Stipa dasyphylla всегда вызывала трудности у монографов. В данной работе проведен критический анализ использующихся в настоящее время основных диагностических признаков и сделана попытка найти новые морфологиче-ские признаки, позволяющие облегчить различение некоторых близких видов этой сложной группы. Нами показана необходимость разделения видов Stipa ucrainica и S. zalesskii, а также неэффективность признака расстояния недохождения краевой полоски волосков на нижней цветковой чешуе до основания ости. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-05-18 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/65 10.1234/XXXX-XXXX-2012-3-49-52 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 3 (2012); 49-52 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 3 (2012); 49-52 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/65/67 Цвелев Н.Н. Злаки СССР. Л.: Наука. Ленингр. отд., 1976. 788 с. Лавренко Е.М. Степи // Растительность европейской части СССР. Л.: Наука, 1980. С. 203—272. Слюсаренко Л.П. Stipa — Ковыль // Злаки Украины / Под ред. Ю.Н. Прокудина. Киев: Наукова думка, 1977. С. 405—424. Смирнов П.А. Stipa L. — Ковыль // Флора Юго-Востока европейской части СССР / Под ред. Б.А. Федченко. Л.: Изд. Гл. бот. сада, 1928. Вып. 2. С. 98—118. Martinovsky J.O. Stipa // Flora Europaea. Vol. 5: Alismataceae to Orchidaceae (Monocotyledones). Cambridge: Cambridge University Press, 1980. P. 247—252. Васюков В.М. О ковылях (Stipa L., Poaceae) Приволжской возвышенности и сопредельных территорий // Фиторазнообразие Восточной Европы. 2007. № 2. С. 42—47. Smirnow P. Zwei neue russische Stipen // Feddes Repertorium specierum novarum regni vegetabilis. 1926. Fasc. 22. S. 374—375. Вилинский* Г.Д. О новом виде ковыля из цикла St. pennata L., распространенном в Ю.-В. России // Дневник 1-го Всероссийского съезда русских ботаников в Петрограде в 1921 году / Под ред. Б.Л. Исаченко. Пг., 1921. С. 40—41. Martinovsky J.O. Taxonomische Studie uber die Stipa-Serie Dasyphyllae // Preslia. 1975. Vol. 47. S. 249—261. Рожевиц Р.Ю. Ковыль — Stipa L. // Флора СССР / Под ред. В.Л. Комарова. Т. 2. Л.: Изд-во АН СССР, 1934. С. 79—112. Клоков М.В., Осычнюк В.В. Ковыли Украины // Новости сист. высш. и низш. растений. Киев, 1975. С. 7—92. Цвелев Н.Н. О ковылях (Stipa L., Gramineae) Украины // Бюл. МОИП. Отд. биол. 1986. Т. 91. Вып. 1. С. 116—123. Ломоносова М.Н. Stipa — Ковыль // Флора Сибири. Т. 2: Poaceae (Gramineae) / Под ред. Л.И. Малышева, Г.А. Пешковой. Новосибирск: Наука. Сиб. отд., 1990. С. 222—230. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/838 2020-03-18T13:12:52Z jour:RA driver

The use of ISSR markers for the analysis of polymorphism in sea buckthorn (Hippophaë rhamnoides l.) Of different origin Использование межмикросателлитных маркеров для анализа полиморфизма облепихи крушиновидной (Hippophaë rhamnoides l.) различного происхождения K. D. Bone I. V. Bocharkina G. I. Karlov O. V. Razumova К. Д. Боне Ю. В. Бочаркина Г. И. Карлов О. В. Разумова дендрограмма ISSR markers PCR DNA polymorphism phylogenetics population genetics dendrogram дендрограмма ISSR-маркеры ПЦР полиморфизм ДНК филогенетика популяционная генетика дендрограмма Sea buckthorn (Hippophaë rhamnoides L.) is a dioecious shrub, or tree. It is the perennial plant, the juvenile period of which continues from 3 to 5 years. Sea buckthorn is widely used in cosmetology, biotechnology, pharmacology, agriculture. It grows in many countries of Europe and Asia. This crop is a source of different vitamins, minerals, carotenoids and flavonoids. Phenotypic description does not give an accurate description of the taxon (species, subspecies, varieties, populations) so it means that we have to use molecular methods of analysis. The collection of Sea buckthorn with different ecological and geographical genesis was selected. It consists of herbarium specimens and natural populations. We selected ISSR-markers which are able to detect genotypic differences effectively. The dendrogram was built on the PCR basis. We revealed a high level of interspecies polymorphism, and it was also established that samples with similar ecological-geographical genesis tend to group into clusters, which are located at different genetic distances. The result of the research will help us to evaluate the gene pool of this crop, the diversity of forms, the similarity between them and it will help us to determine ecological and geographical origin of sea buckthorn, its evolution. So we will be able to select pairs for crossing and to define certification and identification of varieties before they reach the generative period. Облепиха крушиновидная (Hippophaë rhamnoides L.) – двудомный кустарник или дерево. Это многолетнее растение, ювенильный период которого продолжается от 3 до 5 лет. Облепиха широко используется в косметологии, биотехнологии, фармакологии, сельском хозяйстве; она распространена во многих странах Европы и Азии. Это источник ценных витаминов, минералов, каротиноидов и флавоноидов. Фенотипическое описание не дает точную характеристику таксона, в т.ч. вида, подвида, разновидности, популяции, поэтому возникает необходимость использовать молекулярные методы анализа. Для исследования была собрана коллекция облепихи различного эколого-географического происхождения, состоящая из гербарных образцов и образцов, собранных авторами из природных популяций; подобраны межмикросателлитные маркеры, наиболее эффективно выявляющие генотипические различия; составлены бинарные матрицы, на основании которых построена дендрограмма. В результате анализа был выявлен высокий уровень внутривидового полиморфизма, а также установлено, что образцы со сходным эколого-географическим происхождением имеют тенденцию объединяться в кластеры и находятся на разном генетическом расстоянии. Результаты исследования помогут оценить разнообразие форм данной культуры, степень родства между ними, их эколого-географическое происхождение, эволюцию определенных (низших) таксонов, а также произвести паспортизацию и идентификацию сортов до достижения ими генеративного периода, подбирать пары для скрещивания. Lomonosov Moscow State University, School of Biology Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда (соглашение № 17-76-10060). 2020-03-10 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/838 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 75, № 1 (2020); 43-48 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 75, № 1 (2020); 43-48 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/838/506 Комиссия по генетическим ресурсам в сфере продовольствия и сельского хозяйства. Состояние всемирных генетических ресурсов животных в сфере продовольствия и сельского хозяйства. ФАО, 2010. ВИЖ РАСХН, 2010. Москва. C. 359–380. Das K., Hussain G.Sh., Mangla Y., Dar T.U.H., Chaudhary M., Thakur R.K., Tandon R., Raina S.N., Goel Sh. ISSR markers for gender identification and genetic diagnosis of Hippophaё rhamnoides ssp. turkestanica growing at high altitudes in Ladakh region (Jammu and Kashmir) // Protoplasma. 2017. Vol. 254. N 2. P. 1063–1077. Rousi A. The genus Hippophaë L. A taxonomic study // Ann. Bot. Fennici. 1971. Vol. 8. N 3. P. 177–227. Li T.S.C., Schroeder W.R. Sea Buckthorn (Hippophaё rhamnoides L.): A multipurpouse plant // HortTechnology. 1996. Vol. 6. N 4. P. 370–380. Bernarth J., Foldesi D. Sea buckthorn (Hippophaё rhamnoides L.): a promising new medicinal and food crop // J. Herbs Spices Med. Plants. 1992. Vol. 1. N 1–2. P. 27–35. Li H., Ruan Ch.-J., Teixeira da Silva J.A. Identification and genetic relationship based on ISSR analysis in a germplasm collection of sea buckthorn (Hippophaё L.) from China and other countries // Sci. Hortic. 2009. Vol. 123. N 2. P. 263–271. Ruan C.J., Xie Q.L., Li D.Q. Function and benefit of sea buckthorn improving eco-environment of Loess Plateau // Proceedings of 12th ISCO Conference. Beijing. 2002. URL: http://www.tucson.ars.ag.gov (дата обращения: 19.02.2020). Tian Ch., Lei Y., Shi S., Nan P., Chen J., Zhong Y. Genetic diversity of sea buckthorn (Hippophaё rhamnoides) populations in northeastern and northwestern China as revealed by ISSR markers // New Forest. 2004. Vol. 27. N 3. P. 229–237. Земцова А.Я., Зубарев Ю.А., Гунин А.В., Иванова М.С. Оценка генетического полиморфизма образцов рода облепихи (Hippophaё L.) различного эколого-географического происхождения посредством ISSRмаркеров // Вавил. ж. генет. и селекции. 2017. Vol. 21. N 6. C. 623–629. Tikunov Yu.M., Khrustaleva L.I., Karlov G.I. Application of ISSR markers in the genus Lycopersicon // Euphytica. 2003. Vol. 131. N 1. P. 71–81. Nybom H. Comparison of different nuclear DNA markers for estimating intraspecific genetic diversity in plants // Mol. Ecol. 2004. Vol. 13. N 5. P. 1143–1155. Kojima T., Nagaoka T., Noda K., Ogihara Y. Genetic linkage map of ISSR and RAPD markers in einkorn wheat in relation to that of RFLP markers // Theor. Appl. Genet. 1998. Vol. 96. N 1. P. 37–45. Doyle, J.J., Doyle J.L. Isolation of plant DNA from fresh tissue // Focus. 1990. Vol. 12. N 1. P. 13–15. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/97 2015-05-25T11:51:10Z jour:FF driver

GEOGRAPHICAL DISTRIBUTION, NESTING BIOTOPS AND QUANTITY OF YELLOW WAGTAIL MOTACILLA FLAVA LINNAEUS, 1758 (PASSERIFORMES, MOTACILLIDAE) IN THE MIDDLE VOLGA REGION ГЕОГРАФИЧЕСКОЕ РАСПРОСТРАНЕНИЕ, БИОТОПЫ ГНЕЗДОВАНИЯ И ЧИСЛЕННОСТЬ ЖЕЛТОГОЛОВОЙ ТРЯСОГУЗКИ MOTACILLA CITREOLA PALLAS, 1776 (PASSERIFORMES, MOTACILLIDAE) В СРЕДНЕМ ПОВОЛЖЬЕ I. V. Murav’ev E. A. Artem’eva I. R. Beme И. В. Муравьев Е. А. Артемьева И. Р. Бёме Среднее Поволжье population cenose landscape areal ornithofauna species nesting biotope forage reserve birds “yellow” wagtails Motacillidae Middle Volga Region Среднее Поволжье популяция ценоз ландшафт ареал орнитофауна вид гнездовой биотоп кормовая база птицы “желтые” трясогузки Среднее Поволжье Critical estimation of literary information about yellow-frontal wagtail Motacilla citreola Pallas, 1776 (Passeriformes, Motacillidae, Motacillinae) is carrying out on boundary XIX—XX centuries, estimation of contemporary quantity, limited factories and regularities of species distribution on research territory of European part of Russia and the Middle Volga Region are gived. Проведен анализ литературных сведений о распространении и экологии желтоголовой трясогузки Motacilla citreola Pallas, 1776 (Passeriformes, Motacillidae, Motacillinae) на рубеже XIX—XX вв., дана оценка современной численности, выявлены закономерности распространения вида на исследованной территории европейской части России, в том числе Среднем Поволжье. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-05-25 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/97 10.1234/XXXX-XXXX-2014-3-42-48 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 3 (2014); 42-48 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 3 (2014); 42-48 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2014-3 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/97/98 Приезжев Г.П. Семейство трясогузковые Motacillidae // Птицы Волжско-Камского края. Воробьиные. М.:Наука, 1978. С. 145—157. Муравьев И.В. Сравнительная экология близко-родственных видов на примере рода Motacilla L.: Автореф. дис. ... канд. биол. наук. М.: МГПИ, 1997. 17 с. Муравьев И.В. Экология группы “желтых” трясогузок в Среднем Поволжье // Мат-лы III Всерос. Бутурлинских чтений. Ульяновск: Корпорация технологий продвижения, 2010. С. 241—252. Плохинский Н.А. Биометрия. М.: Изд-во Моск. ун-та, 1970. 367 с. Гладков Н.А. Птицы Советского Союза. Т. 5. М.: Советская наука, 1954. С. 594—690. Степанян Л.С. Конспект орнитологической фауны СССР. М.: Наука, 1990. 366 с. Портенко Л.А. Птицы СССР. Ч. 4. М.; Л.: АН СССР, 1960. 416 с. Cramp S. The Birds the Weitern Palearctic. Oxford: Oxford Univ. Press, 1988. P. 1—1063. Коблик Е.А., Редькин Я.А, Архипов В.Ю. Список птиц Российской Федерации. М.: Товарищество научных изданий КМК, 2006. С. 146—148. Сотников В.Н. Птицы Кировской области и сопредельных территорий. Воробьинообразные. Т. 2, Ч. 1. Киров: ООО “Триада+”, 2006. 448 с. Иванов А.И. Каталог птиц СССР. Л.: Наука, 1976. 276 с. Резцов С.А. Материалы к изучению орнитологической фауны Тамбовской губернии. М., 1910. С. 14—260. Федорович Ф.Ф. Звери и птицы Пензенской губернии // Тр. Пенз. любителей естествознания. 1915. Вып. 2. С. 41—45. Артоболевский В.М. Материалы к познанию птиц юго-востока Пензенской губернии (Уу. Городшценский, Пензенский, Чембарский, Инсарский, Саранский и прилегающие к ним места) // Бюл. МОИП. Нов. серия. Отд. биол. 1923—1924. Т. 32. Вып. 1—2. С. 162—193. Завьялов Е.В., Табачишин В.Г., Якушев Н.Н., Мосолова Е.Ю., Шляхтин Г.В., Кошкин В.А., Хучраев С.О., Угольников К.В. Птицы севера Нижнего Поволжья: Кн. IV. Состав орнитофауны / Под ред. Е.В. Завьялова. Саратов: Изд-во Сарат. ун-та, 2009. 268 с. Спангенберг Е.П., Бутьев В.Т., Журавлев М.Н. К экологии желтоголовой трясогузки (Motacilla citreola werae But.) в Московской области // Фауна и экология животных. Ч. 2. М., 1976. С. 225—232. Матвиенко М.Е. О расширении гнездового ареала желтоголовой трясогузки // Тез. докл. 7-й Всесоюз. орнитол. конф. Ч. 1. 1977. С. 84. Лесничий В.В. Находка трясогузки желтоголовой (M. citreola Pall.) в Житомирской области // Вестн. зоол. 1978. № 4. С. 92—93. Панченко С.Г., Лесничий В.В. О гнездовании желтоголовой трясогузки в Ворошиловоградской области // Вестн. зоол. № 1. 1985. С. 81—82. Goleniewski L.J. Obserwcja pliszki cytrynowej (Motacilla citreola) na Polesiu Lubelskim // Not. ornitol. Vol. 28. N 1—4. 1987. C. 103—104. Sviecka J., Typner V. Dalsf vyskyt konipasa citronoveho (Motacilla citreola Pallas) na vychodnim Slovensku // Zb. Vychodosloven ornitol. Klubu. 1988. N 3—4. S. 95—96. Royge A., Fignet P. Premiere observation dune Bergeronnatee citrine observation dune Bergeronnates sitrine M. citreola Pall. // Alauda. 1875. Vol. 57. N 3. P. 218—220. Москвичев А.Н., Бородин О.В., Корепов М.В., Корольков М.А. Птицы города Ульяновска: видовой состав, распространение, лимитирующие факторы и меры охраны. Ульяновск: Корпорация технологий продвижения, 2011. 280 с. Белик В.П. Материалы к орнитофауне Среднего Дона // Орнитология. Вып. 32. 2005. С. 23—56. Аськеев И.В., Аськеев О.В. Орнитофауна Республики Татарстан (Конспект современного состояния). Казань, 1999. 124 с. Лысенков Е.В. Сравнительная экология трясогузок в условиях их совместного обитания в Мордовской АССР // Экологические исследования структуры природных сообществ. Саранск, 1987. С. 118—124. Воронцов Е.М. Птицы Камского Приуралья // Уч. зап. Горьковского ун-та. 1949. Вып. 14. С. 53—71. Бородин О.В. Конспект фауны птиц Ульяновской области (справочник). Серия Природа Ульяновской области. Вып. 1. Ульяновск, 1991. 94 с. Рябицев В.К. Птицы Урала, Приуралья и Западной Сибири (справочник-определитель). Екатеринбург: Изд-во Уральского ун-та, 2001. 608 с. Рузский М.Д. Материалы к изучению птиц Казанской губернии // Тр. общ-ва естествоиспытателей при импер. Казанском ун-те. 1893. Т. 25. Вып. 6. 398 с. Редькин Я.А. Таксономические отношения форм в эволюционно молодых комплексах птиц на примере рода Motacilla L., 1785 (таксономическая ревизия подрода Budytes): Автореф. дис. ... канд. биол. наук. М., 2001. 19 с. Редькин Я.А. Об определении подвидовой принадлежности желтоголовой трясогузки в Подмосковье // Птицы Москвы и Подмосковья. М., 2000. С. 61—64. Муравьев И.В., Рыженкова Е.Н. Водно-болотный комплекс птиц поймы реки Суры микрорайона “Северной поляны” // Изв. ПГПУ им. В.Г. Белинского (сектор молодых ученых). № 6 (10). 2008. С. 190—194. Рахимов И.И. Птицы городов Среднего Поволжья и Предуралья. Казань: Мастер Лайн, 2001. 272 с. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/943 2020-11-06T22:27:07Z jour:KS driver

Index of papers published in “Vestnik Moskovskogo Universiteta. Biologia” in 2020 Указатель статей, опубликованных в журнале «Вестник Московского университета.Серия 16. Биология» в 2020 г. article Editorial статья Редакционная . . Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2020-11-07 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/943 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 75, № 4 (2020); 302-303 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 75, № 4 (2020); 302-303 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/943/539 Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/255 2015-07-25T00:22:38Z jour:DT driver

E.E.USPENSKY — THE FOUNDER OF THE DEPARTMENT OF MICROBIOLOGY OF THE MOSCOW UNIVERSITY Е.Е. УСПЕНСКИЙ - ОСНОВАТЕЛЬ КАФЕДРЫ МИКРОБИОЛОГИИ МОСКОВСКОГО УНИВЕРСИТЕТА N. N. Kolotilova Н. Н. Колотилова . .   Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-25 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/255 10.1234/XXXX-XXXX-2011-1-58-62 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2011); 58-62 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2011); 58-62 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2011-1 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/255/251 Шапошников В.Н., Мантейфель А.Я. К физиологии Bacillus acidificans longissimus (B. delbruckii) // Тр. Научно-исследовательского химико-фармацевтического института. 1923. Вып. 7. Шапошников В.Н. Техническая микробиология. М.: Советская наука, 1948. Бехтерева М.Н. Ацетонобутиловое брожение при непрерывном удалении образующихся продуктов путем экстракции // Микробиология. 1939. Т. 8. Вып. 7. С. 855—862. Шапошников В.Н., Мантейфель А.Я., Иерусалимский Н.Д., Зыкова К.И., Бехтерева М.Н. Ацетонобутиловое брожение на мелассе // Микробиология. 1939. Т. 8. Вып. 1. С. 38—55. Шапошников В.Н. Физиология обмена веществ микроорганизмов в связи с эволюцией функций. М.: Изд-во АН СССР, 1960. Yegorov N.S. Das studium der GesetzmдЯigkeiten des Staffweihsels der Microorganismen in ihrer Entwicklungsdi- namik // Z. Humboldt. Univ. Berlin Math. Nat. R. 1959/60. Шапошников В.Н., Мантейфель А.Я., Иерусалимский Н.Д., Зыкова К.И., Бехтерева М.Н. Ацетонобутиловое брожение на мелассе // Микробиология. 1939. Т. 8. Вып. 1. С. 38—55. Шапошников В.Н. Физиология обмена веществ микроорганизмов в связи с эволюцией функций. М.: Изд-во АН СССР, 1960. Yegorov N.S. Das studium der GesetzmдЯigkeiten des Staffweihsels der Microorganismen in ihrer Entwicklungsdinamik // Z. Humboldt. Univ. Berlin Math. Nat. R. 1959/60. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/24 2015-05-01T10:01:39Z jour:GN driver

ON THE PHENOTYPE AND GENOTYPE CORRELATION OF SABLE AND PINE MARTEN IN SYMPATRIC ZONE IN THE NORTHERN URALS О СООТНОШЕНИИ ФЕНОТИПА И ГЕНОТИПА СОБОЛЯ И ЛЕСНОЙ КУНИЦЫ В ЗОНЕ СИМПАТРИИ НА СЕВЕРНОМ УРАЛЕ V. V. Rozhnov S. L. Pishchulina I. G. Meschersky L. V. Simakin В. В. Рожнов С. Л. Пищулина И. Г. Мещерский Л. В. Симакин гибридизация sable pine marten hybridization гибридизация соболь лесная куница гибридизация Analysis of alleles frequencies of 9 microsatellite loci of nuclear DNA of sables and pine martens revealed that this species from allopatric parts of species range highly significantly distinguish but in the sympatric zone in the Northern Urals interspecific hybridization is common. Sable and pine marten populations in sympatric zone keep their genetic isolation, but phenotypes of individuals not always correlate with their species (or hybrid) belonging, defined by genetic method. Анализ частот встречаемости аллелей 9 микросателлитных локусов яДНК соболя (Martes zibellina) и лесной куницы (M. martes) показал, что эти виды из аллопатрических частей ареалов различаются с высокой степенью достоверности, в то время как в зоне симпатрии на Северном Урале между ними регулярно происходит гибридизация. В целом популяции соболя и лесной куницы в зоне симпатрии сохраняют генетическую обособленность, однако фенотипы особей не всегда коррелируют с их видовой (или гибридной) принадлежностью, определяемой генетическим методом. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-04-30 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/24 10.1234/XXXX-XXXX-2013-3-23-26 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 3 (2013); 23-26 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 3 (2013); 23-26 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2013-3 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/24/26 Кошевой И. Кидас // Бюллетень Зоопарков и Зоосадов. 1935. № 10—11. Портнова Н. Размножение кидаса // Каракулеводство и звероводство. 1941. № 6. Пономарев А.Л. Кидас // Бюл. МОИП. 1946. Т. 51. № 4—5. C. 79—83. Граков Н.Н. О видовой самостоятельности лесной куницы и соболя // Сб. научно-технической информации ВНИИОЗ. 1974. Вып. 46. C. 11—14. Граков Н.Н. Лесная куница. М.: Наука, 1981. 108 с. Юргенсон П.Б. Кидас — гибрид соболя и куницы // Тр. Печоро-Илычского заповедника. 1947. Вып. 5. C. 145—179. Павлинин В.Н. Тобольский соболь // Тр. Ин-та биологии. Свердловск, 1963. Вып. 34. C. 1—112. Рожнов В.В., Мещерский И.Г., Пищулина С.Л., Симакин Л.В. Генетический анализ популяций соболя и лесной куницы в районах совместного обитания на Северном Урале // Генетика. 2010. Т. 46. № 4. C. 488—492. Domingo-Roura X. Genetic distinction of marten species by fixation of a microsatellite region // J. Mamm. 2002. Vol. 83. N 3. P. 907—912. Davis C., Strobeck C. Isolation, variability and crossspecies ampliphication of polymorphic microsatellite loci in the family Mustelidae // Mol. Ecol. 1998. Vol. 7. P. 1776—1778. Fleming M.A., Ostrander E.A., Cook J.A. Microsatellite markers for American mink (Mustela vison) and ermine (Mustela erminea) // Mol. Ecol. 1999. Vol. 8. P. 1351—1362. Pritchard J.K., Stephens M., Donnelly P. Inference of population structure using multilocus genotype data // Genetics. 2000. Vol. 155. P. 945—959. Excoffier L., Laval G., Schneider S. Arlequin ver. 3.0: An integrated software package for population genetics data analysis // Evolutionary Bioinformatics Online. 2005. Vol. 1. P. 47—50. Пищулина С.Л., Мещерский И.Г., Рожнов В.В. Сравнительно-краниометрическая характеристика соболя, лесной куницы и кидаса Северного Урала // Животный мир горных территорий: Мат-лы конф. / Под ред. В.В. Рожнова , Ф.А. Темботовой , В.И. Ланцова, К.Г. Михайлова. М.: Т-во научных изданий КМК, 2009. C. 412—416. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1439 2025-03-04T06:43:38Z jour:RST driver

Dynamics of development of the systemic inflammatory response and disruption of endothelium-dependent vasodilation of cerebral arteries Динамика развития системной воспалительной реакции и нарушение эндотелий-зависимой вазодилатации церебральных артерий I. B. Sokolova V. N. Shuvaeva И. Б. Соколова В. Н. Шуваева степень агрегации эритроцитов brain microcirculation cerebral arteries leukocytes endothelial cells erythrocyte aggregation степень агрегации эритроцитов головной мозг микроциркуляция церебральные артерии лейкоциты эндотелиальные клетки степень агрегации эритроцитов Systemic chronic inflammation (SCI) can develop due to diabetes mellitus, coronary artery disease, atherosclerosis, autoimmune diseases, kidney, liver, and lung pathologies, cancer, etc. During the COVID-19 pandemic, there was clear evidence showing that inflammation damages endothelial cells of the vascular wall, leading to impaired microcirculation. Currently, the mechanisms causing pathological changes in the brain amid SCI are still unclear. In this work, we investigated how systemic inflammation affects the vasodilatory function of cerebral arteries. SCI was modeled using the well-established cecal ligation and puncture model, which involves tying off the cecum below the ileocecal valve and puncturing it with a needle. For characterizing the SCI model in animals, we recorded changes in body weight, blood pressure, and analyzed levels of leukocytes, ESR, hematocrit, erythrocyte aggregation in arterial blood, and the number of desquamated endothelial cells in venous blood. The density of the vascular network in the pial membrane and arterial reactivity was studied using in vivo microvascular imaging. The number of vessels per unit area and changes in arterial diameter under the influence of vasoactive substances – aminoguanidine (an inducible NO-synthase inhibitor) and acetylcholine – were measured. From 7 days to 3 months after the onset of SCI, leukocyte levels in rat blood increased by 2.1–1.7 times compared to the control group. The number of desquamated endothelial cells increased by 1.8 times compared to the control. Erythrocyte aggregation rose by an average of 1.3 times. The density of the vascular network in the pial membrane decreased by an average of 1.7 times. The number of constrictions in pial arteries induced by aminoguanidine increased by 1.5 to 3.7 times. The number of arteries that expanded in response to acetylcholine decreased by 1.8 to 4.9 times. Thus, SCI over a period of three months leads to a decrease in the density of the cerebral vascular network and a deterioration in the vasomotor function of endothelial cells in cerebral arteries. Системное хроническое воспаление (СХВ) может развиться вследствие сахарного диабета, ишемической болезни сердца, атеросклероза, аутоиммунных заболеваний, почечных, печеночных, легочных патологий, онкологии и т.д. В ходе пандемии COVID-19 были получены наглядные доказательства того, что воспаление повреждает эндотелиальные клетки сосудистой стенки с последующим нарушением микроциркуляции. К настоящему времени не выяснены механизмы, приводящие к патологическим изменениям в головном мозге на фоне СХВ. В настоящей работе было исследовано, как отражается развитие системного воспаления на вазодилататорной функции церебральных артерий. Моделирование СХВ было основано на общепринятой модели лигирования и перфорации слепой кишки, которая заключается в перевязке слепой кишки под илеоцекальным клапаном и ее проколе с помощью иглы. Для характеристики полученной модели СХВ у животных фиксировали изменение массы тела и артериального давления, анализировали уровень лейкоцитов, скорость оседания эритроцитов, показатель гематокрита и степень агрегации эритроцитов в артериальной крови, количество десквамированных эндотелиальных клеток в венозной крови. Исследование плотности сосудистой сети пиальной оболочки и реактивности артерий проводили методом прижизненной визуализации микрососудистого русла. Оценивали число сосудов на единицу площади и изменение диаметра артерий под воздействием вазоактивных веществ: аминогуанидина (блокатор индуцибельной NO-синтазы) и ацетилхолина. В период с 7-х сут до 3-х мес. после начала СХВ уровень лейкоцитов в крови крыс увеличивался в 1,7–2,1 раза по сравнению с контролем. Число десквамированных эндотелиальных клеток увеличилось в 1,8 раза относительно контроля. Агрегируемость эритроцитов повысилась в среднем в 1,3 раза. Плотность сосудистой сети пиальной оболочки уменьшилась в среднем в 1,7 раза. В 1,6–3,1 раза увеличилось число констрикций пиальных артерий под воздействием аминогуанидина. В 1,8–4,9 раза снизилось число расширившихся артерий под воздействием ацетилхолина. Таким, образом, развитие СХВ в течение 3 мес. приводит к уменьшению плотности церебральной сосудистой сети и ухудшению вазомоторной функции эндотелиальных клеток мозговых артерий. Lomonosov Moscow State University, School of Biology This study was supported by the State funding allocated to the Pavlov Institute of Physiology Russian Academy of Sciences (No. 1021062411784-3-3.1.8). Работа поддержана средствами федерального бюджета в рамках государственного задания ФГБУН Институт физиологии им. И.П.Павлова РАН (№1021062411784-3-3.1.8). 2025-03-03 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1439 10.55959/MSU0137-0952-16-79-4-9 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 79, № 4 (2024); 315-321 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 79, № 4 (2024); 315-321 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1439/704 Clària J., Arroyo V., Moreau R. Roles of systemic inflammatory and metabolic responses in the pathophysiology of acute-on-chronic liver failure. JHEP Rep. 2023;5(9):100807. Lee K.-S., Yoon S.-H., Hwang I., Ma J.-H., Yang E., Kim R.H., Kim E., Yu J.-W. Hyperglycemia enhances brain susceptibility to lipopolysaccharide-induced neuroinflammation via astrocyte reprogramming. J. Neuroinflammation. 2024;21(1):137. Markousis-Mavrogenis G., Pepe A., Lupi A., Apostolou D., Argyriou P., Velitsista S., Vartela V., Quaia E., Mavrogeni S.I. Combined brain-heart MRI identifies cardiac and white matter lesions in patients with systemic lupus erythematosus and/or antiphospholipid syndrome: A pilot study. Eur. J. Radiol. 2024;8(176):111500. Ju Y.-N., Zou Z.-W., Jia B.-W. Ac2-26 activated the AKT1/GSK3β pathway to reduce cerebral neurons pyroptosis and improve cerebral function in rats after cardiopulmonary bypass. BMC Cardiovasc. Disord. 2024;24(1):266. Otsuka S., Matsuzaki R., Kakimoto S., Tachibe Y., Kawatani T., Takada S., Tani A., Nakanishi K., Matsuoka T., Kato Y., Inadome M., Nojima N., Sakakima H., Mizuno K., Matsubara Y., Maruyama I. Ninjin’yoeito reduces fatigue-like conditions by alleviating inflammation of the brain and skeletal muscles in aging mice. PLoS One. 2024;19(5):e0303833. Белобородова Н.В., Острова И.В. Сепсис-ассоциированная энцефалопатия (обзор). Общая реаниматология. 2017;13(5):121–139. https://doi.org/10.15360/1813-9779-2017-5-121-139. Fruekilde S.K., Bailey C.J., Lambertsen K.L., Clausen B.H., Carlsen J., Xu N-L., Drasbek K.R., Gutiérrez-Jiménez E. Disturbed microcirculation and hyperaemic response in a murine model of systemic inflammation. J. Cereb. Blood Flow Metab. 2022;42(12):2303–2317. Lorenzini L., Zanella L., Sannia M., Baldassarro V.A., Moretti M., Cescatti M., Quadalti C., Baldi S., Bartolucci G., Di Gloria L., Ramazzotti M., Clavenzani P., Costanzini A., De Giorgio R., Amedei A., Calzà L., Giardino L. Experimental colitis in young Tg2576 mice accelerates the onset of an Alzheimer’s-like clinical phenotype. Alzheimers Res. Ther. 2024;16(1):116. Li L., Xing M., Wang L., Zhao Y. Maresin 1 alleviates neuroinflammation and cognitive decline in a mouse model of cecal ligation and puncture. Zhong Nan Da Xue Xue Bao Yi Xue Ban. 2024;49(6):890–902. Zhou Y., Deng Q., Vong C.T., Khan H., Cheang W.S. Oxyresveratrol reduces lipopolysaccharide-induced inflammation and oxidative stress through inactivation of MAPK and NF-κB signaling in brain endothelial cells. Biochem. Biophys. Rep. 2024;40:101823. Yin X.-Y., Tang X.-H., Wang S.-X., Zhao Y.-C., Jia M., Yang J.-J., Ji M.-H., Shen J.-C. HMGB1 mediates synaptic loss and cognitive impairment in an animal model of sepsis-associated encephalopathy. J. Neuroinflammation. 2023;20(1):69. Robledo-Montaña J., Díaz-García C., Martí- nez M., Ambrosio N., Montero E., Marín M.J., Virto L., Muñoz-López M., Herrera D., Sanz M., Leza J.C., García-Bueno B., Figuero E., Martín-Hernández D. Microglial morphological/inflammatory phenotypes and endocannabinoid signaling in a preclinical model of periodontitis and depression. J. Neuroinflammation. 2024;21(1):219. Никифорова Л.Р., Крышень К.Л., Боровкова К.Е. Обзор доклинических моделей сепсиса и септического шока. Лабораторные животные для научных исследований. 2021;4:17–28. Петрищев Н.Н., Беркевич О.А., Власов Т.Д., Волкова Е.В., Зуева Е.Е., Мозговая Е.В. Диагностическая ценность определения дескваминированных эндотелиальных клеток в крови. Клиническая лабораторная диагностика. 2001;1:50–52. Вдовин В.А., Муравьев А.В., Певзнер А.А. Способ определения степени агрегации клеток крови. Ярославский педагогический вестник (Естественные науки). 2012;III(3):151–154. Предтеченский В.Е., Боровская В.М., Марголина Л.Т. Лабораторные методы исследования. Ред. Л.Г. Смирнова, Л.А. Кост. М.: Медгиз. 1950. 804 с. Sokolova I.B. Effects of metabolic disorders and streptozotocin-induced diabetes on cerebral circulation in rats on a hight-fat diet. J. Evol. Biochem. Physiol. 2022;58(3):915–921. Scott J.A., Machoun M., McCormack D.G. Inducible nitric oxide synthase and vascular reactivity in rat thoracic aorta: effect of aminoguanidine. J. Appl. Physiol. 1996;80(1):271–277. Tabernero A., Nadaud S., Corman B., Atkinson J., Capdeville-Atkinson C. Effects of chronic and acute aminoguanidine treatment on tail artery vasomotion in ageing rats. Br. J. Pharmacol. 2000;131(6):1227–1235. Misko T.P., Moore W.M., Kasten T.P., Nickols G.A., Corbett J.A., Tilton R.G., McDaniel M.L., Williamson J.R., Currie M.G. Selective inhibition of the inducible nitric oxide synthase by aminoguanidine. Eur. J. Pharmacol. 1993;233(1):119–125. Zamora R., Vodovotz Y., Billiar T.R. Inducible nitric oxide synthase and inflammatory diseases. Mol. Med. 2000;6(5):347–373. Галагудза М.М., Бельский Ю.П., Бельская Н.В. Индуцибельная NO-синтаза как фармакологическая мишень противовоспалительной терапии: надежда не потеряна? Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины. 2023;38(1):13–20. Cinelli M.A., Do H.T., Miley G.P., Silverman R.B. Inducible nitric oxide synthase: Regulation, structure, and inhibition. Med. Res. Rev. 2020;40(1):158–189. https://doi.org/10.1002/med.21599. Abalenikhina Y.V., Kosmachevskaya O.V., Topunov A.F. Peroxynitrite: Toxic agent and signaling molecule. Appl. Biochem. Microbiol. 2020;56(6):611–623. Герасимов Л.В., Мороз В.В., Исакова А.А. Микрореологические нарушения при критических состояниях. Общая реаниматология. 2010;1(1):74–78. Vallon M., Chang J., Zhang H., Kuo C.J. Developmental and pathological angiogenesis in the central nervous system. Cell. Mol. Life Sci. 2014;71(18):3489–3506. Evans L.E., Taylor J.L., Smith C.J., Pritchard H.A.T., Greenstein A.S., Allan S.M. Cardiovascular comorbidities, inflammation, and cerebral small vessel disease. Cardiovascular Res. 2021;117:2575–2588. Godo S., Shimokawa H. Endothelial functions. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 2017;37(9):e108–e114. Ritson M., Wheeler-Jones C., Stolp H.B. Endothelial dysfunction in neurodegenerative disease: Is endothelial inflammation an overlooked druggable target? J. Neuroimmunol. 2024;391:578363. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/292 2016-03-14T12:41:50Z jour:BIO driver

ANTI-HER2 PHOTOTOXIN BASED ON FLAVOPROTEIN MINISOG CAUSES OXIDATIVE STRESS AND NECROSIS ON HER2-POSITIVE CANCER CELLS АНТИ-HER2-ФОТОТОКСИН НА ОСНОВЕ ФЛАВОПРОТЕИДА miniSOG ВЫЗЫВАЕТ ОКИСЛИТЕЛЬНЫЙ СТРЕСС И НЕКРОЗ HER2-ПОЛОЖИТЕЛЬНЫХ РАКОВЫХ КЛЕТОК O. N. Shilova G. M. Proshkina A. V. Ryabova S. M. Deyev О. Н. Шилова Г. М. Прошкина А. В. Рябова С. М. Деев окислительный стресс. HER2 receptor oxidative stress targeted phototoxin окислительный стресс. рецептор HER2 гипоплоидная ДНК окислительный стресс. Development and functional characterization of novel high-affinity protein compounds that can selectively kill human cancer cells, is an important task of modern biomedical research. In this work the cytotoxicity of recombinant phototoxic protein DARPin-miniSOG on HER2- positive breast adenocarcinoma human cells has been studied. It was determined that targeted phototoxin DARPin-miniSOG specifically interacts with HER2 receptor and causes necrotic death of HER2-positive cells induced by illumination. Treatment of the cells with DARPinminiSOG in the presence of ascorbic acid eliminates the light-induced cytotoxic action of the protein that confirmed the mechanism of action of the protein through oxidative stress. Разработка и функциональная характеристика новых высокоаффинных белковых соединений, способных селективно уничтожать раковые клетки человека, является актуальной задачей современных биомедицинских исследований. В работе изучена цитотоксичность рекомбинантного фототоксичного белка DARPin-miniSOG в отношении HER2-положительных клеток аденокарциномы молочной железы человека. Установлено, что адресный фототоксин DARPin-miniSOG специфически взаимодействует с рецептором HER2 и вызывает фотоиндуцированную гибель HER2-положительных клеток по механизму некроза. Облучение клеток в присутствии аскорбиновой кислоты элиминирует фотоиндуцированную цитотоксичность DARPin-miniSOG, что доказывает прооксидантный механизм действия фототоксина. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2016-03-14 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/292 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2016); 17-22 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2016); 17-22 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/292/285 Slamon D.J., Clark G.M., Wong S.G., Levin W.J., Ullrich A., McGuire W.L. Human breast cancer: correlation of relapse and survival with amplification of the HER-2/neu oncogene // Science. 1987. Vol. 235. N 4785. P. 177–182. Gusterson B.A., Gelber R.D., Goldhirsch A. et al. Prognostic importance of c-erbB-2 expression in breast cancer // J. Clin. Oncol. 1992. Vol. 10. N 7. P. 1049–1056. Binz H.K., Amstutz P., Kohl A., Stumpp M.T., Briand C., Forrer P., Grutter M.G., Pluckthun A. High-affinity binders selected from designed ankyrin repeat protein libraries // Nat. Biotechnol. 2004. Vol. 22. N 5. P. 575–582. Interlandi G., Wetzel S.K., Settanni G., Plückthun A., Caflisch A. Characterization and further stabilization of designed ankyrin repeat proteins by combining molecular dynamics simulations and experiments // J. Mol. Biol. 2008. Vol. 375. N 3. P. 837–854. Zahnd C., Kawe M., Stumpp M.T., Pasquale C., Tamaskovic R., Nagy-Davidescu G., Dreier B., Schibli R., Binz H.K., Waibel R., Plückthun A. Efficient tumor targeting with high-affinity designed ankyrin repeat proteins: effects of affinity and molecular size // Cancer Res. 2010. Vol. 70. N 4. P. 1595–1605. Deyev S.M., Lebedenko E.N., Petrovskaya L.E., Dolgikh D.A., Gabibov A.G. , Kirpichnikov M.P. Man-made antibodies and immunoconjugates with desired properties: function optimization using structural engineering // Rus. Chem. Rev. 2015. Vol. 84. N 1. P. 1–26. Steiner D., Forrer P., Plückthun A. Efficient selection of DARPins with sub-nanomolar affinities using SRP phage display // J. Mol. Biol. 2008. Vol. 382. N 5. P. 1211–1227. Shu X., Lev-Ram V., Deerinck T.J., Qi Y., Ramko E.B., Davidson M.W., Jin Y., Ellisman M.H., Tsien R.Y. A genetically encoded tag for correlated light and electron microscopy of intact cells, tissues, and organisms // PLoS Biol. 2011. Vol. 9. N 4. e1001041. Шилова О.Н., Прошкина Г.М., Лебеденко Е.Н., Деев С.М. // Интернализация и рециркуляция рецептора HER2 при взаимодействии адресного фототоксичного белка DARPin-miniSOG с клетками аденокарциномы молочной железы человека. 2015. Acta Naturae. №3. С. 79–86. Mosmann T. Rapid colorimetric assay for cellular growth and survival: application to proliferation and cytotoxicity assays // J. Immunol. Methods. 1983. Vol. 65. N 1–2. P. 55–63. Ryumina A.P., Serebrovskaya E.O., Shirmanova M.V., Snopova L.B., Kuznetsova M.M., Turchin I.V., Ignatova N.I., Klementieva N.V., Fradkov A.F., Shakhov B.E., Zagaynova E.V., Lukyanov K.A., Lukyanov S.A. Flavoprotein miniSOG as a genetically encoded photosensitizer for cancer cells // Biochim. Biophys. Acta. 2013. Vol. 1830. N 11. P. 5059–5067. Mironova K.E., Proshkina G.M., Ryabova A.V., Stremovskiy O.A., Lukyanov S.A., Petrov R.V., Deyev S.M. Genetically encoded immunophotosensitizer 4D5scFvminiSOG is a highly selective agent for targeted photokilling of tumor cells in vitro // Theranostics. 2013. Vol. 3. N 11. P. 831–840. Gülçin İ. Antioxidant activity of food constituents: an overview // Arch. Toxicol. 2012. Vol. 86. N 3. P. 345–391. Girotti A.W. Photosensitized oxidation of membrane lipids: reaction pathways, cytotoxic effects, and cytoprotective mechanisms // J. Photochem. Photobiol. 2001. Vol. 63. N 1-3. P. 103–113. Finkel T. Signal transduction by reactive oxygen species // J. Cell. Biol. 2011. Vol. 194. N 1. P. 7–15. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/56 2015-05-18T11:36:51Z jour:PH driver

DERINAT A NEW RANGE OF ACTION: INFLUENCE ON MEMORY НОВЫЙ СПЕКТР ДЕЙСТВИЯ ПРЕПАРАТА ДЕРИНАТ: ВЛИЯНИЕ НА ПАМЯТЬ A. V. Novoseletskaya N. A. Tushmalova А. В. Новоселецкая Н. А. Тушмалова условный рефлекс активного избегания memory active avoidance conditioned reflex условный рефлекс активного избегания память условный рефлекс активного избегания In the present research we studied mnemotropic effect of Derinat — the biologically active compound of natural origin — on the passiv avoidance conditioned reflex and active avoidance conditioned reflex. Derinat accelerates the development of the conditioned reflexes. The effect was observed in early stages of the experiments, similarly to the influence of nootropic drugs. В данном исследовании был выявлен мнемотропный эффект в действии дерината — биологически активного соединения природного происхождения — на формирование у крыс условных рефлексов активного и пассивного избегания. Деринат ускоряет выработку условных рефлексов. Эффект проявляется на начальных этапах выработки, что напоминает влияние ноотропов. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-05-17 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/56 10.1234/XXXX-XXXX-2012-3-3-5 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 3 (2012); 3-5 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 3 (2012); 3-5 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/56/58 Прагина Л.Л., Тушмалова Н.А., Баскова И.П., Завалова Л.Л. Новый спектр действия пиявита — влияние на память // VI Российский национальный конгресс “Человек и лекарство”, Москва. 19—21 апреля 1999 г. М., С. 106. Прагина Л.Л., Тушмалова Н.А., Шебалин Н.И. Влияние пантогематогена на память // VII Российский национальный конгресс “Человек и лекарство”, Москва. 19—23 апреля 2000 г. М., С. 537. Тушмалова. Н.А., Прагина Л.Л. Улучшение выработки и воспроизведение УРПИ под действием деривата ДНК (полидан) // Журн. высш. нервн. деят. 1999. Т. 49. С. 777—780. Тушмалова Н.А., Прагина Л.Л. Эволюционно-молекулярный принцип индикации мнемотропных свойств биологически активных соединений природного происхождения // Вестн. Моск. ун-та. Cер. 16. Биология. 2002. № 3. С. 3—6. Каплина Э.Н., Вайнберг Ю.П. Деринат — природный иммуномодулятор для детей и взрослых. М.: Научная книга, 2007. 240 с. Каплина Э.Н., Бажанов Н.О. Применение дерината в хирургии. Пособие для практикующих врачей. М.: Научная книга, 2006. 38 с. Каплина Э.Н., Бажанов Н.О. Применение дерината в офтальмологии. Пособие для практикующих врачей. М.: Научная книга, 2006. 29 с. Каплина Э.Н., Бажанов Н.О. Применение дерината в кардиологии. Пособие для практикующих врачей. М.: Научная книга, 2006. 48 с. Буреш Я., Бурешова О., Хьюстон Дж.П. Методики и основные эксперименты по изучению мозга и поведения. М.: Высшая школа, 1991. С. 175—189. Тушмалова Н.А., Маракуева И.В. Сравнительно-физиологическое исследование ультраструктурных аспектов памяти. М.: Наука, 1986. 158 c. Воронина Т.А., Островская Р.У. Методические указания по изучению ноотропной активности фармакологических веществ / Руководство по экспериментальному (доклиническому) изучению новых фармакологических веществ. М.: Редмедиум, 2000. С. 126—130. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1544 2025-11-10T18:21:01Z jour:%D0%9E%D0%98 driver

Ni-NTA bead-based real-time monitoring of PARPs inhibitor binding Оценка связывания ингибиторов PARP в режиме реального времени на основе Ni-NTA-агарозных шариков A. A. Lobanova O. V. Saulina O. V. Geraskina D. O. Koshkina N. V. Maluchenko A. V. Feofanov V. M. Studitsky А. А. Лобанова А. А. Саулина О. В. Гераськина Д. О. Кошкина Н. В. Малюченко А. В. Феофанов В. М. Студитский нуклеосомы PARP2 PARP inhibitors nucleosomes нуклеосомы PARP2 ингибиторы PARP нуклеосомы This study establishes a real-time fluorescence microscopy platform for visualizing ligand binding dynamics to His-tagged proteins bound to Ni-NTA agarose beads. By preserving solution-phase kinetics while enabling sub-minute temporal resolution in physiological buffers, the methodology overcomes critical limitations of surface-based techniques and gel electrophoretic methods. We applied this platform to investigate inhibitor action within a nucleosomal system, a more physiologically relevant context than free DNA. Through studies of PARP2-nucleosome interactions modulated by clinical inhibitors (talazoparib, veliparib) and by reaction of poly(ADP-ribosyl)ation in the presence of NAD+, we demonstrate direct spatial and temporal resolution of chromatin-protein dynamics. The platform’s virtually unlimited buffer compatibility, real-time monitoring capabilities, and elimination of covalent immobilization artifacts provide transformative insights into drug mechanisms and chromatin engagement processes. В исследовании была создана платформа для флуоресцентной микроскопии, которая позволяет в режиме реального времени визуализировать динамику взаимодействия лиганда с белками, помеченными His-tag, связывающимися с Ni2+ на NTA-агарозных шариках. Эта методология преодолевает критические ограничения традиционных методов, таких как поверхностный плазмонный резонанс или гель-электрофорез, за счет сохранения кинетики фазы раствора и обеспечения субминутного временного разрешения в физиологических буферах. Мы применили эту платформу для исследования действия ингибиторов в системе нуклеосом, которая является более физиологически подходящей моделью, чем свободная ДНК. Изучая взаимодействия PARP2 с нуклеосомами в присутствии и в отсутствие клинических ингибиторов (талазопариба и велипариба), а также реакцию поли(АДФ-рибозил)ирования в присутствии НАД+, мы смогли продемонстрировать прямое пространственное и временное разрешение динамики хроматин-белок. Практически неограниченная совместимость платформы с буферами, возможность мониторинга в режиме реального времени и устранение артефактов ковалентной иммобилизации обеспечивают новое понимание механизмов взаимодействия лекарственных средств и хроматина. Lomonosov Moscow State University, School of Biology This work was supported by the Russian Science Foundation, project no. 21-64-00001-p. Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда, проект № 21-64-00001-п. 2025-11-10 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1544 10.55959/MSU0137-0952-16-80-3S-11 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 80, № 3S (2025); 73–80 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 80, № 3S (2025); 73–80 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1544/736 https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/downloadSuppFile/1544/1217 Luger K., Hansen J.C. Nucleosome and chromatin fiber dynamics. Curr. Opin. Struct. Biol. 2005;15(2):188–196. Luger K., Dechassa M.L., Tremethick D.J. New insights into nucleosome and chromatin structure. Curr. Opin. Struct. Biol. 2012;13(7):436–447. Langelier M.F., Planck J.L., Roy S., Pascal J.M. Structural basis for DNA damage-dependent poly(ADP-ribosyl) ation by human PARP-1. Science. 2012;336(6082):728–732. Lakowicz J.R. Principles of fluorescence spectroscopy. 3rd ed. N.Y.: Springer; 2006. 954 pp. Maluchenko N.V., Nilov D.K., Pushkarev S.V., Kotova E.Y., Gerasimova N.S., Kirpichnikov M.P., Langelier M.F., Pascal J.M., Akhtar M.S., Feofanov A.V., Studitsky V.M. Mechanisms of nucleosome reorganization by PARP1. Int. J. Mol. Sci. 2021;22(22):12127. Maluchenko N., Saulina A., Geraskina O., Kotova E., Korovina A., Armeev G., Kirpichnikov M., Feofanov A., Studitsky V. Poly(ADP-ribose)polymerase 2 is zinc-dependent enzyme and nucleosome reorganizer. Cell. Mol. Life Sci. 2025;82(1):267. Maluchenko N., Koshkina D., Korovina A., Studitsky V., Feofanov A. Interactions of PARP1 inhibitors with PARP1-nucleosome complexes. Cells. 2022;11(21):3343. Hellman L.M., Fried M.G. Electrophoretic mobility shift assay (EMSA) for detecting protein-nucleic acid interactions. Nat. Protoc. 2007;2(8):1849–1861. Pascal J.M. The comings and goings of PARP-1 in response to DNA damage. DNA Repair (Amst). 2018;71:177–182. Riccio AA, Cingolani G, Pascal JM. PARP-2 domain requirements for DNA damage-dependent activation and localization to sites of DNA damage. Nucleic Acids Res. 2016;44(4):1691–1702. Murai J., Huang S.Y., Das B.B., Renaud A., Zhang Y., Doroshow J.H., Ji J., Takeda S., Pommier Y. Trapping of PARP1 and PARP2 by clinical PARP inhibitors. Cancer Res. 2012;72(21):5588–5599. Krüger A., Bürkle A., Hauser K., Mangerich A. Real-time monitoring of PARP1-dependent PARylation by ATR-FTIR spectroscopy. Nat. Commun. 2020;11(1):2174. Kurgina T.A., Anarbaev R.O., Sukhanova M.V., Lavrik O.I. A rapid fluorescent method for the real-time measurement of poly(ADP-ribose) polymerase 1 activity. Anal. Biochem. 2018;545:91–97. Langelier M.F., Riccio A.A., Pascal J.M. PARP-2 and PARP-3 are selectively activated by 5′ phosphorylated DNA breaks through an allosteric regulatory mechanism shared with PARP-1. Nucleic Acids Res. 2014;42(12):7762–7775. Luger K., Mäder A.W., Richmond R.K., Sargent D.F., Richmond T.J. Crystal structure of the nucleosome core particle at 2.8 Å resolution. Nature. 1997;389(6648):251–260. Richmond T.J., Davey C.A. The structure of DNA in the nucleosome core. Nature. 2003;423(6936):145–150. Luger K., Rechsteiner T.J., Richmond T.J. Preparation of nucleosome core particle from recombinant histones. Chromatin. Methods in Enzymology, vol. 304. Eds. P.M. Wassarman and A.P. Wolffe. Academic Press; 1999:3–19. Wasserberg D., Cabanas-Danés J., Prangsma J., O’Mahony S., Cazade P.A., Tromp E., Blum C., Thompson D., Huskens J., Subramaniam V., Jonkheijm P. Controlling protein surface orientation by strategic placement of His-tags. ACS Nano. 2017;11(9):9350–9361. Wu C.C., Reinhoudt D.N., Otto C., Velders A.H., Subramaniam V. Protein immobilization on Ni(II) ion patterns prepared by microcontact printing and dip-pen nanolithography. ACS Nano. 2010;4(2):1083–1091. Castro-Hinojosa C., Del Sol-Fernández S., Moreno-Antolín E., Martín-Gracia B., Ovejero J.G., de la Fuente J.M., Grazú V., Fratila R.M., Moros M. A simple and versatile strategy for oriented immobilization of Histagged proteins on magnetic nanoparticles. Bioconjug. Chem. 2023;34(12):2275–2292. Zandarashvili L., Langelier M.F., Velagapudi U.K., Hancock M.A., Steffen J.D., Billur R., Hannan Z.M., Wicks A.J., Krastev D.B., Pettitt S.J., Lord C.J., Talele T.T., Pascal J.M., Black B.E. Structural basis for allosteric PARP-1 retention on DNA breaks. Science. 2020;368(6486):eaax6367. Lobanova A.A., Korovina A.N., Koshkina D.O., Chernikova P.A., Feofanov A.V., Studitsky V.M., Nilov D.K., Maluchenko N.V. Gel electrophoresis as a method for classifying inhibitors of poly(ADP-ribose) polymerases 1 and 2. Mosc. Univ. Biol. Sci. Bull. 2024;79(4):239–245. Langelier M.F., Steffen J.D., Riccio A.A., McCauley M., Pascal J.M. Purification of DNA damage-dependent PARPs from E. coli for structural and biochemical analysis. Poly(ADP-Ribose) Polymerase. Methods in Molecular Biology, vol 1608. N.Y.: Humana Press; 2017:431–444. Koshkina D., Maluchenko N., Nilov D., Lyubitelev A., Korovina A., Pushkarev S., Armeev G., Kirpichnikov M., Studitsky V., Feofanov A. Non-classical H1-like PARP1 binding to chromatosome. Cells. 2025;14(17):1309. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/655 2018-11-30T17:26:07Z jour:EDIT driver

CELL KINETIC APPROACHES TO THE SEARCH FOR ANTI-AGING DRUGS: THIRTY YEARS AFTER КЛЕТОЧНО-КИНЕТИЧЕСКИЕ ПОДХОДЫ К ПОИСКУ ГЕРОПРОТЕКТОРОВ: ТРИДЦАТЬ ЛЕТ СПУСТЯ A.N. Khokhlov A.N. Khokhlov A.N. Khokhlov А. Н. Хохлов обзор cell cultures geroprotectors geropromoters cell proliferation stationary phase aging kinetics test systems review обзор клеточные культуры геропротекторы геропромоторы клеточная пролиферация “стационарное старение” кинетика тест-системы обзор A brief overview of the ideas of the possibility of using the cell kinetic model developed by the author in the 1980s to test, in experiments on cell cultures, potential geroprotectors and geropromoters, which slow down or accelerate, respectively, the aging of animals and humans. The process of the evolution of this model is considered – from the estimation of only the cell reproduction rate and saturation density in a non-subcultured cell culture to the constructing of survival curves in the stationary phase of growth, and further – to an analysis of the possible interrelation between all parts of the curve of cells’ growth and subsequent dying out. Possible approaches to mathematical and statistical analysis of the data obtained within the framework of this model system are analyzed. It is emphasized that such studies can be carried out on cells of very different nature (normal and transformed human and animal cells, plant cells, yeast, mycoplasmas, bacteria, etc.), which makes possible an evolutionary approach to the interpretation of the results obtained. At the same time, in the author’s opinion, the most promising experiments are those carried out on immortalized cells of humans and animals, since they are not cancerous on the one hand, and on the other have an unlimited mitotic potential and, therefore, do not “age” in the process of numerous divisions, as, for example, normal human diploid fibroblasts do. It is assumed that the appropriate mathematical analysis of the entire growth and dying out curve of a non-subcultured cell culture (from seeding into a culture flask to the complete death of all cells) may allow us to clarify certain relationships between the development and aging of a multicellular organism, and to increase the reliability of identifying promising geroprotectors. Краткий обзор представлений о возможности использования разработанной автором в 80-х годах XX века клеточно-кинетической модели для тестирования в экспериментах на клеточных культурах потенциальных геропротекторов и геропромоторов – факторов, замедляющих или ускоряющих, соответственно, старение животных и человека. Рассматривается процесс эволюции этой модели – от оценки только скорости размножения и насыщающей плотности клеток в непересеваемой культуре до снятия кривых их выживания в стационарной фазе роста и далее – до анализа возможной взаимосвязи всех частей кривой роста и последующего вымирания клеток. Анализируются возможные подходы к математическому и статистическому анализу получаемых в рамках данной модельной системы результатов. Подчеркивается, что такого рода исследования могут проводиться на клетках самой разной природы (нормальных и трансформированных клетках человека и животных, растительных клетках, дрожжах, микоплазмах, бактериях и др.), что делает возможным эволюционный подход к интерпретации полученных результатов. При этом наиболее перспективными, по мнению автора, являются эксперименты, проводимые на иммортализованных клетках человека и животных, так как они, с одной стороны, не являются раковыми, а с другой – обладают неограниченным митотическим потенциалом и поэтому не “стареют” при многочисленных делениях, как это, например, делают нормальные диплоидные фибробласты человека. Предполагается, что соответствующий математический анализ всей кривой роста и гибели непересеваемой клеточной культуры (от посева в культуральный флакон до полной гибели всех клеток) может позволить уточнить определенные взаимосвязи между развитием и старением многоклеточного организма, а также повысить достоверность выявления перспективных геропротекторов. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2018-11-28 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/655 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 73, № 4 (2018); 227-232 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 73, № 4 (2018); 227-232 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/655/445 Schneider E.L., Smith J.R. The relationship of in vitro studies to in vivo human aging // Int. Rev. Cytol. 1981. Vol. 69. P. 261–270. Gazzola G.C., Bussolati O., Longo N., Dall’Asta V., Franchi-Gazzola R., Guidotti G.G. Effect of in vitro ageing on the transport of neutral amino acids in human fibroblasts // Cellular ageing. Monographs in developmental biology, vol. 17 / Ed. H.W. Sauer. Basel-N.Y.: S. Karger, 1984. P. 234–244. Macieira-Coelho A., Loria E., Berumen L. Relationship between cell kinetic changes and metabolic events during cell senescence in vitro // Cell impairment in aging and development / Eds V.J. Cristofalo and E. Holećkova. N.Y.- London: Plenum Press, 1975. P. 51–65. Macieira-Coelho A. Kinetics of the proliferation of human fibroblasts during their lifespan in vitro // Mech. Ageing Dev. 1977. Vol. 6. N 5. P. 341–343. Ohashi M., Aizawa S., Ooka H., Ohsawa T., Kaji K., Kondo H., Kobayashi T., Noumura T., Matsuo M., Mitsui Y., Murota S., Yamamoto K., Ito H., Shimada H., Utakoji T. A new human diploid cell strain, TIG-1, for the research on cellular aging // Exp. Gerontol. 1980. Vol. 15. N 2. P. 121–133. Wasko B.M., Carr D.T., Tung H. et al. Buffering the pH of the culture medium does not extend yeast replicative lifespan // F1000Research. 2013. Vol. 2:216. Morgunova G.V., Klebanov A.A., Marotta F., Khokhlov A.N. Culture medium pH and stationary phase/chronological aging of different cells // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2017. Vol. 72. N 2. P. 47–51. Чиркова Е.Ю., Головина М.Э., Наджарян Т.Л., Хохлов А.Н. Клеточно-кинетическая модель для изучения геропротекторов и геропромоторов // Докл. АН СССР. 1984. Т. 278. N 6. С. 1474–1476. Хохлов А.Н., Головина М.Э., Чиркова Е.Ю., Наджарян Т.Л. Анализ некоторых кинетических закономерностей роста культивируемых клеток. I. Модель // Цитология. 1985. Т. 27. N 8. С. 960–965. Khokhlov A.N. The cell kinetics model for determination of organism biological age and for geroprotectors or geropromoters studies // Biomarkers of aging: expression and regulation. Proceeding / Ed. F. Licastro and C.M. Caldarera. Bologna: CLUEB, 1992. P. 209–216. Конев С.В., Мажуль В.М. Межклеточные контакты. Минск: Наука и техника, 1977. 312 с. Kondo H., Kasuga H., Noumura T. Effects of various steroids on in vitro lifespan and cell growth of human fetal lung fibroblasts (WI-38) // Mech. Ageing Dev. 1983. Vol. 21. N 3–4. P. 335–344. Macieira-Coelho A. Action of cortisone on human fibroblasts in vitro // Experientia. 1966. Vol. 22. N 6. P. 390–391. Grünwald J., Mey J., Schönleben W., Hauss J., Hauss W.H. Cultivated human arterial smooth muscle cells. The effect of donor age, blood pressure, diabetes and smoking on in vitro cell growth // Pathol. Biol. (Paris). 1983. Vol. 31. N 10. P. 819–823. Хохлов А.Н. Пролиферация и старение // Итоги науки и техники ВИНИТИ АН СССР, серия “Общие проблемы физико-химической биологии”. Т. 9. М.: ВИНИТИ, 1988. 176 с. Khokhlov A.N. Cytogerontology at the beginning of the third millennium: from “correlative” to “gist” models // Russ. J. Dev. Biol. 2003. Vol. 34. N 5. P. 321–326. Morgunova G.V., Kolesnikov A.V., Klebanov A.A., Khokhlov A.N. Senescence-associated β-galactosidase – a biomarker of aging, DNA damage, or cell proliferation restriction? // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2015. Vol. 70. N 4. P. 165–167. Khokhlov A.N. Stationary cell cultures as a tool for gerontological studies // Ann. N.Y. Acad. Sci. 1992. Vol. 663. P. 475–476. Khokhlov A.N. Cell proliferation restriction: is it the primary cause of aging? // Ann. N.Y. Acad. Sci. 1998. Vol. 854. P. 519. Khokhlov A.N. From Carrel to Hayflick and back, or what we got from the 100-year cytogerontological studies // Biophysics. 2010. Vol. 55. N 5. P. 859–864. Khokhlov A.N. Does aging need its own program, or is the program of development quite sufficient for it? Stationary cell cultures as a tool to search for anti-aging factors // Curr. Aging Sci. 2013. Vol. 6. N 1. P. 14–20. Khokhlov A.N. Impairment of regeneration in aging: appropriateness or stochastics? // Biogerontology. 2013. Vol. 14. N 6. P. 703–708. Khokhlov A.N., Klebanov A.A., Morgunova G.V. Does aging have a purpose? // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2017. Vol. 72. N 4. P. 222–224. Shilovsky G.A., Shram S.I., Morgunova G.V., Khokhlov A.N. Protein poly(ADP-ribosyl)ation system: Changes in development and aging as well as due to restriction of cell proliferation // Biochemistry (Moscow). 2017. Vol. 82. N 11. P. 1391–1401. Fabrizio P., Longo V.D. The chronological life span of Saccharomyces cerevisiae // Aging Cell. 2003. Vol. 2. N 2. P. 73–81. Nyström T. Stationary-phase physiology // Annu. Rev. Microbiol. 2004. Vol. 58. P. 161–181. Khokhlov A.N. Which aging in yeast is “true”? // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2016. Vol. 71. N 1. P. 11–13. Morgunova G.V., Klebanov A.A., Khokhlov A.N. Some remarks on the relationship between autophagy, cell aging, and cell proliferation restriction // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2016. Vol. 71. N 4. P. 207–211. Khokhlov A.N., Klebanov A.A., Karmushakov A.F., Shilovsky G.A., Nasonov M.M., Morgunova G.V. Testing of geroprotectors in experiments on cell cultures: choosing the correct model system // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2014. Vol. 69. N 1. P. 10–14. Alinkina E.S., Vorobyova A.K., Misharina T.A., Fatkullina L.D., Burlakova E.B., Khokhlov A.N. Cytogerontological studies of biological activity of oregano essential oil // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2012. Vol. 67. N 2. P. 52–57. Yablonskaya O.I., Ryndina T.S., Voeikov V.L., Khokhlov A.N. A paradoxical effect of hydrated C60-fullerene at an ultralow concentration on the viability and aging of cultured Chinese hamster cells // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2013. Vol. 68. N 2. P. 63–68. Khokhlov A.N., Morgunova G.V., Ryndina T.S., Coll F. Pilot study of a potential geroprotector, “Quinton Marine Plasma”, in experiments on cultured cells // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2015. Vol. 70. N 1. P. 7–11. Morgunova G.V., Klebanov A.A. Impairment of the viability of transformed Chinese hamster cells in a nonsubcultured culture under the influence of exogenous oxidized guanoside is manifested only in the stationary phase of growth // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2018. Vol. 73. N 3. P. 124–129. Khokhlov A.N., Morgunova G.V. On the constructing of survival curves for cultured cells in cytogerontological experiments: a brief note with three hierarchy diagrams // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2015. Vol. 70. N 2. P. 67–71. Morgunova G.V., Klebanov A.A., Khokhlov A.N. Interpretation of data about the impact of biologically active compounds on viability of cultured cells of various origin from a gerontological point of view // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2016. Vol. 71. N 2. P. 67–70. Khokhlov A.N., Klebanov A.A., Morgunova G.V. On choosing control objects in experimental gerontological research // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2018. Vol. 73. N 2. P. 59–62. Khokhlov A.N., Morgunova G.V. Testing of geroprotectors in experiments on cell cultures: pros and cons // Anti-aging drugs: From basic research to clinical practice / Ed. A.M. Vaiserman. Royal Society of Chemistry, 2017. P. 53–74. Khokhlov A.N., Klebanov A.A., Morgunova G.V. Antiaging drug discovery in experimental gerontological studies: from organism to cell and back // Aging: Exploring a complex phenomenon / Ed. Sh.I. Ahmad. Boca Raton: Taylor & Francis, 2018. P. 577–595. Charnov E.L. On evolution of age of maturity and the adult lifespan // J. Evol. Biol. 1990. Vol. 3. N 1–2. P. 139–144. Charnov E.L., Berrigan D. Dimensionless numbers and life history evolution: age of maturity versus the adult lifespan // Evol. Ecol. 1990. Vol. 4. N 3. P. 273–275. de Magalhães J.P., Costa J., Church G.M. An analysis of the relationship between metabolism, developmental schedules, and longevity using phylogenetic independent contrasts // J. Gerontol. A Biol. Sci. Med. Sci. 2007. Vol. 62. N 2. P. 149–160. Bodnar A.G., Ouellette M., Frolkis M., Holt S.E., Chiu C.P., Morin G.B., Harley C.B., Shay J.W., Lichtsteiner S., Wright W.E. Extension of life-span by introduction of telomerase into normal human cells // Science. 1998. Vol. 279. N 5349. P. 349–352. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/768 2019-09-22T15:31:26Z jour:RA driver

Application of the new degrader strain Bacillus mobilis 34T for soil clearing from 2,4,5-trichlorophenoxyacetic acid Использование нового штамма-деструктора Bacillus mobilis 34T для очистки почвы от 2,4,5-трихлорфеноксиуксусной кислоты V. V. Korobov E. I. Zhurenko N. V. Zharikova T. R. Iasakov T. V. Markusheva В. В. Коробов Е. Ю. Журенко Н. В. Жарикова Т. Р. Ясаков Т. В. Маркушева почва degrader strain 2 4 5-trichlorophenoxyacetic acid utilization herbicides soil почва штамм-деструктор 2 4 5-трихлорфеноксиуксусная кислота утилизация гербициды почва The 2,4,5-Trichlorophenoxyacetic acid   (2,4,5-T)-degrading strain Bacillus mobilis 34Т isolated from the soil sample of the largest producer of herbicides in Russia was described. The strain was identified as Bacillus mobilis 34Т according to the cultural, morphological, morphometric, physiological, biochemical, features as well as the results of the comparative analysis of the 16S rRNA gene sequence. The growth of B. mobilis 34Т in the batch culture with using 2,4,5-T as a sole source of carbon and energy was studied. It was showed that 2,4,5-T content was reduced from the initial level by 29% and 62% during the first and ninth day, respectively. The strain was used for the treatment of a soil contaminated with 2,4,5-T. The decontamination degree was 41%, 52%, 58% on the 5th, 10th and 15–20st days of cultivation, respectively. Описан новый штамм-деструктор 2,4,5-трихлорфеноксиуксусной кислоты (2,4,5-Т), выделенный из пробы почвы предприятия, которое являлось крупнейшим производителем  гербицидов в России. Идентификация штамма проведена с учетом культурально-морфологических, морфометрических, физиолого-биохимических признаков, а также результатов сравнительного анализа последовательности гена 16S рРНК. Выделенный штамм определен как Bacillus mobilis 34Т. Исследован рост периодической культуры B. mobilis 34Т в условиях использования 2,4,5-Т в концентрации 100 мг/л в качестве источника углерода и энергии. Содержание 2,4,5-Т в культуральной жидкости в течение  первых суток  снижалось  на  29%,  к  9-м  сут  –  на  62%  от  начального  уровня.  Штамм B. mobilis 34Т был применен для биологической очистки почвы, загрязненной стки  составляла  на  5-е  сут  41%,  на  10-е  сут  –  52%  и  на 15 – 20-е сутки культивирования – 58%. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2019-09-21 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/768 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 74, № 3 (2019); 195-199 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 74, № 3 (2019); 195-199 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/768/478 Sastry B.V., Janson V.E., Clark C.P., Owens Cellular toxicity of 2,4,5-trichlorophe- noxyacetic acid: formation of 2,4,5-trichlorophenox yacetylcholine // Cell Mol. Biol. 1997. Vol. 43. N 4. P. 549–557. Korobov V.V., Zhurenko E.Yu., Galkin E.G., Zharikova N.V., Iasakov T.R., Starikov S.N., Sagitova A.I., Markusheva T.V. Cellulosimikrobium sp. Strain NPZ-121, a Degrader of 2,4,5-Trichlorophenoxyacetic Acid // Microbiology. 2018. Vol. 87. N 1. P. 147–150. Bolshakova A.V., Kiselyova O.I., Yaminsky Microbial surfaces investigated using atomic force microscopy // Biotechnol. Prog. 2004. Vol. 20. N 6. P. 1615–1622. Zharikova N.V., Iasakov T.R., Bumazhkin B.K., Patutina E.O., Zhurenko E.I., Korobov V.V., Sagitova A.I., Kuznetsov B.B., Markusheva T.V. Isolation and sequence analysis of pCS36-4CPA, a small plasmid from Citrobacter sp. 36-4CPA // Saudi J. Biol. Sci. 2018. Vol. 25. N 4. P. 660–671. Korobov V.V., Zhurenko E.I., Zharikova N.V., Iasakov T.R., Markusheva T.V. Possibility of using phenol- and 2,4-dichlorophenol-degrading strain, Rhodococcus erythropolis 17S, for treatment of industrial wastewater // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2017. Vol. 72. N 4. P. 235–240. Saitou N., Nei M. The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees // Mol. Biol. Evol. 1987. N 4. P. 406–425. Liu Y., Du J., Lai Q., Zeng R., Ye D., Xu J., Shao Z. Proposal of nine novel species of the Bacillus cereus group // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2017. Vol. 67. N 8. P. 2499–2508. Stackebrandt E., Ebers J. Taxonomic parameters revisited: tarnished gold standards // Microbiol. Today. 2006. Vol. 33. N 4. P. 152–155. Chatterjee D.K., Kilbane J.J., Chakrabarty A.M. Biodegradation of 2,4,5-trichlorophe- noxyacetic acid in soil by a pure culture of Pseudomonas cepacia // Appl. Environ. Microbiol. 1982. Vol. 44. N 2. P. 514–516. Rice J.F., Menn F.M., Hay A.G., Sanseverino J., Sayler G.S. Natural selection for 2,4,5-trichlorophenoxyacetic acid mineralizing bacteria in agent orange contaminated soil // Biodegradation. 2005. Vol. 16. N 6. P. 501–512. Zhurenko E.Yu., Markusheva T.V., Galkin E.G., Korobov V.V., Zharikova N.V., Gafiyatova L.R. Gluconobacter oxydans IBRB-2T Degrades 2,4,5- Thrichlorophenoxyacetic Acid // Biotechnol. Russ. 2003. N 6. P. 75–80. Жарикова Н.В., Журенко Е.Ю., Коробов В.В., Ясаков Т.Р., Анисимова Л.Г., Маркушева Т.В., Абрамов С.Н. Выделение и анализ биодеградационного потенциала нового природного штамма-деструктора хлорфеноксикислот рода Rhodococcus // Изв. Самар. Науч. центра РАН. 2011. Т. 13. № 5–2. С. 169–171. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/197 2015-07-23T20:09:03Z jour:%D0%A1%D0%A2 driver

PHYLOGENETIC RELATIONSHIPS IN FAGOPYRUM SPECIES BASED ON NUCLEOTIDE POLYMORPHISM OF b/c INTRON OF NAD1 GENE ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОТНОШЕНИЯ У ВИДОВ FAGOPYRUM, ОСНОВАННЫЕ НА ДАННЫХ АНАЛИЗА b/c ИНТРОНА ГЕНА NAD1 G. D. Kadyrova N. N. Ryzhova E. Z. Kochieva Г. Д. Кадырова Н. Н. Рыжова Е. З. Кочиева эволюция. polymorphism mitochondrial genome evolution. эволюция. полиморфизм митохондриальный геном эволюция. The sequence analysis of b/c intron of nadl mitochondrial gene in 13 Fagopyrum species was carried out and demonstrated ability of this intron to use in phylogenetic studies. The length of the mitochondrial nadl b/c intron varied from 1217 bp in F. tataricum, F. cymosum, F. giganteum to 1239 bp in F. capillatum. Species- and accession- specific SNPs and indels were detected. For obtained molecular phylogeny of Fagopyrum species a good agreement with the recognized taxo- nomic divisions within the genus was observed. NJ and MP trees showed a clear clustering into two major genetic groups: cymosum and urophyllum. The urophyllum group was characterized by the presence of several synapomorphic characters including 11 bp insert flanked by directrepeats. Впервые был охарактеризован b/c интрон гена nadl 13 видов Fagopyrum и показана возможность использования интрона гена nadl для идентификации видов гречихи. Размеры b/c интрона гена nadl варьировали от 1217 п.н. (F. tataricum, F. cymosum) до 1239 п.н. (F. capil- latum). Были определены видоспецифичные SNPs и индели. Полученная филогения рода совпала с основанной на морфологических признаках. NJ и MP дендрограммы выявили четкое разделение анализируемых видов на две основные группы: cymosum и urophyllum. Группа видов urophyllum характеризовалась присутствием нескольких синапоморфных замен и инделей, включая 11-нуклеотидную вставку, фланкированную прямыми повторами.  Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-23 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/197 10.1234/XXXX-XXXX-2010-4-36-38 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 4 (2010); 36-38 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 4 (2010); 36-38 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2010-4 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/197/196 Yamane K., Yasui Y, Ohnishi O. Intraspecific cpDNA gopyrum cymosum (Polygonaceae) // Am. J. Bot. 2003. Vol. 90. variation of diploid and tetraploid perennial buckwheat, Fa- P. 339—346. Campbell C.G. Buckwheat. Fagopyrum esculentum Moench // International Plant Genetic Resources Institute. Rome, Italy, 1997. 95 p. Ohsako T., Yamane K., Ohnishi O. Two new Fagopyrum (Polygonaceae) species F.gracilipedoides and F.jinshaense from Yunnan, China // Genes and Genet. Syst. 2002. N 77. P. 399—408. Yasui Y., Ohnishi O. Interspecific relationships in Fagopyrum (Polygonaceae) revealed by the nucleotide sequen¬ces of the rbcL and accD genes and their intergenic region // Am. J. Bot. 1998a. Vol. 85. P. 1134—1142. Cameron K.M. On the value of nuclear and mitochon- drial gene sequences for reconstructing the phylogeny of vanilloid orchids (Vanilloideae, Orchidaceae) // Ann. Bot. 2009. Vol. 104(3). P. 377—385. Edwards K., Johnstone C., Thompson C. A simple and rapid method for the preparation of plant genomic DNA for PCR analysis // Nucl. Acids Res. 1991. Vol. 19(6). Ð. 1349. Demesure B., Sodzi N., Petit R.J. A set of universal primers for amplication of polymorphic non-coding regions of mitochondrial and chloroplast DNA in plants // Molec. Ecol. 1995. Vol.4. P. 129—131. Sharma T.R., Jana S. Species relationships in Fago- pyrum revealed by PCR-based DNA fingerprinting // Theor. Appl. Genet. 2002. Vol. 105. P. 306—312. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1270 2023-12-04T08:03:04Z jour:STM driver

Growth of mesenchymal stem cells on oriented microstructured films and electrospun scaffolds Рост мезенхимальных стволовых клеток на ориентированных микроструктурированных пленках и электроформованных скаффолдах I. V. Demianova E. A. Akoulina I. I. Zharkov V. V. Voinova D. V. Chesnokova A. M. Hossain T. K. Makhina G. A. Bonartseva V. I. Kulikouskaya V. V. Nikolaichuk Yu. R. Mukhortova A. S. Pryadko M. A. Surmeneva R. A. Surmenev K. V. Shaitan A. P. Bonartse И. В. Демьянова Е. А. Акулина И. И. Жаркова В. В. Воинова Д. В. Чеснокова А. М. Хоссаин Т. К. Махина Г. А. Бонарцева В. И. Куликовская В. В. Николайчук Ю. Р. Мухортова А. С. Прядко М. А. Сурменева Р. А. Сурменев К. В. Шайтан А. П. Бонарцев мезенхимальные стволовые клетки microstructured spin coating self-assembly oriented mesenchymal stem cells мезенхимальные стволовые клетки микроструктурированный спин-коутинг самоорганизация ориентированный мезенхимальные стволовые клетки The study involved the fabrication of films with different roughness and scaffolds made of poly(3-hydroxybutyrate) using various methods. Chaotic and oriented scaffolds with varying fiber thickness were obtained through the electrospinning method, depending on the polymer concentration and electrospinning parameters. Films with different surface roughness were obtained using spin coating and self-assembly methods. It was demonstrated that the varying microstructure of the surface does not affect the growth of mesenchymal stem cells over the course of a week; however, it does influence the morphology of the adhered cells. В работе получены пленки и скаффолды из поли-3-оксибутирата с различной микроструктурой тремя различными методами. Методом электроформования получены скаффолды с ориентированными и хаотично переплетенными волокнами различной толщины в зависимости от используемых параметров. Методами спин-коутинга и самоорганизации получены пленки с различной микроструктурой поверхности, в том числе с ориентированными элементами топографии. Показано, что микроструктура поверхности не влияет на рост мезенхимальных стволовых клеток в течение недели, однако оказывает влияние на морфологию прикрепленных клеток. Lomonosov Moscow State University, School of Biology This research was funded by the Russian Science Foundation, project number. 20-64- 47008 (in part of the development of electrospun scaffolds and study of their morphology and biocompatibility in vitro Faculty of Biology, Lomonosov Moscow State University), and was supported by the Ministry of Science and Higher Education, grant agreement number 075-15- 2021-588 dated June 1, 2021 (in part of research and analysis by Raman spectroscopy Tomsk Polytechnic University). Исследование выполнено при финансовой поддержке Российского научного фонда (проект №20-64-47008) – разработка скаффолдов, полученных методом электроформования и изучение их морфологии и биосовместимости in vitro (биологический факультет Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова) и Министерства науки и высшего образования (грантовое соглашение №075-15-2021-588 от 1 июня 2021 г.) – исследование и анализ методом спектроскопии комбинационного рассеяния (Томский политехнический университет). Работы проведены без использования животных и без привлечения людей в качестве испытуемых. 2023-11-30 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1270 10.55959/MSU0137-0952-16-78-3S-6 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 78, № 3S (2023); 33-39 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 78, № 3S (2023); 33-39 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1270/641 Werner M., Blanquer S.B.G., Haimi S., Korus G., Dunlop J.W.C., Duda G.N., Grijpma D.W., Petersen A. Surface curvature differentially regulates stem cell migration and differentiation via altered attachment morphology and nuclear deformation. Adv. Sci. 2017;4(2):1600347. Van der Flier L.G., Clevers H. Stem cells, selfrenewal, and differentiation in the intestinal epithelium. Annu. Rev. Physiol. 2009;71:241–260. Prittinen J., Zhou X., Bano F., Backman L., Danielson P. Microstructured collagen films for 3D corneal stroma modelling. Connect. Tissue Res. 2022;63(5):443–452. Kim E.J., Boehm C.A., Mata A., Fleischman A.J., Muschler G.F., Roy S. Post microtextures accelerate cell proliferation and osteogenesis. Acta Biomater. 2010;6(1):160–169. Koh L.B., Rodriguez I., Venkataraman S.S. The effect of topography of polymer surfaces on platelet adhesion. Biomaterials. 2010;31(7):1533–1545. Li L., Chen C., Li J., Zhang A., Liu X., Xu B., Gao S., Jin G., Ma Z. Robust and hydrophilic polymeric films with honeycomb pattern and their cell scaffold applications. J. Mater. Chem. 2009;19(18):2789–2796. Norrman K., Ghanbari-Siahkali A., Larsen N.B. 6 Studies of spin-coated polymer films. Annu. Rep. Prog. Chem., Sect. C: Phys. Chem. 2005;101:174–201. Dong W., Zhou Y., Yan D., Mai Y., He L., Jin C. Honeycomb-structured microporous films made from hyperbranched polymers by the breath figure method. Langmuir. 2009;25(1):173–178. Tokaruk W.A., Molteno T.C.A., Morris S.W. Bénard-Marangoni convection in two-layered liquids. Phys. Rev. Lett. 2000;84(16):3590–3593. Wong K.H., Hernández-Guerrero M., Granville A.M., Davis T.P., Barner-Kowollik C., Stenzel M.H. Water-assisted formation of honeycomb structured porous films. J. Porous Mater. 2006;13(3):213–223. Bondartsev A.P., Bonartseva G.A., Reshetov I.V., Shaitan K.V., Kirpichnikov M.P. Application of polyhydroxyalkanoates in medicine and the biological activity of natural poly(3-hydroxybutyrate). Acta Naturae. 2019;11(2):4–16. Sunami H., Ito E., Tanaka M., Yamamoto S., Shimomura M. Effect of honeycomb film on protein adsorption, cell adhesion and proliferation. Colloids Surf. A Physicochem. Eng. Asp. 2006;284–285:548–551. Xue J., Wu T., Dai Y., Xia Y. Electrospinning and electrospun nanofibers: Methods, materials, and applications. Chem. Rev. 2019;119(8):5298–5415. Demina T.S., Bolbasov E.N., Peshkova M.A., Efremov Y.M., Bikmulina P.Y., Birdibekova A.V., Popyrina T.N., Kosheleva N.V., Tverdokhlebov S.I., Timashev P.S., Akopova T.A. Electrospinning vs. electro-assisted solution blow spinning for fabrication of fibrous scaffolds for tissue engineering. Polymers. 2022;14(23):5254. Bonartsev A.P., Zharkova I.I., Voinova V.V., Kuznetsova E.S., Zhuikov V.A., Makhina T.K., Myshkina V.L., Potashnikova D.M., Chesnokova D.V., Khaydapova D.D., Bonartseva G.A., Shaitan K.V. Poly(3-hydroxybutyrate)/poly(ethylene glycol) scaffolds with different microstructure: the effect on growth of mesenchymal stem cells. 3 Biotech. 2018;8(8):328. Pryadko A.S., Mukhortova Y.R., Chernozem R.V., et al. Electrospun magnetic composite poly-3-hydroxybutyrate/magnetite scaffolds for biomedical applications: Composition, structure, magnetic properties, and biological performance. ACS Appl. Bio Mater. 2022;5(8):3999–4019. Kulikouskaya V.I., Nikalaichuk V.V., Bonartsev A.P., Akoulina E.A., Belishev N.V., Demianova I.V., Chesnokova D.V., Makhina T.K., Bonartseva G.A., Shaitan K.V., Hileuskaya K.S., Voinova V.V. Honeycomb-structured porous films from poly(3-hydroxybutyrate) and poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyvalerate): Physicochemical characterization and mesenchymal stem cells behavior. Polymers (Basel). 2022;14(13):2671. Stalder A. F., Kulik G., Sage D., Barbieri L., Hoffmann P. A snake-based approach to accurate determination of both contact points and contact angles. Colloids Surf. A Physicochem. Eng. Asp. 2006;286(1–3):92–103. Yusop N., Battersby P., Alraies A., Sloan A.J., Moseley R., Waddington R.J. Isolation and characterisation of mesenchymal stem cells from rat bone marrow and the endosteal niche: A comparative study. Stem Cells Int. 2018;2018:6869128. Kumar P., Nagarajan A., Uchil P.D. Analysis of cell viability by the MTT assay. Cold Spring Harb. Protoc. 2018;2018(6):469–472. Özen A., Gül Sancak İ., Tiryaki M., Ceylan A., Alparslan Pınarlı F., Delibaşı T. Mesenchymal stem cells (Mscs) in scanning electron microscopy (SEM) world. Niche. 2013;2:22–24. Furukawa T., Sato H., Murakami R., Zhang J., Noda I., Ochiai S., Ozaki Y. Raman microspectroscopy study of structure, dispersibility, and crystallinity of poly (hydroxybutyrate)/poly (l-lactic acid) blends. Polymer. 2006;47(9):3132–3140. Furukawa T., Sato H., Murakami R., Zhang J., Duan Y.X., Noda I., Shukichi O., Ozaki Y. Structure, dispersibility, and crystallinity of poly(hydroxybutyrate)/poly(l-lactic acid) blends studied by FT-IR microspectroscopy and differential scanning calorimetry. Macromolecules. 2005;38(15):6445–6454. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/229 2015-07-24T19:41:04Z jour:%D0%A1%D0%A2 driver

COMPLETE MITOCHONDRIAL GENOME SEQUENCE OF D. LITTORALIS (DIPTERA: DROSOPHILIDAE): COMPARATIVE ANALYSIS OF THE MITOCHONDRIAL GENOMES IN DROSOPHILA VIRILIS SPECIES GROUP ПОЛНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ МИТОХОНДРИАЛЬНОГО ГЕНОМА D. LITTORALIS (DIPTERA: DROSOPHILIDAE): СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ ГЕНОМОВ В ГРУППЕ ДРОЗОФИЛ VIRILIS S. Yu. Sorokina B. V. Andrianov V. G. Mitrofanov С. Ю. Сорокина Б. В. Андрианов В. Г. Митрофанов Drosophila littoralis. nucleotide sequence intergenic spacer Tv1 retrotransposone Drosophila littoralis. Drosophila littoralis. нуклеотидная последовательность межгенный спейсер псевдоген ретротранспозон Tv1 Drosophila littoralis. An analysis of the complete sequence of D. littoralis mitochondrial genome (mt-genome) is presented. The basic characters of the mt-genome, such as size, nucleotide composition, genes order, as well as a degree of purifying selection pressure on different parts of the mt-genome are reported. The features of protein-coding genes and tRNA genes are discussed. The structure of mtDNA control region and intergenic spacers in the virilis group are presented. The fragments of mitochondrial genes atp6 and cox3 were found in the nuclear genome of D. virilis. The evolution history of mitochondrial and nuclear genes data indicates that mitochondrial gene transfer to the nucleus is a recent event and connected to the activity of retrotransposons.  Представлен анализ полной последовательности митохондриального (мт) генома D. littoralis. Приведены его основные характеристики, размер, нуклеотидный состав, последовательность генов, а также степень давления стабилизирующего отбора на разные участки генома. Обсуждены особенности структуры белок-кодирующих генов и генов тРНК. Приведена структура некодирующих районов: контрольного района и межгенных спейсеров мтДНК группы virilis. Найдены фрагменты мт-генов atp6 и cox3 в ядерном геноме D. virilis. Эволюционная история митохондриальных и ядерных последовательностей этих генов указывает на то, что процесс образования мт-псевдогенов идет в настоящее время и связан с активностью ретротранспозонов.  Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-24 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/229 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 4 (2010); 108-111 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 4 (2010); 108-111 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2010-4 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/229/227 Throckmorton L.H. The virilis species group // The genetics and biology of Drosophila / Eds. M. Ashburner, H.L.Carson, J.N. Thompson. London: Academic Press, 1982. 3b. P. 227—296. Митрофанов В.Г., Полуэктова Е.В. Инверсионный полиморфизм в природной популяции Drosophila imere- tensis Sokolov (D. littoralis Meig.) // Генетика. 1982. Т. 18. № 11. C. 1849—1855. Гончаренко Г.Г., Митрофанов В.Г., Корочкин Л.И. Изучение генотипической структуры Drosophila imeretensis Sokolov (D. littoralis Meigen) в географически разделенных популяциях Краснодарского края и Белоруссии // Докл. АН СССР. 1984. Т. 279. № 1. C. 216—219. Андрианов Б.В., Сорокина С.Ю., Мюге Н.С., Резник Н.Л., Митрофанов В.Г. Популяционная динамика митохондриального полиморфизма в природной популя-ции Drosophila littoralis // Генетика. 2008. Т. 44. № 2. С. 195—201. Clary D.O., Wolstenholme D.R. The mitochondrial DNA molecule of Drosophila yakuba: Nucleotide sequence, gene organization, and genetic code // J. Mol. Evol. 1985. Vol. 22. N 3. P. 252—271. Montooth K., Abt D., Hofmann J., Rand D. Comparati¬ve genomics of Drosophila mtDNA: Novel features of conservation and change across functional domains and lineages // J. Mol Evol. 2009. Vol. 69. N 1. P. 94—114. Saito S., Tamura K., Aotsuka T. Replication origin of mitochondrial DNA in insects // Genetics. 2005. Vol. 171. N 4. P. 1695—1705. Andrianov B.V., Zakharyev V.M., Reznik N.L., Gorelo- va T.V., Evgen'ev M.B. Gypsy group retrotransposon Tv1 from Drosophila virilis // Gene. 1999. Vol. 239. N 1. P. 193—199. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1377 2024-08-27T16:30:17Z jour:REVI driver

Cytokines – regulators of immunity Цитокины – регуляторы иммунитета S. A. Nedospasov С. А. Недоспасов транскрипционные факторы receptors adapters protein kinases transcription factors транскрипционные факторы рецепторы адаптеры белок-киназы транскрипционные факторы This short review focuses on cytokines, molecular mediators of immunity and many other physiological functions of the body. Research on cytokines revealed new principles of cell-tocell communications and new paradigms in intracellular signal transduction. A few recombinant cytokines and, paradoxically, some cytokine inhibitors found practical use in medicine. Этот небольшой обзор посвящен цитокинам – молекулярным медиаторам иммунитета и многих других физиологических функций организма. Наука о цитокинах открыла новые принципы коммуникаций между клетками и новые парадигмы передачи внутриклеточного сигнала. В практической медицине нашли свое применение как некоторые рекомбинантные цитокины, так и – парадоксально – ингибиторы цитокинов. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2024-08-22 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1377 10.55959/MSU0137-0952-16-79-2S-3 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 79, № 2S (2024); 16-21 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 79, № 2S (2024); 16-21 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1377/678 Иммунология по Ярилину: учебник, 2-е изд., испр. и доп. Под ред. С.А. Недоспасова и Д.В. Купраша. Москва: ГЭОТАР-Медиа; 2021. 808 с. Dinarello C.A. Overview of the IL-1 family in innate inflammation and acquired immunity. Immunol. Rev. 2018;281(1):8–27. Locksley R.M, Killeen N, Lenardo M.J. The TNF and TNF receptor superfamilies: integrating mammalian biology. Cell. 2001;104(4):487–501. de Weerd N.A, Nguyen T. The interferons and their receptors—distribution and regulation. Immunol. Cell Biol. 2012;90(5):483–491. Leonard W.J, Lin J.X, O’Shea J.J. The γc family of cytokines: Basic biology to therapeutic ramifications. Immunity. 2019;50(4):832–850. Hercus T.R., Kan W.L.T, Broughton S.E., et al. Role of the β common (βc) family of cytokines in health and disease. Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 2018;10(6):a028514. Wang X, Lupardus P, Laporte S.L., Garcia K.C. Structural biology of shared cytokine receptors. Annu. Rev. Immunol. 2009;27:29–60. Vignali D.A., Kuchroo V.K. IL-12 family cytokines: immunological playmakers. Nat. Immunol. 2012;13(8):722–728. Sabbah D.A, Hajjo R, Sweidan K. Review on epidermal growth factor receptor (EGFR) structure, signaling pathways, interactions, and recent updates of EGFR inhibitors. Curr. Top. Med. Chem. 2020;20(10):815–834. Heldin C.H, Moustakas A. Signaling receptors for TGF-β family members. Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 2016;8(8):a022053. Allen S.J, Crown S.E, Handel T.M. Chemokine: receptor structure, interactions, and antagonism. Annu. Rev. Immunol. 2007;25:787–820. Monaco C., Nanchahal J., Taylor P., Feldmann M. Anti-TNF therapy: past, present and future. Int. Immunol. 2015;27(1):55–62. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/451 2017-05-30T11:39:12Z jour:EC driver

CARBON DIOXIDE EXCHANGE IN THE NEEDLES OF THE COMMON SPRUCE OF SOUTHERN TAIGA SPRUCE FORESTS УГЛЕКИСЛОТНЫЙ ГАЗООБМЕН ХВОИ ЕЛИ ЕВРОПЕЙСКОЙ В ЮЖНОТАЁЖНОМ ЕЛЬНИКЕ A. K. Yuzbekov D. G. Zamolodchikov А. К. Юзбеков Д. Г. Замолодчиков освещённость spruce fir net photosynthesis respiration temperature illumination освещённость ель европейская нетто-фотосинтез дыхание температура освещённость The dynamics of carbon dioxide exchange in the common spruce (Picea abies L.) in relation to environmental factors was monitored for several seasons. A direct linear dependence of photosynthesis intensity on the levels of air temperature and illumination was established (the correlation coefficient was 0,860 (p <0.001) and 0,704 (p <0.001)). It was revealed that the seasonal maximum of net photosynthesis production was attained at temperatures of 23–25°C. A decrease in temperature optimum was associated with a reduced level of CO2 assimilation intensity. The impact of environmental factors on photosynthesis intensity was considered in terms of a model developed by us. Using the model, we demonstrated that the temperature and illumination dynamics in toto accounts for 82% of changes in photosynthesis intensity. It is the air temperature that exerts the strongest influence on the process of photosynthesis. According to our calculations, the net photosynthesis level was three times higher than the respiration level. This is indicative of a positive carbon dioxide balance in the needles of the common spruce. Путём анализа динамики углекислотного газообмена хвои ели европейской (Picea abies L.) и факторов внешней среды в течение нескольких сезонов установлена прямая линейная зависимость интенсивности фотосинтеза от температуры воздуха и освещённости (коэффициенты корреляции составили 0,860 (р < 0,001) и 0,704 (р < 0,001), соответственно). Выявлено, что сезонный максимум нетто-фотосинтеза наблюдается при температуре 23– 25°С; с понижением оптимума температуры отмечено уменьшение интенсивности ассимиляции СО2. На основе разработанной модели воздействий внешних факторов на интенсивность фотосинтеза показано, что в совокупности колебания температуры и освещённости позволяют объяснить 82% вариации интенсивности фотосинтеза; при этом температура воздуха оказывает наиболее сильное влияние на этот процесс. Согласно расчётам, величина нетто-фотосинтеза превышала уровень светового дыхания в три раза, что свидетельствует о положительном углекислотном балансе хвои ели европейской. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2017-04-24 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/451 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 72, № 2 (2017); 106-112 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 72, № 2 (2017); 106-112 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/451/387 Dixon R.K., Solomon A.M., Brown S., Houghton R.A., Trexler M.C., Wisniewski J. Carbon pools and flux of global forest ecosystems // Science. 1994. Vol. 263. N 5144. P. 185–190. Zamolodchikov D.G., Grabovskii V.I., Kraev G.N. A twenty year retrospective on the forest carbon dynamics in Russia // Contemp. Probl. Ecol. 2011. Vol. 4. N 7. P. 706–715. Goodale C.L., Apps M.J., Birdsey R.A., Field C.B., Heath L.S., Houghton R.A., Jenkins J.C., Kohlmaier G.H., Kurz W., Liu S., Nabuurs G.-J., Nilsson S., Shvidenko A.Z. Forests carbon sinks in the Northern Hemisphere // Ecol. Appl. 2002 .Vol. 12. N 3. Р. 891–899. Pan Y., Birdsey R.A., Fang J. et al. A large and persistent carbon sink in the world’s forests // Science. 2011. Vol. 333. N 6045. Р. 988–993. Field C.B, Kaduk J. The carbon balance of an oldgrowth forest: building across approaches // Ecosystems. 2004. Vol. 7. N 5. Р. 525–533. Luyssaert S., Schulze E.-D., Borner A., Knohl A., Hessenmoller D., Law B.E., Ciais P., Grace J. Old-growth forests as global carbon sinks // Nature. 2008. Vol. 455. N 7210. Р. 213–215. Yuzbekov A.K., Zamolodchikov D.G., Ivashchenko A.I. Spruce fir photosynthesis in the forest ecosystems of the log Tayezhnyi test area // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2014. Vol. 69. N 4. Р. 169–172. Karelin D.V., Zamolodchikov D.G., Zukert N.V., Chestnykh O.V., Pochikalov A.V., Kraev G.N. Interannual changes in PAR and soil moisture during warm season may be more important than temperature fluctuations in directing annual carbon balance in Tundra // Biol. Bull. Rev. 2013. Vol. 3. N 5. Р. 371–387. Gaumont-Guay D., Margolis H.A., Bigras F.J., Raulier F. Characterizing the frost sensitivity of black spruce photosynthesis during cold acclimation // Tree Physiol. 2003. Vol. 23. N 5. Р. 301–311. Saunders M., Tobin B., Black K., Gioria M., Nieuwenhuis M., Osborne B.A. Thinning effects on the net ecosystem carbon exchange of a Sitka spruce forest are temperature- dependent // Agr. Forest Meteorol. 2012. Vol. 157. N 5. Р. 1–10. Stinziano J.R., Hüner N.P.А., Way D.A. Warming delays autumn declines in photosynthetic capacity in a boreal conifer, Norway spruce (Picea abies) // Tree Physiol. 2015. Vol. 35. N 12. P. 1303–1313. Бобкова К.С., Тужилкина В.В. Углеродный цикл в еловых экосистемах // Коренные еловые леса севера: биоразнообразие, структура, функции / Под. ред. К.С. Бобковой, Э.П. Галенко. СПб: Наука, 2006. С. 265–288. Щербатюк А.С., Русакова Л.В., Суворова Г.Г., Янькова Л.С. Углекислотный газообмен хвойных Предбайкалья. Новосибирск: Наука, 1991. 135 с. Way D.A., Sage R.F. Thermal acclimation of photosynthesis in black spruce [Picea mariana (Mill.) B.S.P] // Plant Cell Environ. 2008. Vol. 31. N 9. Р. 1250–1262. Суворова Г.Г., Янькова Л.С., Копытова Л.Д., Филиппова А.К. Максимальная интенсивность фотосинтеза сосны обыкновенной и ели сибирской в Предбайкалье // Сиб. экол. журн. 2005. № 1. С. 97–108. Юзбеков А.К., Магомедов И.М. Влияние температуры на синтез карбоксилирующих ферментов в этиолированных листьях растений с С3 – и С4 – путем фотосинтеза на свету // Фотосинтез, дыхание и органические кислоты / Под ред. А.А. Землянухина, В.В. Полевого. Воронеж: Изд-во Воронеж. ун-та, 1980. С. 37–42. Cannell M.G.R., Thornley J.H.M. Modelling the components of plant respiration: some guiding principles // Ann. Bot. 2000. Vol. 85. N 1. P.45–54. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/525 2018-01-23T16:15:09Z jour:MA driver

NEW RECORD OF RED ALGA THOREA HISPIDA (THORE) DESV. (RHODOPHYTA) IN THE MOSKVA RIVER ОБНАРУЖЕНИЕ КРАСНОЙ ВОДОРОСЛИ THOREA HISPIDA (THORE) DESV. (RHODOPHYTA) В РЕКЕ МОСКВЕ A. A. Georgiev G. A. Belyakova D. A. Chudaev M. L. Georgieva M. A. Gololobova А. А. Георгиев Г. А. Белякова Д. А. Чудаев М. Л. Георгиева М. А. Гололобова Красная книга red algae Rhodophyta morphology conservation status of species Moskva River Red List Красная книга красные водоросли Rhodophyta морфология природо-охранный статус вида река Москва Красная книга In Moscow Oblast Thorea hispida (Thore) Desv. was first time recorded at the beginning of the 20th century. Subsequently T. hispida was found in the Moskva River within the territory of Moscow City in 2004 where it still occurs. This species is included in the Red List of Russia, the Red List of Moscow Oblast and in the Red Lists of some European countries. In this paper authors present new data on the distribution of T. hispida in the Moskva River and discuss some problems concerning the morphology and conservation status of this species. В Московской области вид Thorea hispida (Thore) Desv. впервые был обнаружен в начале XX века. Впоследствии он был найден в реке Москве на территории города Москвы только в 2004 г., где с этого времени выявляется ежегодно. T. hispida включен в Красную книгу РФ и Красные книги некоторых европейских стран. В настоящей работе представлены новые данные о распространении Т. hispida в реке Москве, приведены результаты морфологического изучения данного вида и рассмотрены некоторые проблемы, касающиеся его охранного статуса. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2018-01-23 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/525 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 73, № 1 (2018); 38-42 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 73, № 1 (2018); 38-42 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/525/422 AlgaeBase [Электронный ресурс]. 2017. URL: http://www.algaebase.org (дата обращения: 29.10.2017). Temniskova D., Stoyneva M.P., Kirjakov I.K. Red List of the Bulgarian algae. I. Macroalgae // Phytol. Balcan. 2008. Vol. 14. N 2. P. 193–206. Hindak F., Hindakova A. Red list of cyanophytes and algae of Slovakia // Red list of plants and animals of Slovakia / Eds. D. Balaz, K. Marhold, and P. Urban. Ochrana Prirody, 2001. Р. 14–22. Rote Liste gefährdeter Pflanzen Deutschlands // Schriftenreihe für Vegetationskunde / Eds. G. Ludwig and M. Schnittler. Landwirtschaftsverlag, 1996. Р. 1–277. Vitonytė I. First record of red algae Thorea hispida in Lithuanian freshwaters // Bot. Lith. 2011. Vol. 17. N 4. P. 165–175. Sieminska J. Red list of algae in Poland // Red List of plants and fungi in Poland / Eds. Z. Mirek, K. Zarzycki, W. Wojewoda, and Z. Szeląg. Kraków: Polish Academy of Science, 2006. P. 37–52. Simić S., Pantović N. Observation on the rare algae Thorea hispida (Thore) Desvaux (Rhodophyta) from Serbia // Cryptogamie: Algol. 2010. Vol. 31. N 3. P. 343–353. Догадина Т.В., Громакова А.Б., Горбулин О.С. Новая находка представителя Rhodophyta из р. Северский Донец (Украина) // Альгология. 2009. Т. 19. № 3 С. 313–317. IUCN Red List of Threatened Species [Электронный ресурс]. 2017. URL: htpp://www.iucnredlist.org (дата обращения: 29.10.2017). Усачёва И.С. Водоросли водоемов Московской области. Основы изучения видового разнообразия. М.: ИВП РАН, 2002. 140 с. Белякова Г.А. Торея реснитчатая [Электронный ресурс] // Красная книга Российской Федерации 2017. URL: https://cicon.ru/toreya-resnitchataya.html (дата обращения: 29.10.2017). Sheath R.G., Vis M.L., Cole K.M. Distribution and systematics of the freshwater red algal family Thoreaceae in North America // Eur. J. Phycol. 1993. Vol. 28. N 4. P. 231–241. Bolpagni R., Amadio C., Johnston E.T., Racchetti E. New physical and chemical perspectives on the ecology of Thorea hispida (Thoreaceae) // J. Limnol. 2015. Vol. 74. N 2. P. 294–301. John D.M., Johnson L.R., Moore J.A. Observations on Thorea ramosissima Bory (Batrachospermales, Thoreaceae), a freshwater red alga rarely recorded in the British Isles // Brit. Phycol. J. 1989. Vol. 24. N 1. P. 99–102. Simić S.B., Đorđević N.B., Vasiljević B.M. New Record of Red Alga Thorea hispida (Thore) Desvaux (Rhodophyta) in the River Sava (Sremska Mitrovica, Serbia) // Water Resour. Manag. 2014. Vol. 4. N 1. P. 47–52. Carmona J.J., Necchi O., Jr. Systematics and distribution of Thorea (Thoreaceae, Rhodophyta) from central Mexico and south-eastern Brazil // Phycol. Res. 2001. Vol. 49. N 3. P. 231–239. Sato H., Yokoyama T., Madono K., Tsuji M., Mizuno M., Uodome T., Senoo Y., Sugino N., Nagano M., Mitsuhashi H., Asami K., Michioku K., Harada H. Occurrence patterns of the gametophyte of Thorea okadae (Rhodophyta) in the Yasumuro River, Kamigori, Hyogo Prefecture, Japan, with special reference to variations in river-water discharge // Jpn J. Limnol. 2006. Vol. 67. N 2. P. 127–133. Necchi O., Jr., Carmona J.J. Somatic meiosis and development of the juvenile gametophyte in members of the Batrachospermales sensu lato (Rhodophyta) // Phycologia. 2002. Vol. 41. N 4. P. 340–347. Necchi O., Jr., Oliveira M.C. Phylogenetic affinities of “Chantransia” stages in members of the Batrachospermales and Thoreales (Rhodophyta) // J. Phycol. 2011. Vol. 47. N 3. P. 680–686. Swale E.M.F. The development and growth of Thorea ratnosissima Bory // Ann. Bot. 1962. Vol. 26. N 1. P. 105–116. Eloranta P., Kwandrans J. Indicator value of freshwater red algae in running waters for water quality assessment // Oceanol. Hydrobiol. St. 2004. Vol. 33. N 1. P. 47–54. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/139 2015-07-22T18:29:45Z jour:MIC driver

DYNAMICS OF A SURVIVAL OF ENTEROPATHOGENIC AND SAPROTROPHIC BACTERIA AT PASSAGE THROUGH A DIGESTIVE PATH OF BIRDS, IN THEIR EXCREMENT AND IN WATER ДИНАМИКА ВЫЖИВАНИЯ ЭНТЕРОПАТОГЕННЫХ И САПРОТРОФНЫХ БАКТЕРИЙ ПРИ ПРОХОЖДЕНИИ ЧЕРЕЗ ПИЩЕВАРИТЕЛЬНЫЙ ТРАКТ ПТИЦ, В ИХ ЭКСКРЕМЕНТАХ И В ВОДЕ A. A. Koupriyanov A. M. Semenov A.H.C. Van Bruggen A. I. Netrusov E. V. Semenova А. А. Куприянов А. М. Семенов Арина Хендрика Корнелия Ван Бругген А. И. Нетрусов Е. В. Семенова вода dynamic of population survival birds dung water вода популяционная динамика выживание птицы экскременты вода Ability of saprotrophic Pseudomonas fluorescens 32 gfp and two enteropathogenic Salmonella enterica var. Typhimurium MAE 110 gfp and Escherichia coli O157:H7 bacteria to passage through gastroenteric path (GEP) of birds (domestic hens), dynamics of a survival of these bacteria in excrement of hens and in water after moving to one was traced. Выявлена способность сапротрофной Pseudomonas fluorescens 32 gfp и двух энтеропатогенных Salmonella enterica var. Typhimurium МАЕ 110 gfp и Escherichia coli O157:H7 gfp бактерий к прохождению через желудочно-кишечный тракт (ЖКТ) птиц (домашних кур),динамика выживания этих бактерий в экскрементах кур и при перемещении в воду. Курамскармливали комбикорм, инокулированный упомянутыми бактериями, в количестве 107 кл/гсух. комбикорма. В экскрементах кур учитывали количество выживших бактерий и иноку-лировали этими экскрементами нестерильную и стерильную прудовую воду. В воде в динамике учитывали меченые бактерии. Выявлена хорошая выживаемость всех исследуемыхбактерий во всех испытанных субстратах. Это указывает на возможность перемещения бактерий, в том числе опасных для человека, в природе через ряд субстратов и ниш в видецикла и инфицирования этих ниш и субстратов, в том числе используемых человекомв пищу. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-22 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/139 10.1234/XXXX-XXXX-2009-3-13-17 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 3 (2009); 13-17 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 3 (2009); 13-17 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2009-3 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/139/139 Бызов Б.А. 2003. Зоомикробные взаимодействия в почве: Автореф. дис. ... докт. биол. наук. М. Литвин В.Ю., Гинцбург А.Л., Пушкарева В.И., Романова Ю.М., Боев Б.В. 1997. Эпидемиологические аспекты экологии бактерий. М. Семенов A.M. 2005. Трофическое группирование и динамика развития микробных сообществ в почве и ризосфере: Автореф. дис. ... докт. биол. наук. М. Третьякова Е.Б., Добровольская Т.Г., Бызов Б.А., Звягинцев Д.Г. 1996. Сообщества бактерий, ассоциированные с почвенными беспозвоночными // Микробиология. 65. № 1. 102. Ушакова Н.А. 2006. Изучение мутуалистических взаимодействий микроорганизмов и животных и использование микросимбионтов в биотехнологических целях: Автореф. дис. ... докт. биол. наук. М. Altwegg M., Bockemuhl J. 1998. Escherichia and Shigella / Eds. A. Ballows, B.I. Duerden // Microbiology and microbial infections. Systematic Bacteriology. Vol. 2. London. P. 935—967. Asakura H., Makino S., Shirahata Т., Tsukamoto Т., Kurazono H., Ikeda Т., Ta -keshi K. 1998. Detection and genetical characterization of Shiga toxin-producing Escherichia coli from wild deer // Microbiol. Immunol. 42. P. 815—822. Bailey J.R., Warner L., Pritchard G.C., Williamson S., Carson Т., Willshaw G., Cheasty T. 2002. Wild rabbits — a novel vector for verocytotoxigenic Escherichia coli (VTEC) 0157 // Commun. Dis. Public Health. 5. 74—75. Martinez-Urtaza J., Saco M., Novoa J., Perez-Pineiro P., Peiteado J., Lozano-Le -on A., Garcia-Martin O. 2004. Influence of environmental factors and human activity on the presence of Salmonella serovars in a marine environment // Appl. Environ. Microbiol. 70. 2089—2097. McGee P., Scott L., Sheridan J.J., Ear -ley В., Leonard N. 2004. Horizontal transmission of Esgherichia coli O157:H7 during cattle housing // J. Food Prot. 67. 2651—2656. Newell D.G., Fearnley C. 2003. Sources of Campylobacter colonization in broiler chickens // Appl. Environ. Microbiol. 69. 4343—4351. Sojka R.E., Entry J.A. 2000. Influence of polyacrylamide application to soil on movement of microorganisms in runoff water // Environmental pollution. 108. 405—412. Van Bruggen A.H.C., Franz E., Seme -nov A.M. 2008. Human pathogens in organic and conventional foods and effects of the environment / Eds. I. Givens, S. Baxter, A.M. Minihane, E. Shaw // Health Benefits of Organic Food: Effects of the environment. Wallingford, UK. P. 160—189. Waldenstrom J., Ottval R., Hassel -quist D., Harrington C, Olsen B. 2003. Avian reservoirs and zoonotic potential of emerging human pathogen Helicobacter canadensis // Appl. Environ. Microbiol. 69. 7523—7526. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1095 2023-01-09T09:17:19Z jour:RA driver

Seasonal dynamics of phytoplankton in Chupa inlet (White Sea, Kandalaksha Bay) Сезонная динамика фитопланктона в губе Чупа (Белое море, Кандалакшский залив) I. G. Radchenko V. V. Smirnov N. V. Usov A. A. Sukhotin И. Г. Радченко В. В. Смирнов Н. В. Усов А. А. Сухотин потепление климата Subarctic seasonal dynamics phytoplankton abundance biomass dominant species climate warming потепление климата Субарктика сезонная динамика фитопланктон численность биомасса доминирующие виды потепление климата For the first time since 1994, in March–November 2017, the dynamics of the structure and abundance of phytoplankton was studied at different depths in the White Sea. The abundance of algae varied from 3.8∙106 to 3,519∙106 cells/m3. Phytoplankton biomass ranged from 0.2 to 90 mg C/m3 and, with some exceptions, was the highest in the surface layer of the water column (0–5 m). The algal abundance and biomass integrated throughout the water column varied from0.2∙109 to 68.5∙109 cells/m2 and 0.01 to 1.38 g C/m2, respectively. Two peaks of phytoplankton biomass were identified – in early May after the ice removal and in early September. The summer peak of biomass recorded by previous studies in the surface layers in July has not been observed, which was caused by the dominance of smaller nanoplankton prasinophyte and cryptophyte algae and dinoflagellates. The change of dominant species may be related to the general tendency of decrease of the contribution of large species and increase of the heterotrophic component in phytoplankton in conditions of more pronounced stratification of the water column caused by the climate warming. Впервые после 1994 г. в марте–ноябре 2017 г. в Белом море на разных глубинах исследована динамика структуры и обилия фитопланктона. Численность водорослей варьировала от 3,8∙106 до 3519∙106 кл/м3. Биомасса фитопланктона менялась от 0,2 до 90 мг С/м3 и, за некоторым исключением, была выше в верхних слоях толщи воды (0–5 м). Интегрированные на столб воды численность и биомасса водорослей изменялись от 0,2∙109 до 68,5∙109 кл/м2 и от 0,01 до 1,38 г С/м2 соответственно. В динамике биомассы фитопланктона выявлены два пика – в начале мая после схода ледового покрова и в начале сентября. Летний пик биомассы, регистрируемый предыдущими исследованиями в поверхностном слое воды в июле, не выявлен, что вызвано доминированием более мелких нанопланктонных празинофитовых и криптофитовых водорослей и динофлагеллят. Смена доминирующих видов, возможно, связана с общей тенденцией уменьшения вклада крупных видов и увеличения гетеротрофной составляющей в фитопланктоне в условиях более выраженной стратификации водной толщи моря, вызванной потеплением климата. Lomonosov Moscow State University, School of Biology Funding: Sampling was carried out within the framework of the State Task № 1021051402749-2 to the Zoological Institute of Russian Academy of Sciences. Identification of algae by a light microscope was performed within the framework of the State Task of Moscow State University, part 2 (topic № 121032300135-7). The analysis of samples by a scanning electron microscope was performed at the equipment of the User Facilities Center of M.V. Lomonosov Moscow State University with the financial support from the Ministry of Education and Science of the Russian Federation. The analysis of the phytoplankton structure was carried out within the framework of the Interdisciplinary Scientific and Educational School of Lomonosov Moscow State University «The Future of the planet and global environmental changes». Отбор проб выполнен в рамках Государственного задания Зоологического института РАН (№ 1021051402749-2). Идентификация водорослей под световым микроскопом выполнена в рамках Государственного задания МГУ имени М.В. Ломоносова часть 2 (тема № 121032300135-7). Анализ структуры фитопланктона выполнен в рамках Программы развития Междисциплинарной научно-образовательной школы Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова «Будущее планеты и глобальные изменения окружающей среды». 2022-03-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1095 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 77, № 1 (2022); 37-44 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 77, № 1 (2022); 37-44 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1095/579 Bindoff N.L., Cheung W.W.L., Kairo J.G. et al. Changing ocean, marine ecosystems, and dependent communities // IPCC Special Report on the Ocean and Cryosphere in a Changing Climate / Eds. H.-O. Pörtner, D.C. Roberts, V. Masson-Delmotte, P. Zhai, M. Tignor, E. Poloczanska, K. Mintenbeck, A. Alegría, M. Nicolai, A. Okem, J. Petzold, B. Rama, and N.M. Weyer. IPCC, 2019. P. 447–587. Bakhmet I., Sazhin A., Maximovich N., Ekimov D. In situ long-term monitoring of cardiac activity of two bivalve species from the White Sea, the blue mussel Mytilus edulisand horse mussel Modiolus modiolus // J. Mar. Biol. Assoc. U.K. 2019. Vol. 99. N 4. P. 833–840. Кокин К.А., Кольцова Т.И., Хлебович Т.В. Состав и динамика фитопланктона Карельского побережья Белого моря // Бот. журн. 1970. Т. 55. № 4. С. 499–509. Хлебович Т.В. Качественный состав и сезонные изменения численности фитопланктона в губе Чупа Белого моря // Сезонные явления в жизни Белого и Баренцева морей / Под ред. В.В. Хлебовича. Л.: Наука, 1974. С. 56–64. Гогорев Р.М. Сезонные изменения фитопланктона губы Чупа Белого моря // Новости систем. низш. раст. 2005. Т. 38. С. 38–47. Poole H.H., Atkins W.R.G. Photoelectric measures of submarine illumination throughout the year // J. Mar. Biol. Assoc. U.K. 1929. Vol. 16. N 1. P. 297–324. Guiry M.D., Guiry G.M. AlgaeBase [Электронный ресурс] // World-wide electronic publication, National University of Ireland, Galway. 2022. URL: http://www.algaebase.org (дата обращения: 30.01.2022). Menden-Deuer S., Lessard E.J. Carbon to volume relationships for dinoflagellates, diatoms, and other protist plankton // Limnol. Oceanogr. 2000. Vol. 45. N 3. P. 569–579. Usov N.V., Khaitov V.M., Kutcheva I.P., Martynova D.M. Phenological responses of the Arctic, ubiquitous, and boreal copepod species to long-term changes in the annual seasonality of the water temperature in the White Sea // Polar. Biol. 2021. Vol. 44. N 5. P. 959–976. Radchenko I., Smirnov V., Ilyash L., Sukhotin A. Phytoplankton dynamics in a subarctic fjord during the under-ice–open water transition // Mar. Environ. Res. 2021. Vol. 164: 105242. Ilyash L.V., Belevich T.A., Zhitina L.S., Radchenko I.G., Ratkova T.N. Phytoplankton of the White sea // The handbook of environmental chemistry, vol. 81 / Eds. D. Barceló and A.G. Kostianoy. Berlin; Heidelberg: Springer, 2018. P. 187–222. Ardyna M., Mundy C.J., Mills M.M., et al. Environmental drivers of under-ice phytoplankton bloom dynamics in the Arctic Ocean // Elem. Sci. Anth. 2020. Vol. 8: 30. Hodal H., Falk-Petersen S., Hop H., Kristiansen S., Reigstad M. Spring bloom dynamics in Kongsfjorden, Svalbard: nutrients, phytoplankton, protozoans and primary production // Polar Biol. 2012. Vol. 35. N 2. P. 191–203. Menden-Deuer S., Lawrence C., Franzè G. Herbivorous protist growth and grazing rates at in situ and artificially elevated temperatures during an Arctic phytoplankton spring bloom // PeerJ. 2018. 6: e5264. Levinsen H., Nielsen T.G. The trophic role of marine pelagic ciliates and heterotrophic dinoflagellates in arctic and temperate coastal ecosystems: a cross-latitude comparison // Limnol. Oceanogr. 2002. Vol. 47. N 2. P. 427–439. von Quillfeldt C. Common diatom species in Arctic spring blooms: Their distribution and abundance // Botanica Marina. 2000. Vol. 43. N 6. P. 499–516. Tiselius P., Kuylenstierna M. Growth and decline of a diatom spring bloom: Phytoplankton species composition, formation of marine snow and the role of heterotrophic dinoflagellates // J. Plankton Res. 1996. Vol. 18. N 2. P. 133–155. Rat’kova T.N. Phytoplankton composition in the White Sea Basin in summer–autumn 1998 and 1999 // Ber. Polarforsch. 2000. Vol. 359. P. 97–109. Ratkova T.N., Wassmann P. Sea ice algae in the White and Barents seas: composition and origin // Polar Res. 2005. Vol. 24. N 1–2. P. 95–110. Kraberg A., Baumann M., Durselen C.D. Coastal phytoplankton photo guide for northern European seas. München: Pfeil, Dr. Friedrich, 2010. 204 pp. Ilyash L.V., Zhitina L.S., Belevich T.A., Shevchenko V.P., Kravchishina M.D., Pantyulin A.N., Tolstikov A.V., Chultsova A.L. Spatial distribution of the phytoplankton in the White sea during atypical domination of dinoflagellates (July 2009) // Oceanology. 2016. Vol. 56. N 3. P. 372–381. Mousing E.A., Ellegaard M., Richardson K. Global patterns in phytoplankton community size structure – evidence for a direct temperature effect // Mar. Ecol. Prog. Ser. 2014. Vol. 497. P. 25–38. Ardyna M., Arrigo K.R. Phytoplankton dynamics in a changing Arctic Ocean // Nat. Clim. Chang. 2020. Vol. 10. N 10. P. 892–903. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/171 2015-07-23T17:40:51Z jour:PH driver

EFFICIENCY CULTIVATION HYDROBIONTS IN INTEGRATED RECIRCULATING SYSTEMS WITH SPATIAL DIFFERENTIATION OF BIOCOMPONENTS IN CONDITIONS OF CONSTANTS AND VARIABLE TEMPERATURES ЭФФЕКТИВНОСТЬ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ ГИДРОБИОНТОВ В ИНТЕГРИРОВАННЫХ РЕЦИРКУЛЯЦИОННЫХ СИСТЕМАХ С ПРОСТРАНСТВЕННЫМ РАЗГРАНИЧЕНИЕМ БИОКОМПОНЕНТОВ В УСЛОВИЯХ ПОСТОЯННЫХ И ПЕРЕМЕННЫХ ТЕМПЕРАТУР V. Ya. Pushkar V. V. Zdanovich В. Я. Пушкарь В. В. Зданович аквакультура efficiency cultivation integrated recirculating systems constants and variable temperatures, aquaculture аквакультура эффективность культивирования интегрированные рециркуляционные системы постоянные и переменные температуры аквакультура It is shown, that at cultivation hydrobionts in integrated recirculating systems more than twice ecological efficiency of use of food in comparison with a monoculture raises. The highest biological production and more effective utilization of the assimilated food are observed in conditions variable temperatures. Показано, что при выращивании гидробионтов в интегрированных рециркуляционныхсистемах более чем в два раза повышается экологическая эффективность использованияпищи по сравнению с монокультурой. Наиболее высокая биологическая продукция и более эффективное использование ассимилированной пищи наблюдаются в условиях осцил-ляции температуры. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-23 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/171 10.1234/XXXX-XXXX-2010-1-8-14 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2010); 8-14 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2010); 8-14 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2010-1 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/171/170 Schneider O., Seveti V., Eding E.H., Verreth J.A.J. Analysis of nutrient flows in integrated intensive aquaculture systems // Aquacultural Engineering. 2005. Vol. 32. N 3—4. P. 379—401. Naegel L.C.A. Combined production of fish and plants in recirculating water // Aquaculture. 1977. Vol. 10. N 1. P. 17—24. Пушкарь В.Я., Дубровин В.Н., Григорьев В.Н. Установка для выращивания рыб: Авторское свидетельство СССР. 1979. № 789082, МКИ: А01К 61/00. Neori A., Shpigel M., Ben-Ezra D. A sustainable integrated system for culture of fish, seaweed and abalone // Aquaculture. 2000. Vol. 186. N 3—4. P. 279—291. Troell M., Halling C., Neori A., Chopin T., Buschmann A.H., Kautsky N., Yarish C. Integrated mariculture: asking the right questions // Aquaculture. 2003. Vol. 226. N 1—4. P. 69—90. Пушкарь В.Я., Дубровин В.Н. Поликультура рыб на индустриальной основе // Рыбоводство. 1986. № 1. C. 8—9. Neori A., Chopin T., Troell M., Buschmann A.H., Kraemer G.P., Halling C., Shpigel M., Yarish C. Integrated aquaculture: rationale, evolution and state of the art empha-sizing seaweed biofitration in modern mariculture // Aquaculture. 2004. Vol. 231. N 1—4. P. 361—391. Константинов А.С., Пушкарь В.Я., Зданович В.В., Соловьева Е.А. Влияние колебаний температуры на скорость роста и размножение пресноводных планктонных водорослей // Вестн. Моск. ун-та. Сер. Биология. 1998. № 1. С. 47—50. Константинов А.С., Пушкарь В.Я., Зданович В.В., Соловьева Е.А. Влияние колебаний температуры на про-дукционные характеристики планктонной водоросли Scenedesmus quadricauda // Вест. Моск. ун-та. Сер. Биология. 1999. № 2. C. 49—53. Константинов А.С., Пушкарь В.Я., Аверьянова О.В. Влияние колебаний различных абиотических факторов на метаболизм некоторых гидробионтов // Изв. РАН. Сер. биол. 2003. № 6. C. 1—7. Заар Л.П., Тополовский В.А., Трибис Ж.М. Роль переменных температур в размножении Paramecium cau-datum // Журн. общ. биол. 1977. Т. 38. № 4. C. 609—619. Константинов А.С., Тагирова Н.А., Степаненко В.М., Соловьева Е.А. Влияние колебаний некоторых абиотических факторов на рост, размножение и энергетику коловратки Euchlanis dilatata // Гидробиол. журн. 1995. Т. 31. № 6. С. 25—29. Галковская Г.А., Сущеня Л.М. Рост водных животных при переменных температурах. Минск, 1978. Сарвиро В.С. Экологическая оценка влияния термических колебаний на параметры роста бокоплава Gammarus lacustris // Гидробиол. журн. 1983. Т. 19. № 4. C. 71—73. Tian X., Dong S. The effects of thermal amplitude on the growth of Chinese shrimp Fenneropenaeus chinen-sis (Osbeck, 1765) // Aquaculture. 2006. Vol. 251. N 2—4. P. 516—524. Pilditch C.A., Grant J. Effect of temperature fluctuations and food supply on the growth and metabolism of juvenile sea scallop (Placopecten magellanicus) // Mar. Biol. 1999. Vol. 134. P. 235—248. Dong Y., Dong S., Tian X., Wang F., Zhang M. Effect of diel temperature fluctuations on growth, oxygen consumption and proximate body composition in the sea cucumber Apostichopus japonicus Selenka // Aquaculture. 2006. Vol. 255. N 1—4. P. 514—521. Biette R.M., Geen G.H. Growth of underyearling salmon (Oncorhynchus nerka) under constant and cyclic temperatures in relation to live zooplankton ration size // Can. J. Fish. Aquat. Sci. 1980. Vol. 37. N 2. P. 203— 210. Константинов А.С., Зданович В.В. Некоторые особенности роста рыб при переменных температурных режимах // Вопр. ихтиологии. 1986. Т. 26. № 3. С. 448—456. Константинов А.С., Зданович В.В., Калашников А.А. Влияние переменной температуры на рост эвритермных и стенотермных рыб // Вопр. ихтиологии. 1987. Т. 27. № 6. C. 971—977. Константинов А.С., Зданович В.В., Тихомиров Д.Г. Влияние осцилляции температуры на интенсивность обмена и энергетику молоди рыб // Вопр. ихтиологии. 1989. Т. 29. № 6. C. 1019—1027. Константинов А.С., Зданович В.В., Шолохов А.М. Астатичность температурных условий как фактор оптимизации роста, энергетики и физиологического состояния рыб // Вестн. Моск. ун-та. Сер. Биология. 1991. № 2. C. 38—44. Gui Y.M., Wang Z.Y., Chen Y.H. Use of fluctuating temperature to promote growth of Tilapia niloticus // J. Fish. China. 1989. Vol. 13. P. 326— 331. Зданович В.В. Некоторые особенности роста молоди мозамбикской тиляпии Oreochromis mossambicus при постоянных и переменных температурах // Вопр. ихтиологии. 1999. Т. 39. № 1. C. 105—110. Кляшторин Л.Б., Саликзянов Р.Ф. Установка для автоматического измерения дыхания рыб и других гидробионтов при заданных температурных и кислородных условиях // Вопр. ихтиологии. 1979. Т. 19. № 1. C. 558—561. Остапеня А.П. Полнота окисления органического вещества водных беспозвоночных методом бихроматного окисления // ДАН БССР. 1965. Т. 9. № 4. C. 273—276. Винберг Г.Г. Обозначения, единицы измерения и эквиваленты, встречаемые при изучении продуктивности пресных вод. Л., 1972. Заика В.Е. Удельная продукция водных беспозвоночных. Киев, 1972. Новосельцев Г.Е. Биопродуктивная характеристика и трансформация энергетического потока в экосистеме Водлозерского водохранилища (Южная Карелия) // Основы изучения пресноводных экосистем. Л., 1981. С. 18—21. Алимов А.Ф. Введение в продукционную гидробиологию. Л., 1989. Винберг Г.Г. Первичная продукция водоемов. Минск, 1960. Романенко В.И., Кузнецов С.И. Экология микроорганизмов пресных вод. Л., 1974. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1210 2023-03-26T05:14:46Z jour:RST driver

Features of the species, spatial and trophic structure of macrobenthos in the lagoon ecosystem of the Nikolskaya Bay (Kandalaksha Bay, White Sea) Особенности видовой, пространственной и трофической структуры макробентоса в лагунной экосистеме Никольской губы (Кандалакшский залив, Белое море) A. P. Stolyarov А. П. Столяров Белое море macrobenthos species diversity spatial distribution trophic structure White Sea Белое море макробентос видовое разнообразие экосистемы пространственное распределение видов трофическая структура лагуны Белое море The article considers the species composition, features of the spatial and trophic structure of the macrobenthos of the Nikolskaya Bay of the White Sea. Nikolskaya Bay belongs to heavily silty lagoonal ecosystems with a predominance of the trophic group of collecting the detritus feeders. The accumulation of a large amount of organic matter in the sediments of the lagoon and its desalination in the spring period contribute to the development of mainly small species of detritophagous, which are more resistant to siltation and desalination, as well as to oxygen deficiency. These processes are especially manifested in the apex region of the bay. 26 species of invertebrates and 9 species of seagrasses and algae were found in the lagoon. Analysis of the obtained data on the species composition, diversity and structure of macrobenthos communities indicate the predominantly estuarine nature of the fauna of the Nikolskaya Bay lagoon ecosystem compared to other lagoons of the White Sea, since it is well protected from sea waves and currents by islands, luds and corgi. В статье рассматриваются видовой состав, а также особенности пространственной и трофической структуры макробентоса Никольской губы Белого моря. Никольская губа относится к сильно заиленным лагунным экосистемам, в ней доминирует трофическая группа собирающих детритофагов. Накопление большого количества органического вещества в осадках лагуны и ее опреснение в весенний период способствуют развитию преимущественно мелких видов детритофагов-собирателей, которые оказываются более устойчивыми к заилению и опреснению, а также к дефициту кислорода. Эти процессы особенно четко проявляются в кутовом районе губы. В лагуне было обнаружено 26 видов беспозвоночных животных и 9 видов морских трав и водорослей. Анализ полученных данных по видовому составу, разнообразию и структуре сообществ макробентоса свидетельствует о преимущественно эстуарном характере фауны лагунной экосистемы Никольской губы по сравнению с другими лагунами Белого моря, поскольку она хорошо защищена от морских волн и течений островами, лудами и коргами. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2023-03-25 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1210 10.55959/MSU0137-0952-16-78-1-5 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 78, № 1 (2023); 35-42 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 78, № 1 (2023); 35-42 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1210/615 Kjerfve B. Coastal lagoons // Coastal lagoon processes / Ed. Kjerfve B. Amsterdam: Elsevier, 1994. P. 1–8. De Wit R., Leruste A., Le Fur I., Sy M.M., Bec B., Ouisse V., Derolez V., Rey-Valette H. A multidisciplinary approach for restoration ecology of shallow coastal lagoons, a case study in South France // Front. Ecol. Evol. 2020. Vol. 8: 108. Stolyarov A.P. Some features of the species, spatial, and trophic structure of macrobenthos in the lagoon systems of the Ermolinskaya and Nikol’skaya inlets (Kandalaksha bay, the White sea) // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2019. Vol. 74. N 3. P. 176–182. Khlebovich V.V. Applied aspects of the concept of critical salinity // Biol. Bull. Rev. 2015. Vol. 5. N 6. P. 562–567. Комплексные исследования Бабьего моря, полуизолированной беломорской лагуны: геология, гидрология, биота – изменения на фоне трансгрессии берегов (Труды Беломорской биостанции МГУ. Т. 12.) / Под общ. ред. В.О. Мокиевского, А.И. Исаченко, П.Ю. Дгебуадзе и А.Б. Цетлина. М.: Т-во научн. изд. КМК, 2016. 243 с. Ellis J.I., Clark D., Atalah J., Jiang W., Taiapa C., Patterson M., Sinner J., Hewitt J. Multiple stressor effects on marine infauna: Responses of estuarine taxa and functional traits to sedimentation, nutrient and metal loading // Sci. Rep. 2017. Vol. 7. P. 1–16. Van der Linden P., Marchini A., Smith C.J., Dolbeth M., Simone L.R.L., Marques J.C., Molozzi J., Medeiros C.R., Patrício J. Functional changes in polychaete and mollusc communities in two tropical estuaries // Estuar. Coast. Shelf Sci. 2017. Vol. 187. P. 62–73. Labay V.S., Kurilova N.V., Shpilko T.S. Seasonal variability of macrozoobenthos in a lagoon having a periodic connection with the sea (Ptich’e Lake, southern Sakhalin) // Biol. Bull. 2016. Vol. 43. N 9. P. 988–1002. Stolyarov A.P. Peculiarities of the structure of and trends in the macrobenthos community of the Ermolinskaya Bay lagoon ecosystem, Kandalaksha Bay, White Sea // Biol. Bull. 2017. Vol. 44. N 9. P. 1019–1034. Sy M.M., Rey-Valette H., Simier M., Pasqualini V., Figuières Ch, De Wit R. Identifying consensus on coastal lagoons ecosystem services and conservation priorities for an effective decision making: A Q approach // Ecol. Econ. 2018. Vol. 154. P. 1–13. Mosbahi N., Serbaji M.M., Pezy J.P., Neifar L., Dauvin J.C. Response of benthic macrofauna to multiple anthropogenic pressures in the shallow coastal zone south of Sfax (Tunisia, central Mediterranean Sea) // Environ. Pollut. 2019. Vol. 253. P. 474–487. Stolyarov A.P. Species diversity and trophic structure of macrobenthos communities in lagoon ecosystems (Kandalaksha Bay, White Sea) // Biol. Bull. 2020. Vol. 47. N 8. P. 887–896. Shannon С.E. The mathematical theory of communication // Bell Syst. Tech. J. 1948. Vol. 27. N 3. P. 379–423. Hammer Ø., Harper D.A.T., Ryan P.D. PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis // Palaeontol. Electron. 2001. Vol. 4. N 1: 4. Sørensen T.A. A new method of establishing groups of equal amplitude in plant sociology based on similarity of species content and its application to analysis of the vegetation on Danish commons // Kongel. Danske Vidensk. Selsk. Skr. 1948. Vol. 5. N 4. P. 1–34. Броцкая В.А., Жданова Н.Н., Семенова Н.Л. Донная фауна Великой Салмы и прилежащих районов Кандалакшского залива Белого моря // Труды Беломорской биологичесой станции МГУ. Т. 2. М.: Изд-во Моск. ун-та, 1963. С. 159–182. Chikina M.V, Spiridonov V.A., Mardashova M.V. Spatial and temporal variability of coastal benthic communities in the Keretsky Archipelago area and in the Velikaya Salma strait (Karelian coast, the White Sea) // Oceanology. 2014. Vol. 54. N 1. P. 54–65. Артемьев С.Н., Новоселов А.П., Левицкий А.Л. Таксономическое и видовое разнообразие макрозообентоса в Двинском заливе Белого моря // Arct. Environ. Res. 2017. Т. 17. № 4. С. 308–320. Столяров А.П. Видовое разнообразие и трофическая структура литоральных сообществ макробентоса эстуария реки Черной (Кандалакшский залив, Белое море) // Бюлл МОИП. Отд. биол. 2019. Т. 124. № 4. С. 19–28. Лабай В.С., Корнеев Е.С., Абрамова Е.В., Ушаков А.А., Ахмадеева Е.С. Макробентос эстуария типичной «лососевой» реки острова Сахалин (на примере р. Мануй) // Известия ТИНРО. 2022. Т. 202. № 3. С. 640–660. Chertoprood M.V., Udalov A.A., Stoljarov A.P., Borisov R.R. Diversity of macrobenthic communities in the White Sea estuaries // Oceanology. 2004. Vol. 44. N 6. P. 845–855. Романенко Ф.А., Шилова О.С. Послеледниковое поднятие Карельского берега Белого моря по данным радиоуглеродного и диатомового анализов озерно-болотных отложений полуострова Киндо // Докл. Акад. наук. 2012. Т. 442. № 4. С. 544–548. Мардашова М.В., Воронов Д.А., Краснова Е.Д. Бентосные сообщества прибрежных водоемов на разных стадиях изоляции от моря в окрестностях беломорской биостанции МГУ (Кандалакшский залив Белого моря) // Зоол. журн. 2020. T. 99. № 7. С. 819–837. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1559 2025-11-26T20:23:15Z jour:RST driver

The morphofunctional profile of a mouse model of acute moderate dextran sodium sulfate-induced colitis Морфофункциональная характеристика модели острого умеренного колита, индуцированного декстрансульфатом натрия, у мышей N. A. Zolotova M. V. Kirillova I. S. Tsvetkov D. Sh. Dzhalilova L. V. Ozeretskaya M. T. Dobrynina O. V. Makarova Н. А. Золотова М. В. Кириллова И. С. Цветков Д. Ш. Джалилова Л. В. Озерецкая М. Т. Добрынина О. В. Макарова воспаление experimental colitis dextran sulfate sodium microflora, biological model inflammation воспаление экспериментальный колит декстрансульфат натрия микрофлора биологическая модель воспаление Ulcerative colitis is a socially significant disease, but its etiology is unclear. The most widely used experimental model is dextran sodium sulfate (DSS)-induced colitis. The aim of the work was to characterize morphofunctional and molecular biological changes in the colon and mesenteric lymph nodes in acute colitis induced by 1% DSS solution in male C57BL/6 mice. Upon induction of colitis, moderate ulcerative inflammatory process developed in the colon, hyperplasia of the cortex, plasmatization of the medullary cords and macrophage reaction in the sinuses were observed in the mesenteric lymph nodes. Inflammatory infiltration, increased macrophage content, decreased volume fraction of goblet cells and neutral mucin content in them, increased endocrine cell content, increased expression of Cldn4, Cldn7, Bax and Bcl2 were detected in the colon. Pronounced changes in the composition of intestinal microflora were observed. Язвенный колит – социально значимое заболевание, но его этиология не ясна. Наиболее широко используемой экспериментальной моделью является колит, индуцированный декстрансульфатом натрия. Целью настоящей работы стала оценка морфофункциональных и молекулярно-биологических изменений ободочной кишки и брыжеечных лимфатических узлов при остром колите, индуцированном 1%-ным раствором декстрансульфата натрия у самцов мышей C57BL/6. При индукции колита в ободочной кишке развивался язвенно-воспалительный процесс умеренной тяжести, в брыжеечных лимфатических узлах наблюдались гиперплазия коркового вещества, плазматизация мозговых тяжей и макрофагальная реакция в синусах. В ободочной кишке были выявлены воспалительная инфильтрация, повышение содержания макрофагов, снижение объемной доли бокаловидных клеток и содержания в них нейтральных муцинов, повышение содержания эндокринных клеток, увеличение экспрессии Cldn4, Cldn7, Bax и Bcl2. Также наблюдались количественные изменения состава микробиома кишечника. Lomonosov Moscow State University, School of Biology This study was performed under the state assignment of Petrovsky National Research Center of Surgery, project no. 122030200530-6. Работа выполнена в рамках государственного задания Российского научного центра хирургии имени академика Б.В. Петровского (№122030200530-6). 2025-11-26 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1559 10.55959/MSU0137-0952-16-80-3-2 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 80, № 3 (2025); 156-164 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 80, № 3 (2025); 156-164 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1559/747 Маркова А.А., Кашкина Е.И. Современные методы диагностики и оценки тяжести течения неспецифического язвенного колита. Вестник ТГУ. 2012;17(3):915–919. Du L., Ha C. Epidemiology and pathogenesis of ulcerative colitis. Gastroenterol. Clin. North Am. 2020;49(4):643–654. Bolotova E.V., Yumukyan K.A., Dudnikova A.V. Modern idea of the mechanisms of development and predictors of ulcerative colitis severity. Doctor.Ru. 2022;21(2):34–39. Золотова Н.А., Архиева Х.М., Зайратьянц О.В. Эпителиальный барьер толстой кишки в норме и при язвенном колите. Экспер. клин. гастроэнтерол. 2019;(2):4–13. Katsandegwaza B., Horsnell W., Smith K. Inflammatory bowel disease: a review of pre-clinical murine models of human disease. Int. J. Mol. Sci. 2022;23(16):9344. Sann H., Erichsen J.V., Hessmann M., Pahl A., Hoffmeyer A. Efficacy of drugs used in the treatment of IBD and combinations thereof in acute DSS-induced colitis in mice. Life Sci. 2013;92(12):708–718. Postovalova E.A., Khochansky D.N., Zolotova N.A., Gao Y., Makarova O.V., Dobrynina M.T. Morphological changes in mesenteric lymph nodes and lymphocyte subpopulation composition in experimental ulcerative colitis. Bull. Exp. Biol. Med. 2016;160(6):835–839. Дорофеев А.Э., Василенко И.В., Рассохина О.А. Изменения экспрессии MUC2, MUC3, MUC4, TFF3 в слизистой оболочке толстого кишечника у больных неспецифическим язвенным колитом. Гастроэнтерол. 2013;47(1):80–84. Issa C.M., Hambly B.D., Wang Y., Maleki S., Wang W., Fei J., Bao S. TRPV2 in the development of experimental colitis. Scand. J. Immunol. 2014;80(5):307–312. Portela-Gomes G.M., Stridsberg M. Chromogranin A in the human gastrointestinal tract: an immunocytochemical study with region-specific antibodies. J. Histochem. Cytochem. 2002;50(11):1487–1492. Engelstoft M.S., Lund M.L., Grunddal K.V., Egerod K.L., Osborne-Lawrence S., Poulsen S.S., Zigman J.M., Schwartz T.W. Research resource: a chromogranin A reporter for serotonin and histamine secreting enteroendocrine cells. Mol. Endocrinol. 2015;29(11):1658–1671. Na Y.R., Stakenborg M., Seok S.H., Matteoli G. Macrophages in intestinal inflammation and resolution: a potential therapeutic target in IBD. Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol. 2019;16(9):531–543. Jang S., Jang S., Ko J., Bae J.E., Hyung H., Park J.Y., Lim S.G., Park S., Park S., Yi J., Kim S., Kim M.O., Cho D.H., Ryoo Z.Y. HSPA9 reduction exacerbates symptoms and cell death in DSS-induced inflammatory colitis. Sci. Rep. 2024;14(1):5908 Longman R.J., Poulsom R., Corfield A.P., Warren B.F., Wright N.A., Thomas M.G. Alterations in the composition of the supramucosal defense barrier in relation to disease severity of ulcerative colitis. J. Histochem. Cytochem. 2006;54(12):1335–1348. Hoebler C., Gaudier E., De Coppet P., Rival M., Cherbut C. MUC genes are differently expressed during onset and maintenance of inflammation in dextran sodium sulfate-treated mice. Dig. Dis. Sci. 2006;51(2):381–389. Zolotova N.A., Polikarpova A.V., Khochanskii D.N., Makarova O.V., Mikhailova L.P. Expression of mucins and claudins in the colon during acute and chronic experimental colitis. Bull. Exp. Biol. Med. 2018;165(4):434–437. Das P., Goswam P., Das T.K., Nag T., Sreenivas V., Ahuja V., Panda S.K., Gupta S.D., Makharia G.K. Comparative tight junction protein expressions in colonic Crohn’s disease, ulcerative colitis, and tuberculosis: a new perspective. Virchows Arch. 2012;460(3):261–270. Oshima T., Miwa H., Joh T. Changes in the expression of claudins in active ulcerative colitis. J. Gastroenterol. Hepatol. 2008;23 Suppl. 2:S146–S150. Prasad S., Mingrino R., Kaukinen K., Hayes K.L., Powell R.M., MacDonald T.T., Collins J.E. Inflammatory processes have differential effects on claudins 2, 3 and 4 in colonic epithelial cells. Lab. Invest. 2005;85(9):1139–1162. Weber C.R., Nalle S.C., Tretiakova M., Rubin D.T., Turner J.R. Claudin-1 and claudin-2 expression is elevated in inflammatory bowel disease and may contribute to early neoplastic transformation. Lab. Invest. 2008;88(10):1110–1120. Randall K., Henderson N., Reens J., Eckersley S., Nyström A.C., South M.C., Balendran C.A., Böttcher G., Hughes G., Price S.A. Claudin-2 expression levels in ulcerative colitis: development and validation of an in-situ hybridisation assay for therapeutic studies. PLoS One. 2016;11(9):e0162076. Čužić S., Antolić M., Ognjenović A., Stupin-Polančec D., Petrinić Grba A., Hrvačić B., Dominis Kramarić M., Musladin S., Požgaj L., Zlatar I., Polančec D., Aralica G., Banić M., Urek M., Mijandrušić Sinčić B., Čubranić A., Glojnarić I., Bosnar M., Eraković Haber V. Claudins: beyond tight junctions in human IBD and murine models. Front. Pharmacol. 2021;12:682614. Liu S., Wang Z., Xiang Q., Wu B., Lv W., Xu S. A comparative study in healthy and diabetic mice followed the exposure of polystyrene microplastics: Differential lipid metabolism and inflammation reaction. Ecotoxicol. Environ. Saf. 2022;244:114031. Al-Failakawi A., Al-Jarallah A., Rao M., Khan I. The role of claudins in the pathogenesis of dextran sulfate sodium-induced experimental colitis: the effects of nobiletin. Biomolecules. 2024;14(9):1122. Kim H.Y., Jeon H., Bae C.H., Lee Y., Kim H., Kim S. Rumex japonicus Houtt. alleviates dextran sulfate sodium-induced colitis by protecting tight junctions in mice. Integr. Med. Res. 2020;9(2):100398. Yuan B., Zhou S., Lu Y., Liu J., Jin X., Wan H., Wang F. Changes in the expression and distribution of claudins, increased epithelial apoptosis, and a mannan-binding lectin-associated immune response lead to barrier dysfunction in dextran sodium sulfate-induced rat colitis. Gut Liver. 2015;9(6):734–740. Золотова Н.А., Поликарпова А.В., Хочанский Д.Н., Макарова О.В., Михайлова Л.П. Экспрессия муцинов и клаудинов в ободочной кишке при остром и хроническом экспериментальном колите. Бюлл. эксп. биол. мед. 2018;165(4):421–424. Nishida M., Yoshida M., Nishiumi S., Furuse M., Azuma T. Claudin-2 regulates colorectal inflammation via myosin light chain kinase-dependent signaling. Dig. Dis. Sci. 2013;58(6):1546–1559. Ahmad R., Chaturvedi R., Olivares-Villagómez D., Habib T., Asim M., Shivesh P., Polk D.B., Wilson K.T., Washington M.K., Van Kaer L., Dhawan P., Singh A.B. Targeted colonic claudin-2 expression renders resistance to epithelial injury, induces immune suppression, and protects from colitis. Mucosal Immunol. 2014;7(6):1340–1353. Lameris A.L., Huybers S., Kaukinen K., Mäkelä T.H., Bindels R.J., Hoenderop J.G., Nevalainen P.I. Expression profiling of claudins in the human gastrointestinal tract in health and during inflammatory bowel disease. Scand. J. Gastroenterol. 2013;48(1):58–69. Cai L., Li X., Geng C., Lei X., Wang C. Molecular mechanisms of somatostatin-mediated intestinal epithelial barrier function restoration by upregulating claudin-4 in mice with DSS-induced colitis. Am. J. Physiol. Cell Physiol. 2018;315(4):C527–C536. Mennigen R., Nolte K., Rijcken E., Utech M., Loeffler B., Senninger N., Bruewer M. Probiotic mixture VSL#3 protects the epithelial barrier by maintaining tight junction protein expression and preventing apoptosis in a murine model of colitis. Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol. 2009;296(5):G1140–G1149. Arinno A., Sukmak P., Kulworasreth P., Sricharunrat T., Vaddhanaphuti C.S., Pongkorpsakol P. Gallic acid serves as an effective therapeutic agent of inflammatory bowel disease: pharmacological impacts on tight junction-dependent intestinal permeability in vivo and its related intracellular signaling. Curr. Res. Pharmacol. Drug Discov. 2025;8:100223. Capaldo C.T. Claudin barriers on the brink: how conflicting tissue and cellular priorities drive IBD pathogenesis. Int. J. Mol. Sci. 2023; 24(10):8562. Wang K., Ding Y., Xu C., Hao M., Li H., Ding L. Cldn-7 deficiency promotes experimental colitis and associated carcinogenesis by regulating intestinal epithelial integrity. Oncoimmunology. 2021;10(1):1923910. Ogata M., Ogita T., Tari H., Arakawa T., Suzuki T. Supplemental psyllium fibre regulates the intestinal barrier and inflammation in normal and colitic mice. Br. J. Nutr. 2017;118(9):661–672. Ding Y., Wang K., Xu C., Hao M., Li H., Ding L. Intestinal Claudin-7 deficiency impacts the intestinal microbiota in mice with colitis. BMC Gastroenterol. 2022;22(1):24. Dvornikova K.A., Platonova O.N., Bystrova E.Y. Hypoxia and intestinal inflammation: common molecular mechanisms and signaling pathways. Int. J. Mol. Sci. 2023;24(3):2425. Zong W., Friedman E.S., Allu S.R., Firrman J., Tu V., Daniel S.G., Bittinger K., Liu L., Vinogradov S.A., Wu G.D. Disruption of intestinal oxygen balance in acute colitis alters the gut microbiome. Gut Microbes. 2024;16(1):2361493. Hong D., Kim H.K., Yang W., Yoon C., Kim M., Yang C.S., Yoon S. Integrative analysis of single-cell RNAseq and gut microbiome metabarcoding data elucidates macrophage dysfunction in mice with DSS-induced ulcerative colitis. Commun. Biol. 2024;7(1):731. Gevers D., Kugathasan S., Denson L.A., et al. The treatment-naive microbiome in new-onset Crohn’s disease. Cell Host Microbe. 2014;15(3):382–392. Mirsepasi-Lauridsen H.C., Vrankx K., Engberg J., Friis-Møller A., Brynskov J., Nordgaard-Lassen I., Petersen A.M., Krogfelt K.A. Disease-specific enteric microbiome dysbiosis in inflammatory bowel disease. Front. Med. (Lausanne). 2018;5:304. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/351 2016-10-08T16:31:47Z jour:EDIT driver

Обращение к человечеству Обращение к человечеству M. V. Gusev М. В. Гусев глобальный экологический кризис биоцентрическая конституция глобальный экологический кризис Not available Not available Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2016-10-06 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/351 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2005); 3-5 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2005); 3-5 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/351/329 Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/386 2016-10-26T18:43:44Z jour:GR driver

SOME REMARKS ON THE RELATIONSHIP BETWEEN AUTOPHAGY, CELL AGING, AND CELL PROLIFERATION RESTRICTION НЕКОТОРЫЕ ЗАМЕЧАНИЯ, КАСАЮЩИЕСЯ ВЗАИМОСВЯЗИ АУТОФАГИИ, КЛЕТОЧНОГО СТАРЕНИЯ И ОГРАНИЧЕНИЯ КЛЕТОЧНОЙ ПРОЛИФЕРАЦИИ G. V. Morgunova A. A. Klebanov A. N. Khokhlov Г. В. Моргунова А. А. Клебанов А. Н. Хохлов обзор cytogerontology replicative aging stationary phase aging postmitotic cells cell proliferation restriction review обзор цитогеронтология репликативное старение “стационарное старение” постмитотические клетки ограничение клеточной пролиферации обзор In the review the main types of autophagy (macroautophagy, microautophagy, and chaperonemediated autophagy) are shortly described. Data about character of influence of autophagy on the aging process and on the development of some neurodegenerative diseases in various organisms are analyzed. It is noted that this effect is usually (though not always) beneficial. Results of investigations of the phenomenon in experiments on mice, nematodes, fruit flies, bacteria, yeasts, and higher organisms’ cell cultures are considered. Obvious relationship between autophagy activation and cell proliferation restriction is emphasized. The latter the authors believe to be the main cause of age-related accumulation in cells and tissues of various defects (the most important — DNA damage) that leads to the increase of death probability — i.e., to aging. It is concluded that studies of the role of autophagy in the aging process on the models of chronological aging in yeast or stationary phase aging of cell cultures could be considered as the most appropriate approach to the problem solution. В обзоре кратко описываются основные типы аутофагии — макроаутофагия, микроаутофагия и шаперон-опосредованная аутофагия. Анализируются данные о характере влияния аутофагии на возникновение некоторых патологических процессов и старение у различных организмов. Отмечается, что такое влияние, как правило (хоть и не всегда), является положительным. Рассматриваются результаты исследований данного феномена в экспериментах на мышах, нематодах, дрозофилах, бактериях, дрожжах и культурах клеток высших организмов. Подчеркивается очевидная связь активации аутофагии с ограничением клеточной пролиферации, которую авторы считают основной причиной накопления с возрастом различных дефектов (наиболее важные из них — повреждения ДНК) в клетках и тканях, что приводит к увеличению вероятности смерти, т.е. к старению. Заключается, что изучение роли аутофагии в процессе старения наиболее целесообразно проводить на моделях хронологического старения дрожжей или “стационарного старения” клеточных культур.  Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2016-10-26 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/386 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 4 (2016); 28-33 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 4 (2016); 28-33 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/386/361 Rubinsztein D.C., Mariño G., Kroemer G. Autophagy and aging // Cell. 2011. Vol. 146. N 5. P. 682–695. Mortimore G.E., Lardeux B.R., Adams C.E. Regulation of microautophagy and basal protein turnover in rat liver. Effects of short-term starvation // J. Biol. Chem. 1988. Vol. 263. N 5. P. 2506–2512. Vicencio J.M., Galluzzi L., Tajeddine N., Ortiz C., Criollo A., Tasdemir E., Morselli E., Ben Younes A., Maiuri M.C., Lavandero S., Kroemer G. Senescence, apoptosis or autophagy? When a damaged cell must decide its path — A mini-review // Gerontology. 2008. Vol. 54. N 2. P. 92–99. Yen W.-L., Klionsky D.J. How to live long and prosper: Autophagy, mitochondria, and aging // Physiology (Bethesda). 2008. Vol. 23. P. 248–262. Massey A.C., Kiffin R., Cuervo A.M. Autophagic defects in aging. Looking for an “emergency exit”? // Cell Cycle. 2006. Vol. 5. N 12. P. 1292–1296. Levine B., Mizushima N., Virgin H.W. Autophagy in immunity and inflammation // Nature. 2011. Vol. 469. N 7330. P. 323–335. Gottlieb R.A., Carreira R.S. Autophagy in health and disease. 5. Mitophagy as a way of life // Am. J. Physiol. Cell Physiol. 2010. Vol. 299. N 2. P. C203–C210. Madeo F., Tavernarakis N., Kroemer G. Can autophagy promote longevity? // Nat. Cell Biol. 2010. Vol. 12. N 9. P. 842–846. Khokhlov A.N. Does aging need an own program or the existing development program is more than enough? // Russ. J. Gen. Chem. 2010. Vol. 80. N 7. P. 1507–1513. Khokhlov A.N., Wei L., Li Y., He J. Teaching cytogerontology in Russia and China // Adv. Gerontol. 2012. Vol. 25. N 3. P. 513–516. Khokhlov A.N., Klebanov A.A., Karmushakov A.F., Shilovsky G.A., Nasonov M.M., Morgunova G.V. Testing of geroprotectors in experiments on cell cultures: choosing the correct model system // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2014. Vol. 69. N 1. P. 10–14. Khokhlov A.N. What will happen to molecular and cellular biomarkers of aging in case its program is canceled (provided such a program does exist)? // Adv. Gerontol. 2014. Vol. 4. N 2. P. 150–154. Bjedov I., Toivonen J.M., Kerr F., Slack C., Jacobson J., Foley A., Partridge L. Mechanisms of life span extension by rapamycin in the fruit fly Drosophila melanogaster // Cell Metab. 2010. Vol. 11. N 1. P. 35–46. Morselli E., Maiuri M.C., Markaki M., Megalou E., Pasparaki A., Palikaras K., Criollo A., Galluzzi L., Malik S.A., Vitale I., Michaud M., Madeo F., Tavernarakis N., Kroemer G. Caloric restriction and resveratrol promote longevity through the Sirtuin-1-dependent induction of autophagy // Cell Death. Dis. 2010. Vol. 1. e10. Meléndez A., Tallóczy Z., Seaman M., Eskelinen E.L., Hall D.H., Levine B. Autophagy genes are essential for dauer development and life-span extension in C. elegans // Science. 2003. Vol. 301. N 5638. P. 1387–1391. Juhász G., Érdi B., Sass M., Neufeld T.P. Atg7-dependent autophagy promotes neuronal health, stress tolerance, and longevity but is dispensable for metamorphosis in Drosophila // Genes Dev. 2007. Vol. 21. N 23. P. 3061–3066. Simonsen A., Cumming R.C., Brech A., Isakson P., Schubert D.R., Finley K.D. Promoting basal levels of autophagy in the nervous system enhances longevity and oxidant resistance in adult Drosophila // Autophagy. 2008. Vol. 4. N 2. P. 176–184. Hara T., Nakamura K., Matsui M., Yamamoto A., Nakahara Y., Suzuki-Migishima R., Yokoyama M., Mishima K., Saito I., Okano H., Mizushima N. Suppression of basal autophagy in neural cells causes neurodegenerative disease in mice // Nature. 2006. Vol. 441. N 7095. P. 885–889. Komatsu M., Waguri S., Chiba T., Murata S., Iwata J., Tanida I., Ueno T., Koike M., Uchiyama Y., Kominami E., Tanaka K. Loss of autophagy in the central nervous system causes neurodegeneration in mice // Nature. 2006. Vol. 441. N 7095. P. 880–884. Masiero E., Sandri M. Autophagy inhibition induces atrophy and myopathy in adult skeletal muscles // Autophagy. 2010. Vol. 6. N 2. P. 307–309. Khokhlov A.N. Does aging need its own program, or is the program of development quite sufficient for it? Stationary cell cultures as a tool to search for anti-aging factors // Curr. Aging Sci. 2013. Vol. 6. N 1. P. 14–20. Khokhlov A.N. Impairment of regeneration in aging: appropriateness or stochastics? // Biogerontology. 2013. Vol. 14. N 6. P. 703–708. Cuervo A.M., Bergamini E., Brunk U.T., Dröge W., Ffrench M., Terman A. Autophagy and aging: the importance of maintaining “clean” cells // Autophagy. 2005. Vol. 1. N 3. P. 131–140. Cuervo A.M., Dice J.F. How do intracellular proteolytic systems change with age? // Front. Biosci. 1998. Vol. 3. P. d25–d43. Stefanova N.A., Kolosova N.G. Evolution of Alzheimer’s disease pathogenesis conception // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2016. Vol. 71. N 1. P. 4–10. Ravikumar B., Vacher C., Berger Z., Davies J.E., Luo S., Oroz L.G., Scaravilli F., Easton D.F., Duden R., O’Kane C.J., Rubinsztein D.C. Inhibition of mTOR induces autophagy and reduces toxicity of polyglutamine expansions in fly and mouse models of Huntington disease // Nat. Genet. 2004. Vol. 36. N 6. P. 585–595. Gewirtz D.A. Autophagy and senescence. A partnership in search of definition // Autophagy. 2013. Vol. 9. N 5. P. 808–812. Goehe R.W., Di X., Sharma K., Bristol M.L., Henderson S.C., Valerie K., Rodier F., Davalos A.R., Gewirtz D.A. The autophagy-senescence connection in chemotherapy: must tumor cells (self) eat before they sleep? // J. Pharmacol. Exp. Ther. 2012. Vol. 343. N 3. P. 763–778. Degenhardt K., Mathew R., Beaudoin B., Bray K., Anderson D., Chen G., Mukherjee C., Shi Y., Gélinas C., Fan Y., Nelson D.A., Jin S., White E. Autophagy promotes tumor cell survival and restricts necrosis, inflammation, and tumorigenesis // Cancer Cell. 2006. Vol. 10. N 1. P. 51–64. Morgunova G.V., Klebanov A.A., Khokhlov A.N. Interpretation of data about the impact of biologically active compounds on viability of cultured cells of various origin from a gerontological point of view // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2016. Vol. 71. N 2. P. 67–70. Campisi J. Aging, cellular senescence, and cancer // Annu. Rev. Physiol. 2013. Vol. 75. P. 685–705. Hayflick L., Moorhead P.S. The serial cultivation of human diploid cell strains // Exp. Cell Res. 1961. Vol. 25. N 3. P. 585–621. Hayflick L. The limited in vitro lifetime of human diploid cell strains // Exp. Cell Res. 1965. Vol. 37. N 3. P. 614–636. Akimov S.S., Khokhlov A.N. Study of “stationary phase aging” of cultured cells under various types of proliferation restriction // Ann. N.Y. Acad. Sci. 1998. Vol. 854. P. 520. Khokhlov A.N. Evolution of the term “cellular senescence” and its impact on the current cytogerontological research // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2013. Vol. 68. N 4. P. 158–161. Khokhlov A.N., Morgunova G.V., Ryndina T.S., Coll F. Pilot study of a potential geroprotector, “Quinton Marine Plasma”, in experiments on cultured cells // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2015. Vol. 70. N 1. P. 7–11. Khokhlov A.N., Morgunova G.V. On the constructing of survival curves for cultured cells in cytogerontological experiments: a brief note with three hierarchy diagrams // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2015. Vol. 70. N 2. P. 67–71. Jeyapalan J.C., Sedivy J.M. Cellular senescence and organismal aging // Mech. Aging Dev. 2008. Vol. 129. N 7–8. P. 467–474. White E., Lowe S.W. Eating to exit: autophagy-enabled senescence revealed // Genes Dev. 2009. Vol. 23. N 7. P. 784–787. Young A.R., Narita M., Ferreira M., Kirschner K., Sadaie M., Darot J.F., Tavaré S., Arakawa S., Shimizu S., Watt F.M., Narita M. Autophagy mediates the mitotic senescence transition // Genes Dev. 2009. Vol. 23. N 7. P. 798–803. Fabrizio P., Longo V.D. The chronological life span of Saccharomyces cerevisiae // Aging Cell. 2003. Vol. 2. N 2. P. 73–81. Khokhlov A.N. Which aging in yeast is “true”? // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2016. Vol. 71. N 1. P. 11–13. Alvers A.L., Wood M.S., Hu D., Kaywell A.C., Dunn W.A. Jr., Aris J.P. Autophagy is required for extension of yeast chronological life span by rapamycin // Autophagy. 2009. Vol. 5. N 6. P. 847–849. Kaeberlein M., Burtner C.R., Kennedy B.K. Recent developments in yeast aging // PLOS Genet. 2007. Vol. 3. N 5. e84. Herman P.K. Stationary phase in yeast // Curr. Opin. Microbiol. 2002. Vol. 5. N 6. P. 602–607. Matecic M., Smith D.L., Jr., Pan X., Maqani N., Bekiranov S., Boeke J.D., Smith J.S. A microarray-based genetic screen for yeast chronological aging factors // PLOS Genet. 2010. Vol. 6. N 4. e1000921. Nyström T. Stationary-phase physiology // Annu. Rev. Microbiol. 2004. Vol. 58. P. 161–181. Khokhlov A.N. Decline in regeneration during aging: appropriateness or stochastics? // Russ. J. Dev. Biol. 2013. Vol. 44. N 6. P. 336–341. Morgunova G.V., Kolesnikov A.V., Klebanov A.A., Khokhlov A.N. Senescence-associated β-galactosidase — a biomarker of aging, DNA damage, or cell proliferation restriction? // Moscow Univ. biol. Sci. bull. 2015. Vol. 70. N 4. P. 165–167. Shram S.I., Shilovskii G.A., Khokhlov A.N. Poly(ADPribose)-polymerase-1 and aging: experimental study of possible relationship on stationary cell cultures // Bull. Exp. Biol. Med. 2006. Vol. 141. N 5. P. 628–632. Khokhlov A.N. On the immortal hydra. Again // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2014. Vol. 69. N 4. P. 153–157. Chera S., Buzgariu W., Ghila L., Galliot B. Autophagy in Hydra: A response to starvation and stress in early animal evolution // BBA–Mol. Cell Res. 2009. Vol. 1793. N 9. P. 1432–1443. Alayev A., Berger S.M., Kramer M.Y., Schwartz N.S., Holz M.K. The combination of rapamycin and resveratrol blocks autophagy and induces apoptosis in breast cancer cells // J. Cell Biochem. 2015. Vol. 116. N 3. P. 450–457. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/81 2015-05-20T09:52:47Z jour:FF driver

DYNAMICS OF DEVELOPMENT OF JUVENILE PLANTS ON MEADOWS OF THE ALPINE BELT OF NORTHWEST CAUCASUS ДИНАМИКА РАЗВИТИЯ ЮВЕНИЛЬНЫХ РАСТЕНИЙ НА ГЕРАНИЕВО-КОПЕЕЧНИКОВЫХ ЛУГАХ АЛЬПИЙСКОГО ПОЯСА СЕВЕРО-ЗАПАДНОГО КАВКАЗА N. V. Lubeznova Н. В. Любезнова высокогорные луга. Caucasus alpine meadows высокогорные луга. Кавказ высокогорные луга. We investigated juvenile plants in association Hedysaro caucasicae — Geranietum gymnocauli Rabotnova & Onipchenko 2002 of alpine meadows of Northwestern Caucasus. During 5 years we were considered all juvenile plants on 16 plots on 0,5 m2. 4485 sprouts have been noted and the destiny is tracked them. The dominant species Hedysarum caucasicum Bieb. and Geranium gymnocaulon DC. and most species of the Asteraceae give many juvenile plants, but haven’t seeds in soil bank of seeds. Species of grass and other families give sprouts rare and have seeds in the soil bank. The majority from sprouts die after first winter. Sprouts of the dominant species are long time in juvenile age, sprouts of other species quickly pass in vegetative age. В условиях альпийского пояса северо-западного Кавказа на гераниево-копеечниковых лугах в течение 5 лет на постоянной трансекте были зафиксированы все проростки и прослежена их дальнейшая судьба. Выявлен характер всхожести и возобновления видов альпийского пояса. Данные по видовому составу были сопоставлены с имеющимися литературными данными. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-05-20 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/81 10.1234/XXXX-XXXX-2014-1-47-52 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2014); 47-52 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2014); 47-52 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2014-1 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/81/83 Шихэмиров М.Г. Семенная продуктивность горнолуговых экосистем на Восточном Кавказе. М., 1984. 59 c. (Деп. в ВИНИТИ 1928-84). Onipchenko V.G. Alpine Vegetation of the Teberda Reserve, the Northwestern Caucasus / Ed. K. Thompson. Verцffentlichungen des Geobotanischen Institutes der ETH, Stiftung Rьbel. Zьrich, 2002. H. 130. P. 67—107. Онипченко В.Г., Семенова Г.В. Флористическая насыщенность некоторых альпийских сообществ северо-западного Кавказа // Вестн. Моск. ун-та. Сер. Биология. 1988. № 3. С. 42—45. Онипченко В.Г. Фитомасса альпийских сообществ северо-западного Кавказа // Бюл. МОИП. Отд. биол. 1990. Т. 95. Вып. 6. С. 52—62. Фомин С.В., Онипченко В.Г., Сеннов А.В. Питание и роющая деятельность кустарниковой полевки (Pitymys majori Thom.) в альпийских сообществах северо-западного Кавказа // Бюл. МОИП. Отд. биол. 1989. Т. 94. Вып. 3. С. 6—13. Любезнова Н.В. Динамика развития ювенильных растений на альпийских лишайниковых пустошах // Почвы и растительный мир горных территорий: Мат-лы III Междунар. конф. “Горные экосистемы и их компоненты” 24—29 августа 2009 г. М.: Товарищество научных изданий КМК, 2009. С. 217—221. Любезнова Н.В. Динамика развития ювенильных растений на пестроовсяницевых лугах альпийского пояса северо-западного Кавказа // Проблемы изучения и сохранения растительного мира Евразии: Мат-лы Всерос. науч. конф. с междунар. участием, посвящ. памяти выдающегося ученого Л.В. Бардунова (1932—2008). Иркутск, 15—19 сентября 2010 года. Иркутск: Из-во Института географии им. В.Б. Сочавы СО РАН, 2010. С. 407—409. Семенова Г.В., Онипченко В.Г. Жизнеспособные семена в почвах альпийских сообществ Тебердинского заповедника (северо-западный Кавказ) // Бюл. МОИП. Отд. биол. 1990. T. 95. Вып. 5. С. 77—87. Семёнова Г.В., Онипченко В.Г. Опыт изучения семенных банков альпийских сообществ в природных условиях // Бюл. МОИП. Отд. биол. 1991. T. 96. Вып. 4. С. 117—122. Работнов Т.А. Фитоценология. М.: Изд-во Моск. ун-та, 1992. 352 с. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/902 2020-07-31T22:48:32Z jour:RA driver

Small photosynthetic flagellates of the White Sea: seasonal dynamics and role in plankton and ice communities Мелкие фототрофные флагелляты Белого моря: сезонная динамика и роль в планктонных и ледовых сообществах E. R. Nikishova I. G. Radchenko T. A. Belevich Е. Р. Никишова И. Г. Радченко Т. А. Белевич Кандалакшский залив season dynamic cryoflora phytoplankton picophytoplankton Kandalaksha Bay Кандалакшский залив сезонная динамика криофлора фитопланктон пикофитопланктон Кандалакшский залив Abundance and biomass of small photosynthetic flagellates (SPF; 3–10 µm), chlorophyll a, and the contribution of SPF to total phytoplankton biomass in different stages of seasonal succession in ice and the surface water were studied in Kandalaksha Bay of the White Sea in September 2016, February and July 2017. In summer SPF biomass in the photic layer averaged 38.36±9.77 mg С/м3, in autumn – 2.22±1.43 mg С/м3, in under-ice water – 2.6±1.72 mg С/м3, and in ice – 14.79±11.25 mg С/м3. The contribution of SPF to total phytoplankton biomass depends of the season and ranged from 29% to 95%, the contribution to sympagic communities averaged 66%. The size structure of photosynthetic flagellates varied by seasons. Flagellates with cell size 6–10 µm dominated in summer plankton and in the ice. Flagellates with cell size 3–6 µm prevailed in autumn and in the under-ice water. The obtained data of SPF abundance gave higher values of the total phytoplankton biomass of the White Sea in the autumn-winter period compared with the estimates obtained previously. Applying the method of epifluorescence microscopy confirms the assumption that photosynthetic flagellates are the main producers in the winter period, as well as in the summer when the biomass of planktonic algae with cell size more than 10 µm is low.more than 10 µm is low. Численность и биомасса мелких (3–10 мкм) фототрофных флагеллят (МФФ), концентрация хлорофилла «а», а также вклад МФФ в суммарную биомассу фитопланктона на разных этапах сезонного развития во льду и поверхностном слое воды были исследованы в Кандалакшском заливе Белого моря в сентябре 2016 г., а также в феврале и июле 2017 г. Биомасса МФФ в поверхностном слое составила в среднем летом 38,36±9,77 мг С/м3, осенью – 2,22±1,43 мг С/м3, зимой в подледной воде – 2,6±1,72 мг С/м3, во льду – 14,79±11,25 мг С/м3. Вклад МФФ в суммарную биомассу фитопланктона колебался в зависимости от сезона от 29% до 95%, вклад в криофлору составил в среднем 66%. Размерная структура МФФ различалась по сезонам. Летом и зимой во льду доминировали флагелляты с размером клетки от 6 до 10 мкм. Осенью и в подледной воде среди МФФ преобладала размерная группа от 3 до 6 мкм. Полученные оценки обилия МФФ обусловили более высокие значения суммарной биомассы фитопланктона Белого моря в осенне-зимний период по сравнению с оценками, полученными ранее. Учет МФФ современным методом эпифлуоресцентной микроскопии подтверждает предположение о том, что основными продуцентами в зимний период, а также летом при низкой биомассе планктонных водорослей размерной фракции более 10 мкм являются МФФ. Lomonosov Moscow State University, School of Biology Работа выполнена в рамках Государственного задания МГУ имени М.В. Ломоносова часть 2 (тема №АААА–А16–116021660052–0). 2020-08-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/902 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 75, № 3 (2020); 176-181 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 75, № 3 (2020); 176-181 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/902/523 Hernandez-Ruiz M., Barber-Lluch E., Prieto A., Alvarez-Salgado X.A., Logares R., Teira E. Seasonal succession of small planktonic eukaryotes inhabiting surface waters of a coastal upwelling system // Env. Microb. 2018. Vol. 20. N 8. P. 2955–2973. Crawford D.W., Cefarelli A.O., Wrohan I.A., Wyatt S.N., Varela D.E. Spatial patterns in abundance, taxonomic composition and carbon biomass of nano- and microphytoplankton in Subarctic and Arctic Seas // Prog. Oceanogr. 2018. Vol. 162. P. 132–159. Kubiszyn, A.M., Wiktor, J.M., Wiktor J.M.Jr., Griffiths C., Kristiansen S., Gabrielsen T.M. The annual planktonic protist community structure in an ice-free high Arctic fjord (Adventfjorden, West Spitsbergen) // J. Mar. Syst. 2017. Vol. 169. P. 61–72. Sieburth J.M., Smetacek V., Lenz J. Pelagic ecosystem structure: heterotrophic compartments of the plankton and their relationships to plankton size fractions // Limnol. Oceanogr. 1978. Vol. 23. N 6. P. 1256–1263. Moon-van der Staay S.Y., De Wachter R., Vaulot D. Oceanic 18S rDNA sequences from picoplankton reveal unsuspected eukaryotic diversity // Nature. 2001. Vol. 409. N 6820. P. 607–610. Caron D.A. Technique for enumeration of heterotrophic and phototrophic nanoplankton, using epifluorescence microscopy, and comparison with other procedures // Appl. Environ. Microbiol. 1983. Vol. 46. N 2. P. 491–498. Hobbie J.E., Daley R.J., Jasper S. Use of nuclepore filters for counting bacteria by fluorescence microscopy // Appl. Environ. Microbiol. 1977. Vol. 33. N 5. P. 1225–1228. Belevich T.A., Ilyash L.V. Picophytoplankton abundance in the Velikaya Salma strait, White Sea // Microbiology. 2012. Vol. 81. N 3. P. 360–366. Hillebrand H., Durselen C.D., Kirschtel D., Pollingher U., Zohary T. Biovolume calculation for pelagic and benthic microalgae // J. Phycol. 1999. Vol. 35. N 2. P. 403–424. Menden-Deuer S., Lessard E.J. Carbon to volume relationships for dinoflagellates, diatoms, and other protist plankton // Limnol. Oceanogr. 2000 Vol. 45. N 3. P. 569–579. Arar E.J., Collins G.B. Method 445.0: In vitro determination of chlorophyll a and pheophytin a in marine and freshwater algae by fluorescence. Cincinnati: United States Environmental Protection Agency, Office of Research and Development, National Exposure Research Laboratory, 1997. 22 pp. Hammer Ø., Harper D.A.T., Ryan P. D. PAST: Paleontological Statistics Software Package for education and data analysis // Palaeontol. Electron. 2001. Vol. 4. N 1: 4. Sazhin A. Phototrophic and heterotrophic nanoand microorganisms of sea ice and sub-ice water in Guba Chupa (Chupa Inlet), White Sea, in April 2002 // Polar Research. 2004. Vol. 23. N 1. P. 11–18. Ильяш Л.В., Житина Л.С., Кудрявцева В.А., Мельников И.А. Сезонная динамика видового состава и биомассы водорослей в прибрежных льдах Канда- лакшского залива Белого моря // Журн. общ. биол. 2012. Т. 73. № 6. С. 461–472. Bolaños L.M., Karp-Boss L., Choi C.J., et al. Small phytoplankton dominate western North Atlantic biomass // ISME J. 2020. Vol. 14. P. 1663–1674. Wassmann P. Arctic marine ecosystems in an era of rapid climate change // Prog. Oceanogr. 2011. Vol. 90. N 1. P. 1–17. Coello-Camba A., Agustí S., Vaqué D., Holding J., Arrieta J.M., Wassmann P., Duarte C.M. Experimental assessment of temperature thresholds for Arctic phytoplankton communities // Estuar. Coasts. 2015. Vol. 38. N 3. P. 873–885. Sherrr E.B., Wheeler P.A. Thompson K. Temporal and spatial variation in stocks of autotrophic and heterotrophic microbes in the upper water column of the central Arctic Ocean // Deep Sea Res. Pt. I: Oceanogr. Res. Pap. 2003. Vol. 50. N 5. P. 557–571. Vaqué D., Guadayol O., Peters F., Felipe J., Angel-Ripoll L., Terrado R., Lovejoy C., Pedrós-Alioó C. Seasonal changes in planktonic bacterivory rates under the icecovered coastal Arctic Ocean // Limnol. Oceanogr. 2008. Vol. 53. N 6. P. 2427–2438. Mostajir B., Gosselin M., Gratton Y., Booth B., Vasseur C., Garneau M.È., Fouilland É., Vidussi F., Demers S. Surface water distribution of pico- and nanophytoplankton in relation to two distinctive water masses in the North Water, northern Baffin Bay, during fall // Aquat. Microb. Ecol. 2001. Vol. 23. N 2. P. 205–212. Waleron M., Waleron K., Vincent W.F., Wilmotte A. Allochthonous inputs of riverine picocyanobacteria to coastal waters in the Arctic Ocean // FEMS Microbiol. Ecol. 2007. Vol. 59. N 2. P. 356–365. Sanders R.W., Gast R.J. Bacterivory by phototrophic picoplankton and nanoplankton in Arctic waters // FEMS Microbiol. Ecol. 2012. Vol. 82. N 2. P. 242–253. Gradinger R. Occurrence of an algal bloom under Arctic pack ice // Mar. Ecol. Prog. Ser. 1996. Vol. 131. P. 301–305. Demers S., Therriault J.C., Descolas-Gros C. Biomasse et composition specifique de la microflore des glaces saisonnieres: influences de la lumiere et de la vitesse de congelation // Mar. Biol. 1984. Vol. 78. N 2. P. 185–191. Сарухан-Бек К.К., Радченко И.Г., Кольцова Т.И. Фитопланктон губы Чупа (Кандалакшский залив Белого моря) // Исследования фитопланктона в системе мониторинга Балтийского моря и других морей СССР / Под ред. И. Я. Агаровой, Е. Ю. Гупало. М.: Гидрометеоиздат, 1990. С. 111–119. Ильяш Л.В., Ратькова Т.Н., Радченко И.Г., Житина Л.С. Фитопланктон Белого моря // Система Белого моря. Т. II. Водная толща и взаимодействующие с ней атмосфера, криосфера, речной сток и биосфера / Под ред. А.П. Лисицына. М.: Научный мир, 2012. С. 605–639. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/113 2015-06-01T13:41:19Z jour:MIC driver

DEPENDENCE OF GROWTH CHARACTERISTICS OF NATURAL STRAINS OF LACTOCOCCUS LACTIS SUBSP. LACTIS ON THE COMPOSITION OF THE NUTRIENT AGAR MEDIA USED FOR BIOMASS GROWTH ЗАВИСИМОСТЬ РОСТОВЫХ ХАРАКТЕРИСТИК ПРИРОДНЫХ ШТАММОВ LACTOCOCCUS LACTIS SUBSP. LACTIS ОТ СОСТАВА АГАРИЗОВАННЫХ ПИТАТЕЛЬНЫХ СРЕД, ИСПОЛЬЗУЕМЫХ ДЛЯ НАРАЩИВАНИЯ БИОМАССЫ M. A. Treninа H. S. Epremyan L. G. Stoyanova М. А. Тренина А. С. Епремян Л. Г. Стоянова ростовые характеристики culture media growth characteristics. ростовые характеристики питательные среды ростовые характеристики The results of dependence of growth characteristics of strains Lactococcus lactis subsp. lactis 729 and TV2 isolated from milk and homemade curd the content in the agar medium peptone from casein as a main nitrogen source. Different composition on the level of enrichment of the agar medium was used for biomass growth strains in the study of growth characteristics in liquid media with the same composition. Compared the number of colony forming units (CFU), the rate of cell division (TDC) and the average hourly doubling time (AHDT) at two time points of cultivation: from 1,0 to 2,5 and from 2,5 to 3,5 hours. Liquid culture medium was maintained logarithmic growth of strain 729 in all variations on a time interval of cultivation to 3,5 hours with a maximum decrease in pH to 6,5. Maximum accumulation level of biomass (2,5 Ѕ 108 cells/ml) was observed when cultured in a pair of media containing meat extract, and the smallest AHDT (37,5 min) when moving biomass MA4 minimal medium (peptone from casein, and 0,4% lactose 0,4%) and rich in containing yeast extract liquid medium M7. Strain 729 in contrast to a strain incapable TB2 form colonies when the content of casein peptone agar medium is less than 0,4%. Reducing the amount of nitrogen source (peptone from casein from 1,0% to 0,4%) resulted in an increase in colony size strain TV2 from2,85 mm2 to5mm2. The stimulatory effect of yeast extract in liquid media under these concentration ratios allowing cell division to increase the effectiveness while reducing the accumulation of lactic acid to achieve critical acidification (pH 5,5) blocks the transport of oligopeptides into a cell. Meat extract contributed bacteria adapt to the conditions of acidity and has a positive effect on cell division of strain 729 at a late stage of development of bacterial populations. Comparative small size of the colonies (area ~0,5 mm2 , diameter ~0,8 mm) can be a sign of strain as active acidifier. Представлены результаты зависимости ростовых характеристик штаммов 729 и ТВ2 Lactococcus lactis subsp. lactis, выделенных из молока и самоквасного творога, от содержания в агаризованной среде пептона из казеина (ПК) в качестве основного источника азота. Сравнивали количество колониеобразующих единиц (КОЕ), темп деления клеток (ТДК) и среднее почасовое время удвоения (СЧВУ) на двух временных отрезках культивирования: от 1 до 2,5 и от 2,5 до 3,5 ч. Жидкие питательные среды поддерживали логарифмический рост штамма 729 во всех вариантах культивирования до 3,5 ч при максимальном снижении рН до 6,5. Максимальный уровень накопления биомассы (2,5 Ѕ 108 кл/мл) наблюдали при культивировании в средах, содержащих мясной экстракт, а наименьшее СЧВУ (37,5 мин) — при переносе биомассы с минимальной среды МА4 в обогащенную жидкую среду М7. Штамм 729 в отличие от штамма ТВ2 не способен образовывать колонии при содержании ПК в агаризованной среде ниже 0,4%. Снижение количества ПК от 1,0% до 0,4% обусловливает увеличение размера колоний штамма ТВ2 от 2,85 мм2 до5мм2. Стимулирующее действие дрожжевого экстракта в жидких средах при данных концентрационных соотношениях позволяет увеличить эффективность деления клеток при сниженном уровне накопления молочной кислоты до достижения рН 5,5, блокирующего транспорт олигопептидов в клетку. Мясной экстракт способствует адаптации бактерий к условиям повышенной кислотности и оказывает положительное действие на деление клеток штамма 729 на поздней стадии развития бактериальных популяций. Неболшой размер колоний может являться признаком штамма как активного кислотообразователя. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-06-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/113 10.1234/XXXX-XXXX-2015-1-31-36 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2015); 31-36 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2015); 31-36 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2015-1 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/113/114 Duwat P., Cesselin B., Sourice S., Gruss A. Lactococcus lactis, a bacterial model for stress responses and survival // Int. J. Food Microbiol. 2000. Vol. 55. N 1—3. P. 83—86. Тренина М.А., Лысенко А.М., Ахвердян В.З., Мчедлишвили Е.Б. Изучение внутривидовой вариабельности бактерий Lactococcus lactis по признаку адаптации к высокой кислотности среды // Микробиология. 2006. Т. 75. № 1. С. 1—9. Стоянова Л.Г., Сультимова Т.Д., Нетрусов А.И. Влияние фосфата и углеводов на синтез низина Lactococcus lactis subsp. lactis штамм 194 // Вестн. Моск. ун-та. Сер. Биология. 2003. № 4. С. 17—22. Стоянова Л.Г., Левина Н.А. Регуляция синтеза бактериоцина рекомбинантного штамма Lactococcus lactis subsp. lactis F-116 компонентным составом среды // Микробиология. 2006. Т. 75. № 3. С. 342—348. Huggins A.R., Sandine W.E. Differentiation of fast and slow milk-coagulating isolates in strains of lactic streptococci // J. Dairy Sci. 1984. Vol. 67. N 8. P. 1674—1679. Суходолец В.В., Лысенко А.М., Тренина М.А. Штамм бактерий Lactococcus lactis для получения творога из молока. 2003. RU 2244002. Corroler D., Mangin I., Desmasures N., Gueguen M. An ecological study of lactococci isolated from raw milk in the Camembert cheese registered designation of origin area // Appl. Environ. Microbiol. 1998. Vol. 64. N 12. P. 4729—4735. Mills S., McAuliffe O.E., Coffey A., Fitzgerald G.F., Ross R.P. Plasmids of lactococci — genetic accessories or genetic necessities?//FEMS Microbiol. Rev. 2006. Vol. 30. P. 243—273. Kelly W., Ward L. Genotypic vs. phenotypic biodiversity in Lactococcus lactis // Microbiology. 2002. Vol. 148. N 11. P. 3332—3333. Стоянова Л.Г., Егоров Н.С. Получение низинпродуцирующих бактерий методом слияния протопластов двух родственных штаммов Lactococcus lactis subsp. lactis, низкоактивных по синтезу низина // Микробиология. 1998. T. 67. № 1. С. 47—54. Stoyanova L.G., Sul’timova T.L., Netrusov A.I. Establishement of toxonomic status of new perspective bacteriocinsyntnesizing Lactococcus strains of varios origins // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2008. Vol. 63. N 4. P. 156—162. Тренина М.А., Ганина В.И., Стоянова Л.Г., Рыбаков Ю.А., Складнев Д.А. Особенности развития молочно-кислых бактерий Lactococcus lactis subs. lactis штамма 729 // Переработка сельхозсырья. 2008. № 8. С. 55—57. Тренина М.А., Складнев Д.А., Бронников С.В., Устюгова Е.А., Стоянова Л.Г. Развитие популяций бактерий Lactococcus lactis ssp. lactis на агаризованных питательных средах, моделирующих естественный субстрат // Экология и промышленность России. 2009. № 5. С. 42—46. Hutkins R.W., Nannen N.L. pH homeostasis in lactic acid bacteria // J. Dairy Sci. 1993. Vol. 76. N 8. P. 2354—2365. Frees D., Vogensen F.K., Ingmer H. Identification of proteins induced at low pH in Lactococcus lactis // Int. J. Food Microbiol. 2003. Vol. 87. N 3. P. 293—300. Foucaud C., Juillard V. Accumulation of casein-derived peptides during growth of proteinase-positive strains of Lactococcus lactis in milk: their contribution to subsequent bacterial growth is impaired by their internal transport // J. Dairy Research. 2000. Vol. 67. N 2. P. 233—240. Juillard V., Le Bars D., Kunji E.R.S., Konings W.N., Gripon J.-C., Richard J. Oligopeptides are the main source of nitrogen for Lactococcus lactis during growth in milk // Appl. Environ. Microbiol. 1995. Vol. 61. N 8. P. 3024—3030. Letort C., Nardi M., Garault P., Monnet V., Juillard V. Casein utilization by Streptococcus thermophilus results in a diauxic growth in milk // Appl. Environ. Microbiol. 2002. Vol. 68. N 6. P. 3162—3165. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/8 2015-04-29T11:28:48Z jour:FF driver

HAIR DIAMETERS DISTRIBUTION IN SHEEP INTERSPECIES HYBRIDS PАСПРЕДЕЛЕНИЕ ВОЛОС ПО ДИАМЕТРУ ПРИ МЕЖВИДОВОЙ ГИБРИДИЗАЦИИ ОВЕЦ E. B. Vsevolodov G. Zh. Sarsekeeva I. F. Latypov L. Aliev V. A. Golichenkov A. S. Musaeva R. Zhapbasov Э. Б. Всеволодов Г. Ж. Сарсекеева И. Ф. Латыпов Л. Алиев В. А. Голиченков А. С. Мусаева Р. Жапбасов шерсть. O. musimon О. aries wild and domestic sheep underwool kemp hair шерсть. O. musimon О. aries дикие и домашние овцы подшерсток ость шерсть. Hair diameters distribution was studied in wild sheep species (Argali — Ovis ammon, Mouflon — O. musimon), domestic sheep (О. aries) and their hybrids. In wild species and their hybrids rather distinctly separated subpopulations of thin (underwool) hairs (10—22 mcm diameter) and thick (kemps) hairs (85—302 mcm) were detected, intermediate diameters being rare. In domestic sheep the kemp subpopulation was very poor, not distinctly separated from the underwool, maximal hair diameter being < 150 mcm. In wild Ѕ domestic crosses the kemp subpopulation was clearly expressed, shifted to lower diameter range, maximal diameters being < 200 mcm. The same restriction was found in 2-month wild species lambs, comparing with adults. Распределение диаметров волос изучено у диких видов овец (архар — Ovis ammon, муфлон — O. musimon), домашних овец (О. aries) и их гибридов. У диких видов и их помесей отмечены довольно четко разделенные субпопуляции тонких (подшерсток) волос (диаметром 10—22 мкм) и толстых (ость) волос (85—302 мкм). Волосы промежуточной между субпопуляциями толщины были редки. У домашних овец модальная толщина подшерстка была смещена направо (20—22 мкм) по сравнению с соответствующей модой для диких овец (12—14 мкм). Остевая субпопуляция у домашних овец представлена бедно и не так четко обособлена от подшерстка, причем максимальный диаметр волос < 150 мкм. У помесей диких видов с домашними овцами остевая субпопуляция волос была четко выражена, смещена к меньшим значениям диаметра, причем максимальный диаметр < 200 мкм). Такое же ограничение было найдено и у двухмесячных ягнят диких видов и их гибридов по сравнению со взрослыми особями. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-04-29 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/8 10.1234/XXXX-XXXX-2013-1-45-50 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2013); 45-50 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2013); 45-50 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2013-1 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/8/10 Всеволодов Э.Б. Волосяные фолликулы. Алма-Ата: Наука, 1979. 190 c. Соколов В.Е., Петрищев Б.И. Кожный покров домашних млекопитающих (копытные). М.: Институт проблем экологии и эволюции РАН, 1997. 288 р. Ryder M.L., Stephenson S.K. Wool growth. L.; N.Y.: Academic Press, 1968. 805 c. Нуртазин С.Т., Всеволодов Э.Б. Биология индивидуального развития. Алматы: „аза… Университетi, 2005. 261 c. Oliver R.F. The dermal papilla and development and growth of hair // J. Soc. Cosmetic Chem. 1971. Vol. 22. P. 741—755. Rogers G.E. Hair follicle differentiation and regulation // Int. J. Dev. Biol. 2004. P. 48, 163—170. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1387 2024-08-27T16:30:17Z jour:REVI driver

Regulation of vascular smooth muscle cell contraction during early postnatal ontogenesis Регуляция сокращения гладкомышечных клеток сосудов в раннем постнатальном онтогенезе D. K. Gaynullina O. S. Tarasova A. A. Shvetsova Д. К. Гайнуллина О. С. Тарасова А. А. Швецова дифференцировка ion channels calcium sensitivity of the contractile apparatus reactive oxygen species differentiation дифференцировка ионные каналы чувствительность сократительного аппарата к ионам кальция активные формы кислорода дифференцировка Growth of the body in early postnatal ontogenesis is associated with changes in the functioning of many organ systems, including the cardiovascular system. The circulatory system of newborns is characterized by numerous structural and functional features, which at the systemic level is manifested in a significantly lower level of blood pressure. This review describes the differences in the mechanisms of regulation of vascular smooth muscle cell contraction in early postnatal ontogenesis and in adulthood, including age-related changes in the functioning of ion channels, which activity affects membrane potential level and intracellular concentration of calcium ions, as well as changes in calcium sensitivity of the contractile apparatus. The final section of the review discusses the connection between the mechanisms regulating contraction and differentiation of vascular smooth muscle cells during maturation. Рост организма в раннем постнатальном онтогенезе связан с изменением функционирования многих систем, в том числе сердечно-сосудистой. Для кровеносной системы новорожденных характерны многочисленные структурные и функциональные особенности, что на системном уровне проявляется в существенно более низком артериальном давлении. В этом обзоре рассмотрены различия механизмов регуляции сокращения гладкомышечных клеток сосудов в раннем постнатальном онтогенезе и во взрослом возрасте, включая возрастные изменения функционирования ионных каналов, активность которых влияет на уровень мембранного потенциала и внутриклеточную концентрацию ионов кальция, а также изменения кальциевой чувствительности сократительного аппарата. Заключительный раздел обзора посвящен обсуждению вопроса о связи механизмов регуляции сокращения и дифференцировки гладкомышечных клеток сосудов во время их созревания. Lomonosov Moscow State University, School of Biology The research was supported by the Scientific Project of the State Order of the Government of Russian Federation to Lomonosov Moscow State University No. 121032300071-8. Обзор написан в рамках выполнения Научного проекта государственного задания Правительства Российской Федерации Московскому государственному университету имени М.В. Ломоносова № 121032300071-8. 2024-08-27 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1387 10.55959/MSU0137-0952-16-79-2S-11 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 79, № 2S (2024); 55-64 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 79, № 2S (2024); 55-64 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1387/688 Kent A.L., Kecskes Z., Shadbolt B., Falk M.C. Normative blood pressure data in the early neonatal period. Pediatr Nephrol. 2007;22(9):1335–1341. Noori S., Drabu B., Soleymani S., Seri I. Continuous non-invasive cardiac output measurements in the neonate by electrical velocimetry: A comparison with echocardiography. Arch. Dis. Child. Fetal Neonatal Ed. 2012;97(5):340–344. Stulcová B. Postnatal development of cardiac output distribution measured by radioactive microspheres in rats. Biol. Neonate. 1977;32(3–4):119–124. Mochalov S. V., Tarasova N. V., Kudryashova T.V., Gaynullina D.K., Kalenchuk V.U., Borovik A.S., Vorotnikov A.V., Tarasova O.S., Schubert R. Higher Ca2+ -sensitivity of arterial contraction in 1-week-old rats is due to a greater Rho-kinase activity. Acta Physiol. 2018;223(3):e13044. Puzdrova V.A., Kudryashova T. V., Gaynullina D.K., Mochalov S. V., Aalkjaer C., Nilsson H,, Vorotnikov A.V., Schubert R., Tarasova O.S. Trophic action of sympathetic nerves reduces arterial smooth muscle Ca2+ sensitivity during early post-natal development in rats. Acta Physiol. 2014;212(2):128–141. Sofronova S.I., Borzykh A.A., Gaynullina D.K., Kuzmin I. V., Shvetsova A.A., Lukoshkova E.V., Tarasova O.S. Endothelial nitric oxide weakens arterial contractile responses and reduces blood pressure during early postnatal development in rats. Nitric Oxide. 2016;55–56:1–9. Gaynullina D., Lubomirov L.T., Sofronova S.I., Kalenchuk V.U., Gloe T., Pfitzer G., Tarasova O.S., Schubert R. Functional remodelling of arterial endothelium during early postnatal development in rats. Cardiovasc. Res. 2013;99(4):612–621. Gaynullina D.K., Schubert R., Tarasova O.S. Changes in endothelial nitric oxide production in systemic vessels during early ontogenesis-a key mechanism for the perinatal adaptation of the circulatory system. Int. J. Mol. Sci. 2019;20(6):1421. Somlyo A.P., Somlyo A.V. Ca2+ sensitivity of smooth muscle and nonmuscle myosin II: Modulated by G proteins, kinases, and myosin phosphatase. Physiol. Rev. 2003;83(4):1325–1358. Dimopoulos G.J., Semba S., Kitazawa K., Eto M., Kitazawa T. Ca2+-dependent rapid Ca2+ sensitization of contraction in arterial smooth muscle. Circ. Res. 2007;100(1):121–129. Tykocki N.R., Boerman E.M., Jackson W.F. Smooth muscle ion channels and regulation of vascular tone in resistance arteries and arterioles. Compr. Physiol. 2017;7(2):485–581. Kitazawa T., Kitazawa K. Size-dependent heterogeneity of contractile Ca2+ sensitization in rat arterial smooth muscle. J. Physiol. 2012;590(2):5401–5423. Hansen P.B.L. New role of P/Q-type voltagegated calcium channels. J. Cardiovasc. Pharmacol. 2015;65(5):406–411. Gollasch M., Haase H., Ried C., Lindschau C., Morano I., Luft F.C., Haller H. L-type calcium channel expression depends on the differentiated state of vascular smooth muscle cells. FASEB J. 1998;12(7):593–601. Quignard J.F., Grazzini E., Guillon G., Harricane M.C., Nargeot J., Richard S. Absence of calcium channels in neonatal rat aortic myocytes. Pflugers Arch. Eur. J. Physiol. 1996;431(5):791–793. Nakanishi T., Gu H., Abe K., Momma K. Developmental changes in the contractile system of the mesenteric small artery of rabbit. Pediatr. Res. 1997;41(1):65–71. Lozinskaya I.M., Cox R.H. Effects of age on Ca2+ currents in small mesenteric artery myocytes from WistarKyoto and spontaneously hypertensive rats. Hypertens. 1997;29(6):1329–1336. Blood A.B., Zhao Y., Long W., Zhang L., Longo L.D. L-type Ca2+ channels in fetal and adult ovine cerebral arteries. Am. J. Physiol. Regul. Integr. Comp. Physiol. 2002;282(1):51–51. Ahmed A., Waters C.M., Leffler C.W., Jaggar J.H. Ionic mechanisms mediating the myogenic response in newborn porcine cerebral arteries. Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. 2004;287 (5):H2061–H2069. Long W., Zhao Y., Zhang L., Longo L.D. Role of Ca2+ channels in NE-induced increase in [Ca2+]i and tension in fetal and adult cerebral arteries. Am. J. Physiol. Regul. Integr. Comp. Physiol. 1999;277(1):R286–R294. Cogolludo A., Moreno L., Lodi F., Tamargo J., Perez-Vizcaino F. Postnatal maturational shift from PKCζ and voltage-gated K+ channels to RhoA/Rho kinase in pulmonary vasoconstriction. Cardiovasc. Res. 2005;66(1):84–93. Shen C.P., Romero M., Brunelle A., Wolfe C., Dobyns A., Francis M, Taylor M.S., Puglisi J.L., Loggo L.D., Zhang L., Wilson C.G., Wilson S.M. Longterm high-altitude hypoxia influences pulmonary arterial L-type calcium channel-mediated Ca2+ signals and contraction in fetal and adult sheep. Am. J. Physiol. Regul. Integr. Comp. Physiol. 2018;314(3):R433–R446. Ricci A., Bronzetti E., El-Assouad D., Felici L., Greco S., Mariotta S., Sabbatini M., Amenta F. Influence of age on L-type Ca2+ channels in the pulmonary artery and vein of spontaneously hypertensive rats. Mech. Ageing Dev. 2000;120(1–3):33–44. House S.J., Potier M., Bisaillon J., Singer H.A., Trebak M. The non-excitable smooth muscle: Calcium signaling and phenotypic switching during vascular disease. Pflugers Arch. Eur. J. Physiol. 2008;456(5):769–785. Soni H., Peixoto-Neves D., Buddington R.K., Adebiyi A. Adenosine A1 receptor-operated calcium entry in renal afferent arterioles is dependent on postnatal maturation of TRPC3 channels. Am. J. Physiol. Ren. Physiol. 2017;313(6):F1216–F1222. Chipperfield A.R., Harper A.A. Chloride in smooth muscle. Prog. Biophys. Mol. Biol. 2000;74(3–5):175–221. Hübner C.A., Schroeder B.C., Ehmke H. Regulation of vascular tone and arterial blood pressure: role of chloride transport in vascular smooth muscle. Pflugers Arch. Eur. J. Physiol. 2015;467(3):605–614. Nilsson H., Videbæk L.M., Toma C., Mulvany M.J. Role of intracellular calcium for depolarization in rat mesenteric small arteries. J. Vasc. Res. 1998;35:36–44. Boedtkjer D.M.B., Kim S., Jensen A.B., Matchkov V.M., Andersson K.E. New selective inhibitors of calcium-activated chloride channels – T16Ainh-A01, CaCCinh-A01 and MONNA – what do they inhibit? Br. J. Pharmacol. 2015;172(16):4158–4171. Nelson M.T., Conway M.A., Knot H.J., Brayden J.E. Chloride channel blockers inhibit myogenic tone in rat cerebral arteries. J. Physiol. 1997;502(2):259–264. Lamb F.S., Barna T.J. Chloride ion currents contribute functionally to norepinephrine-induced vascular contraction. Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. 1998;275(1):151–160. Kostyunina D.S., Zhang L., Shvetsova A.A., Selivanova E.K., Tarasova O.S., Matchkov VV., Gaynullina D.K. Trophic sympathetic influence weakens pro-contractile role of Cl− channels in rat arteries during postnatal maturation. Sci. Rep. 2020;10(1):20002. Heinze C., Seniuk A., Sokolov M.V., Huebner A.K., Klementowicz A.E., Szijártó I.A., Schleifenbaum J., Vitzthum H., Gollasch M., Ehmke H., Schroeder B.C., Hübner C.A. Disruption of vascular Ca2+-activated chloride currents lowers blood pressure. J. Clin. Invest. 2014;124(2):675–686. Jensen A.B., Joergensen H.B., Dam V.S., Kamaev D., Boedtkjer D., Füchtbauer E.-M., Aalkjaer C., Matchkov V.V. Variable contribution of TMEM16A to tone in murine arterial vasculature. Basic Clin. Pharmacol. Toxicol. 2018;123(1):30–41. Broegger T., Jacobsen J.C.B., Secher Dam V., Boedtkjer D.M.B., Kold-Petersen H., Pedersen F.S, Pedersen F.S., Aalkjaer C., Matchkov V.V. Bestrophin is important for the rhythmic but not the tonic contraction in rat mesenteric small arteries. Cardiovasc. Res. 2011;91(4):685–693. Kostyunina D.S., Tarasova O.S., Gaynullina D.K., Matchkov V.V. Pro-contractile role of chloride in arterial smooth muscle: Postnatal decline potentially governed by sympathetic nerves. Exp. Physiol. 2019;104(7):1018–1022. Belevych A.E., Beck R., Tammaro P., Poston L., Smirnov S.V. Developmental changes in the functional characteristics and expression of voltage-gated K+ channel currents in rat aortic myocytes. Cardiovasc. Res. 2002;54(1):152–161. Shvetsova A.A., Gaynullina D.K., Tarasova O.S., Schubert R. Negative feedback regulation of vasocontraction by potassium channels in 10- to 15-day-old rats: Dominating role of Kv 7 channels. Acta Physiol. 2019;225(2):e13176. Long W., Zhang L., Longo L.D. Cerebral artery KATP- and KCa-channel activity and contractility: changes with development. Am. J. Physiol. Integr. Comp. Physiol. 2000;279(6):R2004–R2014. Shvetsova A.A., Gaynullina D.K., Schmidt N., Bugert P., Lukoshkova E. V., Tarasova O.S, Schubert R. TASK-1 channel blockade by AVE1231 increases vasocontractile responses and BP in 1- to 2-week-old but not adult rats. Br. J. Pharmacol. 2020;177(22):5148–5162. Gomez J.P., Ghisdal P., Morel N. Changes of the potassium currents in rat aortic smooth muscle cells during postnatal development. Pflugers Arch. Eur. J. Physiol. 2000;441(2–3):388–397. Bregestovski P.D., Printseva O.Yu., Serebryakov V., Stinnakre J., Turmin A., Zamoyski V. Comparison of Ca2+-dependent K+ channels in the membrane of smooth muscle cells isolated from adult and foetal human aorta. Pflugers Arch. 1988;413(1):8–13. Gollasch M., Wellman G.C., Knot H.J., Jaggar J.H., Damon D.H., Bonev A.D., Nelson M.T. Ontogeny of local sarcoplasmic reticulum Ca2+ signals in cerebral arteries: Ca2+ sparks as elementary physiological events. Circ. Res. 1998;83(11):1104–1114. Ma D., Gaynullina D., Schmidt N., Mladenov M., Schubert R. The functional availability of arterial Kv 7 channels is suppressed considerably by large-conductance calcium-activated potassium channels in 2- to 3-month old but not in 10- to 15-day old rats. Front. Physiol. 2020;11:597395. Teng G.Q., Nauli S.M., Brayden J.E., Pearce W.J. Maturation alters the contribution of potassium channels to resting and 5HT-induced tone in small cerebral arteries of the sheep. Dev. Brain Res. 2002;133(2):81–91. Thorpe R.B., Stockman S.L., Williams J.M., Lincoln T.M., Pearce W.J. Hypoxic depression of PKGmediated inhibition of serotonergic contraction in ovine carotid arteries. Am. J. Physiol. Regul. Integr. Comp. Physiol. 2013;304(9):R734–R743. Bao L., Cox D.H. Gating and ionic currents reveal how the BKCa channel’s Ca2+ sensitivity is enhanced by its β1 subunit. J. Gen. Physiol. 2005;126(4):393–412. Shvetsova A.A., Gaynullina D.K., Tarasova O.S., Schubert R. Remodeling of arterial tone regulation in postnatal development: Focus on smooth muscle cell potassium channels. Int. J. Mol. Sci. 2021;22(11):5413. Rhodes M.T., Porter V.A., Saqueton C.B., Herron J.M., Resnik E.R., Cornfield D.N. Pulmonary vascular response to normoxia and KCa channel activity is developmentally regulated. Am. J. Physiol. Lung Cell. Mol. Physiol. 2001;280(6):L1250–1257. Cornfield D.N., Saqueton C.B., Porter V.A, Herron J., Resnik E., Haddad I.Y., Reeve H.L. Voltage-gated K(+)-channel activity in ovine pulmonary vasculature is developmentally regulated. Am. J. Physiol. Lung Cell. Mol. Physiol. 2000;278(6):L1297–L1304. Reeve H.L., Weir E.K., Archer S.L., Cornfield D.N. A maturational shift in pulmonary K+ channels, from Ca2+ sensitive to voltage dependent. Am. J. Physiol. 1998;27596):L1019–1025. Pearce W.J., Elliott S.R. Maturation enhances the sensitivity of ovine cerebral arteries to the ATP-sensitive potassium channel activator lemakalim. Pediatr. Res. 1994;35(6):729–732. Akopov S.E., Zhang L., Pearce W.J. Developmental changes in the calcium sensitivity of rabbit cranial arteries. Biol. Neonate. 1998;74(1):60–71. 54. Akopov S.E., Zhang L., Pearce W.J. Physiological variations in ovine cerebrovascular calcium sensitivity. Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. 1997;272(5):41–45. Sandoval R.J., Injeti E.R., Williams J.M., Georthoffer W.T., Pearce W.J. Myogenic contractility is more dependent on myofilament calcium sensitization in term fetal than adult ovine cerebral arteries. Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. 2007;293(1):H548–H556. Воротников А.В., Щербакова О.В., Кудряшова Т.В., Тарасова О.С., Ширинский В.П., Пфитцер Г., Ткачук В.А. Фосфорилирование миозина как основной путь регуляции сокращения гладких мышц. Росс. физиол. журн. им. И.М. Сеченова. 2009;95(10):1058–1073. Pearce W.J., Williams J.M., Chang M.M., Gerthoffer W.T. ERK inhibition attenuates 5-HT-induced contractions in fetal and adult ovine carotid arteries. Arch. Physiol. Biochem. 2003;111(1):36–44. Gaynullina D.K., Kudryashova T.V., Vorotnikov A.V., Schubert R., Tarasova O.S. MAPKs are highly abundant but do not contribute to α1-adrenergic contraction of rat saphenous arteries in the early postnatal period. Int. J. Mol. Sci. 2021;22(11):6037. Akopov S.E., Zhang L., Pearce W.J. Regulation of Ca2+ sensitization by PKC and rho proteins in ovine cerebral arteries: Effects of artery size and age. Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. 1998;275(3):930–939. Mochalov S.V., Kalenchuk V.U., Gainullina D.K., Vorotnikov A.V., Tarasova O.S. The contribution of protein kinase C and Rho-kinase to the regulation of receptordependent contraction of arteries decreases with age independently of sympathetic innervation. Biophysics (Mosc.). 2008;53(6):626–631. Knock G.A. NADPH oxidase in the vasculature: Expression, regulation and signalling pathways; role in normal cardiovascular physiology and its dysregulation in hypertension. Free Radic. Biol. Med. 2019;145:385–427. Shvetsova A.A., Gaynullina D.K., Tarasova O.S. The role of reactive oxygen species in the regulation of blood vessel tone in perinatal and early postnatal ontogenesis. J. Evolutionary Biochem. Physiol. 2023;59(6):2210–2227. Brinks L., Moonen R.M.J., Moral-Sanz J., Barreira B., Kessels L., Perez-Vizcaino F., Collogudo A., Villamor E. Hypoxia-induced contraction of chicken embryo mesenteric arteries: Mechanisms and developmental changes. Am. J. Physiol. Regul. Integr. Comp. Physiol. 2016;311(5):R858–R869. Thakor A.S., Richter H.G., Kane A.D., Dunster C., Kelly F.J., Poston L., Giussani D.A. Redox modulation of the fetal cardiovascular defence to hypoxaemia. J. Physiol. 2010;588(21):4235–4247. Kane A.D., Hansell J.A., Herrera E.A., Allison B.J., Niu Y., Brain K.L., Kaandorp J.J., Derks J.B., Giussani D.A. Xanthine oxidase and the fetal cardiovascular defence to hypoxia in late gestation ovine pregnancy. J. Physiol. 2014;592(3):475–489. Michelakis E.D., Rebeyka I., Wu X.C., Nsair A., Thébaud B., Hashimoto K., Dyck J.R., Haromy A., Harry G., Barr A., Archer S.L. O2 sensing in the human ductus arteriosus: Regulation of voltage-gated K+ channels in smooth muscle cells by a mitochondrial redox sensor. Circ. Res. 2002;91(6):478–486. Cogolludo A.L., Moral-Sanz J., Van Der Sterren S., Frazziano G., Van Cleef A.N.H. Maturation of O2 sensing and signaling in the chicken ductus arteriosus. Am. J. Physiol. Lung Cell. Mol. Physiol. 2009;297(4):619–630. Reeve H.L., Tolarova S., Nelson D.P., Archer S., Kenneth Weir E. Redox control of oxygen sensing in the rabbit ductus arteriosus. J. Physiol. 2001;533(1):253–261. Kajimoto H., Hashimoto K., Bonnet S.N., Haromy A., Harry G., Moudgil R., Nakanishi T., Rebeyka I., Thébaud B., Michelakis E.D., Archer S.I. Oxygen activates the Rho/Rho-kinase pathway and induces RhoB and ROCK-1 expression in human and rabbit ductus arteriosus by increasing mitochondria-derived reactive oxygen species: A newly recognized mechanism for sustaining ductal constriction. Circulation. 2007;115(13):1777–1788. Shvetsova A.A., Khlystova M.A., Makukha Y.A., Shateeva V.S., Borzykh A.A., Gaynullina D.K., Tarasova O.S. Reactive oxygen species augment contractile responses of saphenous artery in 10-15-day-old but not adult rats: Substantial role of NADPH oxidases. Free Radic. Biol. Med. 2024;216:24–32. Vogel P.A., Yang X., Moss N.G., Arendshorst W.J. Superoxide enhances Ca2+ entry through L-type channels in the renal afferent arteriole. Hypertension. 2015:66(2):374–381. Ding Y., Winters A., Ding M., Graham S., Akopova I., Muallem S., Wang Y., Hee Hong J., Gryczynski Z., Yang S.-H., Birnbaumer L., Ma R. Reactive oxygen species-mediated TRPC6 protein activation in vascular myocytes, a mechanism for vasoconstrictor-regulated vascular tone. J. Biol. Chem. 2011;286(36):31799–31809. Snetkov V.A., Smirnov S.V., Kua J., Aaronson P.I., Ward J.P., Knock G.A. Superoxide differentially controls pulmonary and systemic vascular tone through multiple signalling pathways. Cardiovasc. Res. 2011;89(1):214–224. Knock G.A., Snetkov V.A., Shaifta Y., Aaronson P.I., Ward J.P.T., Knock G.A. Superoxide constricts rat pulmonary arteries via Rho-kinase-mediated Ca2+ sensitization. Free Radic. Biol. Med. 2009;46(5):633–642. Bruckner M., Binder-Heschl C., Schwaberger B., Mileder L.P., Baik-Schneditz N., Koestenberger M., Avian A., Urlesberger B., Pichler G. Cerebral and peripheral tissue oxygenation in stable neonates: Absent influence of cardiac function. Acta Paediatr. 2020;109(8):1560–1569. Rudolph A.M. Distribution and regulation of blood flow in the fetal and neonatal lamb. Circ. Res. 1985;57(6):811–821. Charles S.M., Zhang L., Cipolla M.J., Buchholz J.N., Pearce W.J. Roles of cytosolic Ca2+ concentration and myofilament Ca2+ sensitization in age-dependent cerebrovascular myogenic tone. Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. 2010;299(4):H1034– H1044. Reho J.J., Zheng X., Benjamin J.E., Fisher S.A. Neural programming of mesenteric and renal arteries. Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. 2014;307(4):H563–H573. Badran A., Nasser S.A., Mesmar J., El-Yazbi A.F., Bitto A, Fardoun M.M., Baydoun E., Eid A.H. Reactive oxygen species: Modulators of phenotypic switch of vascular smooth muscle cells. Int. J. Mol. Sci. 2020;21(22):8764. Sawma T., Shaito A., Najm N., Sidani M., Orekhov A., El-Yazbi A.F., Iratni R., Eid A.H. Role of RhoA and Rho-associated kinase in phenotypic switching of vascular smooth muscle cells: Implications for vascular function. Atherosclerosis. 2022;358:12–28. Wamhoff B.R., Bowles D.K., McDonald O.G., Sinha S., Somlyo A.P., Somlyo A.V., Owens G.K. L-type voltage-gated Ca2+ channels modulate expression of smooth muscle differentiation marker genes via a Rho kinase/myocardin/SRF-dependent mechanism. Circ. Res. 2004;95(4):406–414. Hellstrand P., Albinsson S. Stretch-dependent growth and differentiation in vascular smooth muscle: role of the actin cytoskeleton. Can. J. Physiol. Pharmacol. 2005;83(10):869–875. Mack C.P., Somlyo A.V, Hautmann M., Somlyo A.P., Owens G.K. Smooth muscle differentiation marker gene expression is regulated by RhoA-mediated actin polymerization. J. Biol. Chem. 2001;276(1):341–347. Clempus R.E., Sorescu D., Dikalova A.E., Pounkova L., Jo P., Sorescu G.P., Schmidt H.H.H., Lassègue B., Griendling K.K. Nox4 is required for maintenance of the differentiated vascular smooth muscle cell phenotype. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 2007;27(1):42–48. Xiao Q., Luo Z., Pepe A.E., Margariti A., Zeng L., Xu Q. Embryonic stem cell differentiation into smooth muscle cells is mediated by Nox4-produced H2O2. Am. J. Physiol. Cell Physiol. 2009;296(4):711–723. Shvetsova A.A., Borzykh A.A., Selivanova E.K., Kiryukhina O.O., Gaynullina D.K., Tarasova O.S. Intrauterine nitric oxide deficiency weakens differentiation of vascular smooth muscle in newborn rats. Int. J. Mol. Sci. 2021;22(15):8003. Sauzeau V., Rolli-Derkinderen M., Marionneau C., Loirand G., Pacaud P. RhoA expression is controlled by nitric oxide through cGMP-dependent protein kinase activation. J. Biol. Chem. 2003;278(11):9472–9480. Pilz R.B., Casteel D.E. Regulation of gene expression by cyclic GMP. Circ. Res. 2003;93(11):1034–1046. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/271 2015-08-17T21:16:06Z jour:MOL-BIO driver

RNA IMPORT INTO MITOCHONDRIA AND ITS USE IN THE GENE THERAPY ИМПОРТ РНК В МИТОХОНДРИИ И ЕГО ПРИМЕНЕНИЕ В ГЕННОЙ ТЕРАПИИ V. A. Lakunina M. V. Baleva S. A. Levitskii I. V. Chicherin I. A. Krasheninnikov E. O. Samoylova P. A. Kamenski Валентина Александровна Лакунина Мария Вячеславовна Балева Сергей Алексеевич Левицкий Иван Владимирович Чичерин Игорь Александрович Крашенинников Елена Олеговна Самойлова Пётр Андреевич Каменский обзор RNA RNA import into mitochondria gene therapy review обзор РНК импорт РНК в митохондрии генная терапия обзор Among biological macromolecules imported into the eukaryotic cells mitochondria, there are proteins and ribonucleic acids. Protein import into mitochondria is a universal process, and its mechanisms are currently well described. RNA import into mitochondria, on the contrary, is known only for several eukaryotic species, and the mechanisms of this process are largely species-specific. In this review, we summarize existing data about RNA import into mitochondria of human cells and discuss the possibilities of its implication for the gene therapy of mitochondrial diseases. К биологическим макромолекулам, импортирующимся в митохондрии эукариотических клеток из цитозоля, относятся белки и рибонуклеиновые кислоты. Импорт белков в митохондрии — универсальный процесс, и его механизмы описаны в достаточной степени подробно. Импорт РНК в митохондрии, напротив, показан только для некоторых групп организмов, и в каждом случае механизмы данного процесса обладают большим количеством индивидуальных особенностей. В данном обзоре рассматриваются современные данные о процессе импорта РНК в митохондрии клеток человека и обсуждается возможность использования данного процесса в генной терапии митохондриальных болезней. Lomonosov Moscow State University, School of Biology Министерство образования и науки РФ 2015-08-17 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/271 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 3 (2015); 32-36 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 3 (2015); 32-36 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/271/269 Schneider A. Mitochondrial tRNA import and its consequences for mitochondrial translation // Annu. Rev. Biochem. 2011. Vol. 80. P. 1033—1053. Chang D.D., Clayton D.A. A mammalian mitochondrial RNA processing activity contains nucleus-encoded RNA // Science. 1987. Vol. 235. N 4793. P. 1178—1184. Li K., Smagula C.S., Parsons W.J., Richardson J.A., Gonzalez M., Hagler H.K., Williams R.S. Subcellular partitioning of MRP RNA assessed by ultrastructural and biochemical analysis // J. Cell Biol. 1994. Vol. 124. N 6. P. 871—882. Doersen C.J., Guerrier-Takada C., Altman S., Attardi G. Characterization of an RNase P activity from HeLa cell mitochondria. Comparison with the cytosol RNase P activity // J. Biol. Chem. 1985. Vol. 260. N 10. P. 5942—5949. Wang G., Chen H.W., Oktay Y., Zhang J., Allen E.L., Smith G.M., Fan K.C., Hong J.S., French S.W., McCaffery J.M., Lightowlers R.N., Morse H.C. III, Koehler C.M., Teitell M.A. PNPASE regulates RNA import into mitochondria // Cell. 2010. Vol. 142. N 3. P. 456—467. Wang G., Shimada E., Koehler C.M., Teitell M.A. PNPASE and RNA trafficking into mitochondria // Biochim. Biophys. Acta. 2012. Vol. 1819. N 9—10. P. 998—1007. Rainey R.N., Glavin J.D., Chen H.W., French S.W., Teitell M.A., Koehler C.M. A new function in translocation for the mitochondrial i-AAA protease Yme1: import of polynucleotide phosphorylase into the intermembrane space // Mol. Cell Biol. 2006. Vol. 26. N 22. P. 8488—8497. Wang G., Shimada E., Zhang J., Hong J.S., Smith G.M., Teitell M.A., Koehler C.M. Correcting human mitochondrial mutations with targeted RNA import // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2012. Vol. 109. N 13. P. 4840—4845. Yoshionari S., Koike T., Yokogawa T., Nishikawa K., Ueda T., Miura K., Watanabe K. Existence of nuclearencoded 5S-rRNA in bovine mitochondria // FEBS Lett. 1994. Vol. 338. N 2. P. 137—142. Magalhaes P.J., Andreu A.L., Schon E.A. Evidence for the presence of 5S rRNA in mammalian mitochondria // Mol. Biol. Cell. 1998. Vol. 9. N 9. P. 2375—2382. Smirnov A.V., Entelis N.S., Krasheninnikov I.A., Martin R., Tarassov I.A. Specific features of 5S rRNA structure — its interactions with macromolecules and possible functions // Biochemistry (Mosc.). 2008. Vol. 73. N 13. P. 1418—1437. Smirnov A., Tarassov I., Mager-Heckel A.M., Letzelter M., Martin R.P., Krasheninnikov I.A., Entelis N. Two distinct structural elements of 5S rRNA are needed for its import into human mitochondria // RNA. 2008. Vol. 14. N 4. P. 749—759. Entelis N.S., Kolesnikova O.A., Dogan S., Martin R.P., Tarassov I.A. 5S rRNA and tRNA import into human mitochondria. Comparison of in vitro requirements // J. Biol. Chem. 2001. Vol. 276. N 49. P. 45642—45653. Smirnov A., Comte C., Mager-Heckel A.M., Addis V., Krasheninnikov I.A., Martin R.P., Entelis N., Tarassov I. Mitochondrial enzyme rhodanese is essential for 5S ribosomal RNA import into human mitochondria // J. Biol. Chem. 2010. Vol. 285. N 40. P. 30792—30803. Smirnov A., Entelis N., Martin R.P., Tarassov I. Biological significance of 5S rRNA import into human mitochondria: role of ribosomal protein MRP-L18 // Genes Dev. 2011. Vol. 25. N 12. P. 1289—1305. Entelis N., Brandina I., Kamenski P., Krasheninnikov I.A., Martin R.P., Tarassov I. A glycolytic enzyme, enolase, is recruited as a cofactor of tRNA targeting toward mitochondria in Saccharomyces cerevisiae // Genes Dev. 2006. Vol. 20. N 12. P. 1609—1620. Kamenski P., Smirnova E., Kolesnikova O., Krasheninnikov I.A., Martin R.P., Entelis N., Tarassov I. tRNA mitochondrial import in yeast: Mapping of the import determinants in the carrier protein, the precursor of mitochondrial lysyl-tRNA synthetase // Mitochondrion. 2010. Vol. 10. N 3. P. 284—293. Brown A., Amunts A., Bai X. C., Sugimoto Y., Edwards P.C., Murshudov G., Scheres S.H., Ramakrishnan V. Structure of the large ribosomal subunit from human mitochondria // Science. 2014. Vol. 346. N 6210. P. 718—722. Greber B.J., Boehringer D., Leibundgut M., Bieri P., Leitner A., Schmitz N., Aebersold R., Ban N. The complete structure of the large subunit of the mammalian mitochondrial ribosome // Nature. 2014. Vol. 515. N 7526. P. 283—286. Gowher A., Smirnov A., Tarassov I., Entelis N. Induced tRNA import into human mitochondria: implication of a host aminoacyl-tRNA-synthetase // PLoS One. 2013. Vol. 8. N 6. P. e66228. Kolesnikova O.A., Entelis N.S., Jacquin-Becker C., Goltzene F., Chrzanowska-Lightowlers Z.M., Lightowlers R.N., Martin R.P., Tarassov I. Nuclear DNA-encoded tRNAs targeted into mitochondria can rescue a mitochondrial DNA mutation associated with the MERRF syndrome in cultured human cells // Hum. Mol. Genet. 2004. Vol. 13. N 20. P. 2519—2534. Patrushev M.V., Kamenski P.A., Mazunin I.O. Mutations in mitochondrial DNA and approaches for their correction // Biochemistry (Mosk.). 2014. Vol. 79. N 11. P. 1151—1160. Kolesnikova O.A., Entelis N.S., Mireau H., Fox T.D., Martin R.P., Tarassov I.A. Suppression of mutations in mitochondrial DNA by tRNAs imported from the cytoplasm // Science. 2000. Vol. 289. N 5486. P. 1931—1933. Karicheva O.Z., Kolesnikova O.A., Schirtz T., Vysokikh M.Y., Mager-Heckel A.M., Lombes A., Boucheham A., Krasheninnikov I.A., Martin R.P., Entelis N., Tarassov I. Correction of the consequences of mitochondrial 3243A>G mutation in the MT-TL1 gene causing the MELAS syndrome by tRNA import into mitochondria // Nucleic Acids Res. 2011. Vol. 39. N 18. P. 8173—8186. Kolesnikova O., Kazakova H., Comte C., Steinberg S., Kamenski P., Martin R.P., Tarassov I., Entelis N. Selection of RNA aptamers imported into yeast and human mitochondria // RNA. 2010. Vol. 16. N 5. P. 926—941. Comte C., Tonin Y., Heckel-Mager A.M., Boucheham A., Smirnov A., Aure K., Lombes A., Martin R.P., Entelis N., Tarassov I. Mitochondrial targeting of recombinant RNAs modulates the level of a heteroplasmic mutation in human mitochondrial DNA associated with Kearns Sayre Syndrome // Nucleic Acids Res. 2013. Vol. 41. N 1. P. 418—433. Tonin Y., Heckel A.M., Vysokikh M., Dovydenko I., Meschaninova M., Rotig A., Munnich A., Venyaminova A., Tarassov I., Entelis N. Modeling of antigenomic therapy of mitochondrial diseases by mitochondrially addressed RNA targeting a pathogenic point mutation in mitochondrial DNA // J. Biol. Chem. 2014. Vol. 289. N 19. P. 13323—13334. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/40 2015-05-17T11:48:46Z jour:GR driver

ON THE CELL BIOLOGY OF AGING TEACHING AT HARBIN INSTITUTE OF TECHNOLOGY AND LOMONOSOV MOSCOW STATE UNIVERSITY ОБ ОПЫТЕ ПРЕПОДАВАНИЯ КЛЕТОЧНОЙ БИОЛОГИИ СТАРЕНИЯ В ХАРБИНСКОМ ПОЛИТЕХНИЧЕСКОМ УНИВЕРСИТЕТЕ И МОСКОВСКОМ ГОСУДАРСТВЕННОМ УНИВЕРСИТЕТЕ ИМЕНИ М.В. ЛОМОНОСОВА Lijun Wei Yu Li Jie He A. N. Khokhlov Лицзун Вэй Юй Ли Цзей Хэй А. Н. Хохлов системный подход cytogerontology cell biology teaching system approach. системный подход цитогеронтология клеточная биология преподавание системный подход The approaches to teaching, as part of the appropriate agreements, the cell biology of aging (cytogerontology) by scientists of the School of Biology of Lomonosov Moscow State University at the Department of Life Science and Engineering of Harbin Institute of Technology (China) are described. Drawing attention to some differences in teaching biology between two institutions the authors emphasize the importance of system approach to the cytogerontology studying. The approach makes absolutely necessary an introductory course on basics of biology of aging. It is concluded that literal perception of the data of modern molecular-cell cytogerontological investigations by the students from both institutions is impossible without understanding the fundamental notions and definitions used in both theoretical and experimental gerontology. Излагаются подходы к преподаванию, в рамках соответствующих соглашений, клеточной биологии старения (цитогеронтологии) специалистами биологического факультета Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова в Центре инженерно-медицинских и биологических наук Харбинского политехнического университета (Китай). Отмечая имеющиеся определенные различия между двумя вузами в преподавании биологических дисциплин, авторы подчеркивают важность системного похода к изучению цитогеронтологии, делающего совершенно необходимым чтение вводного курса лекций по основам биологии старения. Заключается, что адекватное восприятие студентами обоих вузов результатов современных молекулярно-клеточных цитогеронтологических исследований невозможно без понимания основных фундаментальных определений и понятий, используемых как в теоретической, так и в экспериментальной геронтологии. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-05-17 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/40 10.1234/XXXX-XXXX-2012-1-15-19 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2012); 15-19 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2012); 15-19 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/40/42 Hayflick L. Progress in cytogerontology // Mech. Ageing Dev. 1979. Vol. 9. N 5—6. P. 393—408. Khokhlov A.N. Cytogerontology at the beginning of the third millenium: from “correlative” to “gist” models // Russ. J. Dev. Biol. 2003. Vol. 34. N 5. P. 321—326. Khokhlov A.N. From Carrel to Hayflick and back, or what we got from the 100-year cytogerontological studies // Biophysics. 2010. Vol. 55. N 5. P. 850—855. Хохлов А.Н. Итоги и перспективы цитогеронтологических исследований на современном этапе // Цитология. 2002. Т. 44. № 12. С. 1143—1148. Хохлов А.Н. Пролиферация и старение // Итоги науки и техники ВИНИТИ АН СССР. Сер. Общие проблемы физико-химической биологии. Т. 9. М.: ВИНИТИ, 1988. 176 с. Хохлов А.Н. Эволюционная цитогеронтология как наука и перспективы ее развития в Московском университете // Цитология. 1994. Т. 36. № 7. С. 757—758. Khokhlov A.N. ABC of gerontology training at Moscow State University // Biogerontology. 2002. Vol. 3. Suppl. 1. P. 61. Khokhlov A.N. Teaching biology of aging at Moscow State University // Усп. геронтол. 2000. Т. 13. № 5. С. 98. Khokhlov A.N. Teaching biology of aging at Moscow State University // Gerontology. 2001. Vol. 47. Suppl. 1. P. 537. Оловников А.М. Принцип маргинотомии в матричном синтезе полинуклеотидов // Докл. АН СССР. 1971. Т. 201. № 6. С. 1496—1499. Cristofalo V.J., Allen R.G., Pignolo R.J., Martin B.G., Beck J.C. Relationship between donor age and the replicative lifespan of human cells in culture: a reevaluation // Proc. Natl. Acad. Sci. 1998. Vol. 95. N 18. P. 10614—10619. Khokhlov A.N. Does aging need an own program or the existing development program is more than enough? // Russ. J. Gen. Chem. 2010. Vol. 80. N 7. P. 1507—1513. Comfort A. Ageing: the biology of senescence. New York: Holt, Rinehart and Winston, 1964. 365 p. Hayflick L. How and why we age. New York: Ballantine Books, 1994. 377 p. Austad S.N. Why we age: what science is discovering about the body’s journey through life. Chichester: John Wiley & Sons, Inc. 1999. 256 p. Finch C.E. Longevity, senescence, and the genome. Chicago: University of Chicago Press, 1994. 938 p. Holliday R. Aging: the paradox of life. Why we age. Dordrecht: Springer, 2007. 134 p. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1505 2025-07-14T13:18:18Z jour:RA driver

Age-related changes in the tissue antioxidant system of the northern birch mouse (Sicista betulina, Rodentia) at the northern periphery of its habitat area Возрастные изменения тканевой антиоксидантной защиты у лесной мышовки (Sicista betulina, Rodentia) на северной периферии ареала обитания E. P. Antonova V. A. Ilyukha A. E. Yakimova I. V. Baishnikova T. N. Ilyina Е. П. Антонова В. А. Илюха А. Е. Якимова И. В. Баишникова Т. Н. Ильина витамин Е antioxidants hibernators aging homeostasis vitamin E витамин Е антиоксиданты зимоспящие старение гомеостаз витамин Е The study was aimed at determining tissue antioxidant levels in juvenile and adult the northern birch mouse (Sicista betulina Pallas, 1779) at the northern periphery of its range (Republic of Karelia). Our results are indicating a mixed pattern of age-related changes in the antioxidant defense system: aging was accompanied by a decrease the catalase activity in the kidneys as well as an increase in heart catalase activity and kidney, cardiac and skeletal muscle superoxide dismutase activity. The levels of low-molecular antioxidants – reduced glutathione (GSH) (kidneys and heart) and α-tocopherol (heart and skeletal muscle) were lower in the of the northern birch mouse young compared to adult animals, which is probably associated not only with the active growth and high mobility of the juvenile mouse during the dispersal period, but also with the stress of physiological systems due to living in the Northern conditions and preparing for hibernation. Higher levels of GSH and α-tocopherol were found in the hearts of adult northern birch mouse compared to other small mammal species of the order Rodentia living in the Republic of Karelia, which indicates the important role of low-molecular weight antioxidants in protecting tissues against oxidative injury in this species. Проведено исследование уровня тканевых антиоксидантов у молодых и взрослых (зимовавших) особей зимоспящего вида – лесной мышовки (Sicista betulina Pallas, 1779), обитающей вблизи северной границы ареала распространения (Республика Карелия). Показана гетерохронность возрастных изменений показателей антиоксидантной системы: активность каталазы в почках снижалась, а в сердце, напротив, увеличивалась с возрастом; у взрослых особей лесной мышовки активность супероксиддисмутазы в почках, сердечной и скелетной мышце выше, чем у молодых животных. У молодых особей отмечен более низкий уровень низкомолекулярных антиоксидантов – восстановленного глутатиона (почки и сердце) и α-токоферола (сердце и скелетная мышца) – по сравнению с зимовавшими животными, что, вероятно, связано не только с активным ростом и высокой степенью подвижности молодых особей в период расселения, но и с напряженностью физиологических систем в связи с обитанием в условиях Севера и подготовкой к зимней спячке. Обнаружены более высокие уровни восстановленного глутатиона и α-токоферола в сердце зимовавших особей лесной мышовки по сравнению с другими зимовавшими представителями отряда Rodentia, обитающими в Республике Карелия, что подчеркивает важную роль низкомолекулярных антиоксидантов в защите тканей от окислительных повреждений у этого вида. Lomonosov Moscow State University, School of Biology This study was carried out under state assignment to Karelian Research Centre of the Russian Academy of Sciences (FMEN-2022-0003) and Papanin Institute for Biology of Inland Waters Russian Academy of Sciences (№124032500016-4). Авторы выражают признательность сотрудникам лаборатории экологической физиологии животных Института биологии КарНЦ РАН за помощь в проведении исследования. Финансовое обеспечение исследований осуществлялось из средств федерального бюджета на выполнение государственного задания КарНЦ РАН (FMEN-2022-0003) и ИБВВ (№124032500016-4). 2025-07-14 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1505 10.55959/MSU0137-0952-16-80-2-2 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 80, № 2 (2025); 80-88 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 80, № 2 (2025); 80-88 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1505/720 Sohal R.S., Orr W.C. The redox stress hypothesis of aging. Free. Radic. Biol. Med. 2012;52(3):539–555. Yang J., Luo J., Tian X., Zhao Y., Li Y., Wu X. Progress in understanding oxidative stress, aging, and aging-related diseases. Antioxidants (Basel). 2024;13(4):394. Hindle A.G., Lawler J.M., Campbell K.L., et al. Muscle aging and oxidative stress in wild-caught shrews. Comp. Biochem. Physiol., Part B: Biochem. Mol. Biol. 2010;155(4):427–434. Andziak B., O’Connor T.P., Buffenstein R. Antioxidants do not explain the disparate longevity between mice and the longest-living rodent, the naked mole-rat. Mech. Ageing Dev. 2005;126(11):1206–1212. Conde-Perezprina J.C., Luna-Lopez A., Gonzalez-Puertos V.Y., Zenteno-Savín T., León-Galván M.Á., Königsberg M. DNA MMR systems, microsatellite instability and antioxidant activity variations in two species of wild bats: Myotis velifer and Desmodus rotundus, as possible factors associated with longevity. Age. 2012;34(6):1473–1492. Klichkhanov N.K., Nikitina E.R., Shihamirova Z.M., Astaeva M.D., Chalabov S.I., Krivchenko A.I. Erythrocytes of little ground squirrels undergo reversible oxidative stress during arousal from hibernation. Front. Physiol. 2021;12:730657. Haase C.G., Fuller N.W., Hranac C.R., Hayman D.T.S., Olson S.H., Plowright R.K., McGuire L.P. Bats are not squirrels: revisiting the cost of cooling in hibernating mammals. J. Therm. Biol. 2019;81:185–193. Ивантер Э.В. К популяционной экологии лесной мышовки (Sicista betulina Pall.) на северном пределе ареала. Сообщение II. Размножение, экологическая структура популяции, динамика численности. Принципы экологии. 2021;3(41):25–41. Johansen K., Krog J. Diurnal body temperature variations and hibernation in the birch mouse, Sicista betulina. Am. J. Physiol. 1959;196(6):1200–1204. Orr A.L., Lohse L.A., Drew K.L., Hermes-Lima M. Physiological oxidative stress after arousal from hibernation in Arctic ground squirrel. Comp. Biochem. Physiol. A Mol. Integr. Physiol. 2009;153(2):213–221. Ivanter E.V. The reproductive ecology of the bank vole Myodes (Clethrionomys) Glareolus Schreb. In north periphery of its areal: I. sex cycles, course, dates, and intensive reproduction. Biol. Bull. 2020;47(5):535–547. Okamoto I., Kayano T., Hanaya T., Arai S., Ikeda M., Kurimoto M. Up-regulation of an extracellular superoxide dismutase-like activity in hibernating hamsters subjected to oxidative stress in mid- to late arousal from torpor. Comp. Biochem. Physiol. C Toxicol. Pharmacol. 2006;144(1):47–56. James R.S., Staples J.F., Brown J.C., Tessier S.N., Storey K.B. The effects of hibernation on the contractile and biochemical properties of skeletal muscles in the thirteenlined ground squirrel, Ictidomys tridecemlineatus. J. Exp. Biol. 2013;216(Pt. 14):2587–2594. Yin Q., Ge H., Liao C.C., Liu D., Zhang S., Pan Y. Antioxidant defenses in the brains of bats during hibernation. PLoS One. 2016;11(3):e0152135. Ilyina T.N., Baishnikova I.V., Belkin V.V. Retinol and α-tocopherol content in the liver and skeletal muscle of bats (Chiroptera) during hibernation and summer activity. J. Evol. Biochem. Phys. 2022;58(6):1697–1707. Misra H.P., Fridovich I. The role of superoxide anion in the autoxidation of epinephrine and a simple assay for superoxide dismutase. J. Biol. Chem. 1972;247(10):3170–3175. Beers R.F., Sizer I.N. A spectral method for measuring the breakdown of hydrogen peroxide by catalase. J. Biol. Chem. 1952;195(1):133–140. Lowry O.H., Rosenbrough N.J., Farr A.L., Randall R.J. Protein measurement with the Folin phenol reagent. J. Biol. Chem. 1951;193(1):265–275. Sedlak J., Lindsay R.H. Estimation of total, protein-bound and non-protein sulfhydryl groups in tissue with Ellman’s reagent. Anal. Biochem. 1968;25:192–205. Скурихин В.Н., Двинская Л.М. Определение α-токоферола и ретинола в плазме крови сельскохозяйственных животных методом микроколоночной высокоэффективной жидкостной хроматографии. Сельскохозяйственная биология. 1989;4:127–129. Ji L.L., Dillon D., Wu E. Alteration of antioxidant enzymes with aging in rat skeletal muscle and liver. Am. J. Physiol. 1990;258(4 Pt. 2):R918–R923. Andziak B., O’Connor T.P., Qi W. et al. High oxidative damage levels in the longest living rodent, the naked mole-rat. Aging Cell. 2006;5(6):463–471. Saldmann F., Viltard M., Leroy C., Friedlander G. The naked mole rat: a unique example of positive oxidative stress. Oxid. Med. Cell. Longev. 2019:4502819. Aoyama K., Nakaki T. Glutathione in cellular redox homeostasis: association with the excitatory amino acid carrier 1 (EAAC1). Molecules. 2015;20(5):8742–8758. Antonova E.P., Kalinina S.N., Yakimova A.E. et al. Antioxidant defenses in tissues of four species of Arvicolinae (Rodentia, Cricetidae). Biol. Bull. Russ. Acad. Sci. 2023;50(Suppl. 3):S428–S435. Matsuo M., Gomi F., Dooley M.M. Age-related alterations in antioxidant capacity and lipid peroxidation in brain, liver, and lung homogenates of normal and vitamin E-deficient rats. Mech. Ageing Dev. 1992;64(3):273–292. Ilyina T.N., Baishnikova I.V., Yakimova A.E., Zaitseva I.A. On the concentration of vitamins A and E in the tissues of the bank vole (Myodes (Clethrionomys) glareolus) and common shrew (Sorex araneus) inhabiting Karelia. Adv. Gerontol. 2024;14(1):21–27. van Breukelen F., Martin S.L. The hibernation continuum: physiological and molecular aspects of metabolic plasticity in mammals. Physiology (Bethesda). 2015;30(4):273–281. Антонова Е.П., Сергина С.Н., Илюха В.А., Якимова А.Е. Характеристика видовых и возрастных особенностей лактатдегидрогеназной системы в тканях грызунов (Mammalia: Rodentia). Труды Карельского научного центра РАН. 2018;4:3–12. Anegawa D., Sugiura Y., Matsuoka Y., Sone M., Shichiri M., Otsuka R., Ishida N., Yamada K.I., Suematsu M., Miura M., Yamaguchi Y. Hepatic resistance to cold ferroptosis in a mammalian hibernator Syrian hamster depends on effective storage of diet-derived α-tocopherol. Commun. Biol. 2021;4(1):796. Klichkhanov N.K., Ismailova Z.G., Astaeva M.D., Chalabov Sh.I. Effects of vitamins C and E on free radical processes in the blood of rats in acute moderate hypothermia. Biol. Bull. Russ. Acad. Sci. 2019;46:536–543. McNab B.K. An analysis of the factors that influence the level and scaling of mammalian BMR. Comp. Biochem. Physiol. A Mol. Integr. Physiol. 2008;151(1):5–28. Кухарева А.В. К экологии лесной мышовки (Sicista betulina Pall) на севере. Современные проблемы науки и образования. 2007;4:1–14. Austad S.N. Diverse aging rates in metazoans: targets for functional genomics. Mech. Ageing Dev. 2005;126(1):43–49. Lyman C.P., O’Brien R.C., Greene G.C., Papafrangos E.D. Hibernation and longevity in the Turkish hamster Mesocricetus brandti. Science. 1981;212(4495):668–670. Brunet-Rossinni A.K., Austad S.N. Ageing studies on bats: a review. Biogerontology. 2004;5(4):211–222. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/312 2016-10-08T17:19:52Z jour:%D0%A4%D0%98%D0%97 driver

Microbial physiology: problems and prospects Физиология микроорганизмов: проблемы и перспективы V. D. Samuilov В. Д. Самуилов физиология микроорганизмов Physiology is a science on functions. Functions of microorganisms, as for every living thing, are metabolism and energy provision, reproduction and death, regulation of vital activity on the intracellular level and on the level of interactions between microbial cells and abiogenous factors, on the level of microbe-microbial interactions and interactions of microorganisms with plants, animals and man. According to metabolic and energetic potentials, microorganisms are subdivided into photo- and chemotrophs, litho- and organotrophs, auto- and heterotrophs; procaryotic organisms assimilate molecular nitrogen. The noted functions are subjected to versatile regulation that is a basis for intra- and intercellular communications. Microbial responses to exposure on macroorganisms is an introduction or a prevention of programmed cell death (PCD) in infected organisms, a change to inactive state (persistence). An induction of programmed cell death in cells affected by illness that can be spreaded to sound cell and organisms, an induction of PCD in pathogens penetrating in macroorganism, a change of persister cell of pathogens into active state, suppression of density effects in microbial populations (quorum sensing) are important trends in microbial physiology and biotechnology of medical and prophylactic preparations. Материалы международной конференции “Физиология микроорганизмов в природных и экспериментальных системах”, посвященной памяти проф. М.В. Гусева. МГУ. Биологический факультет. 16—19 мая 2006 г. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2008-04-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/312 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2008); 44-48 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2008); 44-48 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/312/301 Льюис К. 2005. Персистирующие клетки и загадка выживания биопленок // Биохимия. 70. 327—336. Оловников А. М. 1971. Принцип маргинотомии в матричном синтезе полинуклеотидов // Докл. АН СССР. 201. 1496—1498. Оловников А. М. 1992. Старение есть результат укорочения “дифферотены” в теломере из-за концевой недорепарации ДНК // Изв. РАН. Сер. биол. № 4. 641—643. Проскуряков С. Я., Габай В. Л., Коноплянников А. Г. 2002. Некроз — активная, управляемая форма программируемой клеточной гибели // Биохимия. 67. 467—491. Самуилов В. Д. 2005. Проблемы энергетики в эволюции живого // Биохимия. 70. 302—307. Самуилов В. Д., Олескин А. В., Лагунова Е. В. 2000. Программируемая клеточная смерть // Биохимия. 65. 1029—1046. Еkerlund T., Nordstrцm K., Bernander R. 1995. Analysis of all size and DNA content in exponentially growing and stationary-phase bath cultures of Escherichia coli // J. Bacteriol. 177. 6791—6797. Balaban N. Q., Merrin J., Chait R., Kowalik L., Leibler S. 2004. Bacterial persistence as a phenotypie switch // Science. 305. 1622—1625. Bassler B. L., Losick R. 2006. Bacterially speaking // Cell. 125. 237—246. Bendich A. J. 2004. Circular chloroplast chromosomes: the grand illusion // Plant Cell. 16. 1661—1666. Costerton J. W., Stewart P. S., Greenberg E. P. 1999. Bacterial biofilms: a common cause of persistent infections // Science. 284. 1318—1322. Eichler J., Adams M. W. W. 2005. Posttranslational protein modification in Archae // Microbiol. Molec. Biol. Revs. 69. 393—425. Festjens N., Vanden Berghe T., Vandenabeele P. 2006. Necrosis, a well-orchestrated form of cell demise: signalling cascades, important mediators and concomitant immune response // Biochim. Biophys. Acta. 1757. 1371—1387. Guimarгes C. A., Linden R. 2004. Programmed cell death. Apoptosis and alternative deathstyles // Eur. J. Biochem. 271. 1638—1650. Hinnebusch B. J., Bendich A. J. 1997. The bacterial nucleoid visualized by fluorescence microscopy of cells lysed within agarose: comparison of Escherichia coli and spirochetes of the genus Borrelia // J. Bacteriol. 179. 2228—2237. Keren I., Kaldalu N., Spoering A., Wang Y., Lewis K. 2004. Persister cells and tolerance to antimicrobials // FEMS Microbiol. Lett. 230. 13—18. Lewis K. 2000. Programmed death in bacteria // Microbiol. Mol. Biol. Revs. 64. 503—514. Ribbe M., Gadkari D., Meyer O. 1997. N2 Fixation by Streptomyces thermoautotrophicus involves a molybdenum-dinitrogenase and a manganese-superoxide oxidoreductase that couple N2 reduction to the oxidation of superoxide production from O2 by a molybdenum-CO dehydrogenase // J. Biol. Chem. 272. 26627—26633. Vandenabeele P., Vanden Berghe T., Festjens N. 2006. Caspase inhibitors promote alternative cell death pathways // Sci. STKE. 358. 44. Williamson D. 2002. The curious history of yeast mitochondrial DNA // Nature Revs. Genetics. 3. 1—7. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/583 2018-05-03T20:56:30Z jour:PH driver

VISUAL STIMULI FOR P300-BASED BRAIN-COMPUTER INTERFACES: COLOR, SHAPE, MOBILITY ЗРИТЕЛЬНЫЕ СТИМУЛЫ ДЛЯ ИНТЕРФЕЙСА МОЗГ-КОМПЬЮТЕР НА ОСНОВЕ ЗРИТЕЛЬНЫХ ВЫЗВАННЫХ ПОТЕНЦИАЛОВ: ЦВЕТ, ФОРМА, ПОДВИЖНОСТЬ R. K. Grigoryan E. U. Krysanova D. A. Kirjanov A. Ya. Kaplan Р. К. Григорян Е. Ю. Крысанова Д. А. Кирьянов А. Я. Каплан нарушения речи electroencephalography visual evoked potentials psychophysiology stroke speech disorders нарушения речи электроэнцефалограмма зрительные вызванные потенциалы психофизиология инсульт нарушения речи The purpose of this study was to identify the impact of different discriminative features of stimuli in P300 brain-computer interface paradigm on overall performance and evoked potentials. It has been shown, that stimuli sets with greater number of discriminative features yield better target selection accuracy. Target selection accuracy was significantly higher for stimuli that differ from each other by color, shape and semantics. Highest performance was achieved with stimuli set containing largest number of discriminative features, namely set of 9 different colored letters. This result is mainly due to higher mean P300 peak amplitude for stimuli sets that contain more discriminative features. The results of the study can be used for designing better user experience in brain-computer interfacing (BCI). Movement of stimuli presentation point and characteristics of this movement (linear or pseudorandom) didn’t have any impact on BCI performance. This result is promising for future BCI designs with rapid serial visual presentation, using mobile robots or augmented reality as stimuli presentation environment. Целью данного исследования была оценка влияния различных отличительных черт стимулов в интерфейсе мозг-компьютер на основе компонента П300 на показатели работы интерфейса и характеристики вызванных потенциалов. Было продемонстрировано, что использование наборов стимулов с большим количеством отличительных признаков позволяет добиться более высокой точности выбора команд. Этот показатель был значимо выше для наборов стимулов, в которых имелись различия по цвету, форме и значению символа. Наилучшие результаты были получены для набора, содержащего наибольшее количество различий между стимулами, а именно, набора из 9 разнообразно окрашенных букв. Этот результат во многом объясняется повышенной амплитудой пика П300 для наборов стимулов, содержащих более разнообразные стимулы. Закономерности, выявленные в ходе работы, могут использоваться для улучшения пользовательского опыта при работе с интерфейсами мозг-компьютер. Движение точки предъявления стимулов по экрану и характер такого движения (линейный или псевдослучайный) не оказывали влияния на показатели работы интерфейса. Этот результат является многообещающим для создания интерфейсов мозг-компьютер с совмещенными в одной позиции стимулами, находящимися на подвижных объектах, таких как мобильные роботы или среды дополненной реальности.  Lomonosov Moscow State University, School of Biology Работа выполнена при поддержке гранта Фонда содействия инновациям № 11413. 2018-05-03 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/583 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 73, № 2 (2018); 111-117 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 73, № 2 (2018); 111-117 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/583/429 Powers J.C., Bieliaieva K., Wu S., Nam C.S. The human factors and ergonomics of P300-based brain-computer interfaces // Brain Sci. 2015. Vol. 5. N 3. P. 318–356. Farwell L.A., Donchin E. Talking off the top of your head: toward a mental prosthesis utilizing event-related brain potentials // Electroencephalogr. Clin. Neurophysiol. 1988. Vol. 70. N 6. P. 510–523. Polich J. Updating P300: an integrative theory of P3a and P3b // Clin. Neurophysiol. 2007. Vol. 118. N 10. P. 2128–2148. Jin J., Allison B.Z., Kaufmann T., Kübler A., Zhang Y., Wang X., Cichocki A. The changing face of P300 BCIs: a comparison of stimulus changes in a P300 BCI involving faces, emotion, and movement // PLoS One. 2012. Vol. 7. N 11. e49688. Guger C., Daban S., Sellers E., Holzner C., Krausz G., Carabalona R., Gramatica F., Edlinger G. How many people are able to control a P300-based brain–computer interface (BCI)? // Neurosci Lett. 2009. Vol. 462. N 1. P. 94–98. Kaplan A.Ya. Neurophysiological Foundations and Practical Realizations of the Brain-Machine Interfaces the Technology in Neurological Rehabilitation // Hum. Physiol. 2016. Vol. 42 N 1 P. 103–110. Jin J., Allison B.Z., Wang X., Neuper C. A combined brain–computer interface based on P300 potentials and motion-onset visual evoked potentials // J. Neurosci. Methods. 2012. Vol. 205. N. 2. P. 265–276. Guo F., Hong B., Gao X., Gao S. A brain–computer interface using motion-onset visual evoked potential // J. Neural Eng. 2008. Vol. 5. N 4. P. 477–485. Acqualagna L., Treder M.S., Schreuder M., Blankertz B. A novel brain-computer interface based on the rapid serial visual presentation paradigm // Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC), 2010 Annual International Conference of the IEEE. Buenos Aires: IEEE, 2010. P. 2686–2689. Yeh Y.Y., Lee D.S., Ko Y.H. Color combination and exposure time on legibility and EEG response of icon presented on visual display terminal // Displays. 2013. Vol. 34. N 1. P. 33–38. Salvaris M., Cinel C., Citi L., Poli R. Novel protocols for P300-based brain–computer interfaces // IEEE T. Neur. Sys. Reh. 2012. Vol. 20. N 1. P. 8–17. Proverbio A.M., Burco F., del Zotto M., Zani A. Blue piglets? Electrophysiological evidence for the primacy of shape over color in object recognition // Cognitive Brain Res. 2004. Vol. 18. N 3. P. 288–300. Ganin I.P., Shishkin S.L., Kaplan A.Y. A P300-based brain-computer interface with stimuli on moving objects: four-session single-trial and triple-trial tests with a game-like task design // PLoS One. 2013. Vol. 8. N 10. e77755. Tang J., Zhou Z., Liu Y. A 3D visual stimuli based P300 brain-computer interface: for a robotic arm control // Proceedings of the 2017 International Conference on Artificial Intelligence, Automation and Control Technologies. Wuhan: ACM, 2017, P. 18. Seabold S., Perktold J. Statsmodels: Econometric and statistical modeling with Python // Proceedings of the 9th Python in Science Conference. Austin: SciPy society, 2010. Vol. 57. P. 61. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/738 2019-07-04T12:55:12Z jour:RA driver

First discovery of alkali-resistant fungi on the coast of chloride Lake Baskunchak Первое обнаружение щелочеустойчивых грибов на побережье хлоридного озера Баскунчак S. A. Bondarenko M. L. Georgieva L. Y. Kokaeva E. N. Bilanenko С. А. Бондаренко М. Л. Георгиева Л. Ю. Кокаева Е. Н. Биланенко галотолерантные грибы alkaliphilic fungi alkalotolerant fungi Sodiomyces salt lakes Lake Baskunchak halotolerant fungi галотолерантные грибы алкалофильные грибы алкалотолерантные грибы Sodiomyces соленые озера озеро Баскунчак галотолерантные грибы This is the first study of alkali-resistant fungi in the conditions of neutral salinization at the Lake Baskunchak (Astrakhan region, Russia). Fungi were isolated from the lake coast chloride soils on alkaline agar medium (pH 10.0-10.5); isolates were characterized by morphological, cultural, and molecular genetic features; phylogenetic analysis and analysis of adaptation to pH and salinity were performed. It has been shown that alkali-resistant fungi at the lake coast is a polyphyletic group of Ascomycetes from Sordariomycetes (9 species), Dothideomycetes (5 species), Eurotiomycetes (3 species), and also sterile mycelium (15 isolates). The study of the growth rates in a wide range of pH has shown that among the isolates there are both alkalotolerant fungi and alkaliphilic one. The tolerance of isolates to elevated concentrations of sodium chloride was confirmed. The discovery of obligate alkaliphiles, under conditions of neutral salinization, was unexpected. Phylogenetic reconstructions were carried out, obligate alkaliphilic isolates were characterized as a new species of the genus Sodiomyces. In the article, we discuss the possible ecological role of alkali-resistant fungi in saline habitats. Статья посвящена первому исследованию щелочеустойчивых грибов в условиях нейтрального засоления на примере хлоридного озера Баскунчак (Астраханская область, Россия). Проведены: выделение грибов из хлоридных почв побережья озера на щелочной агар (рН 10,0-10,5); их идентификация с использованием морфолого-культуральных и молекулярно-генетических признаков; филогенетический анализ и исследование характера адаптации к факторам pH, солености. Показано, что щелочеустойчивые грибы на побережье озера — полифилетическая группа аскомицетов из классов Sordariomycetes (9 видов), Dothideomycetes (5 видов), Eurotiomycetes (3 вида), а также стерильные мицелии (15 изолятов). Изучение роста грибов в широком диапазоне значений рН показало, что среди изолятов есть как алкалотолерантные грибы, так и алкалофильные. Подтверждена устойчивость изолятов к повышенным концентрациям хлористого натрия. Неожиданным стало обнаружение в условиях нейтрального засоления редкой группы грибов - облигатных алкалофилов. Проведены филогенетические построения, облигатно алкалофильные изоля-ты охарактеризованы как новый вид рода Sodiomyces. Обсуждается возможная экологическая роль щелочеустойчивых грибов в засоленных местообитаниях. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2019-07-03 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/738 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 74, № 2 (2019); 73–79 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 74, № 2 (2019); 73–79 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/738/461 Bilanenko E.N., Sorokin D.Y., Ivanova M.L., Kozlova M.V. Heleococcum alkalinum, a new alkalitolerant ascomycete from saline soda soils // Mycotaxon. 2005. Vol. 91. N 1. Р. 497-507. Georgieva M.L., Lebedeva M.P., Bilanenko E.N. Mycelial fungi in saline soils of the western Transbaikal region // Eurasian Soil Sci. 2012. Vol. 45. N 12. P. 1159-1168. Grum-Grzhimaylo A.A., Debets A.J.M., van Diepeningen A.D., Georgieva M.L., Bilanenko E.N. Sodiomyces alkalinus, a new alkaliphilic ascomycete within the Plectosphaerellaceae // Persoonia. 2013. Vol. 31. P. 147-158. Grum-Grzhimaylo A.A., Georgieva M.L., Debets A.J.M, Bilanenko E.N. Are alkalitolerant fungi of the Emericellopsis lineage (Bionectriaceae) of marine origin // IMA fungus. 2013. Vol. 4. N 2. P. 213-228. Grum-Grzhimaylo A.A., Georgieva M.L., Bondarenko S.A., Debets A.J.M., Bilanenko E.N. On the diversity of fungi from soda soils // Fungal Divers. 2016. Vol. 76. N 1. P. 27-74. Bondarenko S.A., Georgieva M.L., Bilanenko E.N.Fungi inhabiting the coastal zone of Lake Magadi // Contemp. Probl. Ecol. 2018. Vol. 11. N 5. P. 439-448. Bondarenko S.A., Georgieva M.L., Bilanenko E.N. Alkalitolerant micromycetes in acidic and neutral soils of the temperate zone // Microbiology. 2016. Vol. 85. N 6. P. 737-744. Зеленковский П.С., Куриленко В.В. Природно-техногенная система соляного озера Баскунчак и особенности эксплуатации её ресурсов // Вестн. С.-Петерб. ун-та. Сер. 7. Геол. Геогр. 2013. № 4. С. 33-52. Bataeva Y.V., Dzerzhinskaya I.S., Astafyeva O.V., Satkalieva Ы.С., Yakovleva L.V., Kondratenko E.I., Magzanova D.K., Baimuhambetova A.S. Investigation of specific microorganisms in the salt lakes of Southern Russia // Afr. J. Microbiol. Res. 2015. Vol. 38. N 9. P. 2051-2056. Buchalo A.S., Nevo E., Wasser S.P., Oren A., Molitoris H.P. Fungal life in the extremely hypersaline water of the Dead Sea: first records // Proc. Biol. Sci. 1998. Vol. 265. N 1404. P. 1461-1465. Kis-Papo T., Oren A., Wasser S.P., Nevo E. Survival of filamentous fungi in hypersaline Dead Sea water // Microbial Ecol. 2003. Vol. 45. N 2. P. 183190. Smolyanyuk E.V., Bilanenko E.N. Communities of halotolerant micromycetes from the areas of natural salinity // Microbiology. 2011. Vol. 80. N 6. P. 877-883. Oren A., Gunde-Cimerman N. Fungal life in the Dead Sea // Biology of Marine Fungi / Eds. C. Raghukumar. Berlin, Heidelberg: Springer, 2012. P. 115-132. Grishkan I., Nevo E., Wasser S.P. Soil micromycete diversity in the hypersaline Dead Sea coastal area, Israel // Mycol. Prog. 2003. Vol. 2. N 1. P. 19-28. Grum-Grzhimaylo A.A., Falkoski D.L., van den Heuvel J., et al. The obligate alkalophilic soda-lake fungus Sodiomyces alkalinus has shifted to a protein diet // Mol. Ecol. 2018. Vol. 27. N 23. P. 4808-4819. Kevbrin V.V. Isolation and cultivation of alkaliphiles // Advances in Biochemical Engineering / Biotechnology / Eds. T. Scheper. Berlin, Heidelberg: Springer, 2019. P. 1-32. Carreira C., Staal M., Falkoski D., Vries R.P., Middelboe M., Brussaard C.P. Disruption of photoautotrophic intertidal mats by filamentous fungi // Environ. Microbiol. 2015. Vol. 17. N 8. P. 29102921. Rogozhin E.A., Sadykova V.S., Baranova A.A., Vasilchenko A.S., Lushpa V.A., Mineev K.S., Georgieva M.L., Kul’ko A.B., Krasheninnikov M.E., Lyundup A.V., Vasilchenko A.V., Andreev Y.A. A novel lipopeptaibol emericellipsin A with antimicrobial and antitumor activity produced by the extremophilic fungus Emericellopsis alkalina // Molecules. 2018. Vol. 23. N 11. Е2785. Domsch K.H., Gams W, Anderson T.H. Compendium of soil fungi. Second edition. Eching: IHW-Verlag & Verlagsbuchhadlung, 2007. 700 pp. Zare R, Gams W.D., Starink-Willemse M, Summerbell R.C. Gibellulopsis, a suitable genus for Verticillium nigrescens, and Musicillium, a new genus for V. theobromae // Nova Hedwigia. 2007. Vol. 85. N 3-4. P. 463-489. Giraldo A., Gem J., Sutton D.A., Madrid H., De Hoog G.S., Cano J., Decock C., Crous P.W., Guarro J. Phylogeny of Sarocladium (Hypocreales) // Persoonia. 2015. Vol. 34. P. 10-24. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1237 2023-07-10T06:43:50Z jour:%D0%BC%D0%BD%D0%B5%D0%BD%D0%B8%D0%B5 driver

Basics of biology of aging for MSU non-biologists Основы биологии старения для небиологов МГУ A. N. Khokhlov А. Н. Хохлов Московский университет gerontology course of lectures teaching non-biology students Moscow University Московский университет геронтология курс лекций преподавание студенты небиологических специальностей Московский университет The history of the creation of the course of lectures “Basics of the Biology of Aging” at the School of Biology of Lomonosov Moscow State University, as well as at the Department of Life Science and Engineering of Harbin Institute of Technology is briefly described. In the process of teaching this course, the author got the impression that its main provisions may also be of interest to students of non-biological specialties, who have recently been quite often involved in the work on the implementation of gerontological grants. This is largely determined, apparently, by the significantly increased funding for this kind of research in recent years. In turn, this is a consequence of the fact that the average life span of people in developed countries has increased dramatically over the past decades. However, the maximum life span has not changed much (it is now the same as it was thousands of years ago, it is just that the chances of living to the age of a centenarian have become much greater). If earlier people often died at an early age from various diseases not related to age (mainly infectious diseases), now, due to significant advances in medicine, most people live to old age. As a result, death “from aging” is becoming more common. At the same time, many people have a very vague idea of what aging is, what are its mechanisms and how to fight it. In this regard, in 2022, an interschool elective course of lectures was organized at MSU for students of any departments of the university, except for the School of Biology itself. It is called “Basics of the biology of aging, or everything you wanted to know about aging (but were afraid to ask).” The material of the lectures was specially adapted for students who are not biologists by their main specialty. The main emphasis in the course, consisting of 12 lectures, is made on the fundamental definitions and methodical/methodological approaches used in gerontology. The article lists the questions submitted for the students’ test and briefly analyzes its results. Кратко излагается история создания курса лекций «Основы биологии старения» на биологическом факультете Московского государственного университета имени  М.В. Ломоносова, а также в Центре инженерно-медицинских и биологических наук Харбинского политехнического университета. В процессе чтения этого курса у автора сложилось впечатление, что основные его положения могут быть интересными и для студентов небиологических специальностей, которые в последнее время довольно часто подключаются к работе по реализации геронтологических грантов. Во многом это определяется, по-видимому, значительно возросшим за последние годы финансированием такого рода исследований. В свою очередь, это является следствием того, что средняя продолжительность жизни людей в развитых странах резко возросла за последние десятилетия. Однако максимальная продолжительность жизни практически не изменилась (она сейчас такая же, как и тысячелетия назад, просто шансов дожить до возраста долгожителя стало гораздо больше). Если раньше часто умирали в раннем возрасте от различных не связанных с возрастом болезней (главным образом – инфекционных), то сейчас, вследствие значительных успехов медицины, большинство людей доживают до старости. В результате смерть «от старения» становится все более распространенной. В то же время многие весьма смутно представляют себе, что такое старение, каковы его механизмы и как можно с ним бороться. В связи с этим в 2022 г. в МГУ был организован межфакультетский курс лекций по выбору для студентов любых подразделений университета, кроме самого биологического факультета. Он называется «Основы биологии старения, или все, что вы хотели знать о старении (но боялись спросить)». Материал лекций был специально адаптирован для студентов, не являющихся по основной специальности биологами. Основной акцент в курсе, состоящем из 12 лекций, сделан на фундаментальных определениях и методических/методологических подходах, используемых в геронтологии. В статье перечислены вопросы, вынесенные на зачет, и кратко анализируются его результаты. Lomonosov Moscow State University, School of Biology This work was performed under the state assignment of Moscow State University, project number 121032300215-6. Работа выполнена в рамках государственного задания МГУ, ч. 2 (фундаментальные научные исследования, № 121032300215-6). 2023-07-09 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1237 10.55959/MSU0137-0952-16-78-2-5 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 78, № 2 (2023); 115-120 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 78, № 2 (2023); 115-120 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1237/625 Khokhlov A.N. Teaching biology of aging at Moscow State University. Gerontology. 2001;47(Suppl. 1):537. Khokhlov A.N. ABC of gerontology training at Moscow State University. Biogerontology. 2002;3(Suppl. 1):61. Khokhlov A.N., Wei L., Li Y., He J. Teaching cytogerontology in Russia and China. Adv. Gerontol. 2012;25(3):513–516. Wei L., Li Y., He J., Khokhlov A.N. Teaching the cell biology of aging at the Harbin Institute of Technology and Moscow State University. Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2012;67(1):13–16. Khokhlov A.N. From Carrel to Hayflick and back, or what we got from the 100-year cytogerontological studies. Biophysics. 2010;55(5):859–864. Khokhlov A.N. Does aging need its own program, or is the program of development quite sufficient for it? Stationary cell cultures as a tool to search for anti-aging factors. Curr. Aging Sci. 2013;6(1):14–20. Khokhlov A.N. Reflections of a pessimistic gerontologist or why we still do not live 1000 years? Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2021;76(4):223–227. Khokhlov A.N., Klebanov A.A., Morgunova G.V. On choosing control objects in experimental gerontological research. Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2018;73(2):59–62. Morgunova G.V., Shilovsky G.A., Khokhlov A.N. Effect of caloric restriction on aging: Fixing the problems of nutrient sensing in postmitotic cells? Biochemistry (Mosc.). 2021;86(10):1352–1367. Khokhlov A.N. On the cholesterol theory of aging-2022. Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2022;77(4):292–296. Khokhlov A.N., Klebanov A.A., Karmushakov A.F., Shilovsky G.A., Nasonov M.M., Morgunova G.V. Testing of geroprotectors in experiments on cell cultures: choosing the correct model system. Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2014;69(1):10–14. Khokhlov A.N., Morgunova G.V. Testing of geroprotectors in experiments on cell cultures: pros and cons. Anti-aging drugs: From basic research to clinical practice, RSC drug discovery. Ed. A.M. Vaiserman. London; 2017:53–74. Khokhlov A.N., Morgunova G.V., Klebanov A.A. Demographic approaches to the study of aging on cell cultures. Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2019;74(4):262–267. Morgunova G.V., Khokhlov A.N. Signs of similarities and differences in cellular models of aging: A scoping review. Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2022;77(3):139–146. Rojas A., Morales M.A., Araya P., González I. RAGE–The receptor of advanced glycation end products. Encyclopedia of Life Sciences. Chichester: John Wiley & Sons; 2017:1–7. Gasparotto J., Girardi C.S., Somensi N., Ribeiro C.T., Moreira J.C., Michels M., Sonai B., Rocha M., Steckert A.V., Barichello T., Quevedo J. Receptor for advanced glycation end products mediates sepsis-triggered amyloid-β accumulation, Tau phosphorylation, and cognitive impairment. J. Biol. Chem. 2018;293(1):226–244. Khokhlov A.N., Morgunova G.V. Is it worth teaching biology students the basics of scientometrics and the instructions for the design of scientific articles, and if so, why? Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2021;76(3):77–82. Carnegie D. How to win friends and influence people. N.Y.: Simon & Schuster; 2009. 291 pp. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/213 2015-07-24T08:17:06Z jour:FF driver

AQUACULTURE OF CHINA AND RUSSIA: SCIENTIFIC CENTERS OF FISH AND OTHER OBJECTS PATHOLOGY АКВАКУЛЬТУРА КНР И РОССИИ: НАУЧНЫЕ ЦЕНТРЫ ПО ИЗУЧЕНИЮ ПАТОЛОГИИ РЫБ И ДРУГИХ ОБЪЕКТОВ I. A. Kondratieva M. E. Maklakova Lian Xing Gui И. А. Кондратьев М. Е. Маклакова Ляньсин Гуй иммунология рыб. immunity of fish diseases of hydrobionts. иммунология рыб. болезни гидробионтов иммунология рыб. This paper presents an overview of the Chinese and Russian scientific literature to identify research centers which study the pathology of fish and other aquatic organisms. We made a comparative analysis of scientific problems and objects of these laboratories and institutes of Russia and China. We present our own data on the rapid method of early diagnosis of fish diseases.  В настоящем обзоре на основании китайской и российской научной периодики выявлены исследовательские центры по изучению патологии рыб и других гидробионтов. Проведен сравнительный анализ научной проблематики и объектов исследований этих институтов и лабораторий России и КНР. Представлены собственные данные по экспресс-методу ранней диагностики заболеваний рыб.  Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-24 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/213 10.1234/XXXX-XXXX-2010-3-34-40 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 3 (2010); 34-40 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 3 (2010); 34-40 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2010-3 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/213/211 Hu C.J., Zhang M.H., Long Y, Li Y.W. New Progress in Aquatic Feed Ingredients and Potential of Enzyme Supplements // Modern Fisheries information. 2005. Vol. 20. P.144-150. Chang O.Q., Shi C.B., Ma H., Pan H.J., Yu D.G., Wu S.Q. Histopathological study on lymphocystis disease of Rachycentron canadum // J. of Fishery Sciences of China. 2006. Vol. 13. P. 45-62. Dong C.F., Lin T.L., Yu F.S., Lin N.X. Analysis of the Pathogenicity and Immunigcnicity of Extracellular Products (ECPs) // J. of Huazhong Agricultural University. 2006. Vol. 25. P. 121-126. Ding S.H., Wang YD., Peng Y.Y., Sun H.C., Deng L P., Li Y. W. Vims diseases and control methods of Scophthalmus maximus I I Reservoir Fisheries. 2006. Vol. 26. P. 332-338. Fan Z.J., Yang A.G., Liu ZH. EfTccts of Cu2+ on immune factors of Chlamys farreri // J. of Fishery Sciences of China . 2004. Vol. II P. 89-93 Liu C.0. Effects of Ca2~/Mg2+in Brine Water from Saltworks on Growth and Activities of AKP and SOD in White Legged Shrimp// Fisheries Sciencc. 2007. Vol. 26. P. 175-181. Gao P., Wu J., Gu B., Hu N.T. Discuss on security problem of using drug in disease prevention and cure of aquaculture animal// Feed industry. 2007. Vol. 28. P. 164-169. S.Zheng FY., Shi C.B., Pan H.J. Isolation and identification of pathogen from diseased Anguilla anguilla // J. of Shanghai Fisheries University. 2005. Vol. 14. P. 120-126. Zhang X.Z., Yang X.L., Yang H. Review on Research of Vibrio anguillarum — Pathogenicity to Aquatic Animals in Mariculture // Modem Fisheries information. 2007. Vol. 22. P. 164-169. Xu H.H., Wang L.Y., Xia Y.J., Xun L. Enhancement of Immune Response in Riccfield Eel (Afonoplerus a lb us) Inoculated with Lipopolysaccharide of Aeromonas hydrophila Using Immune Polysaccharide // J. of HuaZhong agricultural university. 2007. Vol. 26. P. 145-150. Song X.L., Huang J.. Wang X.H., Yang B. Infection of white spot syndrome virus and defense reaction of penacid shrimp // J. of Fishery Sciences of China. 2007. Vol. 14. P. 1033-1039. Zhou Y.C., Chen Y.F., Zeng S.X., Long L.J., Zhang S. Effects of protogrycan from pearl oyster on nonspecific immunology of Pinctada martensii // J. of Fishery Sciences of China. 2003. Vol. 27. P. 211-217. Zhi D.Z., Wen B.Z., Yan H.X., Jing X. Antigenic cross-reactivity of cnistaccan hacmocytes using monoclonal antibodies produced against haemocytes of shrimp (Litopenaeus vannamei) // Fish&Shellfish Immunology. 2004. Vol. 16. P. 71-73. Zheng W.D., Zhang G.L., Pang Q.W. Blood Biochemical Parameters of Juvenile Chinese Sturgeon Acipenser sinensis // J. of HuaZhong agricultural university. 2007. Vol. 26. P. 133-139. Zheng L.. Zhang L., Lin H.. Mcintosh M.T., Malacrida A.R. Toll-like receptors in invertebrate imiatc immunity // Minireview. 2005. Vol. 2. P. 105-113. Аннотированный каталог круглоротых и рыб континентальных вол России. М.г Наука, 1998. 220 с. Рудакова С.Л. Профилактика и контроль инфекционного некроза гемопоэтической ткани (IHN) на лососевых рыбоводных заводах // Ветеринарная практика. 2009. Т. 1. С. 30-37. Щелкунов И. С., Щелкунов а Т.Н.. Пичуги на Т.Д., Борисова М.Н.. Завьялова Е.А. Весенняя вирсмия карпа // Ветеринария. 2004. Т. 5. С. 28-30. Камрникова А.В.. Шестаковская Е.В. Заболевания осетровых рыб при искусственном воспроизводстве и товарном выращивании. Апатиты: Изд-во Кольского научного центра РАН, 2005. С. 20—21. Ми кряков Д. В., Ми кряков В. Р., Балабанова Л. В. Характер изменения состава лейкоцитов при стрессиндуцируемом синдроме язвенной болезни рыб (на примере карпа Cyprinus carpio) // Вонр. рыболовства. 2008. Т. 9. С. 936-946. Кондратьева И.А., Киташова А.А. Функционирование и рефляция иммунной системы рыб // Иммунология.2002. Т. 2. С. 97-102. Маклакова М.Е, Кондратьева И.А., Пичугина Т.Д., Борисова М.И. Диагностики заболеваний по белковому профилю сыворотки крови рыб // Российский иммунологический журнал. 2008. Т. 2. № 11. С. 168. Кондратьева И. А.. Ярил и н А.А. Практикум по иммунологии. М.: Академия, 2004. 324 с. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1333 2024-05-15T21:48:27Z jour:RA driver

Leaf functional traits and strategies of plants in subalpine Calamagrostis meadows of the North-Western Caucasus Функциональные признаки листьев и стратегии растений субальпийских вейниковых лугов северо-западного Кавказа T. V. Poloshevets V. G. Onipchenko E. V. Sandalova T. M. Dzhatdoeva T. G. Elumeeva Т. В. Полошевец В. Г. Онипченко Е. В. Сандалова Т. М. Джатдоева Т. Г. Елумеева средневзвешенные значения ecological strategies subalpine meadows Calamagrostis arundinacea aboveground biomass weighted mean средневзвешенные значения экологические стратегии субальпийские луга Calamagrostis arundinacea надземная биомасса средневзвешенные значения The analysis of plant functional traits and strategies is the main direction to study the formation mechanisms of the composition and structure of plant communities. Comparison of the mean species trait values with a random sample of a local flora allows us to determine the importance of the trait for the plant community formation. Comparison of mean and weighted mean shows the role of the trait in dominance. The aim of this work was to study the role of leaf functional traits and the contribution of Grime’s CSR strategies in the formation of Calamagrostis subalpine meadows, which are the most widespread in the north-western Caucasus. The aboveground biomass in these communities is 384 ± 21 g/m2 (mean and standard error of the mean), the mass of litter of previous years is 393 ± 40 g/m2. The share of grasses in the community is 57,1 ± 2,9%, forbs – 32,9 ± 2,6%, legumes – 8,9 ± 1,4%, sedges and rushes – 1 ± 0,3%. The three species can be considered as dominants: Calamagrostis arundinacea (26,5% of the total phytomass), Festuca varia (23,3%), Hedysarum caucasicum (8%). The dominants of community have a high leaf dry mass, a lower leaf water content, a smaller specific leaf area. The community components are characterized by a lower mass of the water-saturated leaf and dry matter content, and a higher specific leaf area. Dominants and components in the community are characterized by a greater contribution of the stress-tolerant strategy. Анализ функциональных признаков растений и их стратегий – магистральное направление изучения механизмов формирования состава и структуры растительных сообществ. Сравнение средних по видам значений признаков со случайной выборкой местной флоры позволяет определить, насколько тот или иной признак важен для формирования состава сообщества. Сравнение средних и средневзвешенных значений показывает роль признака в доминировании. Целью работы было изучение роли функциональных признаков листьев и вклада CSR-стратегий Ф. Грайма (аббревиатура от названий трех стратегий: C – competitors, S – stress-tolerants, R – ruderals) в формировании наиболее распространенных на северо-западном Кавказе субальпийских вейниковых лугов. Надземная биомасса в этих сообществах – 384 ± 21 г/м² (среднее и его ошибка), масса ветоши прошлых лет – 393 ± 40 г/м². Доля злаков в сообществе 57,1 ± 2,9%, разнотравья – 32,9 ± 2,6%, бобовых– 8,9 ± 1,4%, осок и ситников – 1 ± 0,3%. Доминируют три вида: Calamagrostis arundinacea (26,5% от всей фитомассы), Festuca varia (23,3%), Hedysarum caucasicum (8%). Доминанты сообщества имеют бóльшую сухую массу листа, меньшее содержание воды в листе, меньшую удельную листовую поверхность. Компоненты сообщества характеризуются меньшей массой водонасыщенного листа, меньшей долей сухой массы и большей удельной листовой поверхностью, чем доминанты. Для доминантов и всех компонентов в сообществе характерен больший вклад стресстолерантной стратегии, по сравнению со случайным значением Lomonosov Moscow State University, School of Biology Исследование выполнено при финансовой поддержке Российского научного фонда (проект № 19-14-00038п). 2024-05-15 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1333 10.55959/MSU0137-0952-16-79-1-3 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 79, № 1 (2024); 21-27 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 79, № 1 (2024); 21-27 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1333/662 Garnier E., Navas M.L., Grigulis K. Plant functional diversity. Oxford: Oxford Univ. Press; 2016. 249 pp. Lachaise T., Bergmann J., Rilling M.C., van Kleunen M. Below- and aboveground traits explain local abundance, and regional, continental and global occurrence frequencies of grassland plants. Oikos. 2021;130(1):110–120. Sporbert M., Welk E., Seidler G., et al. Different sets of traits explain abundance and distribution patterns of European plants at different spatial scales. J. Veg. Sci. 2021;32(2):e13016. Егоров А.В., Онипченко В.Г. Структура видового разнообразия высокогорных растительных сообществ Тебердинского заповедника. Бюл. МОИП. Отд. биол. 2011;116(4):65–75. Arnillas C.A., Borer E.T., Seabloom E.W., et al. Opposing community assembly patterns for dominant and nondominant plant species in herbaceous ecosystems globally. Ecol. Evol. 2021;11(24):17744–17761. Grime J. P. Plant strategies and vegetation processes. Chichester; N.Y; Brisbane; Toronto: J. Wiley and Sons; 1979. 222 pp. Grime J.P. Plant Strategies, Vegetation Processes, and Ecosystem Properties. 2nd ed. Chichester: John Wiley and Sons; 2001. 417 pp. Pierce S., Negreiros D., Cerabolini B., et al. A global method for calculating plant CSR ecological strategies applied across biomes world-wide. J. Funct. Ecol. 2017;31(2):444–457. Онипченко В.Г., Казанцева Е.С., Елумеева Т.Г., Захарова Е.А., Петрова С.Е., Ахметжанова А.А., Царегородцева А.А., Текеев Д.К. Абиотические факторы сильнее влияют на функциональные признаки, чем биотические: эксперименты с пересадками в высокогорьях. Ж. общ. биол. 2020;81(5):352–261. Гулисашвили В.З. Природные зоны и естественно-исторические области Кавказа. М.: Наука; 1964. 327 с. Onipchenko V.G., Pavlov V.N. Local plant species richness depends on the total area of alpine communities. Dokl. Biol. Sci. 2009;427(1):381–383. Онипченко В.Г., Дудова К.В., Гулов Д.М., Ахметжанова А.А., Текеев Д.К., Елумеева Т.Г. Функциональные признаки листьев растений важны для формирования состава альпийских растительных сообществ. Ж. общ. биол. 2022;83(2):127–137. Работнов Т.А. Луговедение. М.: Изд-во МГУ; 1974. 384 с. Onipchenko V.G. Alpine Ecosystems in the Northwest Caucasus. Dordrecht; Boston; London: Kluwer Academic Publishers; 2004. 421 pp. Гулов Д.М., Онипченко В.Г., Мартыненко В.Б., Федоров Н.И., Логвиненко О.А., Узденов У.Б., Хубиева О.П. Состав надземной фитомассы субальпийского высокотравья в Тебердинском национальном парке. Бюл. МОИП. Отд. биол. 2022;127(5):46–53. Гулов Д.М., Федоров Н.И., Логвиненко О.А., Онипченко В.Г. Состав надземной фитомассы субальпийских болот в Тебердинском национальном парке. Бюл. МОИП. Отд. биол. 2023;128(4):27–37. Вагабов З.В. Фитомасса луговой растительности малого Кавказа (в пределах Азербайджана). Проблемы ботаники. Флора и растительность высокогорий СССР и их хозяйственное использование. Вып. 13. Баку; 1977:66–69. Deleglise C., Loucougaray G., Alard D. Spatial patterns of species and plant traits in response to 20 years of grazing exclusion in subalpine grassland communities. J. Veg. Sci. 2011;22(3):402–413. Шидаков И.И., Онипченко В.Г. Сравнение параметров листового аппарата растений альпийского пояса Тебердинского заповедника. Бюл. МОИП. Отд. биол. 2007;112(4):42–50. Elumeeva T.G., Onipchenko V.G., Wu Y. Leaf functional traits of plants of alpine pastures at the eastern Qinghai-Tibetan plateau. Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2015;70(1):46–52. Körner C. Alpine plant life: Functional plant ecology of high mountain ecosystems. 2nd ed. Berlin: Springer; 2003. 344 pp. Rosbakh S., Römermann C., Poschlod P. Specific leaf area correlates with temperature: new evidence of trait variation at the population, species and community levels. Alp. Bot. 2015;125(2):79–86. Moles A.T. Being John Harper: Using evolutionary ideas to improve understanding of global patterns in plant traits. J. Ecol. 2018;106(1):1–18. Wright I.J., Dong N., Maire V., et al. Global climatic drivers of leaf size. Science. 2017;357(6354):917–921. Dudova K.V., Dudov S.V., Akhmetzhanova A.A., Onipchenko V.G., Dzhatdoeva T.M., Tekeev D.K. Competitive strategy of subalpine tall-grass species of the northwest Caucasus. Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2019;74(3):140–146. Wang J., Zhang C., Yang H., Mou C., Mo L., Luo P. Plant community ecological strategy assembly response to yak grazing in an alpine meadow on the eastern Tibetan Plateau. Land Degrad. Dev. 2018;29(9):2920–2931. Pierce S., Ceriani R.M., Andreis R., de, Luzzaro A., Cerabolini B. The leaf economics spectrum of Poaceae reflects variation in survival strategies. Plant Biosyst. 2007;141(3):337–343. Boulangeat I., Lavergne S., Es J., van, Garraud L., Thuiller W. Niche breath, rarity and ecological characteristics within a regional flora spanning large environmental gradients. J. Biogeogr. 2012;39(1):204–214. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/413 2017-01-22T17:24:52Z jour:METH driver

PURIFICATION OF PROTEIN-DNA COMPLEXES BY NATIVE GEL ELECTROPHORESIS FOR ELECTRON MICROSCOPY STUDY ОЧИСТКА ДНК-БЕЛКОВЫХ КОМПЛЕКСОВ С ПОМОЩЬЮ НАТИВНОГО ГЕЛЬ-ЭЛЕКТРОФОРЕЗА ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ В ЭЛЕКТРОННОМ МИКРОСКОПЕ M. E. Valieva N. I. Derkacheva O. S. Sokolova М. Е. Валиева Н. И. Деркачева О. С. Соколова мононуклеосома, динуклеосома, электронная микроскопия, обработка изображений, электрофорез в ПААГ dinucleosome electron microscopy image processing PAGE мононуклеосома, динуклеосома, электронная микроскопия, обработка изображений, электрофорез в ПААГ Electrophoretic separation under native conditions may be used for purification of protein molecules and their complexes with DNA and other ligands. Here, we employed this approach to separate protein-DNA complexes with a molecular weight of about 200 kDa: mono- and dinucleosomes. The purified mononucleosomes were subjected to single particle electron microscopy study using negative stain contrasting, and the two-dimensional projections of the nucleosomes were obtained. A comparison of the nucleo some projections before and after separation in the native PAGE revealed different orientation of particles on the carbon film. Электрофоретическое разделение в нативных условиях может быть использовано для очистки белковых молекул, а также их комплексов с ДНК и другими лигандами. В данной работе этот метод использован для разделения фракций моно- и динуклеосом. Показана принципиальная возможность специфического выделения комплексов ДНК с белком размером около 200 кДа из нативного геля в препаративных количествах для изучения с помощью электронной микроскопии. Получены двумерные проекционные структуры нуклеосом с разрешением 25 Å. Проведено сравнение электронно-микроскопических изображений нуклеосом до и после выделения из нативного полиакриламидного геля. Выявлено, что ориентация нуклеосом на углеродной подложке до и после электрофоретического разделения различна. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2017-01-21 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/413 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 72, № 1 (2017); 3-8 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 72, № 1 (2017); 3-8 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/413/371 Clapier C., Cairns B. The biology of chromatin remodeling complexes // Annu. Rev. Biochem. 2009. Vol. 78. P. 273–304. Vignali M., Hassan A., Neely K., Workman J. ATPdependent chromatin-remodeling complexes// Mol. Cell. Biol. 2000. Vol. 20. N 6. P. 1899–1910. Kornberg R.D., Thomas J.O. Chromatin structure; oligomers of the histones // Science. 1974. Vol. 184. N 4139. P. 865–868. Luger K., Mäder A.W., Richmond R.K., Sargent D.F., Richmond T.J. Crystal structure of the nucleosome core particle at 2.8 Å res-olution // Nature. 1997. Vol. 389. N 6648. P. 251–260. Arents G., Moudrianakis E.N. The histone fold: a ubiquitous architectural motif utilized in DNA compaction and protein dimerization // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995. Vol. 92. N 24. P. 11170–11174. Dechassa M.L., Zhang B., Horowitz-Scherer R., Persinger J., Woodcock C.L., Peterson C.L., Bartholomew B. Architecture of the SWI/SNF-nucleosome complex // Mol. Cell. Biol. 2008. Vol. 28. N 19. P. 6010–6021. Feser J., D.T., Das C., Carson J.J., Kieft J., Harkness T., Tyler J.K. Elevated histone expression promotes life span extension // Mol. Cell. 2010. Vol. 39. N 5. P. 724–735. Ljungman M., Hanawalt P. Efficient protection against oxidative DNA damage in chromatin // Mol. Carcinog. 1992. Vol. 5. N 4. P. 264–269. Enright H.U., Miller W.J., Hebbel R.P. Nucleosomal histone protein protects DNA from iron mediated damage // Nucleic. Acids Res. 1992. Vol. 20. N 13. P. 3341–3346. van Heel M., Gowen B., Matadeen R., Orlova E.V., Finn R., Pape T., Cohen D., Stark H., Schmidt R., Schatz M., Patwardhan A. Single-particle electron cryo-microscopy: towards atomic resolution // Q. Rev. Biophys. 2000. Vol. 33. N 4. P. 307–369. Knispel R.W., Kofler C., Boicu M., Nickel W.B.S. Blotting protein complexes from native gels to electron microscopy grids // Nat. Methods. 2012. Vol. 9. N 2. P. 182–184. Pestov N.A., Gerasimova N.S., Kulaeva O.I., Studitsky V.M. Structure of transcribed chromatin is a sensor of DNA damage // Sci. Adv. 2015. Vol. 1. N 6. e1500021. Gaykalova D.A., Kulaeva O.I., Bondarenko V.A., Studitsky V.M. Preparation and analysis of uniquely positioned mononucleosomes // Methods Mol. Biol. 2009. Vol. 523. P. 109–123. van Heel M., Harauz G., Orlova E.V., Schmidt R., Schatz M. A new generation of the IMAGIC image processing system // J. Struct. Biol. 1996. Vol. 116. N 1. P. 17–24. Frank J., Wagenknecht T., McEwen B.F., Marko M., Hsieh C.E., Mannella C.A. Three-dimensional imaging of biological complexity // 2002. J. Struct. Biol. Vol. 138. N 1–2. P. 85–91. Henderson R. The potential and limitations of neutrons, electrons and X-rays for atomic resolution microscopy of unstained biological molecules // Q. Rev. Biophys. 1995. Vol. 28. N 2. P. 171–193. Glaeser R.M. How good can cryo-EM become? // Nat. Methods. 2012. Vol. 13. N 1. P. 28–32. Asturias F.J., Chung W.H., Kornberg R.D., Lorch Y. Structural analysis of the RSC chromatin remodeling complex // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002. Vol. 99. N 21. P. 13477–13480. Davey C.A., Sargent D.F., Luger K., Maeder A.W., Richmond T.J. Solvent mediated interactions in the structure of the nucleosome core particle at 1.9 Å resolution // J. Mol. Biol. 2002. Vol. 319. N 5. P. 1097–1113. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/490 2017-10-20T14:08:09Z jour:VIR driver

COMPARATIVE STUDY OF THE THERMAL REMODELLING OF VIRUSES WITH ICOSAHEDRAL AND HELICAL SYMMETRY СРАВНИТЕЛЬНОЕ ИЗУЧЕНИЕ ТЕРМИЧЕСКОЙ ПЕРЕСТРОЙКИ ВИРУСОВ С ИКОСАЭДРИЧЕСКИМ И СПИРАЛЬНЫМ ТИПОМ СИММЕТРИИ E. A. Trifonova N. A. Nikitin M. V. Arkhipenko E. K. Donchenko J. G. Atabekov O. V. Karpova Е. А. Трифонова Н. А. Никитин М. В. Архипенко Е. К. Донченко И. Г. Атабеков О. В. Карпова сферические частицы helical viruses icosahedral viruses thermal remodelling of viruses structural modified virus particles spherical particles сферические частицы спиральные вирусы икосаэдрические вирусы термическая перестройка вирусов структурно модифицированные вирусные частицы сферические частицы Study of the possibilities of virions and viral proteins modifications and structural remodelling is an important problem of the modern molecular virology. The method of thermal transformation of tobacco mosaic virus rod-like virions in structurally modified spherical particles, consisting of viral coat protein, was developed in our laboratory. These particles have unique adsorption and immunogenic properties. We developed a new candidate vaccine against rubella virus based on structurally modified spherical particles. Later we demonstrated the possibility of thermal remodelling of potato virus X filamentous virions. The present work is devoted to a comparative study of the thermal remodelling of viruses with different structure, belonging to various taxonomic groups. The formation of structurally modified spherical particles was shown during thermal treatment of rod-like virions with a helical symmetry (dolichos enation mosaic virus, barley stripe mosaic virus). The dependence of the sizes of the spherical particles (formed from dolichos enation mosaic virus) on the initial concentration of the virus was revealed. The process of thermal remodelling of alternanthera mosaic virus filamentous virions and virus-like particles was studied. Morphological changes of plant viruses with icosahedral symmetry were not observed during thermal treatment. Изучение возможностей модификации и структурной перестройки вирионов и вирусных белков – важная задача современной молекулярной вирусологии. Ранее в нашей лаборатории был разработан метод термической обработки палочковидного вируса табачной мозаики, позволяющий получить структурно модифицированные частицы сферической формы, состоящие из вирусного белка оболочки. Такие частицы обладали уникальными адсорбционными и иммуногенными свойствами и были успешно нами использованы для создания новой кандидатной вакцины против вируса краснухи. Позднее мы продемонстрировали возможность термической перестройки нитевидных вирионов Х-вируса картофеля. Настоящая работа посвящена сравнительному изучению термической перестройки вирусов с различной структурой, относящихся к разным таксономическим группам. Показано образование структурно модифицированных частиц сферической формы при термической обработке палочковидных вирионов со спиральным типом симметрии (вирус мозаики долихоса, вирус штриховатой мозаики ячменя). Выявлена зависимость размеров сферических частиц, образующихся из вируса мозаики долихоса, от исходной концентрации вируса. Изучена возможность термической перестройки нитевидных вирионов и вирусоподобных частиц вируса мозаики альтернантеры. При термической обработке вирусов растений с икосаэдрическим типом симметрии морфологических изменений обнаружено не было. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2017-10-20 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/490 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 72, № 4 (2017); 209-214 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 72, № 4 (2017); 209-214 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/490/403 Atabekov J., Nikitin N., Arkhipenko M., Chirkov S., Karpova O. Thermal transition of native tobacco mosaic virus and RNA-free viral proteins into spherical nanoparticles // J. Gen. Virol. 2011. Vol. 92. N 2. P. 453–456. Nikitin N.A., Malinin A.S., Rakhnyanskaya A.A., Trifonova E.A., Karpova O.V., Yaroslavov A.A., Atabekov J.G. Use of a polycation spacer for noncovalent immobilization of albumin on thermally modified virus particles // Polym. Sci. Ser. A. 2011. Vol. 53. N 11. P. 1026–1031. Karpova O., Nikitin N., Chirkov S., Trifonova E., Sheve leva A., Lazareva E., Atabekov J. Immunogenic compositions assembled from tobacco mosaic virus-generated spherical particle platform and foreign antigens // J. Gen. Virol. 2012. Vol. 93. N 2. P. 400–407. Dobrov E.N., Nikitin N.A., Trifonova E.A., Parshina E. Yu., Makarov V.V., Maksimov G.V., Karpova O.V., Atabekov J.G. β-structure of the coat protein subunits in spherical particles generated by tobacco mosaic virus thermal denaturation // J. Biomol. Struct. Dyn. 2014. Vol. 32. N 5. P. 701–708. Trifonova E., Nikitin N., Gmyl A., Lazareva E., Karpova O., Atabekov J. Complexes assembled from TMV-derived spherical particles and entire virions of heterogeneous nature // J. Biomol. Struct. Dyn. 2014. Vol. 32. N 8. P. 1193–1201. Trifonova E.A., Nikitin N.A., Kirpichnikov M.P., Karpova O.V., Atabekov J.G. Obtaining and characterization of spherical particles – new biogenic platforms // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2015. Vol. 70. N. 4. P. 194–197. Atabekov J.G., Nikitin N.A., Karpova O.V. New type of platforms for in vitro vaccine assembly // Moscow Univ. Biol. Sci. Bull. 2015. Vol. 70. N 4. P. 177–183. Nikitin N., Trifonova E., Karpova O., Atabekov J. Examination of biologically active nanocomplexes by nanoparticle tracking analysis // Microsc. Microanal. 2013. Vol. 19. N 4. P. 808–813. Nikitin N.A., Malinin A.S., Trifonova E.A., Rakhnyanskaya A.A., Yaroslavov A.A., Karpova O.V., Atabekov J.G. Proteins immobilization on the surface of modified plant viral particles coated with hydrophobic polycations // J. Biomat. Sci. Polym. Ed. 2014. Vol. 25. N 16. P. 1743–1754. Bruckman M.A., Czapar A.E., VanMeter A., Randolph L.N., Steinmetz N.F. Tobacco mosaic virus-based protein nanoparticles and nanorods for chemotherapy delivery targeting breast cancer // J. Control. Release. 2016. Vol. 231. P. 103–113. Trifonova E.A., Zenin V.A., Nikitin N.A., Yurkova M.S., Ryabchevskaya E.M., Putlyaev E.V., Donchenko E.K., Kondakova O.A., Fedorov A.N., Atabekov J.G., Karpova O.V. Study of rubella candidate vaccine based on a structurally modified plant virus // Antiviral Res. 2017. Vol. 144. P. 27–33. Nikitin N., Ksenofontov A., Trifonova E., Arkhipenko M., Petrova E., Kondakova O., Kirpichnikov M., Atabekov J., Dobrov E., Karpova O. Thermal conversion of filamentous potato virus X into spherical particles with different properties from virions // FEBS Lett. 2016. Vol. 590. N 10. P. 1543–1551. Atabekov J., Dobrov E., Karpova O., Rodionova N. Potato virus X: structure, disassembly and reconstitution // Mol. Plant Pathol. 2007. Vol. 8. N 5. P. 667–675. Descriptions of Plant Viruses (DPV) [Электронный ресурс]. 1975. Дата обновления: 08.2013. URL: http://www.dpvweb.net/ (дата обращения: 16.07.2017). Clare D.K., Pechnikova E.V., Skurat E.V., Makarov V.V., Sokolova O.S., Solovyev A.G., Orlova E.V. Novel inter-subunit contacts in barley stripe mosaic virus revealed by cryo-electron microscopy // Structure. 2015. Vol. 23. N 10. P. 1815–1826. Mukhamedzhanova A.A., Smirnov A.A., Arkhipenko M.V., Ivanov P.A., Chirkov S.N., Rodionova N.P., Karpova O.V., Atabekov J.G. Characterization of Alternanthera mosaic virus and its coat protein // Open Virol. J. 2011. Vol. 5. P. 136–140. Karasev A.V., Chirkov S.N., Kaftanova A.S., Miroshnichenko N.A., Surgucheva N.A., Fedotina V.L. Characterization of bean mild mosaic virus: particle morpho logy, composition and RNA cell-free translation // Intervirology. 1989. Vol. 30. N 5. P. 285–293. Yasaka R., Nguyen H.D., Simon Y.W.H., Duchêne S., Korkmaz S., Katis N., Takahashi H., Gibbs A.J., Ohshima K. The temporal evolution and global spread of cauliflower mosaic virus a plant pararetrovirus // PLoS One. 2014. Vol. 9. N 1. e85641. Kassanis B., McCarthy D. The quality of virus as affected by the ambient temperature // J. Gen. Virol. 1967. Vol. 1. N 4. P. 425–440. Nikitin N., Trifonova E., Evtushenko E., Kirpichnikov M., Atabekov J., Karpova O. Comparative study of non-enveloped icosahedral viruses size // PLoS One. 2015. Vol. 10. N 11. e0142415. Stubbs G., Parker L., Junn J., Kendall A. Flexible filamentous virus structures from fiber diffraction // Fibre Diffraction Rev. 2005. Vol. 13. N 2. P. 38–42. Silver S., Quan S., Deom M. Completion of the nucleotide sequence of sunn-hemp mosaic virus: a tobamovirus pathogenic to legumes // Virus Genes. 1996. Vol. 13. N 1. P. 83–85. Hafez E.E., Abdel Aleem E.E., Fattouh F.A. Comparison of barley stripe mosaic virus strains // Z. Naturforsch C. 2008. Vol. 63. N 3–4. P. 271–276. Solovyev A.G., Makarov V.V. Helical capsids of plant viruses: architecture with structural lability // J. Gen. Virol. 2016. Vol. 97. N 8. P. 1739–1754. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/123 2015-07-22T15:41:52Z jour:%D0%A4%D0%98%D0%97 driver

PHOTOHETEROTROPHIC CALLUS CULTURE FICUS ELASTICA. THE FORMATION OF POLYISOPRENE SYNTHESIS ABILITY ФОТОГЕТЕРОТРОФНАЯ КАЛЛУСНАЯ КУЛЬТУРА FICUS ELASTICA. ФОРМИРОВАНИЕ СПОСОБНОСТИ СИНТЕЗА ПОЛИИЗОПРЕНА I. B. Kolchugina E. N. Markarova И. Б. Кольчугина Е. Н. Маркарова The ability to synthesize polyisoprene was studied for lines of photoheterotrophic callus culture Ficus elastica, which result from the selection and prolonged cultivation of the culture in light in media containing 1% sucrose in the presence of 0,5 and 0,05 mg/l BAP and in the absence of the hormone. Results of microscopic studies show that the F. elastica lines are able to synthesize polyisoprene typical of intact plants. The substantial accumulation of polyisoprene was observed for the culture grown in the BAP-free media. Moreover, for some lines considered, tracheide structures were shown to be present in tissues. The formation the tracheide structures correlates directly with the polyisoprene synthesis. We conclude that the changes in the BAP content in the cultivation medium and selection allow the culture exhibiting a certain functional specificity to be prepared. Under optimum cultivation conditions, the culture develops toward the intensification the polyisoprene synthesis. Исследовали способность линий фотогетеротрофной каллусной культуры Ficuselastica полученных ранее в результате селекции и длительного выращивания на свету на средах с 1% сахарозы и БАП в концентрациях 0,50 и 0,05 мг/л и без добавления гормона, синтезировать полиизопрен. Полученные данные по микроскопированию показали, что изучаемые линии F. elastica могут синтезировать характерный для интактного растения полиизопрен. Значительное накопление полиизопрена наблюдалось у культуры на среде без БАП. Кроме этого, для некоторых из изучаемых линий показано присутствие в тканях трахеидных структур. Формирование трахеидных структур прямо коррелировало с синтезом полиизопрена Делается вывод, что изменения содержания БАП в среде культивирования и селекция дают возможность получить культуру с определенной функциональной специфичностью. В оптимальных условиях культивирования культура развивалась в направлении усиления синтеза полиизопрена.  Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-22 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/123 10.1234/XXXX-XXXX-2009-1-31-35 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2009); 31-35 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2009); 31-35 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2009-1 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/123/123 Бутенко Р.Г. 1975. Экспериментальный морфогенез и дифференциация в культуре клеток растений // 35-е Тимирязевские чтения. М. Бутенко Р.Г. 1999. Биология клеток высших растений in vitro и биотехнология на их основе. М. Гусев М.В., Маркарова Е.Н., Кольчугина И. Б., Колганова Т. В., Веселовский В.А. 1989. Содержание хлорофилла, фотосинтез и длительное послесвечение фотогетеротрофной культуры ткани растений-каучуконосов // Физиол. и биохим. культ. растений. 21. № 4. 321—328. Данилова Н.Ф., Козубов Н.Г. 1980. Атлас ультраструктуры растительных тканей. Петрозаводск. Кольчугина И.Б. 2002. Становление фототрофности в каллусной культуре Ficus elastica при изменении внешних факторов культивирования: Автореф. дис. ... канд. биол. наук. М. Кольчугина И. Б., Макарова Е. Н. 2007. Получение протопластов из тканей каллусной культуры Ficus elastica, различающихся по цитокининовой активности. Роль цитокининов в формировании протопластов // Вестн. Моск. ун-та. Сер. Биология. № 3. 9—12. Кольчугина И.Б., Маркарова Е.Н., Гусев М.В. 1996. Содержание цитокининов в каллусных тканях разных штаммов Ficus elastica, растущих на средах, различающихся по количеству 6-бензилами-нопурина // Вестн. Моск. ун-та. Сер. Биология. № 2. 35—39. Маркарова Е. Н., Кольчугина И. Б., 1998. Ультраструктура хлоропластов в каллусных культурах Ficus elastica, различающихся по активности цитокининов // Физиол. раст. 45. № 5. 659—663. Маркарова Е. Н., Кольчугина И. Б., 2003. Возрастные изменения фотосинтеза и дыхания на протяжении цикла культивирования у штаммов каллусной культуры Ficus elastica с различной цитокининовой активностью // Вестн. Моск. ун-та. Сер. Биология. № 1. 12—14. Маркарова Е.Н., Ладыгина М.Е., Бу -хова И.Ф., Родова Н.А. 1983. Образование полиизопрена в культуре ткани каучуконосов // Тез. докл. IV Всесоюз. конф. “Культура клеток растений и биотехнология”. Кишинев. Носов А.М. 1991. Регуляция синтеза вторичных соединений в культуре клеток растений // Биология культивируемых клеток и биотехнология растений. М. Носов А.М. 1994. Функции вторичных метаболитов растений in vivo и in vitro // Физиол. раст. 41. № 6. 873—878. Носов А.М. 1999. Культура клеток высших растений — уникальная система, модель, инструмент // Фи-зиол. раст. 46. 837—844. Прокофьев А.А. 1948. Локализация, образование и состояние каучука в растениях. М.; Л. Санадзе Г.А. 2004. Биогенный изопрен // Физиол. раст. 51. 810—825. Фурст Г.Г. 1979. Методы анатомо-гистохимического исследования растительных тканей. М. Archer B.L. 1980. 5.4.2 Polyisoprene // Encyclopedia of plant physiology new series. Vol. 8. Secondary plant products / Eds. E.A. Bell, B.V. Charlwood. Berlin. Backhaus R.A. 1985. Rubber formation in plants — a mini-reviero // Isr. J. Bot. 34. N 2—4. 283—293. Bondarev N.I., Suchanova M.A., Reshetnyak O.V., Nosov A.M. 2004. Steviol glycoside content in different organs of Stevia rebaudiana and its dynamics during ontogeny // Biol. Plant. 47. N 2. 261—264. Chappell J. 1995. The biochemistry and molecular biology of isoprenoid metabolism // Plant Physiol. 107.N1. 1—6. Estevez J.M., Cantero A., Reindl A., Reichler S., Leon P. 2001. 1- deoxy-d-xylulose-5-phosphate synthase, a limiting enzyme for plastidic isoprenoid biosynthesis in plants // J. Biol. Chem. 276. N 25. 22901—22909. Heintze A., Gorlach J., Leuschner C., Hoppe P., Hagelstein P., Schulze-Siebert D., Schultz G. 1990. Plastidic isoprenoid synthesis during chloroplast development. Change from metabolic autonomy to a divison-of-labor stage // Plant. Physiol. 93. N 3. 1121—1127. Kurz W.G.W. 1986. Biological and environmental factors of product synthesis, accumulation and biotransformation by plant cell cultures // N.Z.J. Technol. 2. N 2. 77—81. Loreto F., Sharkey T.D. 1990. A gas-exchange study of photosynthesis and isoprene emission in Quercus rubra L. // Planta. 182. N 4. 523—531. Murashige T., Skoog F.A. 1962. Revised medium for rapid growth and bioassays with tobacco tissue cultures // Physiol. Plant. 15. N 3. 473—497. Schulze-Siebert D., Schultz G. 1987. -carotene synthesis in isolated spinach chloroplasts. Its light linkage to photosynthetic carbon metabolism // Plant Physiol. 84. N 4. 1233—1237. Schwender J., Seemann M., Lichten -thaler H.K., Rohmer M. 1996. Biosynthesis of isoprenoids (carotenoids, sterols, prenyl side-chains of chlorophylls and plastoquinone) via a novel pyruvate / glyceraldehyde-3-phosphate non-mevalonate pathway in the green alga Scenedesmus obliquus // Biochem. J. 316. N 1. 73—80. Suri S.S., Ramawat K.G. 1995. In vitro hormonal regulation of laticifer differentiation in Calotropis procera // Ann. Bot. N 5. 75. 477—480. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1050 2021-12-02T11:05:01Z jour:REVI driver

Nanoparticles in the aquatic environment: the risks associated with them and the possibilities of their mitigation with microalgae Наночастицы в водной среде: риски и возможности их контроля с помощью микроводорослей A. A. Gusev O. V. Zakharova I. A. Vasyukova N. A. Evtushenko S. G. Vasilieva A. A. Lukyanov E. S. Lobakova E. V. Skripnikova A. E. Solovchenko А. А. Гусев О. В. Захарова И. А. Васюкова Н. А. Евтушенко С. Г. Васильева А. А. Лукьянов Е. С. Лобакова Е. В. Скрипникова А. Е. Соловченко микрополлютанты microalgae biotoxicity bioremoval wastewater micropollutants микрополлютанты микроводоросли биотоксичность биоудаление сточные воды микрополлютанты Nanoparticles (NPs) are dangerous micro-pollutants that exhibit biotoxicity even in low (nanogram range) concentrations. Apart from direct toxicity to living organisms, NPs can absorb and transfer organic or inorganic toxicants, as well as potentiate the toxicity of other micropollutants. Increasing use of NPs in the industrial and domestic applications leads to their increased production and discharge into the environment giving rise to diverse risks for ecosystems. These risks are exacerbated by the resilience of NPs to biodegradation in natural ecosystems and traditional wastewater treatment plants. Efficient NPs removal technologies are complex and expensive, so they cannot be affordably replicated in common wastewater treatment plants. Despite the risks associated with NPs, humanity will not abandon their use in the nearest future, since the NPs are now at the foundation of many modern technologies. Biodestruction and biosorption of NPs using microalgae cultures and algal-bacterial consortia are considered promising approaches regarding the environmental safety and conservation of natural resources. However, the progress of this approach is hindered by paucity and fragmentary nature of the information about the effects of NPs on microalgae cells and microbial communities. This review attempts to fill this gap, at least partially, by considering common industrial NPs types based on metals and their oxides, as well as carbon nanomaterials. The pathways of their entry into aquatic ecosystems, toxicity to living organisms, accumulation and biotransformation in cells, synergistic effects of NPs in combination with heavy metals and antibiotics, as well as methods of bio-removal of NPs and nanomaterials from aquatic ecosystems using microalgae are discussed. Наночастицы (НЧ) относятся к опасным микрополлютантам – загрязнителям, проявляющим биотоксичность в низких (порядка нг/л) концентрациях. НЧ могут не только напрямую влиять на живые организмы, но и служить переносчиками органических и неорганических загрязнителей, а также усиливать токсическое действие других микрополлютантов. НЧ все шире применяются в промышленных и бытовых целях, что влечет за собой рост объемов их производства, выбросов НЧ в окружающую среду и связанные с этим риски для экосистем. Эти риски усиливаются из-за стойкости НЧ к биодеструкции в природных экосистемах и традиционных очистных сооружениях, а эффективные технологии удаления НЧ сложны и дороги, поэтому их повсеместное внедрение на очистных сооружениях пока невозможно. Тем не менее, несмотря на риски, связанные с НЧ, человечество не откажется от их использования в ближайшем будущем, поскольку они прочно вошли в современный технологический уклад. Биодеструкция и биосорбция НЧ с применением культур микроводорослей и водорослево-бактериальных консорциумов считаются перспективными подходами с точки зрения безопасности для окружающей среды и сохранения природных ресурсов. Развитию этого подхода препятствует фрагментарность сведений о действии НЧ на клетки микроводорослей и микробные сообщества. Настоящий обзор – попытка заполнить этот пробел, по крайней мере, частично. В обзоре рассматриваются распространенные типы промышленных НЧ на основе металлов и их оксидов, а также углеродные наноматериалы. Обсуждаются пути их поступления в водную среду, токсичность для живых организмов, накопление и пути трансформации в клетках, синергетические эффекты НЧ, тяжелых металлов и антибиотиков, а также способы биоудаления НЧ и наноматериалов из водных экосистем с помощью микроводорослей. Lomonosov Moscow State University, School of Biology The research was funded by Russian Science Foundation, project number 21-74-20004 (the part on metal-oxide and carbon nanoparticles) and Russian Foundation for Basic Research, project number 20-34-90115 (the part on metal nanoparticles). Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда (проект № 21-74-20004, анализ данных по НЧ оксидов металлов и углерода) и Российского фонда фундаментальных исследований (проект «Аспиранты» № 20-34-90115, анализ данных по металлическим НЧ). Работу проводили без использования животных и без привлечения людей в качестве испытуемых. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов. 2021-11-29 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1050 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 76, № 4 (2021); 202-212 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 76, № 4 (2021); 202-212 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1050/565 Nguyen H.T., Yoon Y., Ngo H.H., Jang A. The application of microalgae in removing organic micropollutants in wastewater // Crit. Rev. Environ. Sci. Technol. 2021. Vol. 51. P. 1187–1220. Xu L., Wang Y.-Y., Huang J., Chen C.-Y., Wang Z.-X., Xie H. Silver nanoparticles: synthesis, medical applications and biosafety // Theranostics. 2020. Vol. 10. N 20. P. 8996–9031. Jiang J., Pi J., Cai J. The advancing of zinc oxide nanoparticles for biomedical applications // Bioinorg. Chem. Appl. 2018. Vol. 2018: 1062562. Ziental D., Czarczynska-Goslinska B., Mlynarczyk D.T., Glowacka-Sobotta A., Stanisz B., Goslinski T., Sobotta L. Titanium dioxide nanoparticles: prospects and applications in medicine // Nanomaterials. 2020. Vol. 10. N 2: 387. Li J., Li C., Zhao L., Pan X., Cai G., Zhu G. The application status, development and future trend of nanoiron materials in anaerobic digestion system // Chemosphere. 2021. Vol. 269: 129389. Bezza F.A., Tichapondwa S.M., Chirwa E.M.N. Fabrication of monodispersed copper oxide nanoparticles with potential application as antimicrobial agents // Sci. Rep. 2020. Vol. 10. N 1: 16680. Hassanpour P., Panahi Y., Ebrahimi-Kalan A., Akbarzadeh A., Davaran S., Nasibova A., Khalilov R., Kavetskyy T. Biomedical applications of aluminium oxide nanoparticles // Micro Nano Lett. 2018. Vol. 13. N 9. P. 1227–1231. Jahangirian H., Kalantari K., Izadiyan Z., RafieeMoghaddam R., Shameli K., Webster T.J. A review of small molecules and drug delivery applications using gold and iron nanoparticles // Int. J. Nanomed. 2019. Vol. 14. P. 1633–1657. Yonezawa T. Application 78 – Preparation of metal nanoparticles and their application for materials // Nanoparticle technology handbook. 3rd Ed. / Eds. M. Naito, T. Yokoyama, K. Hosokawa, and K. Nogi. Amsterdam: Elsevier, 2018. P. 829–837. Soares E.V., Soares H.M.V.M. Harmful effects of metal(loid) oxide nanoparticles // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2021. Vol. 105. P. 1379–1394. Piccinno F., Gottschalk F., Seeger S., Nowack B. Industrial production quantities and uses of ten engineered nanomaterials in Europe and the world // J. Nanopart. Res. 2012. Vol. 14. N 9: 1109. Meyer J.S., Lyons-Darden T., Garman E.R., Middleton E.T., Schlekat C.E. Toxicity of nanoparticulate nickel to aquatic organisms: review and recommendations for improvement of toxicity tests // Environ. Toxicol. Chem. 2020. Vol. 39. N 10. P. 1861–1883. Lead J.R., Batley G.E., Alvarez P.J.J., Croteau M.-N., Handy R.D., McLaughlin M.J., Judy J.D., Schirmer K. Nanomaterials in the environment: behavior, fate, bioavailability, and effects–an updated review // Environ. Toxicol. Chem. 2018. Vol. 37. N 8. P. 2029–2063. Déniel M., Errien N., Daniel P., Caruso A., Lagarde F. Current methods to monitor microalgaenanoparticle interaction and associated effects // Aquat. Toxicol. 2019. Vol. 217: 105311. Pulido-Reyes G., Leganes F., Fernández-Piñas F., Rosal R. Bio-nano interface and environment: a critical review // Env. Toxicol. Chem. 2017. Vol. 36. N 12. P. 3181–3193. Keller A.A., McFerran S., Lazareva A., Suh S. Global life cycle releases of engineered nanomaterials // J. Nanopart. Res. 2013. Vol. 15. N 6: 1692. Bossa N., Chaurand P., Levard C., Borschneck D., Miche H., Vicente J., Geantet C., Aguerre-Chariol O., Michel F.M., Rose J. Environmental exposure to TiO2 nanomaterials incorporated in building material // Environ. Pollut. 2017. Vol. 220. P. 1160–1170. Kaegi R., Ulrich A., Sinnet B., Vonbank R., Wichser A., Zuleeg S., Simmler H., Brunner S., Vonmont H., Burkhardt M., Boller M. Synthetic TiO2 nanoparticle emission from exterior facades into the aquatic environment // Environ. Pollut. 2008. Vol. 156. N 2. P. 233–239. Bundschuh M., Filser J., Lüderwald S., McKee M.S., Metreveli G., Schaumann G.E., Schulz R., Wagner S. Nanoparticles in the environment: where do we come from, where do we go to? // Environ. Sci. Eur. 2018. Vol. 30. N 1: 6. Gondikas A.P., Kammer F. v.d., Reed R.B., Wagner S., Ranville J.F., Hofmann T. Release of TiO2 Nanoparticles from sunscreens into surface waters: a oneyear survey at the old danube recreational lake // Environ. Sci. Technol. 2014. Vol. 48. N 10. P. 5415–5422. Andra S., Balu S.K., Jeevanandam J., Muthalagu M. Emerging nanomaterials for antibacterial textile fabrication // Naunyn-Schmiedeberg’s Arch. Pharmacol. 2021. Vol. 394. N 7. P. 1355–1382. Benn T.M., Westerhoff P. Nanoparticle silver released into water from commercially available sock fabrics // Environ. Sci. Technol. 2008. Vol. 42. N 11. P. 4133–4139. Sawicki K., Czajka M., Matysiak-Kucharek M., Fal B., Drop B., Męczyńska-Wielgosz S., Sikorska K., Kruszewski M., Kapka-Skrzypczak L. Toxicity of metallic nanoparticles in the central nervous system // Nanotechnol. Rev. 2019. Vol. 8. N 1. P. 175–200. Ermolin M.S., Fedotov P.S., Ivaneev A.I., Karandashev V.K., Fedyunina N.N., Eskina V.V. Isolation and quantitative analysis of road dust nanoparticles // J. Anal. Chem. 2017. Vol. 72. N 5. P. 520–532. Galdames A., Ruiz-Rubio L., Orueta M., SánchezArzalluz M., Vilas-Vilela J.L. Zero-valent iron nanoparticles for soil and groundwater remediation // Int. J. Environ. Res. Public Health. 2020. Vol. 17. N 16: 5817. Pirzadah B., Pirzadah T.B., Jan A., Hakeem K.R. Nanofertilizers: a way forward for green economy // Nanobiotechnology in agriculture: an approach towards sustainability / Eds. K.R. Hakeem and T.B. Pirzadah. Cham: Springer. P. 99–112. Rani U.A., Ng L.Y., Ng C.Y., Mahmoudi E. A review of carbon quantum dots and their applications in wastewater treatment // Adv. Colloid Interface Sci. 2020. Vol. 278: 102124. Efimova S.S., Khaleneva D.A., Litasova E.V., Piotrovskiy L.B., Ostroumova O.S. The mechanisms of action of water-soluble aminohexanoic and malonic adducts of fullerene C60 with hexamethonium on model lipid membranes // Biochim. Biophys. Acta Biomembr. 2020. Vol. 1862. N 11: 183433. Moradlou O., Rabiei Z., Delavari N. Antibacterial effects of carbon quantum dots–hematite nanostructures deposited on titanium against gram-positive and gramnegative bacteria // J. Photochem. Photobiol. A: Chem. 2019. Vol. 379. P. 144–149. Joshi P., Mishra R., Narayan R.J. Biosensing applications of carbon-based materials // Curr. Opin. Biomed. Eng. 2021. Vol. 18: 100274. Li H.-Y., Li D., Guo Y., Yang Y., Wei W., Xie B. On-site chemosensing and quantification of Cr(VI) in industrial wastewater using one-step synthesized fluorescent carbon quantum dots // Sens. Actuators B Chem. 2018. Vol. 277. P. 30–38. Fallah Z., Zare E.N., Ghomi M., Ahmadijokani F., Amini M., Tajbakhsh M., Arjmand M., Sharma G., Ali H., Ahmad A., Makvandi P., Lichtfouse E., Sillanpää M., Varma R.S. Toxicity and remediation of pharmaceuticals and pesticides using metal oxides and carbon nanomaterials // Chemosphere. 2021. Vol. 275: 130055. Velasco-Santos C., Martinez-Hernández A.L., Consultchi A., Rodriguez R., Castaño V.M. Naturally produced carbon nanotubes // Chem. Phys. Lett. 2003. Vol. 373. N 3–4. P. 272–276. Bäuerlein P.S., Emke E., Tromp P., Hofman J.A.M.H., Carboni A., Schooneman F., de Voogt P., van Wezel A.P. Is there evidence for man-made nanoparticles in the Dutch environment? // Sci. Total Environ. 2017. Vol. 576. P. 273–283. De Marchi L., Pretti C., Gabriel B., Marques P.A.A.P., Freitas R., Neto V. An overview of graphene materials: properties, applications and toxicity on aquatic environments // Sci. Total Environ. 2018. Vol. 631. P. 1440–1456. Di Felice G., Colombo P. Nanoparticle-allergen complexes for allergen immunotherapy // Int. J. Nanomed. 2017. Vol. 12. P. 4493–4504. Singh S.P., Chinde S., Kamal S.S., Rahman M.F., Mahboob M., Grover P. Genotoxic effects of chromium oxide nanoparticles and microparticles in Wistar rats after 28 days of repeated oral exposure // Environ. Sci. Pollut. Res. Int. 2016. Vol. 23. N 4. P. 3914–3924. Liu F., Chang X., Tian M., Zhu A., Zou L., Han A., Su L., Li S., Sun Y. Nano NiO induced liver toxicity via activating the NF-κB signaling pathway in rats // Toxicol. Res. 2017. Vol. 6. N 2. P. 242–250. Shabbir S., Kulyar M.F. Toxicological consequences of titanium dioxide nanoparticles (TiO2NPs) and their jeopardy to human population // Bionanoscience. 2021. Vol. 11. N 2. P. 621–632. Baranowska-Wójcik E., Szwajgier D., Oleszczuk P., Winiarska-Mieczan A. Effects of titanium dioxide nanoparticles exposure on human health-a review // Biol. Trace Elem. Res. 2020. Vol. 193. N 1. P. 118–129. Wu T., Tang M. The inflammatory response to silver and titanium dioxide nanoparticles in the central nervous system // Nanomedicine. 2018. Vol. 13. N 2. P. 233–249. Sarma S.J., Bhattacharya I., Brar S.K., Tyagi R.D., Surampalli R.Y. Carbon nanotube–bioaccumulation and recent advances in environmental monitoring // Crit. Rev. Environ. Sci. Technol. 2015. Vol. 45. N 9. P. 905–938. Khaliullin T.O., Yanamala N., Newman M.S., Kisin E.R., Fatkhutdinova L.M., Shvedova A.A. Comparative analysis of lung and blood transcriptomes in mice exposed to multi-walled carbon nanotubes // Toxicol. Appl. Pharmacol. 2020. Vol. 390: 114898. Adedara I.A., Anao O.O., Forcados G.E., Awogbindin I.O., Agbowo A., Ola-Davies O.E., Patlolla A.K., Tchounwou P.B., Farombi E.O. Low doses of multi-walled carbon nanotubes elicit hepatotoxicity in rats with markers of oxidative stress and induction of pro-inflammatory cytokines // Biochem. Biophys. Res. Comm. 2018. Vol. 503. N 4. P. 3167–3173. Liu X., Liu T., Song J., Hai Y., Luan F., Zhang H., Yuan Y., Li H., Zhao C. Understanding the interaction of single-walled carbon nanotube (SWCNT) on estrogen receptor: A combined molecular dynamics and experimental study // Ecotoxicol. Environ. Saf. 2019. Vol. 172. P. 373–379. Sasidharan A., Swaroop S., Koduri C.K., Girish C.M., Chandran P., Panchakarla L.S., Somasundaram V.H., Gowd G.S., Nair S., Koyakutty M. Comparative in vivo toxicity, organ biodistribution and immune response of pristine, carboxylated and PEGylated few-layer graphene sheets in Swiss albino mice: a three month study // Carbon. 2015. Vol. 95. P. 511–524. An W., Zhang Y., Zhang X., Li K., Kang Y., Akhtar S., Sha X., Gao L. Ocular toxicity of reduced graphene oxide or graphene oxide exposure in mouse eyes // Exp. Eye Res. 2018. Vol. 174. P. 59–69. Cupi D., Hartmann N.B., Baun A. Influence of pH and media composition on suspension stability of silver, zinc oxide, and titanium dioxide nanoparticles and immobilization of Daphnia magna under guideline testing conditions // Ecotoxicol. Environ. Saf. 2016. Vol. 127. P. 144–152. Wang F., Guan W., Xu L., Ding Z., Ma H., Ma A., Terry N. Effects of nanoparticles on algae: adsorption, distribution, ecotoxicity and fate // Appl. Sci. 2019. Vol. 9. N 8: 1534. Lee S., Kim K., Shon H.K., Kim S.D., Cho J. Biotoxicity of nanoparticles: effect of natural organic matter // J. Nanopart. Res. 2011. Vol. 13. N 7. P. 3051–3061. Levard C., Hotze E.M., Lowry G.V., Brown G.E. Environmental transformations of silver nanoparticles: impact on stability and toxicity // Environ. Sci. Technol. 2012. Vol. 46. N 13. P. 6900–6914. Wang Z., Zhang L., Zhao J., Xing B. Environmental processes and toxicity of metallic nanoparticles in aquatic systems as affected by natural organic matter // Environ. Sci. Nano. 2016. Vol. 3. N 2. P. 240–255. Collin B., Tsyusko O.V., Starnes D.L., Unrine J.M. Effect of natural organic matter on dissolution and toxicity of sulfidized silver nanoparticles to Caenorhabditis elegans // Environ. Sci. Nano. 2016. Vol. 3. N 4. P. 728–736. Li L., Fernández-Cruz M., Connolly M., Schuster M., Navas J. Dissolution and aggregation of Cu nanoparticles in culture media: effects of incubation temperature and particles size // J. Nanopart. Res. 2015. Vol. 17. N 1: 38. Fu L., Hamzeh M., Dodard S., Zhao Y., Sunahara G. Effects of TiO2 nanoparticles on ROS production and growth inhibition using freshwater green algae pre-exposed to UV irradiation // Environ. Toxicol. Pharmacol. 2015. Vol. 39. N 3. P. 1074–1080. Zhao J., Cao X., Liu X., Wang Z., Zhang C., White J.C., Xing B. Interactions of CuO nanoparticles with the algae Chlorella pyrenoidosa: adhesion, uptake, and toxicity // Nanotoxicol. 2016. Vol. 10. N 9. P. 1297–1305. Wang Z., Zhang F., Vijver M.G., Peijnenburg W.J.G.M. Graphene nanoplatelets and reduced graphene oxide elevate the microalgal cytotoxicity of nano-zirconium oxide // Chemosphere. 2021. Vol. 276: 130015. Zhao J., Cao X., Wang Z., Dai Y., Xing B. Mechanistic understanding toward the toxicity of graphenefamily materials to freshwater algae // Water Res. 2017. Vol. 111. P. 18–27. Tao X., Yu Y., Fortner J.D., He Y., Chen Y., Hughes J.B. Effects of aqueous stable fullerene nanocrystal (nC60) on Scenedesmus obliquus: Evaluation of the sub-lethal photosynthetic responses and inhibition mechanism // Chemosphere. 2015. Vol. 122. P. 162–167. Kwok K.W., Leung K.M., Flahaut E., Cheng J., Cheng S.H. Chronic toxicity of double-walled carbon nanotubes to three marine organisms: influence of different dispersion methods // Nanomedicine. 2010. Vol. 5. N 6. P. 951–961. Lukhele L.P., Mamba B.B., Musee N., Wepener V. Acute toxicity of double-walled carbon nanotubes to three aquatic organisms // J. Nanomater. 2015. Vol. 2015. N 3: 219074. Fan W., Liu Y., Xu Z., Wang X., Li X., Luo S. The mechanism of chronic toxicity to Daphnia magna induced by graphene suspended in a water column // Environ. Sci. Nano. 2016. Vol. 3. N 6. P. 1405–1415. Tervonen K., Waissi G., Petersen E.J., Akkanen J., Kukkonen J.V.K. Analysis of fullerene-C60 and kinetic measurements for its accumulation and depuration in Daphnia magna // Environ. Toxicol. Chem. 2010. Vol. 29. N 5. P. 1072–1078. De Marchi L., Neto V., Pretti C., Figueira E., Chiellini F., Morelli A., Soares A.M.V.M., Freitas R. Toxic effects of multi-walled carbon nanotubes on bivalves: Comparison between functionalized and nonfunctionalized nanoparticles // Sci. Total Environ. 2018. Vol. 622. P. 1532–1542. Bangeppagari M., Park S.H., Kundapur R.R., Lee S.J. Graphene oxide induces cardiovascular defects in developing zebrafish (Danio rerio) embryo model: In-vivo toxicity assessment // Sci. Total Environ. 2019. Vol. 673. P. 810–820. Prakash J., Venkatesan M., Sebastian Prakash J, J., Bharath G., Anwer S., Veluswamy P., Prema D., Venkataprasanna K.S., Venkatasubbu G.D. Investigations on the invivo toxicity analysis of reduced graphene oxide/TiO2 nanocomposite in zebrafish embryo and larvae (Danio rerio) // Appl. Surf. Sci. 2019. Vol. 481. P. 1360–1369. Souza J.P., Baretta J.F., Santos F., Paino I.M.M., Zucolotto V. Toxicological effects of graphene oxide on adult zebrafish (Danio rerio) // Aquat. Toxicol. 2017. Vol. 186. P. 11–18. Audira G., Lee J.-S., Siregar P., Malhotra N., Rolden M.J., Huang J.C., Chen K.H., Hsu H.S., Hsu Y., Ger T.R., Hsiao C.D. Comparison of the chronic toxicities of graphene and graphene oxide toward adult zebrafish by using biochemical and phenomic approaches // Environ. Pollut. 2021. Vol. 278: 116907. Malakootian M., Yaseri M., Faraji M. Removal of antibiotics from aqueous solutions by nanoparticles: a systematic review and meta-analysis // Environ. Sci. Pollut Res. 2019. Vol. 26. N 9. P. 8444–8458. Li M., Liu W., Slaveykova V.I. Effects of mixtures of engineered nanoparticles and metallic pollutants on aquatic organisms // Environments. 2020. Vol. 7. N 4: 27. Tang Y., Li S., Qiao J., Wang H., Li L. Synergistic effects of nano-sized titanium dioxide and zinc on the photosynthetic capacity and survival of Anabaena sp. // Int. J. Mol. Sci. 2013. Vol. 14. N 7. P. 14395–14407. Wang D., Hu J., Irons D.R., Wang J. Synergistic toxic effect of nano-TiO and As(V) on Ceriodaphnia dubia // Sci. Total Environ. 2011. Vol. 409. N 7. P. 1351–1356. Yang W.W., Li Y., Miao A.J., Yang L.Y. Cd2+ toxicity as affected by bare TiO2 nanoparticles and their bulk counterpart // Ecotoxicol. Environ. Saf. 2012. Vol. 85. P. 44–51. Hartmann N.B., Legros S., Von der Kammer F., Hofmann T., Baun A. The potential of TiO2 nanoparticles as carriers for cadmium uptake in Lumbriculus variegatus and Daphnia magna // Aquat. Toxicol. 2012. Vol. 118–119. P. 1–8. Peterson J.W., Burkhart R.S., Shaw D.C., Schuiling A.B., Haserodt M.J., Seymour M.D. Experimental determination of ampicillin adsorption to nanometer-size Al2O3 in water // Chemosphere. 2010. Vol. 80. N 11. P. 1268–1273. Van Wieren E.M., Seymour M.D., Peterson J.W. Interaction of the fluoroquinolone antibiotic, ofloxacin, with titanium oxide nanoparticles in water: adsorption and breakdown // Sci. Total Environ. 2012. Vol. 441. P. 1–9. Surwade P., Ghildyal C., Weikel C., Luxton T., Peloquin D., Fan X., Shah V. Augmented antibacterial activity of ampicillin with silver nanoparticles against methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) // J. Antibiot. 2019. Vol. 72. N 1. P. 50–53. Abo-Shama U.H., El-Gendy H., Mousa W.S., Hamouda R.A., Yousuf W.E., Hetta H.F., Abdeen E.E. Synergistic and antagonistic effects of metal nanoparticles in combination with antibiotics against some reference strains of pathogenic microorganisms // Infect. Drug. Resist. 2020. Vol. 13. P. 351–362. McShan D., Zhang Y., Deng H., Ray P.C., Yu H. Synergistic antibacterial effect of silver nanoparticles combined with ineffective antibiotics on drug resistant Salmonella typhimurium DT104 // J. Environ. Sci. Health C: Environ. Carcinog. Ecotoxicol. Rev. 2015. Vol. 33. N 3. P. 369–384. Windiasti G., Feng J., Ma L., Hu Y., Hakeem M.J., Amoako K., Delaquis P., Lu X. Investigating the synergistic antimicrobial effect of carvacrol and zinc oxide nanoparticles against Campylobacter jejuni // Food Control. 2019. Vol. 96. P. 39–46. Hwang I.-S., Hwang J.H., Choi H., Kim K.-J., Lee D.G. Synergistic effects between silver nanoparticles and antibiotics and the mechanisms involved // J. Med. Microbiol. 2012. Vol. 61. N 12. P. 1719–1726. Sun C., Li W., Xu Y., Hu N., Ma J., Cao W., Sun S., Hu C., Zhao Y., Huang Q. Effects of carbon nanotubes on the toxicities of copper, cadmium and zinc toward the freshwater microalgae Scenedesmus obliquus // Aquat. Toxicol. 2020. Vol. 224: 105504. Freixa A., Acuña V., Sanchís J., Farré M., Barceló D., Sabater S. Ecotoxicological effects of carbon based nanomaterials in aquatic organisms // Sci. Total. Environ. 2018. Vol. 619. P. 328–337. Wang X., Qu R., Liu J., Wei Z., Wang L., Yang S., Huang Q., Wang Z. Effect of different carbon nanotubes on cadmium toxicity to Daphnia magna: the role of catalyst impurities and adsorption capacity // Environ. Pollut. 2016. Vol. 208. P. 732–738. Schwab F., Bucheli T.D., Camenzuli L., Magrez A., Knauer K., Sigg L., Nowack B. Diuron sorbed to carbon nanotubes exhibits enhanced toxicity to Chlorella vulgaris // Environ. Sci. Technol. 2013. Vol. 47. N 13. P. 7012–7019. Jang M.-H., Hwang Y.S. Effects of functionalized multi-walled carbon nanotubes on toxicity and bioaccumulation of lead in Daphnia magna // PLoS One. 2018. Vol. 13. N 3: e0194935. Zhang C., Chen X., Tan L., Wang J. Combined toxicities of copper nanoparticles with carbon nanotubes on marine microalgae Skeletonema costatum // Environ. Sci. Pollut. Res. 2018. Vol. 25. N 13. P. 13127–13133. Song B., Xu P., Zeng G., Gong J., Wang X., Yan J., Wang S., Zhang P., Cao W., Ye S. Modeling the transport of sodium dodecyl benzene sulfonate in riverine sediment in the presence of multi-walled carbon nanotubes // Water Res. 2018. Vol. 129. P. 20–28. Sun Y., Liu X., Lv X., Wang T., Xue B. Synthesis of novel lignosulfonate-modified graphene hydrogel for ultrahigh adsorption capacity of Cr(VI) from wastewater // J. Clean. Prod. 2021. Vol. 295: 126406. Chenab K.K., Sohrabi B., Jafari A., Ramakrishna S. Water treatment: functional nanomaterials and applications from adsorption to photodegradation // Mater. Today Chem. 2020. Vol. 16: 100262. Martín-de-Lucía I., Campos-Mañas M.C., Agüera A., Leganés F., Fernández-Piñas F., Rosal R. Combined toxicity of graphene oxide and wastewater to the green alga Chlamydomonas reinhardtii // Environ. Sci. Nano. 2018. Vol. 5. P. 1729–1744. Zhang X., Liu Y. Nanomaterials for radioactive wastewater decontamination // Environ. Sci. Nano. 2020. Vol. 7. N 4. P. 1008–1040. Mubarak N.M., Sahu J.N., Abdullah E.C., Jayakumar N.S., Ganesan P. Microwave-assisted synthesis of multi-walled carbon nanotubes for enhanced removal of Zn(II) from wastewater // Res. Chem. Intermed. 2016. Vol. 42. N 4. P. 3257–3281. Miao A.-J., Luo Z., Chen C.-S., Chin W.-C., Santschi P.H., Quigg A. Intracellular uptake: a possible mechanism for silver engineered nanoparticle toxicity to a freshwater alga Ochromonas danica // PloS One. 2010. Vol. 5. N 12: e15196. Mahana A., Guliy O.I., Mehta S.K. Accumulation and cellular toxicity of engineered metallic nanoparticle in freshwater microalgae: current status and future challenges // Ecotoxicol. Environ. Saf. 2021. Vol. 208: 111662. Chen J., Li H., Han X., Wei X. Transmission and accumulation of nano-TiO2 in a 2-step food chain (Scenedesmus obliquus to Daphnia magna) // Bull. Environ. Contam. Toxicol. 2015. Vol. 95. N 2. P. 145–149. Mariano S., Panzarini E., Inverno M.D., Voulvoulis N., Dini L. Toxicity, Bioaccumulation and biotransformation of glucose-capped silver nanoparticles in green microalgae Chlorella vulgaris // Nanomaterials. 2020. Vol. 10. N 7: 1377. Kalman J., Paul K., Khan F., Stone V., Fernandes T. Characterisation of bioaccumulation dynamics of three differently coated silver nanoparticles and aqueous silver in a simple freshwater food chain // Environ. Chem. 2015. Vol. 12. N 6. P. 662–672. Ribeiro F., Gallego-Urrea J.A., Goodhead R.M., Van Gestel C.A., Moger J., Soares A.M., Loureiro S. Uptake and elimination kinetics of silver nanoparticles and silver nitrate by Raphidocelis subcapitata: The influence of silver behaviour in solution // Nanotoxicol. 2015. Vol. 9. N 6. P. 686–695. Chen F., Xiao Z., Yue L., Wang J., Feng Y., Zhu X., Wang Z., Xing B. Algae response to engineered nanoparticles: current understanding, mechanisms and implications // Environ. Sci. Nano. 2019. Vol. 6. N 4. P. 1026–1042. Oh N., Park J.-H. Endocytosis and exocytosis of nanoparticles in mammalian cells // Int. J. Nanomed. 2014. Vol. 9. Suppl. 1. P. 51–63. Wang S., Lv J., Ma J., Zhang, S. Cellular internalization and intracellular biotransformation of silver nanoparticles in Chlamydomonas reinhardtii // Nanotoxicol. 2016. Vol. 10. N 8. P. 1129–1135. Bakaraki Turan N., Sari H., Onkal Engin G., Bilgili M. Nanoparticles in the aquatic environment: Usage, properties, transformation and toxicity–a review // Process Saf. Environ. Prot. 2019. Vol. 130. P. 238–249. Mortimer M., Petersen E.J., Buchholz B.A., Orias E., Holden P.A. Bioaccumulation of multiwall carbon nanotubes in Tetrahymena thermophila by direct feeding or trophic transfer // Environ. Sci. Technol. 2016. Vol. 50. N 16. P. 8876–8885. Allen B.L., Kichambare P.D., Gou P., Vlasova I.I., Kapralov A.A., Konduru N., Kagan V.E., Star A. Biodegradation of single-walled carbon nanotubes through enzymatic catalysis // Nano Lett. 2008. Vol. 8. N 11. P. 3899–3903. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/155 2015-07-23T09:31:16Z jour:GN driver

SOMACLONAL VARIATIONS OF THE NICOTIANA TABACUM TRANSGENIC PLANTS СОМАКЛОНАЛЬНАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ ТРАНСГЕННЫХ РАСТЕНИЙ NICOTIANA TABACUM A. S. Kurbidaeva M. G. Novokreshchenova А. С. Курбидаева М. Г. Новокрещёнова сомаклональная изменчивость Nicotiana tabacum somaclonal variation сомаклональная изменчивость Nicotiana tabacum сомаклональная изменчивость There   are  difficulties in  studying   of  transgenic plants   which   associate with  the  instability  of transformation, the  inactivation of  insertion and  the  derivation of  somaclonal variants. This  study describes   the   lines  of  tobacco  plants,  which   were  obtained  by  agrobacterial transformation and subsequent micropropagation in  sterile  conditions. Plants  are  characterized by dwarf  length, increased  proportion of sterile  pollen  grains  and  the  lack  of insertion which  was detected before. В процессе изучения морфофизиологических и генетических особенностей трансгенных растений нередко исследователи сталкиваются с трудностями, связанными с нестабильностью трансформации, инактивацией инсерции и появлением сомаклональных вариантов. В данной работе  описаны линии растений табака, полученные после  агробактериальной трансформации  и последующего вегетативного размножения в стерильных условиях. Растения характеризуются   карликовым ростом, повышением доли  стерильных пыльцевых зерен и  отсутствием ранее детектируемой вставки. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-23 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/155 10.1234/XXXX-XXXX-2011-3-8-12 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 3 (2011); 8-12 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 3 (2011); 8-12 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2011-3 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/155/154 Данилова С.А. Методы генетической трансформации зерновых культур // Физиол. раст. 2007. Т. 54. С. 645—658. Sugui J.A., Chang Y.C., Kwon-Chung K.J. Agrobacterium tumefaciens mediated transformation of Aspergillus fu- migatus: an efficient tool for insertional mutagenesis and targeted gene disruption // Appl. Environ. Microbiol. 2005. Vol. 71. P. 1798—1802. Дейнеко Е.В., Новоселя Т.В., Загорская , Филипен- ко Е.А., Пухначева Н.В., Шумный В.К. Инактивирование чужеродных генов в геноме трансгенных растений // Изучение генома и генетическая трансформация расте- ний. Новосибирск: Наука, 2001. С. 132—142. Еникеев А.Г., Копытина Т.В., Семенова Л.А., На- тяганова А.В., Гаманец Л.В., Волкова О.Д. Агробактериальная трансформация как комплексный биологический стрессирующий фактор // J. of Stress Physiology and Biochemistry. 2008. Vol. 4. N 1. P. 11—19. Cassels A.C., Curry R.F. Oxidative stress and physio- logical, epigenetic and genetic variability in plant tissue cultu- re: implications for micropropagators and genetic engineers // Plant Cell Tissue Organ. Cult. 2001. Vol. 64. P. 145—167. Cnops G., den Boer B., Gerats A., Van Montagu M., Van Lijsebettens M. Chromosome landing at the Arabidopsis TORNADO1 locus using an AFLP-based strategy // Mol. Gen. Genet. 1996. Vol. 253. P. 32—41. Ngezahayo F., Dong Y., Liu B. Somaclonal variation at the nucleotide sequence level in rice (Oryza sativa L.) as revealed by RAPD and ISSR markers, and by pairwise sequ- ence analysis // J. Appl. Genet. 2007. Vol. 48. P. 329—336. Дейнеко Е.В. О потенциальных возможностях использования Т-ДНК почвенных бактерий // Вестн. ВОГиС. 1998. № 4. C. 4. Daud N., Taha R.M., Hasbullah N.A. Studies on plant regeneration and somaclonal variation in Saintpaulia ionantha Wendl. (African violet) // Pak. J. Biol. Sci. 2008. Vol. 11. P. 1240—1245. Тарасов В.А.,. Хадеева Н.В., Мельник В.А., Ежова Т.А., Шестаков С.В. Ген At1g12860 Arabidopsis thalia- na, детерминирующий антимикробную кателицидинпо- лобную активность // Докл. РАН. 2009. T. 427. C. 139—141. Dellaporta S.L., Wood J., Hicks J.B. A plant DNA minipreparation: version II // Plant Mol. Biol. Rep. 1983. Vol. 1 P. 19—21. Паушева 3.Л. Практикум по цитологии растений. М.: Колос, 1980. 304 с. Brian M., Abdeen A., Manabe Y., MacDonald P. Se- lectable marker genes and unintended changes to the plant transcriptome // Plant Biotechnol. J. 2009. Vol. 7. P. 211—218. Abdeen A., Miki B. The pleiotropic effects of the bar gene and glufosinate on the Arabidopsis transcriptome // Plant Biotechnol. J. 2009. Vol. 7. P. 266—282. Дубровная О.В., Лялько И.И., Губанова Н.Я. Сомаклональная изменчивость растений сахарной свеклы по признаку стерильности пыльцы // Цитология и гене- тика. 2004. Т. 38. № 5. С. 24—29. Kaeppler Sh.M., Kaeppler H.F., Rhee Y. Epigenetic aspects of somaclonal variation in plants // Plant Molecular Biol. 2000. Vol. 43. P. 179—188. Labra M., Vannini C., Grassi F., Bracale M., Balsemin M., Basso B., Sala F. Genomic stability in Arabidopsis thaliana transgenic plants obtained by floral dip // Theor. Appl. Genet. Nov. Vol. 109. P. 1512—1518. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1163 2023-01-09T09:18:08Z jour:RA driver

Vitamin K2 mediates electron transport from NADH dehydrogenase 2 to bd-type quinol oxidase in Lacticaseibacillus rhamnosus CM MSU 529 Витамин К2 является медиатором транспорта электронов от НАДН-дегидрогеназы 2 к хинолоксидазе bd-типа у Lacticaseibacillus rhamnosus КМ МГУ 529 T. Y. Dinarieva A. I. Klimko T. A. Cherdyntseva A. L. Bryukhanov A. I. Netrusov Т. Ю. Динариева А. И. Климко Т. А. Чердынцева А. Л. Брюханов А. И. Нетрусов Nox-2 Lacticaseibacillus rhamnosus respiration electron-transport chain NADH dehydrogenase 2 quinol oxidase bd Nox-2 Nox-2 Lacticaseibacillus rhamnosus дыхание электрон-транспортная цепь НАДН-дегидрогеназа 2 хинолоксидаза bd Nox-2 Тo activate respiratory metabolism Lacticaseibacillus rhamnosus CM MSU 529 was grown in a batch culture under intensive aeration in the presence of 38 μM hemin and 18 μM vitamin K2 as a source of menaquinone. Unsupplemented aerobic culture served as a control. Supplementation of the growth medium with hemin or menaquinone separately had no significant effect on culture growth. Biomass concentration of 2,86 ± 0,05 g dw cells/l and the yield coefficient for biomass YP/S of 25,6 ± 1,5 g dw cells/mol glucose consumed were determined after 24 h and 18 h of cultivation under respiratory conditions (hemin + K2) respectively. Both values were 27% higher compared to those for aerobic conditions. Spectral analysis revealed the presence of cytochromes b- and d-type in membranes of L. rhamnosus CM MSU 529. The activity of bacterial electron transport chain was investigated by polarographic technique. Membrane preparations obtained from cells grown aerobically on hemin-containing medium intensively consumed oxygen in the presence of 1 mM NADH. Addition of 0.2 mM menaquinone to reaction mixture caused the increase of NADH oxidation rate by 4.6 fold. Enzymes presumably involved in NADH oxidation by membranes were identified using MALDI-TOF MS/MS: pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase (Nox-2), NADH dehydrogenase 2 (Ndh-2), and ubiquinol oxidase bd subunit I (CydA). Thus, during NADH oxidation 80% of electron transport from NADH to oxygen went via Ndh-2, menaquinone, bd-type quinol oxidase and only 20% – via Nox-2. The study presents experimental evidence for electron transport chain functioning in L. rhamnosus CM MSU 529 during aerobic cultivation with hemin and menaquinone. The NADH oxidation rates of membrane preparations of lactic acid bacteria were measured for the first time. The property of exogenous menaquinone to transfer electrons from Ndh-2 to bd-type quinol oxidase was demonstrated for the first time in vitro in lactic acid bacteria. Lacticaseibacillus rhamnosus КМ МГУ 529 выращивали в периодической культуре при интенсивной аэрации в присутствии 38 мкМ гемина и 18 мкМ витамина К2 как источника менахинона для активации дыхательного метаболизма. Контролем служила аэробная культура, выращенная без добавления гемина и менахинона. Внесение в ростовую среду гемина или менахинона по отдельности не оказывало существенного влияния на рост культуры. В дыхательных условиях (гемин + К2) выход биомассы суточной культуры составлял 2,86 ± 0,05 г сухих клеток/л, а молярный экономический коэффициент YP/S после 18 ч культивирования – 25,6 ± 1,5 г сухих клеток/моль использованной глюкозы. Оба значения превышали аналогичные показатели для аэробных условий на 27%. Спектральный анализ выявил присутствие цитохромов b- и d-типа в мембранах L. rhamnosus КМ МГУ 529. Активность электрон-транспортной цепи бактерии исследовали полярографическим методом. Препараты мембран из клеток, выращенных аэробно на среде с гемином, активно потребляли кислород в присутствии 1 мМ НАДН. Внесение 0,2 мМ менахинона в реакционную смесь сопровождалось увеличением скорости окисления мембранами НАДН в 4,6 раза. С помощью MALDI-TOF MS/MS идентифицированы ферменты, предположительно участвующие в окислении мембранами НАДН: пиридиннуклеотид-дисульфид-оксидоредуктаза (Nox-2), НАДН-дегидрогеназа 2 (Ndh-2) и субъединица I убихинолоксидазы bd (CydA). Таким образом, при окислении НАДН 80% транспорта электронов от НАДН к кислороду шло через Ndh-2, менахинон, хинолоксидазу bd-типа и только 20% – через Nox-2. В работе приведены экспериментальные свидетельства в пользу функционирования электрон-транспортной цепи у L. rhamnosus КМ МГУ 529 при аэробном культивировании в присутствии гемина и менахинона. Впервые измерены скорости окисления НАДН препаратами мембран молочнокислой бактерии. При этом впервые продемонстрировано in vitro свойство экзогенного менахинона переносить электроны от Ndh-2 к хинолоксидазе bd-типа у молочнокислой бактерии. Lomonosov Moscow State University, School of Biology The study was performed within the framework of the state task on the topic of the Department of Microbiology of MSU “Physiology and Biochemistry of Phototrophic and Chemotrophic Microorganisms” (project number 121032300094-7). Исследование выполнено в рамках госзадания по теме кафедры микробиологии МГУ «Физиология и биохимия фототрофных и хемотрофных микроорганизмов» (№ 121032300094-7). 2022-08-20 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1163 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 77, № 3 (2022); 188-194 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 77, № 3 (2022); 188-194 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1163/597 Hill C., Guarner F., Reid G., Gibson G.R., Merenstein D.J., Pot B., Morelli L., Canani R.B., Flint H.J., Salminen S., Calder P.C., Sanders M.E. The international scientific association for probiotics and prebiotics consensus statement on the scope and appropriate use of the term probiotic // Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol. 2014. Vol. 11. N 8. P. 506–514. Moslem P., Hossein N., Mahdi R., Seyed N.H., Seyed A.S. Lactobacillus rhamnosus Gorbach-Goldin (GG): a top well-researched probiotic strain // J. Med. Microbiol. 2017. Vol. 5. N 5–6. P. 46–59. Pedersen M.B., Gaudu P., Lechardeur D., Petit M.A., Gruss A. Aerobic respiration metabolism in lactic acid bacteria and uses in biotechnology // Annu. Rev. Food Sci. Technol. 2012. Vol. 3. P. 37–58. Arioli S., Zambelli D., Guglielmetti S., De Noni I., Pedersen M.B., Pedersen P.D., Dal Bello F., Mora D. Increasing the heme-dependent respiratory efficiency of Lactococcus lactis by inhibition of lactate dehydrogenase // Appl. Environ. Microbiol. 2013. Vol. 79. N 1. P. 376–380. Ianniello R.G., Zotta T., Matera A., Genovese F., Parente E., Ricciardi A. Investigation of factors affecting aerobic and respiratory growth in the oxygen-tolerant strain Lactobacillus casei N87 // PLoS One. 2016. Vol. 11. N 11: e0164065. Zotta T., Parente E., Ricciardi A. Aerobic metabolism in the genus Lactobacillus: impact on stress response and potential applications in the food industry // J. Appl. Microbiol. 2017. Vol. 122. N 4. P. 857–869. Siciliano R.A. Pannella G., Lippolis R., Ricciardi A., Mazzeo M. F., Zotta T. Impact of aerobic and respirative life-style on Lactobacillus casei N87 proteome // Int. J. Food Microbiol. 2019. Vol. 298. P. 51–62. Johanson A., Goel A., Olsson L., Franzén C.J. Respiratory physiology of Lactococcus lactis in chemostat cultures and its effect on cellular robustness in frozen and freeze-dried starter cultures // Appl. Environ. Microbiol. 2020. Vol. 86. N 6: e02785–19. Klimko A.I., Cherdyntseva T.A., Brioukhanov A.L., Netrusov A.I. In vitro evaluation of probiotic potential of selected lactic acid bacteria strains // Probiotics Antimicrob. Proteins. 2020. Vol. 12. N 3. P. 1139–1148. Bradford M.M. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding // Anal. Biochem. 1976. Vol. 72. P. 248–254. Teteneva N.A., Mart’yanov S.V., Esteban-López M., Kahnt J., Glatter T., Netrusov A.I., Plakunov V.K., Sourjik V. Multiple drug-induced stress responses inhibit formation of Escherichia coli biofilms // Appl. Environ. Microbiol. 2020. Vol. 86. N 21: e01113–20. Wagner T., Wegner C.E., Kahnt J., Ermler U., Shima S. Phylogenetic and structural comparisons of the three types of methyl coenzyme M reductase from Methanococcales and Methanobacteriales // J. Bacteriol. 2017. Vol. 199. N 16: e00197–17. Eng J.K., McCormack A.L., Yates J.R. An approach to correlate tandem mass spectral data of peptides with amino acid sequences in a protein database // J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1994. Vol. 5. N 11. P. 976–989. Ianniello R.G., Zheng J., Zotta T., Ricciardi A., Gänzle M.G. Biochemical analysis of respiratory metabolism in the heterofermentative Lactobacillus spicheri and Lactobacillus reuteri // J. Appl. Microbiol. 2015. Vol. 119. N 3. P. 763–775. Sakamoto J., Koga E., Mizuta T., Sato C., Noguchi S., Sone N. Gene structure and quinol oxidase activity of a cytochrome bd-type oxidase from Bacillus stearothermophilus // Biochim. Biophys. Acta. 1999. Vol. 1411. N 1. P. 147–158. Averina O.V., Poluektova E.U., Marsova M.V., Danilenko V.N. Biomarkers and utility of the antioxidant potential of probiotic lactobacilli and bifidobacteria as representatives of the human gut microbiota // Biomedicines 2021, Vol. 9. N 10: e1340. Marreiros B.C., Sena F.V., Sousa F.M., Batista A.P.,Manuela M. Pereira M.M. Type II NADH: quinone oxidoreductase family: phylogenetic distribution, structural diversity and evolutionary divergences // Environ. Microbiol. 2016. Vol. 18. N 12. P. 4697–4709. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/250 2015-07-24T23:59:56Z jour:MA driver

THE REACTIVITY OF THE EXOMETABOLITES ALLOCATED IN THE CULTURES LIQUID OF MICROORGANISMS, AS A CRITERION OF COMPATIBILITY AT THE SELECTION OF THE MIXED CULTURES AND ARTIFICIAL ASSOCIATIONS РЕАКЦИОННАЯ СПОСОБНОСТЬ НАТИВНЫХ ЭКЗОМЕТАБОЛИТОВ, ВЫДЕЛЯЕМЫХ В СРЕДУ МИКРООРГАНИЗМАМИ, КАК КРИТЕРИЙ СОВМЕСТИМОСТИ ПРИ ПОДБОРЕ СМЕШАННЫХ КУЛЬТУР И ИСКУССТВЕННЫХ АССОЦИАЦИЙ A. H. Tambiev A. A. Lukyanov А. Х. Тамбиев А. А. Лукьянов актиномицеты reactivity of the exometabolites mixed cultures cyanobacteria microalgae actinomycetes актиномицеты реакционная способность смешанные культуры цианобактерии микроводоросли актиномицеты The reactivity of the exometabolites allocated in the culture liquid in cultures of actinomy- cetes, cyanobacteria and microalgae as possible using like the ecophysiological criterion of the selection of partners for the create mixed cultures and associative pairs of microorganisms has been considered.  Реакционная способность выделяемых в культуральную среду нативных (прижизненных) экзометаболитов в культурах актиномицетов, цианобактерий и микроводорослей рассматри­вается в качестве возможного экофизиологического критерия при подборе партнеров для искусственно создаваемых смешанных культур и ассоциативных пар микроорганизмов. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-07-25 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/250 10.1234/XXXX-XXXX-2011-1-32-35 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 1 (2011); 32-35 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 1 (2011); 32-35 0137-0952 10.1234/XXXX-XXXX-2011-1 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/250/247 Claesson M.J., van Sinderen D., O’Toole P.W. The genus Lactobacillus — a genomic basis for understanding its di- versity // FEMS Microbiol. Let. 2007. Vol. 269. Is. 1. P. 22—28. Маkarova K.S., Koonin E.V. Evolutionary genomics of lactic acid bacteria // J. Bacteriol. 2007. Vol. 189. P. 1199—1208. Kao Y.T., Liu Y.S., Shyu Y.T. Identification of Lactobacillus spp. in probiotic products by real-time PCR and melting curve analysis // Food Research Int. 2007. Vol. 40. Is. 1. P. 71—79. Stackebrandt E., Frederiksen W., Garrity G.M., Gri- mont P.A.D., Kampfer P., Maiden M.C.J., Nesme X., Rossello-Mora R., Swings J., Truper H.G., Vauterin L., Ward A.C., Whitman W.B. Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002. Vol. 52. P. 1043—1047. Chavagnat F., Haueter M., Jimeno J., Casey M.G. Comparison of partial tuf gene sequences for the identifi- cation of lactobacilli // FEMS Microbiology Letters. 2002. Vol. 217. P. 177—183. Naser S.M., Dawyndt P., Hoste B., Gevers D., Vande- meulebroecke K., Cleenwerck I., Vancanneyt M., Swings J. Identification of lactobacilli by pheS and rpoA gene sequ- ence analyses // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007. Vol. 57. P. 2777—2789. Blaiotta G., Fusco V., Ercolini D., Aponte M., Pepe O., Villani F. Lactobacillus strain diversity based on partial hsp60 gene sequences and design of PCR-restriction fragment length polymorphism assays for species identification and differentia- tion // Appl. Environ. Microbiol. 2008. Vol. 74. P. 208—215. Morse R., Collins M.D., O’Hanlon K., Wallbanks S., Richardson P.T. Analysis of the beta’ subunit of DNA-de- pendent RNA polymerase does not support the hypothesis in- ferred from 16S rRNA analysis that Oenococcus oeni (formerly Leuconostoc oenos) is a tachytelic (fast-evolving) bacterium // Int. J. Syst. Bacteriol. 1996. Vol. 46. Is. 4. P. 1004—1009. Adekambi T., Drancourt M., Raoult D. The rpoB gene as a tool for clinical microbiologists // Trends in Microbio- logy. 2009. Vol. 17. N 1. Wilson K. Preparation of genomic DNA from bacteria, in Current Protocols in Molecular Biology (Ausu- bel F.M., Brent R., Kingston R.E., Moore D.D., Seidman J.G., Smith J.A. et al.). Wiley; New York, 1987. P. 241—245. Werle E., Schneider C., Renner M., Vцlker M., Fiehn W. Convenient single-step, one tube purification of PCR products for direct sequencing // Nucleic Acids Res. 1994. Vol. 22. P. 4354—4355. Ko K.S., Kim J.M., Kim J.W., Jung B.Y., Kim W., Kim I.J., Kook Y.-H. Identification of Bacillus anthracis by rpoB sequence analysis and multiplex PCR // J. Clinic. Mic- robiol. 2003. Vol. 41. Is. 7. P. 2908—2914. Rantsiou K., Comi G., Cocolin L. The rpoB gene as a target for PCR-DGGE analysis to follow lactic acid bac- terial population dynamics during food fermentations // Food Microbiol. 2004. Vol. 21. P. 481—487. Morse R., O’Hanlon K., Collins M.D. Phylogenetic, amino acid content and indel analyses of the beta subunit of DNA-dependent RNA polymerase of Gram-positive and Gram-negative bacteria // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002. Vol. 52. P. 1477—1484. Pot B., Tsakalidou E. Taxonomy and metabolism of lactobacillus. Lactobacillus molecular biology from genomics to probiotics. L.: Caister Academic Press, 2009. P. 26—27. Matte-Tailliez O., Brochier C., Forterre P., Philip- pe H. Archaeal phylogeny based on ribosomal proteins // Mol. Biol. Evol. 2002. Vol. 19. P. 631—639. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/19 2015-04-30T18:51:53Z jour:EC driver

SPIRIT GRAIN CARBOHYDRATES TRANSFORMATION BY MICROBIAL ASSOCIATION IMMOBILIZED ON THE POLIMERIC MATRIXES ПРЕОБРАЗОВАНИЕ УГЛЕВОДОВ СПИРТОВОЙ БАРДЫ АССОЦИАЦИЯМИ МИКРООРГАНИЗМОВ, ИММОБИЛИЗОВАННЫХ НА ПОЛИМЕРНЫХ МАТРИЦАХ E. L. Barsky G. A. Dol’nikova Ya. V. Savanina E. E. Belousova E. Y. Karpova A. G. Dedov E. S. Lobakova Е. Л. Барский Г. А. Дольникова Я. В. Саванина Е. Е. Белоусова Е. Ю. Карпова А. Г. Дедов Е. С. Лобакова очистка спиртовой барды polymeric matrixes immobilization sewage treatment of spirit grain. очистка спиртовой барды полимерные волокнистые матрицы иммобилиза- ция очистка спиртовой барды Biological treatment features of spirit grain comparising about 10—20 g/1 saccharides and polysaccharides are examined. The most perspective microbial association concerning carbohydrates utilization and acetate accumulation serve as association “Tambucan silt”. This culture, immobilized on the polymeric matrixes, form biohybrid materials. The largest number of culture cells are adsorbed on the 9,11 and 9,21 matrixes. Cells, immobilized on this matrixes, more effective oxidize carbohydrates and produce more low redox-potential of medium. It is supposed in biohybrid materials are formed specific bacterial systems at the expense of preference development certain microbial group. Из природных и антропогенных источников выделены 5 микробных ассоциаций, перспективных для трансформации углеводов (сахаров и декстринов) спиртовой барды в ацетат. Исследовали характер биологической очистки барды, содержащей до 40 г/л углеводов, ассоциацией “Тамбуканский ил”, иммобилизованной на полимерных нетканых волокнистых органических матрицах. Иммобилизованная ассоциация микроорганизмов образует с матрицами биогибридные материалы, характеризующиеся различными свойствами в зависимости от их природы. Максимальная биомасса микробной ассоциации накапливается в матрицах 9,11 и 9,21 и эффективнее, чем с другими матрицами, окисляет углеводы барды, накапливает ацетат в среде, а также создает более низкий ее редокс-потенциал. Предполагается, что в результате образования биогибридных материалов происходит формирование специфических бактериальных систем, отличающихся физико-химическими и биохимическими свойствами за счет преимущественного развития определенных групп микробных клеток. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-04-30 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/19 10.1234/XXXX-XXXX-2013-2-36-42 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 2 (2013); 36-42 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 2 (2013); 36-42 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/19/21 Хенце М., Армоэс П., Ля-Кур-Янсен Й., Арван Э. Очистка сточных вод. М.: Мир, 2009. 480 с. Кузнецов А.Е., Градова Н.Б., Лушников С.В., Энгельхарт М., Вайссер Т., Чеботарёва М.В. Прикладная экобиотехнология (учебник для высшей школы). Т. 1. М.: Бином. Лаборатория знаний, 2010. 629 с. Callow J.A., Callow M.E. Biofilms // Proc. Mol. Subcell. Biol. 2006. Vol. 42. P. 141—169. Hansen S.K., Rainey P.B., Haagensen J.A., Molin S. Evocation of species interaction in a biofilm community // Nature. 2007. Vol. 445. N 7127. P. 533—536. Заварзин Г.А., Колотилова Н.Н. Введение в природоведческую микробиологию. М., 2001. 200 с. Иммобилизованные клетки и ферменты. Методы / Под ред. Дж. Вудворда. М.: Мир, 1988. 215 с. Лебедева А.Ф., Саванина Я.В., Барский Е.Л. Изменения редокс-потенциала и содержания углеводов в среде при периодическом и диализном культивировании цианобактерии Anacystis nidulans и бактерии Pseudomonas diminuta // Вестн. Моск. ун-та. Сер. 16. Биология. 2002. № 2. С. 24—29. Корженевская Т.Г.. Запольнова И.Б., Гусев М.В., Соколов Б.А. Роль микроорганизмов в преобразовании состава нефти и нефтяных биотехнологиях. М.: Геоинформцентр, 2002. 76 с. Revis N.J.P., Merks A.G.A. Heavy metal uptake by plankton and other seston particles // Chem. Spec. and Biovail. 1989. Vol. 1. N 1. P. 31—37. Омарова Л.О., Кащеева П.Б., Лобакова Е.С., Дольникова Г.А, Идеатулов Р.К., Дедов А.Г. Новые материалы для сорбции и утилизации нефти и нефтепродуктов при аварийных разливах / Вестн. Моск. ун-та. Сер. 16. Биология. 2012. № 1. С. 28—35. Пиневич А.В. Биология прокариот. Т. 2. СПб.: Изд-во СПб ун-та, 2007. 329 с. Лысак Л.В., Добровольская Т.Г., Скворцова И.Н. Методы оценки бактериального разнообразия почв и идентификации почвенных бактерий. М.: МАКС Пресс, 2003. 120 с. Методы химии углеводов / Под ред. Н.К. Кочеткова. М., 1967. 512 с. Бранцевич Л.Г., Лысенко Л.Н., Овод В.В., Гурбик А.В. Микробиология. Практикум для студентов университетов, медицинских институтов и технологических институтов пищевой промышленности. Киев: Вища школа, 1987. 171 с. Баулина О.И. Ультраструктурная пластичность цианобактерий. М.: Научный мир, 2010. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1434 2025-03-04T06:43:38Z jour:REVI driver

Multiple sclerosis. Some features of pathology and prospects for therapy. Part 2 Рассеянный склероз. Некоторые особенности патологии и возможные пути терапии. Часть 2 E. K. Fetisova N. V. Vorobjeva M. S. Muntyan Е. К. Фетисова Н. В. Воробьева М. С. Мунтян старение oxidative stress reactive oxygen species neutrophils mitochondria–targeted antioxidants stem cells helminth therapy aging старение окислительный стресс активные формы кислорода нейтрофилы митохондриально-направленные антиоксиданты стволовые клетки гельминтотерапия старение Multiple sclerosis (MS) is one of the most common neurological diseases and the number of affected people is constantly growing worldwide. Untreated MS leads to disability of the most capable part of the young population, and in recent years it has been diagnosed increasingly in elderly patients as well. The second part of our review is devoted to the prospects of MS therapies currently under development. Mitochondria and the use of mitochodria-targeted antioxidants, neutrophils, as well as immune cells affected by pathology and other differentiated cells, which can be reprogrammed and replaced by healthy cells using stem cells, are considered as targets in MS treatment. Helminth therapy, accompanied by a shift in the composition of the microbiota of MS patients and the release of antioxidants in the tissues of the examined humans and model animals, may lead to immunomodulation and reduction of oxidative stress, providing significant attenuation of the disease. Approaches to the treatment of elderly MS patients are discussed. Рассеянный склероз (РС) входит в число наиболее распространенных неврологических заболеваний. Количество страдающих от РС постоянно растет во всем мире. Заболевание в отсутствие лечения приводит к инвалидизации наиболее трудоспособной части населения молодого возраста, а в последние годы стало все чаще диагносцироваться и у пожилых пациентов. Вторая часть нашего обзора посвящена перспективам методов терапии РС, находящихся в стадии разработки. В качестве мишеней при лечении РС рассмотрены митохондрии с использованием митоходриально-направленных антиоксидантов, нейтрофилы, а также затронутые патологией клетки иммунитета и другие специализированные клетки, перепрограммировать и заместить которые на здоровые можно при помощи стволовых клеток, незрелые олигодендроциты, ускоренно созревающие и вызывающие ремиелинизацию аксонов при воздействии антигистаминного препарата. Гельминтотерапия, сопровождающаяся смещением состава микробиоты больных РС и выделением антиоксидантов в ткани человека и модельных животных, может приводить к иммуномодуляции и снижению окислительного стресса, обеспечивая значительное ослабление заболевания. Обсуждаются подходы к лечению пожилых больных РС. Lomonosov Moscow State University, School of Biology This research was performed under the state assignment of Moscow State University, project numbers 119121690043-3, 1243020800089-2, 121042600047-9. Работа выполнена в рамках госзадания МГУ на госбюджетной основе (научные проекты №/№ 119121690043-3, 1243020800089-2,121042600047-9). 2025-03-03 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1434 10.55959/MSU0137-0952-16-79-4-1 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 79, № 4 (2024); 269-279 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 79, № 4 (2024); 269-279 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1434/699 Huang W.J., Chen W.W., Zhang X. Multiple sclerosis: Pathology, diagnosis and treatments. Exp. Ther. Med. 2017;13(6):3163–3166. Hauser S.L., Cree B.A.C. Treatment of multiple sclerosis: A review. Am. J. Med. 2020;133(12):1380-1390.e2. Macaron G., Larochelle C., Arbour N., Galmard M., Girard J.M., Prat A., Duquette P. Impact of aging on treatment considerations for multiple sclerosis patients. Front. Neurol. 2023;14:1197212. Ostolaza A., Corroza J., Ayuso T. Multiple sclerosis and aging: comorbidity and treatment challenges. Mult. Scler. Relat. Disord. 2021;50:102815. Zhang Y., Atkinson J., Burd C.E., Graves J., Segal B.M. Biological aging in multiple sclerosis. Mult. Scler. 2023;29(14):1701–1708. Zeydan B., Kantarci O.H. Impact of age on multiple sclerosis disease activity and progression. Curr. Neurol. Neurosci. Rep. 2020;20(7):24. Fetisova E., Vorobjeva N., Muntyan M. Multiple sclerosis. Some features of pathology and prospects for therapy. Part 1. Adv. Gerontol. 2024;14(2):35–48. Vorobjeva N.V., Chernyak B.V. NETosis: molecular mechanisms, role in physiology and pathology. Biochemistry (Mosc.). 2020;85(10):1178–1190. De Bondt M., Hellings N., Opdenakker G., Struyf S. Neutrophils: underestimated players in the pathogenesis of multiple sclerosis (MS). Int. J. Mol. Sci. 2020;21(12):4558. Dhaiban S., Al-Ani M., Elemam N.M., AlAawad M.H., Al-Rawi Z., Maghazachi A.A. Role of peripheral immune cells in multiple sclerosis and experimental autoimmune encephalomyelitis. Science. 2021;3(1):12. Grebenciucova E., Pruitt A. Infections in patients receiving multiple sclerosis disease-modifying therapies. Curr. Neurol. Neurosci. Rep. 2017;17(11):88. Fetisova E., Chernyak B., Korshunova G., Muntyan M., Skulachev V. Mitochondria-targeted antioxidants as a prospective therapeutic strategy for multiple sclerosis. Curr. Med. Chem. 2017;24(19):2086–2114. Fetisova E.K., Muntyan M.S., Lyamzaev K.G., Chernyak B.V. Therapeutic effect of the mitochondriatargeted antioxidant SkQ1 on the culture model of multiple sclerosis. Oxid. Med. Cell. Longev. 2019;2019:2082561. Fock E.M., Parnova R.G. Protective effect of mitochondria-targeted antioxidants against inflammatory response to lipopolysaccharide challenge: a review. Pharmaceutics. 2021;13(2):144. Jiang Q., Yin J., Chen J., Ma X., Wu M., Liu G., Yao K., Tan B., Yin Y. Mitochondria-targeted antioxidants: a step towards disease treatment. Oxid. Med. Cell. Longev. 2020;2020:8837893. Liberman E.A., Topaly V.P., Tsofina L.M., Jasaitis A.A., Skulachev V.P. Mechanism of coupling of oxidative phosphorylation and the membrane potential of mitochondria. Nature. 1969;222(5198):1076–1078. Korshunova G.A., Shishkina A.V., Skulachev M.V. Design, synthesis, and some aspects of the biological activity of mitochondria-targeted antioxidants. Biochemistry (Mosc.). 2017;82(7):760–777. Fields M., Marcuzzi A., Gonelli A., Celeghini C., Maximova N., Rimondi E. Mitochondria-targeted antioxidants, an innovative class of antioxidant compounds for neurodegenerative diseases: perspectives and limitations. Int. J. Mol. Sci. 2023;24(4):3739. Skulachev V.P., Antonenko Y.N., Cherepanov D.A., et al. Prevention of cardiolipin oxidation and fatty acid cycling as two antioxidant mechanisms of cationic derivatives of plastoquinone (SkQs). Biochim. Biophys. Acta BBA-Bioenergetics. 2010;1797(6–7):878–89. Antonenko Y.N., Avetisyan A.V., Bakeeva L.E., et al. Mitochondria-targeted plastoquinone derivatives as tools to interrupt execution of the aging program. 1. Cationic plastoquinone derivatives: synthesis and in vitro studies. Biochemistry (Mosc.). 2008;73(12):1273–1287. Murphy M.P., Smith R.A.J. Targeting antioxidants to mitochondria by conjugation to lipophilic cations. Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 2007;47(1):629–656. Открытое исследование I фазы по изучению фармакокинетики, безопасности и переносимости препарата Пластомитин® при однократном приеме возрастающих доз у здоровых добровольцев. (Ответственный исследователь Щукин И.А.) [Электронный ресурс]. Государственный реестр лекарственных средств. 2016. Дата обновления: 15.12.2024. URL: https://grlsbase.ru/clinicaltrails/clintrail/3570 (дата обращения: 15.12.2024). Fassas A., Anagnostopoulos A., Kazis A., Kapinas K., Sakellari I., Kimiskidis V., Tsompanakou A. Peripheral blood stem cell transplantation in the treatment of progressive multiple sclerosis: first results of a pilot study. Bone Marrow Transpl. 1997;20(8):631–638. Iacobaeus E., Kadri N., Lefsihane K., Boberg E., Gavin C., Törnqvist Andrén A., Lilja A., Brundin L., Blanc K.L. Short and long term clinical and immunologic follow up after bone marrow mesenchymal stromal cell therapy in progressive multiple sclerosis – a phase I study. J. Clin. Med. 2019;8(12):2102. Федулов А.С., Борисов А.В., Зафранская М.М., Кривенко С.И., Марченко Л.Н., Качан Т.В., Московских Ю.В., Нижегородова Д.Б. Сравнительная оценка эффективности однократного и курсового применения аутологичной трансплантации мезенхимальных стволовых клеток в терапии рассеянного склероза. РМЖ. Медицинское обозрение. 2019;3(4-2):54–58. Bisaga G.N., Topuzova M.P., Malko V.A., Motorin D.V., Alekseeva Yu.A., Badaev R.S., Krinitsina T.V., Alekseeva T.M. High-dose chemotherapy with autologous hematopoietic stem cell transplantation in multiple sclerosis: intermediate results of 3 years research. Russ. Neurol. J. 2022;27(6):22–31. Pluchino S., Quattrini A., Brambilla E., Gritti A., Salani G., Dina G., Galli R., Del Carro U., Amadio S., Bergami A., Furlan R., Comi G., Vescovi A.L., Martino G. Injection of adult neurospheres induces recovery in a chronic model of multiple sclerosis. Nature. 2003;422(6933):688–694. Genchi A., Brambilla E., Sangalli F., et al. Neural stem cell transplantation in patients with progressive multiple sclerosis: an open-label, phase 1 study. Nat. Med. 2023;29(1):75–85. Uccelli A., Laroni A., Ali R., et al. Safety, tolerability, and activity of mesenchymal stem cells versus placebo in multiple sclerosis (MESEMS): a phase 2, randomised, double-blind crossover trial. Lancet Neurol. 2021;20(11):917–929. Сороковикова Т.В., Морозов А.М., Крюкова А.Н., Наумова С.А., Беляк М.А. Перспективы лечения прогрессирующих форм рассеяного склероза трасплантацией стволовых клеток (обзор литературы). Вестник медицинского института «Реавиз». Реабилитация, врач и здоровье. 2023;13(4):154–161. Cecerska-Heryć E., Pękała M., Serwin N., Gliźniewicz M., Grygorcewicz B., Michalczyk A., Heryć R., Budkowska M., Dołęgowska B. The use of stem cells as a potential treatment method for selected neurodegenerative diseases: review. Cell Mol. Neurobiol. 2023;43(6):2643–2673. Xie C., Liu Y.Q., Guan Y.T., Zhang G.X. Induced stem cells as a novel multiple sclerosis therapy. Curr. Stem Cell Res. Ther. 2016;11(4):313–320. Yun W., Choi K.A., Hwang I., et al. OCT4-induced oligodendrocyte progenitor cells promote remyelination and ameliorate disease. NPJ Regen. Med. 2022;7(1):4. Wang Y., Chang K., Liu C., Na W., Jiang Z., Xiong J. Clemastine promotes oligodendrocyte precursor cell differentiation and myelination after acute radiation injury. J. Radiat. Res. Radiat. Proces. 2023;39(5):48–55. Caverzasi E., Papinutto N., Cordano C., Kirkish G., Gundel T.J., Zhu A., Akula A.V., Boscardin W.J., Neeb H., Henry R.G., Chan J.R., Green A.J. MWF of the corpus callosum is a robust measure of remyelination: Results from the ReBUILD trial. Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. 2023;120(20):e2217635120. Hansen C.S., Hasseldam H., Bacher I.H., Thamsborg S.M., Johansen F.F., Kringel H. Trichuris suis secrete products that reduce disease severity in a multiple sclerosis model. Acta Parasitol. 2017;62(1):22–28. Fleming J., Hernandez G., Hartman L., Maksimovic J., Nace S., Lawler B., Risa T., Cook T., Agni R., Reichelderfer M., Luzzio C., Rolak L., Field A., Fabry Z. Safety and efficacy of helminth treatment in relapsing-remitting multiple sclerosis: results of the HINT 2 clinical trial. Mult. Scler. J. 2019;25(1):81–91. Yordanova I.A., Ebner F., Schulz A.R., Steinfelder S., Rosche B., Bolze A., Paul F., Mei H.E., Hartmann S. The worm-specific immune response in multiple sclerosis patients receiving controlled Trichuris suis ova immunotherapy. Life (Basel). 2021;11(2):101. Libbey J.E., Cusick M.F., Fujinami R.S. Role of pathogens in multiple sclerosis. Int. Rev. Immunol. 2014;33(4):266–283. Tanasescu R., Tench C.R., Constantinescu C.S., Telford G., Singh S., Frakich N., Onion D., Auer D.P., Gran B., Evangelou N., Falah Y., Ranshaw C., Cantacessi C., Jenkins T.P., Pritchard D.I. Hookworm treatment for relapsing multiple sclerosis: a randomized double-blinded placebo-controlled trial. JAMA Neurol. 2020;77(9):1089–1098. Jenkins T.P., Pritchard D.I., Tanasescu R., Telford G., Papaiakovou M., Scotti R., Cortés A., Constantinescu C.S., Cantacessi C. Experimental infection with the hookworm, Necator americanus, is associated with stable gut microbial diversity in human volunteers with relapsing multiple sclerosis. BMC Biol. 2021;19(1):74. Wegener Parfrey L., Jirků M., Šíma R., Jalovecka M., Sak B., Grigore K., Jirků Pomajbíková K. A benign helminth alters the host immune system and the gut microbiota in a rat model system. PLoS One. 2017;12(8):e0182205. Calvani N.E.D., De Marco Verissimo C., Jewhurst H.L., Cwiklinski K., Flaus A., Dalton J.P. Two distinct superoxidase dismutases (SOD) secreted by the helminth parasite Fasciola hepatica play roles in defence against metabolic and host immune cell-derived reactive oxygen species (ROS) during growth and development. Antioxidants. 2022;11(10):1968. Otero L., Bonilla M., Protasio A.V., Fernández C., Gladyshev V.N., Salinas G. Thioredoxin and glutathione systems differ in parasitic and free-living platyhelminths. BMC Genomics. 2010;11:237. Xiang C., Zhong G., Wang H. IL-9 plays a critical role in helminth-induced protection against COVID-19- related cytokine storms. mBio. 2024;15(7):e0122924. Cao Z., Wang J., Liu X., Liu Y., Li F., Liu M., Chiu S., Jin X. Helminth alleviates COVID-19-related cytokine storm in an IL-9-dependent way. mBio. 2024;15(6):e00905-24. Solaro C., Ponzio M., Moran E., Tanganelli P., Pizio R., Ribizzi G., Venturi S., Mancardi G.L., Battaglia M.A. The changing face of multiple sclerosis: Prevalence and incidence in an aging population. Mult. Scler. 2015;21(10):1244–1250. Marrie R.A., Cohen J., Stuve O., Trojano M., Sørensen P.S., Reingold S., Cutter G., Reider N. A systematic review of the incidence and prevalence of comorbidity in multiple sclerosis: overview. Mult. Scler. 2015;21(3):263–281. Noseworthy J., Paty D., Wonnacott T., Feasby T., Ebers G. Multiple sclerosis after age 50. Neurology 1983;33(12):1537–1537. Minden S.L., Frankel D., Hadden L.S., Srinath K.P., Perloff J.N. Disability in elderly people with multiple sclerosis: An analysis of baseline data from the Sonya Slifka Longitudinal Multiple Sclerosis Study. NeuroRehabilitation. 2004;19(1):55–67. Zinganell A., Göbel G., Berek K., Hofer B., Asenbaum-Nan S., Barang M., Böck K., Bsteh C., Bsteh G., Eger S., Eggers C., Fertl E., Joldic D., Khalil M., Langenscheidt D. et al. Multiple sclerosis in the elderly: a retrospective cohort study. J. Neurol. 2024;271(2):674–687. Weideman A.M., Tapia-Maltos M.A., Johnson K., Greenwood M., Bielekova B. Meta-analysis of the age-dependent efficacy of multiple sclerosis treatments. Front. Neurol. 2017;8:577. Bjornevik K., Cortese M., Healy, B.C., Kuhle J., Mina M.J., Leng Y., Elledge S.J., Niebuhr D.W., Scher A.I., Munger K.L., Ascherio A. Longitudinal analysis reveals high prevalence of Epstein-Barr virus associated with multiple sclerosis. Science. 2022;375(6578):296–301. Matell H., Lycke J., Svenningsson A., Holmén C., Khademi M., Hillert J., Olsson T., Piehl F. Age-dependent effects on the treatment response of natalizumab in MS patients. Mult. Scler. 2015;21(1):48–56. Gelibter S., Saraceno L., Pirro F., Susani E.L., Protti A. As time goes by: Treatment challenges in elderly people with multiple sclerosis. J. Neuroimmunol. 2024;391:578368. Muñoz J.S., Santiago A.D., Escudero J.C., Merino J.A.G. Case report: Primary cytomegalovirus infection in a patient with late onset multiple sclerosis treated with dimethyl fumarate. Front. Neurol. 2024;15:1363876. Oudrer N. Multiple sclerosis in elderly patients: When we can stopped treatment? Mult. Scler. Relat. Disord. 2023;80:105181. Skulachev V.P., Anisimov V.N., Antonenko Y.N., et al. An attempt to prevent senescence: a mitochondrial approach. Biochim. Biophys. Acta (BBA)-Bioenergetics. 2009;1787(5):437–461. Zielonka J., Joseph J., Sikora A., Hardy M., Ouari O., Vasquez-Vivar J., Cheng G., Lopez M., Kalyanaraman B. Mitochondria-targeted triphenylphosphonium-based compounds: syntheses, mechanisms of action, and therapeutic and diagnostic applications. Chem. Rev. 2017;117(15):10043–10120. Lin M.M., Liu N., Qin Z.H., Wang Y. Mitochondrial-derived damage-associated molecular patterns amplify neuroinflammation in neurodegenerative diseases. Acta Pharmacol. Sin. 2022;43(10):2439–2447. Sanabria-Castro A., Alape-Girón A., FloresDíaz M., Echeverri-McCandless A., Parajeles-Vindas A. Oxidative stress involvement in the molecular pathogenesis and progression of multiple sclerosis: a literature review. Rev. Neurosci. 2024;35(3):355–371. Sutter P.A., McKenna M.G., Imitola J., Pijewski R.S., Crocker S.J. Therapeutic opportunities for targeting cellular senescence in progressive multiple sclerosis. Curr. Opin. Pharmacol. 2022;63:102184. Ghosh A., Chandran K., Kalivendi S.V., Joseph J., Antholine W.E., Hillard C.J., Kanthasamy A.,Kanthasamy A., Kalyanaraman B. Neuroprotection by a mitochondria-targeted drug in a Parkinson’s Disease model. Free Radical Biol. Med. 2010;49:1674−1684. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/282 2015-11-28T15:11:15Z jour:METH driver

DEVELOPMENT OF FLUORESCENTLY LABELLED MONONUCLEOSOMES TO STUDY TRANSCRIPTION MECHANISMS BY METHOD OF MICROSCOPY OF SINGLE COMPLEXES РАЗРАБОТКА ФЛУОРЕСЦЕНТНО-МЕЧЕНЫХ МОНОНУКЛЕОСОМ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ МЕХАНИЗМОВ ТРАНСКРИПЦИИ МЕТОДОМ МИКРОСКОПИИ ОДИНОЧНЫХ КОМПЛЕКСОВ K. S. Kudryashova D. V. Nikitin O. V. Chertkov N. S. Gerasimova M. E. Valieva V. M. Studitsky A. V. Feofanov К. С. Кудряшова Д. В. Никитин О. В. Чертков Н. С. Герасимова М. Е. Валиева В. М. Студитский А. В. Феофанов эпигенетика RNA polymerase fluorescence microscopy epigenetics эпигенетика РНК-полимераза флуоресценция микроскопия эпигенетика Fluorescence microscopy of single molecules and complexes is becoming increasingly popular method to study nucleosomes and functionally important processes with their participation. In this work we report on the development of positioned mononucleosomes on the basis of fluorescently labeled DNA matrix, which are a new tool for investigation of structural rearrangements in chromatin during transcription by RNA polymerase (RNAP). Two fluorophores, Cy3 (donor) and Cy5 (acceptor), were introduced in a non-transcribed DNA chain. After DNA packing on histone core they are positioned in the middle part of a nucleosome in the neighboring supercoils at a distance of less than 60 Å and interact by the mechanism of Förster resonance energy transfer (FRET). Changes in the nucleosome structure were monitored by changes in FRET efficiency in the study of single complexes of nucleosomes with RNAP by fluorescence microscopy. It is shown that introduction of labels did not affect the ability of RNAP to transcribe nucleosomes. Open complex with RNAP as well as elongation complexes stalled at positions –39 and –5 before the nucleosome boundary were prepared and characterized. It is shown that more than 80% of histones maintain their structure, restoring the original packing of DNA on the histone core after transcription completion. A new experimental system offers new possibilities for the study of a structure of nucleosomes and modulating effects of various protein chaperonesand remodelers on them. Флуоресцентная микроскопия одиночных молекул и комплексов становится все более востребованным методом изучения нуклеосом и функционально важных процессов с их участием. В данной работе на основе флуоресцентно-меченой матрицы ДНК разработаны строго позиционированные мононуклеосомы, которые являются новым инструментом для исследования структурных перестроек в хроматине в процессе транскрипции РНК-полимеразой (РНКП). В нетранскрибируемую цепь ДНК были введены два флуорофора — Cy3 (донор) и Cy5 (акцептор), которые после укладки ДНК на гистоновом октамере оказываются в средней части нуклеосомы на соседних участках ДНК на расстоянии менее 60 Å и взаимодействуют по механизму Фёрстеровского резонансного переноса энергии (Förster resonance energy transfer, FRET). Изменение структуры нуклеосомы регистрировали по изменению эффективности FRET при изучении одиночных комплексов нуклеосом с РНКП методом флуоресцентной микроскопии. Показано, что введение меток не повлияло на способность РНКП транскрибировать нуклеосомы. Получены и охарактеризованы открытый комплекс с РНКП, а также элонгационные комплексы, остановленные в положениях –39 и –5 до границы нуклеосомы. Показано, что после завершения транскрипции более 80% нуклеосом сохраняют свою структуру, восстанавливая исходную укладку ДНК на гистоновом октамере. Разработанная экспериментальная система открывает новые возможности изучения структуры нуклеосом и модулирующего воздействия на них различных белковых шаперонов и ремоделирующих хроматин комплексов. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-11-28 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/282 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 4 (2015); 41-45 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 4 (2015); 41-45 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/282/280 Luger K., Mäder A.W., Richmond R.K., Sargent D.F., Richmond T.J. Crystal structure of the nucleosome core particle at 2.8 Ǻ resolution // Nature. 1997. Vol. 389. N 6648. P. 251–260. Chang H.W., Kulaeva O.I., Shaytan A.K., Kibanov M., Kuznedelov K., Severinov K.V., Kirpichnikov M.P., Clark D.J., Studitsky V.M. Analysis of the mechanism of nucleosome survival during transcription // Nucleic Acids Res. 2014. Vol. 42. N 3. P. 1619–1627. Chang H.W., Shaytan A.K., Hsieh F.-K., Kulaeva O.I., Kirpichnikov M.P, Studitsky V.M. Structural analysis of the key intermediate formed during transcription through a nucleosome // Trends Cell. Mol. Biol. 2013. Vol. 8. P. 13–23. Walter W., Studitsky V.M. Construction, analysis, and transcription of model nucleosomal templates // Methods. 2004. Vol. 33. N 1. P. 18–24. Gaykalova D.A., Kulaeva O.I., Bondarenko V.A., Studitsky V.M. Preparation and analysis of uniquely positioned mononucleosomes // Methods Mol. Biol. 2009. Vol. 523. P. 109–123. Gaykalova D.A., Kulaeva O.I., Pestov N.A., Hsieh F.K., Studitsky V.M. Experimental analysis of the mechanism of chromatin remodeling by RNA polymerase II // Methods Enzymol. 2012. Vol. 512. P. 293–314. Buning R., van Noort J. Single-pair FRET experiments on nucleosome conformational dynamics // Biochimie. 2010. Vol. 92. N 12. P. 1729–1740. Choy J.S., Lee T.H. Structural dynami cs of nucleosomes at single-molecule resolution // Trends Biochem. Sci. 2012. Vol. 37. N 10. P. 425–435. Walter W., Kireeva M.L., Tchernajenko V., Kashlev M., Studitsky V.M. Assay of the fate of the nucleosome during transcription by RNA polymerase II // Methods Enzymol. 2003. Vol. 371. P. 564–577. Kulaeva O.I., Gaykalova D.A., Pestov N.A., Golovastov V.V., Vassylyev D.G., Artsimovitch I., Studitsky V.M. Mechanism of chromatin remodeling and recovery during passage of RNA polymerase II // Nat. Struct. Mol. Biol. 2009. Vol. 16. N 12. P. 1272–1278. Kireeva M.L., Walter W., Tchernajenko V., Bondarenko V., Kashlev M., Studitsky V.M. Nucleosome remodeling induced by RNA polymerase II: loss of the H2A/H2B dimer during transcription // Mol. Cell. 2002. Vol. 9. N 3. P. 541–552. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/51 2015-05-17T19:06:17Z jour:EN driver

MORPHOLOGY AND ULTRASTRUCTURE OF CHEMOSENSORY SENSILLA OF ANTENNAE IN THE COLORADO POTATO BEETLE, LEPTINOTARSA DECEMLINEATA SAY, LARVAE МОРФОЛОГИЯ И УЛЬТРАСТРУКТУРА ХЕМОРЕЦЕПТОРНЫХ СЕНСИЛЛ АНТЕНН ЛИЧИНОК КОЛОРАДСКОГО ЖУКА LEPTINOTARSA DECEMLINEATA SAY (COLEOPTERA: CHRYSOMELIDAE) H. Farazmand S. Yu. Chaika Х. Фаразманд С. Ю. Чайка ультраструктура larvae chemosensory organs ultrastructure ультраструктура личинки хеморецепторные органы ультраструктура The distribution, external morphology and ultrastructure of various types of sensillae on the antennae of larvae of the Colorado potato beetle, Leptinotarsa decemlineata Say are described based on scanning and transmission electron microscopy. On the antennae are placed sensilla of 4 basic morphological types: trichoid, basiconica, styloconica and conical sensilla. It was shown that sensory organs are equipped with 2—7 receptor cells: the trichoid sensillae innervated 2—4 receptor cells, the sensilla basiconica — 4—7 receptor cells, the styloconic sensillae — 6 receptor cells. Based on the results of ultrastructural organization these sensilla have gustatory function. Antennal cone are equipped 2 receptor cells and have function of olfactory. С помощью сканирующей и трансмиссионной электронной микроскопии изучены распределение, внешняя морфология и ультраструктура сенсилл разных типов на антеннах личинок колорадского жука Leptinotarsa decemlineata Say. На антеннах выявлены 11 сенсилл 4 морфологических типов: трихоидные (5), базиконические (4), стилоконическая (1) и антеннальный конус (1). Установлено, что сенсиллы иннервируются 2—7 рецепторными клетками: трихоидные сенсиллы иннервируются 2—4 рецепторными клетками, базиконические сенсиллы — 4—7 рецепторными клетками, стилоконическая сенсилла — 6 рецепторными клетками. Исходя из особенностей ультраструктурной организации, эти сенсиллы имеют вкусовую функцию. Антеннальный конус иннервируется двумя рецепторными клетками и выполняет обонятельную функцию. Lomonosov Moscow State University, School of Biology 2015-05-17 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/51 10.1234/XXXX-XXXX-2012-2-23-29 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; № 2 (2012); 23-29 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; № 2 (2012); 23-29 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/51/53 . Иванов В.П. Органы чувств насекомых и других членистоногих. М. : Наука, 2000. 279 с. Sen A. Ultrastructure of the sensory complex on the maxillary and labial palpi of the Colorado potato beetle, Leptinotarsa decemlineata // J. Morphol. 1 988 . Vol. 1 95 . N 2. P. 1 59— 1 75 . . Sen A., Mitchell B. K. Ultrastructure of the galeal sensory complex in adults of the Colorado potato beetle, Leptinotarsa decemlineata // Physiol. Entomology. 1 987. Vol. 1 2. P. 8 1 —90. Sen A., Mitchell B. K. Olfaction in the Colorado potato beetle, Leptinotarsa decemlineata: Ultrastructure of antennal sensilla in Leptinotarsa sp. // J. Biosci. 200 1 . Vol. 26 . N 2. P. 233—246. Фаразманд Х. Морфология и ультраструктура хеморецепторных сенсилл максиллярных и лабиальных щупиков у личинок колорадского жука Leptinotarsa decemlineata Say (Coleoptera: Chrysomelidae) // Тез. докл. XII междунар. конф. студентов, аспирантов и молодых ученых “ Ломоносов-2005 ” . 2005. С. 228—229. Mitchell B. K., Schoonhoven L.M. Taste receptors in Colorado beetle larvae // J. Insect Physiol. 1 974. Vol. 20. N 9. P. 1 787— 1 789. Алексеев М.А., Синицина Е.Е., Чайка С.Ю. Сенсорные органы антенн и ротовых придатков личинок жуков (Coleoptera) // Энтомол. обозр. 2006. Т. 85 . Вып. 3 . С. 508—5 1 8 . Синицина Е.Е., Чайка С.Ю. Атлас электронно-микроскопической морфологии хеморецепторных органов насекомых. М.: МГУ , 2006 . 344 с. Синицина Е.Е., Чайка С.Ю. Рецепторные органы личинок жужелиц (Carabidae, Coleoptera) // Энтомол. обозр. 2003 . Т. 82. № 2. С. 276—288 . Томкович К.П., Чайка С.Ю. Сенсорные органы личинок долгоносикообразных жуков (Coleoptera, Curculionidae) в связи с проблемой классификации надсемейства // Энтомол. обозр. 200 1 . Т. 80. Вып. 2. С. 294—307. . Чайка С.Ю., Томкович К.П. Сенсорные органы личинок жуков-долгоносиков (Coleoptera, Curculionidae) // Энтомол. обозр. 1 997. Т. 76. Вып. 3 . С. 508—520. Zacharuk R. Y., Albert P.J., Bellamy F. W. Ultrastructure and function of digitiform sensilla on the labial palp of a larval elaterid (Coleoptera) // Can. J. Zool. 1 977. Vol. 55 .P. 569—578 . . Scott D.A., Zacharuk R. Y. Fine structure of the antennal sensory appendix in the larva of Ctenicera destructor (Brown) (Elateridae: Coleoptera) // Can. J. Zool. 1 97 1 . Vol. 49. N 2. P. 1 99—2 1 0. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте).

oai:oai.vestnik-bio-msu.elpub.ru:article/1539 2025-11-13T06:28:52Z jour:%D0%9E%D0%98 driver

Cryo-electron microscopy demonstrates polymorphism of small extracellular vesicles Криоэлектронная микроскопия демонстрирует полиморфизм малых внеклеточных везикул T. S. Trifonova A. V. Moiseenko G. O. Skryabin O. T. Imaraliev E. M. Tchevkina I. A. Karasev A. Yu. Efimenko S. I. Trifonov D. V. Bagrov O. S. Sokolova Т. С. Трифонова А. В. Моисеенко Г. О. Скрябин О. Т. Имаралиев Е. М. Чевкина И. А. Карасев А. Ю. Ефименко С. И. Трифонов Д. В. Багров О. С. Соколова рак желудка cryo-electron microscopy image processing gastric cancer рак желудка криоэлектронная микроскопия обработка изображений рак желудка In this study the computer program Veronica was created – a specialized environment for marking images obtained by cryo-electron microscopy. It allows to highlight the contours of closed and unclosed objects and save them in a convenient format for analysis, as well as to determine the specified metrics for the study of morphology. The Veronica program was used to characterize the morphology of samples of small extracellular vesicles isolated from gastric juice of patients with gastric adenocarcinoma and conditionally healthy donors. An approach to image partitioning and calculation of indices to describe vesicles based on the measurement of nesting (a measure of the number of particles nested within each other) and branching (a measure of the number of adjacent particles surrounded by a common membrane) parameters has been proposed. В рамках данного исследования была создана компьютерная программа Veronica – специализированная среда для разметки изображений, полученных методом криоэлектронной микроскопии. Она позволяет выделять контуры замкнутых и незамкнутых объектов и сохранять их в удобном для анализа формате, а также определять заданные метрики для исследования морфологии. С помощью программы Veronica была охарактеризована морфология образцов малых внеклеточных везикул, выделенных из желудочного сока пациентов с аденокарциномой желудка, а также условно здоровых доноров. Предложен подход к разметке изображений и расчета показателей для описания везикул, основанный на измерении параметров вложенности (меры количества частиц, вложенных друг в друга) и ветвистости (меры количества расположенных рядом частиц, окруженных общей мембраной). Lomonosov Moscow State University, School of Biology This work was financially supported by the MSU Scientific and Educational School “Molecular Technologies of Living Systems and Synthetic Biology” (project No. 24-Sh04-14). Работа выполнена при финансовой поддержке Научно-образовательной Школы МГУ «Молекулярные технологии живых систем и синтетическая биология» (проект № 24-Ш04-14). Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов. От пациентов было получено письменное информированное согласие на исследование. Исследование проводилось в соответствии с рекомендациями Хельсинской декларации и одобрено Комитетом по этике Национального медицинского исследовательского центра онкологии имени Н.Н. Блохина (Разрешение комитета по этике, протокол №1 от 25 января 2024 г.). Изображения мВВ получали с использованием Уникального комплекса оборудования «Трехмерная электронная микроскопия и спектроскопия» биологического факультета МГУ. О.С. Соколова руководит группой по разработке инновационных лекарственных препаратов на основе структурной биологии и биоинформатики в Шэньчжэньском университете МГУ-ППИ, Китай (2022KCXTD034). 2025-11-10 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion application/pdf https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1539 10.55959/MSU0137-0952-16-80-3S-6 Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya; Том 80, № 3S (2025); 38–45 Вестник Московского университета. Серия 16. Биология; Том 80, № 3S (2025); 38–45 0137-0952 rus https://vestnik-bio-msu.elpub.ru/jour/article/view/1539/731 Brent A., Shirmast P., McMillan N.A.J. Extracellular vesicle lipids and their role in delivery. J. Extracell. Biol. 2025;4(6):e70064. Lamorte D., De Luca L., Tartarone A., Trino S., Giulivo I., De Stradis A., Maietti M., Caivano A., Laurenzana I. Serum extracellular vesicle microRNAs as potential biomarkers to predict pembrolizumab response and prognosis in metastatic non-small cell lung cancer patients. Front. Immunol. 2025;16:1540906. Pan R., Chen D., Hou L., Hu R., Jiao Z. Small extracellular vesicles: a novel drug delivery system for neurodegenerative disorders. Front. Aging Neurosci. 2023;15:1184435. Моисеенко А.В., Басалова Н.А., Багров Д.В., Трифонова Т.С., Виговский М.А., Дьячкова У.Д., Дьячкова У.Д., Григорьева О.А., Новоселецкая Е.С., Ефименко А.Ю., Соколова О.С. Прямая визуализация внеклеточных везикул на мембране мезенхимных стволовых/стромальных клеток человека методом криоэлектронной микроскопии. Наноиндустрия. 2024;17(7–8):434–443. Emelyanov A., Shtam T., Kamyshinsky R., Garaeva L., Verlov N., Miliukhina I., Kudrevatykh A., Gavrilov G., Zabrodskaya Y., Pchelina S., Konevega A. Cryo-electron microscopy of extracellular vesicles from cerebrospinal fluid. PLoS One. 2020;15(1):e0227949. Miroshnikova V.V., Dracheva K.V., Kamyshinsky R.A., Yastremsky E.V., Garaeva L.A., Pobozheva I.A., Landa S.B., Anisimova K.A., Balandov S.G., Hamid Z.M., Vasilevsky D.I., Pchelina S.N., Konevega A.L., Shtam T.A. Cryo-electron microscopy of adipose tissue extracellular vesicles in obesity and type 2 diabetes mellitus. PLoS One. 2023;18(2):e0279652. Kapoor K.S., Kong S., Sugimoto H., Guo W., Boominathan V., Chen Y.L., Biswal S.L., Terlier T., McAndrews K.M., Kalluri R. Single extracellular vesicle imaging and computational analysis identifies inherent architectural heterogeneity. ACS Nano. 2024;18(18):11717–11731. Wagner T., Merino F., Stabrin M., et al. SPHIREcrYOLO is a fast and accurate fully automated particle picker for cryo-EM. Commun. Biol. 2019;2:218. Punjani A., Rubinstein J.L., Fleet D.J., Brubaker M.A. cryoSPARC: algorithms for rapid unsupervised cryo-EM structure determination. Nat. Methods. 2017;14(3):290–296. Schönnenbeck P., Junglas B., Sachse C. CryoVIA: An image analysis toolkit for the quantification of membrane structures from cryo-EM micrographs. Structure. 2025;33(4): 808–819. Skryabin G.O., Vinokurova S.V., Galetsky S.A., Elkin D.S., Senkovenko A.M., Denisova D.A., Komelkov A.V., Stilidi I.S., Peregorodiev I.N., Malikhova O.A., Imaraliev O.T., Enikeev A.D., Tchevkina E.M. Isolation and characterization of extracellular vesicles from gastric juice. Cancers. 2022;14(14):3314. Mastronarde D.N. Automated electron microscope tomography using robust prediction of specimen movements. J. Struct. Biol. 2005;152(1):36–51. 14. Kruskal W.H., Wallis W.A. Use of ranks in one-criterion variance analysis. J. Am. Stat. Assoc. 47(260):583–621. Schindelin J., Arganda-Carreras I., Frise E., Kaynig V., Longair M., Pietzsch T., Preibisch S., Rueden C., Saalfeld S., Schmid B., Tinevez J.Y. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nat. Methods. 2012;9(7):676–682. Skryabin G., Enikeev A., Beliaeva A., Galetsky S., Bagrov D., Moiseenko A., Vnukova A., Imaraliev O., Karasev I., Tchevkina E. Distinctive features of extracellular vesicles present in the gastric juice of patients with gastric cancer and healthy subjects. Int. J. Mol. Sci. 2025;26(12):5857. Saadeldin I.M., Seif E., Jongki C. Relevance of multilamellar and multicompartmental vesicles in biological fluids: understanding the significance of proportional variations and disease correlation. Biomarker Res. 2023;11(1):77. Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например, в институтском хранилище или на персональном сайте). 7de900c7ecbe5b3250d0ba29f394628f