Журнал "Вестник Московского университета" был учреждён в ноябре 1946 г. Московским государственным университетом имени М.В. Ломоносова. Начиная с 1949 г. "Вестник" стал подразделяться на серии, которые формировали самостоятельные издания.

1946 г. – Вестник Московского университета

1949 г. – Вестник Московского университета. Серия физико-математических и естественных наук

1955 г. – Вестник Московского университета. Серия биологии, почвоведения, геологии, географии

1959 г. – Вестник Московского университета. Серия 6: Биология, почвоведение

В 1977 г.  появился наш журнал – "Вестник Московского университета. Серия 16. Биология".

В 1974 г. возникла англоязычная версия журнала  – "Moscow University Biological Sciences Bulletin", публикуемая американским издательством "Allerton Press, Inc.", на сегодняшний день она издаётся "Pleiades Publishing Group" . С 2007 г. "Moscow University Biological Sciences Bulletin" распространяется всемирно известной компанией "Springer Science + Business Media", с 2011 г. – входит в международную базу данных Scopus.

В 2015 г. "Вестник Московского университета. Серия 16. Биология" вошёл в базу Russian Sciences Citation Index на платформе Web of Science.