MULTILOCUS SEQUENCE TYPING IS IMPORTANT APPROACH OF MOLECULAR ECOLOGY
https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2010-4-7-10
Abstract
Application of multilocus sequence typing for investigation of Legionella pneumophyla strains isolated in Russia allowed us to obtain data for molecular-ecological analysis of the situation. Strains from subterranean waters demonstrated similar allelic profiles in different distant regions of country. The mutation process had similar direction in conditions of cooling towers and water stagnations in autonomous water supply system. Recombinations predominated during clonal complexes forming. On the bases of comparision of allelic profiles with EWGLI data base epidemiological appreciation of investigated strains was given.
About the Authors
O. L. Voronina
НИИЭМ им. Н.Ф. Гамалеи РАМН
Russian Federation
Russian Federation
M. S. Kunda
НИИЭМ им. Н.Ф. Гамалеи РАМН
Russian Federation
Russian Federation
V. G. Lunin
НИИЭМ им. Н.Ф. Гамалеи РАМН
Russian Federation
Russian Federation
A. L. Gintsburg
НИИЭМ им. Н.Ф. Гамалеи РАМН
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Maiden M.C.J., Bygraves J.A., Feil E, Morelli G., Russell J.E., Urwin R., Zhang Q., Zhou J., Zurth K., Cau- gant D.A., Feavers I.M., Achtman M., Spratt B.G. Multilocus sequence typing: a portable approach to the identificati¬on of clones within populations of pathogenic microorganisms // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. Vol. 95. N 6. P. 3140—3145.
2. Официальный сайт Европейской рабочей группы по легионеллезу (URL: http://www.ewgli.org 13.04.2010).
3. Ratzow S, Gaia V., Helbig J.H., Fry N. Luck P.C. Addition of neuA, the gene encoding N-acylneuraminate cyti- dylyl transferase, increases the discriminatory ability of the consensus sequence-based scheme for typing Legionella pneumophila serogroup 1 strains //J. Clin. Microbiol. 2007. Vol. 45. N 6. P. 1965—1968.
4. Яцишина С.Б., Астахова Т.С., Романенко В.В. и др. Применение молекулярно-генетических методов при рас¬следовании вспышки болезни легионеров в г. Верхняя Пышма // ЖМЭИ. 2008. № 2. C. 23—29.
5. Воронина О.Л., Лунин В.Г. Молекулярно-генетическое типирование Legionella pneumophila серогруппы 1, выделенных в г. Верхняя Пышма, с использованием международных стандартов // ЖМЭИ. 2008. № 2. С. 20—23.
6. Ratcliff R.M., Lanser J.A., Manning P.A., Heuzenroe- der M.W. Sequence-Based Classification Scheme for the Ge¬nus Legionella Targeting the mip Gene //J. Clin. Microbiol. 1998. Vol. 36. N 6. P. 1560—1567
7. Воронина О.Л., Кунда М.С., Лунин В.Г., Карпо¬ва Т.И., Тартаковский И.С. Молекулярно-генетическое типирование штаммов Legionella pneumophila и Legionella species, выделенных на территории Российской Федерации // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2008. Т. 10. № 2. С. 154—162.
8. Основной сайт PubMLST факультета зоологии Оксфордского университета Великобритании (URL: http:// pubmlst.org 15.04.2010).
9. Guttman D.S., Dykhuiszen D.E. Clonal divergence in Escherichia coli as a result of recombination not mutation // Science. 1994. Vol. 266. P. 1380—1383.
10. Diancourt L., Passet V., Chervaux Ch., Garault P., Smokvina T., Brisse S. Multilocus sequence typing of Lac¬tobacillus casei reveals a clonal population structure with low levels of homologous recombination // Appl. Envirom. Microbiol. 2007. Vol. 73. N 20. P. 6601—6611.
Review
For citations:
Voronina O.L., Kunda M.S., Lunin V.G., Gintsburg A.L. MULTILOCUS SEQUENCE TYPING IS IMPORTANT APPROACH OF MOLECULAR ECOLOGY. Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya. 2010;(4):7-10. (In Russ.) https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2010-4-7-10
Views:
487
Email this article 