VARIABILITY OF MICROSATELLITE LOCI IN POPULATIONS OF PACIFIC COD (GADUS MACROCEPHALUS TILESIUS) (GADIDAE)
https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2010-2-35-39
Abstract
Despite the almost secular period of Pacific cod investigation, the monitoring of condition of its stocks, many biological features and especially population structure remain poorly understood. The variability of DNA microsattelite loci Gmo3, Gmo34, Gmo35, and Pgmo32 in Pacific cod samples from different areas of the North Pacific was analyzed. The data obtained show that Pacific cod from the southern Kuril Islands significantly differs (the highest differentiation was inherent in microsattelite loci Gmo3 and Pgmo32) from populations of the Bering Sea, Sea of Okhotsk and coastal waters of Canada. By this, Pacific cod of the three latter populations demonstrates high degree of similarity (I = 0,981—0,993) in spite of considerable geographic remoteness of these areas one from another.
About the Authors
A. N. StroganovRussian Federation
M. E. Buryakova
Russian Federation
A. M. Orlov
Russian Federation
K. I. Afanas’ev
Russian Federation
References
1. Никольский Г.В. Частная ихтиология. М.: Высшая школа, 1971. 472 с.
2. Моисеев П.А. Треска и камбалы дальневосточных морей // Изв. ТИНРО. 1953. Т. 40. C. 21—118.
3. 3. Винников А.В., Давыденко В.А. К вопросу о популяционной структуре тихоокеанской трески Gadus macrocephalus Tilesius (Gadidae) прикамчатских и сопредельных вод по результатам отолитометрии // Исследования биологии и динамики численности промысловых рыб камчатского шельфа. Вып. 4. Петропавловск-Камчатский: КамчатНИРО, 1998. С. 33—38.
4. Endo H. Phylogeny of the order Gadiformes (Teleostei, Paracanthopterygii) // Mem. Grad. Sch. Fish. Sci. Hokkaido Univ. 2002. Vol. 49. P. 1—81.
5. Евсеенко С.А., Лорель Б., Браун Д.А., Маликова Д.Ю. К таксономии рода Gadus: онтогенетические свидетельства // Вопр. ихтиологии. 2006. Т. 46. C. 326—333.
6. Шунтов В.П. Биология дальневосточных морей России. Т. 1. Владивосток: ТИНРО-центр, 2001. 580 с.
7. Ishii K., Yabu H. Chromosomes in three species of Gadidae (Pisces) // Bull. Jap. Soc. Sci. Fish. 1985. Vol. 5. P. 25—28.
8. Renaud C.D., Speers L.I., Quadri S.U., McAllister D.E. Biochemical evidence of speciation in the cod genus Gadus // Can. J. Zool. 1986. Vol. 64. P. 1563—1566.
9. Grant W.Z., Zhang C.I., KobayashiT., Stahl G. Lack of genetic stock discretion in Pacific cod (Gadus macrocephalus) // Can. J. Fish. Aquat. Sci. 1987. Vol. 44. P. 490—498.
10. Carr S.M., Kivlichan D.S., Pepin P., Crutcher D.C. Molecular systematics of gadid fishes: implications for the biogeographic origins of Pacific species // Can. J. Zool. 1999. Vol. 77. P. 19—26.
11. O’Reilly P.T., Canino M.F., Bailey K.M., Bentzen P. Isolation of twenty low stutter di- and tetranucleotide microsatellites for population analyses of walleye pollock and other gadoids // J. Fish Biol. 2000. Vol. 56. P. 1074—1086.
12. Canino M.F., Spies I.B., Hauser L. Development and characterization of novel di- and tetranucleotide microsatellite markers in Pacific cod (Gadus macrocephalus)// Mol. Ecol. Notes. 2005. Vol. 5. P. 908—910.
13. Шунтов В.П. Биологические ресурсы дальневосточных морей: перспективы изучения и освоения // Биология моря. 1988. Т. 3. C. 3—14.
14. Miller K.M., Le K.D., Beacham T.D. Development of tri- and tetranucleotide repeat microsatellite loci in Atlantic cod (Gadus morhua) // Mol. Ecol. Notes. 2000. Vol. 9. P. 238—239.
15. Jakobsdottir K.B., Jorundsdottir D.D., Skirnisdottir S., Hjorleifsdottir S., Hreggvidsson G.O., Danielsdottir A.K., Papoulie Ch. Nine new polymorphic microsatellite loci for the amplification of archived otolith DNA of Atlantic cod, Gadus morhua L. // Mol. Ecol. Notes. 2006. Vol. 6. P. 337—339.
16. Строганов А.Н., Орлов А.М., Афанасьев К.И., Бурякова М.Е., Рубцова Г.А. Предварительные данные по изменчивости трех микросателлитных локусов у тихоокеанской Gadus macrocephalus и атлантической G. morhua трески (Gadidae) // Вопр. ихтиологии. 2009. Т. 49. C. 191—199.
17. Маниатис Т., Фрич Э., Cэмбрук Дж. Молекулярное клонирование. М., 1984.
18. Nei M. Genetic distance between populations // Amer. Naturalist. 1972. Vol. 106. P. 283—292.
19. Weir B.S. Genetic Data Analysis II. Methods for Discrete Population Genetic Data. Massachusets: Sinauer Ass. Sunderland, 1996. 445 p.
20. Клиге Р.К., Данилов И.Д., Конищев В.Н. История гидросферы. М.: Научный мир, 1998. 368 с.
21. Варнавская Н.В. Генетическая дифференциация популяций тихоокеанских лососей // Петропавловск-Камчатский: КамчатНИРО, 2006. 488 c.
22. Степаненко М.А. Распределение, поведение и численность тихоокеанской трески в Беринговом море // Вопр. ихтиологии. 1995. Т. 35. C. 53—59.
23. Степаненко М.А. Межгодовая изменчивость пространственной дифференциации минтая Theragra chalcogramma и трески Gadus macrocephalus Tilesius (Gadidae) Берингова моря // Вопр. ихтиологии. 1997. Т. 37. C. 19—26.
24. Богданов Г.А. Тихоокеанская треска. Вопросы биологии и запасы. М., 2006.
Review
For citations:
Stroganov A.N., Buryakova M.E., Orlov A.M., Afanas’ev K.I. VARIABILITY OF MICROSATELLITE LOCI IN POPULATIONS OF PACIFIC COD (GADUS MACROCEPHALUS TILESIUS) (GADIDAE). Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya. 2010;(2):35-39. (In Russ.) https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2010-2-35-39