Preview

Вестник Московского университета. Серия 16. Биология

Расширенный поиск

ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОТНОШЕНИЯ У ВИДОВ FAGOPYRUM, ОСНОВАННЫЕ НА ДАННЫХ АНАЛИЗА b/c ИНТРОНА ГЕНА NAD1

Полный текст:

Аннотация

Впервые был охарактеризован b/c интрон гена nadl 13 видов Fagopyrum и показана возможность использования интрона гена nadl для идентификации видов гречихи. Размеры b/c интрона гена nadl варьировали от 1217 п.н. (F. tataricum, F. cymosum) до 1239 п.н. (F. capil- latum). Были определены видоспецифичные SNPs и индели. Полученная филогения рода совпала с основанной на морфологических признаках. NJ и MP дендрограммы выявили четкое разделение анализируемых видов на две основные группы: cymosum и urophyllum. Группа видов urophyllum характеризовалась присутствием нескольких синапоморфных замен и инделей, включая 11-нуклеотидную вставку, фланкированную прямыми повторами.

 

Об авторах

Г. Д. Кадырова
Центр "Биоинженерия" РАН, г.Москва; Татарский научно-исследовательский институт сельского хозяйства, г. Казань
Россия

науч. сотр., ГНУ Татарский научно-исследовательский институт сельского хозяйства, 420059, Казань, Оренбургский тракт, 48

 



Н. Н. Рыжова
Центр "Биоинженерия" РАН, г.Москва
Россия

науч. сотр. Центра "Биоинженерия" РАН, 117312, Москва, ул. 60-летия Октября, д. 7, корп. 1

 



Е. З. Кочиева
Центр "Биоинженерия" РАН, г.Москва
Россия

вед. науч. сотр. Центра "Биоинженерия" РАН, 117312, Москва, ул. 60-летия Октября, д. 7, корп. 1



Список литературы

1. Yamane K., Yasui Y, Ohnishi O. Intraspecific cpDNA gopyrum cymosum (Polygonaceae) // Am. J. Bot. 2003. Vol. 90. variation of diploid and tetraploid perennial buckwheat, Fa- P. 339—346.

2. Campbell C.G. Buckwheat. Fagopyrum esculentum Moench // International Plant Genetic Resources Institute. Rome, Italy, 1997. 95 p.

3. Ohsako T., Yamane K., Ohnishi O. Two new Fagopyrum (Polygonaceae) species F.gracilipedoides and F.jinshaense from Yunnan, China // Genes and Genet. Syst. 2002. N 77. P. 399—408.

4. Yasui Y., Ohnishi O. Interspecific relationships in Fagopyrum (Polygonaceae) revealed by the nucleotide sequen¬ces of the rbcL and accD genes and their intergenic region // Am. J. Bot. 1998a. Vol. 85. P. 1134—1142.

5. Cameron K.M. On the value of nuclear and mitochon- drial gene sequences for reconstructing the phylogeny of vanilloid orchids (Vanilloideae, Orchidaceae) // Ann. Bot. 2009. Vol. 104(3). P. 377—385.

6. Edwards K., Johnstone C., Thompson C. A simple and rapid method for the preparation of plant genomic DNA for PCR analysis // Nucl. Acids Res. 1991. Vol. 19(6). Ð. 1349.

7. Demesure B., Sodzi N., Petit R.J. A set of universal primers for amplication of polymorphic non-coding regions of mitochondrial and chloroplast DNA in plants // Molec. Ecol. 1995. Vol.4. P. 129—131.

8. Sharma T.R., Jana S. Species relationships in Fago- pyrum revealed by PCR-based DNA fingerprinting // Theor. Appl. Genet. 2002. Vol. 105. P. 306—312.


Для цитирования:


Кадырова Г.Д., Рыжова Н.Н., Кочиева Е.З. ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОТНОШЕНИЯ У ВИДОВ FAGOPYRUM, ОСНОВАННЫЕ НА ДАННЫХ АНАЛИЗА b/c ИНТРОНА ГЕНА NAD1. Вестник Московского университета. Серия 16. Биология. 2010;(4):36-38.

For citation:


Kadyrova G.D., Ryzhova N.N., Kochieva E.Z. PHYLOGENETIC RELATIONSHIPS IN FAGOPYRUM SPECIES BASED ON NUCLEOTIDE POLYMORPHISM OF b/c INTRON OF NAD1 GENE. Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya. 2010;(4):36-38. (In Russ.)

Просмотров: 38


ISSN 0137-0952 (Print)