ESTIMATION OF THE RATE OF MOLECULAR CLOCK IN LINEAGES OF THE DROSOPHILA VIRILIS SPECIES GROUP
Abstract
Phylogeny of the DroSophila viriliS species group is studied on the base of five nuclear and mi- tochondrial genes: Adh, NonA, Fu, RaSl и 16S-12S rRNA. Mathematical simulation to estimate uneven accumulation of replacements in lineages of closely related species using arbitrary number of sequences was suggested. It accounts for multiple, parallel and reverse mutations. Periods of evolution with irregular rates in the viriliS species group were reconstructed. Phylogeny tree for the group given on the base of neutral variability was constructed.
About the Authors
A. M. Kulikov
Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН
Russian Federation
Russian Federation
O. E. Lazebny
Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН
Russian Federation
Russian Federation
E. Yu. Rybakova
Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Куликов А.М., Лазебный О.Е., Горностаев Н.Г., Чекунова А.И. Митрофанов В.Г. Неравномерность скорости эволюции у дрозофил группы viriliS. I. Применение филогенетически опосредованных тестов Такезаки // Изв. РАН. Сер. биол. 2010. Т. 37. № 1. С. 25—33.
2. Куликов А.М., Лазебный О.Е., Горностаев Н.Г., Чекунова А.И. Митрофанов В.Г. Неравномерность скорости эволюции у дрозофил группы viriliS. II. Применение метода тестирования Таджимы // Изв. РАН. Сер. биол. 2010. Т. 37. № 1. С. 206—209
3. GaSperini R., GibSon G.J. Absence of protein polymorphism in the RaS genes of DroSophila melanogaSter // Mol. Evol. 1999. Vol. 49. N 5. P. 583—590.
4. Сорокина С.Ю., Мюге Н.С., Андрианов Б.В., Митрофанов В.Г.Изменчивость 3'-концевого фрагмента гена 16S рРНК в группе бизкородственных видов дрозофил viriliS // Генетика. 2005. Т. 41. № 8. С. 1049—1054.
5. Чекунова А.И., Куликов А.М., Михайловский С.С., Лазебный О.Е. Лазебная И.В., Митрофанов В.Г Родственные отношения дрозофил группы viriliS, рекомендованные на основе последовательностей гена DraSl // Генетика. 2008. Т. 44. № 3. С. 336—345.
6. Cutler D.J. Understanding the overdispersed molecular clock // Genetics. 2000. Vol. 154. P. 1403—1417.
7. GilleSpie J.H. Lineage effects and the index of dispersion of molecular evolution // Mol. Biol. Evol. 1989. Vol. 6. N 5. P. 636—647.
8. Bulmer M. Estimating the variability of substitution rates // Genetics 1989. Vol. 123. P. 615—619.
Review
For citations:
Kulikov A.M., Lazebny O.E., Rybakova E.Yu. ESTIMATION OF THE RATE OF MOLECULAR CLOCK IN LINEAGES OF THE DROSOPHILA VIRILIS SPECIES GROUP. Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya. 2010;(4):100-103. (In Russ.)
Views:
322
Email this article 