СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ЭКСПРЕССИИ ГЕНА SERPINA1 В КЛЕТОЧНЫХ ЛИНИЯХ ОПУХОЛЕВОГО ПРОИСХОЖДЕНИЯ
Аннотация
Изучали экспрессию гена SERPINA1 в клетках опухолей предстательной железы человека (линии DU145, PC-3, LNCaP) и опухоли печени человека (HepG2). Определяли уровень альфа1-антитрипсина (ААТ) в экстрактах целых клеток, секретомах, субклеточных фракциях и уровень мРНК SERPINA1 в суммарных РНК из клеток указанных линий. Установлено несоответствие уровня мРНК уровню белка в линиях PC-3 и LNCaP. В ядрах клеток некоторых линий обнаружена новая изоформа ААТ массой 37 кДа, вероятно, укороченная с N-конца (в сравнении с полноразмерным ААТ). Предложен механизм внутриклеточного удерживания изоформы 37 кДа. В 3-нетранслируемой области и в транскриптах гена SERPINA1 идентифицировано 2 сайта полиаденилирования. Обсуждается влияние 3-нетранслируемой области гена SERPINA1 на трансляционную регуляцию экспрессии ААТ.
Ключевые слова
альфа1-антитрипсин,
транскрипты SERPINA1,
3ґ-нетранслируемая область,
альтернативное полиаденилирование,
микроРНК
При поддержке: Российский научный фонд
Об авторах
Айтсана Алексеевна Маслакова
биологический факультет МГУ
Россия
мл. науч. сотр. лаборатории эндокринологии кафедры физиологии человека и животных
Россия
мл. науч. сотр. лаборатории эндокринологии кафедры физиологии человека и животных
Мирослав Васильевич Телков
ФНИЦ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи
Россия
канд. биол. наук, ст. науч. сотр.
Россия
канд. биол. наук, ст. науч. сотр.
Игорь Вячеславович Орловский
НИИ Физико-химической биологии имени А.Н. Белозерского МГУ
Россия
канд. биол. наук, науч. сотр. отдела молекулярных основ онтогенеза
Россия
канд. биол. наук, науч. сотр. отдела молекулярных основ онтогенеза
Ольга Сергеевна Соколова
биологический факультет МГУ
Россия
докт. биол. наук, доц. кафедры биоинженерии
Россия
докт. биол. наук, доц. кафедры биоинженерии
Список литературы
1. Rowe R.G., Weiss S.J. Navigating ECM barriers at the invasive front: the cancer cell-stroma interface // Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 2009. Vol. 25. P. 567—595.
2. Friedl P., Wolf K. Tube travel: The role of proteases in individual and collective a cancer cell invasion // Cancer Res. 2008. Vol. 68. N 18. P. 7247—7249.
3. Wolf K., Wu Y.I., Liu Y., Geiger J., Tam E., Overall C., Stack M.S., Friedl P. Multi-step pericellular proteolysis controls the transition from individual to collective cancer cell invasion // Nat. Cell Biol. 2007. Vol. 9. N 8. P. 893—904.
4. Perlmutter D.H., Cole F.S., Kilbridge P., Rossing T.H., Colten H.R. Expression of the alpha 1-proteinase inhibitor gene in human monocytes and macrophages // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1985. Vol. 82. N 3. P. 795—799.
5. Wozniak A., Mila-Kierzenkowska C., Schachtschabel D.O., Wozniak B., Rozwodowska M., Drewa T., Drewa S., Sir J., Sir I., Maciak R., Krzyzynska-Malinowska E. Activity of cathepsin D and alpha(1)-antitrypsin in the blood serum of patients with mammary carcinoma // Exp. Oncol. 2005. Vol. 27. N 3. P. 233—237.
6. Докрунова А.А., Уласова Н.Ю., Крамина Т.Е., Альбицкий И.А., Хасигов П.З., Соколова О.С. Полиморфизм альфа1-антитрипсина при раке и гиперплазии предстательной железы // Молекулярная медицина. 2010. № 6. C. 43—49.
7. Kataoka H., Seguchi K., Inoue T., Koono M. Properties of alpha 1-antitrypsin secreted by human adenocarcinoma cell lines // FEBS Lett. 1993. Vol. 328. N 3. P. 291—295.
8. Lejeune P.J., Mallet B., Farnarier C., Kaplanski S. Changes in serum level and affinity for concanavalin A of human alpha 1-proteinase inhibitor in severe burn patients: relationship to natural killer cell activity // Biochim. Biophys. Acta. 1989. Vol. 990. N 2. P. 122—127.
9. Fukushima M., Fukuda Y., Kawamoto M., Yamanaka N. Elastosis in lung carcinoma: immunohistochemical, ultrastructural and clinical studies // Pathol. Int. 2000. Vol. 50. N 8. P. 626—635.
10. Докрунова А.А., Соколова О.С. Cодержание 1-антитрипсина в сыворотке при заболеваниях предстательной железы // Урология. 2012. № 5. С. 77—80.
11. Kent W.J., Sugnet C.W., Furey T.S., Roskin K.M., Pringle T.H., Zahler A.M., Haussler D. The human genome browser at UCSC // Genome Res. 2002. Vol. 12. N 6. P. 996—1006.
12. Pfaffle M.W. A new mathematical model for relative quantification in real-time RT—PCR // Nucleic Acids Res. 2001. Vol. 29. N 9. P. e45.
13. Rosner M., Schipany K., Hengstschlager M. Merging high-quality biochemical fractionation with a refined flow cytometry approach to monitor nucleocytoplasmic protein expression throughout the unperturbed mammalian cell cycle // Nat. Protoc. 2013. Vol. 8. N 3. P. 602—626.
14. Feng L., Arvan P. The trafficking of alpha 1-antitrypsin, a post-Golgi secretory pathway marker, in INS-1 pancreatic beta cells // J. Biol. Chem. 2003. Vol. 278. N 34. P. 31486—31494.
15. Owen M.C., Brennan S.O., Lewis J.H., Carrell R.W. Mutation of antitrypsin to antithrombin: alpha 1-antitrypsin Pittsburgh (358 Met leads to Arg), a fatal bleeding disorder // New Engl. J. Med. 1983. Vol. 309. N 12. P. 694—698.
16. Samandari T., Brown J.L. A study of the effects of altering the sites for N-glycosylation in alpha-1-proteinase inhibitor variants M and S // Protein Sci. 1993. Vol. 2. N 9. P. 1400—1410.
17. Mayr C., Bartel D.P. Widespread shortening of 3 UTRs by alternative cleavage and polyadenylation activates oncogenes in cancer cells // Cell. 2009. Vol. 138. N 4. P. 673—684.
18. Saito S., Hosoda N., Hoshino S. The Hbs1-Dom34 protein complex functions in non-stop mRNA decay in mammalian cells // J. Biol. Chem. 2013. Vol. 288. N 24. P. 17832—17843.
19. Hassan T., Smith S.G., Gaughan K., Oglesby I.K., O’Neill S., McElvaney N.G., Greene C.M. Isolation and identification of cell-specific microRNAs targeting a messenger RNA using a biotinylated anti-sense oligonucleotide capture affinity technique // Nucleic Acids Res. 2013. Vol. 41. N 6. P. e71.
20. Sandberg R., Neilson J.R., Sarma A., Sharp P.A., Burge C.B. Proliferating cells express mRNAs with shortened 3 untranslated regions and fewer microRNA target sites // Science. 2008. Vol. 320. N 5883. P. 1643—1647.
21. Ji Z., Lee J.Y., Pan Z., Jiang B., Tian B. Progressive lengthening of 3’ untranslated regions of mRNAs by alternative polyadenylation during mouse embryonic development // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2009. Vol. 106. N 17. P. 7028—7033.
Рецензия
Для цитирования:
Маслакова А.А., Телков М.В., Орловский И.В., Соколова О.С. СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ЭКСПРЕССИИ ГЕНА SERPINA1 В КЛЕТОЧНЫХ ЛИНИЯХ ОПУХОЛЕВОГО ПРОИСХОЖДЕНИЯ. Вестник Московского университета. Серия 16. Биология. 2015;(3):26-31.
For citation:
Maslakova A.A., Telkov M.V., Orlovsky I.V., Sokolova O.S. COMPARATIVE ANALYSIS OF SERPINA1 GENE EXPRESSION IN TUMOR CELL LINES. Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya. 2015;(3):26-31. (In Russ.)
Просмотров:
420
Послать статью по эл. почте 