АНАЛИЗ ИНСЕРЦИЙ PDR1 РЕТРОТРАНСПОЗОНА У ГОРОХА ПОСЕВНОГО (PISUM SATIVUM L.)
https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2012-2-9-12
Аннотация
Проведено исследование полиморфизма PDR1 инсерций в сортах, линиях и мутантах гороха с помощью семи пар специфических RBIP-праймеров. Идентифицировано семь локусов PDR1 инсерций в исследованных формах. Установлен высокий уровень полиморфизма вставок ретротранспозона PDR1 с праймерами RBIP2, RBIP1794, RBIP64, который составил 92, 82,98, 78% соответственно. Проведен генетический анализ в популяциях гибридов F2 (Chi115 Ѕ WL1238). На генетической карте гороха в III группе сцепления локализован молекулярный маркер RBIP4700.
Ключевые слова
Об авторах
З. Г. КокаеваРоссия
канд. биол. наук, ст. науч. сотр. кафедры генетики биологического факультета МГУ. Тел. 8-495-939-11-79
А. В. Алешин
Россия
аспирант 2-го года обучения кафедры генетики биологического факультета МГУ. Тел. 8-495-939-11-79
Ю. И. Березов
Россия
канд. с.-х. наук, вед. инженер кафедры физиологии растений биологического факультета МГУ. Тел. 8-495-939-14-06
Список литературы
1. Flavell A.J., Knox M.R., Pearce S.R. Retrotransposonbased insertion polymorphisms (RBIP) for high throughput marker analysis // Plant J. 1998. Vol. 16. P. 643—650.
2. Schulman A.H. Molecular markers to assess genetic diversity // Euphytica on-line. 2006. P. 1—9.
3. Kalendar R., Schulman A. IRAP and REMAP for retrotransposon — based genotyping and fingerprinting // Nature Protocols. 2006. Vol. 1. N 5. P. 2478—2484.
4. Vershinin A.V., Allnutt T.R., Knox M.R., Ambrose M.J., Ellis T.H.N. Ttransposable elements reveal the impact of introgression, rather than transposition, in Pisum divercity, evolution, and domestication // Molec. Biol. Evol. 2003. Vol. 20. N 12. P. 2067—2075.
5. Smэkal P., Horasec J., Dostalova, Hybl M. Variety discrimination in pea (Pisum sativum L.) by molecylar, biochemical and morphological markers // Genet. 2008. Vol. 49. N 2. P. 155—166.
6. Jing R., Vershinin A., Grzebytaet J., Shaw P., Smykal P., Marshall D., Ambrose M.J., Ellis T.H.N., Flavell A.J. The genetic diversity and evolution of field pea (Pisum) studied by high throughput retrotransposon based insertion polymorphism (RBIP) marker analysis // BMC Evol. Biol. 2010. Vol. 10. P. 44.
7. Weeden N.F., Ellis T.H.N., Timmerman-Vaughan G.M., Swiecicki W.K., Rozov S.M., Berdnikov V.A. A consensus linkage map for Pisum sativum // Pisum Genetics. 1998. Vol. 30. P. 1—4.
8. Waugh R., McLean K., Flavell A.J., Pearce S.R., Kumar A., Thomas B.T., Powell W. Genetic distribution of BARE-1 retrotransposable elements in the Barley (Hordeum vulgare) genome revealed by sequence-specific amplification polymorphisms (S-SAP) // Mol. Gen. Genet. 1997. Vol. 253. P. 687—694.
9. Кокаева З.Г., Гостимский С.А. Идентификация сортов и линий гороха с помощью молекулярных маркеров, основанных на ретротранспозонах // Сельскохозяйственная биология. 2007. № 3. C. 38—43.
10. Кокаева З.Г., Алешин А.В. Паспортизация сортов гороха посевного (Pisum sativum L.) // Доклады Московского общества испытателей природы, посвященные 205-летию МОИП. 2010. Т. 47. C. 52—54.
11. Чегамирза К. Молекулярно-генетическое картирование локусов качественных и количественных признаков у гороха: Автореф. дис. ... канд. биол. наук. М., 2004. 26 с.
12. Lee D., Ellis T.H.N., Turner L., Hellens R.P., Cleary W.G. A copia — like element in Pisum demonstrates the uses of dispersed repeated in genetic analysis // Plant Mol. Biol. 1990. Vol. 15. P. 707—722.
13. Torres A.M., Weeden N.F., Martin A. Linkage among isozyme, RFLP and RAPD markers in Vicia faba // Theor. Appl. Genet. 1993. Vol. 85. P. 937—945.
14. Schneider K. Mapping populations and principles of genetic mapping // The handbook of plant genome mapping. Genetic and physical mapping / Eds. K. Meksem, G. Kahl. Weinheim: Wiley-VCH, 2005.
15. Коновалов Ф.А. Картирование и молекулярно-генетический анализ генов гороха (Pisum sativum L.): Автореф. дис. ... канд. биол. наук. М., 2006. 24 с.
16. Brauner S., Murphy R.L., Walling J.G., Przyborowski J., Weeden N.F. STS markers for comparative mapping in legumes // J. Amer. Soc. Hort. Sci. 2002. Vol. 127. N 4. P. 616—622.
Рецензия
Для цитирования:
Кокаева З.Г., Алешин А.В., Березов Ю.И. АНАЛИЗ ИНСЕРЦИЙ PDR1 РЕТРОТРАНСПОЗОНА У ГОРОХА ПОСЕВНОГО (PISUM SATIVUM L.). Вестник Московского университета. Серия 16. Биология. 2012;(2):9-12. https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2012-2-9-12
For citation:
Kokaeva Z.G., Aleshin A.V., Beriozov Y.I. ANALYSIS INSERTIONS PDR1 RETROTRANSPOSON IN THE PEA (PISUM SATIVUM L.). Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya. 2012;(2):9-12. (In Russ.) https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2012-2-9-12
Просмотров:
252
Послать статью по эл. почте 