ОЦЕНКА РАВНОМЕРНОСТИ ХОДА МОЛЕКУЛЯРНЫХ ЧАСОВ В РОДОСЛОВНЫХ ВИДОВ ДРОЗОФИЛ ГРУППЫ VIRILIS
Аннотация
Исследована филогения видов-двойников группы Drosophila virilis на основе изменчивости пяти ядерных и митохондриальных генов: Adh, NonA, Fu, Ras1 и 16S-12S рРНК. Предложена модель для оценки неравномерности накопления замен в филогенетических линиях группы видов по произвольному числу последовательностей ДНК с учетом множественных, параллельных и обратных замен. Реконструированы периоды неравномерного хода молекулярных часов в группе видов virilis и построено филогенетическое дерево данной группы на основе нейтральной изменчивости.
При поддержке: Работа поддержана Российским фондом фундаментальных исследований (грант № 09-04-01745).
Об авторах
А. М. Куликов
Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН
Россия
Россия
канд. биол. наук, ст. науч. сотр., Учреждение Российской академии наук Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН. Тел. (499)135-87-81
О. Е. Лазебный
Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН
Россия
Россия
канд. биол. наук, ст. науч. сотр., Учреждение Российской академии наук Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН. Тел. (499)135-87-81
Е. Ю. Рыбакова
Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН
Россия
Россия
аспирантка, Учреждение Российской академии наук Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН. Тел. (499)135-87-81.
Список литературы
1. Куликов А.М., Лазебный О.Е., Горностаев Н.Г., Чекунова А.И. Митрофанов В.Г. Неравномерность скорости эволюции у дрозофил группы viriliS. I. Применение филогенетически опосредованных тестов Такезаки // Изв. РАН. Сер. биол. 2010. Т. 37. № 1. С. 25—33.
2. Куликов А.М., Лазебный О.Е., Горностаев Н.Г., Чекунова А.И. Митрофанов В.Г. Неравномерность скорости эволюции у дрозофил группы viriliS. II. Применение метода тестирования Таджимы // Изв. РАН. Сер. биол. 2010. Т. 37. № 1. С. 206—209
3. GaSperini R., GibSon G.J. Absence of protein polymorphism in the RaS genes of DroSophila melanogaSter // Mol. Evol. 1999. Vol. 49. N 5. P. 583—590.
4. Сорокина С.Ю., Мюге Н.С., Андрианов Б.В., Митрофанов В.Г.Изменчивость 3'-концевого фрагмента гена 16S рРНК в группе бизкородственных видов дрозофил viriliS // Генетика. 2005. Т. 41. № 8. С. 1049—1054.
5. Чекунова А.И., Куликов А.М., Михайловский С.С., Лазебный О.Е. Лазебная И.В., Митрофанов В.Г Родственные отношения дрозофил группы viriliS, рекомендованные на основе последовательностей гена DraSl // Генетика. 2008. Т. 44. № 3. С. 336—345.
6. Cutler D.J. Understanding the overdispersed molecular clock // Genetics. 2000. Vol. 154. P. 1403—1417.
7. GilleSpie J.H. Lineage effects and the index of dispersion of molecular evolution // Mol. Biol. Evol. 1989. Vol. 6. N 5. P. 636—647.
8. Bulmer M. Estimating the variability of substitution rates // Genetics 1989. Vol. 123. P. 615—619.
Рецензия
Для цитирования:
Куликов А.М., Лазебный О.Е., Рыбакова Е.Ю. ОЦЕНКА РАВНОМЕРНОСТИ ХОДА МОЛЕКУЛЯРНЫХ ЧАСОВ В РОДОСЛОВНЫХ ВИДОВ ДРОЗОФИЛ ГРУППЫ VIRILIS. Вестник Московского университета. Серия 16. Биология. 2010;(4):100-103.
For citation:
Kulikov A.M., Lazebny O.E., Rybakova E.Yu. ESTIMATION OF THE RATE OF MOLECULAR CLOCK IN LINEAGES OF THE DROSOPHILA VIRILIS SPECIES GROUP. Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 16. Biologiya. 2010;(4):100-103. (In Russ.)
Просмотров:
321
Послать статью по эл. почте 