Очистка культур диатомовых водорослей, контаминированных кинетопластидой Bodo saltans Ehrenberg, 1832

Культивирование диатомовых водорослей сопряжено со многими проблемами, одна из которых касается контаминации культур различными микроорганизмами. Среди контаминантов нередко встречается представитель кинетопластид, свободноживущий бактериотроф Bodo saltans Ehrenberg, 1832. В случае, когда B. saltans достигает большой численности, клетки диатомовых в культуре перестают делиться, часть из них погибает, становясь субстратом для развития бактерий, и вслед за этим представителей следующего трофического звена — кинетопластид. Для очистки культур диатомовых мы применили амфотерицин В — полиеновый макроциклический антибиотик, активный в отношении некоторых простейших и грибов. Проверено действие вещества на B. saltans в культурах восьми видов диатомовых, включая Ardissonea crystallina (C. Agardh) Grunow, Climaconeis scalaris (Brebisson) E.J. Cox, Entomoneis paludosa (W. Smith) Reimer, Haslea karadagensis Davidovich, Gastineau & Mouget, Pleurosigma aestuarii (Brebisson ex Kutzing) W. Smith, Pleurosigma sp., Pseudo-nitzschia calliantha Lundholm, Moestrup & Hasle и P. pungens (Grunow ex P.T. Cleve) Hasle. Экспериментально определена зависимость темпов деления клеток диатомовых, подвергнувшихся воздействию амфотерицина В, от дозы и продолжительности воздействия. Даны рекомендации по использованию ам-фотерицина В для очистки культур диатомовых от B. saltans.

1. Mann D.G. Size and sex // The diatom world. Cellular origin, life in extreme habitats and astrobiology. Vol. 19 / Eds. J. Seckbach and J.P. Kociolek. Dordrecht: Springer, 2011. P. 145—166.

2. Round F.E., Crawford R.M., Mann D.G. The Diatoms. Biology and morphology of the genera. Cambridge: Cambridge Univ. Press, 1990. 747 pp.

3. Geitler L. Reproduction and life history in diatoms // Botanical Rev. 1935. Vol. 1. N 5. P. 149—161.

4. Полякова С.Л., Давидович О.И., Подумай Ю.А., Давидович Н.А. Модификация среды ESAW, используемой для культивирования морских диатомовых водорослей // Морской биол. журн. 2018. Т. 3. № 2. С 73—78.

5. Andersen RA, Berges J.A., Harrison P.J., Watanabe M.M. Recipes for freshwater and seawater media // Algal culturing techniques / Ed. R.A. Andersen. N.Y.: Elsevier Academic Press, 2005. P. 429—538.

6. Gastineau R, Lemieux C, Turmel M, Davidovich N.A., Davidovich O.I., Mouget J.-L, Witkowski A. Mitogenome sequence of a Black Sea isolate of the kinetoplastid Bodo saltans // Mitochondrial DNA Part B. 2018. Vol. 3. N 2. P. 970-971.

7. Scheckenbach F, Wylezich C, Mylnikov A.P., Weitere M, Arndt H. Molecular comparisons of freshwater and marine isolates of the same morphospecies of heterotrophic flagellates // Appl. Environ. Microbiol. 2006. Vol. 72. N 10. P. 6638-6643.

8. Wood A.M., Everroad R.C., Wingard L.M. Measuring growth rates in microalgal cultures // Algal culturing techniques / Ed. R.A. Andersen. N.Y.: Elsevier Academic Press, 2005. P. 269-286.

9. Glantz S.A. Primer of biostatistics. N.Y.: McGraw-Hill, Health Professions Division, 1997.473pp.

10. Droop S.J.M. A procedure for routine purification of algal cultures with antibiotics // Br. Phycol. Bull. 1967. Vol. 3. N 2. P. 295-297.

11. Guillard R.R.L. Purification methods for microalgae // Algal culturing techniques / Ed. R.A. Andersen. N.Y.: Elsevier Academic Press, 2005. P. 117-132.

12. Mitchell G.C., Baker J.H., Sleigh M.A. Feeding of a freshwater flagellate, Bodo saltans, on diverse bacteria // J. Eukar. Microbiol. 1988. Vol. 35. N 2. P. 219-222.

13. Жуков Б.Ф. Атлас пресноводных гетеротрофных жгутиконосцев (биология, экология, систематика). Рыбинск: Рыб. Дом печати, 1993. 160 с.

14. Arndt H, Dietrich D, Auer B, Cleven E.-J, Grafenhan T, Weitere M, Mylnikov AP. Functional diversity of heterotrophic flagellates in aquatic ecosystems // The flagellates: unity, diversity and evolution. Vol. 59 / Eds. B.S.C. Leadbeater and J.C. Green. London: Taylor and Francis, 2000. P. 240-268.

15. von der Heyden S, Cavalier-Smith T. Culturing and environmental DNA sequencing uncover hidden kinetoplastid biodiversity and a major marine clade within ancestrally freshwater Neobodo designis // Intern. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005.Vol. 55. N 6. P. 2605-2621.

16. Vickerman K, Appleton P. L, Clarke K. J., Moreira D. Aurigamonas solis n. gen., n. sp., a soil-dwelling predator with unusual helioflagellate organisation and belonging to a novel clade within the Cercozoa // Protist. 2005. Vol. 156. N 3. P. 335-354.

17. Yazaki E, Ishikawa S.A., Kume K, Kumagai A., Kamaishi T, Tanifuji G., Hashimoto T., Inagaki Y. Global Kinetoplastea phylogeny inferred from a large-scale multigene alignment including parasitic species for better understanding transitions from a free-living to a parasitic lifestyle // Genes Genet. Syst. 2017. Vol. 92. N 1. P. 35-42.

18. Deeg C.M., Chow C.-E.T., Suttle C.A. The kinetoplastid-infecting Bodo saltans virus (BsV), a window into the most abundant giant viruses in the sea // eLife. 2018. Vol. 7: e33014.